FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5506, 417 aa
1>>>pF1KE5506 417 - 417 aa - 417 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5534+/-0.00114; mu= 15.7166+/- 0.068
mean_var=66.0890+/-13.226, 0's: 0 Z-trim(101.8): 29 B-trim: 116 in 2/48
Lambda= 0.157765
statistics sampled from 6659 (6682) to 6659 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.567), E-opt: 0.2 (0.205), width: 16
Scan time: 2.480
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS3138.1 CPA3 gene_id:1359|Hs108|chr3 ( 417) 2806 648.0 4.9e-186
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CCDS9401.1 CPB2 gene_id:1361|Hs108|chr13 ( 423) 1130 266.5 3.4e-71
CCDS5817.2 CPA2 gene_id:1358|Hs108|chr7 ( 419) 1032 244.2 1.7e-64
CCDS5818.1 CPA4 gene_id:51200|Hs108|chr7 ( 421) 1021 241.7 9.9e-64
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CCDS5819.1 CPA5 gene_id:93979|Hs108|chr7 ( 436) 977 231.7 1.1e-60
CCDS55163.1 CPA4 gene_id:51200|Hs108|chr7 ( 388) 912 216.9 2.7e-56
CCDS47713.1 CPA5 gene_id:93979|Hs108|chr7 ( 403) 705 169.8 4.3e-42
CCDS73568.1 CPB2 gene_id:1361|Hs108|chr13 ( 386) 616 149.5 5.1e-36
>>CCDS3138.1 CPA3 gene_id:1359|Hs108|chr3 (417 aa)
initn: 2806 init1: 2806 opt: 2806 Z-score: 3453.4 bits: 648.0 E(32554): 4.9e-186
Smith-Waterman score: 2806; 99.5% identity (99.8% similar) in 417 aa overlap (1-417:1-417)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MRLILPVGLIATTLAIAPVRFDREKVFRVKPQDEKQADIIKDLAKTNELDFWYPGATHHV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MRLILPVGLIATTLAIAPVRFDREKVFRVKPQDEKQADIIKDLAKTNELDFWYPGATHHV
10 20 30 40 50 60
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::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 AANMMVDFRVSEKESQAIQSALDQNKMHYEILIHDLQEEIEKQFDVKEDIPGRHSYAKYN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::
CCDS31 NWEKIVAWTEKMMDKYPEMVSRIKIGSTVEDNPLYVLKIGEKNERRKAIFTDCGIHAREW
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VSPAFCQWFVYQATKTYGRNKIMTKLLDRMNFYILPVFNVDGYIWSWTKNRMWRKNRSKN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 QNSKCIGTDLNRNFNASWNSIPNTNDPCADNYRGSAPESEKETKAVTNFIRSHLNEIKVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 QNSKCIGTDLNRNFNASWNSIPNTNDPCADNYRGSAPESEKETKAVTNFIRSHLNEIKVY
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 ITFHSYSQMLLFPYGYTSKLPPNHEDLAKVAKIGTDVLSTRYETRYIYGPIESTIYPISG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 ITFHSYSQMLLFPYGYTSKLPPNHEDLAKVAKIGTDVLSTRYETRYIYGPIESTIYPISG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SSLDWAYDLGIKHTFAFELRDKGKFGFLLPESRIKPTCRETMLAVKFIAKYILKHTS
370 380 390 400 410
>>CCDS33874.1 CPB1 gene_id:1360|Hs108|chr3 (417 aa)
initn: 1486 init1: 1245 opt: 1492 Z-score: 1837.1 bits: 348.9 E(32554): 5.3e-96
Smith-Waterman score: 1492; 49.8% identity (80.3% similar) in 412 aa overlap (9-415:5-415)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MRLILPVGLIATTLAIAPVR-----FDREKVFRVKPQDEKQADIIKDLAKTNELDFWYPG
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CCDS33 MLALLVLVTVALASAHHGGEHFEGEKVFRVNVEDENHINIIRELASTTQIDFWKPD
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 ATHHVAAKMMVDFRVSEKESQAIQSALDQNKMHYEILIHDLQEEIEKQFDVKEDIPGRHS
.. .. . :::::. ... .....: ::...:..:: .:.. .: ::: . : ::
CCDS33 SVTQIKPHSTVDFRVKAEDTVTVENVLKQNELQYKVLISNLRNVVEAQFDSRVRATG-HS
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 YAKYNNWEKIVAWTEKMMDKYPEMVSRIKIGSTVEDNPLYVLKIGEKNERRKAIFMDCGI
: :::.:: : :::... . : ..:: ::.: : .:.::.:. .. . :::::::.
CCDS33 YEKYNKWETIEAWTQQVATENPALISRSVIGTTFEGRAIYLLKVGKAGQNKPAIFMDCGF
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 HAREWVSPAFCQWFVYQATKTYGRNKIMTKLLDRMNFYILPVFNVDGYIWSWTKNRMWRK
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CCDS33 HAREWISPAFCQWFVREAVRTYGREIQVTELLDKLDFYVLPVLNIDGYIYTWTKSRFWRK
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 NRSKNQNSKCIGTDLNRNFNASWNSIPNTNDPCADNYRGSAPESEKETKAVTNFIRSHLN
.:: . .:.::::: ::::.:.: : . .:: ..: : : ::::::::...:::..:.
CCDS33 TRSTHTGSSCIGTDPNRNFDAGWCEIGASRNPCDETYCGPAAESEKETKALADFIRNKLS
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 EIKVYITFHSYSQMLLFPYGYTSKLPPNHEDLAKVAKIGTDVLSTRYETRYIYGPIESTI
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CCDS33 SIKAYLTIHSYSQMMIYPYSYAYKLGENNAELNALAKATVKELASLHGTKYTYGPGATTI
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 YPISGSSLDWAYDLGIKHTFAFELRDKGKFGFLLPESRIKPTCRETMLAVKFIAKYILKH
:: .:.: ::::: ::...:.::::: :..:::::::.:. ::.::.::.:..:.:.:.:
CCDS33 YPAAGGSDDWAYDQGIRYSFTFELRDTGRYGFLLPESQIRATCEETFLAIKYVASYVLEH
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 TS
CCDS33 LY
>>CCDS6200.1 CPA6 gene_id:57094|Hs108|chr8 (437 aa)
initn: 1119 init1: 1010 opt: 1189 Z-score: 1464.1 bits: 280.0 E(32554): 3.2e-75
Smith-Waterman score: 1189; 42.5% identity (73.8% similar) in 400 aa overlap (20-414:36-434)
10 20 30 40
pF1KE5 MRLILPVGLIATTLAIAPVRFDREKVFRVKPQDEKQADIIKDLAKTNEL
:. .::.: :. :..: .: .. ..
CCDS62 KRRGQAAAFLPLCWLFLKILQPGHSHLYNNRYAGDKVIRFIPKTEEEAYALKKISYQLKV
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE5 DFWYPGATHHVAAKMMVDFRVSEKESQAIQSALDQNKMHYEILIHDLQEEIEKQFDV---
:.: :.. .:. ..: .. .. :.:. . :.. ...:..::.:::. .:: ..
CCDS62 DLWQPSSISYVSEGTVTDVHIPQNGSRALLAFLQEANIQYKVLIEDLQKTLEKGSSLHTQ
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE5 --KEDIPGRHSYAKYNNWEKIVAWTEKMMDKYPEMVSRIKIGSTVEDNPLYVLKIGEKNE
.... : ..: :.. :.: : ... . .. ..:: . : :..::.:....
CCDS62 RNRRSLSG-YNYEVYHSLEEIQNWMHHLNKTHSGLIHMFSIGRSYEGRSLFILKLGRRSR
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE5 RRKAIFMDCGIHAREWVSPAFCQWFVYQATKTYGRNKIMTKLLDRMNFYILPVFNVDGYI
..:...:::::::::..:::::::: .: :: . : :.:... :::.::::::::
CCDS62 LKRAVWIDCGIHAREWIGPAFCQWFVKEALLTYKSDPAMRKMLNHLYFYIMPVFNVDGYH
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE5 WSWTKNRMWRKNRSKNQNSKCIGTDLNRNFNASWNSIPNTNDPCADNYRGSAPESEKETK
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CCDS62 FSWTNDRFWRKTRSRNSRFRCRGVDANRNWKVKWCDEGASMHPCDDTYCGPFPESEPEVK
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KE5 AVTNFIRSHLNEIKVYITFHSYSQMLLFPYGYTSKLPPNHEDLAKVAKIGTDVLSTRYET
::.::.:.: ..:..:..::.:.::::.::.: :: . . ..: ....:.. : .
CCDS62 AVANFLRKHRKHIRAYLSFHAYAQMLLYPYSYKYATIPNFRCVESAAYKAVNALQSVYGV
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KE5 RYIYGPIESTIYPISGSSLDWAYDLGIKHTFAFELRDKGKFGFLLPESRIKPTCRETMLA
:: ::: .:.: ::::.:::: :: ..::::::: : ::::::: ::::: :::::
CCDS62 RYRYGPASTTLYVSSGSSMDWAYKNGIPYAFAFELRDTGYFGFLLPEMLIKPTCTETMLA
370 380 390 400 410 420
410
pF1KE5 VKFIAKYILKHTS
:: :. ..::
CCDS62 VKNITMHLLKKCP
430
>>CCDS9401.1 CPB2 gene_id:1361|Hs108|chr13 (423 aa)
initn: 864 init1: 427 opt: 1130 Z-score: 1391.7 bits: 266.5 E(32554): 3.4e-71
Smith-Waterman score: 1130; 40.4% identity (72.7% similar) in 421 aa overlap (1-415:6-422)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MRLILPVGLIATTLAIAPVRFDREKVFRVKPQDEKQADIIKDLAKTNELDFWYPG
. ...:. :. ..: :. .:. . :. .:......:. : :. .: :
CCDS94 MKLCSLAVLVPIVLFCEQHVFA---FQSGQVLAALPRTSRQVQVLQNLTTTYEIVLWQPV
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 ATHHVAAKMMVDFRVSEKESQAIQSALDQNKMHYEILIHDLQEEIEKQFDVKEDIPGRHS
.. .. : .: : :. .. . ... :. . . .:. :... :..:.. .. . : :
CCDS94 TADLIVKKKQVHFFVNASDVDNVKAHLNVSGIPCSVLLADVEDLIQQQIS-NDTVSPRAS
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 ---YAKYNNWEKIVAWTEKMMDKYPEMVSRIKIGSTVEDNPLYVLKI-GEKNERRKAIFM
: .:.. ..: .: : . ...:.:...:.:::. : ::::::. :... ..::..
CCDS94 ASYYEQYHSLNEIYSWIEFITERHPDMLTKIHIGSSFEKYPLYVLKVSGKEQAAKNAIWI
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 DCGIHAREWVSPAFCQWFVYQATKTYGRNKIMTKLLDRMNFYILPVFNVDGYIWSWTKNR
:::::::::.::::: ::. . :. :: .:.:: ..::..:: ::::: .:: :::
CCDS94 DCGIHAREWISPAFCLWFIGHITQFYGIIGQYTNLLRLVDFYVMPVVNVDGYDYSWKKNR
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 MWRKNRSKNQNSKCIGTDLNRNFNAS-WNSIPNTNDPCADNYRGSAPESEKETKAVTNFI
::::::: :..:::::::::: .. : ... :...: : :::: :.:::..:.
CCDS94 MWRKNRSFYANNHCIGTDLNRNFASKHWCEEGASSSSCSETYCGLYPESEPEVKAVASFL
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340
pF1KE5 RSHLNEIKVYITFHSYSQMLLFPYGYTSKLPPNHEDLAKVAKIGTDVL-STRYETRYIYG
: ..:.::.::..::::: ..:::.:: . .::.:. ::. .. .. . .::: .:
CCDS94 RRNINQIKAYISMHSYSQHIVFPYSYTRSKSKDHEELSLVASEAVRAIEKISKNTRYTHG
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE5 PIESTIYPISGSSLDWAYDLGIKHTFAFELRDKGKFGFLLPESRIKPTCRETMLAVKFIA
:.: :.. :: ::::::..:..:::: : .:::::: :::::::.. ::. ::
CCDS94 HGSETLYLAPGGGDDWIYDLGIKYSFTIELRDTGTYGFLLPERYIKPTCREAFAAVSKIA
360 370 380 390 400 410
410
pF1KE5 KYILKHTS
.....
CCDS94 WHVIRNV
420
>>CCDS5817.2 CPA2 gene_id:1358|Hs108|chr7 (419 aa)
initn: 895 init1: 440 opt: 1032 Z-score: 1271.2 bits: 244.2 E(32554): 1.7e-64
Smith-Waterman score: 1032; 38.5% identity (70.9% similar) in 426 aa overlap (1-415:3-417)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MRLILPVGLIATTLAIAPVRFDREKVFRVKPQDEKQA-DIIKDLAKTN-ELDFWY---
::::: : . . . : ..:... :..:.: .... :. . .::::
CCDS58 MAMRLILFFGALFGHIYCLET-FVGDQVLEIVPSNEEQIKNLLQLEAQEHLQLDFWKSPT
10 20 30 40 50
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pF1KE5 -PGATHHVAAKMMVDFRVSEKESQAIQSALDQNKMHYEILIHDLQEEIEKQ-----FDVK
:: : :: :: . ::.. :... . : :.:.:.: ..:. :. .
CCDS58 TPGETAHV--------RVPFVNVQAVKVFLESQGIAYSIMIEDVQVLLDKENEEMLFNRR
60 70 80 90 100 110
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pF1KE5 EDIPGRHSYAKYNNWEKIVAWTEKMMDKYPEMVSRIKIGSTVEDNPLYVLKIGEKNERRK
.. : ... :.. :.: .... ..: .::...:::. :. :. :::.. ...
CCDS58 RERSGNFNFGAYHTLEEISQEMDNLVAEHPGLVSKVNIGSSFENRPMNVLKFSTGGDK-P
120 130 140 150 160 170
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pF1KE5 AIFMDCGIHAREWVSPAFCQWFVYQATKTYGRNKIMTKLLDRMNFYILPVFNVDGYIWSW
::..: ::::::::. : : . . .. ::.. .:..:: .....::: : :::..:
CCDS58 AIWLDAGIHAREWVTQATALWTANKIVSDYGKDPSITSILDALDIFLLPVTNPDGYVFSQ
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE5 TKNRMWRKNRSKNQNSKCIGTDLNRNFNASWNSIPNTNDPCADNYRGSAPESEKETKAVT
::::::::.::: ..: :.:.: :::..:.... ...::.:.:.: . .:: :.:...
CCDS58 TKNRMWRKTRSKVSGSLCVGVDPNRNWDAGFGGPGASSNPCSDSYHGPSANSEVEVKSIV
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE5 NFIRSHLNEIKVYITFHSYSQMLLFPYGYTSKLPPNHEDLAKVAKIGTDVLSTRYETRYI
.::.:: ...:..::.:::::.:.::::: . ..:..::. ... : . . :.:
CCDS58 DFIKSH-GKVKAFITLHSYSQLLMFPYGYKCTKLDDFDELSEVAQKAAQSLRSLHGTKYK
300 310 320 330 340
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pF1KE5 YGPIESTIYPISGSSLDWAYDLGIKHTFAFELRDKGKFGFLLPESRIKPTCRETMLAVKF
::: :.:: ::.:.::.:: :::..::::::: :..::::: .: :: .:: :..:
CCDS58 VGPICSVIYQASGGSIDWSYDYGIKYSFAFELRDTGRYGFLLPARQILPTAEETWLGLKA
350 360 370 380 390 400
410
pF1KE5 IAKYILKHTS
: ... :
CCDS58 IMEHVRDHPY
410
>>CCDS5818.1 CPA4 gene_id:51200|Hs108|chr7 (421 aa)
initn: 943 init1: 434 opt: 1021 Z-score: 1257.7 bits: 241.7 E(32554): 9.9e-64
Smith-Waterman score: 1021; 37.8% identity (69.8% similar) in 421 aa overlap (1-412:1-416)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MRLILPVGLIATTLAIAPVRFDREKVFRVKPQDEKQADIIKDLAKTN--ELDFWYPGATH
:: :: .: . . . .: ..:.:.. .. . . ...:...: .:.:: ..
CCDS58 MRWILFIGALIGSSICGQEKFFGDQVLRINVRNGDEISKLSQLVNSNNLKLNFWKSPSSF
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 HVAAKMMVDFRVSEKESQAIQSALDQNKMHYEILIHDLQEEIEKQFDVKEDIPGRH----
. :: : ::..: : .. ..: . :.::: .... : . :..
CCDS58 NRP----VDVLVPSVSLQAFKSFLRSQGLEYAVTIEDLQALLDNEDDEMQHNEGQERSSN
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 --SYAKYNNWEKIVAWTEKMMDKYPEMVSRIKIGSTVEDNPLYVLKIGE-KNERRKAIFM
.:. :.. : : ... .:... :.::: . :. :.::::.. :. :: :...
CCDS58 NFNYGAYHSLEAIYHEMDNIAADFPDLARRVKIGHSFENRPMYVLKFSTGKGVRRPAVWL
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 DCGIHAREWVSPAFCQWFVYQATKTYGRNKIMTKLLDRMNFYILPVFNVDGYIWSWTKNR
. :::.:::.: : : . . .. : :. .:..:..:....::: : :::... :.::
CCDS58 NAGIHSREWISQATAIWTARKIVSDYQRDPAITSILEKMDIFLLPVANPDGYVYTQTQNR
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 MWRKNRSKNQNSKCIGTDLNRNFNASWNSIPNTNDPCADNYRGSAPESEKETKAVTNFIR
.:::.::.: .:.:::.: :::.:::. . ...::.. :.: .:: :.:.:..::.
CCDS58 LWRKTRSRNPGSSCIGADPNRNWNASFAGKGASDNPCSEVYHGPHANSEVEVKSVVDFIQ
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 SHLNEIKVYITFHSYSQMLLFPYGYTSKLPPNHEDLAKVAKIGTDVLSTRYETRYIYGPI
.: : .: .: .:::::.:..::::. : :. :.: :::.... .:.. :.: ::
CCDS58 KHGN-FKGFIDLHSYSQLLMYPYGYSVKKAPDAEELDKVARLAAKALASVSGTEYQVGPT
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 ESTIYPISGSSLDWAYDLGIKHTFAFELRDKGKFGFLLPESRIKPTCRETMLAVKFIAKY
.:.:: ::::.::::: ::: .:.::::: : .::::: ..: :: .:: :..: : ..
CCDS58 CTTVYPASGSSIDWAYDNGIKFAFTFELRDTGTYGFLLPANQIIPTAEETWLGLKTIMEH
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 ILKHTS
.
CCDS58 VRDNLY
420
>>CCDS5820.1 CPA1 gene_id:1357|Hs108|chr7 (419 aa)
initn: 948 init1: 504 opt: 1004 Z-score: 1236.8 bits: 237.8 E(32554): 1.4e-62
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10 20 30 40 50
pF1KE5 MRLILPVGLIATTLAIAPVRFDRE-----KVFRVKPQDEKQADIIKDLAKTN--ELDFWY
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CCDS58 MRGLLVLSVLLGAV-FGKEDFVGHQVLRISVADEAQVQKVKELEDLEHLQLDFWR
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100
pF1KE5 PGATHHVAAKMMVDFRVSEKESQAIQSALDQNKMHYEILIHDLQ----EEIEKQFDVKED
: .: . .: :: ::.. :... . :: .:.:.: :: :..: .
CCDS58 -GPAHPGSP---IDVRVPFPSIQAVKIFLESHGISYETMIEDVQSLLDEEQEQMFAFRSR
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE5 IPGRHS--YAKYNNWEKIVAWTEKMMDKYPEMVSRIKIGSTVEDNPLYVLKIGEKNERRK
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CCDS58 ARSTDTFNYATYHTLEEIYDFLDLLVAENPHLVSKIQIGNTYEGRPIYVLKFSTGGSKRP
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE5 AIFMDCGIHAREWVSPAFCQWFVYQATKTYGRNKIMTKLLDRMNFYILPVFNVDGYIWSW
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CCDS58 AIWIDTGIHSREWVTQASGVWFAKKITQDYGQDAAFTAILDTLDIFLEIVTNPDGFAFTH
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE5 TKNRMWRKNRSKNQNSKCIGTDLNRNFNASWNSIPNTNDPCADNYRGSAPESEKETKAVT
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CCDS58 STNRMWRKTRSHTAGSLCIGVDPNRNWDAGFGLSGASSNPCSETYHGKFANSEVEVKSIV
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE5 NFIRSHLNEIKVYITFHSYSQMLLFPYGYTSKLPPNHEDLAKVAKIGTDVLSTRYETRYI
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CCDS58 DFVKDHGN-IKAFISIHSYSQLLMYPYGYKTEPVPDQDELDQLSKAAVTALASLYGTKFN
300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KE5 YGPIESTIYPISGSSLDWAYDLGIKHTFAFELRDKGKFGFLLPESRIKPTCRETMLAVKF
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CCDS58 YGSIIKAIYQASGSTIDWTYSQGIKYSFTFELRDTGRYGFLLPASQIIPTAKETWLALLT
350 360 370 380 390 400
410
pF1KE5 IAKYILKHTS
: .. :.:
CCDS58 IMEHTLNHPY
410
>>CCDS2372.1 CPO gene_id:130749|Hs108|chr2 (374 aa)
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90 100 110 120 130 140
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CCDS23 VPGGLGYDRSLAQHRQEIVDKSVSPWSLETYSYNIYHPMGEIYEWMREISEKYKEVVTQH
20 30 40 50 60 70
150 160 170 180 190 200
pF1KE5 KIGSTVEDNPLYVLKIGEKN-ERRKAIFMDCGIHAREWVSPAFCQWFVYQATKTYGRNKI
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CCDS23 FLGVTYETHPMYYLKISQPSGNPKKIIWMDCGIHAREWIAPAFCQWFVKEILQNHKDNSS
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210 220 230 240 250 260
pF1KE5 MTKLLDRMNFYILPVFNVDGYIWSWTKNRMWRKNRSKNQNSKCIGTDLNRNFNASWNSIP
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CCDS23 IRKLLRNLDFYVLPVLNIDGYIYTWTTDRLWRKSRSPHNNGTCFGTDLNRNFNASWCSIG
140 150 160 170 180 190
270 280 290 300 310 320
pF1KE5 NTNDPCADN-YRGSAPESEKETKAVTNFIRSHLNEIKVYITFHSYSQMLLFPYGYTSKLP
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CCDS23 ASRN-CQDQTFCGTGPVSEPETKAVASFIESKKDDILCFLTMHSYGQLILTPYGYTKNKS
200 210 220 230 240 250
330 340 350 360 370 380
pF1KE5 PNHEDLAKVAKIGTDVLSTRYETRYIYGPIESTIYPISGSSLDWAYDLGIKHTFAFELRD
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CCDS23 SNHPEMIQVGQKAANALKAKYGTNYRVGSSADILYASSGSSRDWARDIGIPFSYTFELRD
260 270 280 290 300 310
390 400 410
pF1KE5 KGKFGFLLPESRIKPTCRETMLAVKFIAKYILKHTS
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CCDS23 SGTYGFVLPEAQIQPTCEETMEAVLSVLDDVYAKHWHSDSAGRVTSATMLLGLLVSCMSL
320 330 340 350 360 370
>>CCDS5819.1 CPA5 gene_id:93979|Hs108|chr7 (436 aa)
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10 20 30 40
pF1KE5 MRLILPVGLIATTLAIAPVRFDREKVFRVKPQDEKQADIIKDL
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CCDS58 MQGTPGGGTRPGPSPVDRRTLLVFSFILAA-ALGQMNFTGDQVLRVLAKDEKQLSLLGDL
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KE5 A--KTNELDFWYPGATHHVAAKMMVDFRVSEKESQAIQSALDQNKMHYEILIHDLQEEI-
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CCDS58 EGLKPQKVDFWRGPAR----PSLPVDMRVPFSELKDIKAYLESHGLAYSIMIKDIQVLLD
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150
pF1KE5 -EKQFDVK----EDIPGRHSYAKYNNWEKIVAWTEKMMDKYPEMVSRIKIGSTVEDNPLY
:.: .: : . ::..:.. :.: .: .... .. ..::.:.::.. :.. .
CCDS58 EERQAMAKSRRLERSTNSFSYSSYHTLEEIYSWIDNFVMEHSDIVSKIQIGNSFENQSIL
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KE5 VLKIGEKNERRKAIFMDCGIHAREWVSPAFCQWFVYQATKTYGRNKIMTKLLDRMNFYIL
:::.. . :. ::..: :::.:::.. : : . . .. ::.....: .:. :...:
CCDS58 VLKFSTGGSRHPAIWIDTGIHSREWITHATGIWTANKIVSDYGKDRVLTDILNAMDIFIE
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KE5 PVFNVDGYIWSWTKNRMWRKNRSKNQNSKCIGTDLNRNFNASWNSIPNTNDPCADNYRGS
: : ::. .. . ::.::::.: . :::.:::::....... ....::...:.:
CCDS58 LVTNPDGFAFTHSMNRLWRKNKSIRPGIFCIGVDLNRNWKSGFGGNGSNSNPCSETYHGP
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
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CCDS58 SPQSEPEVAAIVNFITAHGN-FKALISIHSYSQMLMYPYGRLLEPVSNQRELYDLAKDAV
300 310 320 330 340 350
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CCDS58 EALYKVHGIEYIFGSISTTLYVASGITVDWAYDSGIKYAFSFELRDTGQYGFLLPATQII
360 370 380 390 400 410
400 410
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:: .:: .:.. : .. :.:
CCDS58 PTAQETWMALRTIMEHTLNHPY
420 430
>>CCDS55163.1 CPA4 gene_id:51200|Hs108|chr7 (388 aa)
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CCDS55 MRWILFIGALIGSSICGQEKFFGDQVLRINVRNGDEISKLSQLVNSNNLKLNFWKSPSSF
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
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. :: : ::..: : .. ..: . :.:::
CCDS55 NRP----VDVLVPSVSLQAFKSFLRSQGLEYAVTIEDLQ--------------------I
70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 YNNWEKIVAWTEKMMDKYPEMVSRIKIGSTVEDNPLYVLKIGE-KNERRKAIFMDCGIHA
:.. ..:.: .:... :.::: . :. :.::::.. :. :: :.... :::.
CCDS55 YHEMDNIAA-------DFPDLARRVKIGHSFENRPMYVLKFSTGKGVRRPAVWLNAGIHS
100 110 120 130 140
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pF1KE5 REWVSPAFCQWFVYQATKTYGRNKIMTKLLDRMNFYILPVFNVDGYIWSWTKNRMWRKNR
:::.: : : . . .. : :. .:..:..:....::: : :::... :.::.:::.:
CCDS55 REWISQATAIWTARKIVSDYQRDPAITSILEKMDIFLLPVANPDGYVYTQTQNRLWRKTR
150 160 170 180 190 200
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CCDS55 SRNPGSSCIGADPNRNWNASFAGKGASDNPCSEVYHGPHANSEVEVKSVVDFIQKHGN-F
210 220 230 240 250 260
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CCDS55 KGFIDLHSYSQLLMYPYGYSVKKAPDAEELDKVARLAAKALASVSGTEYQVGPTCTTVYP
270 280 290 300 310 320
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CCDS55 ASGSSIDWAYDNGIKFAFTFELRDTGTYGFLLPANQIIPTAEETWLGLKTIMEHVRDNLY
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]