FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5488, 342 aa
1>>>pF1KE5488 342 - 342 aa - 342 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8402+/-0.00144; mu= 12.9861+/- 0.084
mean_var=199.1120+/-70.904, 0's: 0 Z-trim(100.3): 386 B-trim: 372 in 1/45
Lambda= 0.090892
statistics sampled from 5603 (6072) to 5603 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.521), E-opt: 0.2 (0.187), width: 16
Scan time: 1.730
The best scores are: opt bits E(32554)
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CCDS31383.1 OR51I2 gene_id:390064|Hs108|chr11 ( 312) 1138 163.1 2.8e-40
CCDS31382.1 OR51I1 gene_id:390063|Hs108|chr11 ( 314) 1118 160.5 1.7e-39
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CCDS31368.1 OR51A2 gene_id:401667|Hs108|chr11 ( 313) 1055 152.2 5.3e-37
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CCDS44529.1 OR52L1 gene_id:338751|Hs108|chr11 ( 329) 957 139.4 4e-33
CCDS31386.1 OR52H1 gene_id:390067|Hs108|chr11 ( 320) 927 135.4 6.1e-32
CCDS53597.1 OR52E6 gene_id:390078|Hs108|chr11 ( 313) 919 134.4 1.2e-31
CCDS41611.1 OR52B6 gene_id:340980|Hs108|chr11 ( 335) 894 131.1 1.2e-30
CCDS7757.1 OR51B4 gene_id:79339|Hs108|chr11 ( 310) 878 129.0 5.1e-30
CCDS31362.1 OR51S1 gene_id:119692|Hs108|chr11 ( 323) 789 117.3 1.7e-26
CCDS31407.1 OR52W1 gene_id:120787|Hs108|chr11 ( 320) 787 117.1 2e-26
CCDS31395.1 OR56B1 gene_id:387748|Hs108|chr11 ( 324) 782 116.4 3.2e-26
CCDS59223.1 OR52I1 gene_id:390037|Hs108|chr11 ( 324) 759 113.4 2.6e-25
CCDS31355.1 OR52I2 gene_id:143502|Hs108|chr11 ( 350) 759 113.5 2.7e-25
CCDS31404.1 OR56A4 gene_id:120793|Hs108|chr11 ( 365) 745 111.7 9.9e-25
CCDS31405.1 OR56A1 gene_id:120796|Hs108|chr11 ( 318) 737 110.5 1.9e-24
CCDS73248.1 OR56A5 gene_id:390084|Hs108|chr11 ( 313) 734 110.1 2.5e-24
CCDS41614.1 OR56A3 gene_id:390083|Hs108|chr11 ( 315) 701 105.8 5e-23
CCDS31406.1 OR56B4 gene_id:196335|Hs108|chr11 ( 319) 701 105.8 5e-23
CCDS31639.1 OR2AT4 gene_id:341152|Hs108|chr11 ( 320) 650 99.1 5.2e-21
CCDS30898.1 OR10R2 gene_id:343406|Hs108|chr1 ( 335) 615 94.6 1.3e-19
CCDS10496.1 OR1F1 gene_id:4992|Hs108|chr16 ( 312) 604 93.1 3.4e-19
>>CCDS31361.1 OR51F2 gene_id:119694|Hs108|chr11 (342 aa)
initn: 2218 init1: 2218 opt: 2218 Z-score: 1601.6 bits: 304.8 E(32554): 6.9e-83
Smith-Waterman score: 2218; 100.0% identity (100.0% similar) in 342 aa overlap (1-342:1-342)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MTETSLSSQCFPMSVLNNTIAEPLIFLLMGIPGLKATQYWISIPFCLLYVVAVSGNSMIL
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CCDS31 MTETSLSSQCFPMSVLNNTIAEPLIFLLMGIPGLKATQYWISIPFCLLYVVAVSGNSMIL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FVVLCERSLHKPMYYFLSMLSATDLSLSLCTLSTTLGVFWFEAREINLNACIAQMFFLHG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 FTFMESGVLLAMAFDRFVAICYPLRYTTILTNARIAKIGMSMLIRNVAVMLPVMLFVKRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FTFMESGVLLAMAFDRFVAICYPLRYTTILTNARIAKIGMSMLIRNVAVMLPVMLFVKRL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SFCSSMVLSHSYCYHVDLIQLSCTDNRINSILGLFALLSTTGFDCPCILLSYILIIRSVL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SIASSEERRKAFNTCTSHISAVSIFYLPLISLSLVHRYGHSAPPFVHIIMANVFLLIPPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SIASSEERRKAFNTCTSHISAVSIFYLPLISLSLVHRYGHSAPPFVHIIMANVFLLIPPV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340
pF1KE5 LNPIIYSVKIKQIQKAIIKVLIQKHSKSNHQLFLIRDKAIYE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LNPIIYSVKIKQIQKAIIKVLIQKHSKSNHQLFLIRDKAIYE
310 320 330 340
>>CCDS31365.1 OR51G2 gene_id:81282|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 1206 init1: 1184 opt: 1187 Z-score: 871.3 bits: 169.5 E(32554): 3.3e-42
Smith-Waterman score: 1187; 55.6% identity (83.6% similar) in 304 aa overlap (14-317:5-308)
10 20 30 40 50 60
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CCDS31 MTLGSLGNSSSSVSATFLLSGIPGLERMHIWISIPLCFMYLVSIPGNCTIL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FVVLCERSLHKPMYYFLSMLSATDLSLSLCTLSTTLGVFWFEAREINLNACIAQMFFLHG
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CCDS31 FIIKTERSLHEPMYLFLSMLALIDLGLSLCTLPTVLGIFWVGAREISHDACFAQLFFIHC
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130 140 150 160 170 180
pF1KE5 FTFMESGVLLAMAFDRFVAICYPLRYTTILTNARIAKIGMSMLIRNVAVMLPVMLFVKRL
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CCDS31 FSFLESSVLLSMAFDRFVAICHPLHYVSILTNTVIGRIGLVSLGRSVALIFPLPFMLKRF
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190 200 210 220 230 240
pF1KE5 SFCSSMVLSHSYCYHVDLIQLSCTDNRINSILGLFALLSTTGFDCPCILLSYILIIRSVL
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CCDS31 PYCGSPVLSHSYCLHQEVMKLACADMKANSIYGMFVIVSTVGIDSLLILFSYALILRTVL
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250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SIASSEERRKAFNTCTSHISAVSIFYLPLISLSLVHRYGHSAPPFVHIIMANVFLLIPPV
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CCDS31 SIASRAERFKALNTCVSHICAVLLFYTPMIGLSVIHRFGKQAPHLVQVVMGFMYLLFPPV
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340
pF1KE5 LNPIIYSVKIKQIQKAIIKVLIQKHSKSNHQLFLIRDKAIYE
.:::.:::: :::. .
CCDS31 MNPIVYSVKTKQIRDRVTHAFCY
300 310
>>CCDS31369.1 OR51L1 gene_id:119682|Hs108|chr11 (315 aa)
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Smith-Waterman score: 1140; 54.2% identity (82.5% similar) in 308 aa overlap (17-324:6-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MTETSLSSQCFPMSVLNNTIAEPLIFLLMGIPGLKATQYWISIPFCLLYVVAVSGNSMIL
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CCDS31 MGDWNNSDAVEP-IFILRGFPGLEYVHSWLSILFCLAYLVAFMGNVTIL
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70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FVVLCERSLHKPMYYFLSMLSATDLSLSLCTLSTTLGVFWFEAREINLNACIAQMFFLHG
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CCDS31 SVIWIESSLHQPMYYFISILAVNDLGMSLSTLPTMLAVLWLDAPEIQASACYAQLFFIHT
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pF1KE5 FTFMESGVLLAMAFDRFVAICYPLRYTTILTNARIAKIGMSMLIRNVAVMLPVMLFVKRL
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CCDS31 FTFLESSVLLAMAFDRFVAICHPLHYPTILTNSVIGKIGLACLLRSLGVVLPTPLLLRHY
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pF1KE5 SFCSSMVLSHSYCYHVDLIQLSCTDNRINSILGLFALLSTTGFDCPCILLSYILIIRSVL
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CCDS31 HYCHGNALSHAFCLHQDVLRLSCTDARTNSIYGLCVVIATLGVDSIFILLSYVLILNTVL
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pF1KE5 SIASSEERRKAFNTCTSHISAVSIFYLPLISLSLVHRYGHSAPPFVHIIMANVFLLIPPV
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CCDS31 DIASREEQLKALNTCVSHICVVLIFFVPVIGVSMVHRFGKHLSPIVHILMADIYLLLPPV
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pF1KE5 LNPIIYSVKIKQIQKAIIKVLIQKHSKSNHQLFLIRDKAIYE
::::.:::. :::. .:.. .. .
CCDS31 LNPIVYSVRTKQIRLGILHKFVLRRRF
290 300 310
>>CCDS31383.1 OR51I2 gene_id:390064|Hs108|chr11 (312 aa)
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Smith-Waterman score: 1138; 52.8% identity (84.1% similar) in 309 aa overlap (13-321:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MTETSLSSQCFPMSVLNNTIAEPLIFLLMGIPGLKATQYWISIPFCLLYVVAVSGNSMIL
:...: ...: .::: :::::.... :.: :.:..:.::..::..::
CCDS31 MGLFN--VTHPAFFLLTGIPGLESSHSWLSGPLCVMYAVALGGNTVIL
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FVVLCERSLHKPMYYFLSMLSATDLSLSLCTLSTTLGVFWFEAREINLNACIAQMFFLHG
.: : :::.:::::::::: .:...:. :: :.: .: ..::.:...::. :::..:
CCDS31 QAVRVEPSLHEPMYYFLSMLSFSDVAISMATLPTVLRTFCLNARNITFDACLIQMFLIHF
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 FTFMESGVLLAMAFDRFVAICYPLRYTTILTNARIAKIGMSMLIRNVAVMLPVMLFVKRL
:..::::.::::.:::.:::: ::::.:.::. :: .:.. :. ...:. ...:::
CCDS31 FSMMESGILLAMSFDRYVAICDPLRYATVLTTEVIAAMGLGAAARSFITLFPLPFLIKRL
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
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.: : ::::::: : :...:.:.: :::: :::.:.:: :.: :.:::.::.:::.
CCDS31 PICRSNVLSHSYCLHPDMMRLACADISINSIYGLFVLVSTFGMDLFFIFLSYVLILRSVM
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SIASSEERRKAFNTCTSHISAVSIFYLPLISLSLVHRYGHSAPPFVHIIMANVFLLIPPV
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CCDS31 ATASREERLKALNTCVSHILAVLAFYVPMIGVSTVHRFGKHVPCYIHVLMSNVYLFVPPV
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340
pF1KE5 LNPIIYSVKIKQIQKAIIKVLIQKHSKSNHQLFLIRDKAIYE
:::.:::.: :.:..::....
CCDS31 LNPLIYSAKTKEIRRAIFRMFHHIKI
290 300 310
>>CCDS31382.1 OR51I1 gene_id:390063|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 1142 init1: 1118 opt: 1118 Z-score: 822.4 bits: 160.5 E(32554): 1.7e-39
Smith-Waterman score: 1118; 51.6% identity (81.6% similar) in 304 aa overlap (16-319:4-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MTETSLSSQCFPMSVLNNTIAEPLIFLLMGIPGLKATQYWISIPFCLLYVVAVSGNSMIL
::.: .: . : ::::... :... ::.::.... :: ::
CCDS31 MLGLNGTPFQPATLQLTGIPGIQTGLTWVALIFCILYMISIVGNLSIL
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FVVLCERSLHKPMYYFLSMLSATDLSLSLCTLSTTLGVFWFEAREINLNACIAQMFFLHG
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CCDS31 TLVFWEPALHQPMYYFLSMLALNDLGVSFSTLPTVISTFCFNYNHVAFNACLVQMFFIHT
50 60 70 80 90 100
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pF1KE5 FTFMESGVLLAMAFDRFVAICYPLRYTTILTNARIAKIGMSMLIRNVAVMLPVMLFVKRL
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CCDS31 FSFMESGILLAMSLDRFVAICYPLRYVTVLTHNRILAMGLGILTKSFTTLFPFPFVVKRL
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 SFCSSMVLSHSYCYHVDLIQLSCTDNRINSILGLFALLSTTGFDCPCILLSYILIIRSVL
::.. :: :::: : ::....: : ..:.: ::.... : :.: ::::: ::.:..:
CCDS31 PFCKGNVLHHSYCLHPDLMKVACGDIHVNNIYGLLVIIFTYGMDSTFILLSYALILRAML
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SIASSEERRKAFNTCTSHISAVSIFYLPLISLSLVHRYGHSAPPFVHIIMANVFLLIPPV
: :.:.: ::.::: ::: :: ::.:.:..:..::. .:::: ::..:.::.:..::.
CCDS31 VIISQEQRLKALNTCMSHICAVLAFYVPIIAVSMIHRFWKSAPPVVHVMMSNVYLFVPPM
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340
pF1KE5 LNPIIYSVKIKQIQKAIIKVLIQKHSKSNHQLFLIRDKAIYE
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CCDS31 LNPIIYSVKTKEIRKGILKFFHKSQA
290 300 310
>>CCDS31363.1 OR51T1 gene_id:401665|Hs108|chr11 (354 aa)
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10 20 30 40
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CCDS31 MTNKMYAIYIKNLNYFSFLIVQCLQPTMAIFNNTTSSSSNFLLTAFPGLECAHVWISIPV
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE5 CLLYVVAVSGNSMILFVVLCERSLHKPMYYFLSMLSATDLSLSLCTLSTTLGVFWFEARE
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CCDS31 CCLYTIALLGNSMIFLVIITKRRLHKPMYYFLSMLAAVDLCLTITTLPTVLGVLWFHARE
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE5 INLNACIAQMFFLHGFTFMESGVLLAMAFDRFVAICYPLRYTTILTNARIAKIGMSMLIR
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CCDS31 ISFKACFIQMFFVHAFSLLESSVLVAMAFDRFVAICNPLNYATILTDRMVLVIGLVICIR
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
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.. .::... .. .:: .. ::: .::: ..:. . . :.:. ::: : .: :
CCDS31 PAVFLLPLLVAINTVSFHGGHELSHPFCYHPEVIKYTYSKPWISSFWGLFLQLYLNGTDV
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
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CCDS31 LFILFSYVLILRTVLGIVARKKQQKALSTCVCHICAVTIFYVPLISLSLAHRLFHSTPRV
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290 300 310 320 330 340
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310 320 330 340 350
>>CCDS53596.1 OR51M1 gene_id:390059|Hs108|chr11 (326 aa)
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10 20 30 40 50
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CCDS53 MSVQYSLSPQFMLLS--NITQFSP-IFYLTSFPGLEGIKHWIFIPFFFMYMVAISGNCFI
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CCDS53 LIIIKTNPRLHTPMYYLLSLLALTDLGLCVSTLPTTMGIFWFNSHSIYFGACQIQMFCIH
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pF1KE5 GFTFMESGVLLAMAFDRFVAICYPLRYTTILTNARIAKIGMSMLIRNVAVMLPVMLFVKR
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CCDS53 SFSFMESSVLLMMSFDRLVAICHPLRYSVIITGQQVVRAGLIVIFRGPVATIPIVLLLKA
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CCDS53 FPYCGSVVLSHSFCLHQEVIQLACTDITFNNLYGLMVVVFTVMLDLVLIALSYGLILHTV
180 190 200 210 220 230
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pF1KE5 LSIASSEERRKAFNTCTSHISAVSIFYLPLISLSLVHRYGHSAPPFVHIIMANVFLLIPP
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CCDS53 AGLASQEEQRRAFQTCTAPLCAVLVFFVPMMGLSLVHRFGKHAPPAIHLLMANVYLFVPP
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300 310 320 330 340
pF1KE5 VLNPIIYSVKIKQIQKAIIKVL-IQKHSKSNHQLFLIRDKAIYE
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CCDS53 MLNPIIYSIKTKEIHRAIIKFLGLKKASK
300 310 320
>>CCDS31367.1 OR51A4 gene_id:401666|Hs108|chr11 (313 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MTETSLSSQCFPMSVLNNTIAEPLIFLLMGIPGLKATQYWISIPFCLLYVVAVSGNSMIL
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CCDS31 MSIINTSYVEITTFFLVGMPGLEYAHIWISIPICSMYLIAILGNGTIL
10 20 30 40
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pF1KE5 FVVLCERSLHKPMYYFLSMLSATDLSLSLCTLSTTLGVFWFEAREINLNACIAQMFFLHG
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CCDS31 FIIKTEPSLHEPMYYFLSMLAMSDLGLSLSSLPTVLSIFLFNAPEISSNACFAQEFFIHG
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pF1KE5 FTFMESGVLLAMAFDRFVAICYPLRYTTILTNARIAKIGMSMLIRNVAVMLPVMLFVKRL
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CCDS31 FSVLESSVLLIMSFDRFLAIHNPLRYTSILTTVRVAQIGIVFSFKSMLLVLPFPFTLRNL
110 120 130 140 150 160
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pF1KE5 SFCSSMVLSHSYCYHVDLIQLSCTDNRINSILGLFALLSTTGFDCPCILLSYILIIRSVL
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CCDS31 RYCKKNQLSHSYCLHQDVMKLACSDNRIDVIYGFFGALCLM-VDFILIAVSYTLILKTVL
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pF1KE5 SIASSEERRKAFNTCTSHISAVSIFYLPLISLSLVHRYGHSAPPFVHIIMANVFLLIPPV
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CCDS31 GIASKKEQLKALNTCVSHICAVIIFYLPIINLAVVHRFARHVSPLINVLMANVLLLVPPL
230 240 250 260 270 280
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pF1KE5 LNPIIYSVKIKQIQKAIIKVLIQKHSKSNHQLFLIRDKAIYE
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CCDS31 TNPIVYCVKTKQIRVRVVAKLCQRKI
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CCDS44 MLTLNKTDLIPASFILNGVPGLEDTQLWISFPFCSMYVVAMVGNCGLL
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CCDS44 YLIHYEDALHKPMYYFLAMLSFTDLVMCSSTIPKALCIFWFHLKDIGFDECLVQMFFTHT
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CCDS44 FTGMESGVLMLMALDRYVAICYPLRYSTILTNPVIAKVGTATFLRGVLLIIPFTFLTKLL
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CCDS44 PYCRGNILPHTYCDHMSVAKLSCGNVKVNAIYGLMVALLIWGFDILCITNSYTMILRAVV
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CCDS44 SLSSADARQKAFNTCTAHICAIVFSYTPAFFSFFSHRFGEHIIPPSCHIIVANIYLLLPP
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CCDS44 TMNPIVYGVKTKQIRDCVIRILSGSKDTKSYSM
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>>CCDS31364.1 OR51A7 gene_id:119687|Hs108|chr11 (312 aa)
initn: 1090 init1: 731 opt: 1083 Z-score: 797.6 bits: 155.9 E(32554): 4.2e-38
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CCDS31 MSVLNNS--EVKLFLLIGIPGLEHAHIWFSIPICLMYLLAIMGNCTIL
10 20 30 40
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CCDS31 FIIKTEPSLHEPMYYFLAMLAVSDMGLSLSSLPTMLRVFLFNAMGISPNACFAQEFFIHG
50 60 70 80 90 100
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CCDS31 KYCQKNLLSHSYCLHQDTMKLACSDNKTNVIYGFFIALCTM-LDLALIVLSYVLILKTIL
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CCDS31 SIASLAERLKALNTCVSHICAVLTFYVPIITLAAMHHFAKHKSPLVVILIADMFLLVPPL
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]