Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5486
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5486, 339 aa
1>>>pF1KE5486 339 - 339 aa - 339 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7423+/-0.00109; mu= 13.2762+/- 0.064
mean_var=133.9867+/-43.388, 0's: 0 Z-trim(104.3): 410 B-trim: 941 in 2/48
Lambda= 0.110801
statistics sampled from 7279 (7827) to 7279 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.608), E-opt: 0.2 (0.24), width: 16
Scan time: 1.750
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS45955.1 OR7E24 gene_id:26648|Hs108|chr19 ( 339) 2279 376.5 1.7e-104
CCDS32901.1 OR7D4 gene_id:125958|Hs108|chr19 ( 312) 1313 222.1 4.9e-58
CCDS12320.1 OR7C2 gene_id:26658|Hs108|chr19 ( 319) 1312 221.9 5.5e-58
CCDS12319.1 OR7A17 gene_id:26333|Hs108|chr19 ( 309) 1299 219.8 2.3e-57
CCDS12317.1 OR7C1 gene_id:26664|Hs108|chr19 ( 320) 1271 215.4 5.2e-56
CCDS32899.1 OR7G3 gene_id:390883|Hs108|chr19 ( 312) 1270 215.2 5.7e-56
CCDS32936.1 OR7A10 gene_id:390892|Hs108|chr19 ( 309) 1268 214.9 7.1e-56
CCDS32897.1 OR7G2 gene_id:390882|Hs108|chr19 ( 345) 1264 214.3 1.2e-55
CCDS32900.1 OR7D2 gene_id:162998|Hs108|chr19 ( 312) 1261 213.8 1.5e-55
CCDS12318.1 OR7A5 gene_id:26659|Hs108|chr19 ( 319) 1248 211.7 6.6e-55
CCDS32898.2 OR7G1 gene_id:125962|Hs108|chr19 ( 311) 1190 202.4 4e-52
CCDS11020.1 OR1G1 gene_id:8390|Hs108|chr17 ( 313) 1082 185.1 6.4e-47
CCDS35121.1 OR1J2 gene_id:26740|Hs108|chr9 ( 313) 1075 184.0 1.4e-46
CCDS6844.1 OR1N1 gene_id:138883|Hs108|chr9 ( 311) 1069 183.1 2.7e-46
CCDS35123.1 OR1N2 gene_id:138882|Hs108|chr9 ( 330) 1057 181.2 1e-45
CCDS10496.1 OR1F1 gene_id:4992|Hs108|chr16 ( 312) 1056 181.0 1.1e-45
CCDS11024.1 OR1E1 gene_id:8387|Hs108|chr17 ( 314) 1056 181.0 1.1e-45
CCDS35122.1 OR1J4 gene_id:26219|Hs108|chr9 ( 313) 1049 179.9 2.5e-45
CCDS32937.1 OR1I1 gene_id:126370|Hs108|chr19 ( 355) 1025 176.1 3.8e-44
CCDS32896.1 OR1M1 gene_id:125963|Hs108|chr19 ( 313) 1018 174.9 7.6e-44
CCDS11019.1 OR1D2 gene_id:4991|Hs108|chr17 ( 312) 1014 174.3 1.2e-43
CCDS35120.1 OR1J1 gene_id:347168|Hs108|chr9 ( 322) 1001 172.2 5.1e-43
CCDS41481.1 OR1C1 gene_id:26188|Hs108|chr1 ( 314) 998 171.7 7e-43
CCDS35129.1 OR1L4 gene_id:254973|Hs108|chr9 ( 311) 990 170.4 1.7e-42
CCDS35130.2 OR1L6 gene_id:392390|Hs108|chr9 ( 311) 987 170.0 2.4e-42
CCDS31545.1 OR1S2 gene_id:219958|Hs108|chr11 ( 325) 982 169.2 4.2e-42
CCDS35127.2 OR1L1 gene_id:26737|Hs108|chr9 ( 310) 969 167.1 1.7e-41
CCDS58499.1 OR1D5 gene_id:8386|Hs108|chr17 ( 312) 955 164.8 8.2e-41
CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11 ( 330) 910 157.7 1.2e-38
CCDS35128.1 OR1L3 gene_id:26735|Hs108|chr9 ( 324) 909 157.5 1.4e-38
CCDS35125.1 OR1Q1 gene_id:158131|Hs108|chr9 ( 314) 898 155.7 4.6e-38
CCDS35124.1 OR1L8 gene_id:138881|Hs108|chr9 ( 309) 897 155.6 5e-38
CCDS11022.1 OR1A1 gene_id:8383|Hs108|chr17 ( 309) 882 153.2 2.7e-37
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 881 153.0 3e-37
CCDS30899.1 OR6Y1 gene_id:391112|Hs108|chr1 ( 325) 880 152.9 3.4e-37
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 877 152.4 4.7e-37
CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 ( 326) 873 151.8 7.4e-37
CCDS31416.1 OR2D2 gene_id:120776|Hs108|chr11 ( 308) 871 151.4 9e-37
CCDS31517.1 OR8I2 gene_id:120586|Hs108|chr11 ( 310) 870 151.3 1e-36
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 869 151.1 1.1e-36
CCDS31711.1 OR8B12 gene_id:219858|Hs108|chr11 ( 310) 866 150.6 1.6e-36
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 864 150.3 2e-36
CCDS11025.1 OR3A3 gene_id:8392|Hs108|chr17 ( 321) 861 149.8 2.8e-36
CCDS11023.1 OR3A1 gene_id:4994|Hs108|chr17 ( 315) 851 148.2 8.3e-36
CCDS11021.1 OR1A2 gene_id:26189|Hs108|chr17 ( 309) 847 147.6 1.3e-35
CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11 ( 311) 846 147.4 1.4e-35
CCDS4642.1 OR2B6 gene_id:26212|Hs108|chr6 ( 313) 846 147.4 1.4e-35
CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 ( 362) 846 147.5 1.6e-35
CCDS66256.1 OR8G5 gene_id:219865|Hs108|chr11 ( 346) 845 147.3 1.7e-35
CCDS42233.1 OR3A2 gene_id:4995|Hs108|chr17 ( 321) 844 147.1 1.8e-35
>>CCDS45955.1 OR7E24 gene_id:26648|Hs108|chr19 (339 aa)
initn: 2279 init1: 2279 opt: 2279 Z-score: 1989.6 bits: 376.5 E(32554): 1.7e-104
Smith-Waterman score: 2279; 100.0% identity (100.0% similar) in 339 aa overlap (1-339:1-339)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MSYFPILFFFFLKRCPSYTEPQNLTGVSEFLLLGLSEDPELQPVLAGLFLSMYLVTVLGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MSYFPILFFFFLKRCPSYTEPQNLTGVSEFLLLGLSEDPELQPVLAGLFLSMYLVTVLGN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LLIILAVSSDSHLHTPMYFFLSNLSLADIGFTSTTVPKMIVDMQTHSRVISYEGCLTQMS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LLIILAVSSDSHLHTPMYFFLSNLSLADIGFTSTTVPKMIVDMQTHSRVISYEGCLTQMS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 FFVLFACMDDMLLSVMAYDRFVAICHPLHYRIIMNPRLCGFLILLSFFISLLDSQLHNLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 FFVLFACMDDMLLSVMAYDRFVAICHPLHYRIIMNPRLCGFLILLSFFISLLDSQLHNLI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 MLQLTCFKDVDISNFFCDPSQLLHLRCSDTFINEMVIYFMGAIFGCLPISGILFSYYKIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MLQLTCFKDVDISNFFCDPSQLLHLRCSDTFINEMVIYFMGAIFGCLPISGILFSYYKIV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SPILRVPTSDGKYKAFSTCGSHLAVVCLFYGTGLVGYLSSAVLPSPRKSMVASVMYTVVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SPILRVPTSDGKYKAFSTCGSHLAVVCLFYGTGLVGYLSSAVLPSPRKSMVASVMYTVVT
250 260 270 280 290 300
310 320 330
pF1KE5 PMLNPFIYSLRNKDIQSALCRLHGRIIKSHHLHPFCYMG
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 PMLNPFIYSLRNKDIQSALCRLHGRIIKSHHLHPFCYMG
310 320 330
>>CCDS32901.1 OR7D4 gene_id:125958|Hs108|chr19 (312 aa)
initn: 1335 init1: 1306 opt: 1313 Z-score: 1155.5 bits: 222.1 E(32554): 4.9e-58
Smith-Waterman score: 1313; 66.0% identity (85.6% similar) in 306 aa overlap (20-325:2-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MSYFPILFFFFLKRCPSYTEPQNLTGVSEFLLLGLSEDPELQPVLAGLFLSMYLVTVLGN
: .::: .:.:::::::.:::::::: ::::::::::::::
CCDS32 MEAENLTELSKFLLLGLSDDPELQPVLFGLFLSMYLVTVLGN
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LLIILAVSSDSHLHTPMYFFLSNLSLADIGFTSTTVPKMIVDMQTHSRVISYEGCLTQMS
:::::::::::::::::::::::::..:: : :::::::.:..:..:. ::: :::::.
CCDS32 LLIILAVSSDSHLHTPMYFFLSNLSFVDICFISTTVPKMLVSIQARSKDISYMGCLTQVY
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 FFVLFACMDDMLLSVMAYDRFVAICHPLHYRIIMNPRLCGFLILLSFFISLLDSQLHNLI
:...:: :: .::.:::::::::::::::: .:::: :::.:.: :.:: . : .: :.
CCDS32 FLMMFAGMDTFLLAVMAYDRFVAICHPLHYTVIMNPCLCGLLVLASWFIIFWFSLVHILL
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 MLQLTCFKDVDISNFFCDPSQLLHLRCSDTFINEMVIYFMGAIFGCLPISGILFSYYKIV
: .:: ..: .:::.:.:.:.. ::.:..:..:.: :..: .:..:::::: .::
CCDS32 MKRLTFSTGTEIPHFFCEPAQVLKVACSNTLLNNIVLYVATALLGVFPVAGILFSYSQIV
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SPILRVPTSDGKYKAFSTCGSHLAVVCLFYGTGLVGYLSSAVLPSPRKSMVASVMYTVVT
: .. . .. ::::::::::::: :: ::::::: :::::: : ..: .:::::..::
CCDS32 SSLMGMSSTKGKYKAFSTCGSHLCVVSLFYGTGLGVYLSSAVTHSSQSSSTASVMYAMVT
230 240 250 260 270 280
310 320 330
pF1KE5 PMLNPFIYSLRNKDIQSALCRLHGRIIKSHHLHPFCYMG
::::::::::::::...:: :: .:
CCDS32 PMLNPFIYSLRNKDVKGALERLLSRADSCP
290 300 310
>>CCDS12320.1 OR7C2 gene_id:26658|Hs108|chr19 (319 aa)
initn: 1309 init1: 974 opt: 1312 Z-score: 1154.5 bits: 221.9 E(32554): 5.5e-58
Smith-Waterman score: 1312; 64.0% identity (86.8% similar) in 303 aa overlap (20-322:2-303)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MSYFPILFFFFLKRCPSYTEPQNLTGVSEFLLLGLSEDPELQPVLAGLFLSMYLVTVLGN
: : : :..:::::..:: ..: .: ::::::::::..::
CCDS12 MERGNQTEVGNFLLLGFAEDSDMQLLLHGLFLSMYLVTIIGN
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LLIILAVSSDSHLHTPMYFFLSNLSLADIGFTSTTVPKMIVDMQTHSRVISYEGCLTQMS
:::::..::::::::::::::::::.::: :::::::::.:..::.:..:.. :::::.
CCDS12 LLIILTISSDSHLHTPMYFFLSNLSFADICFTSTTVPKMLVNIQTQSKMITFAGCLTQIF
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 FFVLFACMDDMLLSVMAYDRFVAICHPLHYRIIMNPRLCGFLILLSFFISLLDSQLHNLI
::. :.:.:..::.. :::::::::.:::: .::::::::.:.: :. ::.. : :..:
CCDS12 FFIAFGCLDNLLLTMTAYDRFVAICYPLHYTVIMNPRLCGLLVLGSWCISVMGSLLETLT
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 MLQLTCFKDVDISNFFCDPSQLLHLRCSDTFINEMVIYFMGAIFGCLPISGILFSYYKIV
.:.:. ...: .::::::..:.: :::::::..:.::. ..: .:. :::::: .:
CCDS12 ILRLSFCTNMEIPHFFCDPSEVLKLACSDTFINNIVMYFVTIVLGVFPLCGILFSYSQIF
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SPILRVPTSDGKYKAFSTCGSHLAVVCLFYGTGLVGYLSSAVLPSPRKSMVASVMYTVVT
: .::: .. :..::::::::::.:: ::::::: :::::: : : :..::::::.::
CCDS12 SSVLRV-SARGQHKAFSTCGSHLSVVSLFYGTGLGVYLSSAVTPPSRTSLAASVMYTMVT
230 240 250 260 270 280
310 320 330
pF1KE5 PMLNPFIYSLRNKDIQSALCRLHGRIIKSHHLHPFCYMG
::::::::::::::....: ::
CCDS12 PMLNPFIYSLRNKDMKGSLGRLLLRATSLKEGTIAKLS
290 300 310
>>CCDS12319.1 OR7A17 gene_id:26333|Hs108|chr19 (309 aa)
initn: 1299 init1: 1299 opt: 1299 Z-score: 1143.4 bits: 219.8 E(32554): 2.3e-57
Smith-Waterman score: 1299; 65.7% identity (85.7% similar) in 300 aa overlap (20-319:2-301)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MSYFPILFFFFLKRCPSYTEPQNLTGVSEFLLLGLSEDPELQPVLAGLFLSMYLVTVLGN
::.: ::.:::.::::::.::::: : ::::::::::::::
CCDS12 MEPENDTGISEFVLLGLSEEPELQPFLFGLFLSMYLVTVLGN
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LLIILAVSSDSHLHTPMYFFLSNLSLADIGFTSTTVPKMIVDMQTHSRVISYEGCLTQMS
::::::. :::::::::::::::::.::: : :::.:::....::.::::.: ::.:::
CCDS12 LLIILATISDSHLHTPMYFFLSNLSFADICFISTTIPKMLINIQTQSRVITYAGCITQMC
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 FFVLFACMDDMLLSVMAYDRFVAICHPLHYRIIMNPRLCGFLILLSFFISLLDSQLHNLI
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CCDS12 FFVLFGGLDSLLLAVMAYDRFVAICHPLHYTVIMNPRLCGLLVLASWMIAALNSLSQSLM
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 MLQLTCFKDVDISNFFCDPSQLLHLRCSDTFINEMVIYFMGAIFGCLPISGILFSYYKIV
.: :. :..: .:::. .:..:: :::::.:.: .:: ..... :. ::: :: :::
CCDS12 VLWLSFCTDLEIPHFFCELNQVIHLACSDTFLNDMGMYFAAGLLAGGPLVGILCSYSKIV
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SPILRVPTSDGKYKAFSTCGSHLAVVCLFYGTGLVGYLSSAVLPSPRKSMVASVMYTVVT
: : . ...:::::::::.:::.:: :: ::: ::.::. . . : .:::::::.:
CCDS12 SSIRAISSAQGKYKAFSTCASHLSVVSLFCCTGLGVYLTSAATHNSHTSATASVMYTVAT
230 240 250 260 270 280
310 320 330
pF1KE5 PMLNPFIYSLRNKDIQSALCRLHGRIIKSHHLHPFCYMG
:::::::::::::::. ::
CCDS12 PMLNPFIYSLRNKDIKRALKMSFRGKQ
290 300
>>CCDS12317.1 OR7C1 gene_id:26664|Hs108|chr19 (320 aa)
initn: 1308 init1: 1260 opt: 1271 Z-score: 1119.1 bits: 215.4 E(32554): 5.2e-56
Smith-Waterman score: 1271; 62.4% identity (83.7% similar) in 306 aa overlap (20-325:2-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MSYFPILFFFFLKRCPSYTEPQNLTGVSEFLLLGLSEDPELQPVLAGLFLSMYLVTVLGN
: : : ..::::::.: :.: .: :::::::::: ::
CCDS12 METGNQTHAQEFLLLGFSATSEIQFILFGLFLSMYLVTFTGN
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LLIILAVSSDSHLHTPMYFFLSNLSLADIGFTSTTVPKMIVDMQTHSRVISYEGCLTQMS
::::::. :::::::::::::::::.::. :::::::::.... :... :.: :::.:.
CCDS12 LLIILAICSDSHLHTPMYFFLSNLSFADLCFTSTTVPKMLLNILTQNKFITYAGCLSQIF
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 FFVLFACMDDMLLSVMAYDRFVAICHPLHYRIIMNPRLCGFLILLSFFISLLDSQLHNLI
::. :.:.:..::.:::::::::.:::::: .::::.:::.:.: :. ::.. : :..:
CCDS12 FFTSFGCLDNLLLTVMAYDRFVAVCHPLHYTVIMNPQLCGLLVLGSWCISVMGSLLETLT
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 MLQLTCFKDVDISNFFCDPSQLLHLRCSDTFINEMVIYFMGAIFGCLPISGILFSYYKIV
.:.:. ...: .:::: ..:.: :::::::..:::: ...: . ..::.:::::::
CCDS12 VLRLSFCTEMEIPHFFCDLLEVLKLACSDTFINNVVIYFATGVLGVISFTGIFFSYYKIV
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SPILRVPTSDGKYKAFSTCGSHLAVVCLFYGTGLVGYLSSAVLPSPRKSMVASVMYTVVT
:::. .. :.::::::::::.:: ::::::. :::::. :: : :.:::::::.::
CCDS12 FSILRISSAGRKHKAFSTCGSHLSVVTLFYGTGFGVYLSSAATPSSRTSLVASVMYTMVT
230 240 250 260 270 280
310 320 330
pF1KE5 PMLNPFIYSLRNKDIQSALCRLHGRIIKSHHLHPFCYMG
:::::::::::: :.. :: :: .:
CCDS12 PMLNPFIYSLRNTDMKRALGRLLSRATFFNGDITAGLS
290 300 310 320
>>CCDS32899.1 OR7G3 gene_id:390883|Hs108|chr19 (312 aa)
initn: 1266 init1: 1266 opt: 1270 Z-score: 1118.3 bits: 215.2 E(32554): 5.7e-56
Smith-Waterman score: 1270; 60.7% identity (86.7% similar) in 308 aa overlap (23-330:5-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MSYFPILFFFFLKRCPSYTEPQNLTGVSEFLLLGLSEDPELQPVLAGLFLSMYLVTVLGN
:.. . ::.::::: ::::::.: :::::::.:.:::
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CCDS32 PMLNPFIYSLRNKHIKGAMKTFFRGKQ
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CCDS32 MPMQLLLTDFIIFSIRFIINSMEARNQTAISKFLLLGLIEDPELQPVLFSLFLSMYLVTI
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CCDS32 LGNLLILLAVISDSHLHTPMYFFLSNLSFLDICLSTTTIPKMLVNIQAQNRSITYSGCLT
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pF1KE5 QMSFFVLFACMDDMLLSVMAYDRFVAICHPLHYRIIMNPRLCGFLILLSFFISLLDSQLH
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CCDS32 QICFVLFFAGLENCLLAAMAYDRYVAICHPLRYTVIMNPRLCGLLILLSLLTSVVNALLL
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CCDS32 SLMVLRLSFCTDLEIPLFFCELAQVIQLTCSDTLINNILIYFAACIFGGVPLSGIILSYT
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CCDS32 QITSCVLRMPSASGKHKAVSTCGSHLSIVLLFYGAGLGVYISSVVTDSPRKTAVASVMYS
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CCDS32 VFPQMVNPFIYSLRNKDMKGTLRKFIGRIPSLLWCAICFGFRFLE
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>>CCDS32900.1 OR7D2 gene_id:162998|Hs108|chr19 (312 aa)
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CCDS32 MEAGNQTGFLEFILLGLSEDPELQPFIFGLFLSMYLVTVLGN
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CCDS32 LLIILAISSDSHLHTPMYFFLSNLSWVDICFSTCIVPKMLVNIQTENKAISYMDCLTQVY
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CCDS32 FSMFFPILDTLLLTVMAYDRFVAVCHPLHYMIIMNPHLCGLLVFVTWLIGVMTSLLHISL
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CCDS32 MMHLIFCKDFEIPHFFCELTYILQLACSDTFLNSTLIYFMTGVLGVFPLLGIIFSYSRIA
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CCDS32 PMLNPFIYSLRNKDVKGALGSLLSRAASCL
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CCDS12 MEPGNDTQISEFLLLGFSQEPGLQPFLFGLFLSMYLVTVLGN
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CCDS12 LLIILATISDSHLHTPMYFFLSNLSFADICVTSTTIPKMLMNIQTQNKVITYIACLMQMY
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pF1KE5 FFVLFACMDDMLLSVMAYDRFVAICHPLHYRIIMNPRLCGFLILLSFFISLLDSQLHNLI
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CCDS12 FFILFAGFENFLLSVMAYDRFVAICHPLHYMVIMNPHLCGLLVLASWTMSALYSLLQILM
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CCDS12 VVRLSFCTALEIPHFFCELNQVIQLACSDSFLNHMVIYFTVALLGGGPLTGILYSYSKII
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