Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5466
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5466, 310 aa
1>>>pF1KE5466 310 - 310 aa - 310 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1158+/-0.0015; mu= 11.3239+/- 0.087
mean_var=142.8762+/-46.103, 0's: 0 Z-trim(100.2): 378 B-trim: 721 in 2/46
Lambda= 0.107299
statistics sampled from 5552 (6021) to 5552 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.515), E-opt: 0.2 (0.185), width: 16
Scan time: 1.430
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 1290 212.3 3.8e-55
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 1261 207.8 8.5e-54
CCDS31513.1 OR5W2 gene_id:390148|Hs108|chr11 ( 310) 1212 200.3 1.6e-51
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 1208 199.7 2.6e-51
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 1177 194.8 7.1e-50
CCDS31550.1 OR5B2 gene_id:390190|Hs108|chr11 ( 309) 1163 192.7 3.1e-49
CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 ( 309) 1155 191.4 7.4e-49
CCDS31549.1 OR5B3 gene_id:441608|Hs108|chr11 ( 314) 1150 190.7 1.3e-48
CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 ( 362) 1139 189.0 4.6e-48
CCDS35131.1 OR5C1 gene_id:392391|Hs108|chr9 ( 320) 1134 188.2 7.2e-48
CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 ( 308) 1126 186.9 1.7e-47
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 1125 186.8 1.9e-47
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 1124 186.6 2.1e-47
CCDS31525.1 OR5T1 gene_id:390155|Hs108|chr11 ( 326) 1120 186.0 3.3e-47
CCDS31523.1 OR5T2 gene_id:219464|Hs108|chr11 ( 359) 1120 186.1 3.5e-47
CCDS31524.1 OR5T3 gene_id:390154|Hs108|chr11 ( 340) 1119 185.9 3.7e-47
CCDS53630.1 OR5M10 gene_id:390167|Hs108|chr11 ( 315) 1118 185.7 4e-47
CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11 ( 327) 1114 185.1 6.2e-47
CCDS53631.1 OR5M1 gene_id:390168|Hs108|chr11 ( 315) 1107 184.0 1.3e-46
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 1104 183.6 1.8e-46
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 1096 182.3 4.2e-46
CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11 ( 311) 1094 182.0 5.2e-46
CCDS31548.1 OR5B17 gene_id:219965|Hs108|chr11 ( 314) 1090 181.4 8e-46
CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11 ( 330) 1081 180.0 2.2e-45
CCDS31520.1 OR8J3 gene_id:81168|Hs108|chr11 ( 315) 1079 179.7 2.6e-45
CCDS66256.1 OR8G5 gene_id:219865|Hs108|chr11 ( 346) 1076 179.3 3.8e-45
CCDS31518.1 OR8H2 gene_id:390151|Hs108|chr11 ( 312) 1075 179.0 4e-45
CCDS8446.1 OR8B8 gene_id:26493|Hs108|chr11 ( 311) 1067 177.8 9.4e-45
CCDS53629.1 OR5M11 gene_id:219487|Hs108|chr11 ( 305) 1065 177.5 1.1e-44
CCDS31709.1 OR8B3 gene_id:390271|Hs108|chr11 ( 313) 1065 177.5 1.2e-44
CCDS31532.1 OR5M3 gene_id:219482|Hs108|chr11 ( 307) 1064 177.3 1.3e-44
CCDS31698.1 OR8D4 gene_id:338662|Hs108|chr11 ( 314) 1063 177.2 1.4e-44
CCDS31521.1 OR8K5 gene_id:219453|Hs108|chr11 ( 307) 1062 177.0 1.6e-44
CCDS31510.1 OR5D18 gene_id:219438|Hs108|chr11 ( 313) 1061 176.9 1.8e-44
CCDS31711.1 OR8B12 gene_id:219858|Hs108|chr11 ( 310) 1060 176.7 2e-44
CCDS31528.1 OR8K1 gene_id:390157|Hs108|chr11 ( 319) 1060 176.7 2e-44
CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 ( 326) 1058 176.4 2.5e-44
CCDS31529.1 OR8J1 gene_id:219477|Hs108|chr11 ( 316) 1057 176.3 2.8e-44
CCDS31517.1 OR8I2 gene_id:120586|Hs108|chr11 ( 310) 1056 176.1 3e-44
CCDS31533.1 OR5M8 gene_id:219484|Hs108|chr11 ( 311) 1055 176.0 3.4e-44
CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 1052 175.5 4.7e-44
CCDS7783.1 OR5P3 gene_id:120066|Hs108|chr11 ( 311) 1047 174.7 8e-44
CCDS33801.1 OR5H2 gene_id:79310|Hs108|chr3 ( 314) 1046 174.6 9e-44
CCDS43115.1 OR5K1 gene_id:26339|Hs108|chr3 ( 308) 1045 174.4 9.9e-44
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 1045 174.4 9.9e-44
CCDS31542.1 OR9I1 gene_id:219954|Hs108|chr11 ( 314) 1042 173.9 1.4e-43
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 1039 173.5 1.9e-43
CCDS31708.1 OR8B2 gene_id:26595|Hs108|chr11 ( 313) 1038 173.3 2.1e-43
CCDS31511.1 OR5L2 gene_id:26338|Hs108|chr11 ( 311) 1035 172.9 2.9e-43
CCDS31531.1 OR5M9 gene_id:390162|Hs108|chr11 ( 310) 1030 172.1 4.9e-43
>>CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 1290 init1: 1290 opt: 1290 Z-score: 1103.5 bits: 212.3 E(32554): 3.8e-55
Smith-Waterman score: 1290; 58.6% identity (86.2% similar) in 304 aa overlap (4-307:2-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MDKENSSMVTEFIFMGITQDPQMEIIFFVVFLIVYLVNVVGNIGMIILITTDTQLHTPMY
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CCDS31 MENNTEVTEFILVGLTDDPELQIPLFIVFLFIYLITLVGNLGMIELILLDSCLHTPMY
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FFLCNLSFVDLGYSSAIAPRMLADFLTNHKVISFSSCATQFAFFVGFVDAECYVLAAMAY
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CCDS31 FFLSNLSLVDFGYSSAVTPKVMVGFLTGDKFILYNACATQFFFFVAFITAESFLLASMAY
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 GRFVAICRPLHYSTFMSKQVCLALMLGSYLAGLVSLVAHTTLTFSLSYCGSNIINHFFCE
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CCDS31 DRYAALCKPLHYTTTMTTNVCACLAIGSYICGFLNASIHTGNTFRLSFCRSNVVEHFFCD
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 IPPLLALSCSDTYISEILLFSLCGFIEFSTILIIFISYTFILVAIIRMRSAEGRLKAFST
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CCDS31 APPLLTLSCSDNYISEMVIFFVVGFNDLFSILVILISYLFIFITIMKMRSPEGRQKAFST
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CGSHLTGITLFYGTVMFMYLRPTSSYSLDQDKWASVFYTVIIPMLNPLIYSLRNKDVKAA
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CCDS31 CASHLTAVSIFYGTGIFMYLRPNSSHFMGTDKMASVFYAIVIPMLNPLVYSLRNKEVKSA
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE5 FKKLIGKKSQ
::: .::
CCDS31 FKKTVGKAKASIGFIF
300 310
>>CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 (309 aa)
initn: 1264 init1: 827 opt: 1261 Z-score: 1079.3 bits: 207.8 E(32554): 8.5e-54
Smith-Waterman score: 1261; 59.5% identity (86.8% similar) in 304 aa overlap (4-307:2-304)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MDKENSSMVTEFIFMGITQDPQMEIIFFVVFLIVYLVNVVGNIGMIILITTDTQLHTPMY
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CCDS31 MENSTEVTEFILLGLTDDPNLQIPLLLAFLFIYLITLLGNGGMMVIIHSDSHLHTPMY
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FFLCNLSFVDLGYSSAIAPRMLADFLTNHKVISFSSCATQFAFFVGFVDAECYVLAAMAY
::: :::.::::::::.::. .: . .. :.::...::.:: :::::. .:::.::.:::
CCDS31 FFLSNLSLVDLGYSSAVAPKTVAALRSGDKAISYDGCAAQFFFFVGFATVECYLLASMAY
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 GRFVAICRPLHYSTFMSKQVCLALMLGSYLAGLVSLVAHTTLTFSLSYCGSNIINHFFCE
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CCDS31 DRHAAVCRPLHYTTTMTAGVCALLATGSYVSGFLNASIHAAGTFRLSFCGSNEINHFFCD
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 IPPLLALSCSDTYISEILLFSLCGFIEFSTILIIFISYTFILVAIIRMRSAEGRLKAFST
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CCDS31 IPPLLALSCSDTRISKLVVF-VAGFNVFFTLLVILISYFFICITIQRMHSAEGQKKVFST
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CGSHLTGITLFYGTVMFMYLRPTSSYSLDQDKWASVFYTVIIPMLNPLIYSLRNKDVKAA
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CCDS31 CASHLTALSIFYGTIIFMYLQPNSSQSVDTDKIASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEVKSA
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE5 FKKLIGKKSQ
. :...:
CCDS31 LWKILNKLYPQY
300
>>CCDS31513.1 OR5W2 gene_id:390148|Hs108|chr11 (310 aa)
initn: 1244 init1: 1212 opt: 1212 Z-score: 1038.3 bits: 200.3 E(32554): 1.6e-51
Smith-Waterman score: 1212; 56.7% identity (83.4% similar) in 307 aa overlap (1-307:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MDKENSSMVTEFIFMGITQDPQMEIIFFVVFLIVYLVNVVGNIGMIILITTDTQLHTPMY
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CCDS31 MDWENCSSLTDFFLLGITNNPEMKVTLFAVFLAVYIINFSANLGMIVLIRMDYQLHTPMY
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70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FFLCNLSFVDLGYSSAIAPRMLADFLTNHKVISFSSCATQFAFFVGFVDAECYVLAAMAY
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CCDS31 FFLSHLSFCDLCYSTATGPKMLVDLLAKNKSIPFYGCALQFLVFCIFADSECLLLSVMAF
70 80 90 100 110 120
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pF1KE5 GRFVAICRPLHYSTFMSKQVCLALMLGSYLAGLVSLVAHTTLTFSLSYCGSNIINHFFCE
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CCDS31 DRYKAIINPLLYTVNMSSRVCYLLLTGVYLVGIADALIHMTLAFRLCFCGSNEINHFFCD
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190 200 210 220 230 240
pF1KE5 IPPLLALSCSDTYISEILLFSLCGFIEFSTILIIFISYTFILVAIIRMRSAEGRLKAFST
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CCDS31 IPPLLLLSRSDTQVNELVLFTVFGFIELSTISGVFISYCYIILSVLEIHSAEGRFKALST
190 200 210 220 230 240
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pF1KE5 CGSHLTGITLFYGTVMFMYLRPTSSYSLDQDKWASVFYTVIIPMLNPLIYSLRNKDVKAA
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CCDS31 CTSHLSAVAIFQGTLLFMYFRPSSSYSLDQDKMTSLFYTLVVPMLNPLIYSLRNKDVKEA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 FKKLIGKKSQ
.::: .:
CCDS31 LKKLKNKILF
310
>>CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 (324 aa)
initn: 1287 init1: 1194 opt: 1208 Z-score: 1034.7 bits: 199.7 E(32554): 2.6e-51
Smith-Waterman score: 1208; 55.7% identity (86.9% similar) in 305 aa overlap (1-305:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MDKENSSMVTEFIFMGITQDPQMEIIFFVVFLIVYLVNVVGNIGMIILITTDTQLHTPMY
: . : .: :::.:.:.:. ... .:.:::.:: ...:::: .:::.. ...:. :::
CCDS31 MLESNYTMPTEFLFVGFTDYLPLRVTLFLVFLLVYTLTMVGNILLIILVNINSSLQIPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FFLCNLSFVDLGYSSAIAPRMLADFLTNHKVISFSSCATQFAFFVGFVDAECYVLAAMAY
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CCDS31 YFLSNLSFLDISCSTAITPKMLANFLASRKSISPYGCALQMFFFASFADAECLILAAMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 GRFVAICRPLHYSTFMSKQVCLALMLGSYLAGLVSLVAHTTLTFSLSYCGSNIINHFFCE
:..::: :: :.:.::..::. ... .:..: .. ..:. ::: ::.:::::.:::::.
CCDS31 DRYAAICNPLLYTTLMSRRVCVCFIVLAYFSGSTTSLVHVCLTFRLSFCGSNIVNHFFCD
130 140 150 160 170 180
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pF1KE5 IPPLLALSCSDTYISEILLFSLCGFIEFSTILIIFISYTFILVAIIRMRSAEGRLKAFST
:::::::::.:: :...:::.::.::. ::...::::: ::.... ..:. :: :.:::
CCDS31 IPPLLALSCTDTQINQLLLFALCSFIQTSTFVVIFISYFCILITVLSIKSSGGRSKTFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CGSHLTGITLFYGTVMFMYLRPTSSYSLDQDKWASVFYTVIIPMLNPLIYSLRNKDVKAA
:.::: ..:::::...::::.::.::::: :: ..:::::..::.::.:::.:::::: :
CCDS31 CASHLIAVTLFYGALLFMYLQPTTSYSLDTDKVVAVFYTVVFPMFNPIIYSFRNKDVKNA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 FKKLIGKKSQ
.:::.
CCDS31 LKKLLERIGYSNEWYLNRLRIVNI
310 320
>>CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 (316 aa)
initn: 1213 init1: 1170 opt: 1177 Z-score: 1008.9 bits: 194.8 E(32554): 7.1e-50
Smith-Waterman score: 1177; 54.1% identity (85.5% similar) in 303 aa overlap (5-307:11-313)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MDKENSSMVTEFIFMGITQDPQMEIIFFVVFLIVYLVNVVGNIGMIILITTDTQ
:.. ::::...:....:... ..:..::..:..:.:::.:::.:: :
CCDS31 MRLMKEVRGRNQTEVTEFLLLGLSDNPDLQGVLFALFLLIYMANMVGNLGMIVLIKIDLC
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 LHTPMYFFLCNLSFVDLGYSSAIAPRMLADFLTNHKVISFSSCATQFAFFVGFVDAECYV
::::::::: .::::: .:::...:.::.......:.::: .::.:: :: .:. .::..
CCDS31 LHTPMYFFLSSLSFVDASYSSSVTPKMLVNLMAENKAISFHGCAAQFYFFGSFLGTECFL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 LAAMAYGRFVAICRPLHYSTFMSKQVCLALMLGSYLAGLVSLVAHTTLTFSLSYCGSNII
:: ::: :..:: :: : ...: ..:. :. :.::: . . :: .:: ::.:::: :
CCDS31 LAMMAYDRYAAIWNPLLYPVLVSGRICFLLIATSFLAGCGNAAIHTGMTFRLSFCGSNRI
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 NHFFCEIPPLLALSCSDTYISEILLFSLCGFIEFSTILIIFISYTFILVAIIRMRSAEGR
:::.:. :::: ::::::... :..... .:: .: ..:..::: :..:...: : :::
CCDS31 NHFYCDTPPLLKLSCSDTHFNGIVIMAFSSFIVISCVMIVLISYLCIFIAVLKMPSLEGR
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 LKAFSTCGSHLTGITLFYGTVMFMYLRPTSSYSLDQDKWASVFYTVIIPMLNPLIYSLRN
::::::.:.: ..:.:.::..:::::::::::..::: .:::::::::.::::::::.:
CCDS31 HKAFSTCASYLMAVTIFFGTILFMYLRPTSSYSMEQDKVVSVFYTVIIPVLNPLIYSLKN
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 KDVKAAFKKLIGKKSQ
:::: :.::.. :
CCDS31 KDVKKALKKILWKHIL
310
>>CCDS31550.1 OR5B2 gene_id:390190|Hs108|chr11 (309 aa)
initn: 1227 init1: 1163 opt: 1163 Z-score: 997.3 bits: 192.7 E(32554): 3.1e-49
Smith-Waterman score: 1163; 52.1% identity (84.6% similar) in 305 aa overlap (4-308:2-306)
10 20 30 40 50 60
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CCDS31 DRYAAVCKPLHYTTTMTASVGACLALGSYVCGFLNASFHIGGIFSLSFCKSNLVHHFFCD
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CCDS31 CASHFTAVSVFYGTVIFIYLQPSSSHSMDTDKMASVFYAMIIPMLNPVVYSLRNREVQNA
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310
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CCDS31 FKKVLRRQKFL
300
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CCDS41 DMPLLRLTCSDTRFKQLWIFACAGIMFISSLLIVFVSYMFIISAILRMHSAEGRQKAFST
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CCDS41 CGSHMLAVTIFYGTLIFMYLQPSSSHALDTDKMASVFYTVIIPMLNPLIYSLQNKEVKEA
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310
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CCDS41 LKKIIINKN
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CCDS31 MENKTEVTQFILLGLTNDSELQVPLFITFPFIYIITLVGNLGIIVLIFWDSCLHNPMY
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CCDS31 FFLSNLSLVDFCYSSAVTPIVMAGFLIEDKVISYNACAAQMYIFVAFATVENYLLASMAY
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CCDS31 DRYAAVCKPLHYTTTMTTTVCARLAIGSYLCGFLNASIHTGDTFSLSFCKSNEVHHFFCD
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CCDS31 IPAVMVLSCSDRHISELVLIYVVSFNIFIALLVILISYTFIFITILKMHSASVYQKPLST
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CCDS31 CASHFIAVGIFYGTIIFMYLQPSSSHSMDTDKMAPVFYTMVIPMLNPLVYSLRNKEVKSA
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310
pF1KE5 FKKLIGKKSQ
:::.. :
CCDS31 FKKVVEKAKLSVGWSV
300 310
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10 20 30
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CCDS32 LGRIKPSQSPRCSTSFMVVPSFSIAEHWRRMKGANLSQGMEFELLGLTTDPQLQRLLFVV
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CCDS32 FLGMYTATLLGNLVMFLLIHVSATLHTPMYSLLKSLSFLDFCYSSTVVPQTLVNFLAKRK
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CCDS32 VISYFGCMTQMFFYAGFATSECYLIAAMAYDRYAAICNPLLYSTIMSPEVCASLIVGSYS
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CCDS32 AGFLNSLIHTGCIFSLKFCGAHVVTHFFCDGPPILSLSCVDTSLCEILLFIFAGFNLLSC
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pF1KE5 ILIIFISYTFILVAIIRMRSAEGRLKAFSTCGSHLTGITLFYGTVMFMYLRPTSSYSLDQ
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CCDS32 TLTILISYFLILNTILKMSSAQGRFKAFSTCASHLTAICLFFGTTLFMYLRPRSSYSLTQ
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CCDS35 MNSENLTRAAVAPAEFVLLGITNRWDLRVALFLTCLPVYLVSLLGNMGMALLIRMDARLH
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CCDS35 TPMYFFLANLSLLDACYSSAIGPKMLVDLLLPRATIPYTACALQMFVFAGLADTECCLLA
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]