Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5633
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5633, 492 aa
1>>>pF1KE5633 492 - 492 aa - 492 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5381+/-0.000912; mu= 16.5382+/- 0.055
mean_var=66.5682+/-13.503, 0's: 0 Z-trim(105.4): 28 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.157196
statistics sampled from 8377 (8397) to 8377 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.628), E-opt: 0.2 (0.258), width: 16
Scan time: 2.730
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS42981.1 TXNRD2 gene_id:10587|Hs108|chr22 ( 524) 3304 758.4 4.1e-219
CCDS63402.1 TXNRD2 gene_id:10587|Hs108|chr22 ( 338) 1932 447.2 1.3e-125
CCDS53823.1 TXNRD1 gene_id:7296|Hs108|chr12 ( 499) 1859 430.7 1.7e-120
CCDS53821.1 TXNRD1 gene_id:7296|Hs108|chr12 ( 551) 1859 430.8 1.9e-120
CCDS53820.1 TXNRD1 gene_id:7296|Hs108|chr12 ( 649) 1859 430.8 2.2e-120
CCDS77811.1 TXNRD3 gene_id:114112|Hs108|chr3 ( 643) 1830 424.2 2.1e-118
CCDS58274.1 TXNRD1 gene_id:7296|Hs108|chr12 ( 461) 1704 395.6 6.2e-110
CCDS77810.1 TXNRD3 gene_id:114112|Hs108|chr3 ( 607) 1343 313.7 3.5e-85
CCDS34877.1 GSR gene_id:2936|Hs108|chr8 ( 522) 958 226.4 5.8e-59
CCDS5749.1 DLD gene_id:1738|Hs108|chr7 ( 509) 575 139.5 8e-33
CCDS56531.1 GSR gene_id:2936|Hs108|chr8 ( 493) 567 137.7 2.7e-32
CCDS78269.1 DLD gene_id:1738|Hs108|chr7 ( 486) 500 122.5 1e-27
CCDS56532.1 GSR gene_id:2936|Hs108|chr8 ( 469) 460 113.4 5.3e-25
CCDS56530.1 GSR gene_id:2936|Hs108|chr8 ( 440) 459 113.2 5.9e-25
CCDS78268.1 DLD gene_id:1738|Hs108|chr7 ( 461) 446 110.3 4.7e-24
>>CCDS42981.1 TXNRD2 gene_id:10587|Hs108|chr22 (524 aa)
initn: 3304 init1: 3304 opt: 3304 Z-score: 4047.3 bits: 758.4 E(32554): 4.1e-219
Smith-Waterman score: 3304; 99.8% identity (99.8% similar) in 488 aa overlap (5-492:35-522)
10 20 30
pF1KE5 MEDQAGQRDYDLLVVGGGSGGLACAKEAAQLGRK
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 AVALRGLGGRFRWRTQAVAGGVRGAARGAAAGQRDYDLLVVGGGSGGLACAKEAAQLGRK
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE5 VAVVDYVEPSPQGTRWGLGGTCVNVGCIPKKLMHQAALLGGLIQDAPNYGWEVAQPVPHD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 VAVVDYVEPSPQGTRWGLGGTCVNVGCIPKKLMHQAALLGGLIQDAPNYGWEVAQPVPHD
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE5 WRKMAEAVQNHVKSLNWGHRVQLQDRKVKYFNIKASFVDEHTVCGVAKGGKEILLSADHI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 WRKMAEAVQNHVKSLNWGHRVQLQDRKVKYFNIKASFVDEHTVCGVAKGGKEILLSADHI
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KE5 IIATGGRPRYPTHIEGALEYGITSDDIFWLKESPGKTLVVGASYVALECAGFLTGIGLDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 IIATGGRPRYPTHIEGALEYGITSDDIFWLKESPGKTLVVGASYVALECAGFLTGIGLDT
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KE5 TIMMRSIPLRGFDQQMSSMVIEHMASHGTRFLRGCAPSRVRRLPDGQLQVTWEDSTTGKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 TIMMRSIPLRGFDQQMSSMVIEHMASHGTRFLRGCAPSRVRRLPDGQLQVTWEDSTTGKE
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KE5 DTGTFDTVLWAIGRVPDTRSLNLEKAGVDTSPDTQKILVDSREATSVPHIYAIGDVVEGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 DTGTFDTVLWAIGRVPDTRSLNLEKAGVDTSPDTQKILVDSREATSVPHIYAIGDVVEGR
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KE5 PELTPTAIMAGRLLVQRLFGGSSDLMDYDNVPTTVFTPLEYGCVGLSEEEAVARHGQEHV
::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 PELTPIAIMAGRLLVQRLFGGSSDLMDYDNVPTTVFTPLEYGCVGLSEEEAVARHGQEHV
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
pF1KE5 EVYHAHYKPLEFTVAGRDASQCYVKMVCLREPPQLVLGLHFLGPNAGEVTQGFALGIKCG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 EVYHAHYKPLEFTVAGRDASQCYVKMVCLREPPQLVLGLHFLGPNAGEVTQGFALGIKCG
430 440 450 460 470 480
460 470 480 490
pF1KE5 ASYAQVMRTVGIHPTCSEEVVKLRISKRSGLDPTVTGC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 ASYAQVMRTVGIHPTCSEEVVKLRISKRSGLDPTVTGCCG
490 500 510 520
>>CCDS63402.1 TXNRD2 gene_id:10587|Hs108|chr22 (338 aa)
initn: 1932 init1: 1932 opt: 1932 Z-score: 2368.7 bits: 447.2 E(32554): 1.3e-125
Smith-Waterman score: 1932; 100.0% identity (100.0% similar) in 282 aa overlap (5-286:35-316)
10 20 30
pF1KE5 MEDQAGQRDYDLLVVGGGSGGLACAKEAAQLGRK
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 AVALRGLGGRFRWRTQAVAGGVRGAARGAAAGQRDYDLLVVGGGSGGLACAKEAAQLGRK
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE5 VAVVDYVEPSPQGTRWGLGGTCVNVGCIPKKLMHQAALLGGLIQDAPNYGWEVAQPVPHD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 VAVVDYVEPSPQGTRWGLGGTCVNVGCIPKKLMHQAALLGGLIQDAPNYGWEVAQPVPHD
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE5 WRKMAEAVQNHVKSLNWGHRVQLQDRKVKYFNIKASFVDEHTVCGVAKGGKEILLSADHI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 WRKMAEAVQNHVKSLNWGHRVQLQDRKVKYFNIKASFVDEHTVCGVAKGGKEILLSADHI
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KE5 IIATGGRPRYPTHIEGALEYGITSDDIFWLKESPGKTLVVGASYVALECAGFLTGIGLDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 IIATGGRPRYPTHIEGALEYGITSDDIFWLKESPGKTLVVGASYVALECAGFLTGIGLDT
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KE5 TIMMRSIPLRGFDQQMSSMVIEHMASHGTRFLRGCAPSRVRRLPDGQLQVTWEDSTTGKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 TIMMRSIPLRGFDQQMSSMVIEHMASHGTRFLRGCAPSRVRRLPDGQLQVTWEDSTTGKE
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KE5 DTGTFDTVLWAIGRVPDTRSLNLEKAGVDTSPDTQKILVDSREATSVPHIYAIGDVVEGR
::::::::::::
CCDS63 DTGTFDTVLWAIAPCISACLPTTVGHAGKNQRRD
310 320 330
>>CCDS53823.1 TXNRD1 gene_id:7296|Hs108|chr12 (499 aa)
initn: 1850 init1: 787 opt: 1859 Z-score: 2276.6 bits: 430.7 E(32554): 1.7e-120
Smith-Waterman score: 1859; 55.9% identity (78.1% similar) in 494 aa overlap (2-492:5-497)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MEDQAGQRDYDLLVVGGGSGGLACAKEAAQLGRKVAVVDYVEPSPQGTRWGLGGTCV
:: . ::::...:::::::: :::::: :.:: :.:.: :.: :::::::::::
CCDS53 MNGPEDLPKSYDYDLIIIGGGSGGLAAAKEAAQYGKKVMVLDFVTPTPLGTRWGLGGTCV
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 NVGCIPKKLMHQAALLGGLIQDAPNYGWEVAQPVPHDWRKMAEAVQNHVKSLNWGHRVQL
::::::::::::::::: .::. ::::.: . : ::: .: ::::::. :::::.:: :
CCDS53 NVGCIPKKLMHQAALLGQALQDSRNYGWKVEETVKHDWDRMIEAVQNHIGSLNWGYRVAL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 QDRKVKYFNIKASFVDEHTVCGVAKGGKEILLSADHIIIATGGRPRYPTHIEGALEYGIT
...:: : : ..:. : . .. . ::: . ::....:::: :::: : : :: :.
CCDS53 REKKVVYENAYGQFIGPHRIKATNNKGKEKIYSAERFLIATGERPRY-LGIPGDKEYCIS
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 SDDIFWLKESPGKTLVVGASYVALECAGFLTGIGLDTTIMMRSIPLRGFDQQMSSMVIEH
:::.: : ::::::::::::::::::::.:::::.:.:.::: ::::::.:.. . ::
CCDS53 SDDLFSLPYCPGKTLVVGASYVALECAGFLAGIGLDVTVMVRSILLRGFDQDMANKIGEH
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 MASHGTRFLRGCAPSRVRRLP---DGQLQVTWEDSTTGKEDTGTFDTVLWAIGRVPDTRS
: :: .:.: .: .:... :.:.:. ..... . : ..::. :::: ::.
CCDS53 MEEHGIKFIRQFVPIKVEQIEAGTPGRLRVVAQSTNSEEIIEGEYNTVMLAIGRDACTRK
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 LNLEKAGVDTSPDTQKILVDSREATSVPHIYAIGDVVEGRPELTPTAIMAGRLLVQRLFG
..:: .:: . : :: : ..: :.::.::::::..: . ::::.::.:::::.:::..
CCDS53 IGLETVGVKINEKTGKIPVTDEEQTNVPYIYAIGDILEDKVELTPVAIQAGRLLAQRLYA
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 GSSDLMDYDNVPTTVFTPLEYGCVGLSEEEAVARHGQEHVEVYHAHYKPLEFTVAGRDAS
::. ::.::::::::::::: :::::.:: . :.:..::::... :::.:. .:: .
CCDS53 GSTVKCDYENVPTTVFTPLEYGACGLSEEKAVEKFGEENIEVYHSYFWPLEWTIPSRDNN
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE5 QCYVKMVCLREPPQLVLGLHFLGPNAGEVTQGFALGIKCGASYAQVMRTVGIHPTCSEEV
.::.:..: . . :.:.: ::::::::::::: ..::: . :. :.::::.:.:
CCDS53 KCYAKIICNTKDNERVVGFHVLGPNAGEVTQGFAAALKCGLTKKQLDSTIGIHPVCAEVF
420 430 440 450 460 470
480 490
pF1KE5 VKLRISKRSGLDPTVTGC
. : ..:::: . .::
CCDS53 TTLSVTKRSGASILQAGCCG
480 490
>>CCDS53821.1 TXNRD1 gene_id:7296|Hs108|chr12 (551 aa)
initn: 1850 init1: 787 opt: 1859 Z-score: 2275.9 bits: 430.8 E(32554): 1.9e-120
Smith-Waterman score: 1859; 55.9% identity (78.1% similar) in 494 aa overlap (2-492:57-549)
10 20 30
pF1KE5 MEDQAGQRDYDLLVVGGGSGGLACAKEAAQL
:: . ::::...:::::::: ::::::
CCDS53 VKQRKIGGHGPTLKAYQEGRLQKLLKMNGPEDLPKSYDYDLIIIGGGSGGLAAAKEAAQY
30 40 50 60 70 80
40 50 60 70 80 90
pF1KE5 GRKVAVVDYVEPSPQGTRWGLGGTCVNVGCIPKKLMHQAALLGGLIQDAPNYGWEVAQPV
:.:: :.:.: :.: :::::::::::::::::::::::::::: .::. ::::.: . :
CCDS53 GKKVMVLDFVTPTPLGTRWGLGGTCVNVGCIPKKLMHQAALLGQALQDSRNYGWKVEETV
90 100 110 120 130 140
100 110 120 130 140 150
pF1KE5 PHDWRKMAEAVQNHVKSLNWGHRVQLQDRKVKYFNIKASFVDEHTVCGVAKGGKEILLSA
::: .: ::::::. :::::.:: :...:: : : ..:. : . .. . ::: . ::
CCDS53 KHDWDRMIEAVQNHIGSLNWGYRVALREKKVVYENAYGQFIGPHRIKATNNKGKEKIYSA
150 160 170 180 190 200
160 170 180 190 200 210
pF1KE5 DHIIIATGGRPRYPTHIEGALEYGITSDDIFWLKESPGKTLVVGASYVALECAGFLTGIG
....:::: :::: : : :: :.:::.: : ::::::::::::::::::::.:::
CCDS53 ERFLIATGERPRY-LGIPGDKEYCISSDDLFSLPYCPGKTLVVGASYVALECAGFLAGIG
210 220 230 240 250 260
220 230 240 250 260
pF1KE5 LDTTIMMRSIPLRGFDQQMSSMVIEHMASHGTRFLRGCAPSRVRRLP---DGQLQVTWED
::.:.:.::: ::::::.:.. . ::: :: .:.: .: .:... :.:.:. ..
CCDS53 LDVTVMVRSILLRGFDQDMANKIGEHMEEHGIKFIRQFVPIKVEQIEAGTPGRLRVVAQS
270 280 290 300 310 320
270 280 290 300 310 320
pF1KE5 STTGKEDTGTFDTVLWAIGRVPDTRSLNLEKAGVDTSPDTQKILVDSREATSVPHIYAIG
... . : ..::. :::: ::...:: .:: . : :: : ..: :.::.:::::
CCDS53 TNSEEIIEGEYNTVMLAIGRDACTRKIGLETVGVKINEKTGKIPVTDEEQTNVPYIYAIG
330 340 350 360 370 380
330 340 350 360 370 380
pF1KE5 DVVEGRPELTPTAIMAGRLLVQRLFGGSSDLMDYDNVPTTVFTPLEYGCVGLSEEEAVAR
:..: . ::::.::.:::::.:::..::. ::.::::::::::::: :::::.:: .
CCDS53 DILEDKVELTPVAIQAGRLLAQRLYAGSTVKCDYENVPTTVFTPLEYGACGLSEEKAVEK
390 400 410 420 430 440
390 400 410 420 430 440
pF1KE5 HGQEHVEVYHAHYKPLEFTVAGRDASQCYVKMVCLREPPQLVLGLHFLGPNAGEVTQGFA
:.:..::::... :::.:. .:: ..::.:..: . . :.:.: :::::::::::::
CCDS53 FGEENIEVYHSYFWPLEWTIPSRDNNKCYAKIICNTKDNERVVGFHVLGPNAGEVTQGFA
450 460 470 480 490 500
450 460 470 480 490
pF1KE5 LGIKCGASYAQVMRTVGIHPTCSEEVVKLRISKRSGLDPTVTGC
..::: . :. :.::::.:.: . : ..:::: . .::
CCDS53 AALKCGLTKKQLDSTIGIHPVCAEVFTTLSVTKRSGASILQAGCCG
510 520 530 540 550
>>CCDS53820.1 TXNRD1 gene_id:7296|Hs108|chr12 (649 aa)
initn: 1850 init1: 787 opt: 1859 Z-score: 2274.8 bits: 430.8 E(32554): 2.2e-120
Smith-Waterman score: 1859; 55.9% identity (78.1% similar) in 494 aa overlap (2-492:155-647)
10 20 30
pF1KE5 MEDQAGQRDYDLLVVGGGSGGLACAKEAAQL
:: . ::::...:::::::: ::::::
CCDS53 VKQRKIGGHGPTLKAYQEGRLQKLLKMNGPEDLPKSYDYDLIIIGGGSGGLAAAKEAAQY
130 140 150 160 170 180
40 50 60 70 80 90
pF1KE5 GRKVAVVDYVEPSPQGTRWGLGGTCVNVGCIPKKLMHQAALLGGLIQDAPNYGWEVAQPV
:.:: :.:.: :.: :::::::::::::::::::::::::::: .::. ::::.: . :
CCDS53 GKKVMVLDFVTPTPLGTRWGLGGTCVNVGCIPKKLMHQAALLGQALQDSRNYGWKVEETV
190 200 210 220 230 240
100 110 120 130 140 150
pF1KE5 PHDWRKMAEAVQNHVKSLNWGHRVQLQDRKVKYFNIKASFVDEHTVCGVAKGGKEILLSA
::: .: ::::::. :::::.:: :...:: : : ..:. : . .. . ::: . ::
CCDS53 KHDWDRMIEAVQNHIGSLNWGYRVALREKKVVYENAYGQFIGPHRIKATNNKGKEKIYSA
250 260 270 280 290 300
160 170 180 190 200 210
pF1KE5 DHIIIATGGRPRYPTHIEGALEYGITSDDIFWLKESPGKTLVVGASYVALECAGFLTGIG
....:::: :::: : : :: :.:::.: : ::::::::::::::::::::.:::
CCDS53 ERFLIATGERPRY-LGIPGDKEYCISSDDLFSLPYCPGKTLVVGASYVALECAGFLAGIG
310 320 330 340 350 360
220 230 240 250 260
pF1KE5 LDTTIMMRSIPLRGFDQQMSSMVIEHMASHGTRFLRGCAPSRVRRLP---DGQLQVTWED
::.:.:.::: ::::::.:.. . ::: :: .:.: .: .:... :.:.:. ..
CCDS53 LDVTVMVRSILLRGFDQDMANKIGEHMEEHGIKFIRQFVPIKVEQIEAGTPGRLRVVAQS
370 380 390 400 410 420
270 280 290 300 310 320
pF1KE5 STTGKEDTGTFDTVLWAIGRVPDTRSLNLEKAGVDTSPDTQKILVDSREATSVPHIYAIG
... . : ..::. :::: ::...:: .:: . : :: : ..: :.::.:::::
CCDS53 TNSEEIIEGEYNTVMLAIGRDACTRKIGLETVGVKINEKTGKIPVTDEEQTNVPYIYAIG
430 440 450 460 470 480
330 340 350 360 370 380
pF1KE5 DVVEGRPELTPTAIMAGRLLVQRLFGGSSDLMDYDNVPTTVFTPLEYGCVGLSEEEAVAR
:..: . ::::.::.:::::.:::..::. ::.::::::::::::: :::::.:: .
CCDS53 DILEDKVELTPVAIQAGRLLAQRLYAGSTVKCDYENVPTTVFTPLEYGACGLSEEKAVEK
490 500 510 520 530 540
390 400 410 420 430 440
pF1KE5 HGQEHVEVYHAHYKPLEFTVAGRDASQCYVKMVCLREPPQLVLGLHFLGPNAGEVTQGFA
:.:..::::... :::.:. .:: ..::.:..: . . :.:.: :::::::::::::
CCDS53 FGEENIEVYHSYFWPLEWTIPSRDNNKCYAKIICNTKDNERVVGFHVLGPNAGEVTQGFA
550 560 570 580 590 600
450 460 470 480 490
pF1KE5 LGIKCGASYAQVMRTVGIHPTCSEEVVKLRISKRSGLDPTVTGC
..::: . :. :.::::.:.: . : ..:::: . .::
CCDS53 AALKCGLTKKQLDSTIGIHPVCAEVFTTLSVTKRSGASILQAGCCG
610 620 630 640
>>CCDS77811.1 TXNRD3 gene_id:114112|Hs108|chr3 (643 aa)
initn: 1795 init1: 799 opt: 1830 Z-score: 2239.3 bits: 424.2 E(32554): 2.1e-118
Smith-Waterman score: 1830; 56.2% identity (77.4% similar) in 495 aa overlap (2-492:151-641)
10 20 30
pF1KE5 MEDQAGQRDYDLLVVGGGSGGLACAKEAAQL
:: : ::::...:::::::.:::::: :
CCDS77 PNIFVNKVHVGGCDQTFQAYQSGLLQKLLQEDLA--YDYDLIIIGGGSGGLSCAKEAAIL
130 140 150 160 170
40 50 60 70 80 90
pF1KE5 GRKVAVVDYVEPSPQGTRWGLGGTCVNVGCIPKKLMHQAALLGGLIQDAPNYGWEVAQPV
:.:: :.:.: :::::: ::::::::::::::::::::::::: . :. ..::: : :
CCDS77 GKKVMVLDFVVPSPQGTSWGLGGTCVNVGCIPKKLMHQAALLGQALCDSRKFGWEYNQQV
180 190 200 210 220 230
100 110 120 130 140 150
pF1KE5 PHDWRKMAEAVQNHVKSLNWGHRVQLQDRKVKYFNIKASFVDEHTVCGVAKGGKEILLSA
:.:. :..:.:::..:::::.:..:... : : : . ::..: . .. : :.: .:
CCDS77 RHNWETMTKAIQNHISSLNWGYRLSLREKAVAYVNSYGEFVEHHKIKATNKKGQETYYTA
240 250 260 270 280 290
160 170 180 190 200 210
pF1KE5 DHIIIATGGRPRYPTHIEGALEYGITSDDIFWLKESPGKTLVVGASYVALECAGFLTGIG
...:::: :::: :.: :: :::::.: : ::::::::::::::::::::.:.:
CCDS77 AQFVIATGERPRY-LGIQGDKEYCITSDDLFSLPYCPGKTLVVGASYVALECAGFLAGFG
300 310 320 330 340 350
220 230 240 250 260
pF1KE5 LDTTIMMRSIPLRGFDQQMSSMVIEHMASHGTRFLRGCAPSRVRRLPDG---QLQVTWED
::.:.:.::: ::::::.:. : .: .::..::: : :..: : .:.:
CCDS77 LDVTVMVRSILLRGFDQEMAEKVGSYMEQHGVKFLRKFIPVMVQQLEKGSPGKLKVL-AK
360 370 380 390 400 410
270 280 290 300 310 320
pF1KE5 STTGKEDT-GTFDTVLWAIGRVPDTRSLNLEKAGVDTSPDTQKILVDSREATSVPHIYAI
:: : : :...::: :::: ::...::: :: . . :: :.. : :.::..::.
CCDS77 STEGTETIEGVYNTVLLAIGRDSCTRKIGLEKIGVKINEKSGKIPVNDVEQTNVPYVYAV
420 430 440 450 460 470
330 340 350 360 370 380
pF1KE5 GDVVEGRPELTPTAIMAGRLLVQRLFGGSSDLMDYDNVPTTVFTPLEYGCVGLSEEEAVA
::..: .:::::.::..:.::.:::::.: . :: :::::::::::::: :::::.:.
CCDS77 GDILEDKPELTPVAIQSGKLLAQRLFGASLEKCDYINVPTTVFTPLEYGCCGLSEEKAIE
480 490 500 510 520 530
390 400 410 420 430 440
pF1KE5 RHGQEHVEVYHAHYKPLEFTVAGRDASQCYVKMVCLREPPQLVLGLHFLGPNAGEVTQGF
. .:..:.::. . :::.:::::. . ::.:..: . . :.:.:.::::::::::::
CCDS77 VYKKENLEIYHTLFWPLEWTVAGRENNTCYAKIICNKFDHDRVIGFHILGPNAGEVTQGF
540 550 560 570 580 590
450 460 470 480 490
pF1KE5 ALGIKCGASYAQVMRTVGIHPTCSEEVVKLRISKRSGLDPTVTGC
: ..::: . . :.::::::.: . :.:.: :::: : ::
CCDS77 AAAMKCGLTKQLLDDTIGIHPTCGEVFTTLEITKSSGLDITQKGCCG
600 610 620 630 640
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10 20 30 40 50 60
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:.:.: :.: ::::::::::::::::::::
CCDS58 MVLDFVTPTPLGTRWGLGGTCVNVGCIPKKL
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 MHQAALLGGLIQDAPNYGWEVAQPVPHDWRKMAEAVQNHVKSLNWGHRVQLQDRKVKYFN
:::::::: .::. ::::.: . : ::: .: ::::::. :::::.:: :...:: : :
CCDS58 MHQAALLGQALQDSRNYGWKVEETVKHDWDRMIEAVQNHIGSLNWGYRVALREKKVVYEN
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 IKASFVDEHTVCGVAKGGKEILLSADHIIIATGGRPRYPTHIEGALEYGITSDDIFWLKE
..:. : . .. . ::: . ::....:::: :::: : : :: :.:::.: :
CCDS58 AYGQFIGPHRIKATNNKGKEKIYSAERFLIATGERPRY-LGIPGDKEYCISSDDLFSLPY
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 SPGKTLVVGASYVALECAGFLTGIGLDTTIMMRSIPLRGFDQQMSSMVIEHMASHGTRFL
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CCDS58 CPGKTLVVGASYVALECAGFLAGIGLDVTVMVRSILLRGFDQDMANKIGEHMEEHGIKFI
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 RGCAPSRVRRLP---DGQLQVTWEDSTTGKEDTGTFDTVLWAIGRVPDTRSLNLEKAGVD
: .: .:... :.:.:. ..... . : ..::. :::: ::...:: .::
CCDS58 RQFVPIKVEQIEAGTPGRLRVVAQSTNSEEIIEGEYNTVMLAIGRDACTRKIGLETVGVK
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 TSPDTQKILVDSREATSVPHIYAIGDVVEGRPELTPTAIMAGRLLVQRLFGGSSDLMDYD
. : :: : ..: :.::.::::::..: . ::::.::.:::::.:::..::. ::.
CCDS58 INEKTGKIPVTDEEQTNVPYIYAIGDILEDKVELTPVAIQAGRLLAQRLYAGSTVKCDYE
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 NVPTTVFTPLEYGCVGLSEEEAVARHGQEHVEVYHAHYKPLEFTVAGRDASQCYVKMVCL
::::::::::::: :::::.:: . :.:..::::... :::.:. .:: ..::.:..:
CCDS58 NVPTTVFTPLEYGACGLSEEKAVEKFGEENIEVYHSYFWPLEWTIPSRDNNKCYAKIICN
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KE5 REPPQLVLGLHFLGPNAGEVTQGFALGIKCGASYAQVMRTVGIHPTCSEEVVKLRISKRS
. . :.:.: ::::::::::::: ..::: . :. :.::::.:.: . : ..:::
CCDS58 TKDNERVVGFHVLGPNAGEVTQGFAAALKCGLTKKQLDSTIGIHPVCAEVFTTLSVTKRS
400 410 420 430 440 450
490
pF1KE5 GLDPTVTGC
: . .::
CCDS58 GASILQAGCCG
460
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10 20 30
pF1KE5 MEDQAGQRDYDLLVVGGGSGGLACAKEAAQL
:: : ::::...:::::::.:::::: :
CCDS77 PNIFVNKVHVGGCDQTFQAYQSGLLQKLLQEDLA--YDYDLIIIGGGSGGLSCAKEAAIL
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pF1KE5 GRKVAVVDYVEPSPQGTRWGLGGTCVNVGCIPKKLMHQAALLGGLIQDAPNYGWEVAQPV
:.:: :.:.: :::::: ::::::::::::::::::::::::: . :. ..::: : :
CCDS77 GKKVMVLDFVVPSPQGTSWGLGGTCVNVGCIPKKLMHQAALLGQALCDSRKFGWEYNQQV
180 190 200 210 220 230
100 110 120 130 140 150
pF1KE5 PHDWRKMAEAVQNHVKSLNWGHRVQLQDRKVKYFNIKASFVDEHTVCGVAKGGKEILLSA
:.:. :..:.:::..:::::.:..:... : : : . ::..: . .. : :.: .:
CCDS77 RHNWETMTKAIQNHISSLNWGYRLSLREKAVAYVNSYGEFVEHHKIKATNKKGQETYYTA
240 250 260 270 280 290
160 170 180 190 200 210
pF1KE5 DHIIIATGGRPRYPTHIEGALEYGITSDDIFWLKESPGKTLVVGASYVALECAGFLTGIG
...:::: :::: :.: :: :::::.: : ::::::::::::::::::::.:.:
CCDS77 AQFVIATGERPRY-LGIQGDKEYCITSDDLFSLPYCPGKTLVVGASYVALECAGFLAGFG
300 310 320 330 340 350
220 230 240 250 260
pF1KE5 LDTTIMMRSIPLRGFDQQMSSMVIEHMASHGTRFLRGCAPSRVRRLPDG---QLQVTWED
::.:.:.::: ::::::.:. : .: .::..::: : :..: : .:.:
CCDS77 LDVTVMVRSILLRGFDQEMAEKVGSYMEQHGVKFLRKFIPVMVQQLEKGSPGKLKVL-AK
360 370 380 390 400 410
270 280 290 300 310 320
pF1KE5 STTGKEDT-GTFDTVLWAIGRVPDTRSLNLEKAGVDTSPDTQKILVDSREATSVPHIYAI
:: : : :...::: :::: ::...::: :: . . :: :.. : :.::..::.
CCDS77 STEGTETIEGVYNTVLLAIGRDSCTRKIGLEKIGVKINEKSGKIPVNDVEQTNVPYVYAV
420 430 440 450 460 470
330 340 350 360 370 380
pF1KE5 GDVVEGRPELTPTAIMAGRLLVQRLFGGSSDLMDYDNVPTTVFTPLEYGCVGLSEEEAVA
::..: .:::::.::..:.::.:::::.: ::
CCDS77 GDILEDKPELTPVAIQSGKLLAQRLFGAS----------------LE-------------
480 490 500
390 400 410 420 430 440
pF1KE5 RHGQEHVEVYHAHYKPLEFTVAGRDASQCYVKMVCLREPPQLVLGLHFLGPNAGEVTQGF
..::. . :::.:::::. . ::.:..: . . :.:.:.::::::::::::
CCDS77 -------KIYHTLFWPLEWTVAGRENNTCYAKIICNKFDHDRVIGFHILGPNAGEVTQGF
510 520 530 540 550 560
450 460 470 480 490
pF1KE5 ALGIKCGASYAQVMRTVGIHPTCSEEVVKLRISKRSGLDPTVTGC
: ..::: . . :.::::::.: . :.:.: :::: : ::
CCDS77 AAAMKCGLTKQLLDDTIGIHPTCGEVFTTLEITKSSGLDITQKGCCG
570 580 590 600
>>CCDS34877.1 GSR gene_id:2936|Hs108|chr8 (522 aa)
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10 20 30
pF1KE5 MEDQAGQRDYDLLVVGGGSGGLACAKEAAQLGRKVAVVD
:: ::.:::::::: :..::.:: ..:::.
CCDS34 ALTRALSRAMACRQEPQPQGPPPAAGAVASYDYLVIGGGSGGLASARRAAELGARAAVVE
40 50 60 70 80 90
40 50 60 70 80 90
pF1KE5 YVEPSPQGTRWGLGGTCVNVGCIPKKLMHQAALLGGLIQDAPNYGWEVAQPVPHDWRKMA
: . ::::::::::.:::.: ..:. . ...: .::. . .:: .
CCDS34 ----SHK-----LGGTCVNVGCVPKKVMWNTAVHSEFMHDHADYGFPSCEG-KFNWRVIK
100 110 120 130 140
100 110 120 130 140 150
pF1KE5 EAVQNHVKSLNWGHRVQLQDRKVKYFNIKASFVDEHTVCGVAKGGKEILLSADHIIIATG
: . .:. :: .. .: ... . .:.:... . .::. .: ::.::::
CCDS34 EKRDAYVSRLNAIYQNNLTKSHIEIIRGHAAFTSDPKPT-IEVSGKKY--TAPHILIATG
150 160 170 180 190 200
160 170 180 190 200 210
pF1KE5 GRPRYP--THIEGALEYGITSDDIFWLKESPGKTLVVGASYVALECAGFLTGIGLDTTIM
: : : ..: :: ::::: .: :.: ::....:::.:.:.: ::.:...: :..:
CCDS34 GMPSTPHESQIPGA-SLGITSDGFFQLEELPGRSVIVGAGYIAVEMAGILSALGSKTSLM
210 220 230 240 250 260
220 230 240 250 260 270
pF1KE5 MRSIP-LRGFDQQMSSMVIEHMASHGTRFLRGCAPSRVRRLPDGQLQVTWEDSTTGKEDT
.: ::.::...:. :.. . :.. :. ..:.. .: :.:. .. :. .
CCDS34 IRHDKVLRSFDSMISTNCTEELENAGVEVLKFSQVKEVKKTLSG-LEVSMVTAVPGRLPV
270 280 290 300 310
280 290 300 310 320 330
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:. : .::::::::.:..:.:.: :..:. : .:.:: . :.: :::.:::
CCDS34 MTMIPDVDCLLWAIGRVPNTKDLSLNKLGIQTD-DKGHIIVDEFQNTNVKGIYAVGDVC-
320 330 340 350 360 370
340 350 360 370 380 390
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:. :::.:: ::: :..::: . : .::.:.::.::. : :::.:.::. ..:
CCDS34 GKALLTPVAIAAGRKLAHRLFEYKEDSKLDYNNIPTVVFSHPPIGTVGLTEDEAIHKYGI
380 390 400 410 420 430
400 410 420 430 440 450
pF1KE5 EHVEVYHAHYKPLEFTVAGRDASQCYVKMVCLREPPQLVLGLHFLGPNAGEVTQGFALGI
:.:..: . . :. .:. : ..: .:::: . . :.:.:. : . :. ::::...
CCDS34 ENVKTYSTSFTPMYHAVTKRK-TKCVMKMVCANKEEK-VVGIHMQGLGCDEMLQGFAVAV
440 450 460 470 480 490
460 470 480 490
pF1KE5 KCGASYAQVMRTVGIHPTCSEEVVKLRISKRSGLDPTVTGC
: ::. :. ::.:::: :::.: ::
CCDS34 KMGATKADFDNTVAIHPTSSEELVTLR
500 510 520
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10 20 30
pF1KE5 MEDQAGQRDYDLLVVGGGSGGLACAKEAAQLGRKVAVV
: :. :.:.: :: . : .::::: :.. .
CCDS57 LAKRGHFNRISHGLQGLSAVPLRTYADQPIDADVTVIGSGPGGYVAAIKAAQLGFKTVCI
20 30 40 50 60 70
40 50 60 70 80 90
pF1KE5 DYVEPSPQGTRWGLGGTCVNVGCIPKKLM----HQAALLGGLIQDAPNYGWEVAQPVPHD
. : :::::.::::::.: . : . : .: . : :... : .
CCDS57 EKNET--------LGGTCLNVGCIPSKALLNNSHYYHMAHG--KDFASRGIEMSE-VRLN
80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KE5 WRKMAEAVQNHVKSLNWGHRVQLQDRKVKYFNIKASFVDEHTVCGV-AKGGKEILLSADH
:: : .. ::.:. : ... :: . : .... .. : .. : :: ... .. .
CCDS57 LDKMMEQKSTAVKALTGGIAHLFKQNKVVHVNGYGKITGKNQVTATKADGGTQVI-DTKN
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KE5 IIIATGGRPRYPTHIEGALEYGITSDDIFWLKESPGKTLVVGASYVALECAGFLTGIGLD
:.::::.. : . ..: . ::. : : .:.::. ...: .. .: :
CCDS57 ILIATGSEVTPFPGITIDEDTIVSSTGALSLKKVPEKMVVIGAGVIGVELGSVWQRLGAD
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KE5 TTIM--MRSIPLRGFDQQMSSMVIEHMASHGTRFLRGCAPSRVRRLPDGQLQVTWEDSTT
.: . . . :.:...:. . . ..: .: . . . . ::...:. : ..
CCDS57 VTAVEFLGHVGGVGIDMEISKNFQRILQKQGFKFKLNTKVTGATKKSDGKIDVSIEAASG
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KE5 GKEDTGTFDTVLWAIGRVPDTRSLNLEKAGVDTSPDTQKILVDSREATSVPHIYAIGDVV
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CCDS57 GKAEVITCDVLLVCIGRRPFTKNLGLEELGIELDP-RGRIPVNTRFQTKIPNIYAIGDVV
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KE5 EGRPELTPTAIMAGRLLVQRLFGGSSDLMDYDNVPTTVFTPLEYGCVGLSEEEAVARHGQ
: : :. : : . :. . ::. . ::. ::....: : . :: :::. .
CCDS57 AG-PMLAHKAEDEGIICVEGMAGGAVHI-DYNCVPSVIYTHPEVAWVGKSEEQL----KE
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KE5 EHVEVYHAHYKPLEFTVAGRDA-SQCYVKMVCLREPPQLVLGLHFLGPNAGEVTQGFALG
: .: ... . : .: .. .::.. . . ::: :.:::.:::... ::.
CCDS57 EGIEYKVGKFPFAANSRAKTNADTDGMVKILGQKSTDR-VLGAHILGPGAGEMVNEAALA
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490
pF1KE5 IKCGASYAQVMRTVGIHPTCSEEVVKLRISKRSGLDPTVTGC
.. ::: .. :. ::: ::
CCDS57 LEYGASCEDIARVCHAHPTLSEAFREANLAASFGKSINF
480 490 500
492 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 05:22:36 2016 done: Tue Nov 8 05:22:37 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]