Result of FASTA (omim) for
pFN21AE5467
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5467, 310 aa
1>>>pF1KE5467 310 - 310 aa - 310 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2538+/-0.000516; mu= 15.9504+/- 0.031
mean_var=125.1943+/-36.554, 0's: 0 Z-trim(108.0): 422 B-trim: 994 in 1/48
Lambda= 0.114626
statistics sampled from 15511 (16119) to 15511 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.514), E-opt: 0.2 (0.189), width: 16
Scan time: 5.300
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 1047 185.3 1.3e-46
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XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 871 156.2 7.9e-38
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 871 156.2 7.9e-38
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 859 154.2 3.1e-37
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 855 153.6 4.9e-37
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 851 152.9 7.7e-37
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NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 848 152.4 1.1e-36
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 848 152.4 1.1e-36
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 845 151.9 1.5e-36
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XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 833 149.9 6e-36
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 819 147.6 3e-35
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 811 146.3 7.5e-35
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 810 146.1 8.5e-35
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 778 140.8 3.3e-33
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 767 139.0 1.2e-32
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 765 138.7 1.5e-32
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 514 97.2 4.7e-20
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 496 94.2 3.7e-19
NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 247 53.1 9.5e-07
NP_000530 (OMIM: 136880,180380,610445,613731) rhod ( 348) 239 51.8 2.4e-06
NP_006574 (OMIM: 605224) visual pigment-like recep ( 337) 222 48.9 1.7e-05
NP_001164643 (OMIM: 601470,607339,609423,613784) C ( 355) 212 47.3 5.4e-05
NP_001164642 (OMIM: 601470,607339,609423,613784) C ( 355) 212 47.3 5.4e-05
NP_001328 (OMIM: 601470,607339,609423,613784) CX3C ( 355) 212 47.3 5.4e-05
NP_001164645 (OMIM: 601470,607339,609423,613784) C ( 387) 212 47.4 5.7e-05
XP_011508791 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 313) 210 46.9 6.3e-05
XP_006712259 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 333) 210 46.9 6.5e-05
XP_006712258 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 370) 210 47.0 7e-05
XP_011508790 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 376) 210 47.0 7e-05
XP_011508789 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 403) 210 47.0 7.3e-05
NP_006047 (OMIM: 604153) neuromedin-U receptor 1 [ ( 426) 210 47.1 7.6e-05
NP_055441 (OMIM: 604849) trace amine-associated re ( 306) 208 46.6 7.8e-05
NP_001028252 (OMIM: 604849) trace amine-associated ( 351) 208 46.6 8.5e-05
NP_000902 (OMIM: 165195) delta-type opioid recepto ( 372) 202 45.7 0.00017
NP_000903 (OMIM: 165196) kappa-type opioid recepto ( 380) 199 45.2 0.00025
NP_001305426 (OMIM: 165196) kappa-type opioid rece ( 409) 199 45.2 0.00026
NP_005949 (OMIM: 600665) melatonin receptor type 1 ( 350) 198 45.0 0.00027
NP_001265428 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 197 44.9 0.00033
NP_001265426 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 197 44.9 0.00033
NP_001265427 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 197 44.9 0.00033
NP_001265429 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 197 44.9 0.00033
NP_000666 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a [H ( 412) 197 44.9 0.00033
NP_000667 (OMIM: 600446) adenosine receptor A2b [H ( 332) 195 44.5 0.00036
NP_004239 (OMIM: 600895) prolactin-releasing pepti ( 370) 195 44.5 0.00039
NP_149039 (OMIM: 606381) succinate receptor 1 [Hom ( 334) 193 44.1 0.00046
NP_150598 (OMIM: 606665) melanopsin isoform 1 [Hom ( 478) 192 44.2 0.00064
>>NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C46 [H (309 aa)
initn: 1038 init1: 1038 opt: 1047 Z-score: 957.6 bits: 185.3 E(85289): 1.3e-46
Smith-Waterman score: 1047; 48.3% identity (82.6% similar) in 298 aa overlap (4-301:2-299)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MEPQNTTQVSMFVLLGFSQTQELQKFLFLLFLLVYVTTIVGNLLIMVTVTFDCRLHTPMY
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70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLLRNLALIDLCYSTVTSPKMLVDFLHETKTISYQGCMAQIFFFHLLGGGTVFFLSVMAY
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pF1KE5 TTHIIVVSMIFIPCIYIYTWPFTPFLMDKAVSISYTVMTPMLNPMIYTLRNQDMKAAMRR
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NP_001 VSHITVVILFFVPCIFVYMRPAATLPIDKAVAIFYTMITPMLNPLIYTLKNAQMKNAIRK
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE5 LGKCLVICRE
:
NP_001 LCSRKDISGDK
300
>>XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
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pF1KE5 FLLRNLALIDLCYSTVTSPKMLVDFLHETKTISYQGCMAQIFFFHLLGGGTVFFLSVMAY
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pF1KE5 DRYIAISQPLRYVTIMNTQLCVGLVVAAWVGGFVHSIVQLALILPLPFCGPNILDNFYCD
:::.:. . ::: .::. ::. :....::.::. : :: :. . ::.: ...:.. :.
XP_011 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
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pF1KE5 VPQVLRLACTDTSLLEFLMISNSGLLVIIWFLLLLISYT-VILVMLRSHSGKARRKAAST
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XP_011 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
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pF1KE5 CTTHIIVVSMIFIPCIYIYTWPFT-P-FLMDKAVSISYTVMTPMLNPMIYTLRNQDMKAA
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XP_011 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA
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300 310
pF1KE5 MRRLGKCLVICRE
..:
XP_011 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
>>XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
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pF1KE5 MEPQNTTQVSMFVLLGFSQTQELQKFLFLLFLLVYVTTIVGNLLIMVTVTFDCRLHTPMY
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pF1KE5 FLLRNLALIDLCYSTVTSPKMLVDFLHETKTISYQGCMAQIFFFHLLGGGTVFFLSVMAY
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pF1KE5 DRYIAISQPLRYVTIMNTQLCVGLVVAAWVGGFVHSIVQLALILPLPFCGPNILDNFYCD
:::.:. . ::: .::. ::. :....::.::. : :: :. . ::.: ...:.. :.
XP_011 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
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pF1KE5 VPQVLRLACTDTSLLEFLMISNSGLLVIIWFLLLLISYT-VILVMLRSHSGKARRKAAST
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XP_011 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
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pF1KE5 CTTHIIVVSMIFIPCIYIYTWPFT-P-FLMDKAVSISYTVMTPMLNPMIYTLRNQDMKAA
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XP_011 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 MRRLGKCLVICRE
..:
XP_011 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
>>NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [Homo (317 aa)
initn: 868 init1: 659 opt: 871 Z-score: 800.1 bits: 156.2 E(85289): 7.9e-38
Smith-Waterman score: 871; 44.1% identity (74.3% similar) in 304 aa overlap (1-301:1-304)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MEPQNTTQVSMFVLLGFSQTQELQKFLFLLFLLVYVTTIVGNLLIMVTVTFDCRLHTPMY
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NP_036 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
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pF1KE5 FLLRNLALIDLCYSTVTSPKMLVDFLHETKTISYQGCMAQIFFFHLLGGGTVFFLSVMAY
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NP_036 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
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pF1KE5 DRYIAISQPLRYVTIMNTQLCVGLVVAAWVGGFVHSIVQLALILPLPFCGPNILDNFYCD
:::.:. . ::: .::. ::. :....::.::. : :: :. . ::.: ...:.. :.
NP_036 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
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pF1KE5 VPQVLRLACTDTSLLEFLMISNSGLLVIIWFLLLLISYT-VILVMLRSHSGKARRKAAST
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NP_036 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
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pF1KE5 CTTHIIVVSMIFIPCIYIYTWPFT-P-FLMDKAVSISYTVMTPMLNPMIYTLRNQDMKAA
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NP_036 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA
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300 310
pF1KE5 MRRLGKCLVICRE
..:
NP_036 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
>>NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [Homo (317 aa)
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Smith-Waterman score: 859; 43.8% identity (74.3% similar) in 304 aa overlap (1-300:1-304)
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pF1KE5 MEPQNTTQVSMFVLLGFSQTQ-ELQKFLFLLFLLVYVTTIVGNLLIMVTVTFDCRLHTPM
: : :..: :.:..::. :.:..::: :: .:..:. :: ::.... : ::.::
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pF1KE5 YFLLRNLALIDLCYSTVTSPKMLVDFLHETKTISYQGCMAQIFFFHLLGGGTVFFLSVMA
::.::::..... .. : :::: .: . :::. :: .:..:: ..: . :.:..::
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pF1KE5 YDRYIAISQPLRYVTIMNTQLCVGLVVAAWVGGFVHSIVQLALILPLPFCGPNILDNFYC
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NP_835 YDRYVAICSPLHYPVIMNQRTRAKLAAASWFPGFPVATVQTTWLFSFPFCGTNKVNHFFC
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pF1KE5 DVPQVLRLACTDTSLLEFLMISNSGLLVIIWFLLLLISYT-VILVMLRSHSGKARRKAAS
: : ::.:.:.::.:.:. : .. :.:.: ::.: ::: . ..:. :.:...:: :
NP_835 DSPPVLKLVCADTALFEIYAIVGTILVVMIPCLLILCSYTRIAAAILKIPSAKGKHKAFS
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::..:..:::...: : :: . . : .:.::::.::::::.::.:::...:
NP_835 TCSSHLLVVSLFYISSSLTYFWPKSNNSPESKKLLSLSYTVVTPMLNPIIYSLRNSEVKN
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pF1KE5 AMRRLGKCLVICRE
:. :
NP_835 ALSRTFHKVLALRNCIP
310
>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
initn: 792 init1: 673 opt: 855 Z-score: 785.9 bits: 153.6 E(85289): 4.9e-37
Smith-Waterman score: 855; 41.4% identity (74.5% similar) in 302 aa overlap (4-301:6-306)
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pF1KE5 MEPQNTTQVSMFVLLGFSQTQELQKFLFLLFLLVYVTTIVGNLLIMVTVTFDCRLHTP
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NP_006 MEFTDRNYTLVTEFILLGFPTRPELQIVLFLMFLTLYAIILIGNIGLMLLIRIDPHLQTP
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 MYFLLRNLALIDLCYSTVTSPKMLVDFLHETKTISYQGCMAQIFFFHLLGGGTVFFLSVM
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NP_006 MYFFLSNLSFVDLCYFSDIVPKMLVNFLSENKSISYYGCALQFYFFCTFADTESFILAAM
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 AYDRYIAISQPLRYVTIMNTQLCVGLVVAAWVGGFVHSIVQLALILPLPFCGPNILDNFY
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NP_006 AYDRYVAICNPLLYTVVMSRGICMRLIVLSYLGGNMSSLVHTSFAFILKYCDKNVINHFF
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 CDVPQVLRLACTDTSLLEFLMISNSGLLVIIWFLLLLISYTVILV-MLRSHSGKARRKAA
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NP_006 CDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFIIIIISYFFILLSVLKIRSFSGRKKTF
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 STCTTHIIVVSMIFIPCIYIYTWP---FTPFLMDKAVSISYTVMTPMLNPMIYTLRNQDM
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NP_006 STCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNT-DKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKDV
250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 KAAMRRLGKCLVICRE
: : ...
NP_006 KDAAEKVLRSKVDSS
300 310
>>NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [Homo (312 aa)
initn: 818 init1: 627 opt: 851 Z-score: 782.3 bits: 152.9 E(85289): 7.7e-37
Smith-Waterman score: 851; 43.2% identity (72.9% similar) in 303 aa overlap (5-303:3-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MEPQNTTQVSMFVLLGFSQTQELQKFLFLLFLLVYVTTIVGNLLIMVTVTFDCRLHTPMY
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NP_009 MVNQSSTPGFLLLGFSEHPGLERTLFVVVLTSYLLTLVGNTLIILLSALDPKLHSPMY
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pF1KE5 FLLRNLALIDLCYSTVTSPKMLVDFLHETKTISYQGCMAQIFFFHLLGGGTVFFLSVMAY
:.: ::...:::..: :.:::.. ::::. : .:::.: :: ..:.:::.
NP_009 FFLSNLSFLDLCFTTSCVPQMLVNLWGPKKTISFLDCSVQIFIFLSLGTTECILLTVMAF
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pF1KE5 DRYIAISQPLRYVTIMNTQLCVGLVVAAWVGGFVHSIVQLALILPLPFCGPNILDNFYCD
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NP_009 DRYVAVCQPLHYATIIHPRLCWQLASVAWVIGLVESVVQTPSTLHLPFCPDRQVDDFVCE
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pF1KE5 VPQVLRLACTDTSLLEFLMISNSGLLVIIWFLLLLISYTVIL-VMLRSHSGKARRKAAST
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NP_009 VPALIRLSCEDTSYNEIQVAVASVFILVVPLSLILVSYGAITWAVLRINSAKGRRKAFGT
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pF1KE5 CTTHIIVVSMIFIPCIYIYTWPFTPFLMDKA--VSISYTVMTPMLNPMIYTLRNQDMKAA
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NP_009 CSSHLTVVTLFYSSVIAVYLQPKNPYAQERGKFFGLFYAVGTPSLNPLIYTLRNKEVTRA
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300 310
pF1KE5 MRRL-GKCLVICRE
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NP_009 FRRLLGKEMGLTQS
300 310
>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa)
initn: 808 init1: 661 opt: 848 Z-score: 779.7 bits: 152.4 E(85289): 1.1e-36
Smith-Waterman score: 848; 41.4% identity (75.3% similar) in 304 aa overlap (1-301:1-304)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MEPQNTTQVSMFVLLGFSQTQELQKFLFLLFLLVYVTTIVGNLLIMVTVTFDCRLHTPMY
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pF1KE5 FLLRNLALIDLCYSTVTSPKMLVDFLHETKTISYQGCMAQIFFFHLLGGGTVFFLSVMAY
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pF1KE5 DRYIAISQPLRYVTIMNTQLCVGLVVAAWVGGFVHSIVQLALILPLPFCGPNILDNFYCD
:...:. .::.:.. :. :::. ::.. :: . .. ... :. :: ::. : . .:.::
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pF1KE5 VPQVLRLACTDTSLLEFLMISNSGLLVIIWFLLLLISYT-VILVMLRSHSGKARRKAAST
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XP_011 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST
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pF1KE5 CTTHIIVVSMIFIPCIYIYTWPFTPFLMDK--AVSISYTVMTPMLNPMIYTLRNQDMKAA
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XP_011 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA
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300 310
pF1KE5 MRRLGKCLVICRE
....
XP_011 LKKVVGRVVFSV
310
>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
initn: 808 init1: 661 opt: 848 Z-score: 779.7 bits: 152.4 E(85289): 1.1e-36
Smith-Waterman score: 848; 41.4% identity (75.3% similar) in 304 aa overlap (1-301:1-304)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MEPQNTTQVSMFVLLGFSQTQELQKFLFLLFLLVYVTTIVGNLLIMVTVTFDCRLHTPMY
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NP_036 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
10 20 30 40 50 60
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pF1KE5 FLLRNLALIDLCYSTVTSPKMLVDFLHETKTISYQGCMAQIFFFHLLGGGTVFFLSVMAY
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NP_036 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYIAISQPLRYVTIMNTQLCVGLVVAAWVGGFVHSIVQLALILPLPFCGPNILDNFYCD
:...:. .::.:.. :. :::. ::.. :: . .. ... :. :: ::. : . .:.::
NP_036 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
130 140 150 160 170 180
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pF1KE5 VPQVLRLACTDTSLLEFLMISNSGLLVIIWFLLLLISYT-VILVMLRSHSGKARRKAAST
: .:.:.:.:: : : ...:...:..: :: .: :: . ..:. : :.: :: ::
NP_036 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST
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pF1KE5 CTTHIIVVSMIFIPCIYIYTWPFTPFLMDK--AVSISYTVMTPMLNPMIYTLRNQDMKAA
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NP_036 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA
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300 310
pF1KE5 MRRLGKCLVICRE
....
NP_036 LKKVVGRVVFSV
310
>>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa)
initn: 808 init1: 661 opt: 848 Z-score: 779.5 bits: 152.4 E(85289): 1.1e-36
Smith-Waterman score: 848; 41.4% identity (75.3% similar) in 304 aa overlap (1-301:11-314)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MEPQNTTQVSMFVLLGFSQTQELQKFLFLLFLLVYVTTIVGNLLIMVTVT
: : ..:: :.:::.:. . :..::..:: .:..:..:::::...:.
XP_011 MGDRRADPRPMSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVS
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pF1KE5 FDCRLHTPMYFLLRNLALIDLCYSTVTSPKMLVDFLHETKTISYQGCMAQIFFFHLLGGG
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XP_011 IDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDM
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pF1KE5 TVFFLSVMAYDRYIAISQPLRYVTIMNTQLCVGLVVAAWVGGFVHSIVQLALILPLPFCG
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XP_011 DNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCA
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pF1KE5 PNILDNFYCDVPQVLRLACTDTSLLEFLMISNSGLLVIIWFLLLLISYT-VILVMLRSHS
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XP_011 DNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPS
190 200 210 220 230 240
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pF1KE5 GKARRKAASTCTTHIIVVSMIFIPCIYIYTWPFTPFLMDK--AVSISYTVMTPMLNPMIY
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XP_011 TKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIY
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]