FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5641, 583 aa
1>>>pF1KE5641 583 - 583 aa - 583 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7585+/-0.00104; mu= 16.3085+/- 0.062
mean_var=75.3853+/-15.456, 0's: 0 Z-trim(103.9): 110 B-trim: 48 in 1/50
Lambda= 0.147717
statistics sampled from 7505 (7624) to 7505 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.605), E-opt: 0.2 (0.234), width: 16
Scan time: 2.750
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS10280.1 PTPN9 gene_id:5780|Hs108|chr15 ( 593) 3908 842.9 0
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CCDS34740.1 PTPRZ1 gene_id:5803|Hs108|chr7 (2315) 638 146.3 4.1e-34
CCDS2895.1 PTPRG gene_id:5793|Hs108|chr3 (1445) 592 136.4 2.4e-31
CCDS9884.1 PTPN21 gene_id:11099|Hs108|chr14 (1174) 589 135.7 3.2e-31
CCDS1514.1 PTPN14 gene_id:5784|Hs108|chr1 (1187) 564 130.4 1.3e-29
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CCDS74265.1 PTPRS gene_id:5802|Hs108|chr19 (1505) 518 120.6 1.4e-26
CCDS12140.1 PTPRS gene_id:5802|Hs108|chr19 (1910) 518 120.7 1.7e-26
CCDS45930.1 PTPRS gene_id:5802|Hs108|chr19 (1948) 518 120.7 1.8e-26
CCDS490.2 PTPRF gene_id:5792|Hs108|chr1 (1898) 516 120.2 2.3e-26
CCDS489.2 PTPRF gene_id:5792|Hs108|chr1 (1907) 516 120.2 2.3e-26
CCDS13039.1 PTPRA gene_id:5786|Hs108|chr20 ( 793) 498 116.2 1.6e-25
CCDS13038.1 PTPRA gene_id:5786|Hs108|chr20 ( 802) 498 116.2 1.6e-25
CCDS13430.1 PTPN1 gene_id:5770|Hs108|chr20 ( 435) 489 114.2 3.6e-25
CCDS81741.1 PTPN11 gene_id:5781|Hs108|chr12 ( 597) 483 112.9 1.1e-24
CCDS75813.1 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9 (1496) 487 114.0 1.4e-24
CCDS55288.1 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9 (1502) 487 114.0 1.4e-24
CCDS6472.2 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9 (1505) 487 114.0 1.4e-24
CCDS55289.1 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9 (1505) 487 114.0 1.4e-24
CCDS55290.1 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9 (1506) 487 114.0 1.4e-24
CCDS43786.1 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9 (1912) 487 114.1 1.7e-24
CCDS44820.1 PTPN6 gene_id:5777|Hs108|chr12 ( 595) 479 112.1 2e-24
CCDS41744.1 PTPN6 gene_id:5777|Hs108|chr12 ( 597) 479 112.1 2e-24
CCDS44821.1 PTPN6 gene_id:5777|Hs108|chr12 ( 624) 479 112.1 2.1e-24
CCDS42874.1 PTPRT gene_id:11122|Hs108|chr20 (1441) 480 112.5 3.7e-24
CCDS68127.1 PTPRT gene_id:11122|Hs108|chr20 (1460) 480 112.5 3.8e-24
CCDS1398.2 PTPRC gene_id:5788|Hs108|chr1 (1145) 473 111.0 8.6e-24
CCDS1397.2 PTPRC gene_id:5788|Hs108|chr1 (1306) 473 111.0 9.6e-24
CCDS75517.1 PTPRK gene_id:5796|Hs108|chr6 (1439) 469 110.2 1.9e-23
CCDS5137.1 PTPRK gene_id:5796|Hs108|chr6 (1440) 469 110.2 1.9e-23
CCDS55845.1 PTPRB gene_id:5787|Hs108|chr12 (1907) 469 110.2 2.4e-23
CCDS55846.1 PTPRB gene_id:5787|Hs108|chr12 (1907) 469 110.2 2.4e-23
CCDS44944.1 PTPRB gene_id:5787|Hs108|chr12 (1997) 469 110.2 2.5e-23
CCDS81713.1 PTPRB gene_id:5787|Hs108|chr12 (2127) 469 110.2 2.6e-23
CCDS44943.1 PTPRB gene_id:5787|Hs108|chr12 (2215) 469 110.2 2.7e-23
CCDS11840.1 PTPRM gene_id:5797|Hs108|chr18 (1452) 460 108.2 7.2e-23
CCDS58613.1 PTPRM gene_id:5797|Hs108|chr18 (1465) 460 108.2 7.3e-23
CCDS11864.1 PTPN2 gene_id:5771|Hs108|chr18 ( 353) 451 106.0 8.2e-23
CCDS11863.1 PTPN2 gene_id:5771|Hs108|chr18 ( 387) 451 106.0 8.8e-23
CCDS11865.1 PTPN2 gene_id:5771|Hs108|chr18 ( 415) 451 106.1 9.4e-23
CCDS7945.1 PTPRJ gene_id:5795|Hs108|chr11 (1337) 456 107.4 1.2e-22
CCDS5592.1 PTPN12 gene_id:5782|Hs108|chr7 ( 780) 449 105.8 2.2e-22
CCDS2129.1 PTPN4 gene_id:5775|Hs108|chr2 ( 926) 447 105.4 3.3e-22
CCDS7658.1 PTPRE gene_id:5791|Hs108|chr10 ( 642) 439 103.6 8e-22
CCDS7657.1 PTPRE gene_id:5791|Hs108|chr10 ( 700) 439 103.6 8.6e-22
CCDS54321.1 PTPRH gene_id:5794|Hs108|chr19 ( 937) 440 103.9 9.5e-22
CCDS33110.1 PTPRH gene_id:5794|Hs108|chr19 (1115) 440 103.9 1.1e-21
CCDS47473.1 PTPRK gene_id:5796|Hs108|chr6 (1446) 441 104.2 1.2e-21
CCDS78179.1 PTPRK gene_id:5796|Hs108|chr6 (1462) 441 104.2 1.2e-21
>>CCDS10280.1 PTPN9 gene_id:5780|Hs108|chr15 (593 aa)
initn: 3908 init1: 3908 opt: 3908 Z-score: 4501.2 bits: 842.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3908; 99.7% identity (99.8% similar) in 583 aa overlap (1-583:11-593)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MAPELTPEEEQATKQFLEEINKWTVQYNVSPLSWNVAVKFLMARKFDVLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MEPATAPRPDMAPELTPEEEQATKQFLEEINKWTVQYNVSPLSWNVAVKFLMARKFDVLR
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 AIELFHSYRETRRKEGIVKLKPHEEPLRSEILSGKFTILNVRDPTGASIALFTARLHHPH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 AIELFHSYRETRRKEGIVKLKPHEEPLRSEILSGKFTILNVRDPTGASIALFTARLHHPH
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 KSVQHVVLQALFYLLDRAVDSFETQRNGLVFIYDMCGSNYADFELDLGKKVLNLLKGAFP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::
CCDS10 KSVQHVVLQALFYLLDRAVDSFETQRNGLVFIYDMCGSNYANFELDLGKKVLNLLKGAFP
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 ARLKKVLIVGAPIWFRVPYSIISLLLKDKVRERIQILKTSEVTQHLPRECLPENLGGYVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ARLKKVLIVGAPIWFRVPYSIISLLLKDKVRERIQILKTSEVTQHLPRECLPENLGGYVK
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 IDLATWNFQFLPQVNGHPDRFDEIILFSLPPALDWDSVHVPGPHAMTIQELVDYVNARQK
::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 IDLATWNFQFLPQVNGHPDPFDEIILFSLPPALDWDSVHVPGPHAMTIQELVDYVNARQK
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 QGIYEEYEDIRRENPVGTFHCSMSPGNLEKNRYGDVPCLDQTRVKLTKRSGHTQTDYINA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 QGIYEEYEDIRRENPVGTFHCSMSPGNLEKNRYGDVPCLDQTRVKLTKRSGHTQTDYINA
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 SFMDGYKQKNAYIGTQGPLENTYRDFWLMVWEQKVLVIVMTTRFEEGGRRKCGQYWPLEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SFMDGYKQKNAYIGTQGPLENTYRDFWLMVWEQKVLVIVMTTRFEEGGRRKCGQYWPLEK
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KE5 DSRIRFGFLTVTNLGVENMNHYKKTTLEIHNTEERQKRQVTHFQFLSWPDYGVPSSAASL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 DSRIRFGFLTVTNLGVENMNHYKKTTLEIHNTEERQKRQVTHFQFLSWPDYGVPSSAASL
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KE5 IDFLRVVRNQQSLAVSNMGARSKGQCPEPPIVVHCSAGIGRTGTFCSLDICLAQLEELGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 IDFLRVVRNQQSLAVSNMGARSKGQCPEPPIVVHCSAGIGRTGTFCSLDICLAQLEELGT
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580
pF1KE5 LNVFQTVSRMRTQRAFSIQTPEQYYFCYKAILEFAEKEGMVSSGQNLLAVESQ
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LNVFQTVSRMRTQRAFSIQTPEQYYFCYKAILEFAEKEGMVSSGQNLLAVESQ
550 560 570 580 590
>>CCDS56505.1 PTPRZ1 gene_id:5803|Hs108|chr7 (1448 aa)
initn: 616 init1: 291 opt: 657 Z-score: 751.0 bits: 150.2 E(32554): 1.7e-35
Smith-Waterman score: 657; 38.0% identity (67.0% similar) in 303 aa overlap (275-563:838-1124)
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 NGHPDRFDEIILFSLPPALDWDSVHVPGPHAMTIQELVDYV-NARQKQGIYEEYEDIRRE
:. :... .: . . ..:. ::.:...
CCDS56 TAHFYLEDSTSPRVISTPPTPIFPISDDVGAIPIKHFPKHVADLHASSGFTEEFEEVQSC
810 820 830 840 850 860
310 320 330 340 350
pF1KE5 N-PVG-TFHCSMSPGNLEKNRYGDVPCLDQTRVKLTK---RSGHTQTDYINASFMDGYKQ
. .: : : : : .:::: .. :..::::.. ..:. ::::::...:::..
CCDS56 TVDLGITADSSNHPDNKHKNRYINIVAYDHSRVKLAQLAEKDGKL-TDYINANYVDGYNR
870 880 890 900 910 920
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 KNAYIGTQGPLENTYRDFWLMVWEQKVLVIVMTTRFEEGGRRKCGQYWPLEKDSRIRFGF
.:::..::::..: .::: :.::..: :::: : . : ::::: :::: :. ..:
CCDS56 PKAYIAAQGPLKSTAEDFWRMIWEHNVEVIVMITNLVEKGRRKCDQYWP--ADGSEEYGN
930 940 950 960 970 980
420 430 440 450 460 470
pF1KE5 LTVTNLGVENMNHYKKTTLEIHNTEER---QK-----RQVTHFQFLSWPDYGVPSSAASL
. ::. .:. . .: .. ..::. . :: : ::.... .:::.::: . .
CCDS56 FLVTQKSVQVLAYYTVRNFTLRNTKIKKGSQKGRPSGRVVTQYHYTQWPDMGVPEYSLPV
990 1000 1010 1020 1030 1040
480 490 500 510 520 530
pF1KE5 IDFLRVVRNQQSLAVSNMGARSKGQCPEPPIVVHCSAGIGRTGTFCSLDICLAQLEELGT
. :.: . . ::. :.:::::::.:::::. :: : :... ::
CCDS56 LTFVRKAAYAKRHAVG-------------PVVVHCSAGVGRTGTYIVLDSMLQQIQHEGT
1050 1060 1070 1080 1090
540 550 560 570 580
pF1KE5 LNVFQTVSRMRTQRAFSIQTPEQYYFCYKAILEFAEKEGMVSSGQNLLAVESQ
.:.: ....:.:: . .:: ::: : . ...:
CCDS56 VNIFGFLKHIRSQRNYLVQTEEQYVFIHDTLVEAILSKETEVLDSHIHAYVNALLIPGPA
1100 1110 1120 1130 1140 1150
CCDS56 GKTKLEKQFQLLSQSNIQQSDYSAALKQCNREKNRTSSIIPVERSRVGISSLSGEGTDYI
1160 1170 1180 1190 1200 1210
>--
initn: 371 init1: 179 opt: 383 Z-score: 435.4 bits: 91.8 E(32554): 6.2e-18
Smith-Waterman score: 383; 30.1% identity (60.6% similar) in 259 aa overlap (309-562:1173-1413)
280 290 300 310 320 330
pF1KE5 QELVDYVNARQKQGIYEEYEDIRRENPVGTFHCSMSPGNLEKNRYGDVPCLDQTRVKLTK
. ... : :::: ... ....:: ...
CCDS56 NALLIPGPAGKTKLEKQFQLLSQSNIQQSDYSAALKQCNREKNRTSSIIPVERSRVGISS
1150 1160 1170 1180 1190 1200
340 350 360 370 380 390
pF1KE5 RSGHTQTDYINASFMDGYKQKNAYIGTQGPLENTYRDFWLMVWEQKVLVIVMTTRFEEGG
::. :::::::.. :: :.: .: :: :: .: .::: :.:.... ..:: .. .
CCDS56 LSGEG-TDYINASYIMGYYQSNEFIITQHPLLHTIKDFWRMIWDHNAQLVVMIPDGQNMA
1210 1220 1230 1240 1250 1260
400 410 420 430 440 450
pF1KE5 RRKCGQYWPLEKDSRIRFGFLTVTNLGVEN--MNHYKKTTLE---IHNTEERQKRQVTHF
. . ::: .:: : . :: .. :. ... .: .. .. :.. .: ::
CCDS56 EDEF-VYWP-NKDEPINCESFKVTLMAEEHKCLSNEEKLIIQDFILEATQDDYVLEVRHF
1270 1280 1290 1300 1310
460 470 480 490 500 510
pF1KE5 QFLSWPDYGVPSSAASLIDFLRVVRNQQSLAVSNMGARSKGQCPEPPIVVHCSAGIGRTG
: .::. : : . .... :.... .: : :..:: : .:
CCDS56 QCPKWPNPDSPIS--KTFELISVIKEE--------AANRDG-----PMIVHDEHGGVTAG
1320 1330 1340 1350 1360
520 530 540 550 560 570
pF1KE5 TFCSLDICLAQLEELGTLNVFQTVSRMRTQRAFSIQTPEQYYFCYKAILEFAEKEGMVSS
:::.: . :::. ....:.:... . .: . ::: : ::.::
CCDS56 TFCALTTLMHQLEKENSVDVYQVAKMINLMRPGVFADIEQYQFLYKVILSLVSTRQEENP
1370 1380 1390 1400 1410 1420
580
pF1KE5 GQNLLAVESQ
CCDS56 STSLDSNGAALPDGNIAESLESLV
1430 1440
>>CCDS34740.1 PTPRZ1 gene_id:5803|Hs108|chr7 (2315 aa)
initn: 616 init1: 291 opt: 638 Z-score: 726.0 bits: 146.3 E(32554): 4.1e-34
Smith-Waterman score: 640; 37.1% identity (65.2% similar) in 310 aa overlap (275-563:1698-1991)
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 NGHPDRFDEIILFSLPPALDWDSVHVPGPHAMTIQELVDYV-NARQKQGIYEEYEDIRR-
:. :... .: . . ..:. ::.: ...
CCDS34 TAHFYLEDSTSPRVISTPPTPIFPISDDVGAIPIKHFPKHVADLHASSGFTEEFETLKEF
1670 1680 1690 1700 1710 1720
310 320 330 340 350
pF1KE5 -------ENPVG-TFHCSMSPGNLEKNRYGDVPCLDQTRVKLTK---RSGHTQTDYINAS
.: : : : : .:::: .. :..::::.. ..:. ::::::.
CCDS34 YQEVQSCTVDLGITADSSNHPDNKHKNRYINIVAYDHSRVKLAQLAEKDGKL-TDYINAN
1730 1740 1750 1760 1770 1780
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 FMDGYKQKNAYIGTQGPLENTYRDFWLMVWEQKVLVIVMTTRFEEGGRRKCGQYWPLEKD
..:::.. .:::..::::..: .::: :.::..: :::: : . : ::::: :::: :
CCDS34 YVDGYNRPKAYIAAQGPLKSTAEDFWRMIWEHNVEVIVMITNLVEKGRRKCDQYWP--AD
1790 1800 1810 1820 1830 1840
420 430 440 450 460
pF1KE5 SRIRFGFLTVTNLGVENMNHYKKTTLEIHNTEER---QK-----RQVTHFQFLSWPDYGV
. ..: . ::. .:. . .: .. ..::. . :: : ::.... .:::.::
CCDS34 GSEEYGNFLVTQKSVQVLAYYTVRNFTLRNTKIKKGSQKGRPSGRVVTQYHYTQWPDMGV
1850 1860 1870 1880 1890 1900
470 480 490 500 510 520
pF1KE5 PSSAASLIDFLRVVRNQQSLAVSNMGARSKGQCPEPPIVVHCSAGIGRTGTFCSLDICLA
: . .. :.: . . ::. :.:::::::.:::::. :: :
CCDS34 PEYSLPVLTFVRKAAYAKRHAVG-------------PVVVHCSAGVGRTGTYIVLDSMLQ
1910 1920 1930 1940 1950
530 540 550 560 570 580
pF1KE5 QLEELGTLNVFQTVSRMRTQRAFSIQTPEQYYFCYKAILEFAEKEGMVSSGQNLLAVESQ
:... ::.:.: ....:.:: . .:: ::: : . ...:
CCDS34 QIQHEGTVNIFGFLKHIRSQRNYLVQTEEQYVFIHDTLVEAILSKETEVLDSHIHAYVNA
1960 1970 1980 1990 2000 2010
CCDS34 LLIPGPAGKTKLEKQFQLLSQSNIQQSDYSAALKQCNREKNRTSSIIPVERSRVGISSLS
2020 2030 2040 2050 2060 2070
>--
initn: 371 init1: 179 opt: 383 Z-score: 432.3 bits: 91.9 E(32554): 9.3e-18
Smith-Waterman score: 383; 30.1% identity (60.6% similar) in 259 aa overlap (309-562:2040-2280)
280 290 300 310 320 330
pF1KE5 QELVDYVNARQKQGIYEEYEDIRRENPVGTFHCSMSPGNLEKNRYGDVPCLDQTRVKLTK
. ... : :::: ... ....:: ...
CCDS34 NALLIPGPAGKTKLEKQFQLLSQSNIQQSDYSAALKQCNREKNRTSSIIPVERSRVGISS
2010 2020 2030 2040 2050 2060
340 350 360 370 380 390
pF1KE5 RSGHTQTDYINASFMDGYKQKNAYIGTQGPLENTYRDFWLMVWEQKVLVIVMTTRFEEGG
::. :::::::.. :: :.: .: :: :: .: .::: :.:.... ..:: .. .
CCDS34 LSGEG-TDYINASYIMGYYQSNEFIITQHPLLHTIKDFWRMIWDHNAQLVVMIPDGQNMA
2070 2080 2090 2100 2110 2120
400 410 420 430 440 450
pF1KE5 RRKCGQYWPLEKDSRIRFGFLTVTNLGVEN--MNHYKKTTLE---IHNTEERQKRQVTHF
. . ::: .:: : . :: .. :. ... .: .. .. :.. .: ::
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: .::. : : . .... :.... .: : :..:: : .:
CCDS34 QCPKWPNPDSPIS--KTFELISVIKEE--------AANRDG-----PMIVHDEHGGVTAG
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pF1KE5 TFCSLDICLAQLEELGTLNVFQTVSRMRTQRAFSIQTPEQYYFCYKAILEFAEKEGMVSS
:::.: . :::. ....:.:... . .: . ::: : ::.::
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580
pF1KE5 GQNLLAVESQ
CCDS34 STSLDSNGAALPDGNIAESLESLV
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: : .... .:::.::: : .. :.: :. : .. :: :..:
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pF1KE5 -FAEKEGMVSSGQNLLAVESQ
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CCDS28 GGKTRLEKQFKLVTQCNAKYVECFSAQKECNKEKNRNSSVVPSERARVGLAPLPGMKGTD
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CCDS28 YINASYIMGYYRSNEFIITQHPLPHTTKDFWRMIWDHNAQIIVMLPDNQSLAEDEF-VYW
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CCDS28 PSREESMNCEAF-TVTLISKDRLCLSNEEQIIIHDFILEATQDDYVLEVRHFQCPKWPNP
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CCDS28 DAPIS--STFELINVIKEE---ALTRDG----------PTIVHDEYGAVSAGMLCALTTL
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pF1KE5 LAQLEELGTLNVFQTVSRMRTQRAFSIQTPEQYYFCYKAILEF-AEKE---GMVSSGQN-
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CCDS28 SQQLENENAVDVFQVAKMINLMRPGVFTDIEQYQFIYKAMLSLVSTKENGNGPMTVDKNG
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580
pF1KE5 --LLAVESQ
:.: ::
CCDS28 AVLIADESDPAESMESLV
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CCDS98 DMLRQQRMMLVQTLCQYTFVYRVLIQFLKSSRLI
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CCDS15 FLSYLEEIQSVRRHTNSMLEGTKNR----HPPIVVHCSAGVGRTGVLILSELMIYCLEHN
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CCDS15 EKVEVPMMLRLLREQRMFMIQTIAQYKFVYQVLIQFLQNSRLI
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CCDS12 YNMPQYILREFKVTDARDGQSRTVRQFQFTDWPEQGVPKSGEGFIDFIGQVHKTK-----
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CCDS12 MVQTEDEYQFCYQAALEYLGSFDHYAT
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CCDS12 EEKSRIKCDQYWP-NRGTET-YGFIQVTLLDTIELATFCVRTFSLHKNGSSEKREVRQFQ
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CCDS12 FTAWPDHGVPEYPTPFLAFLRRVKT----------------CNPPDAGPIVVHCSAGVGR
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CCDS12 TGCFIVIDAMLERIKPEKTVDVYGHVTLMRSQRNYMVQTEDQYSFIHEALLEAVGCGNTE
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CCDS12 VPARSLYAYIQKLAQVEPGEHVTGMELEFKRLANSKAHTSRFISANLPCNKFKNRLVNIM
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pF1KE5 PDRFDEIILFSLPPALDWDSVHVPGPHAMTIQELVDYVNARQKQGIYEEYEDI-RRENPV
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CCDS74 EDQYSFIHEALLEAVGCGNTEVPARSLYAYIQKLAQVEPGEHVTGMELEFKRLANSKAHT
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. : . : : ::: .. ..::: : : .:::::::.:::.:..:::.::
CCDS74 SRFISANLPCNKFKNRLVNIMPYESTRVCLQPIRGVEGSDYINASFIDGYRQQKAYIATQ
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CCDS74 GPLAETTEDFWRMLWENNSTIVVMLTKLREMGREKCHQYWPAERSAR--YQYFVVDPMAE
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pF1KE5 ENMNHYKKTTLEIHNTEERQKRQVTHFQFLSWPDYGVPSSAASLIDFLRVVRNQQSLAVS
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CCDS74 YNMPQYILREFKVTDARDGQSRTVRQFQFTDWPEQGVPKSGEGFIDFIGQVHKTK-----
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pF1KE5 NMGARSKGQCPEPPIVVHCSAGIGRTGTFCSLDICLAQLEELGTLNVFQTVSRMRTQRAF
.. :: . :: ::::::.::::.: .:.: : ... :....::::. .::::
CCDS74 ----EQFGQ--DGPISVHCSAGVGRTGVFITLSIVLERMRYEGVVDIFQTVKMLRTQRPA
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pF1KE5 SIQTPEQYYFCYKAILEFAEKEGMVSSGQNLLAVESQ
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CCDS74 MVQTEDEYQFCYQAALEYLGSFDHYAT
1480 1490 1500
>--
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pF1KE5 PRECLPENLGGYVKIDLATWNFQFLPQVNGHPDRFDEI--ILFSLPPALDWDSVHVPGPH
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CCDS74 LLYKNKPDSKRKDSEPRTKCLLNNADLAPHHPKDPVEMRRINFQTPGMLS----HPPIPI
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CCDS74 A-DMAEHTERLKANDSLKLSQEYESIDPGQQFTWEHSNLEV-NKPKNRYANVIAYDHSRV
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CCDS74 ILQPIEGIMGSDYINANYVDGYRCQNAYIATQGPLPETFGDFWRMVWEQRSATIVMMTRL
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CCDS12 TGCFIVIDAMLERIKPEKTVDVYGHVTLMRSQRNYMVQTEDQYSFIHEALLEAVGCGNTE
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]