Result of FASTA (omim) for
pFN21AE5577
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5577, 447 aa
1>>>pF1KE5577 447 - 447 aa - 447 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4294+/-0.000364; mu= 17.8152+/- 0.023
mean_var=84.5236+/-17.491, 0's: 0 Z-trim(115.1): 161 B-trim: 1232 in 1/52
Lambda= 0.139504
statistics sampled from 25112 (25273) to 25112 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.665), E-opt: 0.2 (0.296), width: 16
Scan time: 9.030
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_570126 (OMIM: 610121) 5-hydroxytryptamine recep ( 447) 3020 617.8 1.9e-176
NP_001243542 (OMIM: 610123) 5-hydroxytryptamine re ( 456) 2147 442.1 1.5e-123
NP_872395 (OMIM: 610123) 5-hydroxytryptamine recep ( 471) 2115 435.6 1.3e-121
NP_938055 (OMIM: 610123) 5-hydroxytryptamine recep ( 441) 1782 368.6 1.9e-101
NP_938056 (OMIM: 610123) 5-hydroxytryptamine recep ( 456) 1782 368.6 1.9e-101
NP_001243543 (OMIM: 610123) 5-hydroxytryptamine re ( 482) 1549 321.7 2.6e-87
NP_001155244 (OMIM: 182139) 5-hydroxytryptamine re ( 463) 929 196.9 9.3e-50
NP_000860 (OMIM: 182139) 5-hydroxytryptamine recep ( 484) 929 196.9 9.6e-50
NP_001157118 (OMIM: 610122) 5-hydroxytryptamine re ( 454) 912 193.5 9.8e-49
NP_998786 (OMIM: 182139) 5-hydroxytryptamine recep ( 516) 785 168.0 5.3e-41
XP_011541365 (OMIM: 604654) PREDICTED: 5-hydroxytr ( 430) 708 152.4 2.1e-36
NP_006019 (OMIM: 604654) 5-hydroxytryptamine recep ( 441) 708 152.4 2.2e-36
XP_016874041 (OMIM: 604654) PREDICTED: 5-hydroxytr ( 372) 657 142.1 2.4e-33
NP_060051 (OMIM: 605116) neuronal acetylcholine re ( 479) 570 124.7 5.3e-28
NP_004189 (OMIM: 606888) neuronal acetylcholine re ( 494) 553 121.3 5.9e-27
NP_065135 (OMIM: 606372) neuronal acetylcholine re ( 450) 545 119.6 1.7e-26
NP_000740 (OMIM: 118508) neuronal acetylcholine re ( 458) 543 119.2 2.2e-26
NP_000733 (OMIM: 118502,610353) neuronal acetylcho ( 529) 539 118.5 4.3e-26
XP_006716345 (OMIM: 118502,610353) PREDICTED: neur ( 529) 539 118.5 4.3e-26
XP_011542690 (OMIM: 118502,610353) PREDICTED: neur ( 529) 539 118.5 4.3e-26
NP_001160166 (OMIM: 118503,612052) neuronal acetyl ( 489) 537 118.1 5.4e-26
NP_000734 (OMIM: 118503,612052) neuronal acetylcho ( 505) 537 118.1 5.6e-26
XP_016861343 (OMIM: 610122) PREDICTED: 5-hydroxytr ( 233) 530 116.4 8.2e-26
NP_872343 (OMIM: 610122) 5-hydroxytryptamine recep ( 279) 530 116.4 9.4e-26
NP_000737 (OMIM: 118511,612001) neuronal acetylcho ( 502) 533 117.3 9.7e-26
NP_001177384 (OMIM: 118511,612001) neuronal acetyl ( 531) 533 117.3 1e-25
NP_001138615 (OMIM: 610122) 5-hydroxytryptamine re ( 404) 530 116.6 1.2e-25
NP_000735 (OMIM: 118504,188890,600513) neuronal ac ( 627) 530 116.7 1.7e-25
NP_000739 (OMIM: 118507,605375) neuronal acetylcho ( 502) 519 114.4 6.8e-25
NP_001269384 (OMIM: 118502,610353) neuronal acetyl ( 514) 510 112.6 2.4e-24
XP_016877378 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 449) 496 109.8 1.5e-23
XP_016877377 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 462) 496 109.8 1.6e-23
XP_016877376 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 463) 496 109.8 1.6e-23
NP_000741 (OMIM: 118509) neuronal acetylcholine re ( 498) 496 109.8 1.7e-23
XP_006720445 (OMIM: 118503,612052) PREDICTED: neur ( 438) 491 108.8 3.1e-23
NP_000736 (OMIM: 118505,612052) neuronal acetylcho ( 468) 484 107.4 8.5e-23
XP_016877374 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 468) 483 107.2 9.8e-23
XP_016877375 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 468) 483 107.2 9.8e-23
XP_011519488 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 495) 483 107.2 1e-22
XP_011519489 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 495) 483 107.2 1e-22
XP_016883113 (OMIM: 118504,188890,600513) PREDICTE ( 546) 482 107.0 1.3e-22
NP_001186208 (OMIM: 606888) neuronal acetylcholine ( 479) 480 106.6 1.5e-22
XP_011519478 (OMIM: 118511,612001) PREDICTED: neur ( 486) 479 106.4 1.8e-22
XP_011519480 (OMIM: 118511,612001) PREDICTED: neur ( 380) 471 104.7 4.5e-22
NP_000070 (OMIM: 100690,253290,601462,608930) acet ( 457) 441 98.7 3.4e-20
XP_016858746 (OMIM: 100690,253290,601462,608930) P ( 464) 441 98.7 3.4e-20
XP_011519493 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 424) 438 98.1 4.8e-20
XP_011519492 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 424) 438 98.1 4.8e-20
NP_005190 (OMIM: 100730,253290,265000) acetylcholi ( 517) 409 92.3 3.2e-18
NP_001034612 (OMIM: 100690,253290,601462,608930) a ( 482) 402 90.9 8.1e-18
>>NP_570126 (OMIM: 610121) 5-hydroxytryptamine receptor (447 aa)
initn: 3020 init1: 3020 opt: 3020 Z-score: 3288.9 bits: 617.8 E(85289): 1.9e-176
Smith-Waterman score: 3020; 100.0% identity (100.0% similar) in 447 aa overlap (1-447:1-447)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MEGGWPARQSALLCLTVSLLLQGRGDAFTINCSGFDQHGVDPAVFQAVFDRKAFRPFTNY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_570 MEGGWPARQSALLCLTVSLLLQGRGDAFTINCSGFDQHGVDPAVFQAVFDRKAFRPFTNY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 SIPTRVNISFTLSAILGVDAQLQLLTSFLWMDLVWDNPFINWNPKECVGINKLTVLAENL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_570 SIPTRVNISFTLSAILGVDAQLQLLTSFLWMDLVWDNPFINWNPKECVGINKLTVLAENL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 WLPDIFIVESMDVDQTPSGLTAYISSEGRIKYDKPMRVTSICNLDIFYFPFDQQNCTFTF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_570 WLPDIFIVESMDVDQTPSGLTAYISSEGRIKYDKPMRVTSICNLDIFYFPFDQQNCTFTF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 SSFLYTVDSMLLGMDKEVWEITDTSRKVIQTQGEWELLGINKATPKMSMGNNLYDQIMFY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_570 SSFLYTVDSMLLGMDKEVWEITDTSRKVIQTQGEWELLGINKATPKMSMGNNLYDQIMFY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 VAIRRRPSLYIINLLVPSSFLVAIDALSFYLPAESENRAPFKITLLLGYNVFLLMMNDLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_570 VAIRRRPSLYIINLLVPSSFLVAIDALSFYLPAESENRAPFKITLLLGYNVFLLMMNDLL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 PASGTPLISVYFALCLSLMVVSLLETVFITYLLHVATTQPPPMPRWLHSLLLHCTSPGRC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_570 PASGTPLISVYFALCLSLMVVSLLETVFITYLLHVATTQPPPMPRWLHSLLLHCTSPGRC
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 CPTAPQKGNKGLGLTLTHLPGPKEPGELAGKKLGPRETEPDGGSGWTKTQLMELWVQFSH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_570 CPTAPQKGNKGLGLTLTHLPGPKEPGELAGKKLGPRETEPDGGSGWTKTQLMELWVQFSH
370 380 390 400 410 420
430 440
pF1KE5 AMDTLLFRLYLLFMASSILTVIVLWNT
:::::::::::::::::::::::::::
NP_570 AMDTLLFRLYLLFMASSILTVIVLWNT
430 440
>>NP_001243542 (OMIM: 610123) 5-hydroxytryptamine recept (456 aa)
initn: 2361 init1: 2142 opt: 2147 Z-score: 2339.3 bits: 442.1 E(85289): 1.5e-123
Smith-Waterman score: 2318; 73.9% identity (89.5% similar) in 456 aa overlap (1-447:1-456)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MEGGWPARQSALLCLTVSLLLQGRGDAFTINCSGFDQHGVDPAVFQAVFDRKAFRPFTNY
:::.: :. . : ...:::::: .:::::::: :::.::.....::.:: ::: ::
NP_001 MEGSWFHRKRFSFYLLLGFLLQGRGVTFTINCSGFGQHGADPTALNSVFNRKPFRPVTNI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 SIPTRVNISFTLSAILGVDAQLQLLTSFLWMDLVWDNPFINWNPKECVGINKLTVLAENL
:.::.:::::..:::: :. ::.::.::::...:::::::.:::.:: ::.:... :.::
NP_001 SVPTQVNISFAMSAILDVNEQLHLLSSFLWLEMVWDNPFISWNPEECEGITKMSMAAKNL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 WLPDIFIVESMDVDQTPSGLTAYISSEGRIKYDKPMRVTSICNLDIFYFPFDQQNCTFTF
:::::::.: ::::.::.:::::.:.::::.: :::.: ::::::::::::::::::.::
NP_001 WLPDIFIIELMDVDKTPKGLTAYVSNEGRIRYKKPMKVDSICNLDIFYFPFDQQNCTLTF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 SSFLYTVDSMLLGMDKEVWEITDTSRKVIQTQGEWELLGINKATPKMSMGNNLYDQIMFY
:::::::::::: :.::::::::.::...::.:::::::..::: :.: :.::::::.::
NP_001 SSFLYTVDSMLLDMEKEVWEITDASRNILQTHGEWELLGLSKATAKLSRGGNLYDQIVFY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 VAIRRRPSLYIINLLVPSSFLVAIDALSFYLPAESENRAPFKITLLLGYNVFLLMMNDLL
::::::::::.:::::::.:::::::::::::..: ::.:::::::::::::::::.:::
NP_001 VAIRRRPSLYVINLLVPSGFLVAIDALSFYLPVKSGNRVPFKITLLLGYNVFLLMMSDLL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 PASGTPLISVYFALCLSLMVVSLLETVFITYLLHVATTQPPPMPRWLHSLLLHCTSPGRC
:.::::::.::::::::::: :::::.:::.:::::::::::.:::::::::::.:::::
NP_001 PTSGTPLIGVYFALCLSLMVGSLLETIFITHLLHVATTQPPPLPRWLHSLLLHCNSPGRC
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410
pF1KE5 CPTAPQKGNKGLGLTLTHLPGPKEPGELAGKKLGPRETEPDGGSGWTKTQL---------
::::::: ::: ::: ::::: ::: ::. :: :.: ::: ::..:
NP_001 CPTAPQKENKGPGLTPTHLPGVKEPEVSAGQMPGPAEAELTGGSEWTRAQREHEAQKQHS
370 380 390 400 410 420
420 430 440
pF1KE5 MELWVQFSHAMDTLLFRLYLLFMASSILTVIVLWNT
.:::.:::::::..:::::::::::::.::: ::::
NP_001 VELWLQFSHAMDAMLFRLYLLFMASSIITVICLWNT
430 440 450
>>NP_872395 (OMIM: 610123) 5-hydroxytryptamine receptor (471 aa)
initn: 2306 init1: 2110 opt: 2115 Z-score: 2304.3 bits: 435.6 E(85289): 1.3e-121
Smith-Waterman score: 2286; 74.9% identity (89.7% similar) in 446 aa overlap (11-447:26-471)
10 20 30 40
pF1KE5 MEGGWPARQSALLCLTVSLLLQGRGDAFTINCSGFDQHGVDPAVF
::: :: :. ::: .:::::::: :::.::...
NP_872 MLAFILSRATPRPALGPLSYREHRVALLHLTHSMSTTGRGVTFTINCSGFGQHGADPTAL
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE5 QAVFDRKAFRPFTNYSIPTRVNISFTLSAILGVDAQLQLLTSFLWMDLVWDNPFINWNPK
..::.:: ::: :: :.::.:::::..:::: :. ::.::.::::...:::::::.:::.
NP_872 NSVFNRKPFRPVTNISVPTQVNISFAMSAILDVNEQLHLLSSFLWLEMVWDNPFISWNPE
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE5 ECVGINKLTVLAENLWLPDIFIVESMDVDQTPSGLTAYISSEGRIKYDKPMRVTSICNLD
:: ::.:... :.:::::::::.: ::::.::.:::::.:.::::.: :::.: ::::::
NP_872 ECEGITKMSMAAKNLWLPDIFIIELMDVDKTPKGLTAYVSNEGRIRYKKPMKVDSICNLD
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE5 IFYFPFDQQNCTFTFSSFLYTVDSMLLGMDKEVWEITDTSRKVIQTQGEWELLGINKATP
::::::::::::.:::::::::::::: :.::::::::.::...::.:::::::..:::
NP_872 IFYFPFDQQNCTLTFSSFLYTVDSMLLDMEKEVWEITDASRNILQTHGEWELLGLSKATA
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE5 KMSMGNNLYDQIMFYVAIRRRPSLYIINLLVPSSFLVAIDALSFYLPAESENRAPFKITL
:.: :.::::::.::::::::::::.:::::::.:::::::::::::..: ::.::::::
NP_872 KLSRGGNLYDQIVFYVAIRRRPSLYVINLLVPSGFLVAIDALSFYLPVKSGNRVPFKITL
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KE5 LLGYNVFLLMMNDLLPASGTPLISVYFALCLSLMVVSLLETVFITYLLHVATTQPPPMPR
:::::::::::.::::.::::::.::::::::::: :::::.:::.:::::::::::.::
NP_872 LLGYNVFLLMMSDLLPTSGTPLIGVYFALCLSLMVGSLLETIFITHLLHVATTQPPPLPR
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KE5 WLHSLLLHCTSPGRCCPTAPQKGNKGLGLTLTHLPGPKEPGELAGKKLGPRETEPDGGSG
:::::::::.:::::::::::: ::: ::: ::::: ::: ::. :: :.: :::
NP_872 WLHSLLLHCNSPGRCCPTAPQKENKGPGLTPTHLPGVKEPEVSAGQMPGPAEAELTGGSE
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440
pF1KE5 WTKTQL---------MELWVQFSHAMDTLLFRLYLLFMASSILTVIVLWNT
::..: .:::.:::::::..:::::::::::::.::: ::::
NP_872 WTRAQREHEAQKQHSVELWLQFSHAMDAMLFRLYLLFMASSIITVICLWNT
430 440 450 460 470
>>NP_938055 (OMIM: 610123) 5-hydroxytryptamine receptor (441 aa)
initn: 2257 init1: 1756 opt: 1782 Z-score: 1942.4 bits: 368.6 E(85289): 1.9e-101
Smith-Waterman score: 2216; 72.1% identity (86.6% similar) in 456 aa overlap (1-447:1-441)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MEGGWPARQSALLCLTVSLLLQGRGDAFTINCSGFDQHGVDPAVFQAVFDRKAFRPFTNY
:::.: :. . : ...:::::: .:::::::: :::.::.....::.:: ::: ::
NP_938 MEGSWFHRKRFSFYLLLGFLLQGRGVTFTINCSGFGQHGADPTALNSVFNRKPFRPVTNI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 SIPTRVNISFTLSAILGVDAQLQLLTSFLWMDLVWDNPFINWNPKECVGINKLTVLAENL
:.::.:::::..:::: :.:::::::.:::.:: ::.:... :.::
NP_938 SVPTQVNISFAMSAIL---------------DVVWDNPFISWNPEECEGITKMSMAAKNL
70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 WLPDIFIVESMDVDQTPSGLTAYISSEGRIKYDKPMRVTSICNLDIFYFPFDQQNCTFTF
:::::::.: ::::.::.:::::.:.::::.: :::.: ::::::::::::::::::.::
NP_938 WLPDIFIIELMDVDKTPKGLTAYVSNEGRIRYKKPMKVDSICNLDIFYFPFDQQNCTLTF
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 SSFLYTVDSMLLGMDKEVWEITDTSRKVIQTQGEWELLGINKATPKMSMGNNLYDQIMFY
:::::::::::: :.::::::::.::...::.:::::::..::: :.: :.::::::.::
NP_938 SSFLYTVDSMLLDMEKEVWEITDASRNILQTHGEWELLGLSKATAKLSRGGNLYDQIVFY
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 VAIRRRPSLYIINLLVPSSFLVAIDALSFYLPAESENRAPFKITLLLGYNVFLLMMNDLL
::::::::::.:::::::.:::::::::::::..: ::.:::::::::::::::::.:::
NP_938 VAIRRRPSLYVINLLVPSGFLVAIDALSFYLPVKSGNRVPFKITLLLGYNVFLLMMSDLL
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 PASGTPLISVYFALCLSLMVVSLLETVFITYLLHVATTQPPPMPRWLHSLLLHCTSPGRC
:.::::::.::::::::::: :::::.:::.:::::::::::.:::::::::::.:::::
NP_938 PTSGTPLIGVYFALCLSLMVGSLLETIFITHLLHVATTQPPPLPRWLHSLLLHCNSPGRC
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410
pF1KE5 CPTAPQKGNKGLGLTLTHLPGPKEPGELAGKKLGPRETEPDGGSGWTKTQL---------
::::::: ::: ::: ::::: ::: ::. :: :.: ::: ::..:
NP_938 CPTAPQKENKGPGLTPTHLPGVKEPEVSAGQMPGPAEAELTGGSEWTRAQREHEAQKQHS
350 360 370 380 390 400
420 430 440
pF1KE5 MELWVQFSHAMDTLLFRLYLLFMASSILTVIVLWNT
.:::.:::::::..:::::::::::::.::: ::::
NP_938 VELWLQFSHAMDAMLFRLYLLFMASSIITVICLWNT
410 420 430 440
>>NP_938056 (OMIM: 610123) 5-hydroxytryptamine receptor (456 aa)
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Smith-Waterman score: 2184; 73.1% identity (86.8% similar) in 446 aa overlap (11-447:26-456)
10 20 30 40
pF1KE5 MEGGWPARQSALLCLTVSLLLQGRGDAFTINCSGFDQHGVDPAVF
::: :: :. ::: .:::::::: :::.::...
NP_938 MLAFILSRATPRPALGPLSYREHRVALLHLTHSMSTTGRGVTFTINCSGFGQHGADPTAL
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE5 QAVFDRKAFRPFTNYSIPTRVNISFTLSAILGVDAQLQLLTSFLWMDLVWDNPFINWNPK
..::.:: ::: :: :.::.:::::..:::: :.:::::::.:::.
NP_938 NSVFNRKPFRPVTNISVPTQVNISFAMSAIL---------------DVVWDNPFISWNPE
70 80 90 100
110 120 130 140 150 160
pF1KE5 ECVGINKLTVLAENLWLPDIFIVESMDVDQTPSGLTAYISSEGRIKYDKPMRVTSICNLD
:: ::.:... :.:::::::::.: ::::.::.:::::.:.::::.: :::.: ::::::
NP_938 ECEGITKMSMAAKNLWLPDIFIIELMDVDKTPKGLTAYVSNEGRIRYKKPMKVDSICNLD
110 120 130 140 150 160
170 180 190 200 210 220
pF1KE5 IFYFPFDQQNCTFTFSSFLYTVDSMLLGMDKEVWEITDTSRKVIQTQGEWELLGINKATP
::::::::::::.:::::::::::::: :.::::::::.::...::.:::::::..:::
NP_938 IFYFPFDQQNCTLTFSSFLYTVDSMLLDMEKEVWEITDASRNILQTHGEWELLGLSKATA
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KE5 KMSMGNNLYDQIMFYVAIRRRPSLYIINLLVPSSFLVAIDALSFYLPAESENRAPFKITL
:.: :.::::::.::::::::::::.:::::::.:::::::::::::..: ::.::::::
NP_938 KLSRGGNLYDQIVFYVAIRRRPSLYVINLLVPSGFLVAIDALSFYLPVKSGNRVPFKITL
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KE5 LLGYNVFLLMMNDLLPASGTPLISVYFALCLSLMVVSLLETVFITYLLHVATTQPPPMPR
:::::::::::.::::.::::::.::::::::::: :::::.:::.:::::::::::.::
NP_938 LLGYNVFLLMMSDLLPTSGTPLIGVYFALCLSLMVGSLLETIFITHLLHVATTQPPPLPR
290 300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KE5 WLHSLLLHCTSPGRCCPTAPQKGNKGLGLTLTHLPGPKEPGELAGKKLGPRETEPDGGSG
:::::::::.:::::::::::: ::: ::: ::::: ::: ::. :: :.: :::
NP_938 WLHSLLLHCNSPGRCCPTAPQKENKGPGLTPTHLPGVKEPEVSAGQMPGPAEAELTGGSE
350 360 370 380 390 400
410 420 430 440
pF1KE5 WTKTQL---------MELWVQFSHAMDTLLFRLYLLFMASSILTVIVLWNT
::..: .:::.:::::::..:::::::::::::.::: ::::
NP_938 WTRAQREHEAQKQHSVELWLQFSHAMDAMLFRLYLLFMASSIITVICLWNT
410 420 430 440 450
>>NP_001243543 (OMIM: 610123) 5-hydroxytryptamine recept (482 aa)
initn: 2013 init1: 1544 opt: 1549 Z-score: 1688.5 bits: 321.7 E(85289): 2.6e-87
Smith-Waterman score: 2122; 69.1% identity (82.0% similar) in 472 aa overlap (11-447:26-482)
10 20 30 40
pF1KE5 MEGGWPARQSALLCLTVSLLLQGRGDAFTINCSGFDQHGVDPAVF
::: :: :. ::: .:::::::: :::.::...
NP_001 MLAFILSRATPRPALGPLSYREHRVALLHLTHSMSTTGRGVTFTINCSGFGQHGADPTAL
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE5 QAVFDRKAFRPFTNYSIPTRVNISFTLSAILGVDAQLQLLTSFLWMDLVWDNPFINWNPK
..::.:: ::: :: :.::.:::::..:::: :.:::::::.:::.
NP_001 NSVFNRKPFRPVTNISVPTQVNISFAMSAIL---------------DVVWDNPFISWNPE
70 80 90 100
110 120 130
pF1KE5 ECVGINKLTVLAENLWLPDIFIVES--------------------------MDVDQTPSG
:: ::.:... :.:::::::::.: ::::.::.:
NP_001 ECEGITKMSMAAKNLWLPDIFIIELCVSRAGQREVPSPGSHRDHSLPLGPLMDVDKTPKG
110 120 130 140 150 160
140 150 160 170 180 190
pF1KE5 LTAYISSEGRIKYDKPMRVTSICNLDIFYFPFDQQNCTFTFSSFLYTVDSMLLGMDKEVW
::::.:.::::.: :::.: ::::::::::::::::::.:::::::::::::: :.::::
NP_001 LTAYVSNEGRIRYKKPMKVDSICNLDIFYFPFDQQNCTLTFSSFLYTVDSMLLDMEKEVW
170 180 190 200 210 220
200 210 220 230 240 250
pF1KE5 EITDTSRKVIQTQGEWELLGINKATPKMSMGNNLYDQIMFYVAIRRRPSLYIINLLVPSS
::::.::...::.:::::::..::: :.: :.::::::.::::::::::::.:::::::.
NP_001 EITDASRNILQTHGEWELLGLSKATAKLSRGGNLYDQIVFYVAIRRRPSLYVINLLVPSG
230 240 250 260 270 280
260 270 280 290 300 310
pF1KE5 FLVAIDALSFYLPAESENRAPFKITLLLGYNVFLLMMNDLLPASGTPLISVYFALCLSLM
:::::::::::::..: ::.:::::::::::::::::.::::.::::::.::::::::::
NP_001 FLVAIDALSFYLPVKSGNRVPFKITLLLGYNVFLLMMSDLLPTSGTPLIGVYFALCLSLM
290 300 310 320 330 340
320 330 340 350 360 370
pF1KE5 VVSLLETVFITYLLHVATTQPPPMPRWLHSLLLHCTSPGRCCPTAPQKGNKGLGLTLTHL
: :::::.:::.:::::::::::.:::::::::::.:::::::::::: ::: ::: :::
NP_001 VGSLLETIFITHLLHVATTQPPPLPRWLHSLLLHCNSPGRCCPTAPQKENKGPGLTPTHL
350 360 370 380 390 400
380 390 400 410 420 430
pF1KE5 PGPKEPGELAGKKLGPRETEPDGGSGWTKTQL---------MELWVQFSHAMDTLLFRLY
:: ::: ::. :: :.: ::: ::..: .:::.:::::::..:::::
NP_001 PGVKEPEVSAGQMPGPAEAELTGGSEWTRAQREHEAQKQHSVELWLQFSHAMDAMLFRLY
410 420 430 440 450 460
440
pF1KE5 LLFMASSILTVIVLWNT
::::::::.::: ::::
NP_001 LLFMASSIITVICLWNT
470 480
>>NP_001155244 (OMIM: 182139) 5-hydroxytryptamine recept (463 aa)
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30 40 50 60 70 80
pF1KE5 LQGRGDAFTINCSGFDQHGVDPAVFQAVFDRKAFRPFTNYSIPTRVNISFTLSAILGVDA
::. :: .. :: :.:. . :::.::
NP_001 MHRSFLQARRSRNTTRPALLRLSDYLLTNYRKGVRPVRDWRKPTTVSIDVIVYAILNVDE
10 20 30 40 50 60
90 100 110 120 130 140
pF1KE5 QLQLLTSFLWMDLVWDNPFINWNPKECVGINKLTVLAENLWLPDIFIVESMDVDQTPSGL
. :.::...:. : . :..:::.. .:.::.. ....:.:::.: : .:: ..:.
NP_001 KNQVLTTYIWYRQYWTDEFLQWNPEDFDNITKLSIPTDSIWVPDILINEFVDVGKSPNIP
70 80 90 100 110 120
150 160 170 180 190 200
pF1KE5 TAYISSEGRIKYDKPMRVTSICNLDIFYFPFDQQNCTFTFSSFLYTVDSMLLGMDKEVWE
.:: .:... ::..:.. :.:::. :::: :::..::.:.:.:.... ... . . :
NP_001 YVYIRHQGEVQNYKPLQVVTACSLDIYNFPFDVQNCSLTFTSWLHTIQDINISLWR-LPE
130 140 150 160 170
210 220 230 240 250
pF1KE5 ITDTSRKVIQTQGEWELLGINKATPKMSM-GNNLYDQIMFYVAIRRRPSLYIINLLVPSS
. ..:.:...::::::::. ..:: ..: : .. :::.::::: .:...::.::
NP_001 KVKSDRSVFMNQGEWELLGVLPYFREFSMESSNYYAEMKFYVVIRRRPLFYVVSLLLPSI
180 190 200 210 220 230
260 270 280 290 300 310
pF1KE5 FLVAIDALSFYLPAESENRAPFKITLLLGYNVFLLMMNDLLPAS--GTPLISVYFALCLS
::...: ..:::: .: .:. :::::::::.:::....: :::. :::::.:::..:..
NP_001 FLMVMDIVGFYLPPNSGERVSFKITLLLGYSVFLIIVSDTLPATAIGTPLIGVYFVVCMA
240 250 260 270 280 290
320 330 340 350 360
pF1KE5 LMVVSLLETVFITYLLHVATTQPPPMPRWLHSLLLHCTSPGRCC--------PTAPQKGN
:.:.:: ::.::. :.: : : .: ::. :.:. . : : : ....
NP_001 LLVISLAETIFIVRLVHKQDLQQP-VPAWLRHLVLERIAWLLCLREQSTSQRPPATSQAT
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410
pF1KE5 K-----GLGLTLTHLPGP----KEPGELAGKKLGPRETEPDGGSGWTKT-----QLMEL-
: ..: .:. :: : : . . :::. . : . :..:
NP_001 KTDDCSAMGNHCSHMGGPQDFEKSPRDRCSPPPPPREASL-AVCGLLQELSSIRQFLEKR
360 370 380 390 400 410
420 430 440
pF1KE5 ---------WVQFSHAMDTLLFRLYLLFMASSILTVIVLWNT
:.. . ..: :::..::: . . .:...::.
NP_001 DEIREVARDWLRVGSVLDKLLFHIYLLAVLAYSITLVMLWSIWQYA
420 430 440 450 460
>>NP_000860 (OMIM: 182139) 5-hydroxytryptamine receptor (484 aa)
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Smith-Waterman score: 978; 37.6% identity (68.9% similar) in 431 aa overlap (51-446:52-479)
30 40 50 60 70 80
pF1KE5 LQGRGDAFTINCSGFDQHGVDPAVFQAVFDRKAFRPFTNYSIPTRVNISFTLSAILGVDA
::. :: .. :: :.:. . :::.::
NP_000 TLLAQGEARRSRNTTRPALLRLSDYLLTNYRKGVRPVRDWRKPTTVSIDVIVYAILNVDE
30 40 50 60 70 80
90 100 110 120 130 140
pF1KE5 QLQLLTSFLWMDLVWDNPFINWNPKECVGINKLTVLAENLWLPDIFIVESMDVDQTPSGL
. :.::...:. : . :..:::.. .:.::.. ....:.:::.: : .:: ..:.
NP_000 KNQVLTTYIWYRQYWTDEFLQWNPEDFDNITKLSIPTDSIWVPDILINEFVDVGKSPNIP
90 100 110 120 130 140
150 160 170 180 190 200
pF1KE5 TAYISSEGRIKYDKPMRVTSICNLDIFYFPFDQQNCTFTFSSFLYTVDSMLLGMDKEVWE
.:: .:... ::..:.. :.:::. :::: :::..::.:.:.:.... ... . . :
NP_000 YVYIRHQGEVQNYKPLQVVTACSLDIYNFPFDVQNCSLTFTSWLHTIQDINISLWR-LPE
150 160 170 180 190 200
210 220 230 240 250
pF1KE5 ITDTSRKVIQTQGEWELLGINKATPKMSM-GNNLYDQIMFYVAIRRRPSLYIINLLVPSS
. ..:.:...::::::::. ..:: ..: : .. :::.::::: .:...::.::
NP_000 KVKSDRSVFMNQGEWELLGVLPYFREFSMESSNYYAEMKFYVVIRRRPLFYVVSLLLPSI
210 220 230 240 250 260
260 270 280 290 300 310
pF1KE5 FLVAIDALSFYLPAESENRAPFKITLLLGYNVFLLMMNDLLPAS--GTPLISVYFALCLS
::...: ..:::: .: .:. :::::::::.:::....: :::. :::::.:::..:..
NP_000 FLMVMDIVGFYLPPNSGERVSFKITLLLGYSVFLIIVSDTLPATAIGTPLIGVYFVVCMA
270 280 290 300 310 320
320 330 340 350 360
pF1KE5 LMVVSLLETVFITYLLHVATTQPPPMPRWLHSLLLHCTSPGRCC--------PTAPQKGN
:.:.:: ::.::. :.: : : .: ::. :.:. . : : : ....
NP_000 LLVISLAETIFIVRLVHKQDLQQP-VPAWLRHLVLERIAWLLCLREQSTSQRPPATSQAT
330 340 350 360 370
370 380 390 400 410
pF1KE5 K-----GLGLTLTHLPGP----KEPGELAGKKLGPRETEPDGGSGWTKT-----QLMEL-
: ..: .:. :: : : . . :::. . : . :..:
NP_000 KTDDCSAMGNHCSHMGGPQDFEKSPRDRCSPPPPPREASL-AVCGLLQELSSIRQFLEKR
380 390 400 410 420 430
420 430 440
pF1KE5 ---------WVQFSHAMDTLLFRLYLLFMASSILTVIVLWNT
:.. . ..: :::..::: . . .:...::.
NP_000 DEIREVARDWLRVGSVLDKLLFHIYLLAVLAYSITLVMLWSIWQYA
440 450 460 470 480
>>NP_001157118 (OMIM: 610122) 5-hydroxytryptamine recept (454 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MEGGWPARQSALLCLTVSLLLQGRGDAFTINCSGFDQHGVDPAVFQAVFDRKAFRPFTNY
:: :. ::: : ::.. ::: :: :: ::::.:::::::::. : :::
NP_001 MQKHSPGPPALALLSQSLLTTGNGDTLIINCPGFGQHRVDPAAFQAVFDRKAIGPVTNY
10 20 30 40 50
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pF1KE5 SIPTRVNISFTLSAILGVDAQLQLLTSFLWMDLVWDNPFINWNPKECVGINKLTVLAENL
:. :.:::::::::: . .... .. : : :..::: :: ::.: . .:::
NP_001 SVATHVNISFTLSAIWNCYSRIHTFNCH--HARPWHNQFVQWNPDECGGIKKSGMATENL
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 WLPDIFIVESMDVDQTPSGLTAYISSEGRIKYDKPMRVTSICNLDIFYFPFDQQNCTFTF
:: :.:: :: :::::.:: : .: ...:: ..: : ..
NP_001 WLSDVFIEES--VDQTPAGLMASMSI---------VKATSNT--------ISQ--CGWSA
120 130 140 150
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pF1KE5 SSFLYTVDSMLLGMDK-EVWEITDTS-----RKVIQTQGEWELLGINKATPKMSMGNNLY
:. . :. .::. ..:. . : : ..:. :: ::::.: : :.....: :
NP_001 SA--NWTPSISPSMDRARAWRRMSRSFQIHHRTSFRTRREWVLLGIQKRTIKVTVATNQY
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 DQIMFYVAIRRR--PSLYIINLLVPSSFLVAIDALSFYLPAESENRAPFKITLLLGYNVF
.: .:.:::::: :: :..:.::::..:.:::::::::: :: : ::::.:.::::.::
NP_001 EQAIFHVAIRRRCRPSPYVVNFLVPSGILIAIDALSFYLPLESGNCAPFKMTVLLGYSVF
220 230 240 250 260 270
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pF1KE5 LLMMNDLLPASGT--------PLI--------SVYFALCLSLMVVSLLETVFITYLLHVA
::::::::::..: :: .::::::::::: :::::.:::.:::::
NP_001 LLMMNDLLPATSTSSHASLVAPLALMQTPLPAGVYFALCLSLMVGSLLETIFITHLLHVA
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pF1KE5 TTQPPPMPRWLHSLLLHCTSPGRCCPTAPQKGNKGLGLTLTHLPGPKEPGELAGKKLGPR
:::: :.::::::::::::. :::::::::::::: ::: ::::: ::: ::. ::
NP_001 TTQPLPLPRWLHSLLLHCTGQGRCCPTAPQKGNKGPGLTPTHLPGVKEPEVSAGQMPGPG
340 350 360 370 380 390
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pF1KE5 ETEPDGGSGWTKTQL---------MELWVQFSHAMDTLLFRLYLLFMASSILTVIVLWNT
:.: ::: ::..: .:::::::::::.::::::::::::::.::: ::::
NP_001 EAELTGGSEWTRAQREHEAQKQHSVELWVQFSHAMDALLFRLYLLFMASSIITVICLWNT
400 410 420 430 440 450
>>NP_998786 (OMIM: 182139) 5-hydroxytryptamine receptor (516 aa)
initn: 939 init1: 667 opt: 785 Z-score: 857.1 bits: 168.0 E(85289): 5.3e-41
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30 40 50 60 70 80
pF1KE5 LQGRGDAFTINCSGFDQHGVDPAVFQAVFDRKAFRPFTNYSIPTRVNISFTLSAILGVDA
::. :: .. :: :.:. . :::.::
NP_998 TLLAQGEARRSRNTTRPALLRLSDYLLTNYRKGVRPVRDWRKPTTVSIDVIVYAILNVDE
30 40 50 60 70 80
90 100 110 120 130 140
pF1KE5 QLQLLTSFLWMDLVWDNPFINWNPKECVGINKLTVLAENLWLPDIFIVESMDVDQTPSGL
. :.::...:. : . :..:::.. .:.::.. ....:.:::.: : .:: ..:.
NP_998 KNQVLTTYIWYRQYWTDEFLQWNPEDFDNITKLSIPTDSIWVPDILINEFVDVGKSPNIP
90 100 110 120 130 140
150 160 170 180 190 200
pF1KE5 TAYISSEGRIKYDKPMRVTSICNLDIFYFPFDQQNCTFTFSSFLYTVDSMLLGMDKEVWE
.:: .:... ::..:.. :.:::. :::: :::..::.:.:.:.... ... . . :
NP_998 YVYIRHQGEVQNYKPLQVVTACSLDIYNFPFDVQNCSLTFTSWLHTIQDINISLWR-LPE
150 160 170 180 190 200
210 220 230 240 250
pF1KE5 ITDTSRKVIQTQGEWELLGINKATPKMSM-GNNLYDQIMFYVAIRRRPSLYIINLLVPSS
. ..:.:...::::::::. ..:: ..: : .. :::.::::: .:...::.::
NP_998 KVKSDRSVFMNQGEWELLGVLPYFREFSMESSNYYAEMKFYVVIRRRPLFYVVSLLLPSI
210 220 230 240 250 260
260 270 280 290 300
pF1KE5 FLVAIDALSFYLPAESENRAPFKITLLLGYNVFLLMMNDLLPAS--GTPLIS--------
::...: ..:::: .: .:. :::::::::.:::....: :::. :::::.
NP_998 FLMVMDIVGFYLPPNSGERVSFKITLLLGYSVFLIIVSDTLPATAIGTPLIGKAPPGSRA
270 280 290 300 310 320
310 320 330 340
pF1KE5 ------------------------VYFALCLSLMVVSLLETVFITYLLHVATTQPPPMPR
:::..:..:.:.:: ::.::. :.: : : .:
NP_998 QSGEKPAPSHLLHVSLASALGCTGVYFVVCMALLVISLAETIFIVRLVHKQDLQQP-VPA
330 340 350 360 370
350 360 370 380
pF1KE5 WLHSLLLHCTSPGRCC--------PTAPQKGNK-----GLGLTLTHLPGP----KEPGEL
::. :.:. . : : : ....: ..: .:. :: : : .
NP_998 WLRHLVLERIAWLLCLREQSTSQRPPATSQATKTDDCSAMGNHCSHMGGPQDFEKSPRDR
380 390 400 410 420 430
390 400 410 420 430 440
pF1KE5 AGKKLGPRETEPDGGSGWTKTQLMELWVQFSHAMDTLLFRLYLLFMASSILTVIVLWNT
. :::
NP_998 CSPPPPPREASLAVCGLLQELSSIRQFLEKRDEIREVARDWLRVGSVLDKLLFHIYLLAV
440 450 460 470 480 490
447 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 02:00:51 2016 done: Tue Nov 8 02:00:52 2016
Total Scan time: 9.030 Total Display time: 0.070
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]