Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5555
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5555, 367 aa
1>>>pF1KE5555 367 - 367 aa - 367 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.6723+/-0.000902; mu= 6.6090+/- 0.055
mean_var=142.4621+/-28.737, 0's: 0 Z-trim(111.0): 26 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.107454
statistics sampled from 12001 (12027) to 12001 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.719), E-opt: 0.2 (0.369), width: 16
Scan time: 2.980
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS9484.1 MBNL2 gene_id:10150|Hs108|chr13 ( 367) 2477 395.3 4.6e-110
CCDS76644.1 MBNL2 gene_id:10150|Hs108|chr13 ( 373) 2265 362.4 3.6e-100
CCDS9483.1 MBNL2 gene_id:10150|Hs108|chr13 ( 361) 2187 350.3 1.5e-96
CCDS3163.1 MBNL1 gene_id:4154|Hs108|chr3 ( 382) 1890 304.3 1.2e-82
CCDS3168.1 MBNL1 gene_id:4154|Hs108|chr3 ( 342) 1722 278.2 7.4e-75
CCDS3164.1 MBNL1 gene_id:4154|Hs108|chr3 ( 370) 1678 271.4 8.9e-73
CCDS3165.1 MBNL1 gene_id:4154|Hs108|chr3 ( 388) 1571 254.8 9.1e-68
CCDS3167.1 MBNL1 gene_id:4154|Hs108|chr3 ( 340) 1458 237.3 1.5e-62
CCDS14634.1 MBNL3 gene_id:55796|Hs108|chrX ( 334) 1367 223.2 2.7e-58
CCDS14633.1 MBNL3 gene_id:55796|Hs108|chrX ( 354) 1359 221.9 6.6e-58
CCDS82864.1 MBNL1 gene_id:4154|Hs108|chr3 ( 343) 1089 180.1 2.6e-45
CCDS55493.1 MBNL3 gene_id:55796|Hs108|chrX ( 292) 1033 171.3 9.2e-43
CCDS55494.1 MBNL3 gene_id:55796|Hs108|chrX ( 304) 1020 169.3 3.8e-42
CCDS55492.1 MBNL3 gene_id:55796|Hs108|chrX ( 258) 762 129.3 3.7e-30
CCDS54656.1 MBNL1 gene_id:4154|Hs108|chr3 ( 302) 676 116.0 4.3e-26
CCDS3166.1 MBNL1 gene_id:4154|Hs108|chr3 ( 314) 676 116.0 4.5e-26
>>CCDS9484.1 MBNL2 gene_id:10150|Hs108|chr13 (367 aa)
initn: 2477 init1: 2477 opt: 2477 Z-score: 2089.5 bits: 395.3 E(32554): 4.6e-110
Smith-Waterman score: 2477; 100.0% identity (100.0% similar) in 367 aa overlap (1-367:1-367)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MALNVAPVRDTKWLTLEVCRQFQRGTCSRSDEECKFAHPPKSCQVENGRVIACFDSLKGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 MALNVAPVRDTKWLTLEVCRQFQRGTCSRSDEECKFAHPPKSCQVENGRVIACFDSLKGR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 CSRENCKYLHPPTHLKTQLEINGRNNLIQQKTAAAMLAQQMQFMFPGTPLHPVPTFPVGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 CSRENCKYLHPPTHLKTQLEINGRNNLIQQKTAAAMLAQQMQFMFPGTPLHPVPTFPVGP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 AIGTNTAISFAPYLAPVTPGVGLVPTEILPTTPVIVPGSPPVTVPGSTATQKLLRTDKLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 AIGTNTAISFAPYLAPVTPGVGLVPTEILPTTPVIVPGSPPVTVPGSTATQKLLRTDKLE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 VCREFQRGNCARGETDCRFAHPADSTMIDTSDNTVTVCMDYIKGRCMREKCKYFHPPAHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 VCREFQRGNCARGETDCRFAHPADSTMIDTSDNTVTVCMDYIKGRCMREKCKYFHPPAHL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 QAKIKAAQHQANQAAVAAQAAAAAATVMAFPPGALHPLPKRQALEKSNGTSAVFNPSVLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 QAKIKAAQHQANQAAVAAQAAAAAATVMAFPPGALHPLPKRQALEKSNGTSAVFNPSVLH
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 YQQALTSAQLQQHAAFIPTGSVLCMTPATSIVPMMHSATSATVSAATTPATSVPFAATAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 YQQALTSAQLQQHAAFIPTGSVLCMTPATSIVPMMHSATSATVSAATTPATSVPFAATAT
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 ANQIILK
:::::::
CCDS94 ANQIILK
>>CCDS76644.1 MBNL2 gene_id:10150|Hs108|chr13 (373 aa)
initn: 2265 init1: 2265 opt: 2265 Z-score: 1911.8 bits: 362.4 E(32554): 3.6e-100
Smith-Waterman score: 2265; 100.0% identity (100.0% similar) in 331 aa overlap (1-331:1-331)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MALNVAPVRDTKWLTLEVCRQFQRGTCSRSDEECKFAHPPKSCQVENGRVIACFDSLKGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 MALNVAPVRDTKWLTLEVCRQFQRGTCSRSDEECKFAHPPKSCQVENGRVIACFDSLKGR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 CSRENCKYLHPPTHLKTQLEINGRNNLIQQKTAAAMLAQQMQFMFPGTPLHPVPTFPVGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 CSRENCKYLHPPTHLKTQLEINGRNNLIQQKTAAAMLAQQMQFMFPGTPLHPVPTFPVGP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 AIGTNTAISFAPYLAPVTPGVGLVPTEILPTTPVIVPGSPPVTVPGSTATQKLLRTDKLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 AIGTNTAISFAPYLAPVTPGVGLVPTEILPTTPVIVPGSPPVTVPGSTATQKLLRTDKLE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 VCREFQRGNCARGETDCRFAHPADSTMIDTSDNTVTVCMDYIKGRCMREKCKYFHPPAHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 VCREFQRGNCARGETDCRFAHPADSTMIDTSDNTVTVCMDYIKGRCMREKCKYFHPPAHL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 QAKIKAAQHQANQAAVAAQAAAAAATVMAFPPGALHPLPKRQALEKSNGTSAVFNPSVLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 QAKIKAAQHQANQAAVAAQAAAAAATVMAFPPGALHPLPKRQALEKSNGTSAVFNPSVLH
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 YQQALTSAQLQQHAAFIPTGSVLCMTPATSIVPMMHSATSATVSAATTPATSVPFAATAT
:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 YQQALTSAQLQQHAAFIPTGSVLCMTPATSIDNSEIISRNGMECQESALRITKHCYCTYY
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 ANQIILK
CCDS76 PVSSSIELPQTAC
370
>>CCDS9483.1 MBNL2 gene_id:10150|Hs108|chr13 (361 aa)
initn: 2187 init1: 2187 opt: 2187 Z-score: 1846.7 bits: 350.3 E(32554): 1.5e-96
Smith-Waterman score: 2187; 100.0% identity (100.0% similar) in 319 aa overlap (1-319:1-319)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MALNVAPVRDTKWLTLEVCRQFQRGTCSRSDEECKFAHPPKSCQVENGRVIACFDSLKGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 MALNVAPVRDTKWLTLEVCRQFQRGTCSRSDEECKFAHPPKSCQVENGRVIACFDSLKGR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 CSRENCKYLHPPTHLKTQLEINGRNNLIQQKTAAAMLAQQMQFMFPGTPLHPVPTFPVGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 CSRENCKYLHPPTHLKTQLEINGRNNLIQQKTAAAMLAQQMQFMFPGTPLHPVPTFPVGP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 AIGTNTAISFAPYLAPVTPGVGLVPTEILPTTPVIVPGSPPVTVPGSTATQKLLRTDKLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 AIGTNTAISFAPYLAPVTPGVGLVPTEILPTTPVIVPGSPPVTVPGSTATQKLLRTDKLE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 VCREFQRGNCARGETDCRFAHPADSTMIDTSDNTVTVCMDYIKGRCMREKCKYFHPPAHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 VCREFQRGNCARGETDCRFAHPADSTMIDTSDNTVTVCMDYIKGRCMREKCKYFHPPAHL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 QAKIKAAQHQANQAAVAAQAAAAAATVMAFPPGALHPLPKRQALEKSNGTSAVFNPSVLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 QAKIKAAQHQANQAAVAAQAAAAAATVMAFPPGALHPLPKRQALEKSNGTSAVFNPSVLH
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 YQQALTSAQLQQHAAFIPTGSVLCMTPATSIVPMMHSATSATVSAATTPATSVPFAATAT
:::::::::::::::::::
CCDS94 YQQALTSAQLQQHAAFIPTDNSEIISRNGMECQESALRITKHCYCTYYPVSSSIELPQTA
310 320 330 340 350 360
>>CCDS3163.1 MBNL1 gene_id:4154|Hs108|chr3 (382 aa)
initn: 1310 init1: 634 opt: 1890 Z-score: 1597.5 bits: 304.3 E(32554): 1.2e-82
Smith-Waterman score: 1890; 75.9% identity (91.1% similar) in 370 aa overlap (1-364:1-365)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MALNVAPVRDTKWLTLEVCRQFQRGTCSRSDEECKFAHPPKSCQVENGRVIACFDSLKGR
::..:.:.::::::::::::.:::::::: : ::::::: ::::::::::::::::::::
CCDS31 MAVSVTPIRDTKWLTLEVCREFQRGTCSRPDTECKFAHPSKSCQVENGRVIACFDSLKGR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE5 CSRENCKYLHPPTHLKTQLEINGRNNLIQQKTAAAMLAQQMQF---MFPGTPLHPVPTFP
:::::::::::: ::::::::::::::::::. : :::::::. :.::.::.::: :
CCDS31 CSRENCKYLHPPPHLKTQLEINGRNNLIQQKNMA-MLAQQMQLANAMMPGAPLQPVPMFS
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 VGPAIGTN-TAISFAPYLAPVTPGVGLVPTEILPTTPVIVPGSPPVTVPGSTAT--QKLL
:.:...:: .: .: :::.::.: .:::.:::::.:..: :.: : ::...:. :::.
CCDS31 VAPSLATNASAAAFNPYLGPVSP--SLVPAEILPTAPMLVTGNPGVPVPAAAAAAAQKLM
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 RTDKLEVCREFQRGNCARGETDCRFAHPADSTMIDTSDNTVTVCMDYIKGRCMREKCKYF
:::.::::::.::::: :::.:::::::::::::::.::::::::::::::: :::::::
CCDS31 RTDRLEVCREYQRGNCNRGENDCRFAHPADSTMIDTNDNTVTVCMDYIKGRCSREKCKYF
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 HPPAHLQAKIKAAQHQANQAAVAAQAAAAAATVMAFPPGALHPLPKRQALEKSNGTSAVF
::::::::::::::.:.:::: ::::::.::. :..: ..: ::::: ::::.::..:::
CCDS31 HPPAHLQAKIKAAQYQVNQAA-AAQAAATAAA-MGIPQAVLPPLPKRPALEKTNGATAVF
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 NPSVLHYQQALTSAQLQQHAAFIPTGSVLCMTPATSIVPMMHSATSATVSAATTPATSVP
: ....:::::.. :::::.::.: ::.::::::::.:::.:.:: :::::::: :::::
CCDS31 NTGIFQYQQALANMQLQQHTAFLPPGSILCMTPATSVVPMVHGATPATVSAATTSATSVP
300 310 320 330 340 350
360
pF1KE5 FAATATANQIILK
::::::::::
CCDS31 FAATATANQIPIISAEHLTSHKYVTQM
360 370 380
>>CCDS3168.1 MBNL1 gene_id:4154|Hs108|chr3 (342 aa)
initn: 1228 init1: 634 opt: 1722 Z-score: 1457.4 bits: 278.2 E(32554): 7.4e-75
Smith-Waterman score: 1722; 74.8% identity (90.8% similar) in 337 aa overlap (1-331:1-332)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MALNVAPVRDTKWLTLEVCRQFQRGTCSRSDEECKFAHPPKSCQVENGRVIACFDSLKGR
::..:.:.::::::::::::.:::::::: : ::::::: ::::::::::::::::::::
CCDS31 MAVSVTPIRDTKWLTLEVCREFQRGTCSRPDTECKFAHPSKSCQVENGRVIACFDSLKGR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE5 CSRENCKYLHPPTHLKTQLEINGRNNLIQQKTAAAMLAQQMQF---MFPGTPLHPVPTFP
:::::::::::: ::::::::::::::::::. : :::::::. :.::.::.::: :
CCDS31 CSRENCKYLHPPPHLKTQLEINGRNNLIQQKNMA-MLAQQMQLANAMMPGAPLQPVPMFS
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 VGPAIGTN-TAISFAPYLAPVTPGVGLVPTEILPTTPVIVPGSPPVTVPGSTAT--QKLL
:.:...:: .: .: :::.::.: .:::.:::::.:..: :.: : ::...:. :::.
CCDS31 VAPSLATNASAAAFNPYLGPVSP--SLVPAEILPTAPMLVTGNPGVPVPAAAAAAAQKLM
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 RTDKLEVCREFQRGNCARGETDCRFAHPADSTMIDTSDNTVTVCMDYIKGRCMREKCKYF
:::.::::::.::::: :::.:::::::::::::::.::::::::::::::: :::::::
CCDS31 RTDRLEVCREYQRGNCNRGENDCRFAHPADSTMIDTNDNTVTVCMDYIKGRCSREKCKYF
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 HPPAHLQAKIKAAQHQANQAAVAAQAAAAAATVMAFPPGALHPLPKRQALEKSNGTSAVF
::::::::::::::.:.:::: ::::::.::. :..: ..: ::::: ::::.::..:::
CCDS31 HPPAHLQAKIKAAQYQVNQAA-AAQAAATAAA-MGIPQAVLPPLPKRPALEKTNGATAVF
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 NPSVLHYQQALTSAQLQQHAAFIPTGSVLCMTPATSIVPMMHSATSATVSAATTPATSVP
: ....:::::.. :::::.::.: ::.::::::::.
CCDS31 NTGIFQYQQALANMQLQQHTAFLPPGSILCMTPATSVDTHNICRTSD
300 310 320 330 340
360
pF1KE5 FAATATANQIILK
>>CCDS3164.1 MBNL1 gene_id:4154|Hs108|chr3 (370 aa)
initn: 1510 init1: 634 opt: 1678 Z-score: 1420.1 bits: 271.4 E(32554): 8.9e-73
Smith-Waterman score: 1781; 73.5% identity (88.1% similar) in 370 aa overlap (1-364:1-353)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MALNVAPVRDTKWLTLEVCRQFQRGTCSRSDEECKFAHPPKSCQVENGRVIACFDSLKGR
::..:.:.::::::::::::.:::::::: : ::::::: ::::::::::::::::::::
CCDS31 MAVSVTPIRDTKWLTLEVCREFQRGTCSRPDTECKFAHPSKSCQVENGRVIACFDSLKGR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE5 CSRENCKYLHPPTHLKTQLEINGRNNLIQQKTAAAMLAQQMQF---MFPGTPLHPVPTFP
:::::::::::: ::::::::::::::::::. : :::::::. :.::.::.::: :
CCDS31 CSRENCKYLHPPPHLKTQLEINGRNNLIQQKNMA-MLAQQMQLANAMMPGAPLQPVPMFS
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 VGPAIGTN-TAISFAPYLAPVTPGVGLVPTEILPTTPVIVPGSPPVTVPGSTAT--QKLL
:.:...:: .: .: :::.::.: .:::.:::::.:..: :.: : ::...:. :::.
CCDS31 VAPSLATNASAAAFNPYLGPVSP--SLVPAEILPTAPMLVTGNPGVPVPAAAAAAAQKLM
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 RTDKLEVCREFQRGNCARGETDCRFAHPADSTMIDTSDNTVTVCMDYIKGRCMREKCKYF
:::.::::::.::::: :::.:::::::::::::::.::::::::::::::: :::::::
CCDS31 RTDRLEVCREYQRGNCNRGENDCRFAHPADSTMIDTNDNTVTVCMDYIKGRCSREKCKYF
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 HPPAHLQAKIKAAQHQANQAAVAAQAAAAAATVMAFPPGALHPLPKRQALEKSNGTSAVF
::::::::::::::.:.:::: ::::::.::. :..: ..: ::::: ::::.::..:::
CCDS31 HPPAHLQAKIKAAQYQVNQAA-AAQAAATAAA-MGIPQAVLPPLPKRPALEKTNGATAVF
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 NPSVLHYQQALTSAQLQQHAAFIPTGSVLCMTPATSIVPMMHSATSATVSAATTPATSVP
: ....:::::.. :::::.::.: : :::.:.:: :::::::: :::::
CCDS31 NTGIFQYQQALANMQLQQHTAFLP--------P----VPMVHGATPATVSAATTSATSVP
300 310 320 330 340
360
pF1KE5 FAATATANQIILK
::::::::::
CCDS31 FAATATANQIPIISAEHLTSHKYVTQM
350 360 370
>>CCDS3165.1 MBNL1 gene_id:4154|Hs108|chr3 (388 aa)
initn: 1434 init1: 637 opt: 1571 Z-score: 1330.1 bits: 254.8 E(32554): 9.1e-68
Smith-Waterman score: 1746; 70.0% identity (84.5% similar) in 387 aa overlap (1-364:1-371)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MALNVAPVRDTKWLTLEVCRQFQRGTCSRSDEECKFAHPPKSCQVENGRVIACFDSLKGR
::..:.:.::::::::::::.:::::::: : ::::::: ::::::::::::::::::::
CCDS31 MAVSVTPIRDTKWLTLEVCREFQRGTCSRPDTECKFAHPSKSCQVENGRVIACFDSLKGR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE5 CSRENCKYLHPPTHLKTQLEINGRNNLIQQKTAAAMLAQQMQF---MFPGTPLHPVPTFP
:::::::::::: ::::::::::::::::::. : :::::::. :.::.::.::: :
CCDS31 CSRENCKYLHPPPHLKTQLEINGRNNLIQQKNMA-MLAQQMQLANAMMPGAPLQPVPMFS
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 VGPAIGTN-TAISFAPYLAPVTPGVGLVPTEILPTTPVIVPGSPPVTVPGSTAT--QKLL
:.:...:: .: .: :::.::.: .:::.:::::.:..: :.: : ::...:. :::.
CCDS31 VAPSLATNASAAAFNPYLGPVSP--SLVPAEILPTAPMLVTGNPGVPVPAAAAAAAQKLM
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 RTDKLEVCREFQRGNCARGETDCRFAHPADSTMIDTSDNTVTVCMDYIKGRCMREKCKYF
:::.::::::.::::: :::.:::::::::::::::.::::::::::::::: :::::::
CCDS31 RTDRLEVCREYQRGNCNRGENDCRFAHPADSTMIDTNDNTVTVCMDYIKGRCSREKCKYF
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270
pF1KE5 HPPAHLQAKIKAAQHQANQAAVAAQAAAAAATV-----------------MAFPPGALHP
::::::::::::::.:.:::: ::::::.::.. ...: ..: :
CCDS31 HPPAHLQAKIKAAQYQVNQAA-AAQAAATAAAMTQSAVKSLKRPLEATFDLGIPQAVLPP
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KE5 LPKRQALEKSNGTSAVFNPSVLHYQQALTSAQLQQHAAFIPTGSVLCMTPATSIVPMMHS
:::: ::::.::..:::: ....:::::.. :::::.::.: : :::.:.
CCDS31 LPKRPALEKTNGATAVFNTGIFQYQQALANMQLQQHTAFLP--------P----VPMVHG
300 310 320 330 340
340 350 360
pF1KE5 ATSATVSAATTPATSVPFAATATANQIILK
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CCDS31 ATPATVSAATTSATSVPFAATATANQIPIISAEHLTSHKYVTQM
350 360 370 380
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10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MALNVAPVRDTKWLTLEVCRQFQRGTCSRSDEECKFAHPPKSCQVENGRVIACFDSLKGR
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CCDS31 MAVSVTPIRDTKWLTLEVCREFQRGTCSRPDTECKFAHPSKSCQVENGRVIACFDSLKGR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE5 CSRENCKYLHPPTHLKTQLEINGRNNLIQQKTAAAMLAQQMQF---MFPGTPLHPVPTFP
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CCDS31 CSRENCKYLHPPPHLKTQLEINGRNNLIQQKNMA-MLAQQMQLANAMMPGAPLQPVPMFS
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 VGPAIGTN-TAISFAPYLAPVTPGVGLVPTEILPTTPVIVPGSPPVTVPGSTAT--QKLL
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CCDS31 VAPSLATNASAAAFNPYLGPVSPS--LVPAEILPTAPMLVTGNPGVPVPAAAAAAAQKLM
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 RTDKLEVCREFQRGNCARGETDCRFAHPADSTMIDTSDNTVTVCMDYIKGRCMREKCKYF
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CCDS31 RTDRLEVCREYQRGNCNRGENDCRFAHPADSTMIDTNDNTVTVCMDYIKGRCSREKCKYF
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240 250 260 270 280 290
pF1KE5 HPPAHLQAKIKAAQHQANQAAVAAQAAAAAATVMAFPPGALHPL-PKRQALEKSNGTSAV
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CCDS31 HPPAHLQAKIKAAQYQVNQAA-AAQAAATAAAMFPWCTVLRQPLCPQQQHLPQ------V
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 FNPSVLHYQQALTSAQLQQHAAFIPTGSVLCMTPATSIVPMMHSATSATVSAATTPATSV
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CCDS31 F-PSL---QQPQPTSPILDASTLL--GATSCPAAAGKMIPIISAEHLTSHKYVTQM
300 310 320 330 340
360
pF1KE5 PFAATATANQIILK
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10 20 30 40 50
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CCDS14 RCTRENCKYLHPPPHLKTQLEINGRNNLIQQKTAAAMFAQQMQLMLQNAQMSSLGSFPMT
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pF1KE5 PAIGTNTAISFAPYLAPVTPGVGLVPTEILPTTPVIVPGSPPVTVPGSTATQKLLRTDKL
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CCDS14 PSIPANPPMAFNPYI-P-HPGMGLVPAELVPNTPVLIPGNPPLAMPGAVGP-KLMRSDKL
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pF1KE5 EVCREFQRGNCARGETDCRFAHPADSTMIDTSDNTVTVCMDYIKGRCMREKCKYFHPPAH
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CCDS14 EVCREFQRGNCTRGENDCRYAHPTDASMIEASDNTVTICMDYIKGRCSREKCKYFHPPAH
180 190 200 210 220 230
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pF1KE5 LQAKIKAAQHQANQAAVAAQAAAAAATVMAFPPGALHPLPKRQALEKSNGTSAVFNPSVL
:::..:::.:: :..:..:.:
CCDS14 LQARLKAAHHQMNHSAASAMA---------------------------------------
240 250
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 HYQQALTSAQLQQHAAFIPTGSVLCMTPATSIVPMMHSATSATVSAATTPATSVPFAATA
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CCDS14 -----LTNLQLPQ-PAFIPAGPILCMAPASNIVPMMHGATPTTVSAATTPATSVPFAAPT
260 270 280 290 300 310
360
pF1KE5 TANQIILK
:.:::
CCDS14 TGNQIPQLSIDELNSSMFVSQM
320 330
>>CCDS14633.1 MBNL3 gene_id:55796|Hs108|chrX (354 aa)
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Smith-Waterman score: 1747; 67.8% identity (88.4% similar) in 363 aa overlap (2-364:3-352)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MALNVAPVRDTKWLTLEVCRQFQRGTCSRSDEECKFAHPPKSCQVENGRVIACFDSLKG
:.::: .::::::::::::.::::::::.: .:::::::. :.::::::.::::::::
CCDS14 MTAVNVALIRDTKWLTLEVCREFQRGTCSRADADCKFAHPPRVCHVENGRVVACFDSLKG
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 RCSRENCKYLHPPTHLKTQLEINGRNNLIQQKTAAAMLAQQMQFMFPGTPLHPVPTFPVG
::.:::::::::: :::::::::::::::::::::::.:::::.:. .. . . .::.
CCDS14 RCTRENCKYLHPPPHLKTQLEINGRNNLIQQKTAAAMFAQQMQLMLQNAQMSSLGSFPMT
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 PAIGTNTAISFAPYLAPVTPGVGLVPTEILPTTPVIVPGSPPVTVPGSTATQKLLRTDKL
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CCDS14 PSIPANPPMAFNPYI-P-HPGMGLVPAELVPNTPVLIPGNPPLAMPGAVGP-KLMRSDKL
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pF1KE5 EVCREFQRGNCARGETDCRFAHPADSTMIDTSDNTVTVCMDYIKGRCMREKCKYFHPPAH
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CCDS14 EVCREFQRGNCTRGENDCRYAHPTDASMIEASDNTVTICMDYIKGRCSREKCKYFHPPAH
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 LQAKIKAAQHQANQAAVAAQAAAAAATVMAFPPGALHPLPKRQALEKSNGTSAVFNPSVL
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CCDS14 LQARLKAAHHQMNHSA---------ASAMALQPGTLQLIPKRSALEKPNGATPVFNPTVF
240 250 260 270 280
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CCDS14 HCQQALTNLQLPQ-PAFIPAGPILCMAPASNIVPMMHGATPTTVSAATTPATSVPFAAPT
290 300 310 320 330 340
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CCDS14 TGNQLKF
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start: Tue Nov 8 01:47:05 2016 done: Tue Nov 8 01:47:05 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]