Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5535
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5535, 455 aa
1>>>pF1KE5535 455 - 455 aa - 455 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4942+/-0.000908; mu= 16.1592+/- 0.054
mean_var=61.5150+/-12.261, 0's: 0 Z-trim(104.0): 39 B-trim: 5 in 1/51
Lambda= 0.163525
statistics sampled from 7638 (7669) to 7638 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.61), E-opt: 0.2 (0.236), width: 16
Scan time: 3.110
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS10642.1 TUFM gene_id:7284|Hs108|chr16 ( 455) 2971 709.7 1.5e-204
CCDS33849.1 EEFSEC gene_id:60678|Hs108|chr3 ( 596) 337 88.4 2.2e-17
CCDS45414.1 GSPT1 gene_id:2935|Hs108|chr16 ( 499) 272 73.0 7.7e-13
CCDS4980.1 EEF1A1 gene_id:1915|Hs108|chr6 ( 462) 271 72.8 8.5e-13
CCDS45413.1 GSPT1 gene_id:2935|Hs108|chr16 ( 636) 272 73.1 9.6e-13
CCDS45412.1 GSPT1 gene_id:2935|Hs108|chr16 ( 637) 272 73.1 9.6e-13
CCDS13522.1 EEF1A2 gene_id:1917|Hs108|chr20 ( 463) 267 71.8 1.6e-12
CCDS47479.1 HBS1L gene_id:10767|Hs108|chr6 ( 642) 266 71.6 2.6e-12
CCDS5173.1 HBS1L gene_id:10767|Hs108|chr6 ( 684) 266 71.6 2.7e-12
CCDS14336.1 GSPT2 gene_id:23708|Hs108|chrX ( 628) 265 71.4 3e-12
>>CCDS10642.1 TUFM gene_id:7284|Hs108|chr16 (455 aa)
initn: 2971 init1: 2971 opt: 2971 Z-score: 3785.8 bits: 709.7 E(32554): 1.5e-204
Smith-Waterman score: 2971; 100.0% identity (100.0% similar) in 455 aa overlap (1-455:1-455)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MTTMAAATLLRATPHFSGLAAGRTFLLQGLLRLLKAPALPLLCRGLAVEAKKTYVRDKPH
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CCDS10 MTTMAAATLLRATPHFSGLAAGRTFLLQGLLRLLKAPALPLLCRGLAVEAKKTYVRDKPH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 VNVGTIGHVDHGKTTLTAAITKILAEGGGAKFKKYEEIDNAPEERARGITINAAHVEYST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 VNVGTIGHVDHGKTTLTAAITKILAEGGGAKFKKYEEIDNAPEERARGITINAAHVEYST
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 AARHYAHTDCPGHADYVKNMITGTAPLDGCILVVAANDGPMPQTREHLLLARQIGVEHVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 AARHYAHTDCPGHADYVKNMITGTAPLDGCILVVAANDGPMPQTREHLLLARQIGVEHVV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 VYVNKADAVQDSEMVELVELEIRELLTEFGYKGEETPVIVGSALCALEGRDPELGLKSVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 VYVNKADAVQDSEMVELVELEIRELLTEFGYKGEETPVIVGSALCALEGRDPELGLKSVQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 KLLDAVDTYIPVPARDLEKPFLLPVEAVYSVPGRGTVVTGTLERGILKKGDECELLGHSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KLLDAVDTYIPVPARDLEKPFLLPVEAVYSVPGRGTVVTGTLERGILKKGDECELLGHSK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 NIRTVVTGIEMFHKSLERAEAGDNLGALVRGLKREDLRRGLVMVKPGSIKPHQKVEAQVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 NIRTVVTGIEMFHKSLERAEAGDNLGALVRGLKREDLRRGLVMVKPGSIKPHQKVEAQVY
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 ILSKEEGGRHKPFVSHFMPVMFSLTWDMACRIILPPEKELAMPGEDLKFNLILRQPMILE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ILSKEEGGRHKPFVSHFMPVMFSLTWDMACRIILPPEKELAMPGEDLKFNLILRQPMILE
370 380 390 400 410 420
430 440 450
pF1KE5 KGQRFTLRDGNRTIGTGLVTNTLAMTEEEKNIKWG
:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KGQRFTLRDGNRTIGTGLVTNTLAMTEEEKNIKWG
430 440 450
>>CCDS33849.1 EEFSEC gene_id:60678|Hs108|chr3 (596 aa)
initn: 439 init1: 226 opt: 337 Z-score: 425.6 bits: 88.4 E(32554): 2.2e-17
Smith-Waterman score: 388; 28.5% identity (58.3% similar) in 312 aa overlap (60-342:7-303)
30 40 50 60 70 80
pF1KE5 LLRLLKAPALPLLCRGLAVEAKKTYVRDKPHVNVGTIGHVDHGKTTLTAAITKILAEGGG
.::::..::.: :::.:. :.. . ..
CCDS33 MAGRRVNVNVGVLGHIDSGKTALARALS---TTAST
10 20 30
90 100 110 120
pF1KE5 AKFKKYEEIDNAPEERARGITINAAHVEYSTA--AR-----------------------H
: : :. :. : ::::.. . .:. :: .
CCDS33 AAF------DKQPQSRERGITLDLGFSCFSVPLPARLRSSLPEFQAAPEAEPEPGEPLLQ
40 50 60 70 80
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 YAHTDCPGHADYVKNMITGTAPLDGCILVVAANDGPMPQTREHLLLARQIGVEHVVVYVN
. .::::::. ....: :. .: .::. .. : . :. : :... ::. ...:: .:
CCDS33 VTLVDCPGHASLIRTIIGGAQIIDLMMLVIDVTKGMQTQSAECLVIG-QIACQKLVVVLN
90 100 110 120 130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 KADAVQDSE---MVELVELEIRELLTEFGYKGEETPVI-VGSALCALEGRDPELGLKSVQ
: : . ... .. . .... : . ..: .:.: :.. . :. . : ...
CCDS33 KIDLLPEGKRQAAIDKMTKKMQKTLENTKFRG--APIIPVAAKPGGPEAPETEAP-QGIP
150 160 170 180 190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 KLLDAVDTYIPVPARDLEKPFLLPVEAVYSVPGRGTVVTGTLERGILKKGDECELLGHSK
.:.. . . : .:.:: :::. :. .:. :.:::.:::. : .. :: :. .
CCDS33 ELIELLTSQISIPTRDPSGPFLMSVDHCFSIKGQGTVMTGTILSGSISLGDSVEI--PAL
210 220 230 240 250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 NIRTVVTGIEMFHKSLERAEAGDNLGALVRGLKREDLRRGLVMVKPGSIKPHQKVEAQVY
.. : ...::: . : :: :: : . . :.::::
CCDS33 KVVKKVKSMQMFHMPITSAMQGDRLGICVTQFDPKLLERGLVCAPESLHTVHAALISVEK
270 280 290 300 310 320
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 ILSKEEGGRHKPFVSHFMPVMFSLTWDMACRIILPPEKELAMPGEDLKFNLILRQPMILE
CCDS33 IPYFRGPLQTKAKFHITVGHETVMGRLMFFSPAPDNFDQEPILDSFNFSQEYLFQEQYLS
330 340 350 360 370 380
>>CCDS45414.1 GSPT1 gene_id:2935|Hs108|chr16 (499 aa)
initn: 434 init1: 148 opt: 272 Z-score: 343.9 bits: 73.0 E(32554): 7.7e-13
Smith-Waterman score: 401; 28.1% identity (55.0% similar) in 338 aa overlap (58-362:72-400)
30 40 50 60 70 80
pF1KE5 QGLLRLLKAPALPLLCRGLAVEAKKTYVRDKPHVNVGTIGHVDHGKTTLTAAITKILAEG
: :::: ::::: ::.:. . : . .
CCDS45 PPEESAHEMMEEEEEIPKPKSVVAPPGAPKKEHVNVVFIGHVDAGKSTIGGQIMYLTGMV
50 60 70 80 90 100
90 100 110 120 130
pF1KE5 GGAKFKKYEE---------------IDNAPEERARGITINAAHVEYSTAARHYAHTDCPG
..:::. .:. ::: .: :...... . : .:.. : ::
CCDS45 DKRTLEKYEREAKEKNRETWYLSWALDTNQEERDKGKTVEVGRAYFETEKKHFTILDAPG
110 120 130 140 150 160
140 150 160 170 180
pF1KE5 HADYVKNMITGTAPLDGCILVVAANDGPMP-------QTREHLLLARQIGVEHVVVYVNK
: ..: ::: :.. : .::..: : . ::::: .::. ::.:..: .::
CCDS45 HKSFVPNMIGGASQADLAVLVISARKGEFETGFEKGGQTREHAMLAKTAGVKHLIVLINK
170 180 190 200 210 220
190 200 210 220 230
pF1KE5 AD---AVQDSEMVELVELEIRELLTEFGYKGEET----PV--IVGSALCALEGRDP-ELG
: . ..: : . .. .: . :.. .. : ..:. : : .:
CCDS45 MDDPTVNWSNERYEECKEKLVPFLKKVGFNPKKDIHFMPCSGLTGANLKEQSDFCPWYIG
230 240 250 260 270 280
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 LKSVQKLLDAVDTYIPVPARDLEKPFLLPVEAVYSVPGRGTVVTGTLERGILKKGDECEL
: . : :. .: :... :. ::. :. :::: : :: : . ::.. .
CCDS45 LPFIPYL----DN-LPNFNRSVDGPIRLPIVDKYK--DMGTVVLGKLESGSICKGQQLVM
290 300 310 320 330
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 LGHSKNIRTVVTGIEMFHKSLERAEAGDNLGALVRGLKREDLRRGLVMVKPGSI-KPHQK
. ...:.. : :: . . :.:: ..:...:.. :... :... . .
CCDS45 MPNKHNVE--VLGILSDDVETDTVAPGENLKIRLKGIEEEEILPGFILCDPNNLCHSGRT
340 350 360 370 380 390
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 VEAQVYILSKEEGGRHKPFVSHFMPVMFSLTWDMACRIILPPEKELAMPGEDLKFNLILR
.::. :.
CCDS45 FDAQIVIIEHKSIICPGYNAVLHIHTCIEEVEITALICLVDKKSGEKSKTRPRFVKQDQV
400 410 420 430 440 450
>>CCDS4980.1 EEF1A1 gene_id:1915|Hs108|chr6 (462 aa)
initn: 567 init1: 192 opt: 271 Z-score: 343.2 bits: 72.8 E(32554): 8.5e-13
Smith-Waterman score: 560; 31.0% identity (54.6% similar) in 445 aa overlap (56-439:3-438)
30 40 50 60 70 80
pF1KE5 LLQGLLRLLKAPALPLLCRGLAVEAKKTYVRDKPHVNVGTIGHVDHGKTTLTAAIT----
..: :.:. .::::: ::.: :. .
CCDS49 MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKCG
10 20 30
90 100 110 120 130
pF1KE5 -----------KILAEGGGAKFKKYEEIDNAPEERARGITINAAHVEYSTAARHYAHTDC
: :: : ..:: .:. :: :::::. . .. :. . . :
CCDS49 GIDKRTIEKFEKEAAEMGKGSFKYAWVLDKLKAERERGITIDISLWKFETSKYYVTIIDA
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180
pF1KE5 PGHADYVKNMITGTAPLDGCILVVAANDGPMP-------QTREHLLLARQIGVEHVVVYV
::: :..:::::::. : .:.:::. : . ::::: ::: .::....: :
CCDS49 PGHRDFIKNMITGTSQADCAVLIVAAGVGEFEAGISKNGQTREHALLAYTLGVKQLIVGV
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230
pF1KE5 NKADAVQ---DSEMVELVELEIRELLTEFGYKGEETPVIVGSALCALEGRDPEL------
:: :... ... : . :. . ..::. . . . :. . . .:
CCDS49 NKMDSTEPPYSQKRYEEIVKEVSTYIKKIGYNPDTVAFVPISGWNGDNMLEPSANMPWFK
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280
pF1KE5 GLKSVQK--------LLDAVDTYIPVPARDLEKPFLLPVEAVYSVPGRGTVVTGTLERGI
: : ..: ::.:.: .: :.: .::. ::.. ::.. : ::: .: .: :.
CCDS49 GWKVTRKDGNASGTTLLEALDCILP-PTRPTDKPLRLPLQDVYKIGGIGTVPVGRVETGV
220 230 240 250 260 270
290 300 310 320 330 340
pF1KE5 LKKGDECELLGHSKNIRTVVTGIEMFHKSLERAEAGDNLGALVRGLKREDLRRGLVMVKP
:: : . :. : : ..:: :..: .: :::.: :.... .:.::: :
CCDS49 LKPGMVVTFA--PVNVTTEVKSVEMHHEALSEALPGDNVGFNVKNVSVKDVRRGNVAGDS
280 290 300 310 320
350 360 370 380 390 400
pF1KE5 GSIKPHQKV--EAQVYILSKEEGGRHKPFVSH-FMPVMFSLTWDMACRIILPPEKELAMP
. : . . ::: ::. : .: . ::. : .::.. ::
CCDS49 KNDPPMEAAGFTAQVIILN------HPGQISAGYAPVLDCHTAHIACKFAELKEKIDRRS
330 340 350 360 370 380
410 420 430 440
pF1KE5 GEDL----KF---------NLILRQPMILEKGQ------RFTLRDGNRTIGTGLVTNTLA
:. : :: ... .:: .:. . ::..:: .:...:..
CCDS49 GKKLEDGPKFLKSGDAAIVDMVPGKPMCVESFSDYPPLGRFAVRDMRQTVAVGVIKAVDK
390 400 410 420 430 440
450
pF1KE5 MTEEEKNIKWG
CCDS49 KAAGAGKVTKSAQKAQKAK
450 460
>>CCDS45413.1 GSPT1 gene_id:2935|Hs108|chr16 (636 aa)
initn: 407 init1: 148 opt: 272 Z-score: 342.2 bits: 73.1 E(32554): 9.6e-13
Smith-Waterman score: 401; 28.1% identity (55.0% similar) in 338 aa overlap (58-362:209-537)
30 40 50 60 70 80
pF1KE5 QGLLRLLKAPALPLLCRGLAVEAKKTYVRDKPHVNVGTIGHVDHGKTTLTAAITKILAEG
: :::: ::::: ::.:. . : . .
CCDS45 PPEESAHEMMEEEEEIPKPKSVVAPPGAPKKEHVNVVFIGHVDAGKSTIGGQIMYLTGMV
180 190 200 210 220 230
90 100 110 120 130
pF1KE5 GGAKFKKYEE---------------IDNAPEERARGITINAAHVEYSTAARHYAHTDCPG
..:::. .:. ::: .: :...... . : .:.. : ::
CCDS45 DKRTLEKYEREAKEKNRETWYLSWALDTNQEERDKGKTVEVGRAYFETEKKHFTILDAPG
240 250 260 270 280 290
140 150 160 170 180
pF1KE5 HADYVKNMITGTAPLDGCILVVAANDGPMP-------QTREHLLLARQIGVEHVVVYVNK
: ..: ::: :.. : .::..: : . ::::: .::. ::.:..: .::
CCDS45 HKSFVPNMIGGASQADLAVLVISARKGEFETGFEKGGQTREHAMLAKTAGVKHLIVLINK
300 310 320 330 340 350
190 200 210 220 230
pF1KE5 AD---AVQDSEMVELVELEIRELLTEFGYKGEET----PV--IVGSALCALEGRDP-ELG
: . ..: : . .. .: . :.. .. : ..:. : : .:
CCDS45 MDDPTVNWSNERYEECKEKLVPFLKKVGFNPKKDIHFMPCSGLTGANLKEQSDFCPWYIG
360 370 380 390 400 410
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 LKSVQKLLDAVDTYIPVPARDLEKPFLLPVEAVYSVPGRGTVVTGTLERGILKKGDECEL
: . : :. .: :... :. ::. :. :::: : :: : . ::.. .
CCDS45 LPFIPYL----DN-LPNFNRSVDGPIRLPIVDKYK--DMGTVVLGKLESGSICKGQQLVM
420 430 440 450 460 470
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 LGHSKNIRTVVTGIEMFHKSLERAEAGDNLGALVRGLKREDLRRGLVMVKPGSI-KPHQK
. ...:.. : :: . . :.:: ..:...:.. :... :... . .
CCDS45 MPNKHNVE--VLGILSDDVETDTVAPGENLKIRLKGIEEEEILPGFILCDPNNLCHSGRT
480 490 500 510 520
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 VEAQVYILSKEEGGRHKPFVSHFMPVMFSLTWDMACRIILPPEKELAMPGEDLKFNLILR
.::. :.
CCDS45 FDAQIVIIEHKSIICPGYNAVLHIHTCIEEVEITALICLVDKKSGEKSKTRPRFVKQDQV
530 540 550 560 570 580
>>CCDS45412.1 GSPT1 gene_id:2935|Hs108|chr16 (637 aa)
initn: 407 init1: 148 opt: 272 Z-score: 342.2 bits: 73.1 E(32554): 9.6e-13
Smith-Waterman score: 401; 28.1% identity (55.0% similar) in 338 aa overlap (58-362:210-538)
30 40 50 60 70 80
pF1KE5 QGLLRLLKAPALPLLCRGLAVEAKKTYVRDKPHVNVGTIGHVDHGKTTLTAAITKILAEG
: :::: ::::: ::.:. . : . .
CCDS45 PPEESAHEMMEEEEEIPKPKSVVAPPGAPKKEHVNVVFIGHVDAGKSTIGGQIMYLTGMV
180 190 200 210 220 230
90 100 110 120 130
pF1KE5 GGAKFKKYEE---------------IDNAPEERARGITINAAHVEYSTAARHYAHTDCPG
..:::. .:. ::: .: :...... . : .:.. : ::
CCDS45 DKRTLEKYEREAKEKNRETWYLSWALDTNQEERDKGKTVEVGRAYFETEKKHFTILDAPG
240 250 260 270 280 290
140 150 160 170 180
pF1KE5 HADYVKNMITGTAPLDGCILVVAANDGPMP-------QTREHLLLARQIGVEHVVVYVNK
: ..: ::: :.. : .::..: : . ::::: .::. ::.:..: .::
CCDS45 HKSFVPNMIGGASQADLAVLVISARKGEFETGFEKGGQTREHAMLAKTAGVKHLIVLINK
300 310 320 330 340 350
190 200 210 220 230
pF1KE5 AD---AVQDSEMVELVELEIRELLTEFGYKGEET----PV--IVGSALCALEGRDP-ELG
: . ..: : . .. .: . :.. .. : ..:. : : .:
CCDS45 MDDPTVNWSNERYEECKEKLVPFLKKVGFNPKKDIHFMPCSGLTGANLKEQSDFCPWYIG
360 370 380 390 400 410
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 LKSVQKLLDAVDTYIPVPARDLEKPFLLPVEAVYSVPGRGTVVTGTLERGILKKGDECEL
: . : :. .: :... :. ::. :. :::: : :: : . ::.. .
CCDS45 LPFIPYL----DN-LPNFNRSVDGPIRLPIVDKYK--DMGTVVLGKLESGSICKGQQLVM
420 430 440 450 460 470
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 LGHSKNIRTVVTGIEMFHKSLERAEAGDNLGALVRGLKREDLRRGLVMVKPGSI-KPHQK
. ...:.. : :: . . :.:: ..:...:.. :... :... . .
CCDS45 MPNKHNVE--VLGILSDDVETDTVAPGENLKIRLKGIEEEEILPGFILCDPNNLCHSGRT
480 490 500 510 520 530
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 VEAQVYILSKEEGGRHKPFVSHFMPVMFSLTWDMACRIILPPEKELAMPGEDLKFNLILR
.::. :.
CCDS45 FDAQIVIIEHKSIICPGYNAVLHIHTCIEEVEITALICLVDKKSGEKSKTRPRFVKQDQV
540 550 560 570 580 590
>>CCDS13522.1 EEF1A2 gene_id:1917|Hs108|chr20 (463 aa)
initn: 588 init1: 191 opt: 267 Z-score: 338.1 bits: 71.8 E(32554): 1.6e-12
Smith-Waterman score: 574; 32.5% identity (55.9% similar) in 449 aa overlap (56-441:3-440)
30 40 50 60 70 80
pF1KE5 LLQGLLRLLKAPALPLLCRGLAVEAKKTYVRDKPHVNVGTIGHVDHGKTTLTAAIT----
..: :.:. .::::: ::.: :. .
CCDS13 MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKCG
10 20 30
90 100 110 120 130
pF1KE5 -----------KILAEGGGAKFKKYEEIDNAPEERARGITINAAHVEYSTAARHYAHTDC
: :: : ..:: .:. :: :::::. . .. :. . . :
CCDS13 GIDKRTIEKFEKEAAEMGKGSFKYAWVLDKLKAERERGITIDISLWKFETTKYYITIIDA
40 50 60 70 80 90
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CCDS51 ELQTQRPIALELYKDFKELGRFMLRYGGSTIAAGVVTEIKE
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