FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5483, 335 aa
1>>>pF1KE5483 335 - 335 aa - 335 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5772+/-0.00147; mu= 8.8618+/- 0.084
mean_var=157.0973+/-55.131, 0's: 0 Z-trim(100.6): 392 B-trim: 719 in 2/46
Lambda= 0.102327
statistics sampled from 5690 (6183) to 5690 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.516), E-opt: 0.2 (0.19), width: 16
Scan time: 1.660
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS41611.1 OR52B6 gene_id:340980|Hs108|chr11 ( 335) 2191 336.5 1.8e-92
CCDS53598.1 OR52B2 gene_id:255725|Hs108|chr11 ( 323) 1259 198.9 4.7e-51
CCDS31386.1 OR52H1 gene_id:390067|Hs108|chr11 ( 320) 1174 186.3 2.8e-47
CCDS31384.1 OR52D1 gene_id:390066|Hs108|chr11 ( 318) 1139 181.2 1e-45
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CCDS31401.1 OR52E4 gene_id:390081|Hs108|chr11 ( 312) 1056 168.9 4.8e-42
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CCDS31351.1 OR52K2 gene_id:119774|Hs108|chr11 ( 314) 1025 164.3 1.2e-40
CCDS31370.1 OR52J3 gene_id:119679|Hs108|chr11 ( 311) 1018 163.3 2.4e-40
CCDS44528.1 OR52N4 gene_id:390072|Hs108|chr11 ( 321) 1015 162.9 3.3e-40
CCDS31397.1 OR52N5 gene_id:390075|Hs108|chr11 ( 324) 997 160.2 2.1e-39
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CCDS31353.1 OR52M1 gene_id:119772|Hs108|chr11 ( 317) 924 149.4 3.6e-36
CCDS31374.1 OR52A1 gene_id:23538|Hs108|chr11 ( 312) 920 148.8 5.3e-36
CCDS31373.1 OR52A5 gene_id:390054|Hs108|chr11 ( 316) 915 148.1 9e-36
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CCDS31358.2 OR51E1 gene_id:143503|Hs108|chr11 ( 318) 910 147.4 1.5e-35
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CCDS31364.1 OR51A7 gene_id:119687|Hs108|chr11 ( 312) 839 136.9 2.1e-32
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CCDS31381.1 OR51Q1 gene_id:390061|Hs108|chr11 ( 317) 834 136.1 3.6e-32
CCDS31368.1 OR51A2 gene_id:401667|Hs108|chr11 ( 313) 817 133.6 2e-31
CCDS31379.1 OR51B6 gene_id:390058|Hs108|chr11 ( 312) 816 133.5 2.2e-31
CCDS31407.1 OR52W1 gene_id:120787|Hs108|chr11 ( 320) 812 132.9 3.4e-31
CCDS53596.1 OR51M1 gene_id:390059|Hs108|chr11 ( 326) 806 132.0 6.4e-31
CCDS31363.1 OR51T1 gene_id:401665|Hs108|chr11 ( 354) 795 130.4 2.1e-30
CCDS31404.1 OR56A4 gene_id:120793|Hs108|chr11 ( 365) 767 126.3 3.7e-29
CCDS31405.1 OR56A1 gene_id:120796|Hs108|chr11 ( 318) 742 122.6 4.4e-28
CCDS73248.1 OR56A5 gene_id:390084|Hs108|chr11 ( 313) 735 121.5 8.9e-28
CCDS31395.1 OR56B1 gene_id:387748|Hs108|chr11 ( 324) 723 119.8 3.1e-27
CCDS41614.1 OR56A3 gene_id:390083|Hs108|chr11 ( 315) 718 119.0 5.1e-27
CCDS31406.1 OR56B4 gene_id:196335|Hs108|chr11 ( 319) 713 118.3 8.6e-27
CCDS7757.1 OR51B4 gene_id:79339|Hs108|chr11 ( 310) 698 116.1 3.9e-26
CCDS31639.1 OR2AT4 gene_id:341152|Hs108|chr11 ( 320) 671 112.1 6.3e-25
CCDS31362.1 OR51S1 gene_id:119692|Hs108|chr11 ( 323) 644 108.1 1e-23
CCDS6844.1 OR1N1 gene_id:138883|Hs108|chr9 ( 311) 633 106.5 3e-23
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 628 105.7 5.1e-23
>>CCDS41611.1 OR52B6 gene_id:340980|Hs108|chr11 (335 aa)
initn: 2191 init1: 2191 opt: 2191 Z-score: 1773.4 bits: 336.5 E(32554): 1.8e-92
Smith-Waterman score: 2191; 99.7% identity (100.0% similar) in 335 aa overlap (1-335:1-335)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MAQVRALHKIMALFSANSIGAMNNSDTRIAGCFLTGIPGLEQLHIWLSIPFCIMYITALE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 MAQVRALHKIMALFSANSIGAMNNSDTRIAGCFLTGIPGLEQLHIWLSIPFCIMYITALE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 GNGILICVILSQAILHEPMYIFLSMLASADVLLSTTTMPKALANLWLGYSLISFDGCLTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 GNGILICVILSQAILHEPMYIFLSMLASADVLLSTTTMPKALANLWLGYSLISFDGCLTQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 MFFIHFLFIHSAVLLAMAFDRYVAICSPLRYVTILTSKVIGKIVTAALSHSFIIMFPSIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 MFFIHFLFIHSAVLLAMAFDRYVAICSPLRYVTILTSKVIGKIVTAALSHSFIIMFPSIF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 LLEHLHYCQINIIAHTFCEHMGIAHLSCSDISINVWYGLAAALLSTGLDIMLITVSYIHI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LLEHLHYCQINIIAHTFCEHMGIAHLSCSDISINVWYGLAAALLSTGLDIMLITVSYIHI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 LQAVFRLLSQDARSKALSTCGSHICVILLFYVPALFSVFAYRFGGRSIPCYVHILLASLY
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::
CCDS41 LQAVFRLLSQDARSKALSTCGSHICVILLFYVPALFSVFAYRFGGRSVPCYVHILLASLY
250 260 270 280 290 300
310 320 330
pF1KE5 VVIPPMLNPVIYGVRTKPILEGAKQMFSNLAKGSK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 VVIPPMLNPVIYGVRTKPILEGAKQMFSNLAKGSK
310 320 330
>>CCDS53598.1 OR52B2 gene_id:255725|Hs108|chr11 (323 aa)
initn: 1138 init1: 674 opt: 1259 Z-score: 1030.0 bits: 198.9 E(32554): 4.7e-51
Smith-Waterman score: 1259; 60.1% identity (86.2% similar) in 298 aa overlap (34-330:16-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 VRALHKIMALFSANSIGAMNNSDTRIAGCFLTGIPGLEQLHIWLSIPFCIMYITALEGNG
: :::::: :::::::.:..::::. ::.
CCDS53 MSHTNVTIFHPAVFVLPGIPGLEAYHIWLSIPLCLIYITAVLGNS
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 ILICVILSQAILHEPMYIFLSMLASADVLLSTTTMPKALANLWLGYSLISFDGCLTQMFF
::: ::. . :: :::.:::::: :.::::::.::::: .:: :.::.:.:: ::
CCDS53 ILIVVIVMERNLHVPMYFFLSMLAVMDILLSTTTVPKALAIFWLQAHNIAFDACVTQGFF
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 IHFLFI-HSAVLLAMAFDRYVAICSPLRYVTILTSKVIGKIVTAALSHSFIIMFPSIFLL
.:..:. .::.::::::::.::::.::::.:.:: :.:.:. :....:: :.:: ::::
CCDS53 VHMMFVGESAILLAMAFDRFVAICAPLRYTTVLTWPVVGRIALAVITRSFCIIFPVIFLL
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 EHLHYCQINIIAHTFCEHMGIAHLSCSDISINVWYGLAAALLSTGLDIMLITVSYIHILQ
..: .: ::. :..:::.:.:.:.:.::..:.:::... .. . ::..::.::: ::.
CCDS53 KRLPFCLTNIVPHSYCEHIGVARLACADITVNIWYGFSVPIVMVILDVILIAVSYSLILR
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 AVFRLLSQDARSKALSTCGSHICVILLFYVPALFSVFAYRFGGRSIPCYVHILLASLYVV
::::: ::::: :::::::::.::::.::::..:......:: :.:: .::::::.:::.
CCDS53 AVFRLPSQDARHKALSTCGSHLCVILMFYVPSFFTLLTHHFG-RNIPQHVHILLANLYVA
230 240 250 260 270 280
310 320 330
pF1KE5 IPPMLNPVIYGVRTKPILEGAKQMFSNLAKGSK
.::::::..:::.:: : ::. . : ..
CCDS53 VPPMLNPIVYGVKTKQIREGVAHRFFDIKTWCCTSPLGS
290 300 310 320
>>CCDS31386.1 OR52H1 gene_id:390067|Hs108|chr11 (320 aa)
initn: 637 init1: 637 opt: 1174 Z-score: 962.3 bits: 186.3 E(32554): 2.8e-47
Smith-Waterman score: 1174; 54.9% identity (81.3% similar) in 315 aa overlap (15-328:3-316)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MAQVRALHKIMALFSANSIGAMNNSDTRIAGCFLTGIPGLEQLHIWLSIPFCIMYITALE
::... .: :. . .:.:::::::.:.:..:::::.::.:.
CCDS31 MPSASAMIIFNLSSYNPGPFILVGIPGLEQFHVWIGIPFCIIYIVAVV
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 GNGILICVILSQAILHEPMYIFLSMLASADVLLSTTTMPKALANLWLGYSLISFDGCLTQ
:: ::. .:. . :::::..:::::: .:..:::. .::::. .::: :.: :::::
CCDS31 GNCILLYLIVVEHSLHEPMFFFLSMLAMTDLILSTAGVPKALSIFWLGAREITFPGCLTQ
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170
pF1KE5 MFFIHFLFI-HSAVLLAMAFDRYVAICSPLRYVTILTSKVIGKIVTAALSHSFIIMFPSI
:::.:. :. ::.:.:::::.::::::::::.:::: :.: : . . .:: :..:..
CCDS31 MFFLHYNFVLDSAILMAMAFDHYVAICSPLRYTTILTPKTIIKSAMGISFRSFCIILPDV
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 FLLEHLHYCQINIIAHTFCEHMGIAHLSCSDISINVWYGLAAALLSTGLDIMLITVSYIH
::: : .:. :: ::.:::.:.:.:.:.::::: :::. . .... :..::.::: :
CCDS31 FLLTCLPFCRTRIIPHTYCEHIGVAQLACADISINFWYGFCVPIMTVISDVILIAVSYAH
170 180 190 200 210 220
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pF1KE5 ILQAVFRLLSQDARSKALSTCGSHICVILLFYVPALFSVFAYRFGGRSIPCYVHILLASL
:: ::: : :::: .:::.:::::.::::.::.::.::..:.::: ... ::..:.:
CCDS31 ILCAVFGLPSQDACQKALGTCGSHVCVILMFYTPAFFSILAHRFG-HNVSRTFHIMFANL
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330
pF1KE5 YVVIPPMLNPVIYGVRTKPILEGAKQMFSNLAKGSK
:.:::: :::..:::.:: : . . .::
CCDS31 YIVIPPALNPMVYGVKTKQIRDKVILLFSKGTG
290 300 310 320
>>CCDS31384.1 OR52D1 gene_id:390066|Hs108|chr11 (318 aa)
initn: 1142 init1: 757 opt: 1139 Z-score: 934.4 bits: 181.2 E(32554): 1e-45
Smith-Waterman score: 1139; 56.9% identity (81.9% similar) in 299 aa overlap (23-319:5-303)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MAQVRALHKIMALFSANSIGAMNNSDTRIAGCF-LTGIPGLEQLHIWLSIPFCIMYITAL
: ::... : :::::::: :.:..:::: ::..::
CCDS31 MSDSNLSDNHLPDTFFLTGIPGLEAAHFWIAIPFCAMYLVAL
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 EGNGILICVILSQAILHEPMYIFLSMLASADVLLSTTTMPKALANLWLGYSLISFDGCLT
::. :: :: . :: :::.:: .:. .:. ::.::.:: :: ::: . ::: :::.
CCDS31 VGNAALILVIAMDNALHAPMYLFLCLLSLTDLALSSTTVPKMLAILWLHAGEISFGGCLA
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 QMFFIHFLF-IHSAVLLAMAFDRYVAICSPLRYVTILTSKVIGKIVTAALSHSFIIMFPS
::: .: .. ..:..:::::::::::::.::::.:::. :::.: ..: .: :. :
CCDS31 QMFCVHSIYALESSILLAMAFDRYVAICNPLRYTTILNHAVIGRIGFVGLFRSVAIVSPF
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 IFLLEHLHYCQINIIAHTFCEHMGIAHLSCSDISINVWYGLAAALLSTGLDIMLITVSYI
::::..: :: ...::.:::::::.:.:..:..:. :::..:::. ::: .::..::
CCDS31 IFLLRRLPYCGHRVMTHTYCEHMGIARLACANITVNIVYGLTVALLAMGLDSILIAISYG
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 HILQAVFRLLSQDARSKALSTCGSHICVILLFYVPALFSVFAYRFGGRSIPCYVHILLAS
::.:::.: :.::. :::::::::: .::.::.::.:: ...::: . .: .:::.::.
CCDS31 FILHAVFHLPSHDAQHKALSTCGSHIGIILVFYIPAFFSFLTHRFGHHEVPKHVHIFLAN
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330
pF1KE5 LYVVIPPMLNPVIYGVRTKPILEGAKQMFSNLAKGSK
:::..::.:::..::.::: :
CCDS31 LYVLVPPVLNPILYGARTKEIRSRLLKLLHLGKTSI
290 300 310
>>CCDS31371.1 OR52E2 gene_id:119678|Hs108|chr11 (325 aa)
initn: 702 init1: 510 opt: 1125 Z-score: 923.1 bits: 179.1 E(32554): 4.3e-45
Smith-Waterman score: 1125; 54.6% identity (83.3% similar) in 306 aa overlap (23-327:5-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MAQVRALHKIMALFSANSIGAMNNSDTRIAGCFLTGIPGLEQLHIWLSIPFCIMYITALE
:... . .. .: :::::: ::::...::: .:. ::
CCDS31 MFLPNDTQFHPSSFLLLGIPGLETLHIWIGFPFCAVYMIALI
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 GNGILICVILSQAILHEPMYIFLSMLASADVLLSTTTMPKALANLWLGYSLISFDGCLTQ
:: .. :: ... ::.::. ::.:::..:: :::.:.:: :. .:.. : :..::::
CCDS31 GNFTILLVIKTDSSLHQPMFYFLAMLATTDVGLSTATIPKMLGIFWINLRGIIFEACLTQ
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170
pF1KE5 MFFIH-FLFIHSAVLLAMAFDRYVAICSPLRYVTILTSKVIGKIVTAALSHSFIIMFPSI
::::: : ...::::.:::.: :::::.::.: .:::.::.. : ... ...:...:::
CCDS31 MFFIHNFTLMESAVLVAMAYDSYVAICNPLQYSAILTNKVVSVIGLGVFVRALIFVIPSI
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 FLLEHLHYCQINIIAHTFCEHMGIAHLSCSDISINVWYGLAAALLSTGLDIMLITVSYIH
.:. .: .: ..: ::.:::::.:::::..:.::. ::: : . . .:: .:..::.:
CCDS31 LLILRLPFCGNHVIPHTYCEHMGLAHLSCASIKINIIYGLCA-ICNLVFDITVIALSYVH
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 ILQAVFRLLSQDARSKALSTCGSHICVILLFYVPALFSVFAYRFGGRSIPCYVHILLASL
:: ::::: ...:: :.:::::::.:::: ::.::::: ...::: :..: :.:::::.:
CCDS31 ILCAVFRLPTHEARLKSLSTCGSHVCVILAFYTPALFSFMTHRFG-RNVPRYIHILLANL
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330
pF1KE5 YVVIPPMLNPVIYGVRTKPILEGAKQMFSNLAKGSK
:::.:::::::::::::: : . .:...
CCDS31 YVVVPPMLNPVIYGVRTKQIYKCVKKILLQEQGMEKEEYLIHTRF
290 300 310 320
>>CCDS31400.1 OR52E8 gene_id:390079|Hs108|chr11 (317 aa)
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CCDS31 FLLLRLPFCGHRIIPHTYCEHMGIARLACASIKVNIRFGLGNISLLL-LDVILIILSYVR
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CCDS31 YVVVPPALNPVIYGVRTKQIRERVLRIFLKTNH
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CCDS31 RAVFRLPSQDVRLKAFNTCGSHVCVMLCFYTPAFFSFMTHRFG-QNIPHYIHILLANLYV
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CCDS31 VVPPALNPVIYGVRTKQIREQIVKIFVQKE
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CCDS31 MSFLNGTSLTPASFILNGIPGLEDVHLWISFPLCTMYSIAIT
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CCDS31 GNFGLMYLIYCDEALHRPMYVFLALLSFTDVLMCTSTLPNTLFILWFNLKEIDFKACLAQ
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CCDS31 MFFVHTFTGMESGVLMLMALDHCVAICFPLRYATILTNSVIAKAGFLTFLRGVMLVIPST
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CCDS31 FLTKRLPYCKGNVIPHTYCDHMSVAKISCGNVRVNAIYGLIVALLIGGFDILCITISYTM
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CCDS31 ILQAVVSLSSADARQKAFSTCTAHFCAIVLTYVPAFFTFFTHHFGGHTIPLHIHIIMANL
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CCDS31 YLLMPPTMNPIVYGVKTRQVRESVIRFFLKGKDNSHNF
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CCDS31 MSGDNSSSLTPGFFILNGVPGLEATHIWISLPFCFMYIIAV
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CCDS31 VGNCGLICLISHEEALHRPMYYFLALLSFTDVTLCTTMVPNMLCIFWFNLKEIDFNACLA
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CCDS31 QMFFVHMLTGMESGVLMLMALDRYVAICYPLRYATILTNPVIAKAGLATFLRNVMLIIPF
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CCDS31 TLLTKRLPYCRGNFIPHTYCDHMSVAKVSCGNFKVNAIYGLMVALLIGVFDICCISVSYT
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