Result of FASTA (omim) for
pFN21AE5494
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5494, 348 aa
1>>>pF1KE5494 348 - 348 aa - 348 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1400+/-0.000591; mu= 17.4797+/- 0.036
mean_var=120.2564+/-33.169, 0's: 0 Z-trim(105.4): 383 B-trim: 904 in 1/48
Lambda= 0.116955
statistics sampled from 13073 (13587) to 13073 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.478), E-opt: 0.2 (0.159), width: 16
Scan time: 6.470
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 1033 186.6 6.3e-47
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NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 855 156.6 7e-38
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 855 156.6 7e-38
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 844 154.7 2.6e-37
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 840 154.0 4e-37
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 839 153.9 4.5e-37
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 834 153.0 8.1e-37
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 832 152.7 1e-36
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 832 152.7 1e-36
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 809 148.8 1.5e-35
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 808 148.6 1.7e-35
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 790 145.6 1.4e-34
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 788 145.2 1.8e-34
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 785 144.7 2.5e-34
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 784 144.6 2.8e-34
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 768 141.9 1.8e-33
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 764 141.2 2.9e-33
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 749 138.6 1.6e-32
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 726 134.8 2.5e-31
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 591 112.0 1.8e-24
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 482 93.6 6.2e-19
NP_000667 (OMIM: 600446) adenosine receptor A2b [H ( 332) 251 54.7 3.4e-07
NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 225 50.3 7.3e-06
NP_000530 (OMIM: 136880,180380,610445,613731) rhod ( 348) 217 49.0 1.9e-05
NP_000721 (OMIM: 118444) cholecystokinin receptor ( 428) 212 48.2 3.8e-05
NP_004215 (OMIM: 300207) melatonin-related recepto ( 617) 213 48.6 4.3e-05
NP_000668 (OMIM: 600445) adenosine receptor A3 iso ( 318) 209 47.6 4.6e-05
NP_778237 (OMIM: 608923) trace amine-associated re ( 345) 206 47.1 6.8e-05
NP_003958 (OMIM: 607405) trace amine-associated re ( 337) 205 46.9 7.5e-05
NP_001699 (OMIM: 190900,613522) short-wave-sensiti ( 348) 202 46.4 0.00011
NP_778227 (OMIM: 608282) trace amine-associated re ( 348) 196 45.4 0.00022
NP_000666 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a [H ( 412) 196 45.5 0.00024
NP_001265428 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 196 45.5 0.00024
NP_001265426 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 196 45.5 0.00024
NP_001265429 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 196 45.5 0.00024
NP_001265427 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 196 45.5 0.00024
NP_055441 (OMIM: 604849) trace amine-associated re ( 306) 193 44.8 0.00029
XP_011535421 (OMIM: 275200,603372,603373,609152) P ( 671) 197 46.0 0.00029
NP_063941 (OMIM: 155540,602025,607948) melanocorti ( 323) 193 44.9 0.0003
XP_005268094 (OMIM: 275200,603372,603373,609152) P ( 764) 197 46.0 0.00031
NP_000360 (OMIM: 275200,603372,603373,609152) thyr ( 764) 197 46.0 0.00031
NP_001028252 (OMIM: 604849) trace amine-associated ( 351) 193 44.9 0.00031
NP_004239 (OMIM: 600895) prolactin-releasing pepti ( 370) 193 44.9 0.00032
XP_011521963 (OMIM: 600446) PREDICTED: adenosine r ( 116) 187 43.3 0.00033
NP_444508 (OMIM: 606927) trace amine-associated re ( 342) 192 44.7 0.00035
NP_057658 (OMIM: 126450,159900) D(2) dopamine rece ( 414) 189 44.3 0.00055
XP_016872785 (OMIM: 126450,159900) PREDICTED: D(2) ( 443) 189 44.4 0.00058
NP_000786 (OMIM: 126450,159900) D(2) dopamine rece ( 443) 189 44.4 0.00058
NP_005217 (OMIM: 601965) sphingosine 1-phosphate r ( 378) 188 44.1 0.00059
>>NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C46 [H (309 aa)
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10 20 30 40 50 60
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70 80 90 100 110 120
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pF1KE5 IFTPILNPVMYTLRNKEVKAAMSKLKSRYLKPSQVSVVIRNVLFLETK
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NP_001 MITPMLNPLIYTLKNAQMKNAIRKLCSRKDISGDK
280 290 300
>>XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
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XP_011 CAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAYDRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISS
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pF1KE5 TSQLAFTVNLPFCGPNKVDSFFCDLPLVTKLACIDTYVVSLLIVADSGFLSLSSFLLLVV
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pF1KE5 SYTVILVTV-RNRSSESMAKARSTLTAHITVVTLFFGPCIFIYVWPFSSYSV--DKVLAV
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pF1KE5 FYTIFTPILNPVMYTLRNKEVKAAMSKLKSRYLKPSQVSVVIRNVLFLETK
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XP_011 FYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGAWQKLLWKFSGLTSKLAT
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>>NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [Homo (317 aa)
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Smith-Waterman score: 855; 45.1% identity (73.7% similar) in 304 aa overlap (25-325:1-304)
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pF1KE5 SYTVILVTV-RNRSSESMAKARSTLTAHITVVTLFFGPCIFIYVWPFSSYSV--DKVLAV
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NP_036 SYIQIISTILKIQSREGRKKAFHTCASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSV
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pF1KE5 FYTIFTPILNPVMYTLRNKEVKAAMSKLKSRYLKPSQVSVVIRNVLFLETK
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NP_036 FYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGAWQKLLWKFSGLTSKLAT
280 290 300 310
>>XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
initn: 742 init1: 609 opt: 855 Z-score: 801.1 bits: 156.6 E(85289): 7e-38
Smith-Waterman score: 855; 45.1% identity (73.7% similar) in 304 aa overlap (25-325:1-304)
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pF1KE5 MLTSLTDLCFSPIQVAEIKSLPKSMNETNHSRVTEFVLLGLSSSRELQPFLFLTFSLLYL
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XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYV
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pF1KE5 AILLGNFLIILTVTSDSRLHTPMYFLLASLSFIDVCVASFATPKMIADFLVVRKTIAFDA
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XP_011 VTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMYFFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQS
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pF1KE5 CLAQIFFVHLFTGSEMVLLVSMAYDRYVAICKPLHYMTVMSRRVCVVLVLISWFVGFIHT
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XP_011 CAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAYDRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISS
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pF1KE5 TSQLAFTVNLPFCGPNKVDSFFCDLPLVTKLACIDTYVVSLLIVADSGFLSLSSFLLLVV
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XP_011 PVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCELLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLL
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XP_011 SYIQIISTILKIQSREGRKKAFHTCASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSV
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pF1KE5 FYTIFTPILNPVMYTLRNKEVKAAMSKLKSRYLKPSQVSVVIRNVLFLETK
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XP_011 FYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGAWQKLLWKFSGLTSKLAT
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>>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa)
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Smith-Waterman score: 844; 41.6% identity (74.8% similar) in 310 aa overlap (22-328:8-317)
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pF1KE5 MLTSLTDLCFSPIQVAEIKSLPKSMNETNHSRVTEFVLLGLSSSRELQPFLFLTFSLLYL
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XP_011 MGDRRADPRPMSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYL
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XP_011 ATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCG
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XP_011 CLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNV
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XP_011 LLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILA
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pF1KE5 SYTVILVTV-RNRSSESMAKARSTLTAHITVVTLFFGPCIFIYVWPFSSYSVDK--VLAV
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XP_011 SYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATV
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pF1KE5 FYTIFTPILNPVMYTLRNKEVKAAMSKLKSRYLKPSQVSVVIRNVLFLETK
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XP_011 LYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
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>>NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G1 [H (307 aa)
initn: 855 init1: 615 opt: 840 Z-score: 787.5 bits: 154.0 E(85289): 4e-37
Smith-Waterman score: 840; 41.0% identity (75.0% similar) in 300 aa overlap (29-325:2-301)
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pF1KE5 MLTSLTDLCFSPIQVAEIKSLPKSMNETNHSRVTEFVLLGLSSSRELQPFLFLTFSLLYL
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NP_001 MNHSVVTEFIILGLTKKPELQGIIFLFFLIVYL
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 AILLGNFLIILTVTSDSRLHTPMYFLLASLSFIDVCVASFATPKMIADFLVVRKTIAFDA
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NP_001 VAFLGNMLIIIAKIYNNTLHTPMYVFLLTLAVVDIICTTSIIPKMLGTMLTSENTISYAG
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 CLAQIFFVHLFTGSEMVLLVSMAYDRYVAICKPLHYMTVMSRRVCVVLVLISWFVGFIHT
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NP_001 CMSQLFLFTWSLGAEMVLFTTMAYDRYVAICFPLHYSTIMNHHMCVALLSMVMAIAVTNS
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 TSQLAFTVNLPFCGPNKVDSFFCDLPLVTKLACIDTYVVSLLIVADSGFLSLSSFLLLVV
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NP_001 WVHTALIMRLTFCGPNTIDHFFCEIPPLLALSCSPVRINEVMVYVADITLAIGDFILTCI
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290
pF1KE5 SYTVILVTV-RNRSSESMAKARSTLTAHITVVTLFFGPCIFIYVWPFSSYSV--DKVLAV
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NP_001 SYGFIIVAILRIRTVEGKRKAFSTCSSHLTVVTLYYSPVIYTYIRPASSYTFERDKVVAA
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340
pF1KE5 FYTIFTPILNPVMYTLRNKEVKAAMSKLKSRYLKPSQVSVVIRNVLFLETK
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NP_001 LYTLVTPTLNPMVYSFQNREMQAGIRKVFAFLKH
280 290 300
>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
initn: 757 init1: 617 opt: 839 Z-score: 786.5 bits: 153.9 E(85289): 4.5e-37
Smith-Waterman score: 839; 42.8% identity (70.9% similar) in 306 aa overlap (27-328:5-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MLTSLTDLCFSPIQVAEIKSLPKSMNETNHSRVTEFVLLGLSSSRELQPFLFLTFSLLYL
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NP_006 MEFTDRNYTLVTEFILLGFPTRPELQIVLFLMFLTLYA
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 AILLGNFLIILTVTSDSRLHTPMYFLLASLSFIDVCVASFATPKMIADFLVVRKTIAFDA
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NP_006 IILIGNIGLMLLIRIDPHLQTPMYFFLSNLSFVDLCYFSDIVPKMLVNFLSENKSISYYG
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 CLAQIFFVHLFTGSEMVLLVSMAYDRYVAICKPLHYMTVMSRRVCVVLVLISWFVGFIHT
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NP_006 CALQFYFFCTFADTESFILAAMAYDRYVAICNPLLYTVVMSRGICMRLIVLSYLGGNMSS
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 TSQLAFTVNLPFCGPNKVDSFFCDLPLVTKLACIDTYVVSLLIVADSGFLSLSSFLLLVV
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NP_006 LVHTSFAFILKYCDKNVINHFFCDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFIIIII
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290
pF1KE5 SYTVILVTV-RNRSSESMAKARSTLTAHITVVTLFFGPCIFIYVWPFSSYS--VDKVLAV
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NP_006 SYFFILLSVLKIRSFSGRKKTFSTCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISV
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340
pF1KE5 FYTIFTPILNPVMYTLRNKEVKAAMSK-LKSRYLKPSQVSVVIRNVLFLETK
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NP_006 FYTIFIPVLNPLIYSLRNKDVKDAAEKVLRSKVDSS
280 290 300 310
>>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo (314 aa)
initn: 735 init1: 600 opt: 834 Z-score: 782.0 bits: 153.0 E(85289): 8.1e-37
Smith-Waterman score: 834; 42.3% identity (72.6% similar) in 307 aa overlap (25-328:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MLTSLTDLCFSPIQVAEIKSLPKSMNETNHSRVTEFVLLGLSSSRELQPFLFLTFSLLYL
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NP_003 MTRKNYTSLTEFVLLGLADTLELQIILFLFFLVIYT
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 AILLGNFLIILTVTSDSRLHTPMYFLLASLSFIDVCVASFATPKMIADFLVVRKTIAFDA
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NP_003 LTVLGNLGMILLIRIDSQLHTPMYFFLANLSFVDVCNSTTITPKMLADLLSEKKTISFAG
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 CLAQIFFVHLFTGSEMVLLVSMAYDRYVAICKPLHYMTVMSRRVCVVLVLISWFVGFIHT
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NP_003 CFLQMYFFISLATTECILFGLMAYDRYAAICRPLLYSLIMSRTVYLKMAAGAFAAGLLNF
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 TSQLAFTVNLPFCGPNKVDSFFCDLPLVTKLACIDTYVVSLLIVADSGFLSLSSFLLLVV
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NP_003 MVNTSHVSSLSFCDSNVIHHFFCDSPPLFKLSCSDTILKESISSILAGVNIVGTLLVILS
160 170 180 190 200 210
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pF1KE5 SYTVILVTVRN-RSSESMAKARSTLTAHITVVTLFFGPCIFIYVWPFSSYSV--DKVLAV
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NP_003 SYSYVLFSIFSMHSGEGRHRAFSTCASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDKVASV
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340
pF1KE5 FYTIFTPILNPVMYTLRNKEVKAAMSKLKSRYLKPSQVSVVIRNVLFLETK
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NP_003 FYTVVIPMLNPLIYSLRSKEVKKALANVISRKRTSSFL
280 290 300 310
>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa)
initn: 861 init1: 646 opt: 832 Z-score: 780.2 bits: 152.7 E(85289): 1e-36
Smith-Waterman score: 832; 41.7% identity (74.9% similar) in 307 aa overlap (25-328:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MLTSLTDLCFSPIQVAEIKSLPKSMNETNHSRVTEFVLLGLSSSRELQPFLFLTFSLLYL
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XP_011 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYL
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 AILLGNFLIILTVTSDSRLHTPMYFLLASLSFIDVCVASFATPKMIADFLVVRKTIAFDA
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XP_011 ATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCG
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 CLAQIFFVHLFTGSEMVLLVSMAYDRYVAICKPLHYMTVMSRRVCVVLVLISWFVGFIHT
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XP_011 CLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNV
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 TSQLAFTVNLPFCGPNKVDSFFCDLPLVTKLACIDTYVVSLLIVADSGFLSLSSFLLLVV
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XP_011 LLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILA
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290
pF1KE5 SYTVILVTV-RNRSSESMAKARSTLTAHITVVTLFFGPCIFIYVWPFSSYSVDK--VLAV
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XP_011 SYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATV
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340
pF1KE5 FYTIFTPILNPVMYTLRNKEVKAAMSKLKSRYLKPSQVSVVIRNVLFLETK
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XP_011 LYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
280 290 300 310
>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
initn: 861 init1: 646 opt: 832 Z-score: 780.2 bits: 152.7 E(85289): 1e-36
Smith-Waterman score: 832; 41.7% identity (74.9% similar) in 307 aa overlap (25-328:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MLTSLTDLCFSPIQVAEIKSLPKSMNETNHSRVTEFVLLGLSSSRELQPFLFLTFSLLYL
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NP_036 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYL
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 AILLGNFLIILTVTSDSRLHTPMYFLLASLSFIDVCVASFATPKMIADFLVVRKTIAFDA
: .:::.::::.:. :: :::::::.:..:::.:.: . ..:::.:. .. .::.: .
NP_036 ATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCG
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 CLAQIFFVHLFTGSEMVLLVSMAYDRYVAICKPLHYMTVMSRRVCVVLVLISWFVGFIHT
::.:..:: .:. . ::. ::::..::.:.:::: . :....:..:: : :. ...
NP_036 CLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNV
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 TSQLAFTVNLPFCGPNKVDSFFCDLPLVTKLACIDTYVVSLLIVADSGFLSLSSFLLLVV
. . . : ::. : . ::::. . ::.: ::.. ..:....... .. :: ...
NP_036 LLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILA
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290
pF1KE5 SYTVILVTV-RNRSSESMAKARSTLTAHITVVTLFFGPCIFIYVWPFSSYSVDK--VLAV
:: : :: . :... :: :: .:..:: ::.. : .: :.::.:..: . .:
NP_036 SYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATV
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340
pF1KE5 FYTIFTPILNPVMYTLRNKEVKAAMSKLKSRYLKPSQVSVVIRNVLFLETK
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NP_036 LYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
280 290 300 310
348 residues in 1 query sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]