Result of FASTA (omim) for
pFN21AE5621
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5621, 512 aa
1>>>pF1KE5621 512 - 512 aa - 512 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7244+/-0.000411; mu= 15.4775+/- 0.025
mean_var=67.1591+/-13.466, 0's: 0 Z-trim(111.8): 53 B-trim: 474 in 1/50
Lambda= 0.156503
statistics sampled from 20463 (20516) to 20463 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.608), E-opt: 0.2 (0.241), width: 16
Scan time: 9.480
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001085 (OMIM: 601784) acid-sensing ion channel ( 512) 3441 786.3 0
NP_899233 (OMIM: 601784) acid-sensing ion channel ( 563) 2572 590.1 5.8e-168
NP_001086 (OMIM: 602866) acid-sensing ion channel ( 528) 2356 541.3 2.6e-153
XP_011536654 (OMIM: 602866) PREDICTED: acid-sensin ( 529) 2344 538.6 1.7e-152
NP_064423 (OMIM: 602866) acid-sensing ion channel ( 574) 2169 499.1 1.5e-140
NP_001243759 (OMIM: 602866) acid-sensing ion chann ( 562) 1757 406.1 1.4e-112
XP_011536653 (OMIM: 602866) PREDICTED: acid-sensin ( 559) 1634 378.3 3.3e-104
XP_011536652 (OMIM: 602866) PREDICTED: acid-sensin ( 560) 1622 375.6 2.1e-103
NP_061144 (OMIM: 606715) acid-sensing ion channel ( 666) 1306 304.2 7.5e-82
XP_016859928 (OMIM: 606715) PREDICTED: acid-sensin ( 320) 1109 259.7 9.6e-69
NP_004760 (OMIM: 611741) acid-sensing ion channel ( 531) 1027 241.2 5.6e-63
NP_064718 (OMIM: 611741) acid-sensing ion channel ( 543) 1027 241.2 5.8e-63
NP_064717 (OMIM: 611741) acid-sensing ion channel ( 549) 1027 241.2 5.8e-63
NP_059115 (OMIM: 616693) acid-sensing ion channel ( 505) 791 187.9 5.9e-47
NP_878267 (OMIM: 606715) acid-sensing ion channel ( 647) 787 187.1 1.4e-46
XP_016863780 (OMIM: 616693) PREDICTED: acid-sensin ( 463) 473 116.1 2.3e-25
NP_001029 (OMIM: 264350,600228,613021) amiloride-s ( 669) 269 70.1 2.3e-11
NP_001153047 (OMIM: 264350,600228,613021) amilorid ( 692) 269 70.1 2.4e-11
NP_001153048 (OMIM: 264350,600228,613021) amilorid ( 728) 269 70.1 2.5e-11
XP_011540234 (OMIM: 601328) PREDICTED: amiloride-s ( 638) 247 65.1 6.9e-10
XP_011540235 (OMIM: 601328) PREDICTED: amiloride-s ( 638) 247 65.1 6.9e-10
XP_011540231 (OMIM: 601328) PREDICTED: amiloride-s ( 696) 247 65.1 7.4e-10
XP_011540227 (OMIM: 601328) PREDICTED: amiloride-s ( 704) 247 65.1 7.5e-10
XP_016857533 (OMIM: 601328) PREDICTED: amiloride-s ( 732) 247 65.2 7.8e-10
XP_011540222 (OMIM: 601328) PREDICTED: amiloride-s ( 736) 247 65.2 7.8e-10
XP_016857532 (OMIM: 601328) PREDICTED: amiloride-s ( 749) 247 65.2 8e-10
XP_016857531 (OMIM: 601328) PREDICTED: amiloride-s ( 757) 247 65.2 8e-10
XP_016857530 (OMIM: 601328) PREDICTED: amiloride-s ( 760) 247 65.2 8.1e-10
XP_016857529 (OMIM: 601328) PREDICTED: amiloride-s ( 764) 247 65.2 8.1e-10
XP_011540210 (OMIM: 601328) PREDICTED: amiloride-s ( 795) 247 65.2 8.4e-10
NP_001123885 (OMIM: 601328) amiloride-sensitive so ( 802) 247 65.2 8.5e-10
XP_016857528 (OMIM: 601328) PREDICTED: amiloride-s ( 810) 247 65.2 8.5e-10
XP_011540208 (OMIM: 601328) PREDICTED: amiloride-s ( 816) 247 65.2 8.6e-10
XP_011540207 (OMIM: 601328) PREDICTED: amiloride-s ( 827) 247 65.2 8.7e-10
XP_016857527 (OMIM: 601328) PREDICTED: amiloride-s ( 846) 247 65.2 8.9e-10
XP_011540204 (OMIM: 601328) PREDICTED: amiloride-s ( 851) 247 65.2 8.9e-10
XP_011540203 (OMIM: 601328) PREDICTED: amiloride-s ( 859) 247 65.2 9e-10
XP_011540201 (OMIM: 601328) PREDICTED: amiloride-s ( 895) 247 65.2 9.3e-10
XP_016857526 (OMIM: 601328) PREDICTED: amiloride-s ( 895) 247 65.2 9.3e-10
XP_016879015 (OMIM: 177200,211400,264350,600760) P ( 623) 227 60.6 1.5e-08
NP_000327 (OMIM: 177200,211400,264350,600760) amil ( 640) 227 60.6 1.6e-08
XP_011544216 (OMIM: 177200,211400,264350,600760) P ( 646) 227 60.6 1.6e-08
XP_011544215 (OMIM: 177200,211400,264350,600760) P ( 651) 227 60.6 1.6e-08
XP_016879014 (OMIM: 177200,211400,264350,600760) P ( 659) 227 60.6 1.6e-08
NP_001030 (OMIM: 177200,264350,600761,613071) amil ( 649) 168 47.3 0.00016
>>NP_001085 (OMIM: 601784) acid-sensing ion channel 2 is (512 aa)
initn: 3441 init1: 3441 opt: 3441 Z-score: 4197.5 bits: 786.3 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 3441; 100.0% identity (100.0% similar) in 512 aa overlap (1-512:1-512)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MDLKESPSEGSLQPSSIQIFANTSTLHGIRHIFVYGPLTIRRVLWAVAFVGSLGLLLVES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MDLKESPSEGSLQPSSIQIFANTSTLHGIRHIFVYGPLTIRRVLWAVAFVGSLGLLLVES
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 SERVSYYFSYQHVTKVDEVVAQSLVFPAVTLCNLNGFRFSRLTTNDLYHAGELLALLDVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SERVSYYFSYQHVTKVDEVVAQSLVFPAVTLCNLNGFRFSRLTTNDLYHAGELLALLDVN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 LQIPDPHLADPSVLEALRQKANFKHYKPKQFSMLEFLHRVGHDLKDMMLYCKFKGQECGH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LQIPDPHLADPSVLEALRQKANFKHYKPKQFSMLEFLHRVGHDLKDMMLYCKFKGQECGH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 QDFTTVFTKYGKCYMFNSGEDGKPLLTTVKGGTGNGLEIMLDIQQDEYLPIWGETEETTF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QDFTTVFTKYGKCYMFNSGEDGKPLLTTVKGGTGNGLEIMLDIQQDEYLPIWGETEETTF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 EAGVKVQIHSQSEPPFIQELGFGVAPGFQTFVATQEQRLTYLPPPWGECRSSEMGLDFFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EAGVKVQIHSQSEPPFIQELGFGVAPGFQTFVATQEQRLTYLPPPWGECRSSEMGLDFFP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 VYSITACRIDCETRYIVENCNCRMVHMPGDAPFCTPEQHKECAEPALGLLAEKDSNYCLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VYSITACRIDCETRYIVENCNCRMVHMPGDAPFCTPEQHKECAEPALGLLAEKDSNYCLC
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 RTPCNLTRYNKELSMVKIPSKTSAKYLEKKFNKSEKYISENILVLDIFFEALNYETIEQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RTPCNLTRYNKELSMVKIPSKTSAKYLEKKFNKSEKYISENILVLDIFFEALNYETIEQK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE5 KAYEVAALLGDIGGQMGLFIGASILTILELFDYIYELIKEKLLDLLGKEEDEGSHDENVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KAYEVAALLGDIGGQMGLFIGASILTILELFDYIYELIKEKLLDLLGKEEDEGSHDENVS
430 440 450 460 470 480
490 500 510
pF1KE5 TCDTMPNHSETISHTVNVPLQTTLGTLEEIAC
::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TCDTMPNHSETISHTVNVPLQTTLGTLEEIAC
490 500 510
>>NP_899233 (OMIM: 601784) acid-sensing ion channel 2 is (563 aa)
initn: 2597 init1: 2341 opt: 2572 Z-score: 3136.5 bits: 590.1 E(85289): 5.8e-168
Smith-Waterman score: 2592; 79.0% identity (88.6% similar) in 499 aa overlap (26-512:66-563)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MDLKESPSEGSLQPSSIQIFANTSTLHGIRHIFV----YGPLTIRRVLWAVAFVG
:::.::. . : ::.::..::
NP_899 GQPGGGRGGERALQGPGVARRGRPSLSRAKLHGLRHMCAGRTAAGGSFQRRALWVLAFCT
40 50 60 70 80 90
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 SLGLLLVESSERVSYYFSYQHVTKVDEVVAQSLVFPAVTLCNLNGFRFSRLTTNDLYHAG
:.:::: ::.:. :..:. :.: . ...: :::::.:: : .:: ::. .:::.::
NP_899 SFGLLLSWSSNRLLYWLSFPSHTRVHREWSRQLPFPAVTVCNNNPLRFPRLSKGDLYYAG
100 110 120 130 140 150
120 130 140 150 160
pF1KE5 ELLALLDVNLQIPDPHLA-----DPSVLEALRQKANFKHY-KPKQFSMLE--FLHRVGHD
. :.:: : . : .. : . .:. :.:. . :..: . :. :.::.
NP_899 HWLGLLLPN-RTARPLVSELLRGDEPRRQWFRKLADFRLFLPPRHFEGISAAFMDRLGHQ
160 170 180 190 200 210
170 180 190 200 210 220
pF1KE5 LKDMMLYCKFKGQECGHQDFTTVFTKYGKCYMFNSGEDGKPLLTTVKGGTGNGLEIMLDI
:.::.: ::..:. :: ..:..::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_899 LEDMLLSCKYRGELCGPHNFSSVFTKYGKCYMFNSGEDGKPLLTTVKGGTGNGLEIMLDI
220 230 240 250 260 270
230 240 250 260 270 280
pF1KE5 QQDEYLPIWGETEETTFEAGVKVQIHSQSEPPFIQELGFGVAPGFQTFVATQEQRLTYLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_899 QQDEYLPIWGETEETTFEAGVKVQIHSQSEPPFIQELGFGVAPGFQTFVATQEQRLTYLP
280 290 300 310 320 330
290 300 310 320 330 340
pF1KE5 PPWGECRSSEMGLDFFPVYSITACRIDCETRYIVENCNCRMVHMPGDAPFCTPEQHKECA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_899 PPWGECRSSEMGLDFFPVYSITACRIDCETRYIVENCNCRMVHMPGDAPFCTPEQHKECA
340 350 360 370 380 390
350 360 370 380 390 400
pF1KE5 EPALGLLAEKDSNYCLCRTPCNLTRYNKELSMVKIPSKTSAKYLEKKFNKSEKYISENIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_899 EPALGLLAEKDSNYCLCRTPCNLTRYNKELSMVKIPSKTSAKYLEKKFNKSEKYISENIL
400 410 420 430 440 450
410 420 430 440 450 460
pF1KE5 VLDIFFEALNYETIEQKKAYEVAALLGDIGGQMGLFIGASILTILELFDYIYELIKEKLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_899 VLDIFFEALNYETIEQKKAYEVAALLGDIGGQMGLFIGASILTILELFDYIYELIKEKLL
460 470 480 490 500 510
470 480 490 500 510
pF1KE5 DLLGKEEDEGSHDENVSTCDTMPNHSETISHTVNVPLQTTLGTLEEIAC
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_899 DLLGKEEDEGSHDENVSTCDTMPNHSETISHTVNVPLQTTLGTLEEIAC
520 530 540 550 560
>>NP_001086 (OMIM: 602866) acid-sensing ion channel 1 is (528 aa)
initn: 1378 init1: 1378 opt: 2356 Z-score: 2873.3 bits: 541.3 E(85289): 2.6e-153
Smith-Waterman score: 2387; 66.1% identity (84.8% similar) in 528 aa overlap (1-512:1-528)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MDLKESPSE-GSLQPSSIQIFANTSTLHGIRHIFVYGPLTIRRVLWAVAFVGSLGLLLVE
:.:: : :..:: ::: ::..:::::. ::: : :...:.:::. :.:::..::
NP_001 MELKAEEEEVGGVQPVSIQAFASSSTLHGLAHIFSYERLSLKRALWALCFLGSLAVLLCV
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 SSERVSYYFSYQHVTKVDEVVAQSLVFPAVTLCNLNGFRFSRLTTNDLYHAGELLALLDV
.:::.::: :.::::.:::.:..:.:::::::::: ::::... :::::::::::::.
NP_001 CTERVQYYFHYHHVTKLDEVAASQLTFPAVTLCNLNEFRFSQVSKNDLYHAGELLALLNN
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 NLQIPDPHLADPSVLEALRQKANFKHYKPKQFSMLEFLHRVGHDLKDMMLYCKFKGQECG
.::: ..:: . :: :..::::. .::: :.: :: :.:::..::.: :.:.:. :.
NP_001 RYEIPDTQMADEKQLEILQDKANFRSFKPKPFNMREFYDRAGHDIRDMLLSCHFRGEVCS
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 HQDFTTVFTKYGKCYMFNSGEDGKPLLTTVKGGTGNGLEIMLDIQQDEYLPIWGETEETT
.:: .:::.::::: ::::.::.: : :.:::::::::::::::::::::.::::.::.
NP_001 AEDFKVVFTRYGKCYTFNSGRDGRPRLKTMKGGTGNGLEIMLDIQQDEYLPVWGETDETS
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 FEAGVKVQIHSQSEPPFIQELGFGVAPGFQTFVATQEQRLTYLPPPWGECRSSEMG--LD
::::.:::::::.:::::..:::::::::::::: ::::: ::::::: :.. : ::
NP_001 FEAGIKVQIHSQDEPPFIDQLGFGVAPGFQTFVACQEQRLIYLPPPWGTCKAVTMDSDLD
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 FFPVYSITACRIDCETRYIVENCNCRMVHMPGDAPFCTPEQHKECAEPALGLLAEKDSNY
:: ::::::::::::::.::::::::::::::::.:::::.::::.::: .:.:::..:
NP_001 FFDSYSITACRIDCETRYLVENCNCRMVHMPGDAPYCTPEQYKECADPALDFLVEKDQEY
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 CLCRTPCNLTRYNKELSMVKIPSKTSAKYLEKKFNKSEKYISENILVLDIFFEALNYETI
:.:. :::::::.:::::::::::.::::: :::::::.::.:::::::::::.::::::
NP_001 CVCEMPCNLTRYGKELSMVKIPSKASAKYLAKKFNKSEQYIGENILVLDIFFEVLNYETI
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KE5 EQKKAYEVAALLGDIGGQMGLFIGASILTILELFDYIYELIKEKLL--DLLGKEEDEGSH
:::::::.:.:::::::::::::::::::.:::::: ::.::.:: :: ..:
NP_001 EQKKAYEIAGLLGDIGGQMGLFIGASILTVLELFDYAYEVIKHKLCRRGKCQKEAKRSSA
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510
pF1KE5 DENVST----------CDTMPNHSETISHTVNV-PLQTTLGTLEEIAC
:..:. :... .: .....:. : . . ::.:...:
NP_001 DKGVALSLDDVKRHNPCESLRGHPAGMTYAANILPHHPARGTFEDFTC
490 500 510 520
>>XP_011536654 (OMIM: 602866) PREDICTED: acid-sensing io (529 aa)
initn: 2259 init1: 1294 opt: 2344 Z-score: 2858.7 bits: 538.6 E(85289): 1.7e-152
Smith-Waterman score: 2375; 66.0% identity (84.7% similar) in 529 aa overlap (1-512:1-529)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MDLKESPSE-GSLQPSSIQIFANTSTLHGIRHIFVYGPLTIRRVLWAVAFVGSLGLLLVE
:.:: : :..:: ::: ::..:::::. ::: : :...:.:::. :.:::..::
XP_011 MELKAEEEEVGGVQPVSIQAFASSSTLHGLAHIFSYERLSLKRALWALCFLGSLAVLLCV
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 SSERVSYYFSYQHVTKVDEVVAQSLVFPAVTLCNLNGFRFSRLTTNDLYHAGELLALLDV
.:::.::: :.::::.:::.:..:.:::::::::: ::::... :::::::::::::.
XP_011 CTERVQYYFHYHHVTKLDEVAASQLTFPAVTLCNLNEFRFSQVSKNDLYHAGELLALLNN
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 NLQIPDPHLADPSVLEALRQKANFKHYKPKQFSMLEFLHRVGHDLKDMMLYCKFKGQECG
.::: ..:: . :: :..::::. .::: :.: :: :.:::..::.: :.:.:. :.
XP_011 RYEIPDTQMADEKQLEILQDKANFRSFKPKPFNMREFYDRAGHDIRDMLLSCHFRGEVCS
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 HQDFTTVFTKYGKCYMFNSGEDGKPLLTTVKGGTGNGLEIMLDIQQDEYLPIWGETEETT
.:: .:::.::::: ::::.::.: : :.:::::::::::::::::::::.::::.::.
XP_011 AEDFKVVFTRYGKCYTFNSGRDGRPRLKTMKGGTGNGLEIMLDIQQDEYLPVWGETDETS
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 FEAGVKVQIHSQSEPPFIQELGFGVAPGFQTFVATQEQR-LTYLPPPWGECRSSEMG--L
::::.:::::::.:::::..:::::::::::::: :::: : ::::::: :.. : :
XP_011 FEAGIKVQIHSQDEPPFIDQLGFGVAPGFQTFVACQEQRQLIYLPPPWGTCKAVTMDSDL
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 DFFPVYSITACRIDCETRYIVENCNCRMVHMPGDAPFCTPEQHKECAEPALGLLAEKDSN
::: ::::::::::::::.::::::::::::::::.:::::.::::.::: .:.:::..
XP_011 DFFDSYSITACRIDCETRYLVENCNCRMVHMPGDAPYCTPEQYKECADPALDFLVEKDQE
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 YCLCRTPCNLTRYNKELSMVKIPSKTSAKYLEKKFNKSEKYISENILVLDIFFEALNYET
::.:. :::::::.:::::::::::.::::: :::::::.::.:::::::::::.:::::
XP_011 YCVCEMPCNLTRYGKELSMVKIPSKASAKYLAKKFNKSEQYIGENILVLDIFFEVLNYET
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KE5 IEQKKAYEVAALLGDIGGQMGLFIGASILTILELFDYIYELIKEKLL--DLLGKEEDEGS
::::::::.:.:::::::::::::::::::.:::::: ::.::.:: :: ..:
XP_011 IEQKKAYEIAGLLGDIGGQMGLFIGASILTVLELFDYAYEVIKHKLCRRGKCQKEAKRSS
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510
pF1KE5 HDENVST----------CDTMPNHSETISHTVNV-PLQTTLGTLEEIAC
:..:. :... .: .....:. : . . ::.:...:
XP_011 ADKGVALSLDDVKRHNPCESLRGHPAGMTYAANILPHHPARGTFEDFTC
490 500 510 520
>>NP_064423 (OMIM: 602866) acid-sensing ion channel 1 is (574 aa)
initn: 2165 init1: 1378 opt: 2169 Z-score: 2644.6 bits: 499.1 E(85289): 1.5e-140
Smith-Waterman score: 2254; 63.4% identity (79.3% similar) in 541 aa overlap (1-489:1-541)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MDLKESPSE-GSLQPSSIQIFANTSTLHGIRHIFVYGPLTIRRVLWAVAFVGSLGLLLVE
:.:: : :..:: ::: ::..:::::. ::: : :...:.:::. :.:::..::
NP_064 MELKAEEEEVGGVQPVSIQAFASSSTLHGLAHIFSYERLSLKRALWALCFLGSLAVLLCV
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 SSERVSYYFSYQHVTKVDEVVAQSLVFPAVTLCNLNGFRFSRLTTNDLYHAGELLALLDV
.:::.::: :.::::.:::.:..:.:::::::::: ::::... :::::::::::::.
NP_064 CTERVQYYFHYHHVTKLDEVAASQLTFPAVTLCNLNEFRFSQVSKNDLYHAGELLALLNN
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 NLQIPDPHLADPSVLEALRQKANFKHYKPKQFSMLEFLHRVGHDLKDMMLYCKFKGQECG
.::: ..:: . :: :..::::. .::: :.: :: :.:::..::.: :.:.:. :.
NP_064 RYEIPDTQMADEKQLEILQDKANFRSFKPKPFNMREFYDRAGHDIRDMLLSCHFRGEVCS
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 HQDFTTVFTKYGKCYMFNSGEDGKPLLTTVKGGTGNGLEIMLDIQQDEYLPIWGETEETT
.:: .:::.::::: ::::.::.: : :.:::::::::::::::::::::.::::.::.
NP_064 AEDFKVVFTRYGKCYTFNSGRDGRPRLKTMKGGTGNGLEIMLDIQQDEYLPVWGETDETS
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 FEAGVKVQIHSQSEPPFIQELGFGVAPGFQTFVATQEQRLTYLPPPWGECRSSEMG--LD
::::.:::::::.:::::..:::::::::::::: ::::: ::::::: :.. : ::
NP_064 FEAGIKVQIHSQDEPPFIDQLGFGVAPGFQTFVACQEQRLIYLPPPWGTCKAVTMDSDLD
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 FFPVYSITACRIDCETRYIVENCNCRMVHMPGDAPFCTPEQHKECAEPALGLLAEKDSNY
:: ::::::::::::::.::::::::::::::::.:::::.::::.::: .:.:::..:
NP_064 FFDSYSITACRIDCETRYLVENCNCRMVHMPGDAPYCTPEQYKECADPALDFLVEKDQEY
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 CLCRTPCNLTRYNKELSMVKIPSKTSAKYLEKKFNKSEKYISENILVLDIFFEALNYETI
:.:. :::::::.:::::::::::.::::: :::::::.::.:::::::::::.::::::
NP_064 CVCEMPCNLTRYGKELSMVKIPSKASAKYLAKKFNKSEQYIGENILVLDIFFEVLNYETI
370 380 390 400 410 420
420 430
pF1KE5 EQKKAYEVAALLG----------------------------------------------D
:::::::.:.::: :
NP_064 EQKKAYEIAGLLGELLMTPVPFSCHGHGVAPYHPKAGCSLLSHEGPPPQRPFPKPCCLGD
430 440 450 460 470 480
440 450 460 470 480
pF1KE5 IGGQMGLFIGASILTILELFDYIYELIKEKLL--DLLGKEEDEGSHDENVS-TCDTMPNH
:::::::::::::::.:::::: ::.::.:: :: ..: :..:. . : . :
NP_064 IGGQMGLFIGASILTVLELFDYAYEVIKHKLCRRGKCQKEAKRSSADKGVALSLDDVKRH
490 500 510 520 530 540
490 500 510
pF1KE5 SETISHTVNVPLQTTLGTLEEIAC
.
NP_064 NPCESLRGHPAGMTYAANILPHHPARGTFEDFTC
550 560 570
>>NP_001243759 (OMIM: 602866) acid-sensing ion channel 1 (562 aa)
initn: 1291 init1: 979 opt: 1757 Z-score: 2142.0 bits: 406.1 E(85289): 1.4e-112
Smith-Waterman score: 2088; 60.6% identity (79.8% similar) in 525 aa overlap (3-512:51-562)
10 20 30
pF1KE5 MDLKESPSEGSLQPSSIQIFANTSTLHGIRHI
... ::: .: .. :::. :::: ::
NP_001 LGDIWGPHHHQQQQDISESEEEEEEKEKEAVRKEASEGH-SPMDLVAFANSCTLHGTNHI
30 40 50 60 70
40 50 60 70 80 90
pF1KE5 FVYGPLTIRRVLWAVAFVGSLGLLLVESSERVSYYFSYQHVTKVDEVVAQSLVFPAVTLC
:: : :.:::::::: .:: .: . ..::.::.:: ::: ..::.. :.:::::::
NP_001 FVEGGPGPRQVLWAVAFVLALGAFLCQVGDRVAYYLSYPHVTLLNEVATTELAFPAVTLC
80 90 100 110 120 130
100 110 120 130 140 150
pF1KE5 NLNGFRFSRLTTNDLYHAGELLALLDVNLQIPDPHLADPSVLEALRQKANFKHYKPKQFS
: :. :.:.:. :: . . .:.: . . : :: :. :: .. . :.
NP_001 NTNAVRLSQLSYPDLLYLAPMLGLDESDD--PGVPLAPPGP-EA---------FSGEPFN
140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KE5 MLEFLHRVGHDLKDMMLYCKFKGQECGHQDFTTVFTKYGKCYMFNSGEDGKPLLTTVKGG
. .: .: : :.::.:::...: :: ..:..:::.::::: ::::.::.: : :.:::
NP_001 LHRFYNRSCHRLEDMLLYCSYQGGPCGPHNFSVVFTRYGKCYTFNSGRDGRPRLKTMKGG
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KE5 TGNGLEIMLDIQQDEYLPIWGETEETTFEAGVKVQIHSQSEPPFIQELGFGVAPGFQTFV
::::::::::::::::::.::::.::.::::.:::::::.:::::..:::::::::::::
NP_001 TGNGLEIMLDIQQDEYLPVWGETDETSFEAGIKVQIHSQDEPPFIDQLGFGVAPGFQTFV
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KE5 ATQEQRLTYLPPPWGECRSSEMG--LDFFPVYSITACRIDCETRYIVENCNCRMVHMPGD
: ::::: ::::::: :.. : :::: ::::::::::::::.::::::::::::::
NP_001 ACQEQRLIYLPPPWGTCKAVTMDSDLDFFDSYSITACRIDCETRYLVENCNCRMVHMPGD
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KE5 APFCTPEQHKECAEPALGLLAEKDSNYCLCRTPCNLTRYNKELSMVKIPSKTSAKYLEKK
::.:::::.::::.::: .:.:::..::.:. :::::::.:::::::::::.::::: ::
NP_001 APYCTPEQYKECADPALDFLVEKDQEYCVCEMPCNLTRYGKELSMVKIPSKASAKYLAKK
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
pF1KE5 FNKSEKYISENILVLDIFFEALNYETIEQKKAYEVAALLGDIGGQMGLFIGASILTILEL
:::::.::.:::::::::::.:::::::::::::.:.:::::::::::::::::::.:::
NP_001 FNKSEQYIGENILVLDIFFEVLNYETIEQKKAYEIAGLLGDIGGQMGLFIGASILTVLEL
430 440 450 460 470 480
460 470 480 490
pF1KE5 FDYIYELIKEKLL--DLLGKEEDEGSHDENVST----------CDTMPNHSETISHTVNV
::: ::.::.:: :: ..: :..:. :... .: .....:.
NP_001 FDYAYEVIKHKLCRRGKCQKEAKRSSADKGVALSLDDVKRHNPCESLRGHPAGMTYAANI
490 500 510 520 530 540
500 510
pF1KE5 -PLQTTLGTLEEIAC
: . . ::.:...:
NP_001 LPHHPARGTFEDFTC
550 560
>>XP_011536653 (OMIM: 602866) PREDICTED: acid-sensing io (559 aa)
initn: 1689 init1: 979 opt: 1634 Z-score: 1991.9 bits: 378.3 E(85289): 3.3e-104
Smith-Waterman score: 2306; 62.5% identity (80.1% similar) in 557 aa overlap (3-512:3-559)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MDLKESPSE-GSLQPSSIQIFANTSTLHGIRHIFVYGPLTIRRVLWAVAFVGSLGLLLVE
:: : :..:: ::: ::..:::::. ::: : :...:.:::. :.:::..::
XP_011 MELKAEEEEVGGVQPVSIQAFASSSTLHGLAHIFSYERLSLKRALWALCFLGSLAVLLCV
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 SSERVSYYFSYQHVTKVDEVVAQSLVFPAVTLCNLNGFRFSRLTTNDLYHAGELLALLDV
.:::.::: :.::::.:::.:..:.:::::::::: ::::... :::::::::::::.
XP_011 CTERVQYYFHYHHVTKLDEVAASQLTFPAVTLCNLNEFRFSQVSKNDLYHAGELLALLNN
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 NLQIPDPHLADPSVLEALRQKANFKHYKPKQFSMLEFLHRVGHDLKDMMLYCKFKGQECG
.::: ..:: . :: :..::::. .::: :.: :: :.:::..::.: :.:.:. :.
XP_011 RYEIPDTQMADEKQLEILQDKANFRSFKPKPFNMREFYDRAGHDIRDMLLSCHFRGEVCS
130 140 150 160 170 180
180 190 200
pF1KE5 HQDFTT-------------------------------VFTKYGKCYMFNSGEDGKPLLTT
.:: . :::.::::: ::::.::.: : :
XP_011 AEDFKVKPMQVAKELRRCTLPGTVFQGTQRARKGEKQVFTRYGKCYTFNSGRDGRPRLKT
190 200 210 220 230 240
210 220 230 240 250 260
pF1KE5 VKGGTGNGLEIMLDIQQDEYLPIWGETEETTFEAGVKVQIHSQSEPPFIQELGFGVAPGF
.:::::::::::::::::::::.::::.::.::::.:::::::.:::::..:::::::::
XP_011 MKGGTGNGLEIMLDIQQDEYLPVWGETDETSFEAGIKVQIHSQDEPPFIDQLGFGVAPGF
250 260 270 280 290 300
270 280 290 300 310 320
pF1KE5 QTFVATQEQRLTYLPPPWGECRSSEMG--LDFFPVYSITACRIDCETRYIVENCNCRMVH
::::: ::::: ::::::: :.. : :::: ::::::::::::::.::::::::::
XP_011 QTFVACQEQRLIYLPPPWGTCKAVTMDSDLDFFDSYSITACRIDCETRYLVENCNCRMVH
310 320 330 340 350 360
330 340 350 360 370 380
pF1KE5 MPGDAPFCTPEQHKECAEPALGLLAEKDSNYCLCRTPCNLTRYNKELSMVKIPSKTSAKY
::::::.:::::.::::.::: .:.:::..::.:. :::::::.:::::::::::.::::
XP_011 MPGDAPYCTPEQYKECADPALDFLVEKDQEYCVCEMPCNLTRYGKELSMVKIPSKASAKY
370 380 390 400 410 420
390 400 410 420 430 440
pF1KE5 LEKKFNKSEKYISENILVLDIFFEALNYETIEQKKAYEVAALLGDIGGQMGLFIGASILT
: :::::::.::.:::::::::::.:::::::::::::.:.:::::::::::::::::::
XP_011 LAKKFNKSEQYIGENILVLDIFFEVLNYETIEQKKAYEIAGLLGDIGGQMGLFIGASILT
430 440 450 460 470 480
450 460 470 480 490
pF1KE5 ILELFDYIYELIKEKLL--DLLGKEEDEGSHDENVST----------CDTMPNHSETISH
.:::::: ::.::.:: :: ..: :..:. :... .: ...
XP_011 VLELFDYAYEVIKHKLCRRGKCQKEAKRSSADKGVALSLDDVKRHNPCESLRGHPAGMTY
490 500 510 520 530 540
500 510
pF1KE5 TVNV-PLQTTLGTLEEIAC
..:. : . . ::.:...:
XP_011 AANILPHHPARGTFEDFTC
550
>>XP_011536652 (OMIM: 602866) PREDICTED: acid-sensing io (560 aa)
initn: 2246 init1: 979 opt: 1622 Z-score: 1977.3 bits: 375.6 E(85289): 2.1e-103
Smith-Waterman score: 2293; 62.7% identity (80.5% similar) in 550 aa overlap (10-512:11-560)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MDLKESPSEGSLQPSSIQIFANTSTLHGIRHIFVYGPLTIRRVLWAVAFVGSLGLLLVE
:..:: ::: ::..:::::. ::: : :...:.:::. :.:::..::
XP_011 MELKAEEEEVGGVQPVSIQAFASSSTLHGLAHIFSYERLSLKRALWALCFLGSLAVLLCV
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 SSERVSYYFSYQHVTKVDEVVAQSLVFPAVTLCNLNGFRFSRLTTNDLYHAGELLALLDV
.:::.::: :.::::.:::.:..:.:::::::::: ::::... :::::::::::::.
XP_011 CTERVQYYFHYHHVTKLDEVAASQLTFPAVTLCNLNEFRFSQVSKNDLYHAGELLALLNN
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 NLQIPDPHLADPSVLEALRQKANFKHYKPKQFSMLEFLHRVGHDLKDMMLYCKFKGQECG
.::: ..:: . :: :..::::. .::: :.: :: :.:::..::.: :.:.:. :.
XP_011 RYEIPDTQMADEKQLEILQDKANFRSFKPKPFNMREFYDRAGHDIRDMLLSCHFRGEVCS
130 140 150 160 170 180
180 190 200
pF1KE5 HQDFTT-------------------------------VFTKYGKCYMFNSGEDGKPLLTT
.:: . :::.::::: ::::.::.: : :
XP_011 AEDFKVKPMQVAKELRRCTLPGTVFQGTQRARKGEKQVFTRYGKCYTFNSGRDGRPRLKT
190 200 210 220 230 240
210 220 230 240 250 260
pF1KE5 VKGGTGNGLEIMLDIQQDEYLPIWGETEETTFEAGVKVQIHSQSEPPFIQELGFGVAPGF
.:::::::::::::::::::::.::::.::.::::.:::::::.:::::..:::::::::
XP_011 MKGGTGNGLEIMLDIQQDEYLPVWGETDETSFEAGIKVQIHSQDEPPFIDQLGFGVAPGF
250 260 270 280 290 300
270 280 290 300 310 320
pF1KE5 QTFVATQEQR-LTYLPPPWGECRSSEMG--LDFFPVYSITACRIDCETRYIVENCNCRMV
::::: :::: : ::::::: :.. : :::: ::::::::::::::.:::::::::
XP_011 QTFVACQEQRQLIYLPPPWGTCKAVTMDSDLDFFDSYSITACRIDCETRYLVENCNCRMV
310 320 330 340 350 360
330 340 350 360 370 380
pF1KE5 HMPGDAPFCTPEQHKECAEPALGLLAEKDSNYCLCRTPCNLTRYNKELSMVKIPSKTSAK
:::::::.:::::.::::.::: .:.:::..::.:. :::::::.:::::::::::.:::
XP_011 HMPGDAPYCTPEQYKECADPALDFLVEKDQEYCVCEMPCNLTRYGKELSMVKIPSKASAK
370 380 390 400 410 420
390 400 410 420 430 440
pF1KE5 YLEKKFNKSEKYISENILVLDIFFEALNYETIEQKKAYEVAALLGDIGGQMGLFIGASIL
:: :::::::.::.:::::::::::.:::::::::::::.:.::::::::::::::::::
XP_011 YLAKKFNKSEQYIGENILVLDIFFEVLNYETIEQKKAYEIAGLLGDIGGQMGLFIGASIL
430 440 450 460 470 480
450 460 470 480 490
pF1KE5 TILELFDYIYELIKEKLL--DLLGKEEDEGSHDENVST----------CDTMPNHSETIS
:.:::::: ::.::.:: :: ..: :..:. :... .: ..
XP_011 TVLELFDYAYEVIKHKLCRRGKCQKEAKRSSADKGVALSLDDVKRHNPCESLRGHPAGMT
490 500 510 520 530 540
500 510
pF1KE5 HTVNV-PLQTTLGTLEEIAC
...:. : . . ::.:...:
XP_011 YAANILPHHPARGTFEDFTC
550 560
>>NP_061144 (OMIM: 606715) acid-sensing ion channel 4 is (666 aa)
initn: 1482 init1: 665 opt: 1306 Z-score: 1590.5 bits: 304.2 E(85289): 7.5e-82
Smith-Waterman score: 1515; 50.0% identity (76.7% similar) in 454 aa overlap (14-462:166-600)
10 20 30 40
pF1KE5 MDLKESPSEGSLQPSSIQIFANTSTLHGIRHIFVYGPLTIRRV
: .. ::.::::::. . :: .::.
NP_061 IKFAEEDAKPKEKEAGDEQSLLGAVAPGAAPRDLATFASTSTLHGLGRACGPGPHGLRRT
140 150 160 170 180 190
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pF1KE5 LWAVAFVGSLGLLLVESSERVSYYFSYQHVTKVDEVVAQSLV-FPAVTLCNLNGFRFSRL
:::.:.. ::. .: ... . :.. :.. .: .. .. ::::::::.: :: : :
NP_061 LWALALLTSLAAFLYQAAGLARGYLTRPHLVAMDPAAPAPVAGFPAVTLCNINRFRHSAL
200 210 220 230 240 250
110 120 130 140 150 160
pF1KE5 TTNDLYHAGELLALLDVNLQIPDPHLADPSVLEALRQKANFKHYKPKQFSMLEFLHRVGH
. :..: ..: .: : :. : .. :.... .: .:...:.:.::
NP_061 SDADIFHLANLTGL-------P-PKDRDG------HRAAGLRYPEP---DMVDILNRTGH
260 270 280 290
170 180 190 200 210 220
pF1KE5 DLKDMMLYCKFKGQECGHQDFTTVFTKYGKCYMFNSGEDGKPLLTTVKGGTGNGLEIMLD
.: ::. :.:.:..:. ..:..:.:.::::: ::. : . : . :: :.:::::::
NP_061 QLADMLKSCNFSGHHCSASNFSVVYTRYGKCYTFNA--DPRSSLPSRAGGMGSGLEIMLD
300 310 320 330 340 350
230 240 250 260 270 280
pF1KE5 IQQDEYLPIWGETEETTFEAGVKVQIHSQSEPPFIQELGFGVAPGFQTFVATQEQRLTYL
:::.:::::: ::.::.::::..:::::: :::.:..:::::.:::::::. ::::::::
NP_061 IQQEEYLPIWRETNETSFEAGIRVQIHSQEEPPYIHQLGFGVSPGFQTFVSCQEQRLTYL
360 370 380 390 400 410
290 300 310 320 330
pF1KE5 PPPWGECRS-SEMG---LDFFPVYSITACRIDCETRYIVENCNCRMVHMPGDAPFCTPEQ
: :::.::. ::. :. . .::..:::. :: . ... :.::::::::. .: :.
NP_061 PQPWGNCRAESELREPELQGYSAYSVSACRLRCEKEAVLQRCHCRMVHMPGNETICPPNI
420 430 440 450 460 470
340 350 360 370 380 390
pF1KE5 HKECAEPALGLLAEKDSNYCLCRTPCNLTRYNKELSMVKIPSKTSAKYLEKKFNKSEKYI
. :::. .: :. . :.: ::::::::.::.:::.::.. ::.:: .:.:..: ::
NP_061 YIECADHTLDSLGGGPEGPCFCPTPCNLTRYGKEISMVRIPNRGSARYLARKYNRNETYI
480 490 500 510 520 530
400 410 420 430 440 450
pF1KE5 SENILVLDIFFEALNYETIEQKKAYEVAALLGDIGGQMGLFIGASILTILELFDYIYELI
::.::::.:::::. :..::. :: ..:::::.::::::::::::::.::..:::::.
NP_061 RENFLVLDVFFEALTSEAMEQRAAYGLSALLGDLGGQMGLFIGASILTLLEILDYIYEVS
540 550 560 570 580 590
460 470 480 490 500 510
pF1KE5 KEKLLDLLGKEEDEGSHDENVSTCDTMPNHSETISHTVNVPLQTTLGTLEEIAC
..:
NP_061 WDRLKRVWRRPKTPLRTSTGGISTLGLQELKEQSPCPSRGRVEGGGVSSLLPNHHHPHGP
600 610 620 630 640 650
>>XP_016859928 (OMIM: 606715) PREDICTED: acid-sensing io (320 aa)
initn: 1104 init1: 665 opt: 1109 Z-score: 1355.2 bits: 259.7 E(85289): 9.6e-69
Smith-Waterman score: 1109; 61.7% identity (85.0% similar) in 253 aa overlap (214-462:2-254)
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 TTVFTKYGKCYMFNSGEDGKPLLTTVKGGTGNGLEIMLDIQQDEYLPIWGETEETTFEAG
:.::::::::::.:::::: ::.::.::::
XP_016 MGSGLEIMLDIQQEEYLPIWRETNETSFEAG
10 20 30
250 260 270 280 290
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