Result of FASTA (omim) for
pFN21AE5578
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5578, 458 aa
1>>>pF1KE5578 458 - 458 aa - 458 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1049+/-0.000311; mu= 15.4462+/- 0.019
mean_var=105.0621+/-21.303, 0's: 0 Z-trim(118.9): 47 B-trim: 868 in 1/59
Lambda= 0.125127
statistics sampled from 32212 (32260) to 32212 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.713), E-opt: 0.2 (0.378), width: 16
Scan time: 7.750
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_003032 (OMIM: 182381,233100) sodium/glucose cot ( 672) 2550 470.8 4.8e-132
XP_006721135 (OMIM: 182381,233100) PREDICTED: sodi ( 705) 2550 470.8 5e-132
XP_011528633 (OMIM: 182380,606824) PREDICTED: sodi ( 432) 1736 323.7 5.9e-88
NP_000334 (OMIM: 182380,606824) sodium/glucose cot ( 664) 1736 323.9 8.2e-88
XP_016878391 (OMIM: 610238) PREDICTED: sodium/myo- ( 675) 1490 279.5 1.9e-74
XP_016878390 (OMIM: 610238) PREDICTED: sodium/myo- ( 675) 1490 279.5 1.9e-74
NP_443176 (OMIM: 610238) sodium/myo-inositol cotra ( 675) 1490 279.5 1.9e-74
XP_005255137 (OMIM: 610238) PREDICTED: sodium/myo- ( 675) 1490 279.5 1.9e-74
XP_016878392 (OMIM: 610238) PREDICTED: sodium/myo- ( 675) 1490 279.5 1.9e-74
XP_016878389 (OMIM: 610238) PREDICTED: sodium/myo- ( 675) 1490 279.5 1.9e-74
XP_016878393 (OMIM: 610238) PREDICTED: sodium/myo- ( 662) 1395 262.3 2.8e-69
NP_008864 (OMIM: 600444) sodium/myo-inositol cotra ( 718) 1394 262.2 3.4e-69
NP_001245342 (OMIM: 610238) sodium/myo-inositol co ( 611) 1329 250.4 1e-65
XP_016878395 (OMIM: 610238) PREDICTED: sodium/myo- ( 611) 1329 250.4 1e-65
NP_001243243 (OMIM: 182380,606824) sodium/glucose ( 537) 1163 220.4 9.6e-57
NP_001245341 (OMIM: 610238) sodium/myo-inositol co ( 605) 885 170.2 1.3e-41
XP_006721078 (OMIM: 610238) PREDICTED: sodium/myo- ( 576) 877 168.8 3.5e-41
XP_011544027 (OMIM: 610238) PREDICTED: sodium/myo- ( 627) 877 168.8 3.8e-41
XP_016878394 (OMIM: 610238) PREDICTED: sodium/myo- ( 640) 877 168.8 3.8e-41
NP_001245340 (OMIM: 610238) sodium/myo-inositol co ( 640) 877 168.8 3.8e-41
XP_016878397 (OMIM: 610238) PREDICTED: sodium/myo- ( 583) 875 168.4 4.6e-41
XP_016878396 (OMIM: 610238) PREDICTED: sodium/myo- ( 583) 875 168.4 4.6e-41
XP_005255139 (OMIM: 610238) PREDICTED: sodium/myo- ( 514) 848 163.5 1.2e-39
NP_001245343 (OMIM: 610238) sodium/myo-inositol co ( 519) 714 139.3 2.4e-32
XP_016878398 (OMIM: 610238) PREDICTED: sodium/myo- ( 548) 485 98.0 6.8e-20
XP_011544030 (OMIM: 610238) PREDICTED: sodium/myo- ( 365) 298 64.1 7.3e-10
NP_000444 (OMIM: 274400,601843) sodium/iodide cotr ( 643) 297 64.1 1.3e-09
XP_011526494 (OMIM: 274400,601843) PREDICTED: sodi ( 654) 297 64.1 1.3e-09
XP_011518223 (OMIM: 612455) PREDICTED: sodium-coup ( 413) 288 62.3 2.8e-09
XP_006718219 (OMIM: 612455) PREDICTED: sodium-coup ( 417) 288 62.3 2.8e-09
NP_848593 (OMIM: 612455) sodium-coupled monocarbox ( 618) 288 62.5 3.8e-09
XP_006712192 (OMIM: 604024) PREDICTED: sodium-depe ( 635) 262 57.8 1e-07
NP_066918 (OMIM: 604024) sodium-dependent multivit ( 635) 262 57.8 1e-07
XP_006712191 (OMIM: 604024) PREDICTED: sodium-depe ( 635) 262 57.8 1e-07
XP_006712193 (OMIM: 604024) PREDICTED: sodium-depe ( 635) 262 57.8 1e-07
XP_016874399 (OMIM: 608044) PREDICTED: sodium-coup ( 444) 251 55.7 3e-07
NP_666018 (OMIM: 608044) sodium-coupled monocarbox ( 610) 251 55.8 3.8e-07
NP_068587 (OMIM: 158580,608761,617143) high affini ( 580) 222 50.5 1.4e-05
NP_001291934 (OMIM: 158580,608761,617143) high aff ( 580) 222 50.5 1.4e-05
XP_016882647 (OMIM: 274400,601843) PREDICTED: sodi ( 554) 193 45.3 0.00051
XP_011526495 (OMIM: 274400,601843) PREDICTED: sodi ( 565) 193 45.3 0.00051
>>NP_003032 (OMIM: 182381,233100) sodium/glucose cotrans (672 aa)
initn: 2550 init1: 2550 opt: 2550 Z-score: 2491.5 bits: 470.8 E(85289): 4.8e-132
Smith-Waterman score: 2550; 100.0% identity (100.0% similar) in 377 aa overlap (1-377:1-377)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MEEHTEAGSAPEMGAQKALIDNPADILVIAAYFLLVIGVGLWSMCRTNRGTVGGYFLAGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 MEEHTEAGSAPEMGAQKALIDNPADILVIAAYFLLVIGVGLWSMCRTNRGTVGGYFLAGR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 SMVWWPVGASLFASNIGSGHFVGLAGTGAASGLAVAGFEWNALFVVLLLGWLFAPVYLTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 SMVWWPVGASLFASNIGSGHFVGLAGTGAASGLAVAGFEWNALFVVLLLGWLFAPVYLTA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 GVITMPQYLRKRFGGRRIRLYLSVLSLFLYIFTKISVDMFSGAVFIQQALGWNIYASVIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 GVITMPQYLRKRFGGRRIRLYLSVLSLFLYIFTKISVDMFSGAVFIQQALGWNIYASVIA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 LLGITMIYTVTGGLAALMYTDTVQTFVILGGACILMGYAFHEVGGYSGLFDKYLGAATSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 LLGITMIYTVTGGLAALMYTDTVQTFVILGGACILMGYAFHEVGGYSGLFDKYLGAATSL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 TVSEDPAVGNISSFCYRPRPDSYHLLRHPVTGDLPWPALLLGLTIVSGWYWCSDQVIVQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 TVSEDPAVGNISSFCYRPRPDSYHLLRHPVTGDLPWPALLLGLTIVSGWYWCSDQVIVQR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 CLAGKSLTHIKAGCILCGYLKLTPMFLMVMPGMISRILYPDEVACVVPEVCRRVCGTEVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 CLAGKSLTHIKAGCILCGYLKLTPMFLMVMPGMISRILYPDEVACVVPEVCRRVCGTEVG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 CSNIAYPRLVVKLMPNGRLLGTHRGPADGPGTPDSRVLLRLGQLCAALGVPSFPLRRALP
:::::::::::::::::
NP_003 CSNIAYPRLVVKLMPNGLRGLMLAVMLAALMSSLASIFNSSSTLFTMDIYTRLRPRAGDR
370 380 390 400 410 420
>>XP_006721135 (OMIM: 182381,233100) PREDICTED: sodium/g (705 aa)
initn: 2550 init1: 2550 opt: 2550 Z-score: 2491.3 bits: 470.8 E(85289): 5e-132
Smith-Waterman score: 2550; 100.0% identity (100.0% similar) in 377 aa overlap (1-377:8-384)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MEEHTEAGSAPEMGAQKALIDNPADILVIAAYFLLVIGVGLWSMCRTNRGTVG
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 MGQILGRMEEHTEAGSAPEMGAQKALIDNPADILVIAAYFLLVIGVGLWSMCRTNRGTVG
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 GYFLAGRSMVWWPVGASLFASNIGSGHFVGLAGTGAASGLAVAGFEWNALFVVLLLGWLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 GYFLAGRSMVWWPVGASLFASNIGSGHFVGLAGTGAASGLAVAGFEWNALFVVLLLGWLF
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 APVYLTAGVITMPQYLRKRFGGRRIRLYLSVLSLFLYIFTKISVDMFSGAVFIQQALGWN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 APVYLTAGVITMPQYLRKRFGGRRIRLYLSVLSLFLYIFTKISVDMFSGAVFIQQALGWN
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 IYASVIALLGITMIYTVTGGLAALMYTDTVQTFVILGGACILMGYAFHEVGGYSGLFDKY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 IYASVIALLGITMIYTVTGGLAALMYTDTVQTFVILGGACILMGYAFHEVGGYSGLFDKY
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 LGAATSLTVSEDPAVGNISSFCYRPRPDSYHLLRHPVTGDLPWPALLLGLTIVSGWYWCS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 LGAATSLTVSEDPAVGNISSFCYRPRPDSYHLLRHPVTGDLPWPALLLGLTIVSGWYWCS
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 DQVIVQRCLAGKSLTHIKAGCILCGYLKLTPMFLMVMPGMISRILYPDEVACVVPEVCRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 DQVIVQRCLAGKSLTHIKAGCILCGYLKLTPMFLMVMPGMISRILYPDEVACVVPEVCRR
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 VCGTEVGCSNIAYPRLVVKLMPNGRLLGTHRGPADGPGTPDSRVLLRLGQLCAALGVPSF
::::::::::::::::::::::::
XP_006 VCGTEVGCSNIAYPRLVVKLMPNGLRGLMLAVMLAALMSSLASIFNSSSTLFTMDIYTRL
370 380 390 400 410 420
>>XP_011528633 (OMIM: 182380,606824) PREDICTED: sodium/g (432 aa)
initn: 1741 init1: 1064 opt: 1736 Z-score: 1700.0 bits: 323.7 E(85289): 5.9e-88
Smith-Waterman score: 1736; 66.3% identity (89.2% similar) in 362 aa overlap (19-377:22-377)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MEEHTEAGSAPEMGAQKALIDNPADILVIAAYFLLVIGVGLWSMCRTNRGTVGGYFL
:: : ::: .:. ::..:..::::.: ::::::::.::
XP_011 MDSSTWSPKTTAVTRPVETHELIRNAADISIIVIYFVVVMAVGLWAMFSTNRGTVGGFFL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 AGRSMVWWPVGASLFASNIGSGHFVGLAGTGAASGLAVAGFEWNALFVVLLLGWLFAPVY
:::::::::.:::::::::::::::::::::::::.:..::::::: .:..:::::.:.:
XP_011 AGRSMVWWPIGASLFASNIGSGHFVGLAGTGAASGIAIGGFEWNALVLVVVLGWLFVPIY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 LTAGVITMPQYLRKRFGGRRIRLYLSVLSLFLYIFTKISVDMFSGAVFIQQALGWNIYAS
. :::.:::.::::::::.::..:::.:::.::::::::.:.::::.::. ::: :.: .
XP_011 IKAGVVTMPEYLRKRFGGQRIQVYLSLLSLLLYIFTKISADIFSGAIFINLALGLNLYLA
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 VIALLGITMIYTVTGGLAALMYTDTVQTFVILGGACILMGYAFHEVGGYSGLFDKYLGAA
.. ::.:: .::.::::::..::::.:: ..: :. :: :.::::::::.....::. :
XP_011 IFLLLAITALYTITGGLAAVIYTDTLQTVIMLVGSLILTGFAFHEVGGYDAFMEKYMKAI
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 TSLTVSEDPAVGNISSF---CYRPRPDSYHLLRHPVTGDLPWPALLLGLTIVSGWYWCSD
.. ::. :: ..: :: :: ::.:..: :.:::::::....:..:.. ::::.:
XP_011 PTI-VSD----GN-TTFQEKCYTPRADSFHIFRDPLTGDLPWPGFIFGMSILTLWYWCTD
250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 QVIVQRCLAGKSLTHIKAGCILCGYLKLTPMFLMVMPGMISRILYPDEVACVVPEVCRRV
::::::::..:...:.:.:::::::::: :::.:::::::::::: ...::::: :..
XP_011 QVIVQRCLSAKNMSHVKGGCILCGYLKLMPMFIMVMPGMISRILYTEKIACVVPSECEKY
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 CGTEVGCSNIAYPRLVVKLMPNGRLLGTHRGPADGPGTPDSRVLLRLGQLCAALGVPSFP
:::.:::.::::: :::.:::::
XP_011 CGTKVGCTNIAYPTLVVELMPNGLRGLMLSVMLASLMSSLTSIFNSASTLFTMDIYAKVR
360 370 380 390 400 410
>>NP_000334 (OMIM: 182380,606824) sodium/glucose cotrans (664 aa)
initn: 1741 init1: 1064 opt: 1736 Z-score: 1697.5 bits: 323.9 E(85289): 8.2e-88
Smith-Waterman score: 1736; 66.3% identity (89.2% similar) in 362 aa overlap (19-377:22-377)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MEEHTEAGSAPEMGAQKALIDNPADILVIAAYFLLVIGVGLWSMCRTNRGTVGGYFL
:: : ::: .:. ::..:..::::.: ::::::::.::
NP_000 MDSSTWSPKTTAVTRPVETHELIRNAADISIIVIYFVVVMAVGLWAMFSTNRGTVGGFFL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 AGRSMVWWPVGASLFASNIGSGHFVGLAGTGAASGLAVAGFEWNALFVVLLLGWLFAPVY
:::::::::.:::::::::::::::::::::::::.:..::::::: .:..:::::.:.:
NP_000 AGRSMVWWPIGASLFASNIGSGHFVGLAGTGAASGIAIGGFEWNALVLVVVLGWLFVPIY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 LTAGVITMPQYLRKRFGGRRIRLYLSVLSLFLYIFTKISVDMFSGAVFIQQALGWNIYAS
. :::.:::.::::::::.::..:::.:::.::::::::.:.::::.::. ::: :.: .
NP_000 IKAGVVTMPEYLRKRFGGQRIQVYLSLLSLLLYIFTKISADIFSGAIFINLALGLNLYLA
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 VIALLGITMIYTVTGGLAALMYTDTVQTFVILGGACILMGYAFHEVGGYSGLFDKYLGAA
.. ::.:: .::.::::::..::::.:: ..: :. :: :.::::::::.....::. :
NP_000 IFLLLAITALYTITGGLAAVIYTDTLQTVIMLVGSLILTGFAFHEVGGYDAFMEKYMKAI
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 TSLTVSEDPAVGNISSF---CYRPRPDSYHLLRHPVTGDLPWPALLLGLTIVSGWYWCSD
.. ::. :: ..: :: :: ::.:..: :.:::::::....:..:.. ::::.:
NP_000 PTI-VSD----GN-TTFQEKCYTPRADSFHIFRDPLTGDLPWPGFIFGMSILTLWYWCTD
250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 QVIVQRCLAGKSLTHIKAGCILCGYLKLTPMFLMVMPGMISRILYPDEVACVVPEVCRRV
::::::::..:...:.:.:::::::::: :::.:::::::::::: ...::::: :..
NP_000 QVIVQRCLSAKNMSHVKGGCILCGYLKLMPMFIMVMPGMISRILYTEKIACVVPSECEKY
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 CGTEVGCSNIAYPRLVVKLMPNGRLLGTHRGPADGPGTPDSRVLLRLGQLCAALGVPSFP
:::.:::.::::: :::.:::::
NP_000 CGTKVGCTNIAYPTLVVELMPNGLRGLMLSVMLASLMSSLTSIFNSASTLFTMDIYAKVR
360 370 380 390 400 410
>>XP_016878391 (OMIM: 610238) PREDICTED: sodium/myo-inos (675 aa)
initn: 1494 init1: 921 opt: 1490 Z-score: 1457.4 bits: 279.5 E(85289): 1.9e-74
Smith-Waterman score: 1490; 55.5% identity (82.6% similar) in 380 aa overlap (1-377:1-372)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MEEHTEAGSAPEMGAQKALIDN---PADILVIAAYFLLVIGVGLWSMCRTNRGTVGGYFL
:: : . . :.. :. .. :.:: :.. :::.:..::::: .:.: :: ::::
XP_016 MESGTSSPQPPQLDPLDAFPQKGLEPGDIAVLVLYFLFVLAVGLWSTVKTKRDTVKGYFL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 AGRSMVWWPVGASLFASNIGSGHFVGLAGTGAASGLAVAGFEWNALFVVLLLGWLFAPVY
:: .::::::::::::::.:::::.::::.:::.:..:...: :.:: ::.:.:.: :.:
XP_016 AGGDMVWWPVGASLFASNVGSGHFIGLAGSGAATGISVSAYELNGLFSVLMLAWIFLPIY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 LTAGVITMPQYLRKRFGGRRIRLYLSVLSLFLYIFTKISVDMFSGAVFIQQALGWNIYAS
... : :::.:::::::: :: . :.:: ::.::::::::::..::.::::.: ..: .
XP_016 IAGQVTTMPEYLRKRFGGIRIPIILAVLYLFIYIFTKISVDMYAGAIFIQQSLHLDLYLA
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 VIALLGITMIYTVTGGLAALMYTDTVQTFVILGGACILMGYAFHEVGGYSGLFDKYLGAA
...::.:: .:::.:::::..:::..::...: :: ::::.: :::. :: .::. :
XP_016 IVGLLAITAVYTVAGGLAAVIYTDALQTLIMLIGALTLMGYSFAAVGGMEGLKEKYFLAL
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 TSLTVSEDPAVGNISSFCYRPRPDSYHLLRHPVTGDLPWPALLLGLTIVSGWYWCSDQVI
.: . ::. : : :: :..:..: :.:.:::::..:.:..: : ::::.::::
XP_016 AS-NRSEN-------SSCGLPREDAFHIFRDPLTSDLPWPGVLFGMSIPSLWYWCTDQVI
250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 VQRCLAGKSLTHIKAGCILCGYLKLTPMFLMVMPGMISRILYPDEVACVVPEVCRRVCGT
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300 310 320 330 340 350
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:::.::::.::..:.:.:
XP_016 PSGCSDIAYPKLVLELLPTGLRGLMMAVMVAALMSSLTSIFNSASTIFTMDLWNHLRPRA
360 370 380 390 400 410
>>XP_016878390 (OMIM: 610238) PREDICTED: sodium/myo-inos (675 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KE5 MEEHTEAGSAPEMGAQKALIDN---PADILVIAAYFLLVIGVGLWSMCRTNRGTVGGYFL
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XP_016 MESGTSSPQPPQLDPLDAFPQKGLEPGDIAVLVLYFLFVLAVGLWSTVKTKRDTVKGYFL
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XP_016 AGGDMVWWPVGASLFASNVGSGHFIGLAGSGAATGISVSAYELNGLFSVLMLAWIFLPIY
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pF1KE5 LTAGVITMPQYLRKRFGGRRIRLYLSVLSLFLYIFTKISVDMFSGAVFIQQALGWNIYAS
... : :::.:::::::: :: . :.:: ::.::::::::::..::.::::.: ..: .
XP_016 IAGQVTTMPEYLRKRFGGIRIPIILAVLYLFIYIFTKISVDMYAGAIFIQQSLHLDLYLA
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pF1KE5 VIALLGITMIYTVTGGLAALMYTDTVQTFVILGGACILMGYAFHEVGGYSGLFDKYLGAA
...::.:: .:::.:::::..:::..::...: :: ::::.: :::. :: .::. :
XP_016 IVGLLAITAVYTVAGGLAAVIYTDALQTLIMLIGALTLMGYSFAAVGGMEGLKEKYFLAL
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pF1KE5 VQRCLAGKSLTHIKAGCILCGYLKLTPMFLMVMPGMISRILYPDEVACVVPEVCRRVCGT
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XP_016 PSGCSDIAYPKLVLELLPTGLRGLMMAVMVAALMSSLTSIFNSASTIFTMDLWNHLRPRA
360 370 380 390 400 410
>>NP_443176 (OMIM: 610238) sodium/myo-inositol cotranspo (675 aa)
initn: 1494 init1: 921 opt: 1490 Z-score: 1457.4 bits: 279.5 E(85289): 1.9e-74
Smith-Waterman score: 1490; 55.5% identity (82.6% similar) in 380 aa overlap (1-377:1-372)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MEEHTEAGSAPEMGAQKALIDN---PADILVIAAYFLLVIGVGLWSMCRTNRGTVGGYFL
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NP_443 AGGDMVWWPVGASLFASNVGSGHFIGLAGSGAATGISVSAYELNGLFSVLMLAWIFLPIY
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pF1KE5 LTAGVITMPQYLRKRFGGRRIRLYLSVLSLFLYIFTKISVDMFSGAVFIQQALGWNIYAS
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NP_443 IAGQVTTMPEYLRKRFGGIRIPIILAVLYLFIYIFTKISVDMYAGAIFIQQSLHLDLYLA
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pF1KE5 VIALLGITMIYTVTGGLAALMYTDTVQTFVILGGACILMGYAFHEVGGYSGLFDKYLGAA
...::.:: .:::.:::::..:::..::...: :: ::::.: :::. :: .::. :
NP_443 IVGLLAITAVYTVAGGLAAVIYTDALQTLIMLIGALTLMGYSFAAVGGMEGLKEKYFLAL
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pF1KE5 TSLTVSEDPAVGNISSFCYRPRPDSYHLLRHPVTGDLPWPALLLGLTIVSGWYWCSDQVI
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NP_443 AS-NRSEN-------SSCGLPREDAFHIFRDPLTSDLPWPGVLFGMSIPSLWYWCTDQVI
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pF1KE5 VQRCLAGKSLTHIKAGCILCGYLKLTPMFLMVMPGMISRILYPDEVACVVPEVCRRVCGT
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NP_443 VQRTLAAKNLSHAKGGALMAAYLKVLPLFIMVFPGMVSRILFPDQVACADPEICQKICSN
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NP_443 PSGCSDIAYPKLVLELLPTGLRGLMMAVMVAALMSSLTSIFNSASTIFTMDLWNHLRPRA
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>>XP_005255137 (OMIM: 610238) PREDICTED: sodium/myo-inos (675 aa)
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Smith-Waterman score: 1490; 55.5% identity (82.6% similar) in 380 aa overlap (1-377:1-372)
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pF1KE5 MEEHTEAGSAPEMGAQKALIDN---PADILVIAAYFLLVIGVGLWSMCRTNRGTVGGYFL
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XP_005 AGGDMVWWPVGASLFASNVGSGHFIGLAGSGAATGISVSAYELNGLFSVLMLAWIFLPIY
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... : :::.:::::::: :: . :.:: ::.::::::::::..::.::::.: ..: .
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pF1KE5 VIALLGITMIYTVTGGLAALMYTDTVQTFVILGGACILMGYAFHEVGGYSGLFDKYLGAA
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XP_005 IVGLLAITAVYTVAGGLAAVIYTDALQTLIMLIGALTLMGYSFAAVGGMEGLKEKYFLAL
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XP_005 AS-NRSEN-------SSCGLPREDAFHIFRDPLTSDLPWPGVLFGMSIPSLWYWCTDQVI
250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 VQRCLAGKSLTHIKAGCILCGYLKLTPMFLMVMPGMISRILYPDEVACVVPEVCRRVCGT
::: ::.:.:.: :.: .. .:::. :.:.::.:::.::::.::.:::. ::.:...:..
XP_005 VQRTLAAKNLSHAKGGALMAAYLKVLPLFIMVFPGMVSRILFPDQVACADPEICQKICSN
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 EVGCSNIAYPRLVVKLMPNGRLLGTHRGPADGPGTPDSRVLLRLGQLCAALGVPSFPLRR
:::.::::.::..:.:.:
XP_005 PSGCSDIAYPKLVLELLPTGLRGLMMAVMVAALMSSLTSIFNSASTIFTMDLWNHLRPRA
360 370 380 390 400 410
>>XP_016878392 (OMIM: 610238) PREDICTED: sodium/myo-inos (675 aa)
initn: 1494 init1: 921 opt: 1490 Z-score: 1457.4 bits: 279.5 E(85289): 1.9e-74
Smith-Waterman score: 1490; 55.5% identity (82.6% similar) in 380 aa overlap (1-377:1-372)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MEEHTEAGSAPEMGAQKALIDN---PADILVIAAYFLLVIGVGLWSMCRTNRGTVGGYFL
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XP_016 MESGTSSPQPPQLDPLDAFPQKGLEPGDIAVLVLYFLFVLAVGLWSTVKTKRDTVKGYFL
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XP_016 AGGDMVWWPVGASLFASNVGSGHFIGLAGSGAATGISVSAYELNGLFSVLMLAWIFLPIY
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pF1KE5 VIALLGITMIYTVTGGLAALMYTDTVQTFVILGGACILMGYAFHEVGGYSGLFDKYLGAA
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XP_016 IVGLLAITAVYTVAGGLAAVIYTDALQTLIMLIGALTLMGYSFAAVGGMEGLKEKYFLAL
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240 250 260 270 280 290
pF1KE5 TSLTVSEDPAVGNISSFCYRPRPDSYHLLRHPVTGDLPWPALLLGLTIVSGWYWCSDQVI
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XP_016 AS-NRSEN-------SSCGLPREDAFHIFRDPLTSDLPWPGVLFGMSIPSLWYWCTDQVI
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pF1KE5 VQRCLAGKSLTHIKAGCILCGYLKLTPMFLMVMPGMISRILYPDEVACVVPEVCRRVCGT
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XP_016 VQRTLAAKNLSHAKGGALMAAYLKVLPLFIMVFPGMVSRILFPDQVACADPEICQKICSN
300 310 320 330 340 350
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pF1KE5 EVGCSNIAYPRLVVKLMPNGRLLGTHRGPADGPGTPDSRVLLRLGQLCAALGVPSFPLRR
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XP_016 PSGCSDIAYPKLVLELLPTGLRGLMMAVMVAALMSSLTSIFNSASTIFTMDLWNHLRPRA
360 370 380 390 400 410
>>XP_016878389 (OMIM: 610238) PREDICTED: sodium/myo-inos (675 aa)
initn: 1494 init1: 921 opt: 1490 Z-score: 1457.4 bits: 279.5 E(85289): 1.9e-74
Smith-Waterman score: 1490; 55.5% identity (82.6% similar) in 380 aa overlap (1-377:1-372)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MEEHTEAGSAPEMGAQKALIDN---PADILVIAAYFLLVIGVGLWSMCRTNRGTVGGYFL
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XP_016 MESGTSSPQPPQLDPLDAFPQKGLEPGDIAVLVLYFLFVLAVGLWSTVKTKRDTVKGYFL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 AGRSMVWWPVGASLFASNIGSGHFVGLAGTGAASGLAVAGFEWNALFVVLLLGWLFAPVY
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XP_016 AGGDMVWWPVGASLFASNVGSGHFIGLAGSGAATGISVSAYELNGLFSVLMLAWIFLPIY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 LTAGVITMPQYLRKRFGGRRIRLYLSVLSLFLYIFTKISVDMFSGAVFIQQALGWNIYAS
... : :::.:::::::: :: . :.:: ::.::::::::::..::.::::.: ..: .
XP_016 IAGQVTTMPEYLRKRFGGIRIPIILAVLYLFIYIFTKISVDMYAGAIFIQQSLHLDLYLA
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 VIALLGITMIYTVTGGLAALMYTDTVQTFVILGGACILMGYAFHEVGGYSGLFDKYLGAA
...::.:: .:::.:::::..:::..::...: :: ::::.: :::. :: .::. :
XP_016 IVGLLAITAVYTVAGGLAAVIYTDALQTLIMLIGALTLMGYSFAAVGGMEGLKEKYFLAL
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 TSLTVSEDPAVGNISSFCYRPRPDSYHLLRHPVTGDLPWPALLLGLTIVSGWYWCSDQVI
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XP_016 AS-NRSEN-------SSCGLPREDAFHIFRDPLTSDLPWPGVLFGMSIPSLWYWCTDQVI
250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 VQRCLAGKSLTHIKAGCILCGYLKLTPMFLMVMPGMISRILYPDEVACVVPEVCRRVCGT
::: ::.:.:.: :.: .. .:::. :.:.::.:::.::::.::.:::. ::.:...:..
XP_016 VQRTLAAKNLSHAKGGALMAAYLKVLPLFIMVFPGMVSRILFPDQVACADPEICQKICSN
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 EVGCSNIAYPRLVVKLMPNGRLLGTHRGPADGPGTPDSRVLLRLGQLCAALGVPSFPLRR
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XP_016 PSGCSDIAYPKLVLELLPTGLRGLMMAVMVAALMSSLTSIFNSASTIFTMDLWNHLRPRA
360 370 380 390 400 410
458 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]