Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5513
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5513, 417 aa
1>>>pF1KE5513 417 - 417 aa - 417 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1186+/-0.00106; mu= 17.8141+/- 0.064
mean_var=59.8000+/-11.979, 0's: 0 Z-trim(102.0): 37 B-trim: 0 in 0/49
Lambda= 0.165853
statistics sampled from 6754 (6778) to 6754 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.571), E-opt: 0.2 (0.208), width: 16
Scan time: 1.870
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS33874.1 CPB1 gene_id:1360|Hs108|chr3 ( 417) 2775 672.8 1.6e-193
CCDS3138.1 CPA3 gene_id:1359|Hs108|chr3 ( 417) 1485 364.2 1.3e-100
CCDS6200.1 CPA6 gene_id:57094|Hs108|chr8 ( 437) 1225 302.0 7.4e-82
CCDS9401.1 CPB2 gene_id:1361|Hs108|chr13 ( 423) 1164 287.4 1.8e-77
CCDS5820.1 CPA1 gene_id:1357|Hs108|chr7 ( 419) 1151 284.3 1.5e-76
CCDS5818.1 CPA4 gene_id:51200|Hs108|chr7 ( 421) 1111 274.7 1.2e-73
CCDS5817.2 CPA2 gene_id:1358|Hs108|chr7 ( 419) 1104 273.0 3.7e-73
CCDS2372.1 CPO gene_id:130749|Hs108|chr2 ( 374) 1016 251.9 7.3e-67
CCDS55163.1 CPA4 gene_id:51200|Hs108|chr7 ( 388) 995 246.9 2.5e-65
CCDS5819.1 CPA5 gene_id:93979|Hs108|chr7 ( 436) 987 245.0 1e-64
CCDS47713.1 CPA5 gene_id:93979|Hs108|chr7 ( 403) 679 171.3 1.5e-42
CCDS73568.1 CPB2 gene_id:1361|Hs108|chr13 ( 386) 665 168.0 1.4e-41
>>CCDS33874.1 CPB1 gene_id:1360|Hs108|chr3 (417 aa)
initn: 2775 init1: 2775 opt: 2775 Z-score: 3587.8 bits: 672.8 E(32554): 1.6e-193
Smith-Waterman score: 2775; 100.0% identity (100.0% similar) in 417 aa overlap (1-417:1-417)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MLALLVLVTVALASAHHGGEHFEGEKVFRVNVEDENHINIIRELASTTQIDFWKPDSVTQ
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CCDS33 MLALLVLVTVALASAHHGGEHFEGEKVFRVNVEDENHINIIRELASTTQIDFWKPDSVTQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 IKPHSTVDFRVKAEDTVTVENVLKQNELQYKVLISNLRNVVEAQFDSRVRATGHSYEKYN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 IKPHSTVDFRVKAEDTVTVENVLKQNELQYKVLISNLRNVVEAQFDSRVRATGHSYEKYN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 KWETIEAWTQQVATENPALISRSVIGTTFEGRAIYLLKVGKAGQNKPAIFMDCGFHAREW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 KWETIEAWTQQVATENPALISRSVIGTTFEGRAIYLLKVGKAGQNKPAIFMDCGFHAREW
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 ISPAFCQWFVREAVRTYGREIQVTELLDKLDFYVLPVLNIDGYIYTWTKSRFWRKTRSTH
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CCDS33 ISPAFCQWFVREAVRTYGREIQVTELLDKLDFYVLPVLNIDGYIYTWTKSRFWRKTRSTH
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 TGSSCIGTDPNRNFDAGWCEIGASRNPCDETYCGPAAESEKETKALADFIRNKLSSIKAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 TGSSCIGTDPNRNFDAGWCEIGASRNPCDETYCGPAAESEKETKALADFIRNKLSSIKAY
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 LTIHSYSQMMIYPYSYAYKLGENNAELNALAKATVKELASLHGTKYTYGPGATTIYPAAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LTIHSYSQMMIYPYSYAYKLGENNAELNALAKATVKELASLHGTKYTYGPGATTIYPAAG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410
pF1KE5 GSDDWAYDQGIRYSFTFELRDTGRYGFLLPESQIRATCEETFLAIKYVASYVLEHLY
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CCDS33 GSDDWAYDQGIRYSFTFELRDTGRYGFLLPESQIRATCEETFLAIKYVASYVLEHLY
370 380 390 400 410
>>CCDS3138.1 CPA3 gene_id:1359|Hs108|chr3 (417 aa)
initn: 1479 init1: 1237 opt: 1485 Z-score: 1919.6 bits: 364.2 E(32554): 1.3e-100
Smith-Waterman score: 1485; 49.5% identity (80.1% similar) in 412 aa overlap (5-415:9-415)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MLALLVLVTVALASAHHGGEHFEGEKVFRVNVEDENHINIIRELASTTQIDFWKPD
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CCDS31 MRLILPVGLIATTLAIAPVR-----FDREKVFRVKPQDEKQADIIKDLAKTNELDFWYPG
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 SVTQIKPHSTVDFRVKAEDTVTVENVLKQNELQYKVLISNLRNVVEAQFDSRVRATG-HS
.. .. . :::::. ... .....: ::...:..:: .:.. .: ::: . : ::
CCDS31 ATHHVAANMMVDFRVSEKESQAIQSALDQNKMHYEILIHDLQEEIEKQFDVKEDIPGRHS
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 YEKYNKWETIEAWTQQVATENPALISRSVIGTTFEGRAIYLLKVGKAGQNKPAIFMDCGF
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CCDS31 YAKYNNWEKIVAWTEKMMDKYPEMVSRIKIGSTVEDNPLYVLKIGEKNERRKAIFTDCGI
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 HAREWISPAFCQWFVREAVRTYGREIQVTELLDKLDFYVLPVLNIDGYIYTWTKSRFWRK
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CCDS31 HAREWVSPAFCQWFVYQATKTYGRNKIMTKLLDRMNFYILPVFNVDGYIWSWTKNRMWRK
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 TRSTHTGSSCIGTDPNRNFDAGWCEIGASRNPCDETYCGPAAESEKETKALADFIRNKLS
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CCDS31 NRSKNQNSKCIGTDLNRNFNASWNSIPNTNDPCADNYRGSAPESEKETKAVTNFIRSHLN
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 SIKAYLTIHSYSQMMIYPYSYAYKLGENNAELNALAKATVKELASLHGTKYTYGPGATTI
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CCDS31 EIKVYITFHSYSQMLLFPYGYTSKLPPNHEDLAKVAKIGTDVLSTRYETRYIYGPIESTI
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 YPAAGGSDDWAYDQGIRYSFTFELRDTGRYGFLLPESQIRATCEETFLAIKYVASYVLEH
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CCDS31 YPISGSSLDWAYDLGIKHTFAFELRDKGKFGFLLPESRIKPTCRETMLAVKFIAKYILKH
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 LY
CCDS31 TS
>>CCDS6200.1 CPA6 gene_id:57094|Hs108|chr8 (437 aa)
initn: 1129 init1: 1080 opt: 1225 Z-score: 1583.1 bits: 302.0 E(32554): 7.4e-82
Smith-Waterman score: 1225; 40.9% identity (73.7% similar) in 418 aa overlap (2-414:17-434)
10 20 30 40
pF1KE5 MLALLVLVTVALASAHHGGEHFEGEKVFRVNVEDENHINIIRELA
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CCDS62 MKCLGKRRGQAAAFLPLCWLFLKILQPGHSHLYNNRYAGDKVIRFIPKTEEEAYALKKIS
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE5 STTQIDFWKPDSVTQIKPHSTVDFRVKAEDTVTVENVLKQNELQYKVLISNLRNVVEAQF
..:.:.:.:.. .. ...: .. . . .. :.. ..:::::: .:....:
CCDS62 YQLKVDLWQPSSISYVSEGTVTDVHIPQNGSRALLAFLQEANIQYKVLIEDLQKTLEKGS
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE5 D-----SRVRATGHSYEKYNKWETIEAWTQQVATENPALISRSVIGTTFEGRAIYLLKVG
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CCDS62 SLHTQRNRRSLSGYNYEVYHSLEEIQNWMHHLNKTHSGLIHMFSIGRSYEGRSLFILKLG
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE5 KAGQNKPAIFMDCGFHAREWISPAFCQWFVREAVRTYGREIQVTELLDKLDFYVLPVLNI
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CCDS62 RRSRLKRAVWIDCGIHAREWIGPAFCQWFVKEALLTYKSDPAMRKMLNHLYFYIMPVFNV
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE5 DGYIYTWTKSRFWRKTRSTHTGSSCIGTDPNRNFDAGWCEIGASRNPCDETYCGPAAESE
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CCDS62 DGYHFSWTNDRFWRKTRSRNSRFRCRGVDANRNWKVKWCDEGASMHPCDDTYCGPFPESE
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KE5 KETKALADFIRNKLSSIKAYLTIHSYSQMMIYPYSYAYKLGENNAELNALAKATVKELAS
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CCDS62 PEVKAVANFLRKHRKHIRAYLSFHAYAQMLLYPYSYKYATIPNFRCVESAAYKAVNALQS
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KE5 LHGTKYTYGPGATTIYPAAGGSDDWAYDQGIRYSFTFELRDTGRYGFLLPESQIRATCEE
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CCDS62 VYGVRYRYGPASTTLYVSSGSSMDWAYKNGIPYAFAFELRDTGYFGFLLPEMLIKPTCTE
370 380 390 400 410 420
410
pF1KE5 TFLAIKYVASYVLEHLY
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CCDS62 TMLAVKNITMHLLKKCP
430
>>CCDS9401.1 CPB2 gene_id:1361|Hs108|chr13 (423 aa)
initn: 1054 init1: 406 opt: 1164 Z-score: 1504.4 bits: 287.4 E(32554): 1.8e-77
Smith-Waterman score: 1164; 41.5% identity (74.4% similar) in 422 aa overlap (1-416:3-423)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MLALLVLVTVALASAHHGGEHFEGEKVFRVNVEDENHINIIRELASTTQIDFWKPDSV
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CCDS94 MKLCSLAVLVPIVLFCEQHV-FAFQSGQVLAALPRTSRQVQVLQNLTTTYEIVLWQPVTA
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 TQIKPHSTVDFRVKAEDTVTVENVLKQNELQYKVLISNLRNVVEAQFDSRV---RATGHS
: .. : : :.: :. .:. :. . . .::......... :... . ::..
CCDS94 DLIVKKKQVHFFVNASDVDNVKAHLNVSGIPCSVLLADVEDLIQQQISNDTVSPRASASY
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 YEKYNKWETIEAWTQQVATENPALISRSVIGTTFEGRAIYLLKV-GKAGQNKPAIFMDCG
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CCDS94 YEQYHSLNEIYSWIEFITERHPDMLTKIHIGSSFEKYPLYVLKVSGKEQAAKNAIWIDCG
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 FHAREWISPAFCQWFVREAVRTYGREIQVTELLDKLDFYVLPVLNIDGYIYTWTKSRFWR
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CCDS94 IHAREWISPAFCLWFIGHITQFYGIIGQYTNLLRLVDFYVMPVVNVDGYDYSWKKNRMWR
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 KTRSTHTGSSCIGTDPNRNFDAG-WCEIGASRNPCDETYCGPAAESEKETKALADFIRNK
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CCDS94 KNRSFYANNHCIGTDLNRNFASKHWCEEGASSSSCSETYCGLYPESEPEVKAVASFLRRN
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 LSSIKAYLTIHSYSQMMIYPYSYAYKLGENNAELNALAKATVKELASL-HGTKYTYGPGA
...::::...::::: ...::::. . .... ::. .:. .:. . .. ..:.::.: :.
CCDS94 INQIKAYISMHSYSQHIVFPYSYTRSKSKDHEELSLVASEAVRAIEKISKNTRYTHGHGS
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 TTIYPAAGGSDDWAYDQGIRYSFTFELRDTGRYGFLLPESQIRATCEETFLAIKYVASYV
:.: : ::.::: :: ::.::::.:::::: ::::::: :. ::.:.: :.. .: .:
CCDS94 ETLYLAPGGGDDWIYDLGIKYSFTIELRDTGTYGFLLPERYIKPTCREAFAAVSKIAWHV
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 LEHLY
....
CCDS94 IRNV
420
>>CCDS5820.1 CPA1 gene_id:1357|Hs108|chr7 (419 aa)
initn: 959 init1: 550 opt: 1151 Z-score: 1487.7 bits: 284.3 E(32554): 1.5e-76
Smith-Waterman score: 1151; 43.0% identity (72.7% similar) in 421 aa overlap (6-417:4-419)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MLALLVLVTVALASAHHGGEHFEGEKVFRVNVEDENHINIIRELASTT--QIDFWKPDSV
.:: .: .: : : : :..:.:..: :: ... ..:: . :.:::. .
CCDS58 MRGLLVLSVLLGAVFGKEDFVGHQVLRISVADEAQVQKVKELEDLEHLQLDFWRGPA-
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 TQIKPHSTVDFRVKAEDTVTVENVLKQNELQYKVLISNLRNVVEAQ------FDSRVRAT
.: : .: :: . .:. :... ..:...: ....... . : ::.:.:
CCDS58 ---HPGSPIDVRVPFPSIQAVKIFLESHGISYETMIEDVQSLLDEEQEQMFAFRSRARST
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 G-HSYEKYNKWETIEAWTQQVATENPALISRSVIGTTFEGRAIYLLKVGKAGQNKPAIFM
.: :. : : . . ...::: :.:. ::.:.::: ::.:: . .:...:::..
CCDS58 DTFNYATYHTLEEIYDFLDLLVAENPHLVSKIQIGNTYEGRPIYVLKFSTGGSKRPAIWI
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 DCGFHAREWISPAFCQWFVREAVRTYGREIQVTELLDKLDFYVLPVLNIDGYIYTWTKSR
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CCDS58 DTGIHSREWVTQASGVWFAKKITQDYGQDAAFTAILDTLDIFLEIVTNPDGFAFTHSTNR
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 FWRKTRSTHTGSSCIGTDPNRNFDAGWCEIGASRNPCDETYCGPAAESEKETKALADFIR
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CCDS58 MWRKTRSHTAGSLCIGVDPNRNWDAGFGLSGASSNPCSETYHGKFANSEVEVKSIVDFVK
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 NKLSSIKAYLTIHSYSQMMIYPYSYAYKLGENNAELNALAKATVKELASLHGTKYTYGPG
.. ..:::...::::::...:::.: . .. ::. :.::.: ::::.:::..::
CCDS58 DH-GNIKAFISIHSYSQLLMYPYGYKTEPVPDQDELDQLSKAAVTALASLYGTKFNYGSI
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 ATTIYPAAGGSDDWAYDQGIRYSFTFELRDTGRYGFLLPESQIRATCEETFLAIKYVASY
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CCDS58 IKAIYQASGSTIDWTYSQGIKYSFTFELRDTGRYGFLLPASQIIPTAKETWLALLTIMEH
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 VLEHLY
.:.: :
CCDS58 TLNHPY
>>CCDS5818.1 CPA4 gene_id:51200|Hs108|chr7 (421 aa)
initn: 980 init1: 481 opt: 1111 Z-score: 1435.9 bits: 274.7 E(32554): 1.2e-73
Smith-Waterman score: 1111; 41.6% identity (72.7% similar) in 425 aa overlap (5-417:4-421)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MLALLVLVTVALASAHHGGEHFEGEKVFRVNVEDENHINIIRELASTT--QIDFWK-PDS
.... . ..:. : :.: :..:.:.::.. ..:. . .:.... ...::: :.:
CCDS58 MRWILFIGALIGSSICGQEKFFGDQVLRINVRNGDEISKLSQLVNSNNLKLNFWKSPSS
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 VTQIKPHSTVDFRVKAEDTVTVENVLKQNELQYKVLISNLRNVVEAQFDSRVRATGH---
. .: :: : . . . .. :... :.: : : .:. ... . : . :.
CCDS58 FN--RP---VDVLVPSVSLQAFKSFLRSQGLEYAVTIEDLQALLDNEDDEMQHNEGQERS
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160
pF1KE5 ----SYEKYNKWETIEAWTQQVATENPALISRSVIGTTFEGRAIYLLK--VGKAGQNKPA
.: :.. :.: ...:.. : : : :: .::.: .:.:: .:: : .::
CCDS58 SNNFNYGAYHSLEAIYHEMDNIAADFPDLARRVKIGHSFENRPMYVLKFSTGK-GVRRPA
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE5 IFMDCGFHAREWISPAFCQWFVREAVRTYGREIQVTELLDKLDFYVLPVLNIDGYIYTWT
.... :.:.::::: : : .:. : : :. .: .:.:.:...::: : :::.:: :
CCDS58 VWLNAGIHSREWISQATAIWTARKIVSDYQRDPAITSILEKMDIFLLPVANPDGYVYTQT
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE5 KSRFWRKTRSTHTGSSCIGTDPNRNFDAGWCEIGASRNPCDETYCGPAAESEKETKALAD
..:.:::::: . ::::::.:::::..:.. ::: :::.:.: :: :.:: :.:...:
CCDS58 QNRLWRKTRSRNPGSSCIGADPNRNWNASFAGKGASDNPCSEVYHGPHANSEVEVKSVVD
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE5 FIRNKLSSIKAYLTIHSYSQMMIYPYSYAYKLGENNAELNALAKATVKELASLHGTKYTY
::. : ...:... .:::::...:::.:. : . . ::. .:. ..: :::. ::.:
CCDS58 FIQ-KHGNFKGFIDLHSYSQLLMYPYGYSVKKAPDAEELDKVARLAAKALASVSGTEYQV
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE5 GPGATTIYPAAGGSDDWAYDQGIRYSFTFELRDTGRYGFLLPESQIRATCEETFLAIKYV
:: ::.:::.:.: :::::.::...::::::::: :::::: .:: : :::.:..: .
CCDS58 GPTCTTVYPASGSSIDWAYDNGIKFAFTFELRDTGTYGFLLPANQIIPTAEETWLGLKTI
360 370 380 390 400 410
410
pF1KE5 ASYVLEHLY
.: ..::
CCDS58 MEHVRDNLY
420
>>CCDS5817.2 CPA2 gene_id:1358|Hs108|chr7 (419 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KE5 MLALLVLVTVALASAHHGGEHFEGEKVFRVNVEDENHINIIRELASTT--QIDFWKPDSV
: :.: :: . . : : :..:... .:..:. . .: . :.:::: ..
CCDS58 MAMRLILFFGALFGHIYCLETFVGDQVLEIVPSNEEQIKNLLQLEAQEHLQLDFWKSPTT
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 TQIKPHSTVDFRVKAEDTVTVENVLKQNELQYKVLISNLRNVVEAQ-----FDSRVRATG
: :. :: .. .:. :... . :...: ... ... . :. : . .:
CCDS58 ----PGETAHVRVPFVNVQAVKVFLESQGIAYSIMIEDVQVLLDKENEEMLFNRRRERSG
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 H-SYEKYNKWETIEAWTQQVATENPALISRSVIGTTFEGRAIYLLKVGKAGQNKPAIFMD
. .. :. : : .....:.:.:.:. ::..::.: . .:: . .: .::::..:
CCDS58 NFNFGAYHTLEEISQEMDNLVAEHPGLVSKVNIGSSFENRPMNVLKFSTGG-DKPAIWLD
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 CGFHAREWISPAFCQWFVREAVRTYGREIQVTELLDKLDFYVLPVLNIDGYIYTWTKSRF
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CCDS58 AGIHAREWVTQATALWTANKIVSDYGKDPSITSILDALDIFLLPVTNPDGYVFSQTKNRM
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 WRKTRSTHTGSSCIGTDPNRNFDAGWCEIGASRNPCDETYCGPAAESEKETKALADFIRN
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CCDS58 WRKTRSKVSGSLCVGVDPNRNWDAGFGGPGASSNPCSDSYHGPSANSEVEVKSIVDFIKS
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 KLSSIKAYLTIHSYSQMMIYPYSYAYKLGENNAELNALAKATVKELASLHGTKYTYGPGA
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CCDS58 H-GKVKAFITLHSYSQLLMFPYGYKCTKLDDFDELSEVAQKAAQSLRSLHGTKYKVGPIC
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 TTIYPAAGGSDDWAYDQGIRYSFTFELRDTGRYGFLLPESQIRATCEETFLAIKYVASYV
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CCDS58 SVIYQASGGSIDWSYDYGIKYSFAFELRDTGRYGFLLPARQILPTAEETWLGLKAIMEHV
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 LEHLY
.: :
CCDS58 RDHPY
>>CCDS2372.1 CPO gene_id:130749|Hs108|chr2 (374 aa)
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90 100 110 120 130 140
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.::. :. : : .... . ....
CCDS23 VPGGLGYDRSLAQHRQEIVDKSVSPWSLETYSYNIYHPMGEIYEWMREISEKYKEVVTQH
20 30 40 50 60 70
150 160 170 180 190 200
pF1KE5 VIGTTFEGRAIYLLKVGK-AGQNKPAIFMDCGFHAREWISPAFCQWFVREAVRTYGREIQ
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CCDS23 FLGVTYETHPMYYLKISQPSGNPKKIIWMDCGIHAREWIAPAFCQWFVKEILQNHKDNSS
80 90 100 110 120 130
210 220 230 240 250 260
pF1KE5 VTELLDKLDFYVLPVLNIDGYIYTWTKSRFWRKTRSTHTGSSCIGTDPNRNFDAGWCEIG
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CCDS23 IRKLLRNLDFYVLPVLNIDGYIYTWTTDRLWRKSRSPHNNGTCFGTDLNRNFNASWCSIG
140 150 160 170 180 190
270 280 290 300 310 320
pF1KE5 ASRNPCDETYCGPAAESEKETKALADFIRNKLSSIKAYLTIHSYSQMMIYPYSYAYKLGE
:::: :.:.:: . :: ::::.:.::..: ..: .::.:::.:... ::.:. . .
CCDS23 ASRNCQDQTFCGTGPVSEPETKAVASFIESKKDDILCFLTMHSYGQLILTPYGYTKNKSS
200 210 220 230 240 250
330 340 350 360 370 380
pF1KE5 NNAELNALAKATVKELASLHGTKYTYGPGATTIYPAAGGSDDWAYDQGIRYSFTFELRDT
:. :. ... ... : . .::.: : .: .: ..:.: ::: : :: .:.::::::.
CCDS23 NHPEMIQVGQKAANALKAKYGTNYRVGSSADILYASSGSSRDWARDIGIPFSYTFELRDS
260 270 280 290 300 310
390 400 410
pF1KE5 GRYGFLLPESQIRATCEETFLAIKYVASYVLEHLY
: :::.:::.::. :::::. :.
CCDS23 GTYGFVLPEAQIQPTCEETMEAVLSVLDDVYAKHWHSDSAGRVTSATMLLGLLVSCMSLL
320 330 340 350 360 370
>>CCDS55163.1 CPA4 gene_id:51200|Hs108|chr7 (388 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KE5 MLALLVLVTVALASAHHGGEHFEGEKVFRVNVEDENHINIIRELASTT--QIDFWK-PDS
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CCDS55 MRWILFIGALIGSSICGQEKFFGDQVLRINVRNGDEISKLSQLVNSNNLKLNFWKSPSS
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 VTQIKPHSTVDFRVKAEDTVTVENVLKQNELQYKVLISNLRNVVEAQFDSRVRATGHSYE
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CCDS55 FN--RP---VDVLVPSVSLQAFKSFLRSQGLEYAVTIEDLQ--IYHEMDN----------
60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 KYNKWETIEAWTQQVATENPALISRSVIGTTFEGRAIYLLK--VGKAGQNKPAIFMDCGF
.:.. : : : :: .::.: .:.:: .:: : .::.... :.
CCDS55 --------------IAADFPDLARRVKIGHSFENRPMYVLKFSTGK-GVRRPAVWLNAGI
110 120 130 140
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 HAREWISPAFCQWFVREAVRTYGREIQVTELLDKLDFYVLPVLNIDGYIYTWTKSRFWRK
:.::::: : : .:. : : :. .: .:.:.:...::: : :::.:: :..:.:::
CCDS55 HSREWISQATAIWTARKIVSDYQRDPAITSILEKMDIFLLPVANPDGYVYTQTQNRLWRK
150 160 170 180 190 200
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 TRSTHTGSSCIGTDPNRNFDAGWCEIGASRNPCDETYCGPAAESEKETKALADFIRNKLS
::: . ::::::.:::::..:.. ::: :::.:.: :: :.:: :.:...:::. : .
CCDS55 TRSRNPGSSCIGADPNRNWNASFAGKGASDNPCSEVYHGPHANSEVEVKSVVDFIQ-KHG
210 220 230 240 250 260
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 SIKAYLTIHSYSQMMIYPYSYAYKLGENNAELNALAKATVKELASLHGTKYTYGPGATTI
..:... .:::::...:::.:. : . . ::. .:. ..: :::. ::.: :: ::.
CCDS55 NFKGFIDLHSYSQLLMYPYGYSVKKAPDAEELDKVARLAAKALASVSGTEYQVGPTCTTV
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:::.:.: :::::.::...::::::::: :::::: .:: : :::.:..: . .: ..
CCDS55 YPASGSSIDWAYDNGIKFAFTFELRDTGTYGFLLPANQIIPTAEETWLGLKTIMEHVRDN
330 340 350 360 370 380
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::
CCDS55 LY
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:.. . ::.: : .: :..:.:: ..::...... .:
CCDS58 MQGTPGGGTRPGPSPVDRRTLLVFSFILAAAL-GQMNFTGDQVLRVLAKDEKQLSLLGDL
10 20 30 40 50
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CCDS58 EGLKPQKVDFWRGPA----RPSLPVDMRVPFSELKDIKAYLESHGLAYSIMIKDIQVLLD
60 70 80 90 100 110
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pF1KE5 ----AQFDSRV--RATGH-SYEKYNKWETIEAWTQQVATENPALISRSVIGTTFEGRAIY
:. :: :.:. :: .:. : : .: .. . :. ..:. ::..::...:
CCDS58 EERQAMAKSRRLERSTNSFSYSSYHTLEEIYSWIDNFVMEHSDIVSKIQIGNSFENQSIL
120 130 140 150 160 170
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pF1KE5 LLKVGKAGQNKPAIFMDCGFHAREWISPAFCQWFVREAVRTYGREIQVTELLDKLDFYVL
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CCDS58 VLKFSTGGSRHPAIWIDTGIHSREWITHATGIWTANKIVSDYGKDRVLTDILNAMDIFIE
180 190 200 210 220 230
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CCDS58 LVTNPDGFAFTHSMNRLWRKNKSIRPGIFCIGVDLNRNWKSGFGGNGSNSNPCSETYHGP
240 250 260 270 280 290
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CCDS58 SPQSEPEVAAIVNFITAH-GNFKALISIHSYSQMLMYPYGRLLEPVSNQRELYDLAKDAV
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CCDS58 EALYKVHGIEYIFGSISTTLYVASGITVDWAYDSGIKYAFSFELRDTGQYGFLLPATQII
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CCDS58 PTAQETWMALRTIMEHTLNHPY
420 430
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]