FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5462, 309 aa
1>>>pF1KE5462 309 - 309 aa - 309 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2030+/-0.000509; mu= 16.2056+/- 0.031
mean_var=83.2672+/-19.335, 0's: 0 Z-trim(108.0): 244 B-trim: 900 in 1/50
Lambda= 0.140552
statistics sampled from 15763 (16067) to 15763 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.522), E-opt: 0.2 (0.188), width: 16
Scan time: 5.830
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 1288 271.6 1.4e-72
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 871 187.1 4e-47
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 856 184.0 3.3e-46
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 856 184.0 3.3e-46
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 856 184.0 3.3e-46
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 856 184.0 3.4e-46
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 832 179.2 9.5e-45
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 831 179.0 1.1e-44
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 814 175.5 1.2e-43
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 814 175.5 1.2e-43
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 814 175.5 1.2e-43
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 813 175.3 1.4e-43
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 807 174.1 3.3e-43
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 803 173.3 5.6e-43
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 799 172.5 1e-42
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 794 171.5 2e-42
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 788 170.2 4.7e-42
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 764 165.4 1.3e-40
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 757 164.0 3.6e-40
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 735 159.5 8e-39
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 537 119.3 9.9e-27
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 499 111.6 2.1e-24
NP_778237 (OMIM: 608923) trace amine-associated re ( 345) 191 49.2 1.4e-05
NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 186 48.2 2.8e-05
NP_778227 (OMIM: 608282) trace amine-associated re ( 348) 183 47.6 4.3e-05
XP_016855645 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 183 47.8 6.3e-05
NP_000731 (OMIM: 100100,118494) muscarinic acetylc ( 590) 183 47.8 6.3e-05
XP_011542347 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 183 47.8 6.3e-05
XP_011542343 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 183 47.8 6.3e-05
XP_016855649 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 183 47.8 6.3e-05
XP_011542345 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 183 47.8 6.3e-05
XP_016855650 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 183 47.8 6.3e-05
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XP_016855641 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 183 47.8 6.3e-05
XP_016855642 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 183 47.8 6.3e-05
XP_005273089 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 183 47.8 6.3e-05
XP_016855644 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 183 47.8 6.3e-05
XP_016855652 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 183 47.8 6.3e-05
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XP_011542346 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 183 47.8 6.3e-05
XP_016855648 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 183 47.8 6.3e-05
XP_016855647 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 183 47.8 6.3e-05
XP_011542349 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 183 47.8 6.3e-05
XP_016855646 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 183 47.8 6.3e-05
XP_011542348 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 183 47.8 6.3e-05
NP_005950 (OMIM: 125853,600804) melatonin receptor ( 362) 179 46.8 7.8e-05
XP_011541141 (OMIM: 125853,600804) PREDICTED: mela ( 362) 179 46.8 7.8e-05
NP_000667 (OMIM: 600446) adenosine receptor A2b [H ( 332) 175 46.0 0.00013
NP_063941 (OMIM: 155540,602025,607948) melanocorti ( 323) 168 44.5 0.00033
NP_001278840 (OMIM: 202200,607397) adrenocorticotr ( 297) 167 44.3 0.00036
>>NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C46 [H (309 aa)
initn: 1288 init1: 1288 opt: 1288 Z-score: 1424.1 bits: 271.6 E(85289): 1.4e-72
Smith-Waterman score: 1288; 61.4% identity (85.9% similar) in 306 aa overlap (1-306:1-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MEPRKNVTDFVLLGFTQNPKEQKVLFVMFLLFYILTMVGNLLIVVTVTVSETLGSPMYFF
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NP_001 MENRNNMTEFVLLGLTENPKMQKIIFVVFFVIYIITVVGYVLIVVTITASPSLGSPMYLS
10 20 30 40 50 60
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pF1KE5 LAGLSFIDIIYSSSISPRLISGLFFGNNSISFQSCMAQLFIEHLFGGSEVFLLLVMAYDC
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NP_001 LAYLSFIDACYSSVNTPNLITHSLYGKKAILFNGCMTQVFGEHFFGGAEGILLTVMAYDH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 YVAICKPLHYLVIMRQWVCVLLLVVSWVGGFLHSVFQLSIIYGLPFCGPNVIDHFFCDMY
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NP_001 YVAICKPLHYMTIMNQCVCALLMGVVWMGGFLHATIQILFIFQLPFCGPNVIDHFMCDLN
130 140 150 160 170 180
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pF1KE5 PLLKLVCTDTHAIGLLVVANGGLACTIVFLLLLISYGVILHSLKNLSQKGRQKALSTCSS
:::.:.::::: . :...::.:. : . : :::.:: ::: ::.. : ..:.:::::: :
NP_001 PLLNLACTDTHMLELFIAANSGFICLLNFALLLVSYVVILCSLRTHSLEARHKALSTCVS
190 200 210 220 230 240
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pF1KE5 HMTVVVFFFVPCIFMYARPARTFPIDKSVSVFYTVITPMLNPLIYTLRNSEMTSAMKKLW
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NP_001 HITVVILFFVPCIFVYMRPAATLPIDKAVAIFYTMITPMLNPLIYTLKNAQMKNAIRKLC
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 RRDLISSST
: ::
NP_001 SRKDISGDK
>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
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Smith-Waterman score: 871; 44.1% identity (73.0% similar) in 304 aa overlap (7-307:11-314)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MEPRKNVTDFVLLGFTQNPKEQKVLFVMFLLFYILTMVGNLLIVVTVTVSETLGSP
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NP_006 MEFTDRNYTLVTEFILLGFPTRPELQIVLFLMFLTLYAIILIGNIGLMLLIRIDPHLQTP
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pF1KE5 MYFFLAGLSFIDIIYSSSISPRLISGLFFGNNSISFQSCMAQLFIEHLFGGSEVFLLLVM
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NP_006 MYFFLSNLSFVDLCYFSDIVPKMLVNFLSENKSISYYGCALQFYFFCTFADTESFILAAM
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pF1KE5 AYDCYVAICKPLHYLVIMRQWVCVLLLVVSWVGGFLHSVFQLSIIYGLPFCGPNVIDHFF
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NP_006 AYDRYVAICNPLLYTVVMSRGICMRLIVLSYLGGNMSSLVHTSFAFILKYCDKNVINHFF
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pF1KE5 CDMYPLLKLVCTDTHAIGLLVVANGGLACTIVFLLLLISYGVILHS-LKNLSQKGRQKAL
::. ::::: :::: :. . :. . : :....::: :: : :: : .::.:..
NP_006 CDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFIIIIISYFFILLSVLKIRSFSGRKKTF
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240 250 260 270 280 290
pF1KE5 STCSSHMTVVVFFFVPCIFMYARPARTF-P-IDKSVSVFYTVITPMLNPLIYTLRNSEMT
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NP_006 STCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKDVK
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300
pF1KE5 SAMKKLWRRDLISSST
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NP_006 DAAEKVLRSKVDSS
310
>>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor (311 aa)
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Smith-Waterman score: 856; 42.6% identity (74.7% similar) in 296 aa overlap (10-300:15-310)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MEPRKNVTDFVLLGFTQNPKEQKVLFVMFLLFYILTMVGNLLIVVTVTVSETLGS
:.:.::.. :. . :.::. :.::..:..:::.:.. .. : .
NP_001 MNDDGKVNASSEGYFILVGFSNWPHLEVVIFVVVLIFYLMTLIGNLFIIILSYLDSHLHT
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pF1KE5 PMYFFLAGLSFIDIIYSSSISPRLISGLFFGNNSISFQSCMAQLFIEHLFGGSEVFLLLV
::::::..:::.:. :..: :.:. .:. ...::. .:: ::.. .: .: ::.:
NP_001 PMYFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLWGPEKTISYAGCMIQLYFVLALGTTECVLLVV
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pF1KE5 MAYDCYVAICKPLHYLVIMRQWVCVLLLVVSWVGGFLHSVFQLSIIYGLPFCGPNVIDHF
:.:: :.:.:.:::: :.:. : :: :.:::.:: .:... :. . .:.:: .:::
NP_001 MSYDRYAAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLAVASWVSGFTNSALHSSFTFWVPLCGHRQVDHF
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pF1KE5 FCDMYPLLKLVCTDTHAIGLLVVANGGLACTIVFLLLLISYGVILHS-LKNLSQKGRQKA
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NP_001 FCEVPALLRLSCVDTHVNELTLMITSSIFVLIPLILILTSYGAIVRAILRMQSTTGLQKV
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pF1KE5 LSTCSSHMTVVVFFFVPCIFMYARPARTFPID--KSVSVFYTVITPMLNPLIYTLRNSEM
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NP_001 FGTCGAHLMAVSLFFIPAMCMYLQPPSGNSQDQGKFIALFYTVVTPSLNPLIYTLRNKVV
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300
pF1KE5 TSAMKKL--WRRDLISSST
.:.:.: :
NP_001 RGAVKRLMGWE
310
>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
initn: 831 init1: 633 opt: 856 Z-score: 950.6 bits: 184.0 E(85289): 3.3e-46
Smith-Waterman score: 856; 42.2% identity (75.5% similar) in 306 aa overlap (4-306:6-311)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MEPRKNVTDFVLLGFTQNPKEQKVLFVMFLLFYILTMVGNLLIVVTVTVSETLGSPMY
...:..:.:::....:..:..:::.:: .:. :..:::::...:... : .:::
NP_036 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
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pF1KE5 FFLAGLSFIDIIYSSSISPRLISGLFFGNNSISFQSCMAQLFIEHLFGGSEVFLLLVMAY
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NP_036 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
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pF1KE5 DCYVAICKPLHYLVIMRQWVCVLLLVVSWVGGFLHSVFQLSIIYGLPFCGPNVIDHFFCD
: .::.:.:::: . : . .:.::.. :: . :. ... .. : ::. :.: :::::
NP_036 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
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pF1KE5 MYPLLKLVCTDTHAIGLLVVANGGLACTIVFLLLLISYGVILHS-LKNLSQKGRQKALST
. ::::: :.::: ......:.:. :: .: :: : . :: : ::: ::.::
NP_036 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST
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pF1KE5 CSSHMTVVVFFFVPCIFMYARPARTFPIDKSV--SVFYTVITPMLNPLIYTLRNSEMTSA
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NP_036 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA
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300
pF1KE5 MKKLWRRDLISSST
.::. : ..:
NP_036 LKKVVGRVVFSV
310
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Smith-Waterman score: 856; 42.2% identity (75.5% similar) in 306 aa overlap (4-306:6-311)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MEPRKNVTDFVLLGFTQNPKEQKVLFVMFLLFYILTMVGNLLIVVTVTVSETLGSPMY
...:..:.:::....:..:..:::.:: .:. :..:::::...:... : .:::
XP_011 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
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pF1KE5 FFLAGLSFIDIIYSSSISPRLISGLFFGNNSISFQSCMAQLFIEHLFGGSEVFLLLVMAY
:::..:::.:: .: . :..... .. ...::: .:..:... .: . ::: ::::
XP_011 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
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pF1KE5 DCYVAICKPLHYLVIMRQWVCVLLLVVSWVGGFLHSVFQLSIIYGLPFCGPNVIDHFFCD
: .::.:.:::: . : . .:.::.. :: . :. ... .. : ::. :.: :::::
XP_011 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
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pF1KE5 MYPLLKLVCTDTHAIGLLVVANGGLACTIVFLLLLISYGVILHS-LKNLSQKGRQKALST
. ::::: :.::: ......:.:. :: .: :: : . :: : ::: ::.::
XP_011 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST
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pF1KE5 CSSHMTVVVFFFVPCIFMYARPARTFPIDKSV--SVFYTVITPMLNPLIYTLRNSEMTSA
:.::..::..:. : .: : . .:.. .:.:::.::::::.::.::: . .:
XP_011 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA
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300
pF1KE5 MKKLWRRDLISSST
.::. : ..:
XP_011 LKKVVGRVVFSV
310
>>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa)
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Smith-Waterman score: 856; 42.2% identity (75.5% similar) in 306 aa overlap (4-306:16-321)
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pF1KE5 MEPRKNVTDFVLLGFTQNPKEQKVLFVMFLLFYILTMVGNLLIVVTVT
...:..:.:::....:..:..:::.:: .:. :..:::::...:.
XP_011 MGDRRADPRPMSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVS
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE5 VSETLGSPMYFFLAGLSFIDIIYSSSISPRLISGLFFGNNSISFQSCMAQLFIEHLFGGS
.. : .::::::..:::.:: .: . :..... .. ...::: .:..:... .:
XP_011 IDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDM
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE5 EVFLLLVMAYDCYVAICKPLHYLVIMRQWVCVLLLVVSWVGGFLHSVFQLSIIYGLPFCG
. ::: ::::: .::.:.:::: . : . .:.::.. :: . :. ... .. : ::.
XP_011 DNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCA
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE5 PNVIDHFFCDMYPLLKLVCTDTHAIGLLVVANGGLACTIVFLLLLISYGVILHS-LKNLS
:.: :::::. ::::: :.::: ......:.:. :: .: :: : . :: :
XP_011 DNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPS
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE5 QKGRQKALSTCSSHMTVVVFFFVPCIFMYARPARTFPIDKSV--SVFYTVITPMLNPLIY
::: ::.:::.::..::..:. : .: : . .:.. .:.:::.::::::.::
XP_011 TKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIY
250 260 270 280 290 300
290 300
pF1KE5 TLRNSEMTSAMKKLWRRDLISSST
.::: . .:.::. : ..:
XP_011 SLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
310 320
>>NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G1 [H (307 aa)
initn: 842 init1: 584 opt: 832 Z-score: 924.4 bits: 179.2 E(85289): 9.5e-45
Smith-Waterman score: 832; 42.6% identity (74.8% similar) in 298 aa overlap (7-300:6-302)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MEPRKNVTDFVLLGFTQNPKEQKVLFVMFLLFYILTMVGNLLIVVTVTVSETLGSPMYFF
::.:..::.:..:. : ..:..::. :.....::.::... ..:: .::: :
NP_001 MNHSVVTEFIILGLTKKPELQGIIFLFFLIVYLVAFLGNMLIIIAKIYNNTLHTPMYVF
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LAGLSFIDIIYSSSISPRLISGLFFGNNSISFQSCMAQLFIEHLFGGSEVFLLLVMAYDC
: :. .::: ..:: :.... .. ..:.::. .::.:::. :.:. :. .::::
NP_001 LLTLAVVDIICTTSIIPKMLGTMLTSENTISYAGCMSQLFLFTWSLGAEMVLFTTMAYDR
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 YVAICKPLHYLVIMRQWVCVLLLVVSWVGGFLHSVFQLSIIYGLPFCGPNVIDHFFCDMY
::::: :::: .:: . .:: :: . . . .: . ..:. : :::::.::::::..
NP_001 YVAICFPLHYSTIMNHHMCVALLSMVMAIAVTNSWVHTALIMRLTFCGPNTIDHFFCEIP
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KE5 PLLKLVCTDTHAIGLLV-VANGGLACTIVFLLLLISYG-VILHSLKNLSQKGRQKALSTC
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NP_001 PLLALSCSPVRINEVMVYVADITLAIGD-FILTCISYGFIIVAILRIRTVEGKRKAFSTC
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 SSHMTVVVFFFVPCIFMYARPAR--TFPIDKSVSVFYTVITPMLNPLIYTLRNSEMTSAM
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NP_001 SSHLTVVTLYYSPVIYTYIRPASSYTFERDKVVAALYTLVTPTLNPMVYSFQNREMQAGI
240 250 260 270 280 290
300
pF1KE5 KKLWRRDLISSST
.:..
NP_001 RKVFAFLKH
300
>>NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN1 [H (311 aa)
initn: 824 init1: 565 opt: 831 Z-score: 923.2 bits: 179.0 E(85289): 1.1e-44
Smith-Waterman score: 831; 43.8% identity (71.6% similar) in 299 aa overlap (7-302:10-308)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MEPRKNVTDFVLLGFTQNPKEQKVLFVMFLLFYILTMVGNLLIVVTVTVSETLGSPM
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NP_001 MTGGGNITEITYFILLGFSDFPRIIKVLFTIFLVIYITSLAWNLSLIVLIRMDSHLHTPM
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 YFFLAGLSFIDIIYSSSISPRLISGLFFGNNSISFQSCMAQLFIEHLFGGSEVFLLLVMA
::::..:::::. : :: :...:.:. ...:.: .:. : :: .: :: :. .::
NP_001 YFFLSNLSFIDVCYISSTVPKMLSNLLQEQQTITFVGCIIQYFIFSTMGLSESCLMTAMA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 YDCYVAICKPLHYLVIMRQWVCVLLLVVSWVGGFLHSVFQLSIIYGLPFCGPNVIDHFFC
:: :.:::.:: : :: .:: ... ... :. :.::.. . : ::: ::: ::::
NP_001 YDRYAAICNPLLYSSIMSPTLCVWMVLGAYMTGLTASLFQIGALLQLHFCGSNVIRHFFC
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 DMYPLLKLVCTDTHAIGLLVVANGGLACTIVFLLLLISYGVI-LHSLKNLSQKGRQKALS
:: :: : :::: . .... . :...:::: : . .: : :::.::..
NP_001 DMPQLLILSCTDTFFVQVMTAILTMFFGIASALVIMISYGYIGISIMKITSAKGRSKAFN
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 TCSSHMTVVVFFFVPCIFMYARPAR--TFPIDKSVSVFYTVITPMLNPLIYTLRNSEMTS
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NP_001 TCASHLTAVSLFYTSGIFVYLSSSSGGSSSFDRFASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEIKD
250 260 270 280 290 300
300
pF1KE5 AMKKLWRRDLISSST
:.:.: .:
NP_001 ALKRLQKRKCC
310
>>XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
initn: 814 init1: 581 opt: 814 Z-score: 904.5 bits: 175.5 E(85289): 1.2e-43
Smith-Waterman score: 814; 41.0% identity (73.1% similar) in 305 aa overlap (7-307:9-313)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MEPRKNVTDFVLLGFTQNPKEQKVLFVMFLLFYILTMVGNLLIVVTVTVSETLGSPMY
:..:.:::.... . :::.::..:..:..:: :::. . .. : .:::
XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 FFLAGLSFIDIIYSSSISPRLISGLFFGNNSISFQSCMAQLFIEHLFGGSEVFLLLVMAY
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XP_011 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 DCYVAICKPLHYLVIMRQWVCVLLLVVSWVGGFLHSVFQLSIIYGLPFCGPNVIDHFFCD
: :::.: :.: .::. .:. : ..:::.::. : : .: . ::.: . :::. :.
XP_011 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 MYPLLKLVCTDTHAIGLLVVANGGLACTIVFLLLLISYGVILHS-LKNLSQKGRQKALST
. ...:.:.:: . . ..... . : :.:.:: :. . :: :..::.::. :
XP_011 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CSSHMTVVVFFFVPCIFMYARPARTFPI--DKSVSVFYTVITPMLNPLIYTLRNSEMTSA
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XP_011 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA
250 260 270 280 290 300
300
pF1KE5 MKKL-WRRDLISSST
.:: :. . ..:
XP_011 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
>>XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
initn: 814 init1: 581 opt: 814 Z-score: 904.5 bits: 175.5 E(85289): 1.2e-43
Smith-Waterman score: 814; 41.0% identity (73.1% similar) in 305 aa overlap (7-307:9-313)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MEPRKNVTDFVLLGFTQNPKEQKVLFVMFLLFYILTMVGNLLIVVTVTVSETLGSPMY
:..:.:::.... . :::.::..:..:..:: :::. . .. : .:::
XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 FFLAGLSFIDIIYSSSISPRLISGLFFGNNSISFQSCMAQLFIEHLFGGSEVFLLLVMAY
:::..::..:. :..:. :.:.. .. ...: :::: ::::. .:: : :: ::::
XP_011 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 DCYVAICKPLHYLVIMRQWVCVLLLVVSWVGGFLHSVFQLSIIYGLPFCGPNVIDHFFCD
: :::.: :.: .::. .:. : ..:::.::. : : .: . ::.: . :::. :.
XP_011 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 MYPLLKLVCTDTHAIGLLVVANGGLACTIVFLLLLISYGVILHS-LKNLSQKGRQKALST
. ...:.:.:: . . ..... . : :.:.:: :. . :: :..::.::. :
XP_011 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CSSHMTVVVFFFVPCIFMYARPARTFPI--DKSVSVFYTVITPMLNPLIYTLRNSEMTSA
:.::.:::.. . :: : .: . . .: ::::...::::::.::.:::.:. .:
XP_011 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA
250 260 270 280 290 300
300
pF1KE5 MKKL-WRRDLISSST
.:: :. . ..:
XP_011 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
309 residues in 1 query sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]