Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5474
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5474, 327 aa
1>>>pF1KE5474 327 - 327 aa - 327 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0333+/-0.000992; mu= 11.1389+/- 0.058
mean_var=113.8233+/-35.691, 0's: 0 Z-trim(104.9): 379 B-trim: 975 in 2/51
Lambda= 0.120215
statistics sampled from 7654 (8147) to 7654 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.616), E-opt: 0.2 (0.25), width: 16
Scan time: 2.040
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS7772.1 OR6A2 gene_id:8590|Hs108|chr11 ( 327) 2180 389.6 1.8e-108
CCDS53391.1 OR6P1 gene_id:128366|Hs108|chr1 ( 317) 1247 227.8 8.9e-60
CCDS43667.1 OR6B1 gene_id:135946|Hs108|chr7 ( 311) 1243 227.1 1.4e-59
CCDS30899.1 OR6Y1 gene_id:391112|Hs108|chr1 ( 325) 1216 222.4 3.8e-58
CCDS42837.1 OR6B3 gene_id:150681|Hs108|chr2 ( 331) 1195 218.8 4.8e-57
CCDS46559.1 OR6B2 gene_id:389090|Hs108|chr2 ( 312) 1183 216.7 1.9e-56
CCDS31095.1 OR6F1 gene_id:343169|Hs108|chr1 ( 308) 1029 190.0 2.1e-48
CCDS31541.1 OR6Q1 gene_id:219952|Hs108|chr11 ( 317) 1019 188.3 7.2e-48
CCDS30906.1 OR6N2 gene_id:81442|Hs108|chr1 ( 317) 975 180.6 1.4e-45
CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1 ( 312) 960 178.0 8.5e-45
CCDS31695.1 OR6X1 gene_id:390260|Hs108|chr11 ( 312) 955 177.2 1.6e-44
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 955 177.2 1.6e-44
CCDS7774.1 OR10A4 gene_id:283297|Hs108|chr11 ( 315) 950 176.3 2.9e-44
CCDS32038.1 OR6S1 gene_id:341799|Hs108|chr14 ( 331) 943 175.1 6.9e-44
CCDS32034.1 OR11H4 gene_id:390442|Hs108|chr14 ( 324) 941 174.7 8.6e-44
CCDS7773.1 OR10A5 gene_id:144124|Hs108|chr11 ( 317) 938 174.2 1.2e-43
CCDS32033.1 OR11H6 gene_id:122748|Hs108|chr14 ( 330) 935 173.7 1.8e-43
CCDS32032.1 OR11G2 gene_id:390439|Hs108|chr14 ( 345) 934 173.6 2.1e-43
CCDS30895.1 OR10T2 gene_id:128360|Hs108|chr1 ( 314) 932 173.2 2.5e-43
CCDS35129.1 OR1L4 gene_id:254973|Hs108|chr9 ( 311) 925 172.0 5.7e-43
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 925 172.0 5.8e-43
CCDS31098.1 OR11L1 gene_id:391189|Hs108|chr1 ( 322) 923 171.6 7.4e-43
CCDS34364.1 OR10C1 gene_id:442194|Hs108|chr6 ( 312) 919 170.9 1.2e-42
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 918 170.7 1.3e-42
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 914 170.0 2.2e-42
CCDS35130.2 OR1L6 gene_id:392390|Hs108|chr9 ( 311) 913 169.9 2.4e-42
CCDS31696.1 OR6M1 gene_id:390261|Hs108|chr11 ( 313) 912 169.7 2.7e-42
CCDS31517.1 OR8I2 gene_id:120586|Hs108|chr11 ( 310) 910 169.4 3.5e-42
CCDS31702.1 OR10G4 gene_id:390264|Hs108|chr11 ( 311) 910 169.4 3.5e-42
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 910 169.4 3.5e-42
CCDS31705.1 OR10G7 gene_id:390265|Hs108|chr11 ( 311) 908 169.0 4.4e-42
CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11 ( 330) 903 168.2 8.4e-42
CCDS34363.1 OR11A1 gene_id:26531|Hs108|chr6 ( 315) 901 167.8 1e-41
CCDS31703.1 OR10G9 gene_id:219870|Hs108|chr11 ( 311) 897 167.1 1.7e-41
CCDS30901.1 OR10Z1 gene_id:128368|Hs108|chr1 ( 313) 897 167.1 1.7e-41
CCDS35087.1 OR13F1 gene_id:138805|Hs108|chr9 ( 319) 896 166.9 1.9e-41
CCDS30898.1 OR10R2 gene_id:343406|Hs108|chr1 ( 335) 896 167.0 2e-41
CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 893 166.4 2.7e-41
CCDS31547.1 OR10Q1 gene_id:219960|Hs108|chr11 ( 319) 889 165.7 4.4e-41
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 887 165.4 5.5e-41
CCDS4642.1 OR2B6 gene_id:26212|Hs108|chr6 ( 313) 887 165.4 5.5e-41
CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6 ( 357) 887 165.4 6.1e-41
CCDS31415.1 OR10A2 gene_id:341276|Hs108|chr11 ( 303) 885 165.0 6.9e-41
CCDS32017.1 OR11H12 gene_id:440153|Hs108|chr14 ( 326) 884 164.9 8.2e-41
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 883 164.7 9.2e-41
CCDS34358.1 OR2B3 gene_id:442184|Hs108|chr6 ( 313) 881 164.3 1.1e-40
CCDS35090.1 OR13C8 gene_id:138802|Hs108|chr9 ( 320) 881 164.3 1.2e-40
CCDS31704.1 OR10G8 gene_id:219869|Hs108|chr11 ( 311) 879 164.0 1.4e-40
CCDS31514.1 OR10AG1 gene_id:282770|Hs108|chr11 ( 301) 876 163.4 2e-40
CCDS31518.1 OR8H2 gene_id:390151|Hs108|chr11 ( 312) 876 163.5 2.1e-40
>>CCDS7772.1 OR6A2 gene_id:8590|Hs108|chr11 (327 aa)
initn: 2180 init1: 2180 opt: 2180 Z-score: 2061.0 bits: 389.6 E(32554): 1.8e-108
Smith-Waterman score: 2180; 100.0% identity (100.0% similar) in 327 aa overlap (1-327:1-327)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MEWRNHSGRVSEFVLLGFPAPAPLQVLLFALLLLAYVLVLTENTLIIMAIRNHSTLHKPM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 MEWRNHSGRVSEFVLLGFPAPAPLQVLLFALLLLAYVLVLTENTLIIMAIRNHSTLHKPM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 YFFLANMSFLEIWYVTVTIPKMLAGFVGSKQDHGQLISFEGCMTQLYFFLGLGCTECVLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 YFFLANMSFLEIWYVTVTIPKMLAGFVGSKQDHGQLISFEGCMTQLYFFLGLGCTECVLL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 AVMAYDRYMAICYPLHYPVIVSGRLCVQMAAGSWAGGFGISMVKVFLISGLSYCGPNIIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 AVMAYDRYMAICYPLHYPVIVSGRLCVQMAAGSWAGGFGISMVKVFLISGLSYCGPNIIN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 HFFCDVSPLLNLSCTDMSTAELTDFILAIFILLGPLSVTGASYVAITGAVMHIPSAAGRY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 HFFCDVSPLLNLSCTDMSTAELTDFILAIFILLGPLSVTGASYVAITGAVMHIPSAAGRY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 KAFSTCASHLTVVIIFYAASIFIYARPKALSAFDTNKLVSVLYAVIVPLLNPIIYCLRNQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 KAFSTCASHLTVVIIFYAASIFIYARPKALSAFDTNKLVSVLYAVIVPLLNPIIYCLRNQ
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE5 EVKRALCCTLHLYQHQDPDPKKASRNV
:::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 EVKRALCCTLHLYQHQDPDPKKASRNV
310 320
>>CCDS53391.1 OR6P1 gene_id:128366|Hs108|chr1 (317 aa)
initn: 1231 init1: 926 opt: 1247 Z-score: 1186.6 bits: 227.8 E(32554): 8.9e-60
Smith-Waterman score: 1247; 57.4% identity (84.5% similar) in 317 aa overlap (4-319:2-314)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MEWRNHSG-RVSEFVLLGFPAPAPLQVLLFALLLLAYVLVLTENTLIIMAIRNHSTLHKP
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CCDS53 MRNLSGGHVEEFVLVGFPTTPPLQLLLFVLFFAIYLLTLLENALIVFTIWLAPSLHRP
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 MYFFLANMSFLEIWYVTVTIPKMLAGFVGSKQDHGQLISFEGCMTQLYFFLGLGCTECVL
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CCDS53 MYFFLGHLSFLELWYINVTIPRLLAAFL--TQD-GR-VSYVGCMTQLYFFIALACTECVL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 LAVMAYDRYMAICYPLHYPVIVSGRLCVQMAAGSWAGGFGISMVKVFLISGLSYCGPNII
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CCDS53 LAVMAYDRYLAICGPLLYPSLMPSSLATRLAAASWGSGFFSSMMKLLFISQLSYCGPNII
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 NHFFCDVSPLLNLSCTDMSTAELTDFILAIFILLGPLSVTGASYVAITGAVMHIPSAAGR
::::::.::::::.:.: :::.::.::. ..: :: .. .::.:: .:...::.. ::
CCDS53 NHFFCDISPLLNLTCSDKEQAELVDFLLALVMILLPLLAVVSSYTAIIAAILRIPTSRGR
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 YKAFSTCASHLTVVIIFYAASIFIYARPKALSAFDTNKLVSVLYAVIVPLLNPIIYCLRN
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CCDS53 HKAFSTCAAHLAVVVIYYSSTLFTYARPRAMYTFNHNKIISVLYTIIVPFFNPAIYCLRN
240 250 260 270 280 290
300 310 320
pF1KE5 QEVKRALCCTLHLYQHQDPDPKKASRNV
.:::.:. :. : :
CCDS53 KEVKEAFRKTVMGRCHYPRDVQD
300 310
>>CCDS43667.1 OR6B1 gene_id:135946|Hs108|chr7 (311 aa)
initn: 1226 init1: 628 opt: 1243 Z-score: 1183.0 bits: 227.1 E(32554): 1.4e-59
Smith-Waterman score: 1243; 57.8% identity (84.3% similar) in 306 aa overlap (1-306:1-299)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MEWRNHSGRVSEFVLLGFPAPAPLQVLLFALLLLAYVLVLTENTLIIMAIRNHSTLHKPM
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CCDS43 MELENQT-RVTKFILVGFPGSLSMRAAMFLIFLVAYILTVAENVIIILLVLQNRPLHKPM
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 YFFLANMSFLEIWYVTVTIPKMLAGFVGSKQDHGQLISFEGCMTQLYFFLGLGCTECVLL
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CCDS43 YFFLANLSFLETWYISVTVPKLLFSFWSVNNS----ISFTLCMIQLYFFIALMCTECVLL
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 AVMAYDRYMAICYPLHYPVIVSGRLCVQMAAGSWAGGFGISMVKVFLISGLSYCGPNIIN
:.::::::.::: :::::.:.: :: ..: :::: :::::..:...:: ::.::::.::
CCDS43 AAMAYDRYVAICRPLHYPTIMSHGLCFRLALGSWAIGFGISLAKIYFISCLSFCGPNVIN
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 HFFCDVSPLLNLSCTDMSTAELTDFILAIFILLGPLSVTGASYVAITGAVMHIPSAAGRY
:::::.::.::::::::: .::.:::::. :.: :: .: :: : .... .:. :.
CCDS43 HFFCDISPVLNLSCTDMSITELVDFILALVIFLFPLFITVLSYGCILATILCMPT--GKQ
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 KAFSTCASHLTVVIIFYAASIFIYARPKALSAFDTNKLVSVLYAVIVPLLNPIIYCLRNQ
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CCDS43 KAFSTCASHLVVVTIFYSAIIFMYARPRVIHAFNMNKIISIFYAIVTPSLNPFIYCLRNR
240 250 260 270 280 290
310 320
pF1KE5 EVKRALCCTLHLYQHQDPDPKKASRNV
:::.::
CCDS43 EVKEALKKLAYCQASRSD
300 310
>>CCDS30899.1 OR6Y1 gene_id:391112|Hs108|chr1 (325 aa)
initn: 1202 init1: 916 opt: 1216 Z-score: 1157.4 bits: 222.4 E(32554): 3.8e-58
Smith-Waterman score: 1216; 57.6% identity (82.3% similar) in 311 aa overlap (1-311:6-311)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MEWRNHSGRVSEFVLLGFPAPAPLQVLLFALLLLAYVLVLTENTLIIMAIRNHST
.: ::. ...:.:::::. .:.:.:...: .:.:.: :: :::.::.. .
CCDS30 MTTIILEVDNHT-VTTRFILLGFPTRPAFQLLFFSIFLATYLLTLLENLLIILAIHSDGQ
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 LHKPMYFFLANMSFLEIWYVTVTIPKMLAGFVGSKQDHGQLISFEGCMTQLYFFLGLGCT
:::::::::...::::.::::: ::::. :. .: . :::.:::::::::. . ::
CCDS30 LHKPMYFFLSHLSFLEMWYVTVISPKMLVDFL----SHDKSISFNGCMTQLYFFVTFVCT
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 ECVLLAVMAYDRYMAICYPLHYPVIVSGRLCVQMAAGSWAGGFGISMVKVFLISGLSYCG
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CCDS30 EYILLAIMAFDRYVAICNPLRYPVIMTNQLCGTLAGGCWFCGLMTAMIKMVFIAQLHYCG
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 PNIINHFFCDVSPLLNLSCTDMSTAELTDFILAIFILLGPLSVTGASYVAITGAVMHIPS
:::.:::.:::::.:: : : ::..::.::.... :: :. :::.:: .....:::
CCDS30 MPQINHYFCDISPLLNVSCEDASQAEMVDFFLALMVIAIPLCVVVASYAAILATILRIPS
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 AAGRYKAFSTCASHLTVVIIFYAASIFIYARPKALSAFDTNKLVSVLYAVIVPLLNPIIY
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CCDS30 AQGRQKAFSTCASHLTVVILFYSMTLFTYARPKLMYAYNSNKVVSVLYTVIVPLLNPIIY
240 250 260 270 280 290
300 310 320
pF1KE5 CLRNQEVKRALCCTLHLYQHQDPDPKKASRNV
::::.::: :: :.:
CCDS30 CLRNHEVKAALRKTIHCRGSGPQGNGAFSS
300 310 320
>>CCDS42837.1 OR6B3 gene_id:150681|Hs108|chr2 (331 aa)
initn: 1201 init1: 907 opt: 1195 Z-score: 1137.6 bits: 218.8 E(32554): 4.8e-57
Smith-Waterman score: 1195; 59.1% identity (85.2% similar) in 298 aa overlap (9-306:8-301)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MEWRNHSGRVSEFVLLGFPAPAPLQVLLFALLLLAYVLVLTENTLIIMAIRNHSTLHKPM
::. :.:.:::. :: ::: :.::.:..::.:: ::... . ..::.::
CCDS42 MSGENVTRVGTFILVGFPTAPGLQYLLFLLFLLTYLFVLVENLAIILTVWSSTSLHRPM
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 YFFLANMSFLEIWYVTVTIPKMLAGFVGSKQDHGQLISFEGCMTQLYFFLGLGCTECVLL
:.::..:::::::::. :::: ::. ... ::: ::::::::: .: :::::::
CCDS42 YYFLSSMSFLEIWYVSDITPKMLEGFLLQQKR----ISFVGCMTQLYFFSSLVCTECVLL
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 AVMAYDRYMAICYPLHYPVIVSGRLCVQMAAGSWAGGFGISMVKVFLISGLSYCGPNIIN
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CCDS42 ASMAYDRYVAICHPLRYHVLVTPGLCLQLVGFSFVSGFTISMIKVCFISSVTFCGSNVLN
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 HFFCDVSPLLNLSCTDMSTAELTDFILAIFILLGPLSVTGASYVAITGAVMHIPSAAGRY
:::::.::.:.:.:::.:::::.:::::..::. :: .: ::. :: ::..::::.: .
CCDS42 HFFCDISPILKLACTDFSTAELVDFILAFIILVFPLLATMLSYAHITLAVLRIPSATGCW
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 KAFSTCASHLTVVIIFYAASIFIYARPKALSAFDTNKLVSVLYAVIVPLLNPIIYCLRNQ
.:: ::::::::: .::.: .:.:.::.:... ..:::.::::.::.:.:::.::::::.
CCDS42 RAFFTCASHLTVVTVFYTALLFMYVRPQAIDSRSSNKLISVLYTVITPILNPLIYCLRNK
240 250 260 270 280 290
310 320
pF1KE5 EVKRALCCTLHLYQHQDPDPKKASRNV
: : ::
CCDS42 EFKNALKKAFGLTSCAVEGRLSSLLELHLQIHSQPL
300 310 320 330
>>CCDS46559.1 OR6B2 gene_id:389090|Hs108|chr2 (312 aa)
initn: 1183 init1: 896 opt: 1183 Z-score: 1126.7 bits: 216.7 E(32554): 1.9e-56
Smith-Waterman score: 1183; 57.2% identity (84.0% similar) in 306 aa overlap (9-314:8-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MEWRNHSGRVSEFVLLGFPAPAPLQVLLFALLLLAYVLVLTENTLIIMAIRNHSTLHKPM
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]