Result of FASTA (omim) for
pFN21AE5618
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5618, 533 aa
1>>>pF1KE5618 533 - 533 aa - 533 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.8886+/-0.00043; mu= 1.1553+/- 0.027
mean_var=157.2405+/-31.930, 0's: 0 Z-trim(115.0): 156 B-trim: 982 in 3/59
Lambda= 0.102280
statistics sampled from 25097 (25254) to 25097 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.649), E-opt: 0.2 (0.296), width: 16
Scan time: 8.670
The best scores are: opt bits E(85289)
XP_011533253 (OMIM: 189973) PREDICTED: ETS-related ( 560) 870 140.7 1.1e-32
XP_016875898 (OMIM: 189973) PREDICTED: ETS-related ( 619) 870 140.7 1.2e-32
NP_758961 (OMIM: 189973) ETS-related transcription ( 619) 870 140.7 1.2e-32
XP_016875901 (OMIM: 189973) PREDICTED: ETS-related ( 619) 870 140.7 1.2e-32
XP_016875900 (OMIM: 189973) PREDICTED: ETS-related ( 619) 870 140.7 1.2e-32
XP_016875899 (OMIM: 189973) PREDICTED: ETS-related ( 619) 870 140.7 1.2e-32
XP_011533252 (OMIM: 189973) PREDICTED: ETS-related ( 619) 870 140.7 1.2e-32
XP_005266334 (OMIM: 189973) PREDICTED: ETS-related ( 619) 870 140.7 1.2e-32
XP_005266333 (OMIM: 189973) PREDICTED: ETS-related ( 619) 870 140.7 1.2e-32
XP_016875902 (OMIM: 189973) PREDICTED: ETS-related ( 619) 870 140.7 1.2e-32
XP_011529609 (OMIM: 300775) PREDICTED: ETS-related ( 595) 824 133.9 1.3e-30
XP_005262446 (OMIM: 300775) PREDICTED: ETS-related ( 663) 824 133.9 1.5e-30
NP_001120669 (OMIM: 300775) ETS-related transcript ( 663) 824 133.9 1.5e-30
NP_001412 (OMIM: 300775) ETS-related transcription ( 663) 824 133.9 1.5e-30
XP_011529610 (OMIM: 300775) PREDICTED: ETS-related ( 586) 822 133.6 1.6e-30
NP_001138825 (OMIM: 189973) ETS-related transcript ( 595) 779 127.3 1.3e-28
XP_005252919 (OMIM: 605439) PREDICTED: ETS homolog ( 277) 335 61.6 3.5e-09
NP_001193544 (OMIM: 605439) ETS homologous factor ( 277) 335 61.6 3.5e-09
XP_005252918 (OMIM: 605439) PREDICTED: ETS homolog ( 299) 335 61.7 3.7e-09
XP_016873023 (OMIM: 605439) PREDICTED: ETS homolog ( 298) 329 60.8 6.9e-09
XP_011518287 (OMIM: 605439) PREDICTED: ETS homolog ( 300) 326 60.3 9.4e-09
XP_011518286 (OMIM: 605439) PREDICTED: ETS homolog ( 300) 326 60.3 9.4e-09
NP_036285 (OMIM: 605439) ETS homologous factor iso ( 300) 326 60.3 9.4e-09
XP_005252917 (OMIM: 605439) PREDICTED: ETS homolog ( 300) 326 60.3 9.4e-09
XP_011518285 (OMIM: 605439) PREDICTED: ETS homolog ( 303) 326 60.3 9.5e-09
NP_001193545 (OMIM: 605439) ETS homologous factor ( 322) 326 60.3 1e-08
XP_005252914 (OMIM: 605439) PREDICTED: ETS homolog ( 321) 322 59.7 1.5e-08
NP_001244097 (OMIM: 311040) ETS domain-containing ( 95) 306 57.2 2.6e-08
NP_001107595 (OMIM: 311040) ETS domain-containing ( 428) 312 58.3 5.4e-08
XP_016884828 (OMIM: 311040) PREDICTED: ETS domain- ( 428) 312 58.3 5.4e-08
NP_005220 (OMIM: 311040) ETS domain-containing pro ( 428) 312 58.3 5.4e-08
NP_001107781 (OMIM: 602191) ETS-related transcript ( 371) 309 57.8 6.5e-08
NP_004424 (OMIM: 602191) ETS-related transcription ( 371) 309 57.8 6.5e-08
NP_001239223 (OMIM: 608144) SAM pointed domain-con ( 319) 305 57.2 8.5e-08
NP_036523 (OMIM: 608144) SAM pointed domain-contai ( 335) 305 57.2 8.9e-08
XP_005249045 (OMIM: 608144) PREDICTED: SAM pointed ( 407) 305 57.3 1.1e-07
NP_001155894 (OMIM: 164720) protein C-ets-1 isofor ( 225) 294 55.6 1.9e-07
XP_005260995 (OMIM: 600609) PREDICTED: GA-binding ( 454) 300 56.5 2e-07
NP_002031 (OMIM: 600609) GA-binding protein alpha ( 454) 300 56.5 2e-07
XP_011527823 (OMIM: 600609) PREDICTED: GA-binding ( 454) 300 56.5 2e-07
NP_001184226 (OMIM: 600609) GA-binding protein alp ( 454) 300 56.5 2e-07
XP_016883802 (OMIM: 600609) PREDICTED: GA-binding ( 454) 300 56.5 2e-07
XP_011527822 (OMIM: 600609) PREDICTED: GA-binding ( 454) 300 56.5 2e-07
NP_001317380 (OMIM: 164720) protein C-ets-1 isofor ( 354) 296 55.9 2.4e-07
XP_005260992 (OMIM: 164740) PREDICTED: protein C-e ( 469) 298 56.3 2.5e-07
NP_005230 (OMIM: 164740) protein C-ets-2 isoform 1 ( 469) 298 56.3 2.5e-07
XP_016883779 (OMIM: 164740) PREDICTED: protein C-e ( 469) 298 56.3 2.5e-07
XP_016872806 (OMIM: 164720) PREDICTED: protein C-e ( 398) 296 55.9 2.6e-07
XP_011540953 (OMIM: 164720) PREDICTED: protein C-e ( 432) 296 55.9 2.8e-07
NP_001243224 (OMIM: 164740) protein C-ets-2 isofor ( 609) 298 56.3 3.1e-07
>>XP_011533253 (OMIM: 189973) PREDICTED: ETS-related tra (560 aa)
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Smith-Waterman score: 1026; 38.9% identity (65.4% similar) in 561 aa overlap (14-529:20-555)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MATSLHEGPTNQLDLLIRAVEASVHSSNAHCTDKTIEAAEALLHMESPTCLRD-
: . .:::: :... : .:::::::::.:.:: . :
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10 20 30 40 50
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pF1KE5 SRSPVEVFVPP---CVSTPEFIHAAMRPDVITETVVEVSTEESEPMDTSPIPTSPDSHEP
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XP_011 KRINNNIFSSPEDDMVVAP-VTHVSVTLDGIPE-VME-TQQVQEKYADSPGASSPE--QP
60 70 80 90 100 110
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pF1KE5 MKKKKVGRKPKTQQSPISNGSPELGIKKKPREGKGNTTYLWEFLLDLLQDKNTCPRYIKW
.:: :: .:: . .:....::: ..::::: ::::::: ::::: :::.::::
XP_011 KRKKGRKTKPPRPDSPAT--TPNISVKKKNKDGKGNTIYLWEFLLALLQDKATCPKYIKW
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 TQREKGIFKLVDSKAVSKLWGKHKNKPDMNYETMGRALRYYYQRGILAKVEGQRLVYQFK
:::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TQREKGIFKLVDSKAVSRLWGKHKNKPDMNYETMGRALRYYYQRGILAKVEGQRLVYQFK
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240 250 260 270
pF1KE5 DMPKNIVVIDD-DKS---ETCNEDLAGTT----DEKSLERVSLS------AESLLKAASS
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XP_011 EMPKDLIYINDEDPSSSIESSDPSLSSSATSNRNQTSRSRVSSSPGVKGGATTVLKPGNS
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310
pF1KE5 VRSGKNSSPINC---SRAEKGVA-----------RVVNITSP------GHDASSRSPTTT
...: ..:.. :.. . : :.:....: :. : . .
XP_011 -KAAKPKDPVEVAQPSEVLRTVQPTQSPYPTQLFRTVHVVQPVQAVPEGEAARTSTMQDE
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pF1KE5 ASVSATAAPRTVRVAMQVPVVMTSLGQKISTVAVQSVNAGAPLITSTSPTTAT-SPKVVI
. :.. . ::... :::::.. .:.. ::..:.: . .:.::.:...: : : ..
XP_011 TLNSSVQSIRTIQAPTQVPVVVSPRNQQLHTVTLQTVPL-TTVIASTDPSAGTGSQKFIL
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380 390 400 410 420 430
pF1KE5 QTIPTVMPASTENGDKITMQPAKIITIPATQLAQCQLQT--KSNLTG--SGSINIVGTPL
:.::. .: .. . ... .: : . :. :. :.: ::. .:.......:
XP_011 QAIPSSQPMTVLK-ENVMLQSQKAGSPPSIVLGPAQVQQVLTSNVQTICNGTVSVASSP-
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440 450 460 470 480
pF1KE5 AVRALTPVSIAHGTPVMRLSMPTQQASGQTPPRVISAVIKGPEVKS--EAVAKKQEHDVK
:.. .::. .: ..: .. : ::..::: :.:. . : ::. .:
XP_011 --------SFSATAPVVTFSPRSSQLVAHPPGTVITSVIKTQETKTLTQEVEKKESED--
470 480 490 500 510
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pF1KE5 TLQLVEEKPADGNKTVTHVVVVSAPSAIALPVTMKTEGLVTCEK
.: :. .. .:.:::. .... :.:: . :.
XP_011 --HLKENTEKTEQQPQPYVMVVSSSNGFTSQVAMKQNELLEPNSF
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>>XP_016875898 (OMIM: 189973) PREDICTED: ETS-related tra (619 aa)
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Smith-Waterman score: 1026; 38.9% identity (65.4% similar) in 561 aa overlap (14-529:79-614)
10 20 30 40
pF1KE5 MATSLHEGPTNQLDLLIRAVEASVHSSNAHCTDKTIEAAEALL
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50 60 70 80 90
pF1KE5 HMESPTCLRD-SRSPVEVFVPP---CVSTPEFIHAAMRPDVITETVVEVSTEESEPMDTS
.:.:: . : .: ..: : : .: :... : : : :.: . . .: . :
XP_016 NMDSPGPMLDEKRINNNIFSSPEDDMVVAP-VTHVSVTLDGIPE-VME-TQQVQEKYADS
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pF1KE5 PIPTSPDSHEPMKKKKVGRKPKTQQSPISNGSPELGIKKKPREGKGNTTYLWEFLLDLLQ
: .::. .: .:: :: .:: . .:....::: ..::::: ::::::: :::
XP_016 PGASSPE--QPKRKKGRKTKPPRPDSPAT--TPNISVKKKNKDGKGNTIYLWEFLLALLQ
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160 170 180 190 200 210
pF1KE5 DKNTCPRYIKWTQREKGIFKLVDSKAVSKLWGKHKNKPDMNYETMGRALRYYYQRGILAK
:: :::.:::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::
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220 230 240 250 260
pF1KE5 VEGQRLVYQFKDMPKNIVVIDD-DKS---ETCNEDLAGTT----DEKSLERVSLS-----
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pF1KE5 -AESLLKAASSVRSGKNSSPINC---SRAEKGVA-----------RVVNITSP------G
: ..:: ..: ...: ..:.. :.. . : :.:....: :
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pF1KE5 HDASSRSPTTTASVSATAAPRTVRVAMQVPVVMTSLGQKISTVAVQSVNAGAPLITSTSP
. : . . . :.. . ::... :::::.. .:.. ::..:.: . .:.::.:
XP_016 EAARTSTMQDETLNSSVQSIRTIQAPTQVPVVVSPRNQQLHTVTLQTVPL-TTVIASTDP
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pF1KE5 TTAT-SPKVVIQTIPTVMPASTENGDKITMQPAKIITIPATQLAQCQLQT--KSNLTG--
...: : : ..:.::. .: .. . ... .: : . :. :. :.: ::.
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pF1KE5 SGSINIVGTPLAVRALTPVSIAHGTPVMRLSMPTQQASGQTPPRVISAVIKGPEVKS--E
.:.......: :.. .::. .: ..: .. : ::..::: :.:. .
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pF1KE5 AVAKKQEHDVKTLQLVEEKPADGNKTVTHVVVVSAPSAIALPVTMKTEGLVTCEK
: ::. .: .: :. .. .:.:::. .... :.:: . :.
XP_016 EVEKKESED----HLKENTEKTEQQPQPYVMVVSSSNGFTSQVAMKQNELLEPNSF
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>>NP_758961 (OMIM: 189973) ETS-related transcription fac (619 aa)
initn: 979 init1: 704 opt: 870 Z-score: 706.8 bits: 140.7 E(85289): 1.2e-32
Smith-Waterman score: 1026; 38.9% identity (65.4% similar) in 561 aa overlap (14-529:79-614)
10 20 30 40
pF1KE5 MATSLHEGPTNQLDLLIRAVEASVHSSNAHCTDKTIEAAEALL
: . .:::: :... : .:::::::::
NP_758 AGLACVEEPNDMITESSLDVAEEEIIDDDDDDITLTVEASCHDGDE--TIETIEAAEALL
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50 60 70 80 90
pF1KE5 HMESPTCLRD-SRSPVEVFVPP---CVSTPEFIHAAMRPDVITETVVEVSTEESEPMDTS
.:.:: . : .: ..: : : .: :... : : : :.: . . .: . :
NP_758 NMDSPGPMLDEKRINNNIFSSPEDDMVVAP-VTHVSVTLDGIPE-VME-TQQVQEKYADS
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pF1KE5 PIPTSPDSHEPMKKKKVGRKPKTQQSPISNGSPELGIKKKPREGKGNTTYLWEFLLDLLQ
: .::. .: .:: :: .:: . .:....::: ..::::: ::::::: :::
NP_758 PGASSPE--QPKRKKGRKTKPPRPDSPAT--TPNISVKKKNKDGKGNTIYLWEFLLALLQ
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pF1KE5 DKNTCPRYIKWTQREKGIFKLVDSKAVSKLWGKHKNKPDMNYETMGRALRYYYQRGILAK
:: :::.:::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::
NP_758 DKATCPKYIKWTQREKGIFKLVDSKAVSRLWGKHKNKPDMNYETMGRALRYYYQRGILAK
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220 230 240 250 260
pF1KE5 VEGQRLVYQFKDMPKNIVVIDD-DKS---ETCNEDLAGTT----DEKSLERVSLS-----
:::::::::::.:::... :.: : : :. . .:.... .. : ::: :
NP_758 VEGQRLVYQFKEMPKDLIYINDEDPSSSIESSDPSLSSSATSNRNQTSRSRVSSSPGVKG
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: ..:: ..: ...: ..:.. :.. . : :.:....: :
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pF1KE5 HDASSRSPTTTASVSATAAPRTVRVAMQVPVVMTSLGQKISTVAVQSVNAGAPLITSTSP
. : . . . :.. . ::... :::::.. .:.. ::..:.: . .:.::.:
NP_758 EAARTSTMQDETLNSSVQSIRTIQAPTQVPVVVSPRNQQLHTVTLQTVPL-TTVIASTDP
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pF1KE5 TTAT-SPKVVIQTIPTVMPASTENGDKITMQPAKIITIPATQLAQCQLQT--KSNLTG--
...: : : ..:.::. .: .. . ... .: : . :. :. :.: ::.
NP_758 SAGTGSQKFILQAIPSSQPMTVLK-ENVMLQSQKAGSPPSIVLGPAQVQQVLTSNVQTIC
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pF1KE5 SGSINIVGTPLAVRALTPVSIAHGTPVMRLSMPTQQASGQTPPRVISAVIKGPEVKS--E
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NP_758 NGTVSVASSP---------SFSATAPVVTFSPRSSQLVAHPPGTVITSVIKTQETKTLTQ
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pF1KE5 AVAKKQEHDVKTLQLVEEKPADGNKTVTHVVVVSAPSAIALPVTMKTEGLVTCEK
: ::. .: .: :. .. .:.:::. .... :.:: . :.
NP_758 EVEKKESED----HLKENTEKTEQQPQPYVMVVSSSNGFTSQVAMKQNELLEPNSF
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>>XP_016875901 (OMIM: 189973) PREDICTED: ETS-related tra (619 aa)
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Smith-Waterman score: 1026; 38.9% identity (65.4% similar) in 561 aa overlap (14-529:79-614)
10 20 30 40
pF1KE5 MATSLHEGPTNQLDLLIRAVEASVHSSNAHCTDKTIEAAEALL
: . .:::: :... : .:::::::::
XP_016 AGLACVEEPNDMITESSLDVAEEEIIDDDDDDITLTVEASCHDGDE--TIETIEAAEALL
50 60 70 80 90 100
50 60 70 80 90
pF1KE5 HMESPTCLRD-SRSPVEVFVPP---CVSTPEFIHAAMRPDVITETVVEVSTEESEPMDTS
.:.:: . : .: ..: : : .: :... : : : :.: . . .: . :
XP_016 NMDSPGPMLDEKRINNNIFSSPEDDMVVAP-VTHVSVTLDGIPE-VME-TQQVQEKYADS
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XP_011 PGASSPE--QPKRKKGRKTKPPRPDSPAT--TPNISVKKKNKDGKGNTIYLWEFLLALLQ
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XP_005 DKATCPKYIKWTQREKGIFKLVDSKAVSRLWGKHKNKPDMNYETMGRALRYYYQRGILAK
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pF1KE5 VEGQRLVYQFKDMPKNIVVIDD-DKS---ETCNEDLAGTT----DEKSLERVSLS-----
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