Result of FASTA (omim) for
pFN21AE5478
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5478, 330 aa
1>>>pF1KE5478 330 - 330 aa - 330 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9123+/-0.000526; mu= 18.4634+/- 0.033
mean_var=101.9602+/-26.947, 0's: 0 Z-trim(107.4): 379 B-trim: 1686 in 2/48
Lambda= 0.127016
statistics sampled from 14949 (15500) to 14949 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.506), E-opt: 0.2 (0.182), width: 16
Scan time: 6.520
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 1250 240.4 3.6e-63
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 1051 204.0 3.5e-52
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 1051 204.0 3.5e-52
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 1051 204.0 3.5e-52
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 982 191.3 2.2e-48
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 979 190.8 3.2e-48
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 956 186.6 6e-47
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 956 186.6 6e-47
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 956 186.6 6.1e-47
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 928 181.4 2.1e-45
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 916 179.2 9.7e-45
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 911 178.3 1.8e-44
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 903 176.9 5.1e-44
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 900 176.3 7.4e-44
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 896 175.6 1.2e-43
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 892 174.8 2e-43
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 883 173.2 6.6e-43
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 817 161.1 2.8e-39
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 802 158.3 1.9e-38
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 793 156.7 5.9e-38
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 499 102.8 9.9e-22
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 493 101.7 2.1e-21
NP_000668 (OMIM: 600445) adenosine receptor A3 iso ( 318) 218 51.3 3.1e-06
NP_003848 (OMIM: 603691) galanin receptor type 2 [ ( 387) 213 50.5 6.7e-06
XP_011542714 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 308) 209 49.7 9.6e-06
XP_016868585 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 317) 209 49.7 9.8e-06
XP_011542713 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 324) 209 49.7 9.9e-06
NP_001309433 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic re ( 342) 209 49.7 1e-05
NP_001309432 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic re ( 370) 209 49.8 1.1e-05
NP_001309431 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic re ( 372) 209 49.8 1.1e-05
NP_057624 (OMIM: 605569) probable G-protein couple ( 423) 209 49.9 1.2e-05
XP_006716356 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 429) 209 49.9 1.2e-05
NP_150645 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic recep ( 429) 209 49.9 1.2e-05
NP_150647 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic recep ( 455) 209 49.9 1.2e-05
NP_000671 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic recep ( 466) 209 49.9 1.2e-05
XP_016868583 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 475) 209 49.9 1.3e-05
XP_016868584 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 475) 209 49.9 1.3e-05
XP_006716355 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 475) 209 49.9 1.3e-05
NP_150646 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic recep ( 475) 209 49.9 1.3e-05
NP_076404 (OMIM: 606379) G-protein coupled recepto ( 358) 202 48.5 2.6e-05
NP_000504 (OMIM: 300821,303700,303800) medium-wave ( 364) 199 47.9 3.8e-05
NP_062874 (OMIM: 182137) 5-hydroxytryptamine recep ( 432) 195 47.3 7e-05
NP_000863 (OMIM: 182137) 5-hydroxytryptamine recep ( 445) 195 47.3 7.1e-05
NP_062873 (OMIM: 182137) 5-hydroxytryptamine recep ( 479) 195 47.4 7.5e-05
NP_064445 (OMIM: 300822,303700,303900) long-wave-s ( 364) 192 46.7 9.2e-05
NP_003605 (OMIM: 603692) galanin receptor type 3 [ ( 368) 192 46.7 9.3e-05
NP_000667 (OMIM: 600446) adenosine receptor A2b [H ( 332) 189 46.1 0.00013
NP_063941 (OMIM: 155540,602025,607948) melanocorti ( 323) 188 45.9 0.00014
NP_005217 (OMIM: 601965) sphingosine 1-phosphate r ( 378) 188 45.9 0.00016
NP_005285 (OMIM: 601909) probable G-protein couple ( 349) 187 45.7 0.00017
>>NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [Homo (308 aa)
initn: 1260 init1: 1080 opt: 1250 Z-score: 1255.1 bits: 240.4 E(85289): 3.6e-63
Smith-Waterman score: 1250; 63.2% identity (84.0% similar) in 307 aa overlap (17-323:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MCSFFLCQTGKQAKISMGEENQTFVSKFIFLGLSQDLQTQILLFILFLIIYLLTVLGNQL
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NP_003 MRQINQTQVTEFLLLGLSDGPHTEQLLFIVLLGVYLVTVLGNLL
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70 80 90 100 110 120
pF1KE5 IIILIFLDSRLHTPMYFFLRNISFADLCFSTSIVPQVLVHFLVKRKTISFYGCMTQIIVF
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NP_003 LISLVHVDSQLHTPMYFFLCNLSLADLCFSTNIVPQALVHLLSRKKVIAFTLCAARLLFF
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130 140 150 160 170 180
pF1KE5 LLVGCTECALLAVMSYDRYVAVCKPLYYSTIMTQRVCLWLSFRSSASGALVSLVDTSFTF
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NP_003 LIFGCTQCALLAVMSYDRYVAICNPLRYPNIMTWKVCVQLATGSWTSGILVSVVDTTFIL
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pF1KE5 HLPYWGQNIINHYFCEPPALLKLASIDTYSTEMAIFSMGVVILLAPVSLILGSYWNIIST
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NP_003 RLPYRGSNSIAHFFCEAPALLILASTDTHASEMAIFLMGVVILLIPVFLILVSYGRIIVT
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pF1KE5 VIQMQSGEGRLKAFSTCGSHLIVVVLFYGSGIFTYMRPNSKTTKELDKMISVFYTAVTPM
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NP_003 VVKMKSTVGSLKAFSTCGSHLMVVILFYGSAIITYMTP--KSSKQQEKSVSVFYAIVTPM
230 240 250 260 270 280
310 320 330
pF1KE5 LNPIIYSLRNKDVKGALRKLVGRKCFSHRQ
:::.::::::::::.::::.. :
NP_003 LNPLIYSLRNKDVKAALRKVATRNFP
290 300
>>NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [Homo (317 aa)
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Smith-Waterman score: 1051; 53.8% identity (82.0% similar) in 305 aa overlap (17-321:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MCSFFLCQTGKQAKISMGEENQTFVSKFIFLGLSQDLQTQILLFILFLIIYLLTVLGNQL
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NP_036 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCL
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pF1KE5 IIILIFLDSRLHTPMYFFLRNISFADLCFSTSIVPQVLVHFLVKRKTISFYGCMTQIIVF
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pF1KE5 LLVGCTECALLAVMSYDRYVAVCKPLYYSTIMTQRVCLWLSFRSSASGALVSLVDTSFTF
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NP_036 LALGGIEFVLLAVMAYDRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITF
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pF1KE5 HLPYWGQNIINHYFCEPPALLKLASIDTYSTEMAIFSMGVVILLAPVSLILGSYWNIIST
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NP_036 QLPMCRNKFIDHISCELLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIIST
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pF1KE5 VIQMQSGEGRLKAFSTCGSHLIVVVLFYGSGIFTYMRPNSKTTKELDKMISVFYTAVTPM
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NP_036 ILKIQSREGRKKAFHTCASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPM
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310 320 330
pF1KE5 LNPIIYSLRNKDVKGALRKLVGRKCFSHRQ
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NP_036 LNPMIYSLRNKEVKGAWQKLLWKFSGLTSKLAT
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>>XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
initn: 1085 init1: 1051 opt: 1051 Z-score: 1057.8 bits: 204.0 E(85289): 3.5e-52
Smith-Waterman score: 1051; 53.8% identity (82.0% similar) in 305 aa overlap (17-321:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MCSFFLCQTGKQAKISMGEENQTFVSKFIFLGLSQDLQTQILLFILFLIIYLLTVLGNQL
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XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCL
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pF1KE5 IIILIFLDSRLHTPMYFFLRNISFADLCFSTSIVPQVLVHFLVKRKTISFYGCMTQIIVF
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XP_011 IVLLIRLDSRLHTPMYFFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFS
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pF1KE5 LLVGCTECALLAVMSYDRYVAVCKPLYYSTIMTQRVCLWLSFRSSASGALVSLVDTSFTF
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XP_011 LALGGIEFVLLAVMAYDRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITF
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pF1KE5 HLPYWGQNIINHYFCEPPALLKLASIDTYSTEMAIFSMGVVILLAPVSLILGSYWNIIST
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XP_011 QLPMCRNKFIDHISCELLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIIST
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pF1KE5 VIQMQSGEGRLKAFSTCGSHLIVVVLFYGSGIFTYMRPNSKTTKELDKMISVFYTAVTPM
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XP_011 ILKIQSREGRKKAFHTCASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPM
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pF1KE5 LNPIIYSLRNKDVKGALRKLVGRKCFSHRQ
:::.:::::::.:::: .::.
XP_011 LNPMIYSLRNKEVKGAWQKLLWKFSGLTSKLAT
290 300 310
>>XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
initn: 1085 init1: 1051 opt: 1051 Z-score: 1057.8 bits: 204.0 E(85289): 3.5e-52
Smith-Waterman score: 1051; 53.8% identity (82.0% similar) in 305 aa overlap (17-321:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MCSFFLCQTGKQAKISMGEENQTFVSKFIFLGLSQDLQTQILLFILFLIIYLLTVLGNQL
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XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCL
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pF1KE5 IIILIFLDSRLHTPMYFFLRNISFADLCFSTSIVPQVLVHFLVKRKTISFYGCMTQIIVF
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XP_011 IVLLIRLDSRLHTPMYFFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFS
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pF1KE5 LLVGCTECALLAVMSYDRYVAVCKPLYYSTIMTQRVCLWLSFRSSASGALVSLVDTSFTF
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XP_011 LALGGIEFVLLAVMAYDRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITF
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pF1KE5 HLPYWGQNIINHYFCEPPALLKLASIDTYSTEMAIFSMGVVILLAPVSLILGSYWNIIST
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XP_011 QLPMCRNKFIDHISCELLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIIST
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pF1KE5 VIQMQSGEGRLKAFSTCGSHLIVVVLFYGSGIFTYMRPNSKTTKELDKMISVFYTAVTPM
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XP_011 ILKIQSREGRKKAFHTCASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPM
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310 320 330
pF1KE5 LNPIIYSLRNKDVKGALRKLVGRKCFSHRQ
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XP_011 LNPMIYSLRNKEVKGAWQKLLWKFSGLTSKLAT
290 300 310
>>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo (314 aa)
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Smith-Waterman score: 982; 47.7% identity (78.6% similar) in 308 aa overlap (17-324:1-308)
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pF1KE5 MCSFFLCQTGKQAKISMGEENQTFVSKFIFLGLSQDLQTQILLFILFLIIYLLTVLGNQL
: ..: : ...:..:::.. :. ::.::..::.:: ::::::
NP_003 MTRKNYTSLTEFVLLGLADTLELQIILFLFFLVIYTLTVLGNLG
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pF1KE5 IIILIFLDSRLHTPMYFFLRNISFADLCFSTSIVPQVLVHFLVKRKTISFYGCMTQIIVF
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pF1KE5 LLVGCTECALLAVMSYDRYVAVCKPLYYSTIMTQRVCLWLSFRSSASGALVSLVDTSFTF
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NP_003 ISLATTECILFGLMAYDRYAAICRPLLYSLIMSRTVYLKMAAGAFAAGLLNFMVNTSHVS
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pF1KE5 HLPYWGQNIINHYFCEPPALLKLASIDTYSTEMAIFSMGVVILLAPVSLILGSYWNIIST
: . .:.:.:.::. : :.::. :: : .. : ... . .::.:: .. .
NP_003 SLSFCDSNVIHHFFCDSPPLFKLSCSDTILKESISSILAGVNIVGTLLVILSSYSYVLFS
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pF1KE5 VIQMQSGEGRLKAFSTCGSHLIVVVLFYGSGIFTYMRPNSKTTKELDKMISVFYTAVTPM
...:.::::: .:::::.::: ...:::.. :.::.::.:. . . ::. :::::.: ::
NP_003 IFSMHSGEGRHRAFSTCASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDKVASVFYTVVIPM
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pF1KE5 LNPIIYSLRNKDVKGALRKLVGRKCFSHRQ
:::.:::::.:.:: :: ....::
NP_003 LNPLIYSLRSKEVKKALANVISRKRTSSFL
290 300 310
>>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor (311 aa)
initn: 1020 init1: 973 opt: 979 Z-score: 986.6 bits: 190.8 E(85289): 3.2e-48
Smith-Waterman score: 979; 46.9% identity (77.4% similar) in 305 aa overlap (18-322:5-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MCSFFLCQTGKQAKISMGEENQTFVSKFIFLGLSQDLQTQILLFILFLIIYLLTVLGNQL
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NP_001 MNDDGKVNASSEGYFILVGFSNWPHLEVVIFVVVLIFYLMTLIGNLF
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70 80 90 100 110 120
pF1KE5 IIILIFLDSRLHTPMYFFLRNISFADLCFSTSIVPQVLVHFLVKRKTISFYGCMTQIIVF
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NP_001 IIILSYLDSHLHTPMYFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLWGPEKTISYAGCMIQLYFV
50 60 70 80 90 100
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pF1KE5 LLVGCTECALLAVMSYDRYVAVCKPLYYSTIMTQRVCLWLSFRSSASGALVSLVDTSFTF
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NP_001 LALGTTECVLLVVMSYDRYAAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLAVASWVSGFTNSALHSSFTF
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 HLPYWGQNIINHYFCEPPALLKLASIDTYSTEMAIFSMGVVILLAPVSLILGSYWNIIST
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NP_001 WVPLCGHRQVDHFFCEVPALLRLSCVDTHVNELTLMITSSIFVLIPLILILTSYGAIVRA
170 180 190 200 210 220
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pF1KE5 VIQMQSGEGRLKAFSTCGSHLIVVVLFYGSGIFTYMRPNSKTTKELDKMISVFYTAVTPM
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NP_001 ILRMQSTTGLQKVFGTCGAHLMAVSLFFIPAMCMYLQPPSGNSQDQGKFIALFYTVVTPS
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pF1KE5 LNPIIYSLRNKDVKGALRKLVGRKCFSHRQ
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NP_001 LNPLIYTLRNKVVRGAVKRLMGWE
290 300 310
>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
initn: 951 init1: 951 opt: 956 Z-score: 963.8 bits: 186.6 E(85289): 6e-47
Smith-Waterman score: 956; 49.7% identity (76.3% similar) in 312 aa overlap (17-327:1-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MCSFFLCQTGKQAKISMGEENQTFVSKFIFLGLSQDLQTQILLFILFLIIYLLTVLGNQL
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NP_036 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLL
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pF1KE5 IIILIFLDSRLHTPMYFFLRNISFADLCFSTSIVPQVLVHFLVKRKTISFYGCMTQI-IV
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pF1KE5 FLLVGCTECALLAVMSYDRYVAVCKPLYYSTIMTQRVCLWLSFRSSASGALVSLVDTSFT
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NP_036 FMFVD-MDNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLM
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pF1KE5 FHLPYWGQNIINHYFCEPPALLKLASIDTYSTEMAIFSMGVVILLAPVSLILGSYWNIIS
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pF1KE5 TVIQMQSGEGRLKAFSTCGSHLIVVVLFYGSGIFTYMRPNSKTTKELDKMISVFYTAVTP
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NP_036 MLNPFIYSLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
290 300 310
>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa)
initn: 951 init1: 951 opt: 956 Z-score: 963.8 bits: 186.6 E(85289): 6e-47
Smith-Waterman score: 956; 49.7% identity (76.3% similar) in 312 aa overlap (17-327:1-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MCSFFLCQTGKQAKISMGEENQTFVSKFIFLGLSQDLQTQILLFILFLIIYLLTVLGNQL
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XP_011 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLL
10 20 30 40
70 80 90 100 110
pF1KE5 IIILIFLDSRLHTPMYFFLRNISFADLCFSTSIVPQVLVHFLVKRKTISFYGCMTQI-IV
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XP_011 IILSVSIDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFV
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pF1KE5 FLLVGCTECALLAVMSYDRYVAVCKPLYYSTIMTQRVCLWLSFRSSASGALVSLVDTSFT
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XP_011 FMFVD-MDNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLM
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pF1KE5 FHLPYWGQNIINHYFCEPPALLKLASIDTYSTEMAIFSMGVVILLAPVSLILGSYWNIIS
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XP_011 APLSFCADNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITC
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pF1KE5 TVIQMQSGEGRLKAFSTCGSHLIVVVLFYGSGIFTYMRPNSKTTKELDKMISVFYTAVTP
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XP_011 TVLKVPSTKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTP
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pF1KE5 MLNPIIYSLRNKDVKGALRKLVGRKCFSHRQ
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XP_011 MLNPFIYSLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
290 300 310
>>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa)
initn: 951 init1: 951 opt: 956 Z-score: 963.7 bits: 186.6 E(85289): 6.1e-47
Smith-Waterman score: 956; 49.7% identity (76.3% similar) in 312 aa overlap (17-327:11-321)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MCSFFLCQTGKQAKISMGEENQTFVSKFIFLGLSQDLQTQILLFILFLIIYLLTVLGNQL
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XP_011 MGDRRADPRPMSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE5 IIILIFLDSRLHTPMYFFLRNISFADLCFSTSIVPQVLVHFLVKRKTISFYGCMTQI-IV
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XP_011 IILSVSIDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFV
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 FLLVGCTECALLAVMSYDRYVAVCKPLYYSTIMTQRVCLWLSFRSSASGALVSLVDTSFT
:..: . :::::.::..::::.::.:.. ::...: : . . : :. : .
XP_011 FMFVD-MDNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLM
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 FHLPYWGQNIINHYFCEPPALLKLASIDTYSTEMAIFSMGVVILLAPVSLILGSYWNIIS
: . ..: :.:.::. ::::. ::. .:. :.: :......: ::.:: .:
XP_011 APLSFCADNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITC
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 TVIQMQSGEGRLKAFSTCGSHLIVVVLFYGSGIFTYMRPNSKTTKELDKMISVFYTAVTP
::... : .:: :::::::::: ::.:::.. : .:. : :. . : : : .:.::.:::
XP_011 TVLKVPSTKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTP
240 250 260 270 280 290
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pF1KE5 MLNPIIYSLRNKDVKGALRKLVGRKCFSHRQ
::::.::::::. .::::.:.::: ::
XP_011 MLNPFIYSLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
300 310 320
>>NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [Homo (312 aa)
initn: 970 init1: 928 opt: 928 Z-score: 936.1 bits: 181.4 E(85289): 2.1e-45
Smith-Waterman score: 928; 47.7% identity (76.0% similar) in 304 aa overlap (21-324:3-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MCSFFLCQTGKQAKISMGEENQTFVSKFIFLGLSQDLQTQILLFILFLIIYLLTVLGNQL
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NP_009 MVNQSSTPGFLLLGFSEHPGLERTLFVVVLTSYLLTLVGNTL
10 20 30 40
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pF1KE5 IIILIFLDSRLHTPMYFFLRNISFADLCFSTSIVPQVLVHFLVKRKTISFYGCMTQIIVF
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NP_009 IILLSALDPKLHSPMYFFLSNLSFLDLCFTTSCVPQMLVNLWGPKKTISFLDCSVQIFIF
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pF1KE5 LLVGCTECALLAVMSYDRYVAVCKPLYYSTIMTQRVCLWLSFRSSASGALVSLVDTSFTF
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NP_009 LSLGTTECILLTVMAFDRYVAVCQPLHYATIIHPRLCWQLASVAWVIGLVESVVQTPSTL
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pF1KE5 HLPYWGQNIINHYFCEPPALLKLASIDTYSTEMAIFSMGVVILLAPVSLILGSYWNIIST
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NP_009 HLPFCPDRQVDDFVCEVPALIRLSCEDTSYNEIQVAVASVFILVVPLSLILVSYGAITWA
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pF1KE5 VIQMQSGEGRLKAFSTCGSHLIVVVLFYGSGIFTYMRPNSKTTKELDKMISVFYTAVTPM
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NP_009 VLRINSAKGRRKAFGTCSSHLTVVTLFYSSVIAVYLQPKNPYAQERGKFFGLFYAVGTPS
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]