Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5495
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5495, 348 aa
1>>>pF1KE5495 348 - 348 aa - 348 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4978+/-0.00123; mu= 14.9467+/- 0.072
mean_var=166.2487+/-59.001, 0's: 0 Z-trim(101.8): 436 B-trim: 419 in 1/49
Lambda= 0.099471
statistics sampled from 6131 (6664) to 6131 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.54), E-opt: 0.2 (0.205), width: 16
Scan time: 2.150
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31113.1 OR2T4 gene_id:127074|Hs108|chr1 ( 348) 2349 350.3 1.4e-96
CCDS55695.1 OR2T29 gene_id:343563|Hs108|chr1 ( 315) 1896 285.3 4.8e-77
CCDS31118.1 OR2T5 gene_id:401993|Hs108|chr1 ( 315) 1890 284.4 8.7e-77
CCDS31121.1 OR2T10 gene_id:127069|Hs108|chr1 ( 312) 1497 228.0 8.2e-60
CCDS31117.1 OR2T3 gene_id:343173|Hs108|chr1 ( 318) 1394 213.2 2.3e-55
CCDS31120.1 OR2T34 gene_id:127068|Hs108|chr1 ( 318) 1377 210.8 1.3e-54
CCDS31116.1 OR2T2 gene_id:401992|Hs108|chr1 ( 324) 1330 204.1 1.4e-52
CCDS31123.1 OR2T35 gene_id:403244|Hs108|chr1 ( 323) 1318 202.3 4.5e-52
CCDS31124.1 OR2T27 gene_id:403239|Hs108|chr1 ( 317) 1301 199.9 2.4e-51
CCDS31115.1 OR2T1 gene_id:26696|Hs108|chr1 ( 369) 1280 197.0 2.1e-50
CCDS31114.1 OR2T6 gene_id:254879|Hs108|chr1 ( 308) 1219 188.1 8.3e-48
CCDS31109.1 OR2T33 gene_id:391195|Hs108|chr1 ( 320) 1152 178.5 6.7e-45
CCDS31106.1 OR2M2 gene_id:391194|Hs108|chr1 ( 347) 1147 177.8 1.1e-44
CCDS31100.1 OR2T8 gene_id:343172|Hs108|chr1 ( 312) 1128 175.0 7.1e-44
CCDS31107.1 OR2M3 gene_id:127062|Hs108|chr1 ( 312) 1109 172.3 4.7e-43
CCDS31110.1 OR2T12 gene_id:127064|Hs108|chr1 ( 320) 1104 171.6 7.9e-43
CCDS31108.1 OR2M4 gene_id:26245|Hs108|chr1 ( 311) 1102 171.3 9.5e-43
CCDS31111.1 OR2M7 gene_id:391196|Hs108|chr1 ( 312) 1102 171.3 9.5e-43
CCDS31105.1 OR2M5 gene_id:127059|Hs108|chr1 ( 312) 1101 171.2 1e-42
CCDS4461.1 OR2V2 gene_id:285659|Hs108|chr5 ( 315) 1086 169.0 4.7e-42
CCDS58992.1 OR2V1 gene_id:26693|Hs108|chr5 ( 315) 1071 166.9 2.1e-41
CCDS31103.1 OR2L2 gene_id:26246|Hs108|chr1 ( 312) 1061 165.4 5.6e-41
CCDS31104.1 OR2L3 gene_id:391192|Hs108|chr1 ( 312) 1051 164.0 1.5e-40
CCDS58068.1 OR2L5 gene_id:81466|Hs108|chr1 ( 312) 1036 161.8 6.7e-40
CCDS1637.1 OR2L13 gene_id:284521|Hs108|chr1 ( 312) 1009 158.0 9.9e-39
CCDS31413.1 OR2AG2 gene_id:338755|Hs108|chr11 ( 316) 1007 157.7 1.2e-38
CCDS31414.1 OR2AG1 gene_id:144125|Hs108|chr11 ( 316) 1006 157.5 1.3e-38
CCDS34696.1 OR2AE1 gene_id:81392|Hs108|chr7 ( 323) 989 155.1 7.4e-38
CCDS32895.1 OR2Z1 gene_id:284383|Hs108|chr19 ( 314) 975 153.1 2.9e-37
CCDS31102.1 OR2AK2 gene_id:391191|Hs108|chr1 ( 335) 954 150.1 2.4e-36
CCDS34364.1 OR10C1 gene_id:442194|Hs108|chr6 ( 312) 919 145.1 7.6e-35
CCDS43670.1 OR2A12 gene_id:346525|Hs108|chr7 ( 310) 904 142.9 3.4e-34
CCDS30898.1 OR10R2 gene_id:343406|Hs108|chr1 ( 335) 888 140.7 1.7e-33
CCDS31416.1 OR2D2 gene_id:120776|Hs108|chr11 ( 308) 886 140.3 2e-33
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 879 139.3 4.1e-33
CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11 ( 330) 879 139.4 4.2e-33
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 877 139.0 5e-33
CCDS30899.1 OR6Y1 gene_id:391112|Hs108|chr1 ( 325) 877 139.1 5.1e-33
CCDS35089.1 OR13C3 gene_id:138803|Hs108|chr9 ( 347) 877 139.1 5.3e-33
CCDS43668.1 OR2A5 gene_id:393046|Hs108|chr7 ( 311) 873 138.5 7.4e-33
CCDS56515.1 OR2A42 gene_id:402317|Hs108|chr7 ( 310) 872 138.3 8.2e-33
CCDS43673.1 OR2A1 gene_id:346528|Hs108|chr7 ( 310) 872 138.3 8.2e-33
CCDS35088.1 OR13C4 gene_id:138804|Hs108|chr9 ( 318) 872 138.3 8.3e-33
CCDS32896.1 OR1M1 gene_id:125963|Hs108|chr19 ( 313) 870 138.0 1e-32
CCDS43672.1 OR2A14 gene_id:135941|Hs108|chr7 ( 310) 869 137.9 1.1e-32
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 868 137.8 1.2e-32
CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 ( 309) 865 137.3 1.6e-32
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 860 136.6 2.7e-32
CCDS34365.1 OR2H2 gene_id:7932|Hs108|chr6 ( 312) 859 136.4 3e-32
CCDS41481.1 OR1C1 gene_id:26188|Hs108|chr1 ( 314) 859 136.4 3e-32
>>CCDS31113.1 OR2T4 gene_id:127074|Hs108|chr1 (348 aa)
initn: 2349 init1: 2349 opt: 2349 Z-score: 1847.6 bits: 350.3 E(32554): 1.4e-96
Smith-Waterman score: 2349; 100.0% identity (100.0% similar) in 348 aa overlap (1-348:1-348)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MDNITWMASHTGWSDFILMGLFRQSKHPMANITWMANHTGWSDFILLGLFRQSKHPALLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MDNITWMASHTGWSDFILMGLFRQSKHPMANITWMANHTGWSDFILLGLFRQSKHPALLC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 VVIFVVFLMALSGNAVLILLIHCDAHLHTPMYFFISQLSLMDMAYISVTVPKMLLDQVMG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VVIFVVFLMALSGNAVLILLIHCDAHLHTPMYFFISQLSLMDMAYISVTVPKMLLDQVMG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 VNKISAPECGMQMFFYVTLAGSEFFLLATMAYDRYVAICHPLRYPVLMNHRVCLFLSSGC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VNKISAPECGMQMFFYVTLAGSEFFLLATMAYDRYVAICHPLRYPVLMNHRVCLFLSSGC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 WFLGSVDGFTFTPITMTFPFRGSREIHHFFCEVPAVLNLSCSDTSLYEIFMYLCCVLMLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 WFLGSVDGFTFTPITMTFPFRGSREIHHFFCEVPAVLNLSCSDTSLYEIFMYLCCVLMLL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 IPVVIISSSYLLILLTIHGMNSAEGRKKAFATCSSHLTVVILFYGAAIYTYMLPSSYHTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 IPVVIISSSYLLILLTIHGMNSAEGRKKAFATCSSHLTVVILFYGAAIYTYMLPSSYHTP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340
pF1KE5 EKDMMVSVFYTILTPVVNPLIYSLRNKDVMGALKKMLTVEPAFQKAME
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 EKDMMVSVFYTILTPVVNPLIYSLRNKDVMGALKKMLTVEPAFQKAME
310 320 330 340
>>CCDS55695.1 OR2T29 gene_id:343563|Hs108|chr1 (315 aa)
initn: 1896 init1: 1896 opt: 1896 Z-score: 1496.7 bits: 285.3 E(32554): 4.8e-77
Smith-Waterman score: 1896; 91.6% identity (95.8% similar) in 311 aa overlap (29-339:1-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MDNITWMASHTGWSDFILMGLFRQSKHPMANITWMANHTGWSDFILLGLFRQSKHPALLC
::::: :::::: ::::.::::::::::::
CCDS55 MANITRMANHTGRLDFILMGLFRQSKHPALLS
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 VVIFVVFLMALSGNAVLILLIHCDAHLHTPMYFFISQLSLMDMAYISVTVPKMLLDQVMG
:::::::: :::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VVIFVVFLKALSGNAVLILLIHCDAHLHSPMYFFISQLSLMDMAYISVTVPKMLLDQVMG
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 VNKISAPECGMQMFFYVTLAGSEFFLLATMAYDRYVAICHPLRYPVLMNHRVCLFLSSGC
:::.::::::::::.:.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::
CCDS55 VNKVSAPECGMQMFLYLTLAGSEFFLLATMAYDRYVAICHPLRYPVLMNHRVCLFLASGC
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 WFLGSVDGFTFTPITMTFPFRGSREIHHFFCEVPAVLNLSCSDTSLYEIFMYLCCVLMLL
::::::::: .:::::.::: : :::::::::::: :::::::::: .::::::::::
CCDS55 WFLGSVDGFMLTPITMSFPFCRSWEIHHFFCEVPAVTILSCSDTSLYETLMYLCCVLMLL
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 IPVVIISSSYLLILLTIHGMNSAEGRKKAFATCSSHLTVVILFYGAAIYTYMLPSSYHTP
:::.::::::::::::.: ::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::
CCDS55 IPVTIISSSYLLILLTVHRMNSAEGRKKAFATCSSHLTVVILFYGAAVYTYMLPSSYHTP
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340
pF1KE5 EKDMMVSVFYTILTPVVNPLIYSLRNKDVMGALKKMLTVEPAFQKAME
::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::
CCDS55 EKDMMVSVFYTILTPVLNPLIYSLRNKDVMGALKKMLTVRFVL
280 290 300 310
>>CCDS31118.1 OR2T5 gene_id:401993|Hs108|chr1 (315 aa)
initn: 1890 init1: 1890 opt: 1890 Z-score: 1492.1 bits: 284.4 E(32554): 8.7e-77
Smith-Waterman score: 1890; 91.3% identity (95.8% similar) in 311 aa overlap (29-339:1-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MDNITWMASHTGWSDFILMGLFRQSKHPMANITWMANHTGWSDFILLGLFRQSKHPALLC
::::: :::::: ::::.::::.:::::::
CCDS31 MANITRMANHTGKLDFILMGLFRRSKHPALLS
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 VVIFVVFLMALSGNAVLILLIHCDAHLHTPMYFFISQLSLMDMAYISVTVPKMLLDQVMG
:::::::: :::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VVIFVVFLKALSGNAVLILLIHCDAHLHSPMYFFISQLSLMDMAYISVTVPKMLLDQVMG
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 VNKISAPECGMQMFFYVTLAGSEFFLLATMAYDRYVAICHPLRYPVLMNHRVCLFLSSGC
:::.::::::::::.:.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::
CCDS31 VNKVSAPECGMQMFLYLTLAGSEFFLLATMAYDRYVAICHPLRYPVLMNHRVCLFLASGC
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 WFLGSVDGFTFTPITMTFPFRGSREIHHFFCEVPAVLNLSCSDTSLYEIFMYLCCVLMLL
::::::::: .:::::.::: : :::::::::::: :::::::::: .::::::::::
CCDS31 WFLGSVDGFMLTPITMSFPFCRSWEIHHFFCEVPAVTILSCSDTSLYETLMYLCCVLMLL
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 IPVVIISSSYLLILLTIHGMNSAEGRKKAFATCSSHLTVVILFYGAAIYTYMLPSSYHTP
:::.::::::::::::.: ::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::
CCDS31 IPVTIISSSYLLILLTVHRMNSAEGRKKAFATCSSHLTVVILFYGAAVYTYMLPSSYHTP
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340
pF1KE5 EKDMMVSVFYTILTPVVNPLIYSLRNKDVMGALKKMLTVEPAFQKAME
::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::
CCDS31 EKDMMVSVFYTILTPVLNPLIYSLRNKDVMGALKKMLTVRFVL
280 290 300 310
>>CCDS31121.1 OR2T10 gene_id:127069|Hs108|chr1 (312 aa)
initn: 1566 init1: 1493 opt: 1497 Z-score: 1187.3 bits: 228.0 E(32554): 8.2e-60
Smith-Waterman score: 1497; 71.6% identity (88.7% similar) in 310 aa overlap (35-343:3-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 TWMASHTGWSDFILMGLFRQSKHPMANITWMANHTGWSDFILLGLFRQSKHPALLCVVIF
.::.: .::.:::.: : .::. ::..::
CCDS31 MRLANQTLGGDFFLLGIFSQISHPGRLCLLIF
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 VVFLMALSGNAVLILLIHCDAHLHTPMYFFISQLSLMDMAYISVTVPKMLLDQVMGVNKI
.::::.: : .:::::: :. :::::::::.::::.:..::::::::::..:. . :
CCDS31 SIFLMAVSWNITLILLIHIDSSLHTPMYFFINQLSLIDLTYISVTVPKMLVNQLAKDKTI
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 SAPECGMQMFFYVTLAGSEFFLLATMAYDRYVAICHPLRYPVLMNHRVCLFLSSGCWFLG
:. :: ::.::. :.:.: :::.::::::::::::::: :::.:::::.:.:::::.:
CCDS31 SVLGCGTQMYFYLQLGGAECCLLAAMAYDRYVAICHPLRYSVLMSHRVCLLLASGCWFVG
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 SVDGFTFTPITMTFPFRGSREIHHFFCEVPAVLNLSCSDTSLYEIFMYLCCVLMLLIPVV
::::: .:::.:.::: :.::.::::::::::.:::::::::.::::::::.::::::.
CCDS31 SVDGFMLTPIAMSFPFCRSHEIQHFFCEVPAVLKLSCSDTSLYKIFMYLCCVIMLLIPVT
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 IISSSYLLILLTIHGMNSAEGRKKAFATCSSHLTVVILFYGAAIYTYMLPSSYHTPEKDM
.:: :: :.:::: :::.:::::::.:::::.::: ::::::::.:::::::.::::::
CCDS31 VISVSYYYIILTIHKMNSVEGRKKAFTTCSSHITVVSLFYGAAIYNYMLPSSYQTPEKDM
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340
pF1KE5 MVSVFYTILTPVVNPLIYSLRNKDVMGALKKMLTVE-PAFQKAME
: : ::::::::.::.:::.::::: ::::::.:. : .
CCDS31 MSSFFYTILTPVLNPIIYSFRNKDVTRALKKMLSVQKPPY
280 290 300 310
>>CCDS31117.1 OR2T3 gene_id:343173|Hs108|chr1 (318 aa)
initn: 1488 init1: 1383 opt: 1394 Z-score: 1107.4 bits: 213.2 E(32554): 2.3e-55
Smith-Waterman score: 1394; 67.4% identity (87.0% similar) in 301 aa overlap (37-337:10-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MASHTGWSDFILMGLFRQSKHPMANITWMANHTGWSDFILLGLFRQSKHPALLCVVIFVV
:.:. .:: : ::: .::: ::: .: :..
CCDS31 MCSGNQTSQNQTASTDFTLTGLFAESKHAALLYTVTFLL
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLMALSGNAVLILLIHCDAHLHTPMYFFISQLSLMDMAYISVTVPKMLLDQVMGVNKISA
:::::.:::.:::::: . .::::::::::::.:::. :. :::::::. :: : . ::
CCDS31 FLMALTGNALLILLIHSEPRLHTPMYFFISQLALMDLMYLCVTVPKMLVGQVTGDDTISP
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 PECGMQMFFYVTLAGSEFFLLATMAYDRYVAICHPLRYPVLMNHRVCLFLSSGCWFLGSV
::.:::::.::::.: ::::.::::::.:.:.::.::.:::.::: .: :.:: :: :
CCDS31 SGCGIQMFFYLTLAGAEVFLLAAMAYDRYAAVCRPLHYPLLMNQRVCQLLVSACWVLGMV
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 DGFTFTPITMTFPFRGSREIHHFFCEVPAVLNLSCSDTSLYEIFMYLCCVLMLLIPVVII
::. .:::::.::: ::.: ::::.::.:.:::::.:::. .:::::.:::: :...:
CCDS31 DGLLLTPITMSFPFCQSRKILSFFCETPALLKLSCSDVSLYKTLMYLCCILMLLAPIMVI
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SSSYLLILLTIHGMNSAEGRKKAFATCSSHLTVVILFYGAAIYTYMLPSSYHTPEKDMMV
:::: ::: :: :::: :..::.::::::. .:.:..::..::::::::::: :.::::
CCDS31 SSSYTLILHLIHRMNSAAGHRKALATCSSHMIIVLLLFGASFYTYMLPSSYHTAEQDMMV
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340
pF1KE5 SVFYTILTPVVNPLIYSLRNKDVMGALKKMLTVEPAFQKAME
:.::::.:::.:::::::::::: ::..:.
CCDS31 SAFYTIFTPVLNPLIYSLRNKDVTRALRSMMQSRMNQEK
280 290 300 310
>>CCDS31120.1 OR2T34 gene_id:127068|Hs108|chr1 (318 aa)
initn: 1470 init1: 1366 opt: 1377 Z-score: 1094.2 bits: 210.8 E(32554): 1.3e-54
Smith-Waterman score: 1377; 66.8% identity (86.7% similar) in 301 aa overlap (37-337:10-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MASHTGWSDFILMGLFRQSKHPMANITWMANHTGWSDFILLGLFRQSKHPALLCVVIFVV
:.:. .:: : ::: .::: ::: .: :..
CCDS31 MCSGNQTSQNQTASTDFTLTGLFAESKHAALLYTVTFLL
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLMALSGNAVLILLIHCDAHLHTPMYFFISQLSLMDMAYISVTVPKMLLDQVMGVNKISA
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CCDS31 FLMALTGNALLILLIHSEPRLHTPMYFFISQLALMDLMYLCVTVPKMLVGQVTGDDTISP
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 PECGMQMFFYVTLAGSEFFLLATMAYDRYVAICHPLRYPVLMNHRVCLFLSSGCWFLGSV
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CCDS31 SGCGIQMFFHLTLAGAEVFLLAAMAYDRYAAVCRPLHYPLLMNQRVCQLLVSACWVLGMV
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 DGFTFTPITMTFPFRGSREIHHFFCEVPAVLNLSCSDTSLYEIFMYLCCVLMLLIPVVII
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CCDS31 DGLLLTPITMSFPFCQSRKILSFFCETPALLKLSCSDVSLYKMLTYLCCILMLLTPIMVI
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SSSYLLILLTIHGMNSAEGRKKAFATCSSHLTVVILFYGAAIYTYMLPSSYHTPEKDMMV
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CCDS31 SSSYTLILHLIHRMNSAAGRRKALATCSSHMIIVLLLFGASFYTYMLRSSYHTAEQDMMV
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340
pF1KE5 SVFYTILTPVVNPLIYSLRNKDVMGALKKMLTVEPAFQKAME
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CCDS31 SAFYTIFTPVLNPLIYSLRNKDVTRALRSMMQSRMNQEK
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20 30 40 50 60 70
pF1KE5 GWSDFILMGLFRQSKHPMANITWMANHTGWSDFILLGLFRQSKHPALLCVVIFVVFLMAL
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CCDS31 MGMEGLLQNSTNFVLTGLITHPAFPGLLFAIVFSIFVVAI
10 20 30 40
80 90 100 110 120 130
pF1KE5 SGNAVLILLIHCDAHLHTPMYFFISQLSLMDMAYISVTVPKMLLDQVMGVNKISAPECGM
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CCDS31 TANLVMILLIHMDSRLHTPMYFLLSQLSIMDTIYICITVPKMLQDLLSKDKTISFLGCAV
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140 150 160 170 180 190
pF1KE5 QMFFYVTLAGSEFFLLATMAYDRYVAICHPLRYPVLMNHRVCLFLSSGCWFLGSVDGFTF
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CCDS31 QIFLYLTLIGGEFFLLGLMAYDRYVAVCNPLRYPLLMNRRVCLFMVVGSWVGGSLDGFML
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pF1KE5 TPITMTFPFRGSREIHHFFCEVPAVLNLSCSDTSLYEIFMYLCCVLMLLIPVVIISSSYL
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CCDS31 TPVTMSFPFCRSREINHFFCEIPAVLKLSCTDTSLYETLMYACCVLMLLIPLSVISVSYT
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260 270 280 290 300 310
pF1KE5 LILLTIHGMNSAEGRKKAFATCSSHLTVVILFYGAAIYTYMLPSSYHTPEKDMMVSVFYT
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CCDS31 HILLTVHRMNSAEGRRKAFATCSSHIMVVSVFYGAAFYTNVLPHSYHTPEKDKVVSAFYT
230 240 250 260 270 280
320 330 340
pF1KE5 ILTPVVNPLIYSLRNKDVMGALKKMLTVEPAFQKAME
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CCDS31 ILTPMLNPLIYSLRNKDVAAALRKVLGRCGSSQSIRVATVIRKG
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>>CCDS31123.1 OR2T35 gene_id:403244|Hs108|chr1 (323 aa)
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Smith-Waterman score: 1318; 65.2% identity (84.8% similar) in 296 aa overlap (42-337:11-305)
20 30 40 50 60 70
pF1KE5 GWSDFILMGLFRQSKHPMANITWMANHTGWSDFILLGLFRQSKHPALLCVVIFVVFLMAL
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CCDS31 MGMEGLLQNSTNFVLTGLITHPAFPGLLFAVVFSIFVVAI
10 20 30 40
80 90 100 110 120 130
pF1KE5 SGNAVLILLIHCDAHLHTPMYFFISQLSLMDMAYISVTVPKMLLDQVMGVNKISAPECGM
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CCDS31 TANLVMILLIHMDSRLHTPMYFLLSQLSIMDTIYICITVPKMLQDLLSKDKTISFLGCAV
50 60 70 80 90 100
140 150 160 170 180 190
pF1KE5 QMFFYVTLAGSEFFLLATMAYDRYVAICHPLRYPVLMNHRVCLFLSSGCWFLGSVDGFTF
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CCDS31 QIF-YLTLIGGEFFLLGLMAYDRYVAVCNPLRYPLLMNRRVCLFMVVGSWVGGSLDGFML
110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KE5 TPITMTFPFRGSREIHHFFCEVPAVLNLSCSDTSLYEIFMYLCCVLMLLIPVVIISSSYL
::.::.::: ::::.:::::.::::.:::.:::::: .:: :::::::::. .:: ::
CCDS31 TPVTMSFPFCRSREINHFFCEIPAVLKLSCTDTSLYETLMYACCVLMLLIPLSVISVSYT
160 170 180 190 200 210
260 270 280 290 300 310
pF1KE5 LILLTIHGMNSAEGRKKAFATCSSHLTVVILFYGAAIYTYMLPSSYHTPEKDMMVSVFYT
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CCDS31 HILLTVHRMNSAEGRRKAFATCSSHIMVVSVFYGAAFYTNVLPHSYHTPEKDKVVSAFYT
220 230 240 250 260 270
320 330 340
pF1KE5 ILTPVVNPLIYSLRNKDVMGALKKMLTVEPAFQKAME
::::..:::::::::::: .::.:.:
CCDS31 ILTPMLNPLIYSLRNKDVAAALRKVLGRCGSSQSIRVATVIRKG
280 290 300 310 320
>>CCDS31124.1 OR2T27 gene_id:403239|Hs108|chr1 (317 aa)
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pF1KE5 WMASHTGWSDFILMGLFRQSKHPMANITWMANHTGWSDFILLGLFRQSKHPALLCVVIFV
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CCDS31 MEQSNYSVYADFILLGLFSNARFPWLLFALILL
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 VFLMALSGNAVLILLIHCDAHLHTPMYFFISQLSLMDMAYISVTVPKMLLDQVMGVNKIS
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CCDS31 VFLTSIASNVVKIILIHIDSRLHTPMYFLLSQLSLRDILYISTIVPKMLVDQVMSQRAIS
40 50 60 70 80 90
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pF1KE5 APECGMQMFFYVTLAGSEFFLLATMAYDRYVAICHPLRYPVLMNHRVCLFLSSGCWFLGS
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CCDS31 FAGCTAQHFLYLTLAGAEFFLLGLMSYDRYVAICNPLHYPVLMSRKICWLIVAAAWLGGS
100 110 120 130 140 150
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pF1KE5 VDGFTFTPITMTFPFRGSREIHHFFCEVPAVLNLSCSDTSLYEIFMYLCCVLMLLIPVVI
.::: .::.:: ::: .::::.::::::::.:.:::.::: :: ::.::..::::: .
CCDS31 IDGFLLTPVTMQFPFCASREINHFFCEVPALLKLSCTDTSAYETAMYVCCIMMLLIPFSV
160 170 180 190 200 210
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CCDS31 ISGSYTRILITVYRMSEAEGRGKAVATCSSHMVVVSLFYGAAMYTYVLPHSYHTPEQDKA
220 230 240 250 260 270
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pF1KE5 VSVFYTILTPVVNPLIYSLRNKDVMGALKKMLTVEPAFQKAME
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CCDS31 VSAFYTILTPMLNPLIYSLRNKDVTGALQKVVGRCVSSGKVTTF
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10 20 30
pF1KE5 MDNITWMASHTGWSDFILMGLFRQSKHPMANITW
. : : :. . .: : . .
CCDS31 MWQEYYFLNVFFPLLKVCCLTINSHVVILLPWECYHLIWKILPYIGTTVGSMEEY-----
10 20 30 40 50
40 50 60 70 80 90
pF1KE5 MANHTGWSDFILLGLFRQSKHPALLCVVIFVVFLMALSGNAVLILLIHCDAHLHTPMYFF
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CCDS31 ---NTSSTDFTFMGLFNRKETSGLIFAIISIIFFTALMANGVMIFLIQTDLRLHTPMYFL
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CCDS31 AVLKLACADTALYETVMYVCCVLMLLIPFSVVLASYARILTTVQCMSSVEGRKKAFATCS
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CCDS31 SHMTVVSLFYGAAMYTYMLPHSYHKPAQDKVLSVFYTILTPMLNPLIYSLRNKDVTGALK
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. :
CCDS31 RALGRFKGPQRVSGGVF
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]