Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5484
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5484, 335 aa
1>>>pF1KE5484 335 - 335 aa - 335 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9008+/-0.00117; mu= 12.5968+/- 0.068
mean_var=181.0487+/-63.306, 0's: 0 Z-trim(101.8): 413 B-trim: 370 in 1/50
Lambda= 0.095318
statistics sampled from 6162 (6677) to 6162 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.545), E-opt: 0.2 (0.205), width: 16
Scan time: 1.920
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31102.1 OR2AK2 gene_id:391191|Hs108|chr1 ( 335) 2181 313.4 1.7e-85
CCDS31104.1 OR2L3 gene_id:391192|Hs108|chr1 ( 312) 1207 179.4 3.4e-45
CCDS58068.1 OR2L5 gene_id:81466|Hs108|chr1 ( 312) 1157 172.5 4e-43
CCDS31124.1 OR2T27 gene_id:403239|Hs108|chr1 ( 317) 1157 172.5 4e-43
CCDS31103.1 OR2L2 gene_id:26246|Hs108|chr1 ( 312) 1147 171.1 1e-42
CCDS31115.1 OR2T1 gene_id:26696|Hs108|chr1 ( 369) 1122 167.8 1.2e-41
CCDS1637.1 OR2L13 gene_id:284521|Hs108|chr1 ( 312) 1115 166.7 2.2e-41
CCDS31105.1 OR2M5 gene_id:127059|Hs108|chr1 ( 312) 1101 164.8 8.3e-41
CCDS31116.1 OR2T2 gene_id:401992|Hs108|chr1 ( 324) 1094 163.9 1.7e-40
CCDS31106.1 OR2M2 gene_id:391194|Hs108|chr1 ( 347) 1093 163.8 1.9e-40
CCDS4461.1 OR2V2 gene_id:285659|Hs108|chr5 ( 315) 1088 163.0 2.9e-40
CCDS31123.1 OR2T35 gene_id:403244|Hs108|chr1 ( 323) 1082 162.2 5.2e-40
CCDS31107.1 OR2M3 gene_id:127062|Hs108|chr1 ( 312) 1079 161.8 6.8e-40
CCDS58992.1 OR2V1 gene_id:26693|Hs108|chr5 ( 315) 1066 160.0 2.4e-39
CCDS31111.1 OR2M7 gene_id:391196|Hs108|chr1 ( 312) 1065 159.9 2.6e-39
CCDS31114.1 OR2T6 gene_id:254879|Hs108|chr1 ( 308) 1034 155.6 4.9e-38
CCDS31413.1 OR2AG2 gene_id:338755|Hs108|chr11 ( 316) 1027 154.6 9.7e-38
CCDS31121.1 OR2T10 gene_id:127069|Hs108|chr1 ( 312) 1010 152.3 4.9e-37
CCDS31414.1 OR2AG1 gene_id:144125|Hs108|chr11 ( 316) 989 149.4 3.6e-36
CCDS32895.1 OR2Z1 gene_id:284383|Hs108|chr19 ( 314) 987 149.1 4.4e-36
CCDS31109.1 OR2T33 gene_id:391195|Hs108|chr1 ( 320) 984 148.7 5.9e-36
CCDS31108.1 OR2M4 gene_id:26245|Hs108|chr1 ( 311) 972 147.1 1.8e-35
CCDS31100.1 OR2T8 gene_id:343172|Hs108|chr1 ( 312) 969 146.7 2.4e-35
CCDS31118.1 OR2T5 gene_id:401993|Hs108|chr1 ( 315) 969 146.7 2.4e-35
CCDS55695.1 OR2T29 gene_id:343563|Hs108|chr1 ( 315) 968 146.5 2.7e-35
CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11 ( 330) 965 146.1 3.7e-35
CCDS31117.1 OR2T3 gene_id:343173|Hs108|chr1 ( 318) 961 145.6 5.3e-35
CCDS34696.1 OR2AE1 gene_id:81392|Hs108|chr7 ( 323) 955 144.7 9.4e-35
CCDS31113.1 OR2T4 gene_id:127074|Hs108|chr1 ( 348) 954 144.7 1.1e-34
CCDS31110.1 OR2T12 gene_id:127064|Hs108|chr1 ( 320) 950 144.1 1.5e-34
CCDS31120.1 OR2T34 gene_id:127068|Hs108|chr1 ( 318) 945 143.4 2.4e-34
CCDS43434.1 OR2J2 gene_id:26707|Hs108|chr6 ( 312) 940 142.7 3.9e-34
CCDS35092.1 OR13C2 gene_id:392376|Hs108|chr9 ( 318) 936 142.1 5.7e-34
CCDS43433.1 OR2J3 gene_id:442186|Hs108|chr6 ( 311) 928 141.0 1.2e-33
CCDS31090.1 OR2B11 gene_id:127623|Hs108|chr1 ( 317) 923 140.3 2e-33
CCDS35089.1 OR13C3 gene_id:138803|Hs108|chr9 ( 347) 921 140.1 2.5e-33
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 917 139.5 3.5e-33
CCDS31416.1 OR2D2 gene_id:120776|Hs108|chr11 ( 308) 914 139.1 4.6e-33
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 912 138.8 5.6e-33
CCDS34364.1 OR10C1 gene_id:442194|Hs108|chr6 ( 312) 910 138.5 6.7e-33
CCDS34365.1 OR2H2 gene_id:7932|Hs108|chr6 ( 312) 909 138.4 7.4e-33
CCDS4642.1 OR2B6 gene_id:26212|Hs108|chr6 ( 313) 909 138.4 7.4e-33
CCDS35093.1 OR13C9 gene_id:286362|Hs108|chr9 ( 318) 909 138.4 7.5e-33
CCDS43668.1 OR2A5 gene_id:393046|Hs108|chr7 ( 311) 905 137.8 1.1e-32
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 904 137.7 1.2e-32
CCDS43666.1 OR2F2 gene_id:135948|Hs108|chr7 ( 317) 904 137.7 1.2e-32
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 899 137.0 2e-32
CCDS35091.1 OR13C5 gene_id:138799|Hs108|chr9 ( 318) 898 136.9 2.1e-32
CCDS34358.1 OR2B3 gene_id:442184|Hs108|chr6 ( 313) 895 136.5 2.8e-32
CCDS10496.1 OR1F1 gene_id:4992|Hs108|chr16 ( 312) 894 136.3 3.1e-32
>>CCDS31102.1 OR2AK2 gene_id:391191|Hs108|chr1 (335 aa)
initn: 2181 init1: 2181 opt: 2181 Z-score: 1648.4 bits: 313.4 E(32554): 1.7e-85
Smith-Waterman score: 2181; 99.7% identity (100.0% similar) in 335 aa overlap (1-335:1-335)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MNISDVISFDILVSAMKTGNQSFGTDFLLVGLFQYGWINSLLFVVIATLFTVALTGNIML
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CCDS31 MNISDVISFDILVSAMKTGNQSFGTDFLLVGLFQYGWINSLLFVVIATLFTVALTGNIML
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 IHLIRLNTRLHTPMYFLLSQLSIVDLMYISTTVPKMAVSFLSQSKTIRFLGCEIQTYVFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 IHLIRLNTRLHTPMYFLLSQLSIVDLMYISTTVPKMAVSFLSQSKTIRFLGCEIQTYVFL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 ALGGTEALLLGFMSYDRYVAICHPLHYPMLMSKKICCLMVACAWASGSINAFIHTLYVFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 ALGGTEALLLGFMSYDRYVAICHPLHYPMLMSKKICCLMVACAWASGSINAFIHTLYVFQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 LPFCRSRLINHFFCEVPALLSLMCQDTSQYEYTVLLSGLIILLLPFLAILASYARVLIVV
::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LPFCRSRLINHFFCEVPALLSLVCQDTSQYEYTVLLSGLIILLLPFLAILASYARVLIVV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 FQMSSGKGQAKAVSTCSSHLIVASLFYATTLFTYTRPHSLRSPSRDKAVAVFYTIVTPLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FQMSSGKGQAKAVSTCSSHLIVASLFYATTLFTYTRPHSLRSPSRDKAVAVFYTIVTPLL
250 260 270 280 290 300
310 320 330
pF1KE5 NPFIYSLRNKEVTGAVRRLLGYWICCRKYDFRSLY
:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 NPFIYSLRNKEVTGAVRRLLGYWICCRKYDFRSLY
310 320 330
>>CCDS31104.1 OR2L3 gene_id:391192|Hs108|chr1 (312 aa)
initn: 1255 init1: 1194 opt: 1207 Z-score: 924.8 bits: 179.4 E(32554): 3.4e-45
Smith-Waterman score: 1207; 57.5% identity (82.7% similar) in 313 aa overlap (16-328:1-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MNISDVISFDILVSAMKTGNQSFGTDFLLVGLFQYGWINSLLFVVIATLFTVALTGNIML
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CCDS31 MENYNQT-STDFILLGFFPPSRIGLFLFILIVFIFLMALIGNLSM
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 IHLIRLNTRLHTPMYFLLSQLSIVDLMYISTTVPKMAVSFLSQSKTIRFLGCEIQTYVFL
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CCDS31 ILLIFLDTHLHTPMYFLLSQLSLIDLNYISTIVPKMASDFLSGNKSISFTGCGIQSFFFS
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130 140 150 160 170 180
pF1KE5 ALGGTEALLLGFMSYDRYVAICHPLHYPMLMSKKICCLMVACAWASGSINAFIHTLYVFQ
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CCDS31 ALGGAEALLLASMAYDRYIAICFPLHYPIRMSKRMCVLMITGSWIIGSINACAHTVYVLH
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 LPFCRSRLINHFFCEVPALLSLMCQDTSQYEYTVLLSGLIILLLPFLAILASYARVLIVV
.:.:.:: ::::::.:::...: :.:: :: ::.:: :.:..::.:: ::.:::..:
CCDS31 IPYCQSRAINHFFCDVPAMVTLACMDTWVYEGTVFLSTTIFLVFPFIAISCSYGRVLLAV
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 FQMSSGKGQAKAVSTCSSHLIVASLFYATTLFTYTRPHSLRSPSRDKAVAVFYTIVTPLL
..:.:..:. :: :::.:: :....:: ..:: ::.:::::..::..::::: .::.:
CCDS31 YHMKSAEGRKKAYLTCSTHLTVVTFYYAPFVYTYLRPRSLRSPTEDKVLAVFYTTLTPML
230 240 250 260 270 280
310 320 330
pF1KE5 NPFIYSLRNKEVTGAVRRLLGYWICCRKYDFRSLY
::.::::::::: ::. :. . :: :
CCDS31 NPIIYSLRNKEVMGALTRV-SQRICSGKM
290 300 310
>>CCDS58068.1 OR2L5 gene_id:81466|Hs108|chr1 (312 aa)
initn: 1189 init1: 1148 opt: 1157 Z-score: 887.7 bits: 172.5 E(32554): 4e-43
Smith-Waterman score: 1157; 56.4% identity (82.6% similar) in 305 aa overlap (16-320:1-304)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MNISDVISFDILVSAMKTGNQSFGTDFLLVGLFQYGWINSLLFVVIATLFTVALTGNIML
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CCDS58 MENYNQT-STDFILLGLFPPSKIGLFLFILFVLIFLMALIGNLSM
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 IHLIRLNTRLHTPMYFLLSQLSIVDLMYISTTVPKMAVSFLSQSKTIRFLGCEIQTYVFL
: :: :.:.:::::::::::::..:: :::: ::::: .:: .:.: :.:: ::.. :.
CCDS58 ILLIFLDTHLHTPMYFLLSQLSLIDLNYISTIVPKMASDFLYGNKSISFIGCGIQSFFFM
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130 140 150 160 170 180
pF1KE5 ALGGTEALLLGFMSYDRYVAICHPLHYPMLMSKKICCLMVACAWASGSINAFIHTLYVFQ
...:.::::: :.:::::::: :::::. :::.. ::.. .: ::::. ::.:.:.
CCDS58 TFAGAEALLLTSMAYDRYVAICFPLHYPIRMSKRMYVLMITGSWMIGSINSCAHTVYAFR
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190 200 210 220 230 240
pF1KE5 LPFCRSRLINHFFCEVPALLSLMCQDTSQYEYTVLLSGLIILLLPFLAILASYARVLIVV
.:.:.:: ::::::.:::.:.: : :: :::::.::. :.:..:: .: ::. ::..:
CCDS58 IPYCKSRAINHFFCDVPAMLTLACTDTWVYEYTVFLSSTIFLVFPFTGIACSYGWVLLAV
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 FQMSSGKGQAKAVSTCSSHLIVASLFYATTLFTYTRPHSLRSPSRDKAVAVFYTIVTPLL
..: :..:. :: ::::.:: :....:: .:: :.:::: ..::..::::::.::.:
CCDS58 YRMHSAEGRKKAYSTCSTHLTVVTFYYAPFAYTYLCPRSLRSLTEDKVLAVFYTILTPML
230 240 250 260 270 280
310 320 330
pF1KE5 NPFIYSLRNKEVTGAVRRLLGYWICCRKYDFRSLY
::.::::::::: ::. :..
CCDS58 NPIIYSLRNKEVMGALTRVIQNIFSVKM
290 300 310
>>CCDS31124.1 OR2T27 gene_id:403239|Hs108|chr1 (317 aa)
initn: 1165 init1: 1143 opt: 1157 Z-score: 887.6 bits: 172.5 E(32554): 4e-43
Smith-Waterman score: 1157; 54.9% identity (85.3% similar) in 306 aa overlap (16-321:1-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MNISDVISFDILVSAMKTGNQSFGTDFLLVGLFQYGWINSLLFVVIATLFTVALTGNIML
:. .: : .::.:.:::. . . :::..: .: .....:..
CCDS31 MEQSNYSVYADFILLGLFSNARFPWLLFALILLVFLTSIASNVVK
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 IHLIRLNTRLHTPMYFLLSQLSIVDLMYISTTVPKMAVSFLSQSKTIRFLGCEIQTYVFL
: ::....::::::::::::::. :..:::: :::: :. . ....: : :: : ...:
CCDS31 IILIHIDSRLHTPMYFLLSQLSLRDILYISTIVPKMLVDQVMSQRAISFAGCTAQHFLYL
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 ALGGTEALLLGFMSYDRYVAICHPLHYPMLMSKKICCLMVACAWASGSINAFIHTLYVFQ
.:.:.: .:::.::::::::::.:::::.:::.::: :.:: :: .:::..:. : ..:
CCDS31 TLAGAEFFLLGLMSYDRYVAICNPLHYPVLMSRKICWLIVAAAWLGGSIDGFLLTPVTMQ
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 LPFCRSRLINHFFCEVPALLSLMCQDTSQYEYTVLLSGLIILLLPFLAILASYARVLIVV
.::: :: ::::::::::::.: : ::: :: .. . ...::.:: .: .::.:.::.:
CCDS31 FPFCASREINHFFCEVPALLKLSCTDTSAYETAMYVCCIMMLLIPFSVISGSYTRILITV
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 FQMSSGKGQAKAVSTCSSHLIVASLFYATTLFTYTRPHSLRSPSRDKAVAVFYTIVTPLL
..:: ..:..:::.:::::..:.::::.....::. ::: ..: .::::..::::.::.:
CCDS31 YRMSEAEGRGKAVATCSSHMVVVSLFYGAAMYTYVLPHSYHTPEQDKAVSAFYTILTPML
230 240 250 260 270 280
310 320 330
pF1KE5 NPFIYSLRNKEVTGAVRRLLGYWICCRKYDFRSLY
::.:::::::.::::.....:
CCDS31 NPLIYSLRNKDVTGALQKVVGRCVSSGKVTTF
290 300 310
>>CCDS31103.1 OR2L2 gene_id:26246|Hs108|chr1 (312 aa)
initn: 1160 init1: 1138 opt: 1147 Z-score: 880.2 bits: 171.1 E(32554): 1e-42
Smith-Waterman score: 1147; 55.7% identity (82.0% similar) in 305 aa overlap (16-320:1-304)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MNISDVISFDILVSAMKTGNQSFGTDFLLVGLFQYGWINSLLFVVIATLFTVALTGNIML
:.. ::. .:::.:.::: . :. ..:..: .: .:: ::. .
CCDS31 MENYNQT-STDFILLGLFPQSRIGLFVFTLIFLIFLMALIGNLSM
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 IHLIRLNTRLHTPMYFLLSQLSIVDLMYISTTVPKMAVSFLSQSKTIRFLGCEIQTYVFL
: :: :. .:::::::::::::..:: :::: ::::. .:: .:.: : :: ::.. ::
CCDS31 ILLIFLDIHLHTPMYFLLSQLSLIDLNYISTIVPKMVYDFLYGNKSISFTGCGIQSFFFL
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 ALGGTEALLLGFMSYDRYVAICHPLHYPMLMSKKICCLMVACAWASGSINAFIHTLYVFQ
.:. .:.::: :.:::::::: :::::. .::..: .:.. .: .:::. ::.:..
CCDS31 TLAVAEGLLLTSMAYDRYVAICFPLHYPIRISKRVCVMMITGSWMISSINSCAHTVYALC
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 LPFCRSRLINHFFCEVPALLSLMCQDTSQYEYTVLLSGLIILLLPFLAILASYARVLIVV
.:.:.:: ::::::.:::.:.: : :: :: ::.::. :.:.::: .: ::.:::..:
CCDS31 IPYCKSRAINHFFCDVPAMLTLACTDTWVYESTVFLSSTIFLVLPFTGIACSYGRVLLAV
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 FQMSSGKGQAKAVSTCSSHLIVASLFYATTLFTYTRPHSLRSPSRDKAVAVFYTIVTPLL
..: :..:. :: ::::.:: :.:..:: .::.::.:::::..:: .::::::.::.:
CCDS31 YRMHSAEGRKKAYSTCSTHLTVVSFYYAPFAYTYVRPRSLRSPTEDKILAVFYTILTPML
230 240 250 260 270 280
310 320 330
pF1KE5 NPFIYSLRNKEVTGAVRRLLGYWICCRKYDFRSLY
::.::::::::: ::. ...
CCDS31 NPIIYSLRNKEVMGALTQVIQKIFSVKM
290 300 310
>>CCDS31115.1 OR2T1 gene_id:26696|Hs108|chr1 (369 aa)
initn: 1113 init1: 1113 opt: 1122 Z-score: 860.9 bits: 167.8 E(32554): 1.2e-41
Smith-Waterman score: 1122; 52.4% identity (83.2% similar) in 309 aa overlap (13-321:49-356)
10 20 30 40
pF1KE5 MNISDVISFDILVSAMKTGNQSFGTDFLLVGLFQYGWINSLL
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50 60 70 80 90 100
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CCDS31 FAIISIIFFTALMANGVMIFLIQTDLRLHTPMYFLLSHLSLIDMMYISTIVPKMLVNYLL
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110 120 130 140 150 160
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170 180 190 200 210 220
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230 240 250 260 270 280
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290 300 310 320 330
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CCDS16 IHLIHVDPRLHTPMYFLLSQLSLMDLMYISTTVPKMAYNFLSGQKGISFLGCGVQSFFFL
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CCDS16 YHMHSKEGRKKAFTTISTHLTVVIFYYAPFVYTYLRPRNLRSPAEDKILAVFYTILTPML
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CCDS16 NPIIYSLRNKEVLGAMRRVFGIFSFLKE
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CCDS31 VLLIYLDTQLHTPMYFLLSQLFLMDLMLICSTVPKMAFNYLSGSKSISMAGCATQIFFYV
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CCDS31 SLLGSECFLLAVMSYDRYIAICHPLRYTNLMRPKICGLMTAFSWILGSMDAIIDAVATFS
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CCDS31 FSYCGSREIAHFFCDFPSLLILSCNDTSIFEKVLFICCIVMIVFPVAIIIASYARVILAV
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CCDS31 IHMGSGEGRRKAFTTCSSHLMVVGMYYGAGLFMYIRPTSDRSPMQDKLVSVFYTILTPML
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CCDS31 NPLIYSLRNKEVTRALRKVLGKGKCGE
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CCDS31 MGMEGLLQNSTNFVLTGLITHPAFPGLLFAIVFSIFVVAITANLVM
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CCDS31 ILLIHMDSRLHTPMYFLLSQLSIMDTIYICITVPKMLQDLLSKDKTISFLGCAVQIFLYL
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CCDS31 TLIGGEFFLLGLMAYDRYVAVCNPLRYPLLMNRRVCLFMVVGSWVGGSLDGFMLTPVTMS
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CCDS31 FPFCRSREINHFFCEIPAVLKLSCTDTSLYETLMYACCVLMLLIPLSVISVSYTHILLTV
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CCDS31 NPLIYSLRNKDVAAALRKVLGRCGSSQSIRVATVIRKG
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CCDS31 MAWENQTFNSDFILLGIFNHSPPHTFLFFLVLGIFLVAFMGNSVM
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CCDS31 VLLIYLDTQLHTPMYFLLSQLSLMDLMLICTTVPKMAFNYLSGSKSISMAGCVTQIFFYI
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CCDS31 SLSGSECFLLAVMAYDRYIAICHPLRYTNLMNPKICGLMATFSWILGSTDGIIDAVATFS
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CCDS31 FSFCGSREIAHFFCEFPSLLILSCNDTSIFEEVIFICCIVMLVFPVAIIIASYARVILAV
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]