FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5501, 419 aa
1>>>pF1KE5501 419 - 419 aa - 419 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2427+/-0.000987; mu= 17.3587+/- 0.059
mean_var=61.7742+/-12.289, 0's: 0 Z-trim(104.1): 33 B-trim: 3 in 1/47
Lambda= 0.163181
statistics sampled from 7714 (7745) to 7714 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.608), E-opt: 0.2 (0.238), width: 16
Scan time: 2.500
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS5820.1 CPA1 gene_id:1357|Hs108|chr7 ( 419) 2773 661.6 3.9e-190
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CCDS5819.1 CPA5 gene_id:93979|Hs108|chr7 ( 436) 1761 423.4 2.1e-118
CCDS5818.1 CPA4 gene_id:51200|Hs108|chr7 ( 421) 1622 390.6 1.5e-108
CCDS47713.1 CPA5 gene_id:93979|Hs108|chr7 ( 403) 1355 327.8 1.2e-89
CCDS55163.1 CPA4 gene_id:51200|Hs108|chr7 ( 388) 1282 310.6 1.7e-84
CCDS33874.1 CPB1 gene_id:1360|Hs108|chr3 ( 417) 1150 279.5 4.1e-75
CCDS3138.1 CPA3 gene_id:1359|Hs108|chr3 ( 417) 1008 246.1 4.7e-65
CCDS6200.1 CPA6 gene_id:57094|Hs108|chr8 ( 437) 996 243.3 3.5e-64
CCDS9401.1 CPB2 gene_id:1361|Hs108|chr13 ( 423) 878 215.5 7.8e-56
CCDS2372.1 CPO gene_id:130749|Hs108|chr2 ( 374) 790 194.7 1.2e-49
CCDS73568.1 CPB2 gene_id:1361|Hs108|chr13 ( 386) 522 131.7 1.2e-30
>>CCDS5820.1 CPA1 gene_id:1357|Hs108|chr7 (419 aa)
initn: 2773 init1: 2773 opt: 2773 Z-score: 3527.0 bits: 661.6 E(32554): 3.9e-190
Smith-Waterman score: 2773; 99.8% identity (100.0% similar) in 419 aa overlap (1-419:1-419)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MRGLLVLSVLLGAVFGKEDFVGHQVLRISVADEAQVQKVKELEDLEHLQLDFWRGPAHPG
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CCDS58 MRGLLVLSVLLGAVFGKEDFVGHQVLRISVADEAQVQKVKELEDLEHLQLDFWRGPAHPG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 SPIDVRVPFPSIQAVKIFLESHGISYETMIEDVQSLLDEEQEQMFAFRSRARSTDTFNYA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SPIDVRVPFPSIQAVKIFLESHGISYETMIEDVQSLLDEEQEQMFAFRSRARSTDTFNYA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 TYHTLEEIYDFLDLLVAENPHLVSKIQIGNTYEGRPIYVLKFSTGGSKRPAIWIDTGIHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 TYHTLEEIYDFLDLLVAENPHLVSKIQIGNTYEGRPIYVLKFSTGGSKRPAIWIDTGIHS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 REWVTQASGVWFAKKITQDYGQDAAFTAILDTLDIFLEIVTNPDGFAFTHSTNRMWRKTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 REWVTQASGVWFAKKITQDYGQDAAFTAILDTLDIFLEIVTNPDGFAFTHSTNRMWRKTR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SHTAGSLCIGVDPNRNWDAGFGLSGASSNPCSETYRGKFANSEVEVKSIVDFVKDHGNIK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SHTAGSLCIGVDPNRNWDAGFGLSGASSNPCSETYHGKFANSEVEVKSIVDFVKDHGNIK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 AFISIHSYSQLLMYPYGYKTEPVPDQDELDQLSKAAVTALASLYGTKFNYGSIIKAIYQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 AFISIHSYSQLLMYPYGYKTEPVPDQDELDQLSKAAVTALASLYGTKFNYGSIIKAIYQA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410
pF1KE5 SGSTIDWTYSQGIKYSFTFELRDTGRYGFLLPASQIIPTAKETWLALLTIMEHTLNHPY
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SGSTIDWTYSQGIKYSFTFELRDTGRYGFLLPASQIIPTAKETWLALLTIMEHTLNHPY
370 380 390 400 410
>>CCDS5817.2 CPA2 gene_id:1358|Hs108|chr7 (419 aa)
initn: 1608 init1: 1229 opt: 1808 Z-score: 2299.2 bits: 434.4 E(32554): 9.6e-122
Smith-Waterman score: 1808; 62.5% identity (86.2% similar) in 419 aa overlap (1-419:3-419)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MRGLLVLSVLLGAVFGKEDFVGHQVLRISVADEAQVQKVKELEDLEHLQLDFWRGPAH
:: .: ...:.: .. : ::: :::.: ..: :.... .:: ::::::::..:.
CCDS58 MAMRLILFFGALFGHIYCLETFVGDQVLEIVPSNEEQIKNLLQLEAQEHLQLDFWKSPTT
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 PGSPIDVRVPFPSIQAVKIFLESHGISYETMIEDVQSLLDEEQEQMFAFRSRARSTDTFN
:: ::::: ..::::.::::.::.: :::::: :::.:.:.:. : : :: . ::
CCDS58 PGETAHVRVPFVNVQAVKVFLESQGIAYSIMIEDVQVLLDKENEEMLFNRRRERSGN-FN
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 YATYHTLEEIYDFLDLLVAENPHLVSKIQIGNTYEGRPIYVLKFSTGGSKRPAIWIDTGI
...::::::: . .: ::::.: ::::..::...:.::. ::::::::.: ::::.:.::
CCDS58 FGAYHTLEEISQEMDNLVAEHPGLVSKVNIGSSFENRPMNVLKFSTGGDK-PAIWLDAGI
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 HSREWVTQASGVWFAKKITQDYGQDAAFTAILDTLDIFLEIVTNPDGFAFTHSTNRMWRK
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CCDS58 HAREWVTQATALWTANKIVSDYGKDPSITSILDALDIFLLPVTNPDGYVFSQTKNRMWRK
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 TRSHTAGSLCIGVDPNRNWDAGFGLSGASSNPCSETYRGKFANSEVEVKSIVDFVKDHGN
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CCDS58 TRSKVSGSLCVGVDPNRNWDAGFGGPGASSNPCSDSYHGPSANSEVEVKSIVDFIKSHGK
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 IKAFISIHSYSQLLMYPYGYKTEPVPDQDELDQLSKAAVTALASLYGTKFNYGSIIKAIY
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CCDS58 VKAFITLHSYSQLLMFPYGYKCTKLDDFDELSEVAQKAAQSLRSLHGTKYKVGPICSVIY
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 QASGSTIDWTYSQGIKYSFTFELRDTGRYGFLLPASQIIPTAKETWLALLTIMEHTLNHP
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CCDS58 QASGGSIDWSYDYGIKYSFAFELRDTGRYGFLLPARQILPTAEETWLGLKAIMEHVRDHP
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 Y
:
CCDS58 Y
>>CCDS5819.1 CPA5 gene_id:93979|Hs108|chr7 (436 aa)
initn: 1761 init1: 1761 opt: 1761 Z-score: 2239.1 bits: 423.4 E(32554): 2.1e-118
Smith-Waterman score: 1761; 60.0% identity (84.0% similar) in 418 aa overlap (2-419:19-436)
10 20 30 40
pF1KE5 MRGLLVLSVLLGAVFGKEDFVGHQVLRISVADEAQVQKVKELE
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CCDS58 MQGTPGGGTRPGPSPVDRRTLLVFSFILAAALGQMNFTGDQVLRVLAKDEKQLSLLGDLE
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE5 DLEHLQLDFWRGPAHPGSPIDVRVPFPSIQAVKIFLESHGISYETMIEDVQSLLDEEQEQ
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CCDS58 GLKPQKVDFWRGPARPSLPVDMRVPFSELKDIKAYLESHGLAYSIMIKDIQVLLDEERQA
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE5 MFAFRSRARSTDTFNYATYHTLEEIYDFLDLLVAENPHLVSKIQIGNTYEGRPIYVLKFS
: : :::..:.:..::::::::...: .: :. .::::::::..:.. : :::::
CCDS58 MAKSRRLERSTNSFSYSSYHTLEEIYSWIDNFVMEHSDIVSKIQIGNSFENQSILVLKFS
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE5 TGGSKRPAIWIDTGIHSREWVTQASGVWFAKKITQDYGQDAAFTAILDTLDIFLEIVTNP
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CCDS58 TGGSRHPAIWIDTGIHSREWITHATGIWTANKIVSDYGKDRVLTDILNAMDIFIELVTNP
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE5 DGFAFTHSTNRMWRKTRSHTAGSLCIGVDPNRNWDAGFGLSGASSNPCSETYRGKFANSE
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CCDS58 DGFAFTHSMNRLWRKNKSIRPGIFCIGVDLNRNWKSGFGGNGSNSNPCSETYHGPSPQSE
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KE5 VEVKSIVDFVKDHGNIKAFISIHSYSQLLMYPYGYKTEPVPDQDELDQLSKAAVTALASL
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CCDS58 PEVAAIVNFITAHGNFKALISIHSYSQMLMYPYGRLLEPVSNQRELYDLAKDAVEALYKV
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KE5 YGTKFNYGSIIKAIYQASGSTIDWTYSQGIKYSFTFELRDTGRYGFLLPASQIIPTAKET
.: .. .::: ..: ::: :.::.:..::::.:.:::::::.:::::::.::::::.::
CCDS58 HGIEYIFGSISTTLYVASGITVDWAYDSGIKYAFSFELRDTGQYGFLLPATQIIPTAQET
370 380 390 400 410 420
410
pF1KE5 WLALLTIMEHTLNHPY
:.:: :::::::::::
CCDS58 WMALRTIMEHTLNHPY
430
>>CCDS5818.1 CPA4 gene_id:51200|Hs108|chr7 (421 aa)
initn: 1595 init1: 1131 opt: 1622 Z-score: 2062.5 bits: 390.6 E(32554): 1.5e-108
Smith-Waterman score: 1622; 54.2% identity (84.8% similar) in 421 aa overlap (1-419:1-421)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MRGLLVLSVLLGA-VFGKEDFVGHQVLRISVADEAQVQKVKELEDLEHLQLDFWRGPAHP
:: .: ...:.:. . :.: : : :::::.: . ...:...: . ..:.:.::..:.
CCDS58 MRWILFIGALIGSSICGQEKFFGDQVLRINVRNGDEISKLSQLVNSNNLKLNFWKSPSSF
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 GSPIDVRVPFPSIQAVKIFLESHGISYETMIEDVQSLLDEEQEQMFAFRSRARSTDTFNY
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CCDS58 NRPVDVLVPSVSLQAFKSFLRSQGLEYAVTIEDLQALLDNEDDEMQHNEGQERSSNNFNY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 ATYHTLEEIYDFLDLLVAENPHLVSKIQIGNTYEGRPIYVLKFSTG-GSKRPAIWIDTGI
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CCDS58 GAYHSLEAIYHEMDNIAADFPDLARRVKIGHSFENRPMYVLKFSTGKGVRRPAVWLNAGI
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 HSREWVTQASGVWFAKKITQDYGQDAAFTAILDTLDIFLEIVTNPDGFAFTHSTNRMWRK
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CCDS58 HSREWISQATAIWTARKIVSDYQRDPAITSILEKMDIFLLPVANPDGYVYTQTQNRLWRK
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 TRSHTAGSLCIGVDPNRNWDAGFGLSGASSNPCSETYRGKFANSEVEVKSIVDFVKDHGN
:::.. :: :::.::::::.:.:. .:::.:::::.:.: :::::::::.:::.. :::
CCDS58 TRSRNPGSSCIGADPNRNWNASFAGKGASDNPCSEVYHGPHANSEVEVKSVVDFIQKHGN
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 IKAFISIHSYSQLLMYPYGYKTEPVPDQDELDQLSKAAVTALASLYGTKFNYGSIIKAIY
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CCDS58 FKGFIDLHSYSQLLMYPYGYSVKKAPDAEELDKVARLAAKALASVSGTEYQVGPTCTTVY
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 QASGSTIDWTYSQGIKYSFTFELRDTGRYGFLLPASQIIPTAKETWLALLTIMEHTLNHP
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CCDS58 PASGSSIDWAYDNGIKFAFTFELRDTGTYGFLLPANQIIPTAEETWLGLKTIMEHVRDNL
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 Y
:
CCDS58 Y
>>CCDS47713.1 CPA5 gene_id:93979|Hs108|chr7 (403 aa)
initn: 1355 init1: 1355 opt: 1355 Z-score: 1723.1 bits: 327.8 E(32554): 1.2e-89
Smith-Waterman score: 1355; 58.5% identity (82.9% similar) in 328 aa overlap (2-329:19-346)
10 20 30 40
pF1KE5 MRGLLVLSVLLGAVFGKEDFVGHQVLRISVADEAQVQKVKELE
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CCDS47 MQGTPGGGTRPGPSPVDRRTLLVFSFILAAALGQMNFTGDQVLRVLAKDEKQLSLLGDLE
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE5 DLEHLQLDFWRGPAHPGSPIDVRVPFPSIQAVKIFLESHGISYETMIEDVQSLLDEEQEQ
:. ..:::::::.:. :.:.:::: .. .: .:::::..: ::.:.: :::::..
CCDS47 GLKPQKVDFWRGPARPSLPVDMRVPFSELKDIKAYLESHGLAYSIMIKDIQVLLDEERQA
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE5 MFAFRSRARSTDTFNYATYHTLEEIYDFLDLLVAENPHLVSKIQIGNTYEGRPIYVLKFS
: : :::..:.:..::::::::...: .: :. .::::::::..:.. : :::::
CCDS47 MAKSRRLERSTNSFSYSSYHTLEEIYSWIDNFVMEHSDIVSKIQIGNSFENQSILVLKFS
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE5 TGGSKRPAIWIDTGIHSREWVTQASGVWFAKKITQDYGQDAAFTAILDTLDIFLEIVTNP
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CCDS47 TGGSRHPAIWIDTGIHSREWITHATGIWTANKIVSDYGKDRVLTDILNAMDIFIELVTNP
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE5 DGFAFTHSTNRMWRKTRSHTAGSLCIGVDPNRNWDAGFGLSGASSNPCSETYRGKFANSE
:::::::: ::.:::..: : .::::: :::: .::: .:..::::::::.: .::
CCDS47 DGFAFTHSMNRLWRKNKSIRPGIFCIGVDLNRNWKSGFGGNGSNSNPCSETYHGPSPQSE
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KE5 VEVKSIVDFVKDHGNIKAFISIHSYSQLLMYPYGYKTEPVPDQDELDQLSKAAVTALASL
:: .::.:. :::.::.::::::::.:::::: ::: .: ::
CCDS47 PEVAAIVNFITAHGNFKALISIHSYSQMLMYPYGRLLEPVSNQRELMWPVGSPSTGPMTV
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KE5 YGTKFNYGSIIKAIYQASGSTIDWTYSQGIKYSFTFELRDTGRYGFLLPASQIIPTAKET
CCDS47 ASSTPSALSSGTLGSMASCCRPHRSSPRPRRRGWRFGPSWSTP
370 380 390 400
>>CCDS55163.1 CPA4 gene_id:51200|Hs108|chr7 (388 aa)
initn: 1362 init1: 1131 opt: 1282 Z-score: 1630.5 bits: 310.6 E(32554): 1.7e-84
Smith-Waterman score: 1451; 50.8% identity (78.1% similar) in 421 aa overlap (1-419:1-388)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MRGLLVLSVLLGA-VFGKEDFVGHQVLRISVADEAQVQKVKELEDLEHLQLDFWRGPAHP
:: .: ...:.:. . :.: : : :::::.: . ...:...: . ..:.:.::..:.
CCDS55 MRWILFIGALIGSSICGQEKFFGDQVLRINVRNGDEISKLSQLVNSNNLKLNFWKSPSSF
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 GSPIDVRVPFPSIQAVKIFLESHGISYETMIEDVQSLLDEEQEQMFAFRSRARSTDTFNY
. :.:: :: :.:: : ::.:.:. : . :::.:
CCDS55 NRPVDVLVPSVSLQAFKSFLRSQGLEYAVTIEDLQ-------------------------
70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 ATYHTLEEIYDFLDLLVAENPHLVSKIQIGNTYEGRPIYVLKFSTG-GSKRPAIWIDTGI
:: .: ..:. : :. ...::...:.::.:::::::: : .:::.:...::
CCDS55 --------IYHEMDNIAADFPDLARRVKIGHSFENRPMYVLKFSTGKGVRRPAVWLNAGI
100 110 120 130 140
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 HSREWVTQASGVWFAKKITQDYGQDAAFTAILDTLDIFLEIVTNPDGFAFTHSTNRMWRK
:::::..::...: :.::..:: .: :.:.::. .:::: :.::::...:.. ::.:::
CCDS55 HSREWISQATAIWTARKIVSDYQRDPAITSILEKMDIFLLPVANPDGYVYTQTQNRLWRK
150 160 170 180 190 200
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 TRSHTAGSLCIGVDPNRNWDAGFGLSGASSNPCSETYRGKFANSEVEVKSIVDFVKDHGN
:::.. :: :::.::::::.:.:. .:::.:::::.:.: :::::::::.:::.. :::
CCDS55 TRSRNPGSSCIGADPNRNWNASFAGKGASDNPCSEVYHGPHANSEVEVKSVVDFIQKHGN
210 220 230 240 250 260
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 IKAFISIHSYSQLLMYPYGYKTEPVPDQDELDQLSKAAVTALASLYGTKFNYGSIIKAIY
.:.::..:::::::::::::... .:: .:::.... :. ::::. ::... : ..:
CCDS55 FKGFIDLHSYSQLLMYPYGYSVKKAPDAEELDKVARLAAKALASVSGTEYQVGPTCTTVY
270 280 290 300 310 320
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 QASGSTIDWTYSQGIKYSFTFELRDTGRYGFLLPASQIIPTAKETWLALLTIMEHTLNHP
::::.:::.:..:::..::::::::: :::::::.::::::.::::.: :::::. ..
CCDS55 PASGSSIDWAYDNGIKFAFTFELRDTGTYGFLLPANQIIPTAEETWLGLKTIMEHVRDNL
330 340 350 360 370 380
pF1KE5 Y
:
CCDS55 Y
>>CCDS33874.1 CPB1 gene_id:1360|Hs108|chr3 (417 aa)
initn: 958 init1: 549 opt: 1150 Z-score: 1462.0 bits: 279.5 E(32554): 4.1e-75
Smith-Waterman score: 1150; 43.0% identity (72.7% similar) in 421 aa overlap (4-419:6-417)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MRGLLVLSVLLGAVFGKEDFVGHQVLRISVADEAQVQKVKELEDLEHLQLDFWRGPA-
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CCDS33 MLALLVLVTVALASAHHGGEHFEGEKVFRVNVEDENHINIIRELASTT--QIDFWKPDSV
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 ---HPGSPIDVRVPFPSIQAVKIFLESHGISYETMIEDVQSLLDEEQEQMFAFRSRARST
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CCDS33 TQIKPHSTVDFRVKAEDTVTVENVLKQNELQYKVLISNLRNVVEAQ------FDSRVRAT
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 DTFNYATYHTLEEIYDFLDLLVAENPHLVSKIQIGNTYEGRPIYVLKFSTGGSKRPAIWI
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CCDS33 G-HSYEKYNKWETIEAWTQQVATENPALISRSVIGTTFEGRAIYLLKVGKAGQNKPAIFM
120 130 140 150 160 170
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pF1KE5 DTGIHSREWVTQASGVWFAKKITQDYGQDAAFTAILDTLDIFLEIVTNPDGFAFTHSTNR
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CCDS33 DCGFHAREWISPAFCQWFVREAVRTYGREIQVTELLDKLDFYVLPVLNIDGYIYTWTKSR
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pF1KE5 MWRKTRSHTAGSLCIGVDPNRNWDAGFGLSGASSNPCSETYRGKFANSEVEVKSIVDFVK
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CCDS33 FWRKTRSTHTGSSCIGTDPNRNFDAGWCEIGASRNPCDETYCGPAAESEKETKALADFIR
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pF1KE5 DH-GNIKAFISIHSYSQLLMYPYGYKTEPVPDQDELDQLSKAAVTALASLYGTKFNYGSI
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CCDS33 NKLSSIKAYLTIHSYSQMMIYPYSYAYKLGENNAELNALAKATVKELASLHGTKYTYGPG
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pF1KE5 IKAIYQASGSTIDWTYSQGIKYSFTFELRDTGRYGFLLPASQIIPTAKETWLALLTIMEH
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CCDS33 ATTIYPAAGGSDDWAYDQGIRYSFTFELRDTGRYGFLLPESQIRATCEETFLAIKYVASY
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 TLNHPY
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CCDS33 VLEHLY
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10 20 30 40 50
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CCDS31 MRLILPVGLIATTLAIAPVRFDRE-----KVFRVKPQDEKQADIIKDLAKTN--ELDFWY
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pF1KE5 -GPAHPGSP---IDVRVPFPSIQAVKIFLESHGISYETMIEDVQSLLDEEQEQMFAFRSR
: .: . .: :: ::.. :... . :: .:.:.: :: :..: .
CCDS31 PGATHHVAANMMVDFRVSEKESQAIQSALDQNKMHYEILIHDLQ----EEIEKQFDVKED
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pF1KE5 ARSTDTFNYATYHTLEEIYDFLDLLVAENPHLVSKIQIGNTYEGRPIYVLKFSTGGSKRP
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CCDS31 AIFTDCGIHAREWVSPAFCQWFVYQATKTYGRNKIMTKLLDRMNFYILPVFNVDGYIWSW
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CCDS31 TKNRMWRKNRSKNQNSKCIGTDLNRNFNASWNSIPNTNDPCADNYRGSAPESEKETKAVT
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CCDS31 NFIRSHLNEIKVYITFHSYSQMLLFPYGYTSKLPPNHEDLAKVAKIGTDVLSTRYETRYI
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pF1KE5 YGSIIKAIYQASGSTIDWTYSQGIKYSFTFELRDTGRYGFLLPASQIIPTAKETWLALLT
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CCDS31 YGPIESTIYPISGSSLDWAYDLGIKHTFAFELRDKGKFGFLLPESRIKPTCRETMLAVKF
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410
pF1KE5 IMEHTLNHPY
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CCDS31 IAKYILKHTS
410
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10 20 30 40
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CCDS62 TQRNR-RSLSGYNYEVYHSLEEIQNWMHHLNKTHSGLIHMFSIGRSYEGRSLFILKLGRR
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CCDS62 SRLKRAVWIDCGIHAREWIGPAFCQWFVKEALLTYKSDPAMRKMLNHLYFYIMPVFNVDG
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230 240 250 260 270 280
pF1KE5 FAFTHSTNRMWRKTRSHTAGSLCIGVDPNRNWDAGFGLSGASSNPCSETYRGKFANSEVE
. :. ...:.::::::... : ::: :::: . . ::: .::..:: : : .:: :
CCDS62 YHFSWTNDRFWRKTRSRNSRFRCRGVDANRNWKVKWCDEGASMHPCDDTYCGPFPESEPE
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290 300 310 320 330 340
pF1KE5 VKSIVDFVKDH-GNIKAFISIHSYSQLLMYPYGYKTEPVPDQDELDQLSKAAVTALASLY
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CCDS62 VKAVANFLRKHRKHIRAYLSFHAYAQMLLYPYSYKYATIPNFRCVESAAYKAVNALQSVY
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CCDS62 GVRYRYGPASTTLYVSSGSSMDWAYKNGIPYAFAFELRDTGYFGFLLPEMLIKPTCTETM
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CCDS62 LAVKNITMHLLKKCP
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>>CCDS9401.1 CPB2 gene_id:1361|Hs108|chr13 (423 aa)
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CCDS94 MKLCSLAVLVPIVLFCEQHVFAFQSGQVLAALPRTSRQVQVLQNLTTTYEIVLWQ-PVT
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CCDS94 ADLIVKKKQVHFFVNASDVDNVKAHLNVSGIPCSVLLADVEDLI---QQQISNDTVSPRA
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CCDS94 SASY-YEQYHSLNEIYSWIEFITERHPDMLTKIHIGSSFEKYPLYVLKVSGKEQAAKNAI
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CCDS94 WIDCGIHAREWISPAFCLWFIGHITQFYGIIGQYTNLLRLVDFYVMPVVNVDGYDYSWKK
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]