Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5593
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5593, 420 aa
1>>>pF1KE5593 420 - 420 aa - 420 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6944+/-0.000813; mu= 10.5415+/- 0.049
mean_var=110.0552+/-22.504, 0's: 0 Z-trim(110.7): 124 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.122256
statistics sampled from 11626 (11773) to 11626 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.722), E-opt: 0.2 (0.362), width: 16
Scan time: 2.700
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS4995.1 TPBG gene_id:7162|Hs108|chr6 ( 420) 2790 502.8 2.5e-142
CCDS7957.1 RTN4RL2 gene_id:349667|Hs108|chr11 ( 420) 405 82.2 1.1e-15
CCDS13777.1 RTN4R gene_id:65078|Hs108|chr22 ( 473) 367 75.5 1.2e-13
CCDS60895.1 TPBGL gene_id:100507050|Hs108|chr11 ( 382) 334 69.6 5.7e-12
CCDS75573.1 TRIL gene_id:9865|Hs108|chr7 ( 811) 322 67.7 4.6e-11
>>CCDS4995.1 TPBG gene_id:7162|Hs108|chr6 (420 aa)
initn: 2790 init1: 2790 opt: 2790 Z-score: 2668.8 bits: 502.8 E(32554): 2.5e-142
Smith-Waterman score: 2790; 100.0% identity (100.0% similar) in 420 aa overlap (1-420:1-420)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MPGGCSRGPAAGDGRLRLARLALVLLGWVSSSSPTSSASSFSSSAPFLASAVSAQPPLPD
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CCDS49 MPGGCSRGPAAGDGRLRLARLALVLLGWVSSSSPTSSASSFSSSAPFLASAVSAQPPLPD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 QCPALCECSEAARTVKCVNRNLTEVPTDLPAYVRNLFLTGNQLAVLPAGAFARRPPLAEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 QCPALCECSEAARTVKCVNRNLTEVPTDLPAYVRNLFLTGNQLAVLPAGAFARRPPLAEL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 AALNLSGSRLDEVRAGAFEHLPSLRQLDLSHNPLADLSPFAFSGSNASVSAPSPLVELIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 AALNLSGSRLDEVRAGAFEHLPSLRQLDLSHNPLADLSPFAFSGSNASVSAPSPLVELIL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 NHIVPPEDERQNRSFEGMVVAALLAGRALQGLRRLELASNHFLYLPRDVLAQLPSLRHLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 NHIVPPEDERQNRSFEGMVVAALLAGRALQGLRRLELASNHFLYLPRDVLAQLPSLRHLD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 LSNNSLVSLTYVSFRNLTHLESLHLEDNALKVLHNGTLAELQGLPHIRVFLDNNPWVCDC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 LSNNSLVSLTYVSFRNLTHLESLHLEDNALKVLHNGTLAELQGLPHIRVFLDNNPWVCDC
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 HMADMVTWLKETEVVQGKDRLTCAYPEKMRNRVLLELNSADLDCDPILPPSLQTSYVFLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 HMADMVTWLKETEVVQGKDRLTCAYPEKMRNRVLLELNSADLDCDPILPPSLQTSYVFLG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 IVLALIGAIFLLVLYLNRKGIKKWMHNIRDACRDHMEGYHYRYEINADPRLTNLSSNSDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 IVLALIGAIFLLVLYLNRKGIKKWMHNIRDACRDHMEGYHYRYEINADPRLTNLSSNSDV
370 380 390 400 410 420
>>CCDS7957.1 RTN4RL2 gene_id:349667|Hs108|chr11 (420 aa)
initn: 285 init1: 138 opt: 405 Z-score: 395.4 bits: 82.2 E(32554): 1.1e-15
Smith-Waterman score: 407; 31.9% identity (54.7% similar) in 320 aa overlap (54-349:23-315)
30 40 50 60 70 80
pF1KE5 VLLGWVSSSSPTSSASSFSSSAPFLASAVSAQPPLPDQCPALCECSEAARTVKCVNRNLT
: : .:: :: : . ::.: :..
CCDS79 MLPGLRRLLQAPASACLLLMLLALPLAAPSCPMLCTCYSSPPTVSCQANNFS
10 20 30 40 50
90 100 110 120 130 140
pF1KE5 EVPTDLPAYVRNLFLTGNQLAVLPAGAFARRPPLAELAALNLSGSRLDEVRAGAFEHLPS
:: .:: .. ::: .: . .: :.:. ..: .: : .. :. . :.:.:: .
CCDS79 SVPLSLPPSTQRLFLQNNLIRTLRPGTFG-----SNLLTLWLFSNNLSTIYPGTFRHLQA
60 70 80 90 100
150 160 170 180 190 200
pF1KE5 LRQLDLSHN-PLADLSPFAFSGSNASVSAPSPLVELILNHIVPPEDERQNRSFEGMVVAA
:..:::. : : .: : .:.: : .: :. . : :. : .
CCDS79 LEELDLGDNRHLRSLEPDTFQG----------LERLQSLHLY----RCQLSSLPGNIF--
110 120 130 140 150
210 220 230 240 250 260
pF1KE5 LLAGRALQGLRRLELASNHFLYLPRDVLAQLPSLRHLDLSNNSLVSLTYVSFRNLTHLES
:.: .:. : : : .:.: :..:.: .: :: : .: : :: ::.: :.
CCDS79 ----RGLVSLQYLYLQENSLLHLQDDLFADLANLSHLFLHGNRLRLLTEHVFRGLGSLDR
160 170 180 190 200
270 280 290 300
pF1KE5 LHLEDNALKVLH----------------NGTLAELQG-----LPHIRVF-LDNNPWVCDC
: :. : :. .: :..:: : : :: .. . :. :::.:::
CCDS79 LLLHGNRLQGVHRAAFRGLSRLTILYLFNNSLASLPGEALADLPSLEFLRLNANPWACDC
210 220 230 240 250 260
310 320 330 340 350
pF1KE5 HMADMVTWLKETEVVQGKDRLTCAYPEKMRNRVLLELNSADLD-CDPILPPSLQTSYVFL
. . .:.....: ... .::: : . ..: : : ::.. : : :
CCDS79 RARPLWAWFQRARV--SSSDVTCATPPERQGRDLRALREADFQACPPAAPTRPGSRARGN
270 280 290 300 310 320
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 GIVLALIGAIFLLVLYLNRKGIKKWMHNIRDACRDHMEGYHYRYEINADPRLTNLSSNSD
CCDS79 SSSNHLYGVAEAGAPPADPSTLYRDLPAEDSRGRQGGDAPTEDDYWGGYGGEDQRGEQMC
330 340 350 360 370 380
>>CCDS13777.1 RTN4R gene_id:65078|Hs108|chr22 (473 aa)
initn: 257 init1: 99 opt: 367 Z-score: 358.4 bits: 75.5 E(32554): 1.2e-13
Smith-Waterman score: 367; 30.0% identity (59.6% similar) in 297 aa overlap (62-350:27-315)
40 50 60 70 80 90
pF1KE5 SSPTSSASSFSSSAPFLASAVSAQPPLPDQCPALCEC-SEAARTVKCVNRNLTEVPTDLP
::. : : .: :..: ...: ::. .:
CCDS13 MKRASAGGSRLLAWVLWLQAWQVAAPCPGACVCYNEPKVTTSCPQQGLQAVPVGIP
10 20 30 40 50
100 110 120 130 140
pF1KE5 AYVRNLFLTGNQLAVLPAGAF-ARRPPLAELAALNLSGSRLDEVRAGAFEHLPSLRQLDL
: . .:: ::... .::..: : : .:. : : .. : .. :.:: : :.::::
CCDS13 AASQRIFLHGNRISHVPAASFRACR----NLTILWLHSNVLARIDAAAFTGLALLEQLDL
60 70 80 90 100 110
150 160 170 180 190 200
pF1KE5 SHNP-LADLSPFAFSGSNA--SVSAPSPLVELILNHIVPPEDERQNRSFEGMVVAALLAG
: : : ...: .: : . .. .. . . : .. .. ::
CCDS13 SDNAQLRSVDPATFHGLGRLHTLHLDRCGLQELGPGLFRGLAALQYLYLQDNALQALPDD
120 130 140 150 160 170
210 220 230 240 250 260
pF1KE5 --RALQGLRRLELASNHFLYLPRDVLAQLPSLRHLDLSNNSLVSLTYVSFRNLTHLESLH
: : .: .: : .:.. .:. .. : :: .: : .: .. . .::.: .: .:.
CCDS13 TFRDLGNLTHLFLHGNRISSVPERAFRGLHSLDRLLLHQNRVAHVHPHAFRDLGRLMTLY
180 190 200 210 220 230
270 280 290 300 310 320
pF1KE5 LEDNALKVLHNGTLAELQGLPHIRVFLDNNPWVCDCHMADMVTWLKETEVVQGKDRLTCA
: : :..: . .:: :..: ..: :..:::::::. . .::.. . ..... :.
CCDS13 LFANNLSALPTEALAPLRALQYLR--LNDNPWVCDCRARPLWAWLQKFR--GSSSEVPCS
240 250 260 270 280
330 340 350 360 370 380
pF1KE5 YPEKMRNRVLLELNSADLD-CDPILPPSLQTSYVFLGIVLALIGAIFLLVLYLNRKGIKK
:... .: : .: . ::. : :
CCDS13 LPQRLAGRDLKRLAANDLQGCAVATGPYHPIWTGRATDEEPLGLPKCCQPDAADKASVLE
290 300 310 320 330 340
>>CCDS60895.1 TPBGL gene_id:100507050|Hs108|chr11 (382 aa)
initn: 785 init1: 334 opt: 334 Z-score: 328.3 bits: 69.6 E(32554): 5.7e-12
Smith-Waterman score: 702; 40.1% identity (58.4% similar) in 392 aa overlap (47-410:14-362)
20 30 40 50 60 70
pF1KE5 RLARLALVLLGWVSSSSPTSSASSFSSSAPFLASAVSAQPPLPDQCPALCECSEAARTV-
.:..:. .:: : :: : : . . .
CCDS60 MAPRAGQPGLQGLLLVAAALSQPAAP--CPFQCYCFGGPKLLL
10 20 30 40
80 90 100 110 120
pF1KE5 KCVN-RNLTEVPTDLPAYVRNLFLTGNQLAVLPAGAFAR-----------RPPLAELAAL
.:.. .: . : :.: .::: ..: .:.:: :.::: : :: :.::
CCDS60 RCASGAELRQPPRDVPPDARNLTIVGANLTVLRAAAFAGGDGDGDQAAGVRLPL--LSAL
50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 NLSGSRLDEVRAGAFEHLPSLRQLDLSHNPLADLSPFAFSGSNASVSAPSPLVELILNHI
:. .... :. :::. :::: :::::::: :. :: : : : : :::
CCDS60 RLTHNHIEVVEDGAFDGLPSLAALDLSHNPLRALGGGAFRGLPA-------LRSLQLNH-
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 VPPEDERQNRSFEGMVVAALLAGRALQGLRRLELASNHFLYLPRDVLAQLPSLRHLDLSN
: . .: :: : :. : :: : :: : :..
CCDS60 -----------------ALVRGGPAL--LAALDAA-----------LAPLAELRLLGLAG
160 170 180
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 NSLVSLTYVSFRNLTHLESLHLEDNALKVLHNGTLAELQ---GLPHIRVFLDNNPWVCDC
:.: : ...: :..::.: .. ::: : : :. ::: :..: .:: : :
CCDS60 NALSRLPPAALR-LARLEQLDVRLNALAGLDPDELRALERDGGLPGPRLLLADNPLRCGC
190 200 210 220 230 240
310 320 330 340
pF1KE5 HMADMVTWLKE-TEVVQGKDRLTCAYPEKMRNRVLLELNSADLDCDP-----------IL
...::.. :: : . :: :: :. . .: ::.:..: : :
CCDS60 AARPLLAWLRNATERVPDSRRLRCAAPRALLDRPLLDLDGARLRCADSGADARGEEAEAA
250 260 270 280 290 300
350 360 370 380 390 400
pF1KE5 PPSLQTSYVFLGIVLALIGAIFLLVLYLNRKGIKKWMHNIRDACRDHMEGYHYRYEINAD
: :..::::.:.:::::: :::.::::::.::..::.:.:.::::.::::::::: .::
CCDS60 GPELEASYVFFGLVLALIGLIFLMVLYLNRRGIQRWMRNLREACRDQMEGYHYRYEQDAD
310 320 330 340 350 360
410 420
pF1KE5 PRLTNLSSNSDV
::
CCDS60 PRRAPAPAAPAGSRATSPGSGL
370 380
>>CCDS75573.1 TRIL gene_id:9865|Hs108|chr7 (811 aa)
initn: 336 init1: 136 opt: 322 Z-score: 312.1 bits: 67.7 E(32554): 4.6e-11
Smith-Waterman score: 328; 33.7% identity (59.8% similar) in 276 aa overlap (96-355:160-422)
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 CECSEAARTVKCVNRNLTEVPTDLPAYVRNLFLTGNQLAVLPAGAFARRPPLAELAALNL
: : :: :..:: ..:: ::..: :.:
CCDS75 LRKLRILYANGNEISRLSRGSFEGLESLVKLRLDGNALGALPDAVFA---PLGNLLYLHL
130 140 150 160 170 180
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 SGSRLDEVRAGAFEHLPSLRQLDLSHNPLADLSPFAFSGSNASVSAP-SPLVELILN---
..:. . .:: .: .:: :.:: : .:.: : .:.. :: : :::.
CCDS75 ESNRIRFLGKNAFAQLGKLRFLNLSAN---ELQP---SLRHAATFAPLRSLSSLILSANN
190 200 210 220 230 240
190 200 210 220 230
pF1KE5 --HIVPPEDERQNR----SFEGMVVAALL--AGRALQGLRRLELASNHFLYLPRDVLAQL
:. : .. : :..: .. : : .:..::.:.: .:.. :: .: :
CCDS75 LQHLGPRIFQHLPRLGLLSLRGNQLTHLAPEAFWGLEALRELRLEGNRLSQLPTALLEPL
250 260 270 280 290 300
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 PSLRHLDLSNNSLVSLTYVSFRNLTHLESLHLEDNALKVLHNGTLAELQGLPHIRVFLDN
::. ::::.: : .: ..: .: .:. : :..:::..: . .: .: :. ::.
CCDS75 HSLEALDLSGNELSALHPATFGHLGRLRELSLRNNALSALSGDIFAASPAL--YRLDLDG
310 320 330 340 350
300 310 320 330 340
pF1KE5 NPWVCDCHMADMVTWLKETEVVQGKDRLT----CAYPEKMRNRVLLELNSADLDCDPILP
: :.:::.. . :. . . ::. :: : .: .:.. : :.. .:.
CCDS75 NGWTCDCRLRGLKRWMGDWHS-QGR-LLTVFVQCRHPPALRGKYLDYLDDQQLQNGSCAD
360 370 380 390 400 410
350 360 370 380 390 400
pF1KE5 PSLQTSYVFLGIVLALIGAIFLLVLYLNRKGIKKWMHNIRDACRDHMEGYHYRYEINADP
:: ..:
CCDS75 PSPSASLTADRRRQPLPTAAGEEMTPPAGLAEELPPQPQLQQQGRFLAGVAWDGAARELV
420 430 440 450 460 470
420 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 02:07:52 2016 done: Tue Nov 8 02:07:53 2016
Total Scan time: 2.700 Total Display time: 0.000
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]