Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5521
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5521, 437 aa
1>>>pF1KE5521 437 - 437 aa - 437 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7790+/-0.000984; mu= 14.2582+/- 0.059
mean_var=62.6152+/-12.379, 0's: 0 Z-trim(103.6): 21 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.162082
statistics sampled from 7467 (7487) to 7467 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.607), E-opt: 0.2 (0.23), width: 16
Scan time: 2.400
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS6200.1 CPA6 gene_id:57094|Hs108|chr8 ( 437) 3022 715.6 2.4e-206
CCDS33874.1 CPB1 gene_id:1360|Hs108|chr3 ( 417) 1223 294.9 9.8e-80
CCDS3138.1 CPA3 gene_id:1359|Hs108|chr3 ( 417) 1185 286.0 4.7e-77
CCDS9401.1 CPB2 gene_id:1361|Hs108|chr13 ( 423) 1082 262.0 8.4e-70
CCDS5817.2 CPA2 gene_id:1358|Hs108|chr7 ( 419) 1077 260.8 1.9e-69
CCDS5818.1 CPA4 gene_id:51200|Hs108|chr7 ( 421) 1052 254.9 1.1e-67
CCDS2372.1 CPO gene_id:130749|Hs108|chr2 ( 374) 1018 247.0 2.4e-65
CCDS5820.1 CPA1 gene_id:1357|Hs108|chr7 ( 419) 994 241.4 1.3e-63
CCDS5819.1 CPA5 gene_id:93979|Hs108|chr7 ( 436) 994 241.4 1.4e-63
CCDS55163.1 CPA4 gene_id:51200|Hs108|chr7 ( 388) 868 211.9 9e-55
CCDS47713.1 CPA5 gene_id:93979|Hs108|chr7 ( 403) 694 171.2 1.6e-42
CCDS73568.1 CPB2 gene_id:1361|Hs108|chr13 ( 386) 618 153.4 3.5e-37
>>CCDS6200.1 CPA6 gene_id:57094|Hs108|chr8 (437 aa)
initn: 3022 init1: 3022 opt: 3022 Z-score: 3818.1 bits: 715.6 E(32554): 2.4e-206
Smith-Waterman score: 3022; 99.8% identity (99.8% similar) in 437 aa overlap (1-437:1-437)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MKCLGKRRGQAAAFLPLCWLFLKILQPGHSHLYNNRYAGDKVIRFIPKTEEEAYALKKIS
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CCDS62 MKCLGKRRGQAAAFLPLCWLFLKILQPGHSHLYNNRYAGDKVIRFIPKTEEEAYALKKIS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 YQLKVDLWQPSSISYVSEGTVTDVHIPQNGSRALLAFLQEANIQYKVLIEDLQKTLEKGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 YQLKVDLWQPSSISYVSEGTVTDVHIPQNGSRALLAFLQEANIQYKVLIEDLQKTLEKGS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 SLHTQRNRRSLSGYNYEVYHSLEEIQNWMHHLNKTHSGLIHMFSIGRSYEGRCLFILKLG
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::
CCDS62 SLHTQRNRRSLSGYNYEVYHSLEEIQNWMHHLNKTHSGLIHMFSIGRSYEGRSLFILKLG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 RRSRLKRAVWIDCGIHAREWIGPAFCQWFVKEALLTYKSDPAMRKMLNHLYFYIMPVFNV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 RRSRLKRAVWIDCGIHAREWIGPAFCQWFVKEALLTYKSDPAMRKMLNHLYFYIMPVFNV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 DGYHFSWTNDRFWRKTRSRNSRFRCRGVDANRNWKVKWCDEGASMHPCDDTYCGPFPESE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 DGYHFSWTNDRFWRKTRSRNSRFRCRGVDANRNWKVKWCDEGASMHPCDDTYCGPFPESE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 PEVKAVANFLRKHRKHIRAYLSFHAYAQMLLYPYSYKYATIPNFRCVESAAYKAVNALQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 PEVKAVANFLRKHRKHIRAYLSFHAYAQMLLYPYSYKYATIPNFRCVESAAYKAVNALQS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 VYGVRYRYGPASTTLYVSSGSSMDWAYKNGIPYAFAFELRDTGYFGFLLPEMLIKPTCTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 VYGVRYRYGPASTTLYVSSGSSMDWAYKNGIPYAFAFELRDTGYFGFLLPEMLIKPTCTE
370 380 390 400 410 420
430
pF1KE5 TMLAVKNITMHLLKKCP
:::::::::::::::::
CCDS62 TMLAVKNITMHLLKKCP
430
>>CCDS33874.1 CPB1 gene_id:1360|Hs108|chr3 (417 aa)
initn: 1127 init1: 1078 opt: 1223 Z-score: 1544.9 bits: 294.9 E(32554): 9.8e-80
Smith-Waterman score: 1223; 41.1% identity (73.7% similar) in 418 aa overlap (17-434:2-414)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MKCLGKRRGQAAAFLPLCWLFLKILQPGHSHLYNNRYAGDKVIRFIPKTEEEAYALKKIS
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CCDS33 MLALLVLVTVALASAHHGGEHFEGEKVFRVNVEDENHINIIRELA
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 YQLKVDLWQPSSISYVSEGTVTDVHIPQNGSRALLAFLQEANIQYKVLIEDLQKTLEKGS
..:.:.:.:.. .. ...: .. . . .. :.. ..:::::: .:....:
CCDS33 STTQIDFWKPDSVTQIKPHSTVDFRVKAEDTVTVENVLKQNELQYKVLISNLRNVVE---
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 SLHTQRNRRSLSGYNYEVYHSLEEIQNWMHHLNKTHSGLIHMFSIGRSYEGRCLFILKLG
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CCDS33 AQFDSRVRA--TGHSYEKYNKWETIEAWTQQVATENPALISRSVIGTTFEGRAIYLLKVG
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 RRSRLKRAVWIDCGIHAREWIGPAFCQWFVKEALLTYKSDPAMRKMLNHLYFYIMPVFNV
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CCDS33 KAGQNKPAIFMDCGFHAREWISPAFCQWFVREAVRTYGREIQVTELLDKLDFYVLPVLNI
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 DGYHFSWTNDRFWRKTRSRNSRFRCRGVDANRNWKVKWCDEGASMHPCDDTYCGPFPESE
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CCDS33 DGYIYTWTKSRFWRKTRSTHTGSSCIGTDPNRNFDAGWCEIGASRNPCDETYCGPAAESE
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 PEVKAVANFLRKHRKHIRAYLSFHAYAQMLLYPYSYKYATIPNFRCVESAAYKAVNALQS
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CCDS33 KETKALADFIRNKLSSIKAYLTIHSYSQMMIYPYSYAYKLGENNAELNALAKATVKELAS
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 VYGVRYRYGPASTTLYVSSGSSMDWAYKNGIPYAFAFELRDTGYFGFLLPEMLIKPTCTE
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CCDS33 LHGTKYTYGPGATTIYPAAGGSDDWAYDQGIRYSFTFELRDTGRYGFLLPESQIRATCEE
350 360 370 380 390 400
430
pF1KE5 TMLAVKNITMHLLKKCP
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CCDS33 TFLAIKYVASYVLEHLY
410
>>CCDS3138.1 CPA3 gene_id:1359|Hs108|chr3 (417 aa)
initn: 1115 init1: 1004 opt: 1185 Z-score: 1496.9 bits: 286.0 E(32554): 4.7e-77
Smith-Waterman score: 1185; 42.5% identity (73.8% similar) in 400 aa overlap (36-434:20-414)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 KRRGQAAAFLPLCWLFLKILQPGHSHLYNNRYAGDKVIRFIPKTEEEAYALKKISYQLKV
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CCDS31 MRLILPVGLIATTLAIAPVRFDREKVFRVKPQDEKQADIIKDLAKTNEL
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 DLWQPSSISYVSEGTVTDVHIPQNGSRALLAFLQEANIQYKVLIEDLQKTLEKGSSLHTQ
:.: :.. .:. . ..: .. .. :.:. . :.. ...:..::.:::. .:: ..
CCDS31 DFWYPGATHHVAANMMVDFRVSEKESQAIQSALDQNKMHYEILIHDLQEEIEKQFDV---
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 RNRRSLSG-YNYEVYHSLEEIQNWMHHLNKTHSGLIHMFSIGRSYEGRCLFILKLGRRSR
.... : ..: :.. :.: : ... . .. ..:: . : :..::.:....
CCDS31 --KEDIPGRHSYAKYNNWEKIVAWTEKMMDKYPEMVSRIKIGSTVEDNPLYVLKIGEKNE
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 LKRAVWIDCGIHAREWIGPAFCQWFVKEALLTYKSDPAMRKMLNHLYFYIMPVFNVDGYH
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CCDS31 RRKAIFTDCGIHAREWVSPAFCQWFVYQATKTYGRNKIMTKLLDRMNFYILPVFNVDGYI
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 FSWTNDRFWRKTRSRNSRFRCRGVDANRNWKVKWCDEGASMHPCDDTYCGPFPESEPEVK
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CCDS31 WSWTKNRMWRKNRSKNQNSKCIGTDLNRNFNASWNSIPNTNDPCADNYRGSAPESEKETK
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 AVANFLRKHRKHIRAYLSFHAYAQMLLYPYSYKYATIPNFRCVESAAYKAVNALQSVYGV
::.::.:.: ..:..:..::.:.::::.::.: :: . . ..: ....:.. : .
CCDS31 AVTNFIRSHLNEIKVYITFHSYSQMLLFPYGYTSKLPPNHEDLAKVAKIGTDVLSTRYET
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 RYRYGPASTTLYVSSGSSMDWAYKNGIPYAFAFELRDTGYFGFLLPEMLIKPTCTETMLA
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CCDS31 RYIYGPIESTIYPISGSSLDWAYDLGIKHTFAFELRDKGKFGFLLPESRIKPTCRETMLA
350 360 370 380 390 400
430
pF1KE5 VKNITMHLLKKCP
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CCDS31 VKFIAKYILKHTS
410
>>CCDS9401.1 CPB2 gene_id:1361|Hs108|chr13 (423 aa)
initn: 1034 init1: 360 opt: 1082 Z-score: 1366.6 bits: 262.0 E(32554): 8.4e-70
Smith-Waterman score: 1082; 40.0% identity (69.3% similar) in 427 aa overlap (15-434:1-421)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MKCLGKRRGQAAAFLPLCWL--FLKILQPGHSHLYNNRYAGDKVIRFIPKTEEEAYALKK
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CCDS94 MKLCSLAVLVPIVLFCEQHVFA--FQSGQVLAALPRTSRQVQVLQN
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 ISYQLKVDLWQPSSISYVSEGTVTDVHIPQNGSRA--LLAFLQEANIQYKVLIEDLQKTL
.. .. :::: . . . . .::. :.: . . : :. ..: .::. :.. .
CCDS94 LTTTYEIVLWQPVTADLIVKKK--QVHFFVNASDVDNVKAHLNVSGIPCSVLLADVEDLI
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 EKGSSLHTQRNRRSLSGYNYEVYHSLEEIQNWMHHLNKTHSGLIHMFSIGRSYEGRCLFI
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CCDS94 QQQISNDTVSPRASAS-Y-YEQYHSLNEIYSWIEFITERHPDMLTKIHIGSSFEKYPLYV
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 LKL-GRRSRLKRAVWIDCGIHAREWIGPAFCQWFVKEALLTYKSDPAMRKMLNHLYFYIM
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CCDS94 LKVSGKEQAAKNAIWIDCGIHAREWISPAFCLWFIGHITQFYGIIGQYTNLLRLVDFYVM
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 PVFNVDGYHFSWTNDRFWRKTRSRNSRFRCRGVDANRNWKVK-WCDEGASMHPCDDTYCG
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CCDS94 PVVNVDGYDYSWKKNRMWRKNRSFYANNHCIGTDLNRNFASKHWCEEGASSSSCSETYCG
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 PFPESEPEVKAVANFLRKHRKHIRAYLSFHAYAQMLLYPYSYKYATIPNFRCVESAAYKA
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CCDS94 LYPESEPEVKAVASFLRRNINQIKAYISMHSYSQHIVFPYSYTRSKSKDHEELSLVASEA
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 VNALQSVY-GVRYRYGPASTTLYVSSGSSMDWAYKNGIPYAFAFELRDTGYFGFLLPEML
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CCDS94 VRAIEKISKNTRYTHGHGSETLYLAPGGGDDWIYDLGIKYSFTIELRDTGTYGFLLPERY
350 360 370 380 390 400
420 430
pF1KE5 IKPTCTETMLAVKNITMHLLKKCP
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CCDS94 IKPTCREAFAAVSKIAWHVIRNV
410 420
>>CCDS5817.2 CPA2 gene_id:1358|Hs108|chr7 (419 aa)
initn: 894 init1: 437 opt: 1077 Z-score: 1360.4 bits: 260.8 E(32554): 1.9e-69
Smith-Waterman score: 1077; 40.1% identity (70.7% similar) in 406 aa overlap (31-432:15-414)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MKCLGKRRGQAAAFLPLCWLFLKILQPGHSHLYN-NRYAGDKVIRFIPKTEEEAYALKKI
:.: . ..::.:....:..::. : ..
CCDS58 MAMRLILFFGALFGHIYCLETFVGDQVLEIVPSNEEQIKNLLQL
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 SYQ--LKVDLWQPSSISYVSEGTVTDVHIPQNGSRALLAFLQEANIQYKVLIEDLQKTLE
: :..:.:. : .. : .. :..: . .:. .::. .: :...:::.: :.
CCDS58 EAQEHLQLDFWK----SPTTPGETAHVRVPFVNVQAVKVFLESQGIAYSIMIEDVQVLLD
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 KGSSLHTQRNRRSLSG-YNYEVYHSLEEIQNWMHHLNKTHSGLIHMFSIGRSYEGRCLFI
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CCDS58 KENEEMLFNRRRERSGNFNFGAYHTLEEISQEMDNLVAEHPGLVSKVNIGSSFENRPMNV
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 LKLGRRSRLKRAVWIDCGIHAREWIGPAFCQWFVKEALLTYKSDPAMRKMLNHLYFYIMP
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CCDS58 LKFSTGGD-KPAIWLDAGIHAREWVTQATALWTANKIVSDYGKDPSITSILDALDIFLLP
170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 VFNVDGYHFSWTNDRFWRKTRSRNSRFRCRGVDANRNWKVKWCDEGASMHPCDDTYCGPF
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CCDS58 VTNPDGYVFSQTKNRMWRKTRSKVSGSLCVGVDPNRNWDAGFGGPGASSNPCSDSYHGPS
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 PESEPEVKAVANFLRKHRKHIRAYLSFHAYAQMLLYPYSYKYATIPNFRCVESAAYKAVN
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CCDS58 ANSEVEVKSIVDFIKSHGK-VKAFITLHSYSQLLMFPYGYKCTKLDDFDELSEVAQKAAQ
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 ALQSVYGVRYRYGPASTTLYVSSGSSMDWAYKNGIPYAFAFELRDTGYFGFLLPEMLIKP
.:.:..:..:. :: ...: .::.:.::.: :: :.::::::::: .::::: : :
CCDS58 SLRSLHGTKYKVGPICSVIYQASGGSIDWSYDYGIKYSFAFELRDTGRYGFLLPARQILP
340 350 360 370 380 390
420 430
pF1KE5 TCTETMLAVKNITMHLLKKCP
: :: :..: : :.
CCDS58 TAEETWLGLKAIMEHVRDHPY
400 410
>>CCDS5818.1 CPA4 gene_id:51200|Hs108|chr7 (421 aa)
initn: 959 init1: 433 opt: 1052 Z-score: 1328.8 bits: 254.9 E(32554): 1.1e-67
Smith-Waterman score: 1052; 39.3% identity (71.2% similar) in 420 aa overlap (19-432:3-416)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MKCLGKRRGQAAAFLPLCWLFLKILQPGHSHLYNNRYAGDKVIRFIPKTEEEAYALKKI-
:... : : .... ::.:.:. .. .: :...
CCDS58 MRWILFIGALIGSSICGQEKFFGDQVLRINVRNGDEISKLSQLV
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 -SYQLKVDLWQ-PSSISYVSEGTVTDVHIPQNGSRALLAFLQEANIQYKVLIEDLQKTL-
: .::...:. :::.. .:: .:. . .:. .::. ...: : ::::: :
CCDS58 NSNNLKLNFWKSPSSFNRP-----VDVLVPSVSLQAFKSFLRSQGLEYAVTIEDLQALLD
50 60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 -EKGSSLHTQRNRRSLSGYNYEVYHSLEEIQNWMHHLNKTHSGLIHMFSIGRSYEGRCLF
: :.. ..:: ...:: .::::: : . : .. : . .::.:.:.: ..
CCDS58 NEDDEMQHNEGQERSSNNFNYGAYHSLEAIYHEMDNIAADFPDLARRVKIGHSFENRPMY
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 ILKLGRRSRLKR-AVWIDCGIHAREWIGPAFCQWFVKEALLTYKSDPAMRKMLNHLYFYI
.::.. . ..: :::.. :::.::::. : : ... . :. :::. ..:... ...
CCDS58 VLKFSTGKGVRRPAVWLNAGIHSREWISQATAIWTARKIVSDYQRDPAITSILEKMDIFL
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 MPVFNVDGYHFSWTNDRFWRKTRSRNSRFRCRGVDANRNWKVKWCDEGASMHPCDDTYCG
.:: : ::: .. :..:.:::::::: : :.: ::::.... .::: .::...: :
CCDS58 LPVANPDGYVYTQTQNRLWRKTRSRNPGSSCIGADPNRNWNASFAGKGASDNPCSEVYHG
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 PFPESEPEVKAVANFLRKHRKHIRAYLSFHAYAQMLLYPYSYKYATIPNFRCVESAAYKA
: .:: :::.:..:..:: ........:.:.:.:.:::.:. :. . ....: :
CCDS58 PHANSEVEVKSVVDFIQKH-GNFKGFIDLHSYSQLLMYPYGYSVKKAPDAEELDKVARLA
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 VNALQSVYGVRYRYGPASTTLYVSSGSSMDWAYKNGIPYAFAFELRDTGYFGFLLPEMLI
..:: :: :..:. ::. ::.: .::::.:::: ::: .::.::::::: .::::: :
CCDS58 AKALASVSGTEYQVGPTCTTVYPASGSSIDWAYDNGIKFAFTFELRDTGTYGFLLPANQI
340 350 360 370 380 390
420 430
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: :: ..
CCDS23 MEAVLSVLDDVYAKHWHSDSAGRVTSATMLLGLLVSCMSLL
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410
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