Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5649
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5649, 494 aa
1>>>pF1KE5649 494 - 494 aa - 494 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3471+/-0.000858; mu= 17.9287+/- 0.052
mean_var=68.4319+/-13.604, 0's: 0 Z-trim(106.2): 77 B-trim: 2 in 1/48
Lambda= 0.155040
statistics sampled from 8768 (8846) to 8768 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.649), E-opt: 0.2 (0.272), width: 16
Scan time: 3.120
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12568.1 CYP2A6 gene_id:1548|Hs108|chr19 ( 494) 3286 744.2 7.6e-215
CCDS12571.1 CYP2A13 gene_id:1553|Hs108|chr19 ( 494) 3109 704.6 6.3e-203
CCDS12569.1 CYP2A7 gene_id:1549|Hs108|chr19 ( 494) 3102 703.0 1.9e-202
CCDS12570.1 CYP2B6 gene_id:1555|Hs108|chr19 ( 491) 1800 411.8 8.6e-115
CCDS12572.1 CYP2F1 gene_id:1572|Hs108|chr19 ( 491) 1775 406.2 4.1e-113
CCDS7436.1 CYP2C19 gene_id:1557|Hs108|chr10 ( 490) 1722 394.3 1.5e-109
CCDS7435.1 CYP2C18 gene_id:1562|Hs108|chr10 ( 490) 1677 384.3 1.6e-106
CCDS7437.1 CYP2C9 gene_id:1559|Hs108|chr10 ( 490) 1667 382.0 7.7e-106
CCDS7438.1 CYP2C8 gene_id:1558|Hs108|chr10 ( 490) 1659 380.3 2.7e-105
CCDS7686.1 CYP2E1 gene_id:1571|Hs108|chr10 ( 493) 1619 371.3 1.3e-102
CCDS12573.1 CYP2S1 gene_id:29785|Hs108|chr19 ( 504) 1618 371.1 1.6e-102
CCDS73166.1 CYP2C8 gene_id:1558|Hs108|chr10 ( 420) 1415 325.6 6.3e-89
CCDS613.1 CYP2J2 gene_id:1573|Hs108|chr1 ( 502) 1324 305.3 9.8e-83
CCDS55721.1 CYP2C8 gene_id:1558|Hs108|chr10 ( 388) 1295 298.8 7.1e-81
CCDS46721.1 CYP2D6 gene_id:1565|Hs108|chr22 ( 497) 1099 255.0 1.4e-67
CCDS5319.2 CYP2W1 gene_id:54905|Hs108|chr7 ( 490) 1092 253.4 4e-67
CCDS7818.1 CYP2R1 gene_id:120227|Hs108|chr11 ( 501) 1051 244.3 2.4e-64
CCDS34047.1 CYP2U1 gene_id:113612|Hs108|chr4 ( 544) 1023 238.0 1.9e-62
CCDS44460.1 CYP2C18 gene_id:1562|Hs108|chr10 ( 431) 821 192.8 6.4e-49
CCDS33657.1 CYP2D6 gene_id:1565|Hs108|chr22 ( 446) 815 191.5 1.7e-48
CCDS7541.1 CYP17A1 gene_id:1586|Hs108|chr10 ( 508) 729 172.2 1.1e-42
CCDS10268.1 CYP1A1 gene_id:1543|Hs108|chr15 ( 512) 664 157.7 2.8e-38
CCDS32293.1 CYP1A2 gene_id:1544|Hs108|chr15 ( 516) 646 153.7 4.5e-37
CCDS4735.1 CYP21A2 gene_id:1589|Hs108|chr6 ( 495) 614 146.5 6.2e-35
CCDS1793.1 CYP1B1 gene_id:1545|Hs108|chr2 ( 543) 533 128.4 1.9e-29
CCDS5674.1 CYP3A4 gene_id:1576|Hs108|chr7 ( 503) 472 114.8 2.3e-25
CCDS47406.1 CYP21A2 gene_id:1589|Hs108|chr6 ( 465) 460 112.1 1.4e-24
CCDS5672.1 CYP3A5 gene_id:1577|Hs108|chr7 ( 502) 456 111.2 2.7e-24
CCDS5676.1 CYP3A43 gene_id:64816|Hs108|chr7 ( 503) 453 110.5 4.4e-24
CCDS5675.1 CYP3A43 gene_id:64816|Hs108|chr7 ( 504) 447 109.2 1.1e-23
CCDS81906.1 CYP1A1 gene_id:1543|Hs108|chr15 ( 483) 446 108.9 1.3e-23
CCDS5673.1 CYP3A7 gene_id:1551|Hs108|chr7 ( 503) 425 104.2 3.4e-22
CCDS75639.1 CYP3A51P gene_id:100861540|Hs108|chr7 ( 535) 425 104.3 3.5e-22
CCDS33491.1 CYP24A1 gene_id:1591|Hs108|chr20 ( 514) 422 103.6 5.4e-22
CCDS34119.1 CYP4V2 gene_id:285440|Hs108|chr4 ( 525) 399 98.4 2e-20
CCDS545.1 CYP4Z1 gene_id:199974|Hs108|chr1 ( 505) 372 92.4 1.2e-18
CCDS544.1 CYP4X1 gene_id:260293|Hs108|chr1 ( 509) 370 91.9 1.7e-18
CCDS5677.1 CYP3A43 gene_id:64816|Hs108|chr7 ( 420) 363 90.3 4.3e-18
CCDS8954.1 CYP27B1 gene_id:1594|Hs108|chr12 ( 508) 359 89.5 9.4e-18
CCDS9954.1 CYP46A1 gene_id:10858|Hs108|chr14 ( 500) 355 88.6 1.7e-17
CCDS2423.1 CYP27A1 gene_id:1593|Hs108|chr2 ( 531) 344 86.1 1e-16
CCDS64723.1 CYP3A43 gene_id:64816|Hs108|chr7 ( 393) 333 83.6 4.3e-16
CCDS33285.1 CYP27C1 gene_id:339761|Hs108|chr2 ( 372) 328 82.5 8.9e-16
CCDS74303.1 CYP4F8 gene_id:11283|Hs108|chr19 ( 520) 316 79.9 7.5e-15
CCDS46616.1 CYP24A1 gene_id:1591|Hs108|chr20 ( 448) 304 77.2 4.3e-14
CCDS6393.1 CYP11B2 gene_id:1585|Hs108|chr8 ( 503) 304 77.2 4.7e-14
CCDS42517.1 CYP4F12 gene_id:66002|Hs108|chr19 ( 524) 298 75.9 1.2e-13
CCDS7426.1 CYP26A1 gene_id:1592|Hs108|chr10 ( 497) 295 75.2 1.9e-13
CCDS12337.1 CYP4F11 gene_id:57834|Hs108|chr19 ( 524) 290 74.1 4.3e-13
CCDS12336.1 CYP4F2 gene_id:8529|Hs108|chr19 ( 520) 288 73.6 5.8e-13
>>CCDS12568.1 CYP2A6 gene_id:1548|Hs108|chr19 (494 aa)
initn: 3286 init1: 3286 opt: 3286 Z-score: 3970.7 bits: 744.2 E(32554): 7.6e-215
Smith-Waterman score: 3286; 100.0% identity (100.0% similar) in 494 aa overlap (1-494:1-494)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MLASGMLLVALLVCLTVMVLMSVWQQRKSKGKLPPGPTPLPFIGNYLQLNTEQMYNSLMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MLASGMLLVALLVCLTVMVLMSVWQQRKSKGKLPPGPTPLPFIGNYLQLNTEQMYNSLMK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 ISERYGPVFTIHLGPRRVVVLCGHDAVREALVDQAEEFSGRGEQATFDWVFKGYGVVFSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ISERYGPVFTIHLGPRRVVVLCGHDAVREALVDQAEEFSGRGEQATFDWVFKGYGVVFSN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 GERAKQLRRFSIATLRDFGVGKRGIEERIQEEAGFLIDALRGTGGANIDPTFFLSRTVSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 GERAKQLRRFSIATLRDFGVGKRGIEERIQEEAGFLIDALRGTGGANIDPTFFLSRTVSN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 VISSIVFGDRFDYKDKEFLSLLRMMLGIFQFTSTSTGQLYEMFSSVMKHLPGPQQQAFQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 VISSIVFGDRFDYKDKEFLSLLRMMLGIFQFTSTSTGQLYEMFSSVMKHLPGPQQQAFQL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 LQGLEDFIAKKVEHNQRTLDPNSPRDFIDSFLIRMQEEEKNPNTEFYLKNLVMTTLNLFI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LQGLEDFIAKKVEHNQRTLDPNSPRDFIDSFLIRMQEEEKNPNTEFYLKNLVMTTLNLFI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 GGTETVSTTLRYGFLLLMKHPEVEAKVHEEIDRVIGKNRQPKFEDRAKMPYMEAVIHEIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 GGTETVSTTLRYGFLLLMKHPEVEAKVHEEIDRVIGKNRQPKFEDRAKMPYMEAVIHEIQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 RFGDVIPMSLARRVKKDTKFRDFFLPKGTEVYPMLGSVLRDPSFFSNPQDFNPQHFLNEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RFGDVIPMSLARRVKKDTKFRDFFLPKGTEVYPMLGSVLRDPSFFSNPQDFNPQHFLNEK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE5 GQFKKSDAFVPFSIGKRNCFGEGLARMELFLFFTTVMQNFRLKSSQSPKDIDVSPKHVGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 GQFKKSDAFVPFSIGKRNCFGEGLARMELFLFFTTVMQNFRLKSSQSPKDIDVSPKHVGF
430 440 450 460 470 480
490
pF1KE5 ATIPRNYTMSFLPR
::::::::::::::
CCDS12 ATIPRNYTMSFLPR
490
>>CCDS12571.1 CYP2A13 gene_id:1553|Hs108|chr19 (494 aa)
initn: 3109 init1: 3109 opt: 3109 Z-score: 3756.7 bits: 704.6 E(32554): 6.3e-203
Smith-Waterman score: 3109; 93.5% identity (98.4% similar) in 494 aa overlap (1-494:1-494)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MLASGMLLVALLVCLTVMVLMSVWQQRKSKGKLPPGPTPLPFIGNYLQLNTEQMYNSLMK
:::::.:::.::.:::::::::::.::::.::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MLASGLLLVTLLACLTVMVLMSVWRQRKSRGKLPPGPTPLPFIGNYLQLNTEQMYNSLMK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 ISERYGPVFTIHLGPRRVVVLCGHDAVREALVDQAEEFSGRGEQATFDWVFKGYGVVFSN
:::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::.::::::.:::
CCDS12 ISERYGPVFTIHLGPRRVVVLCGHDAVKEALVDQAEEFSGRGEQATFDWLFKGYGVAFSN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 GERAKQLRRFSIATLRDFGVGKRGIEERIQEEAGFLIDALRGTGGANIDPTFFLSRTVSN
:::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::
CCDS12 GERAKQLRRFSIATLRGFGVGKRGIEERIQEEAGFLIDALRGTHGANIDPTFFLSRTVSN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 VISSIVFGDRFDYKDKEFLSLLRMMLGIFQFTSTSTGQLYEMFSSVMKHLPGPQQQAFQL
:::::::::::::.::::::::::::: ::::.:::::::::::::::::::::::::.
CCDS12 VISSIVFGDRFDYEDKEFLSLLRMMLGSFQFTATSTGQLYEMFSSVMKHLPGPQQQAFKE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 LQGLEDFIAKKVEHNQRTLDPNSPRDFIDSFLIRMQEEEKNPNTEFYLKNLVMTTLNLFI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS12 LQGLEDFIAKKVEHNQRTLDPNSPRDFIDSFLIRMQEEEKNPNTEFYLKNLVMTTLNLFF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 GGTETVSTTLRYGFLLLMKHPEVEAKVHEEIDRVIGKNRQPKFEDRAKMPYMEAVIHEIQ
.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::
CCDS12 AGTETVSTTLRYGFLLLMKHPEVEAKVHEEIDRVIGKNRQPKFEDRAKMPYTEAVIHEIQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 RFGDVIPMSLARRVKKDTKFRDFFLPKGTEVYPMLGSVLRDPSFFSNPQDFNPQHFLNEK
::::..::.::.::.::::::::::::::::.:::::::::: :::::.::::::::..:
CCDS12 RFGDMLPMGLAHRVNKDTKFRDFFLPKGTEVFPMLGSVLRDPRFFSNPRDFNPQHFLDKK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE5 GQFKKSDAFVPFSIGKRNCFGEGLARMELFLFFTTVMQNFRLKSSQSPKDIDVSPKHVGF
::::::::::::::::: :::::::::::::::::.:::::.:: :::::::::::::::
CCDS12 GQFKKSDAFVPFSIGKRYCFGEGLARMELFLFFTTIMQNFRFKSPQSPKDIDVSPKHVGF
430 440 450 460 470 480
490
pF1KE5 ATIPRNYTMSFLPR
::::::::::::::
CCDS12 ATIPRNYTMSFLPR
490
>>CCDS12569.1 CYP2A7 gene_id:1549|Hs108|chr19 (494 aa)
initn: 3102 init1: 3102 opt: 3102 Z-score: 3748.2 bits: 703.0 E(32554): 1.9e-202
Smith-Waterman score: 3102; 93.7% identity (98.8% similar) in 494 aa overlap (1-494:1-494)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MLASGMLLVALLVCLTVMVLMSVWQQRKSKGKLPPGPTPLPFIGNYLQLNTEQMYNSLMK
:::::.::::::.::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::.. .:.::
CCDS12 MLASGLLLVALLACLTVMVLMSVWQQRKSRGKLPPGPTPLPFIGNYLQLNTEHICDSIMK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 ISERYGPVFTIHLGPRRVVVLCGHDAVREALVDQAEEFSGRGEQATFDWVFKGYGVVFSN
.:: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::
CCDS12 FSECYGPVFTIHLGPRRVVVLCGHDAVREALVDQAEEFSGRGEQATFDWVFKGYGVAFSN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 GERAKQLRRFSIATLRDFGVGKRGIEERIQEEAGFLIDALRGTGGANIDPTFFLSRTVSN
::::::: ::.:::::::::::::::::::::.::::.:.:.: ::::::::::::::::
CCDS12 GERAKQLLRFAIATLRDFGVGKRGIEERIQEESGFLIEAIRSTHGANIDPTFFLSRTVSN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 VISSIVFGDRFDYKDKEFLSLLRMMLGIFQFTSTSTGQLYEMFSSVMKHLPGPQQQAFQL
:::::::::::::.:::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::.:
CCDS12 VISSIVFGDRFDYEDKEFLSLLSMMLGIFQFTSTSTGQLYEMFSSVMKHLPGPQQQAFKL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 LQGLEDFIAKKVEHNQRTLDPNSPRDFIDSFLIRMQEEEKNPNTEFYLKNLVMTTLNLFI
::::::::::::::::::::::::.::::::::.:::::::::::::::::.:.::::::
CCDS12 LQGLEDFIAKKVEHNQRTLDPNSPQDFIDSFLIHMQEEEKNPNTEFYLKNLMMSTLNLFI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 GGTETVSTTLRYGFLLLMKHPEVEAKVHEEIDRVIGKNRQPKFEDRAKMPYMEAVIHEIQ
.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::
CCDS12 AGTETVSTTLRYGFLLLMKHPEVEAKVHEEIDRVIGKNRQPKFEDRTKMPYMEAVIHEIQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 RFGDVIPMSLARRVKKDTKFRDFFLPKGTEVYPMLGSVLRDPSFFSNPQDFNPQHFLNEK
:::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::..:
CCDS12 RFGDVIPMSLARRVKKDTKFRDFFLPKGTEVFPMLGSVLRDPSFFSNPQDFNPQHFLDDK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE5 GQFKKSDAFVPFSIGKRNCFGEGLARMELFLFFTTVMQNFRLKSSQSPKDIDVSPKHVGF
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :
CCDS12 GQFKKSDAFVPFSIGKRNCFGEGLARMELFLFFTTVMQNFRLKSSQSPKDIDVSPKHVVF
430 440 450 460 470 480
490
pF1KE5 ATIPRNYTMSFLPR
::::::::::::::
CCDS12 ATIPRNYTMSFLPR
490
>>CCDS12570.1 CYP2B6 gene_id:1555|Hs108|chr19 (491 aa)
initn: 1797 init1: 1797 opt: 1800 Z-score: 2174.4 bits: 411.8 E(32554): 8.6e-115
Smith-Waterman score: 1800; 51.4% identity (83.0% similar) in 494 aa overlap (1-494:1-491)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MLASGMLLVALLVCLTVMVLMSVWQQRKSKGKLPPGPTPLPFIGNYLQLNTEQMYNSLMK
: : .:..::: : ..:. : .. ... .::::: :::..:: ::.. . . .:...
CCDS12 MELSVLLFLALL---TGLLLLLVQRHPNTHDRLPPGPRPLPLLGNLLQMDRRGLLKSFLR
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 ISERYGPVFTIHLGPRRVVVLCGHDAVREALVDQAEEFSGRGEQATFDWVFKGYGVVFSN
. :.:: :::.::::: ::.::: .:.::::::.:: :::::. : : :.::::.:.:
CCDS12 FREKYGDVFTVHLGPRPVVMLCGVEAIREALVDKAEAFSGRGKIAMVDPFFRGYGVIFAN
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 GERAKQLRRFSIATLRDFGVGKRGIEERIQEEAGFLIDALRGTGGANIDPTFFLSRTVSN
:.: : :::::..:.::::.:::..:::::::: ::. :: . :: .::::... ..:
CCDS12 GNRWKVLRRFSVTTMRDFGMGKRSVEERIQEEAQCLIEELRKSKGALMDPTFLFQSITAN
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 VISSIVFGDRFDYKDKEFLSLLRMMLGIFQFTSTSTGQLYEMFSSVMKHLPGPQQQAFQL
.: ::::: :: :.:.:::..: .. :.. :. :::.:.::. .:..:: ..:...
CCDS12 IICSIVFGKRFHYQDQEFLKMLNLFYQTFSLISSVFGQLFELFSGFLKYFPGAHRQVYKN
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 LQGLEDFIAKKVEHNQRTLDPNSPRDFIDSFLIRMQEEEKNPNTEFYLKNLVMTTLNLFI
:: .. .:...::....::::..:.:.::..:..:..:..: ..:: .:: ..::.::.
CCDS12 LQEINAYIGHSVEKHRETLDPSAPKDLIDTYLLHMEKEKSNAHSEFSHQNLNLNTLSLFF
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 GGTETVSTTLRYGFLLLMKHPEVEAKVHEEIDRVIGKNRQPKFEDRAKMPYMEAVIHEIQ
.::::.::::::::::..:.:.: .:..::..::: .: :...::::::: ::::.:::
CCDS12 AGTETTSTTLRYGFLLMLKYPHVAERVYREIEQVIGPHRPPELHDRAKMPYTEAVIYEIQ
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
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490
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480 490
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10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MLASGMLLVALLVCLTVMVLMSVWQQRKSKGKLPPGPTPLPFIGNYLQLNTEQMYNSLMK
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CCDS74 MEPFVVLVLCLSFMLLFSLWRQSCRRRKLPPGPTPLPIIGNMLQIDVKDICKSFTN
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pF1KE5 ISERYGPVFTIHLGPRRVVVLCGHDAVREALVDQAEEFSGRGEQATFDWVFKGYGVVFSN
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CCDS74 FSKVYGPVFTVYFGMNPIVVFHGYEAVKEALIDNGEEFSGRGNSPISQRITKGLGIISSN
60 70 80 90 100 110
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pF1KE5 GERAKQLRRFSIATLRDFGVGKRGIEERIQEEAGFLIDALRGTGGANIDPTFFLSRTVSN
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CCDS74 GKRWKEIRRFSLTTLRNFGMGKRSIEDRVQEEAHCLVEELRKTKASPCDPTFILGCAPCN
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pF1KE5 VISSIVFGDRFDYKDKEFLSLLRMMLGIFQFTSTSTGQLYEMFSSVMKHLPGPQQQAFQL
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CCDS74 VICSVVFQKRFDYKDQNFLTLMKRFNENFRILNSPWIQVCNNFPLLIDCFPGTHNKVLKN
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CCDS74 GNFKKSDYFMPFSAGKRICAGEGLARMELFLFLTTILQNFNLKSVDDLKNLNTTAVTKGI
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CCDS74 VSLPPSYQICFIPV
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