Result of FASTA (omim) for
pFN21AE5486
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5486, 339 aa
1>>>pF1KE5486 339 - 339 aa - 339 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0289+/-0.000442; mu= 17.6101+/- 0.027
mean_var=88.4782+/-22.337, 0's: 0 Z-trim(110.2): 380 B-trim: 2131 in 2/48
Lambda= 0.136350
statistics sampled from 17951 (18508) to 17951 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.581), E-opt: 0.2 (0.217), width: 16
Scan time: 5.810
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 1313 268.9 1e-71
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 1057 218.5 1.5e-56
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 1056 218.3 1.7e-56
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 1056 218.3 1.7e-56
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 1014 210.0 5.3e-54
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 871 181.9 1.5e-45
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 830 173.9 4.2e-43
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 823 172.5 1.1e-42
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 810 169.9 6.4e-42
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 806 169.1 1.1e-41
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 789 165.8 1.2e-40
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 785 165.0 1.9e-40
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 785 165.0 1.9e-40
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 785 165.0 1.9e-40
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 780 164.0 3.8e-40
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 772 162.4 1.1e-39
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 768 161.7 2e-39
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 764 160.9 3.3e-39
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 748 157.7 2.9e-38
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 675 143.4 6.3e-34
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 537 116.2 9.5e-26
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 525 113.9 4.9e-25
XP_011508791 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 313) 224 54.6 3.2e-07
XP_006712259 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 333) 224 54.7 3.3e-07
XP_006712258 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 370) 224 54.7 3.6e-07
XP_011508790 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 376) 224 54.7 3.6e-07
XP_011508789 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 403) 224 54.8 3.8e-07
NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 223 54.5 3.9e-07
NP_006047 (OMIM: 604153) neuromedin-U receptor 1 [ ( 426) 224 54.8 4e-07
NP_063941 (OMIM: 155540,602025,607948) melanocorti ( 323) 215 52.9 1.1e-06
XP_016856596 (OMIM: 602392) PREDICTED: orexin rece ( 389) 213 52.6 1.7e-06
NP_001516 (OMIM: 602392) orexin receptor type 1 [H ( 425) 213 52.6 1.8e-06
XP_016856594 (OMIM: 602392) PREDICTED: orexin rece ( 425) 213 52.6 1.8e-06
XP_016856595 (OMIM: 602392) PREDICTED: orexin rece ( 425) 213 52.6 1.8e-06
XP_011542714 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 308) 205 50.9 4.2e-06
XP_016868585 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 317) 205 50.9 4.3e-06
NP_000668 (OMIM: 600445) adenosine receptor A3 iso ( 318) 205 50.9 4.3e-06
XP_011542713 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 324) 205 50.9 4.4e-06
NP_001309433 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic re ( 342) 205 50.9 4.5e-06
NP_001309432 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic re ( 370) 205 51.0 4.8e-06
NP_001309431 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic re ( 372) 205 51.0 4.8e-06
XP_006716356 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 429) 205 51.1 5.3e-06
NP_150645 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic recep ( 429) 205 51.1 5.3e-06
NP_150647 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic recep ( 455) 205 51.1 5.5e-06
NP_000671 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic recep ( 466) 205 51.1 5.6e-06
XP_006716355 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 475) 205 51.1 5.7e-06
NP_150646 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic recep ( 475) 205 51.1 5.7e-06
XP_016868583 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 475) 205 51.1 5.7e-06
XP_016868584 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 475) 205 51.1 5.7e-06
NP_001517 (OMIM: 602393) orexin receptor type 2 [H ( 444) 204 50.9 6.2e-06
>>NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 [Ho (312 aa)
initn: 1335 init1: 1306 opt: 1313 Z-score: 1408.4 bits: 268.9 E(85289): 1e-71
Smith-Waterman score: 1313; 66.0% identity (85.6% similar) in 306 aa overlap (20-325:2-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MSYFPILFFFFLKRCPSYTEPQNLTGVSEFLLLGLSEDPELQPVLAGLFLSMYLVTVLGN
: .::: .:.:::::::.:::::::: ::::::::::::::
NP_001 MEAENLTELSKFLLLGLSDDPELQPVLFGLFLSMYLVTVLGN
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LLIILAVSSDSHLHTPMYFFLSNLSLADIGFTSTTVPKMIVDMQTHSRVISYEGCLTQMS
:::::::::::::::::::::::::..:: : :::::::.:..:..:. ::: :::::.
NP_001 LLIILAVSSDSHLHTPMYFFLSNLSFVDICFISTTVPKMLVSIQARSKDISYMGCLTQVY
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 FFVLFACMDDMLLSVMAYDRFVAICHPLHYRIIMNPRLCGFLILLSFFISLLDSQLHNLI
:...:: :: .::.:::::::::::::::: .:::: :::.:.: :.:: . : .: :.
NP_001 FLMMFAGMDTFLLAVMAYDRFVAICHPLHYTVIMNPCLCGLLVLASWFIIFWFSLVHILL
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190 200 210 220 230 240
pF1KE5 MLQLTCFKDVDISNFFCDPSQLLHLRCSDTFINEMVIYFMGAIFGCLPISGILFSYYKIV
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NP_001 MKRLTFSTGTEIPHFFCEPAQVLKVACSNTLLNNIVLYVATALLGVFPVAGILFSYSQIV
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SPILRVPTSDGKYKAFSTCGSHLAVVCLFYGTGLVGYLSSAVLPSPRKSMVASVMYTVVT
: .. . .. ::::::::::::: :: ::::::: :::::: : ..: .:::::..::
NP_001 SSLMGMSSTKGKYKAFSTCGSHLCVVSLFYGTGLGVYLSSAVTHSSQSSSTASVMYAMVT
230 240 250 260 270 280
310 320 330
pF1KE5 PMLNPFIYSLRNKDIQSALCRLHGRIIKSHHLHPFCYMG
::::::::::::::...:: :: .:
NP_001 PMLNPFIYSLRNKDVKGALERLLSRADSCP
290 300 310
>>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa)
initn: 1097 init1: 1049 opt: 1057 Z-score: 1136.0 bits: 218.5 E(85289): 1.5e-56
Smith-Waterman score: 1057; 53.2% identity (77.1% similar) in 314 aa overlap (16-329:8-321)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MSYFPILFFFFLKRCPSYTEPQNLTGVSEFLLLGLSEDPELQPVLAGLFLSMYLVTVLGN
: : ..::::::::::..:. : .: .::::::.:::::
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10 20 30 40 50
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pF1KE5 LLIILAVSSDSHLHTPMYFFLSNLSLADIGFTSTTVPKMIVDMQTHSRVISYEGCLTQMS
:::::.:: :: :::::::::::::..:: :. ::::::... ....::. ::::::
XP_011 LLIILSVSIDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMY
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130 140 150 160 170 180
pF1KE5 FFVLFACMDDMLLSVMAYDRFVAICHPLHYRIIMNPRLCGFLILLSFFISLLDSQLHNLI
: .:. ::..::.:::::.:::.:::::: :. .::..:. . .. :. ::.:.
XP_011 FVFMFVDMDNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLL
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190 200 210 220 230 240
pF1KE5 MLQLTCFKDVDISNFFCDPSQLLHLRCSDTFINEMVIYFMGAIFGCLPISGILFSYYKIV
: :. : :..:::: . ::.: :::: .::..: ::. :. :: ::..:.
XP_011 MAPLSFCADNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHIT
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SPILRVPTSDGKYKAFSTCGSHLAVVCLFYGTGLVGYLSSAVLPSPRKSMVASVMYTVVT
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XP_011 CTVLKVPSTKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVT
240 250 260 270 280 290
310 320 330
pF1KE5 PMLNPFIYSLRNKDIQSALCRLHGRIIKSHHLHPFCYMG
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XP_011 PMLNPFIYSLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
300 310 320
>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa)
initn: 1097 init1: 1049 opt: 1056 Z-score: 1135.1 bits: 218.3 E(85289): 1.7e-56
Smith-Waterman score: 1056; 54.1% identity (78.5% similar) in 307 aa overlap (23-329:5-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MSYFPILFFFFLKRCPSYTEPQNLTGVSEFLLLGLSEDPELQPVLAGLFLSMYLVTVLGN
: ..::::::::::..:. : .: .::::::.:::::
XP_011 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGN
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pF1KE5 LLIILAVSSDSHLHTPMYFFLSNLSLADIGFTSTTVPKMIVDMQTHSRVISYEGCLTQMS
:::::.:: :: :::::::::::::..:: :. ::::::... ....::. ::::::
XP_011 LLIILSVSIDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMY
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pF1KE5 FFVLFACMDDMLLSVMAYDRFVAICHPLHYRIIMNPRLCGFLILLSFFISLLDSQLHNLI
: .:. ::..::.:::::.:::.:::::: :. .::..:. . .. :. ::.:.
XP_011 FVFMFVDMDNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLL
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pF1KE5 MLQLTCFKDVDISNFFCDPSQLLHLRCSDTFINEMVIYFMGAIFGCLPISGILFSYYKIV
: :. : :..:::: . ::.: :::: .::..: ::. :. :: ::..:.
XP_011 MAPLSFCADNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHIT
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pF1KE5 SPILRVPTSDGKYKAFSTCGSHLAVVCLFYGTGLVGYLSSAVLPSPRKSMVASVMYTVVT
.:.::.. :..::::::::::::: :::.: .. :.. : .:. .:.:.:::::
XP_011 CTVLKVPSTKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVT
230 240 250 260 270 280
310 320 330
pF1KE5 PMLNPFIYSLRNKDIQSALCRLHGRIIKSHHLHPFCYMG
::::::::::::. ...:: .. ::.. :
XP_011 PMLNPFIYSLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
290 300 310
>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
initn: 1097 init1: 1049 opt: 1056 Z-score: 1135.1 bits: 218.3 E(85289): 1.7e-56
Smith-Waterman score: 1056; 54.1% identity (78.5% similar) in 307 aa overlap (23-329:5-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MSYFPILFFFFLKRCPSYTEPQNLTGVSEFLLLGLSEDPELQPVLAGLFLSMYLVTVLGN
: ..::::::::::..:. : .: .::::::.:::::
NP_036 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGN
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LLIILAVSSDSHLHTPMYFFLSNLSLADIGFTSTTVPKMIVDMQTHSRVISYEGCLTQMS
:::::.:: :: :::::::::::::..:: :. ::::::... ....::. ::::::
NP_036 LLIILSVSIDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMY
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 FFVLFACMDDMLLSVMAYDRFVAICHPLHYRIIMNPRLCGFLILLSFFISLLDSQLHNLI
: .:. ::..::.:::::.:::.:::::: :. .::..:. . .. :. ::.:.
NP_036 FVFMFVDMDNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLL
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 MLQLTCFKDVDISNFFCDPSQLLHLRCSDTFINEMVIYFMGAIFGCLPISGILFSYYKIV
: :. : :..:::: . ::.: :::: .::..: ::. :. :: ::..:.
NP_036 MAPLSFCADNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHIT
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250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SPILRVPTSDGKYKAFSTCGSHLAVVCLFYGTGLVGYLSSAVLPSPRKSMVASVMYTVVT
.:.::.. :..::::::::::::: :::.: .. :.. : .:. .:.:.:::::
NP_036 CTVLKVPSTKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVT
230 240 250 260 270 280
310 320 330
pF1KE5 PMLNPFIYSLRNKDIQSALCRLHGRIIKSHHLHPFCYMG
::::::::::::. ...:: .. ::.. :
NP_036 PMLNPFIYSLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
290 300 310
>>NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [Homo (312 aa)
initn: 1017 init1: 862 opt: 1014 Z-score: 1090.5 bits: 210.0 E(85289): 5.3e-54
Smith-Waterman score: 1014; 51.8% identity (78.9% similar) in 303 aa overlap (28-330:10-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MSYFPILFFFFLKRCPSYTEPQNLTGVSEFLLLGLSEDPELQPVLAGLFLSMYLVTVLGN
:::::::.::.:: : .: .:::::::::.::
NP_002 MDGGNQSEGSEFLLLGMSESPEQQRILFWMFLSMYLVTVVGN
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LLIILAVSSDSHLHTPMYFFLSNLSLADIGFTSTTVPKMIVDMQTHSRVISYEGCLTQMS
.:::::.::::.::::.::::.:::..:. :...:.:::.:..:.:...::: :::::.
NP_002 VLIILAISSDSRLHTPVYFFLANLSFTDLFFVTNTIPKMLVNLQSHNKAISYAGCLTQLY
50 60 70 80 90 100
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pF1KE5 FFVLFACMDDMLLSVMAYDRFVAICHPLHYRIIMNPRLCGFLILLSFFISLLDSQLHNLI
:.: .. .:...:.::::::.:::: :::: :.:.:: .:. : . .:.: . .:.:.
NP_002 FLVSLVALDNLILAVMAYDRYVAICCPLHYTTAMSPKLCILLLSLCWVLSVLYGLIHTLL
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pF1KE5 MLQLTCFKDVDISNFFCDPSQLLHLRCSDTFINEMVIYFMGAIFGCLPISGILFSYYKIV
: ..: . : .::. ::.. ::. ::. :. : .. .:.. ...:: :.
NP_002 MTRVTFCGSRKIHYIFCEMYVLLRMACSNIQINHTVLIATGCFIFLIPFGFVIISYVLII
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pF1KE5 SPILRVPTSDGKYKAFSTCGSHLAVVCLFYGTGLVGYLSSAVLPSPRKSMVASVMYTVVT
:::.:. . ::::::::.:::..: ::::: . ::. : . : ::.:::.:::
NP_002 RAILRIPSVSKKYKAFSTCASHLGAVSLFYGTLCMVYLKPLHTYSVKDS-VATVMYAVVT
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310 320 330
pF1KE5 PMLNPFIYSLRNKDIQSALCRLHGRIIKSHHLHPFCYMG
::.:::::::::::...:: ::.. .:
NP_002 PMMNPFIYSLRNKDMHGAL----GRLLDKHFKRLT
290 300 310
>>NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [Homo (308 aa)
initn: 899 init1: 727 opt: 871 Z-score: 938.5 bits: 181.9 E(85289): 1.5e-45
Smith-Waterman score: 871; 45.5% identity (74.9% similar) in 303 aa overlap (23-325:5-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MSYFPILFFFFLKRCPSYTEPQNLTGVSEFLLLGLSEDPELQPVLAGLFLSMYLVTVLGN
: : :.::::::::. :. . .: ..:..::::::::
NP_003 MRQINQTQVTEFLLLGLSDGPHTEQLLFIVLLGVYLVTVLGN
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LLIILAVSSDSHLHTPMYFFLSNLSLADIGFTSTTVPKMIVDMQTHSRVISYEGCLTQMS
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NP_003 LLLISLVHVDSQLHTPMYFFLCNLSLADLCFSTNIVPQALVHLLSRKKVIAFTLCAARLL
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 FFVLFACMDDMLLSVMAYDRFVAICHPLHYRIIMNPRLCGFLILLSFFISLLDSQLHNLI
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NP_003 FFLIFGCTQCALLAVMSYDRYVAICNPLRYPNIMTWKVCVQLATGSWTSGILVSVVDTTF
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 MLQLTCFKDVDISNFFCDPSQLLHLRCSDTFINEMVIYFMGAIFGCLPISGILFSYYKIV
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NP_003 ILRLPYRGSNSIAHFFCEAPALLILASTDTHASEMAIFLMGVVILLIPVFLILVSYGRII
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SPILRVPTSDGKYKAFSTCGSHLAVVCLFYGTGLVGYLSSAVLPSPRKSMVASVMYTVVT
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NP_003 VTVVKMKSTVGSLKAFSTCGSHLMVVILFYGSAIITYMTPKSSKQQEKSV--SVFYAIVT
230 240 250 260 270 280
310 320 330
pF1KE5 PMLNPFIYSLRNKDIQSALCRLHGRIIKSHHLHPFCYMG
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NP_003 PMLNPLIYSLRNKDVKAALRKVATRNFP
290 300
>>NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN1 [H (311 aa)
initn: 848 init1: 800 opt: 830 Z-score: 894.9 bits: 173.9 E(85289): 4.2e-43
Smith-Waterman score: 830; 43.8% identity (72.4% similar) in 304 aa overlap (23-325:6-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MSYFPILFFFFLKRCPSYTEPQNLTGVSEFLLLGLSEDPELQPVLAGLFLSMYLVTVLGN
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NP_001 MTGGGNITEITYFILLGFSDFPRIIKVLFTIFLVIYITSLAWN
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LLIILAVSSDSHLHTPMYFFLSNLSLADIGFTSTTVPKMIVDMQTHSRVISYEGCLTQMS
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NP_001 LSLIVLIRMDSHLHTPMYFFLSNLSFIDVCYISSTVPKMLSNLLQEQQTITFVGCIIQYF
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pF1KE5 FFVLFACMDDMLLSVMAYDRFVAICHPLHYRIIMNPRLCGFLILLSFFISLLDSQLHNLI
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NP_001 IFSTMGLSESCLMTAMAYDRYAAICNPLLYSSIMSPTLCVWMVLGAYMTGLTASLFQIGA
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pF1KE5 MLQLT-CFKDVDISNFFCDPSQLLHLRCSDTFINEMVIYFMGAIFGCLPISGILFSYYKI
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NP_001 LLQLHFCGSNV-IRHFFCDMPQLLILSCTDTFFVQVMTAILTMFFGIASALVIMISYGYI
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pF1KE5 VSPILRVPTSDGKYKAFSTCGSHLAVVCLFYGTGLVGYLSSAVLPSPRKSMVASVMYTVV
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NP_001 GISIMKITSAKGRSKAFNTCASHLTAVSLFYTSGIFVYLSSSSGGSSSFDRFASVFYTVV
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pF1KE5 TPMLNPFIYSLRNKDIQSALCRLHGRIIKSHHLHPFCYMG
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NP_001 IPMLNPLIYSLRNKEIKDALKRLQKRKCC
290 300 310
>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
initn: 825 init1: 797 opt: 823 Z-score: 887.4 bits: 172.5 E(85289): 1.1e-42
Smith-Waterman score: 823; 43.6% identity (72.1% similar) in 298 aa overlap (22-318:6-302)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MSYFPILFFFFLKRCPSYTEPQNLTGVSEFLLLGLSEDPELQPVLAGLFLSMYLVTVLGN
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NP_006 MEFTDRNYTLVTEFILLGFPTRPELQIVLFLMFLTLYAIILIGN
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LLIILAVSSDSHLHTPMYFFLSNLSLADIGFTSTTVPKMIVDMQTHSRVISYEGCLTQMS
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NP_006 IGLMLLIRIDPHLQTPMYFFLSNLSFVDLCYFSDIVPKMLVNFLSENKSISYYGCALQFY
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pF1KE5 FFVLFACMDDMLLSVMAYDRFVAICHPLHYRIIMNPRLCGFLILLSFFISLLDSQLHNLI
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NP_006 FFCTFADTESFILAAMAYDRYVAICNPLLYTVVMSRGICMRLIVLSYLGGNMSSLVHTSF
110 120 130 140 150 160
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pF1KE5 MLQLT-CFKDVDISNFFCDPSQLLHLRCSDTFINEMVIYFMGAIFGCLPISGILFSYYKI
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NP_006 AFILKYCDKNV-INHFFCDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFIIIIISYFFI
170 180 190 200 210 220
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pF1KE5 VSPILRVPTSDGKYKAFSTCGSHLAVVCLFYGTGLVGYLSSAVLPSPRKSMVASVMYTVV
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NP_006 LLSVLKIRSFSGRKKTFSTCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIF
230 240 250 260 270 280
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pF1KE5 TPMLNPFIYSLRNKDIQSALCRLHGRIIKSHHLHPFCYMG
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NP_006 IPVLNPLIYSLRNKDVKDAAEKVLRSKVDSS
290 300 310
>>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor (311 aa)
initn: 808 init1: 767 opt: 810 Z-score: 873.6 bits: 169.9 E(85289): 6.4e-42
Smith-Waterman score: 810; 40.4% identity (71.9% similar) in 302 aa overlap (23-324:8-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MSYFPILFFFFLKRCPSYTEPQNLTGVSEFLLLGLSEDPELQPVLAGLFLSMYLVTVLGN
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NP_001 MNDDGKVNASSEGYFILVGFSNWPHLEVVIFVVVLIFYLMTLIGN
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LLIILAVSSDSHLHTPMYFFLSNLSLADIGFTSTTVPKMIVDMQTHSRVISYEGCLTQMS
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NP_001 LFIIILSYLDSHLHTPMYFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLWGPEKTISYAGCMIQLY
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 FFVLFACMDDMLLSVMAYDRFVAICHPLHYRIIMNPRLCGFLILLSFFISLLDSQLHNLI
: . .. . .:: ::.:::..:.:.:::: ..:.::.: .: . :. .. .: ::. .
NP_001 FVLALGTTECVLLVVMSYDRYAAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLAVASWVSGFTNSALHSSF
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 MLQLTCFKDVDISNFFCDPSQLLHLRCSDTFINEMVIYFMGAIFGCLPISGILFSYYKIV
. . ....:::. ::.: : :: .::..... ..:: .:. :: :: ::
NP_001 TFWVPLCGHRQVDHFFCEVPALLRLSCVDTHVNELTLMITSSIFVLIPLILILTSYGAIV
170 180 190 200 210 220
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pF1KE5 SPILRVPTSDGKYKAFSTCGSHLAVVCLFYGTGLVGYLSSAVLPSPRKSMVASVMYTVVT
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NP_001 RAILRMQSTTGLQKVFGTCGAHLMAVSLFFIPAMCMYLQPPSGNSQDQGKFIALFYTVVT
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pF1KE5 PMLNPFIYSLRNKDIQSALCRLHGRIIKSHHLHPFCYMG
: :::.::.:::: ...:. :: :
NP_001 PSLNPLIYTLRNKVVRGAVKRLMGWE
290 300 310
>>NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [Homo (317 aa)
initn: 803 init1: 753 opt: 806 Z-score: 869.3 bits: 169.1 E(85289): 1.1e-41
Smith-Waterman score: 806; 43.0% identity (70.7% similar) in 314 aa overlap (23-334:5-317)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MSYFPILFFFFLKRCPSYTEPQNLTGVSEFLLLGLSEDP-ELQPVLAGLFLSMYLVTVLG
: : .:::.:...: : :.: .: ::..::::. :
NP_835 MAIGNWTEISEFILMSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLKG
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 NLLIILAVSSDSHLHTPMYFFLSNLSLADIGFTSTTVPKMIVDMQTHSRVISYEGCLTQM
: ::::.. .: ::.:::::: :::. .:::. . ::::. . ... .::. :: :::
NP_835 NSLIILVTLADPMLHSPMYFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLLAQDTTISFLGCATQM
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pF1KE5 SFFVLFACMDDMLLSVMAYDRFVAICHPLHYRIIMNPRLCGFLILLSFFISLLDSQLHNL
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NP_835 YFFFFFGVAECFLLATMAYDRYVAICSPLHYPVIMNQRTRAKLAAASWFPGFPVATVQTT
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pF1KE5 IMLQLTCFKDVDISNFFCDPSQLLHLRCSDTFINEMVIYFMGAIFGCL-PISGILFSYYK
.... ...:::: .:.: :.:: . : . ..:.:. . : :: :: .
NP_835 WLFSFPFCGTNKVNHFFCDSPPVLKLVCADTALFE-IYAIVGTILVVMIPCLLILCSYTR
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pF1KE5 IVSPILRVPTSDGKYKAFSTCGSHLAVVCLFYGTGLVGYLSSAVLPSPRKSMVASVMYTV
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]