Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5578
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5578, 458 aa
1>>>pF1KE5578 458 - 458 aa - 458 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4093+/-0.000777; mu= 13.6637+/- 0.047
mean_var=101.4899+/-20.684, 0's: 0 Z-trim(111.8): 28 B-trim: 279 in 1/48
Lambda= 0.127310
statistics sampled from 12648 (12670) to 12648 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.726), E-opt: 0.2 (0.389), width: 16
Scan time: 2.720
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS10714.1 SLC5A2 gene_id:6524|Hs108|chr16 ( 672) 2550 478.6 8.4e-135
CCDS13902.1 SLC5A1 gene_id:6523|Hs108|chr22 ( 664) 1736 329.1 8.4e-90
CCDS30709.2 SLC5A9 gene_id:200010|Hs108|chr1 ( 681) 1600 304.1 2.9e-82
CCDS13903.1 SLC5A4 gene_id:6527|Hs108|chr22 ( 659) 1581 300.6 3.1e-81
CCDS10625.1 SLC5A11 gene_id:115584|Hs108|chr16 ( 675) 1490 283.9 3.4e-76
CCDS42275.1 SLC5A10 gene_id:125206|Hs108|chr17 ( 596) 1489 283.7 3.5e-76
CCDS11201.2 SLC5A10 gene_id:125206|Hs108|chr17 ( 612) 1447 276.0 7.5e-74
CCDS33549.1 SLC5A3 gene_id:6526|Hs108|chr21 ( 718) 1394 266.3 7.3e-71
CCDS58439.1 SLC5A11 gene_id:115584|Hs108|chr16 ( 611) 1329 254.3 2.5e-67
CCDS59277.1 SLC5A10 gene_id:125206|Hs108|chr17 ( 560) 1293 247.7 2.3e-65
CCDS44136.1 SLC5A9 gene_id:200010|Hs108|chr1 ( 706) 1204 231.4 2.3e-60
CCDS58805.1 SLC5A1 gene_id:6523|Hs108|chr22 ( 537) 1163 223.8 3.4e-58
CCDS58438.1 SLC5A11 gene_id:115584|Hs108|chr16 ( 605) 885 172.8 8.8e-43
CCDS58437.1 SLC5A11 gene_id:115584|Hs108|chr16 ( 640) 877 171.3 2.6e-42
CCDS59278.1 SLC5A10 gene_id:125206|Hs108|chr17 ( 569) 785 154.4 2.8e-37
CCDS58440.1 SLC5A11 gene_id:115584|Hs108|chr16 ( 519) 714 141.3 2.2e-33
CCDS74008.1 SLC5A10 gene_id:125206|Hs108|chr17 ( 566) 615 123.2 7.1e-28
>>CCDS10714.1 SLC5A2 gene_id:6524|Hs108|chr16 (672 aa)
initn: 2550 init1: 2550 opt: 2550 Z-score: 2533.6 bits: 478.6 E(32554): 8.4e-135
Smith-Waterman score: 2550; 100.0% identity (100.0% similar) in 377 aa overlap (1-377:1-377)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MEEHTEAGSAPEMGAQKALIDNPADILVIAAYFLLVIGVGLWSMCRTNRGTVGGYFLAGR
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CCDS10 MEEHTEAGSAPEMGAQKALIDNPADILVIAAYFLLVIGVGLWSMCRTNRGTVGGYFLAGR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 SMVWWPVGASLFASNIGSGHFVGLAGTGAASGLAVAGFEWNALFVVLLLGWLFAPVYLTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SMVWWPVGASLFASNIGSGHFVGLAGTGAASGLAVAGFEWNALFVVLLLGWLFAPVYLTA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 GVITMPQYLRKRFGGRRIRLYLSVLSLFLYIFTKISVDMFSGAVFIQQALGWNIYASVIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GVITMPQYLRKRFGGRRIRLYLSVLSLFLYIFTKISVDMFSGAVFIQQALGWNIYASVIA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 LLGITMIYTVTGGLAALMYTDTVQTFVILGGACILMGYAFHEVGGYSGLFDKYLGAATSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LLGITMIYTVTGGLAALMYTDTVQTFVILGGACILMGYAFHEVGGYSGLFDKYLGAATSL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 TVSEDPAVGNISSFCYRPRPDSYHLLRHPVTGDLPWPALLLGLTIVSGWYWCSDQVIVQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 TVSEDPAVGNISSFCYRPRPDSYHLLRHPVTGDLPWPALLLGLTIVSGWYWCSDQVIVQR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 CLAGKSLTHIKAGCILCGYLKLTPMFLMVMPGMISRILYPDEVACVVPEVCRRVCGTEVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 CLAGKSLTHIKAGCILCGYLKLTPMFLMVMPGMISRILYPDEVACVVPEVCRRVCGTEVG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 CSNIAYPRLVVKLMPNGRLLGTHRGPADGPGTPDSRVLLRLGQLCAALGVPSFPLRRALP
:::::::::::::::::
CCDS10 CSNIAYPRLVVKLMPNGLRGLMLAVMLAALMSSLASIFNSSSTLFTMDIYTRLRPRAGDR
370 380 390 400 410 420
>>CCDS13902.1 SLC5A1 gene_id:6523|Hs108|chr22 (664 aa)
initn: 1741 init1: 1064 opt: 1736 Z-score: 1725.7 bits: 329.1 E(32554): 8.4e-90
Smith-Waterman score: 1736; 66.3% identity (89.2% similar) in 362 aa overlap (19-377:22-377)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MEEHTEAGSAPEMGAQKALIDNPADILVIAAYFLLVIGVGLWSMCRTNRGTVGGYFL
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CCDS13 MDSSTWSPKTTAVTRPVETHELIRNAADISIIVIYFVVVMAVGLWAMFSTNRGTVGGFFL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 AGRSMVWWPVGASLFASNIGSGHFVGLAGTGAASGLAVAGFEWNALFVVLLLGWLFAPVY
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CCDS13 AGRSMVWWPIGASLFASNIGSGHFVGLAGTGAASGIAIGGFEWNALVLVVVLGWLFVPIY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 LTAGVITMPQYLRKRFGGRRIRLYLSVLSLFLYIFTKISVDMFSGAVFIQQALGWNIYAS
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CCDS13 IKAGVVTMPEYLRKRFGGQRIQVYLSLLSLLLYIFTKISADIFSGAIFINLALGLNLYLA
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 VIALLGITMIYTVTGGLAALMYTDTVQTFVILGGACILMGYAFHEVGGYSGLFDKYLGAA
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CCDS13 IFLLLAITALYTITGGLAAVIYTDTLQTVIMLVGSLILTGFAFHEVGGYDAFMEKYMKAI
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 TSLTVSEDPAVGNISSF---CYRPRPDSYHLLRHPVTGDLPWPALLLGLTIVSGWYWCSD
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CCDS13 PTI-VSD----GN-TTFQEKCYTPRADSFHIFRDPLTGDLPWPGFIFGMSILTLWYWCTD
250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 QVIVQRCLAGKSLTHIKAGCILCGYLKLTPMFLMVMPGMISRILYPDEVACVVPEVCRRV
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CCDS13 QVIVQRCLSAKNMSHVKGGCILCGYLKLMPMFIMVMPGMISRILYTEKIACVVPSECEKY
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 CGTEVGCSNIAYPRLVVKLMPNGRLLGTHRGPADGPGTPDSRVLLRLGQLCAALGVPSFP
:::.:::.::::: :::.:::::
CCDS13 CGTKVGCTNIAYPTLVVELMPNGLRGLMLSVMLASLMSSLTSIFNSASTLFTMDIYAKVR
360 370 380 390 400 410
>>CCDS30709.2 SLC5A9 gene_id:200010|Hs108|chr1 (681 aa)
initn: 1599 init1: 983 opt: 1600 Z-score: 1590.5 bits: 304.1 E(32554): 2.9e-82
Smith-Waterman score: 1600; 59.9% identity (85.6% similar) in 369 aa overlap (9-377:21-381)
10 20 30 40
pF1KE5 MEEHTEAGSAPEMGAQKALIDNPADILVIAAYFLLVIGVGLWSMCRTN
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CCDS30 MSKELAAMGPGASGDGVRTETAPHIALDSRVGLHAYDISVVVIYFVFVIAVGIWSSIRAS
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE5 RGTVGGYFLAGRSMVWWPVGASLFASNIGSGHFVGLAGTGAASGLAVAGFEWNALFVVLL
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CCDS30 RGTIGGYFLAGRSMSWWPIGASLMSSNVGSGLFIGLAGTGAAGGLAVGGFEWNATWLLLA
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE5 LGWLFAPVYLTAGVITMPQYLRKRFGGRRIRLYLSVLSLFLYIFTKISVDMFSGAVFIQQ
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CCDS30 LGWVFVPVYIAAGVVTMPQYLKKRFGGQRIQVYMSVLSLILYIFTKISTDIFSGALFIQM
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE5 ALGWNIYASVIALLGITMIYTVTGGLAALMYTDTVQTFVILGGACILMGYAFHEVGGYSG
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CCDS30 ALGWNLYLSTGILLVVTAVYTIAGGLMAVIYTDALQTVIMVGGALVLMFLGFQDVGWYPG
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE5 LFDKYLGAATSLTVSEDPAVGNISSFCYRPRPDSYHLLRHPVTGDLPWPALLLGLTIVSG
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CCDS30 LEQRYRQAIPNVTV---P-----NTTCHLPRPDAFHILRDPVSGDIPWPGLIFGLTVLAT
250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE5 WYWCSDQVIVQRCLAGKSLTHIKAGCILCGYLKLTPMFLMVMPGMISRILYPDEVACVVP
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CCDS30 WCWCTDQVIVQRSLSAKSLSHAKGGSVLGGYLKILPMFFIVMPGMISRALFPDEVGCVDP
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE5 EVCRRVCGTEVGCSNIAYPRLVVKLMPNGRLLGTHRGPADGPGTPDSRVLLRLGQLCAAL
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CCDS30 DVCQRICGARVGCSNIAYPKLVMALMPVGLRGLMIAVIMAALMSSLTSIFNSSSTLFTID
360 370 380 390 400 410
>>CCDS13903.1 SLC5A4 gene_id:6527|Hs108|chr22 (659 aa)
initn: 1587 init1: 952 opt: 1581 Z-score: 1571.9 bits: 300.6 E(32554): 3.1e-81
Smith-Waterman score: 1581; 58.3% identity (86.1% similar) in 367 aa overlap (11-377:14-377)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MEEHTEAGSAPEMGAQKALIDNPADILVIAAYFLLVIGVGLWSMCRTNRGTVGGYFL
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CCDS13 MASTVSPSTIAETPEPPPLSDHIRNAADISVIVIYFLVVMAVGLWAMLKTNRGTIGGFFL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 AGRSMVWWPVGASLFASNIGSGHFVGLAGTGAASGLAVAGFEWNALFVVLLLGWLFAPVY
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CCDS13 AGRDMAWWPMGASLFASNIGSNHYVGLAGTGAASGVATVTFEWTSSVMLLILGWIFVPIY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 LTAGVITMPQYLRKRFGGRRIRLYLSVLSLFLYIFTKISVDMFSGAVFIQQALGWNIYAS
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CCDS13 IKSGVMTMPEYLKKRFGGERLQVYLSILSLFICVVLLISADIFAGAIFIKLALGLDLYLA
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 VIALLGITMIYTVTGGLAALMYTDTVQTFVILGGACILMGYAFHEVGGYSGLFDKYLGAA
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CCDS13 IFILLAMTAVYTTTGGLASVIYTDTLQTIIMLIGSFILMGFAFNEVGGYESFTEKYVNAT
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 TSLTVSEDPAVGNISSFCYRPRPDSYHLLRHPVTGDLPWPALLLGLTIVSGWYWCSDQVI
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CCDS13 PSVVEGDNLT---ISASCYTPRADSFHIFRDAVTGDIPWPGIIFGMPITALWYWCTNQVI
250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 VQRCLAGKSLTHIKAGCILCGYLKLTPMFLMVMPGMISRILYPDEVACVVPEVCRRVCGT
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CCDS13 VQRCLCGKDMSHVKAACIMCAYLKLLPMFLMVMPGMISRILYTDMVACVVPSECVKHCGV
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 EVGCSNIAYPRLVVKLMPNGRLLGTHRGPADGPGTPDSRVLLRLGQLCAALGVPSFPLRR
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CCDS13 DVGCTNYAYPTMVLELMPQGLRGLMLSVMLASLMSSLTSIFNSASTLFTIDLYTKMRKQA
360 370 380 390 400 410
>>CCDS10625.1 SLC5A11 gene_id:115584|Hs108|chr16 (675 aa)
initn: 1494 init1: 921 opt: 1490 Z-score: 1481.4 bits: 283.9 E(32554): 3.4e-76
Smith-Waterman score: 1490; 55.5% identity (82.6% similar) in 380 aa overlap (1-377:1-372)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MEEHTEAGSAPEMGAQKALIDN---PADILVIAAYFLLVIGVGLWSMCRTNRGTVGGYFL
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CCDS10 MESGTSSPQPPQLDPLDAFPQKGLEPGDIAVLVLYFLFVLAVGLWSTVKTKRDTVKGYFL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 AGRSMVWWPVGASLFASNIGSGHFVGLAGTGAASGLAVAGFEWNALFVVLLLGWLFAPVY
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CCDS10 AGGDMVWWPVGASLFASNVGSGHFIGLAGSGAATGISVSAYELNGLFSVLMLAWIFLPIY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 LTAGVITMPQYLRKRFGGRRIRLYLSVLSLFLYIFTKISVDMFSGAVFIQQALGWNIYAS
... : :::.:::::::: :: . :.:: ::.::::::::::..::.::::.: ..: .
CCDS10 IAGQVTTMPEYLRKRFGGIRIPIILAVLYLFIYIFTKISVDMYAGAIFIQQSLHLDLYLA
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 VIALLGITMIYTVTGGLAALMYTDTVQTFVILGGACILMGYAFHEVGGYSGLFDKYLGAA
...::.:: .:::.:::::..:::..::...: :: ::::.: :::. :: .::. :
CCDS10 IVGLLAITAVYTVAGGLAAVIYTDALQTLIMLIGALTLMGYSFAAVGGMEGLKEKYFLAL
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 TSLTVSEDPAVGNISSFCYRPRPDSYHLLRHPVTGDLPWPALLLGLTIVSGWYWCSDQVI
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CCDS10 AS-NRSEN-------SSCGLPREDAFHIFRDPLTSDLPWPGVLFGMSIPSLWYWCTDQVI
250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 VQRCLAGKSLTHIKAGCILCGYLKLTPMFLMVMPGMISRILYPDEVACVVPEVCRRVCGT
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CCDS10 VQRTLAAKNLSHAKGGALMAAYLKVLPLFIMVFPGMVSRILFPDQVACADPEICQKICSN
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 EVGCSNIAYPRLVVKLMPNGRLLGTHRGPADGPGTPDSRVLLRLGQLCAALGVPSFPLRR
:::.::::.::..:.:.:
CCDS10 PSGCSDIAYPKLVLELLPTGLRGLMMAVMVAALMSSLTSIFNSASTIFTMDLWNHLRPRA
360 370 380 390 400 410
>>CCDS42275.1 SLC5A10 gene_id:125206|Hs108|chr17 (596 aa)
initn: 1520 init1: 921 opt: 1489 Z-score: 1481.2 bits: 283.7 E(32554): 3.5e-76
Smith-Waterman score: 1489; 57.9% identity (83.9% similar) in 354 aa overlap (24-377:19-364)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MEEHTEAGSAPEMGAQKALIDNPADILVIAAYFLLVIGVGLWSMCRTNRGTVGGYFLAGR
:::.::..:: : ..::.:: ::..:.::.:::::::
CCDS42 MAANSTSDLHTPGTQLSVADIIVITVYFALNVAVGIWSSCRASRNTVNGYFLAGR
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 SMVWWPVGASLFASNIGSGHFVGLAGTGAASGLAVAGFEWNALFVVLLLGWLFAPVYLTA
.:.:::.:::::::. ::: :.::::.:::.::::::::::: .:.: :.:.:.:.:...
CCDS42 DMTWWPIGASLFASSEGSGLFIGLAGSGAAGGLAVAGFEWNATYVLLALAWVFVPIYISS
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 GVITMPQYLRKRFGGRRIRLYLSVLSLFLYIFTKISVDMFSGAVFIQQALGWNIYASVIA
..:.:.:..::.::.:::.:::::::.: .:::::.:...::.:.. ::::.: :.:
CCDS42 EIVTLPEYIQKRYGGQRIRMYLSVLSLLLSVFTKISLDLYAGALFVHICLGWNFYLSTIL
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 LLGITMIYTVTGGLAALMYTDTVQTFVILGGACILMGYAFHEVGGYSGLFDKYLGAATSL
:::: .::..:::::..:::..::.... :: :: :: ..:::. : : : :
CCDS42 TLGITALYTIAGGLAAVIYTDALQTLIMVVGAVILTIKAFDQIGGYGQLEAAYAQAIPSR
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 TVSEDPAVGNISSFCYRPRPDSYHLLRHPVTGDLPWPALLLGLTIVSGWYWCSDQVIVQR
:.. .. :. :: :..:..: : :::::: .. .::::.. ::::.:::::::
CCDS42 TIA--------NTTCHLPRTDAMHMFRDPHTGDLPWTGMTFGLTIMATWYWCTDQVIVQR
240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 CLAGKSLTHIKAGCILCGYLKLTPMFLMVMPGMISRILYPDEVACVVPEVCRRVCGTEVG
:....:.: ::: :: .:::. :: :..::::::: :.::.:.:::: : :.::.:::
CCDS42 SLSARDLNHAKAGSILASYLKMLPMGLIIMPGMISRALFPDDVGCVVPSECLRACGAEVG
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 CSNIAYPRLVVKLMPNGRLLGTHRGPADGPGTPDSRVLLRLGQLCAALGVPSFPLRRALP
:::::::.::..::: :
CCDS42 CSNIAYPKLVMELMPIGLRGLMIAVMLAALMSSLTSIFNSSSTLFTMDIWRRLRPRSGER
350 360 370 380 390 400
>>CCDS11201.2 SLC5A10 gene_id:125206|Hs108|chr17 (612 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MEEHTEAGSAPEMGAQKALIDNPADILVIAAYFLLVIGVGLWSMCRTNRGTVGGYFLAGR
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CCDS11 MAANSTSDLHTPGTQLSVADIIVITVYFALNVAVGIWSSCRASRNTVNGYFLAGR
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 SMVWWPVGASLFASNIGSGHFVGLAGTGAASGLAVAGFEWNALFVVLLLGWLFAPVYLTA
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CCDS11 DMTWWPIGASLFASSEGSGLFIGLAGSGAAGGLAVAGFEWNATYVLLALAWVFVPIYISS
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 GVITMPQYLRKRFGGRRIRLYLSVLSLFLYIFTKISVDMFSGAVFIQQALGWNIYASVIA
..:.:.:..::.::.:::.:::::::.: .:::::.:...::.:.. ::::.: :.:
CCDS11 EIVTLPEYIQKRYGGQRIRMYLSVLSLLLSVFTKISLDLYAGALFVHICLGWNFYLSTIL
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 LLGITMIYTVTGGLAALMYTDTVQTFVILGGACILMGYAFHEVGGYSGLFDKYLGAATSL
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CCDS11 TLGITALYTIAGGLAAVIYTDALQTLIMVVGAVILTIKAFDQIGGYGQLEAAYAQAIPSR
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
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CCDS11 TIA--------NTTCHLPRTDAMHMFRDPHTGDLPWTGMTFGLTIMATWYWCTDQVIVQR
240 250 260 270 280
310 320 330 340
pF1KE5 CLAGKSLTHIKAGCILCGYLKLTPMFLMVMPGMISRILYP----------------DEVA
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CCDS11 SLSARDLNHAKAGSILASYLKMLPMGLIIMPGMISRALFPGAHVYEERHQVSVSRTDDVG
290 300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KE5 CVVPEVCRRVCGTEVGCSNIAYPRLVVKLMPNGRLLGTHRGPADGPGTPDSRVLLRLGQL
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CCDS11 CVVPSECLRACGAEVGCSNIAYPKLVMELMPIGLRGLMIAVMLAALMSSLTSIFNSSSTL
350 360 370 380 390 400
410 420 430 440 450
pF1KE5 CAALGVPSFPLRRALPLLRHCAVLLLWPPHPHGLPVHRAHPQKAPPPPGLQSPA
CCDS11 FTMDIWRRLRPRSGERELLLVGRLVIVALIGVSVAWIPVLQDSNSGQLFIYMQSVTSSLA
410 420 430 440 450 460
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10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MEEHTEAGSAPEMGAQKALIDNPADILVIAAYFLLVIGVGLWSMCRTNRGTVGGYFLAGR
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CCDS33 MRAVLDT-ADIAIVALYFILVMCIGFFAMWKSNRSTVSGYFLAGR
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 SMVWWPVGASLFASNIGSGHFVGLAGTGAASGLAVAGFEWNALFVVLLLGWLFAPVYLTA
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CCDS33 SMTWVAIGASLFVSNIGSEHFIGLAGSGAASGFAVGAWEFNALLLLQLLGWVFIPIYIRS
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 GVITMPQYLRKRFGGRRIRLYLSVLSLFLYIFTKISVDMFSGAVFIQQALGWNIYASVIA
:: :::.:: :::::.::..:...:::.::::::.:::..:::.:::..::::.:.:::
CCDS33 GVYTMPEYLSKRFGGHRIQVYFAALSLILYIFTKLSVDLYSGALFIQESLGWNLYVSVIL
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 LLGITMIYTVTGGLAALMYTDTVQTFVILGGACILMGYAFHEVGGYSGLFDKYLGAATSL
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CCDS33 LIGMTALLTVTGGLVAVIYTDTLQALLMIIGALTLMIISIMEIGGFEEVKRRYMLASPDV
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290
pF1KE5 T-VSEDPAVGNISSFCYRPRPDSYHLLRHPVTGDLPWPALLLGLTIVSGWYWCSDQVIVQ
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CCDS33 TSILLTYNLSNTNSCNVSPKKEALKMLRNPTDEDVPWPGFILGQTPASVWYWCADQVIVQ
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 RCLAGKSLTHIKAGCILCGYLKLTPMFLMVMPGMISRILYPDEVACVVPEVCRRVCGTEV
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CCDS33 RVLAAKNIAHAKGSTLMAGFLKLLPMFIIVVPGMISRILFTDDIACINPEHCMLVCGSRA
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 GCSNIAYPRLVVKLMPNGRLLGTHRGPADGPGTPDSRVLLRLGQLCAALGVPSFPLRRAL
:::::::::::.::.: :
CCDS33 GCSNIAYPRLVMKLVPVGLRGLMMAVMIAALMSDLDSIFNSASTIFTLDVYKLIRKSASS
350 360 370 380 390 400
>>CCDS58439.1 SLC5A11 gene_id:115584|Hs108|chr16 (611 aa)
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40 50 60 70 80 90
pF1KE5 YFLLVIGVGLWSMCRTNRGTVGGYFLAGRSMVWWPVGASLFASNIGSGHFVGLAGTGAAS
::::::::::::::.:::::.::::.:::.
CCDS58 MVWWPVGASLFASNVGSGHFIGLAGSGAAT
10 20 30
100 110 120 130 140 150
pF1KE5 GLAVAGFEWNALFVVLLLGWLFAPVYLTAGVITMPQYLRKRFGGRRIRLYLSVLSLFLYI
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CCDS58 GISVSAYELNGLFSVLMLAWIFLPIYIAGQVTTMPEYLRKRFGGIRIPIILAVLYLFIYI
40 50 60 70 80 90
160 170 180 190 200 210
pF1KE5 FTKISVDMFSGAVFIQQALGWNIYASVIALLGITMIYTVTGGLAALMYTDTVQTFVILGG
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CCDS58 FTKISVDMYAGAIFIQQSLHLDLYLAIVGLLAITAVYTVAGGLAAVIYTDALQTLIMLIG
100 110 120 130 140 150
220 230 240 250 260 270
pF1KE5 ACILMGYAFHEVGGYSGLFDKYLGAATSLTVSEDPAVGNISSFCYRPRPDSYHLLRHPVT
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CCDS58 ALTLMGYSFAAVGGMEGLKEKYFLALAS-NRSEN-------SSCGLPREDAFHIFRDPLT
160 170 180 190 200
280 290 300 310 320 330
pF1KE5 GDLPWPALLLGLTIVSGWYWCSDQVIVQRCLAGKSLTHIKAGCILCGYLKLTPMFLMVMP
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CCDS58 SDLPWPGVLFGMSIPSLWYWCTDQVIVQRTLAAKNLSHAKGGALMAAYLKVLPLFIMVFP
210 220 230 240 250 260
340 350 360 370 380 390
pF1KE5 GMISRILYPDEVACVVPEVCRRVCGTEVGCSNIAYPRLVVKLMPNGRLLGTHRGPADGPG
::.::::.::.:::. ::.:...:.. :::.::::.::..:.:.:
CCDS58 GMVSRILFPDQVACADPEICQKICSNPSGCSDIAYPKLVLELLPTGLRGLMMAVMVAALM
270 280 290 300 310 320
400 410 420 430 440 450
pF1KE5 TPDSRVLLRLGQLCAALGVPSFPLRRALPLLRHCAVLLLWPPHPHGLPVHRAHPQKAPPP
CCDS58 SSLTSIFNSASTIFTMDLWNHLRPRASEKELMIVGRVFVLLLVLVSILWIPVVQASQGGQ
330 340 350 360 370 380
>>CCDS59277.1 SLC5A10 gene_id:125206|Hs108|chr17 (560 aa)
initn: 1324 init1: 921 opt: 1293 Z-score: 1287.0 bits: 247.7 E(32554): 2.3e-65
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10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MEEHTEAGSAPEMGAQKALIDNPADILVIAAYFLLVIGVGLWSMCRTNRGTVGGYFLAGR
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CCDS59 MAANSTSDLHTPGTQLSVADIIVITVYFALNVAVGIWSSCRASRNTVNGYFLAGR
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 SMVWWPVGASLFASNIGSGHFVGLAGTGAASGLAVAGFEWNALFVVLLLGWLFAPVYLTA
.:.:::.:::::::. ::: :.::::.:::.::::::::::: .:.: :.:.:.:.:...
CCDS59 DMTWWPIGASLFASSEGSGLFIGLAGSGAAGGLAVAGFEWNATYVLLALAWVFVPIYISS
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 GVITMPQYLRKRFGGRRIRLYLSVLSLFLYIFTKISVDMFSGAVFIQQALGWNIYASVIA
..:.:.:..::.::.:::.:::::::.: .:::::.:...::.:.. ::::.: :.:
CCDS59 EIVTLPEYIQKRYGGQRIRMYLSVLSLLLSVFTKISLDLYAGALFVHICLGWNFYLSTIL
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 LLGITMIYTVTGGLAALMYTDTVQTFVILGGACILMGYAFHEVGGYSGLFDKYLGAATSL
:::: .::..:::::..:::..::.... :: :: :: ..:::. : : : :
CCDS59 TLGITALYTIAGGLAAVIYTDALQTLIMVVGAVILTIKAFDQIGGYGQLEAAYAQAIPSR
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 TVSEDPAVGNISSFCYRPRPDSYHLLRHPVTGDLPWPALLLGLTIVSGWYWCSDQVIVQR
:.. .. :. :: :..:..: : :::::: .. .::::.. ::::.:::::::
CCDS59 TIA--------NTTCHLPRTDAMHMFRDPHTGDLPWTGMTFGLTIMATWYWCTDQVIVQR
240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 CLAGKSLTHIKAGCILCGYLKLTPMFLMVMPGMISRILYPDEVACVVPEVCRRVCGTEVG
:....:.: ::: :: .:::. :: :..::::::: :.:
CCDS59 SLSARDLNHAKAGSILASYLKMLPMGLIIMPGMISRALFPGLRGLMIAVMLAALMSSLTS
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 CSNIAYPRLVVKLMPNGRLLGTHRGPADGPGTPDSRVLLRLGQLCAALGVPSFPLRRALP
CCDS59 IFNSSSTLFTMDIWRRLRPRSGERELLLVGRLVIVALIGVSVAWIPVLQDSNSGQLFIYM
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]