Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5612
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5612, 511 aa
1>>>pF1KE5612 511 - 511 aa - 511 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1379+/-0.000904; mu= 18.8522+/- 0.054
mean_var=59.2333+/-11.880, 0's: 0 Z-trim(104.5): 25 B-trim: 7 in 1/49
Lambda= 0.166645
statistics sampled from 7924 (7936) to 7924 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.613), E-opt: 0.2 (0.244), width: 16
Scan time: 2.980
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS5790.1 SPAM1 gene_id:6677|Hs108|chr7 ( 511) 3499 849.8 0
CCDS5791.1 SPAM1 gene_id:6677|Hs108|chr7 ( 509) 3377 820.5 0
CCDS5789.1 HYAL4 gene_id:23553|Hs108|chr7 ( 481) 1352 333.7 2.9e-91
CCDS2818.1 HYAL2 gene_id:8692|Hs108|chr3 ( 473) 1157 286.8 3.7e-77
CCDS2816.1 HYAL1 gene_id:3373|Hs108|chr3 ( 435) 1130 280.3 3.1e-75
CCDS2815.1 HYAL3 gene_id:8372|Hs108|chr3 ( 417) 920 229.8 4.7e-60
CCDS2817.1 HYAL1 gene_id:3373|Hs108|chr3 ( 405) 772 194.2 2.4e-49
CCDS46832.1 HYAL1 gene_id:3373|Hs108|chr3 ( 253) 688 173.9 1.9e-43
CCDS56257.1 HYAL3 gene_id:8372|Hs108|chr3 ( 387) 674 170.6 2.8e-42
CCDS46833.1 HYAL1 gene_id:3373|Hs108|chr3 ( 176) 439 113.9 1.5e-25
CCDS56260.1 HYAL3 gene_id:8372|Hs108|chr3 ( 168) 356 94.0 1.4e-19
>>CCDS5790.1 SPAM1 gene_id:6677|Hs108|chr7 (511 aa)
initn: 3499 init1: 3499 opt: 3499 Z-score: 4541.2 bits: 849.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3499; 100.0% identity (100.0% similar) in 511 aa overlap (1-511:1-511)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGVLKFKHIFFRSFVKSSGVSQIVFTFLLIPCCLTLNFRAPPVIPNVPFLWAWNAPSEFC
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CCDS57 MGVLKFKHIFFRSFVKSSGVSQIVFTFLLIPCCLTLNFRAPPVIPNVPFLWAWNAPSEFC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LGKFDEPLDMSLFSFIGSPRINATGQGVTIFYVDRLGYYPYIDSITGVTVNGGIPQKISL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 LGKFDEPLDMSLFSFIGSPRINATGQGVTIFYVDRLGYYPYIDSITGVTVNGGIPQKISL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 QDHLDKAKKDITFYMPVDNLGMAVIDWEEWRPTWARNWKPKDVYKNRSIELVQQQNVQLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 QDHLDKAKKDITFYMPVDNLGMAVIDWEEWRPTWARNWKPKDVYKNRSIELVQQQNVQLS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 LTEATEKAKQEFEKAGKDFLVETIKLGKLLRPNHLWGYYLFPDCYNHHYKKPGYNGSCFN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 LTEATEKAKQEFEKAGKDFLVETIKLGKLLRPNHLWGYYLFPDCYNHHYKKPGYNGSCFN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 VEIKRNDDLSWLWNESTALYPSIYLNTQQSPVAATLYVRNRVREAIRVSKIPDAKSPLPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 VEIKRNDDLSWLWNESTALYPSIYLNTQQSPVAATLYVRNRVREAIRVSKIPDAKSPLPV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 FAYTRIVFTDQVLKFLSQDELVYTFGETVALGASGIVIWGTLSIMRSMKSCLLLDNYMET
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 ILNPYIINVTLAAKMCSQVLCQEQGVCIRKNWNSSDYLHLNPDNFAIQLEKGGKFTVRGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 ILNPYIINVTLAAKMCSQVLCQEQGVCIRKNWNSSDYLHLNPDNFAIQLEKGGKFTVRGK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE5 PTLEDLEQFSEKFYCSCYSTLSCKEKADVKDTDAVDVCIADGVCIDAFLKPPMETEEPQI
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CCDS57 PTLEDLEQFSEKFYCSCYSTLSCKEKADVKDTDAVDVCIADGVCIDAFLKPPMETEEPQI
430 440 450 460 470 480
490 500 510
pF1KE5 FYNASPSTLSATMFIWRLEVWDQGISRIGFF
:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 FYNASPSTLSATMFIWRLEVWDQGISRIGFF
490 500 510
>>CCDS5791.1 SPAM1 gene_id:6677|Hs108|chr7 (509 aa)
initn: 3377 init1: 3377 opt: 3377 Z-score: 4382.7 bits: 820.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3377; 100.0% identity (100.0% similar) in 495 aa overlap (1-495:1-495)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGVLKFKHIFFRSFVKSSGVSQIVFTFLLIPCCLTLNFRAPPVIPNVPFLWAWNAPSEFC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 MGVLKFKHIFFRSFVKSSGVSQIVFTFLLIPCCLTLNFRAPPVIPNVPFLWAWNAPSEFC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LGKFDEPLDMSLFSFIGSPRINATGQGVTIFYVDRLGYYPYIDSITGVTVNGGIPQKISL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 LGKFDEPLDMSLFSFIGSPRINATGQGVTIFYVDRLGYYPYIDSITGVTVNGGIPQKISL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 QDHLDKAKKDITFYMPVDNLGMAVIDWEEWRPTWARNWKPKDVYKNRSIELVQQQNVQLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 QDHLDKAKKDITFYMPVDNLGMAVIDWEEWRPTWARNWKPKDVYKNRSIELVQQQNVQLS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 LTEATEKAKQEFEKAGKDFLVETIKLGKLLRPNHLWGYYLFPDCYNHHYKKPGYNGSCFN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 LTEATEKAKQEFEKAGKDFLVETIKLGKLLRPNHLWGYYLFPDCYNHHYKKPGYNGSCFN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 VEIKRNDDLSWLWNESTALYPSIYLNTQQSPVAATLYVRNRVREAIRVSKIPDAKSPLPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 VEIKRNDDLSWLWNESTALYPSIYLNTQQSPVAATLYVRNRVREAIRVSKIPDAKSPLPV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 FAYTRIVFTDQVLKFLSQDELVYTFGETVALGASGIVIWGTLSIMRSMKSCLLLDNYMET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 FAYTRIVFTDQVLKFLSQDELVYTFGETVALGASGIVIWGTLSIMRSMKSCLLLDNYMET
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 ILNPYIINVTLAAKMCSQVLCQEQGVCIRKNWNSSDYLHLNPDNFAIQLEKGGKFTVRGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 ILNPYIINVTLAAKMCSQVLCQEQGVCIRKNWNSSDYLHLNPDNFAIQLEKGGKFTVRGK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE5 PTLEDLEQFSEKFYCSCYSTLSCKEKADVKDTDAVDVCIADGVCIDAFLKPPMETEEPQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 PTLEDLEQFSEKFYCSCYSTLSCKEKADVKDTDAVDVCIADGVCIDAFLKPPMETEEPQI
430 440 450 460 470 480
490 500 510
pF1KE5 FYNASPSTLSATMFIWRLEVWDQGISRIGFF
:::::::::::::::
CCDS57 FYNASPSTLSATMFIVSILFLIISSVASL
490 500
>>CCDS5789.1 HYAL4 gene_id:23553|Hs108|chr7 (481 aa)
initn: 1160 init1: 679 opt: 1352 Z-score: 1752.0 bits: 333.7 E(32554): 2.9e-91
Smith-Waterman score: 1352; 45.1% identity (72.0% similar) in 446 aa overlap (15-458:14-455)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGVLKFKHIFFRSFVKSSGVSQIVFTFLLIPCCLTLNFRAPPVIPNVPFLWAWNAPSEFC
:. ... .. :... :. :. ::. :::::.. :
CCDS57 MKVLSEGQLKLCVVQPVHLTSWLLIFFILKSISCLKPARLPIYQRKPFIAAWNAPTDQC
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LGKFDEPLDMSLFSFIGSPRINATGQGVTIFYVDRLGYYPYIDSITGVTVNGGIPQKISL
: :.. :....: :::: .: ::.::::::.::::::. : :: .:::.::.:::
CCDS57 LIKYNLRLNLKMFPVIGSPLAKARGQNVTIFYVNRLGYYPWYTS-QGVPINGGLPQNISL
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KE5 QDHLDKAKKDITFYMPVDNL-GMAVIDWEEWRPTWARNWKPKDVYKNRSIELVQQQNVQL
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CCDS57 QVHLEKADQDINYYIPAEDFSGLAVIDWEYWRPQWARNWNSKDVYRQKSRKLISDMGKNV
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 SLTEATEKAKQEFEKAGKDFLVETIKLGKLLRPNHLWGYYLFPDCYNHHYKKPGYNGSCF
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CCDS57 SATDIEYLAKVTFEESAKAFMKETIKLGIKSRPKGLWGYYLYPDCHNYNVYAPNYSGSCP
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 NVEIKRNDDLSWLWNESTALYPSIYLNTQQSPVAATL-YVRNRVREAIRVSKIPDAKSPL
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CCDS57 EDEVLRNNELSWLWNSSAALYPSIGVWKSLGDSENILRFSKFRVHESMRISTMTSHDYAL
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 PVFAYTRIVFTDQVLKFLSQDELVYTFGETVALGASGIVIWGTLSIMRSMKSCLLLDNYM
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CCDS57 PVFVYTRLGYRDEPLFFLSKQDLVSTIGESAALGAAGIVIWGDMNLTASKANCTKVKQFV
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 ETILNPYIINVTLAAKMCSQVLCQEQGVCIRKNWNSSDYLHLNPDNFAIQLEKGGKFTVR
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CCDS57 SSDLGSYIANVTRAAEVCSLHLCRNNGRCIRKMWNAPSYLHLNPASYHIEASEDGEFTVK
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE5 GKPTLEDLEQFSEKFYCSCYSTLSCKEKADVKDTDAVDVCIADGVCIDAFLKPPMETEEP
:: . :: ... : : ::. : :: .. ..: :
CCDS57 GKASDTDLAVMADTFSCHCYQGY---EGADCREIKTADGCSGVSPSPGSLMTLCLLLLAS
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510
pF1KE5 QIFYNASPSTLSATMFIWRLEVWDQGISRIGFF
CCDS57 YRSIQL
480
>>CCDS2818.1 HYAL2 gene_id:8692|Hs108|chr3 (473 aa)
initn: 977 init1: 531 opt: 1157 Z-score: 1498.7 bits: 286.8 E(32554): 3.7e-77
Smith-Waterman score: 1157; 40.3% identity (71.8% similar) in 412 aa overlap (34-438:21-430)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 LKFKHIFFRSFVKSSGVSQIVFTFLLIPCCLTLNFRAPPVIPNVPFLWAWNAPSEFCLGK
. :. :::.. . ::. ::..:.. : .
CCDS28 MRAGPGPTVTLALVLAVSWAMELKPTAPPIFTGRPFVVAWDVPTQDCGPR
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FDEPLDMSLFSFIGSPRINATGQGVTIFYVDRLGYYPYIDSITGVTVNGGIPQKISLQDH
. :::.. :. .:: . ..:..:::: :::: :: .:: .: .:.::.::..:: :
CCDS28 LKVPLDLNAFDVQASPNEGFVNQNITIFYRDRLGLYPRFDS-AGRSVHGGVPQNVSLWAH
60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 LDKAKKDITFYMPV-DNLGMAVIDWEEWRPTWARNWKPKDVYKNRSIELVQQQNVQLSLT
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CCDS28 RKMLQKRVEHYIRTQESAGLAVIDWEDWRPVWVRNWQDKDVYRRLSRQLVASRHPDWPPD
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 EATEKAKQEFEKAGKDFLVETIKLGKLLRPNHLWGYYLFPDCYNHHYKK--PGYNGSCFN
. ...:. ::: :...:..::.. : .:: ::::.::::::::: : . .:.: : .
CCDS28 RIVKQAQYEFEFAAQQFMLETLRYVKAVRPRHLWGFYLFPDCYNHDYVQNWESYTGRCPD
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290
pF1KE5 VEIKRNDDLSWLWNESTALYPSIYLN-TQQSPVAATLYVRNRVREAIRVSKIPDAKSPLP
::. :::.:.::: :::::.::.::. : : . .: ::.::.::.. :. ::
CCDS28 VEVARNDQLAWLWAESTALFPSVYLDETLASSRHGRNFVSFRVQEALRVARTHHANHALP
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 VFAYTRIVFTDQVLKFLSQDELVYTFGETVALGASGIVIWGTLSIMRSMKSCLLLDNYME
:...:: ... . : ::. .:. :.::..::::.:...:: . : ..: : .:.
CCDS28 VYVFTRPTYSRR-LTGLSEMDLISTIGESAALGAAGVILWGDAGYTTSTETCQYLKDYLT
290 300 310 320 330 340
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pF1KE5 TILNPYIINVTLAAKMCSQVLCQEQGVCIRKNWNSSDYLHLNPDNFA-IQLEKGGKFTVR
.: ::..::. :...::.. :. .: :.:.: ..: .:::. ..: . . :. .:
CCDS28 RLLVPYVVNVSWATQYCSRAQCHGHGRCVRRNPSASTFLHLSTNSFRLVPGHAPGEPQLR
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KE5 --GKPTLEDLEQFSEKFYCSCYSTLSCKEKADVKDTDAVDVCIADGVCIDAFLKPPMETE
:. . :..... .: :.::
CCDS28 PVGELSWADIDHLQTHFRCQCYLGWSGEQCQWDHRQAAGGASEAWAGSHLTSLLALAALA
410 420 430 440 450 460
>>CCDS2816.1 HYAL1 gene_id:3373|Hs108|chr3 (435 aa)
initn: 894 init1: 601 opt: 1130 Z-score: 1464.2 bits: 280.3 E(32554): 3.1e-75
Smith-Waterman score: 1130; 41.6% identity (69.4% similar) in 421 aa overlap (29-438:5-421)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MGVLKFKHIFFRSFVKSSGVSQIVFTFLLIPCC---LTL-----NFRAPPVIPNVPFLWA
:.: : ::: .::.: ..:: :: .
CCDS28 MAAHLLPICALFLTLLDMAQGFRGP-LLPNRPFTTV
10 20 30
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 WNAPSEFCLGKFDEPLDMSLFSFIGSPRINATGQGVTIFYVDRLGYYPYIDSITGVTVNG
::: ...:: . .:.:.:. ...: . : .:::: ..:: ::: . :: : :
CCDS28 WNANTQWCLERHGVDVDVSVFDVVANPGQTFRGPDMTIFYSSQLGTYPYY-TPTGEPVFG
40 50 60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 GIPQKISLQDHLDKAKKDITFYMPVDNL-GMAVIDWEEWRPTWARNWKPKDVYKNRSIEL
:.::. :: :: .. .:: .:. .. :.:::::: ::: :: :: ::.:..:: :
CCDS28 GLPQNASLIAHLARTFQDILAAIPAPDFSGLAVIDWEAWRPRWAFNWDTKDIYRQRSRAL
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 VQQQNVQLSLTEATEKAKQEFEKAGKDFLVETIKLGKLLRPNHLWGYYLFPDCYNHHYKK
:: :. . .. :...:. :.. ... :..::. ::: :::.: ::::::. . .
CCDS28 VQAQHPDWPAPQVEAVAQDQFQGAARAWMAGTLQLGRALRPRGLWGFYGFPDCYNYDFLS
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 PGYNGSCFNVEIKRNDDLSWLWNESTALYPSIYL-NTQQSPVAATLYVRNRVREAIRVSK
:.:.:.: . .::.:.:::..: :::::::. . .. . .::..:: ::.::.
CCDS28 PNYTGQCPSGIRAQNDQLGWLWGQSRALYPSIYMPAVLEGTGKSQMYVQHRVAEAFRVA-
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 IPDAKSPLPVFAYTRIVFTDQVLKFLSQDELVYTFGETVALGASGIVIWGTLSIMRSMKS
. . :::. :..: : : . .:: ::: ...::..: ::.:.:.: . :. .:
CCDS28 VAAGDPNLPVLPYVQI-FYDTTNHFLPLDELEHSLGESAAQGAAGVVLWVSWENTRTKES
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 CLLLDNYMETILNPYIINVTLAAKMCSQVLCQEQGVCIRKNWNSSDYLHLNPDNFAIQLE
: . .::.: :.:.:.::: .: .:::.::. .: :.:.. . . : ::: .:.:::
CCDS28 CQAIKEYMDTTLGPFILNVTSGALLCSQALCSGHGRCVRRTSHPKALLLLNPASFSIQLT
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460
pF1KE5 KGG-KFTVRGKPTLEDLEQFSEKFYCSCYSTLSCKEKADVKDTDAVDVCIADGVCIDAFL
:: ...:: .::: :.. .: : ::
CCDS28 PGGGPLSLRGALSLEDQAQMAVEFKCRCYPGWQAPWCERKSMW
400 410 420 430
>>CCDS2815.1 HYAL3 gene_id:8372|Hs108|chr3 (417 aa)
initn: 677 init1: 301 opt: 920 Z-score: 1191.6 bits: 229.8 E(32554): 4.7e-60
Smith-Waterman score: 920; 39.3% identity (64.1% similar) in 379 aa overlap (28-403:9-384)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MGVLKFKHIFFRSFVKSSGVSQIVFTFLLIPCCLTLNFRAP-PVIPNVPFLWAWNAPSEF
:.. : :. : : .:. :: ::.::
CCDS28 MTTQLGPALVLGVALCLGCGQPLPQVPERPFSVLWNVPSAH
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 CLGKFDEPLDMSLFSFIGSPRINATGQGVTIFYVDRLGYYPYIDSITGVTVNGGIPQKIS
: ..: : .. ...:.. . ::..:::: ..:: :::. :.. :::::: .
CCDS28 CEARFGVHLPLNALGIIANRGQHFHGQNMTIFYKNQLGLYPYFGP-RGTAHNGGIPQALP
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 LQDHLDKAKKDITFYMPVDNLGMAVIDWEEWRPTWARNWKPKDVYKNRSIELVQQQNVQL
:. :: : .: . : ::.::::: : :: :: . .:. : .:: .:
CCDS28 LDRHLALAAYQIHHSLRPGFAGPAVLDWEEWCPLWAGNWGRRRAYQAASWAWAQQVFPDL
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 SLTEATEKAKQEFEKAGKDFLVETIKLGKLLRPNHLWGYYLFPDCYNH-HYKKPGYNGSC
. : :: ::.:.. .. .:..... :::. :::.: .: : : : .:.: :
CCDS28 DPQEQLYKAYTGFEQAARALMEDTLRVAQALRPHGLWGFYHYPACGNGWHSMASNYTGRC
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 FNVEIKRNDDLSWLWNESTALYPSIYLNTQQSPVAATLYVRNRVREAIRVSKIPDAKSPL
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::.::.:.. . .:::::.:: ..: ..::::.:.:.:: ::. : . : : .:.
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280 290 300 310 320 330
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400 410
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:: ...:: .::: :.. .: : ::
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