Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5462
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5462, 309 aa
1>>>pF1KE5462 309 - 309 aa - 309 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8915+/-0.00121; mu= 12.1995+/- 0.071
mean_var=132.9408+/-42.733, 0's: 0 Z-trim(102.3): 384 B-trim: 399 in 1/46
Lambda= 0.111236
statistics sampled from 6456 (6907) to 6456 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.553), E-opt: 0.2 (0.212), width: 16
Scan time: 2.430
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31490.1 OR4A47 gene_id:403253|Hs108|chr11 ( 309) 2034 338.6 3.5e-93
CCDS31500.1 OR4A15 gene_id:81328|Hs108|chr11 ( 344) 1387 234.9 6.8e-62
CCDS73289.1 OR4A5 gene_id:81318|Hs108|chr11 ( 315) 1358 230.2 1.6e-60
CCDS31496.1 OR4C12 gene_id:283093|Hs108|chr11 ( 309) 1309 222.3 3.7e-58
CCDS31499.1 OR4A16 gene_id:81327|Hs108|chr11 ( 328) 1296 220.2 1.7e-57
CCDS73288.1 OR4C46 gene_id:119749|Hs108|chr11 ( 309) 1288 218.9 3.9e-57
CCDS31495.1 OR4C13 gene_id:283092|Hs108|chr11 ( 309) 1262 214.8 7e-56
CCDS31506.1 OR4C6 gene_id:219432|Hs108|chr11 ( 309) 1243 211.7 5.8e-55
CCDS31489.1 OR4C3 gene_id:256144|Hs108|chr11 ( 329) 1236 210.6 1.3e-54
CCDS31503.1 OR4C11 gene_id:219429|Hs108|chr11 ( 310) 1217 207.5 1e-53
CCDS31505.1 OR4S2 gene_id:219431|Hs108|chr11 ( 311) 1211 206.6 2e-53
CCDS31501.1 OR4C15 gene_id:81309|Hs108|chr11 ( 370) 1207 206.0 3.6e-53
CCDS31485.1 OR4B1 gene_id:119765|Hs108|chr11 ( 309) 1174 200.6 1.2e-51
CCDS31487.1 OR4X1 gene_id:390113|Hs108|chr11 ( 305) 1145 196.0 3.1e-50
CCDS31699.1 OR4D5 gene_id:219875|Hs108|chr11 ( 318) 1131 193.8 1.5e-49
CCDS31504.1 OR4P4 gene_id:81300|Hs108|chr11 ( 312) 1118 191.7 6.4e-49
CCDS31563.1 OR4D11 gene_id:219986|Hs108|chr11 ( 311) 1108 190.0 1.9e-48
CCDS42365.1 OR4D1 gene_id:26689|Hs108|chr17 ( 310) 1098 188.4 5.9e-48
CCDS31488.1 OR4S1 gene_id:256148|Hs108|chr11 ( 309) 1091 187.3 1.3e-47
CCDS32020.1 OR4Q3 gene_id:441669|Hs108|chr14 ( 313) 1077 185.1 6.1e-47
CCDS31564.1 OR4D9 gene_id:390199|Hs108|chr11 ( 314) 1073 184.4 9.5e-47
CCDS41916.1 OR4E2 gene_id:26686|Hs108|chr14 ( 313) 1067 183.5 1.9e-46
CCDS53636.1 OR4D10 gene_id:390197|Hs108|chr11 ( 311) 1061 182.5 3.6e-46
CCDS32030.1 OR4K17 gene_id:390436|Hs108|chr14 ( 343) 1041 179.3 3.5e-45
CCDS32026.1 OR4K15 gene_id:81127|Hs108|chr14 ( 348) 1021 176.1 3.3e-44
CCDS32027.1 OR4K14 gene_id:122740|Hs108|chr14 ( 310) 1015 175.1 6e-44
CCDS31562.1 OR4D6 gene_id:219983|Hs108|chr11 ( 314) 1013 174.8 7.5e-44
CCDS32022.1 OR4N2 gene_id:390429|Hs108|chr14 ( 307) 1008 174.0 1.3e-43
CCDS32688.1 OR4D2 gene_id:124538|Hs108|chr17 ( 307) 1008 174.0 1.3e-43
CCDS32172.1 OR4M2 gene_id:390538|Hs108|chr15 ( 313) 1007 173.8 1.5e-43
CCDS32343.1 OR4F4 gene_id:26682|Hs108|chr15 ( 305) 1002 173.0 2.5e-43
CCDS32021.1 OR4M1 gene_id:441670|Hs108|chr14 ( 313) 1002 173.0 2.6e-43
CCDS32031.1 OR4N5 gene_id:390437|Hs108|chr14 ( 308) 998 172.4 3.9e-43
CCDS32854.1 OR4F17 gene_id:81099|Hs108|chr19 ( 305) 997 172.2 4.4e-43
CCDS32023.1 OR4K2 gene_id:390431|Hs108|chr14 ( 314) 994 171.8 6.2e-43
CCDS30547.1 OR4F5 gene_id:79501|Hs108|chr1 ( 305) 987 170.6 1.3e-42
CCDS32025.1 OR4K1 gene_id:79544|Hs108|chr14 ( 311) 980 169.5 2.9e-42
CCDS32028.1 OR4K13 gene_id:390433|Hs108|chr14 ( 304) 974 168.5 5.6e-42
CCDS32173.1 OR4N4 gene_id:283694|Hs108|chr15 ( 316) 968 167.6 1.1e-41
CCDS32029.1 OR4L1 gene_id:122742|Hs108|chr14 ( 312) 960 166.3 2.7e-41
CCDS32341.1 OR4F6 gene_id:390648|Hs108|chr15 ( 312) 959 166.1 3e-41
CCDS32024.1 OR4K5 gene_id:79317|Hs108|chr14 ( 323) 958 166.0 3.5e-41
CCDS32342.1 OR4F15 gene_id:390649|Hs108|chr15 ( 312) 940 163.1 2.5e-40
CCDS41221.1 OR4F16 gene_id:81399|Hs108|chr1 ( 312) 938 162.8 3.2e-40
CCDS43415.1 OR4F3 gene_id:26683|Hs108|chr5 ( 312) 938 162.8 3.2e-40
CCDS72675.1 OR4F29 gene_id:729759|Hs108|chr1 ( 312) 938 162.8 3.2e-40
CCDS34792.1 OR4F21 gene_id:441308|Hs108|chr8 ( 312) 935 162.3 4.4e-40
CCDS31703.1 OR10G9 gene_id:219870|Hs108|chr11 ( 311) 899 156.5 2.4e-38
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 898 156.4 2.7e-38
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 894 155.7 4.2e-38
>>CCDS31490.1 OR4A47 gene_id:403253|Hs108|chr11 (309 aa)
initn: 2034 init1: 2034 opt: 2034 Z-score: 1786.3 bits: 338.6 E(32554): 3.5e-93
Smith-Waterman score: 2034; 99.4% identity (100.0% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MEPRKNVTDFVLLGFTQNPKEQKVLFVMFLLFYILTMVGNLLIVVTVTVSETLGSPMYFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MEPRKNVTDFVLLGFTQNPKEQKVLFVMFLLFYILTMVGNLLIVVTVTVSETLGSPMYFF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LAGLSFIDIIYSSSISPRLISGLFFGNNSISFQSCMAQLFIEHLFGGSEVFLLLVMAYDC
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::
CCDS31 LAGLSFIDIIYSSSISPRLISGLFFGNNSISFQSCMAQLFIEHIFGGSEVFLLLVMAYDC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 YVAICKPLHYLVIMRQWVCVLLLVVSWVGGFLHSVFQLSIIYGLPFCGPNVIDHFFCDMY
::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 YVAICKPLHYLVIMRQWVCVVLLVVSWVGGFLHSVFQLSIIYGLPFCGPNVIDHFFCDMY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 PLLKLVCTDTHAIGLLVVANGGLACTIVFLLLLISYGVILHSLKNLSQKGRQKALSTCSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PLLKLVCTDTHAIGLLVVANGGLACTIVFLLLLISYGVILHSLKNLSQKGRQKALSTCSS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 HMTVVVFFFVPCIFMYARPARTFPIDKSVSVFYTVITPMLNPLIYTLRNSEMTSAMKKLW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 HMTVVVFFFVPCIFMYARPARTFPIDKSVSVFYTVITPMLNPLIYTLRNSEMTSAMKKLW
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 RRDLISSST
:::::::::
CCDS31 RRDLISSST
>>CCDS31500.1 OR4A15 gene_id:81328|Hs108|chr11 (344 aa)
initn: 1432 init1: 1378 opt: 1387 Z-score: 1224.6 bits: 234.9 E(32554): 6.8e-62
Smith-Waterman score: 1387; 63.6% identity (89.4% similar) in 302 aa overlap (1-302:31-332)
10 20 30
pF1KE5 MEPRKNVTDFVLLGFTQNPKEQKVLFVMFL
:. ..:::.:.:::.::::. :::::: ::
CCDS31 MELLTNNLKFITDPFVCRLRHLSPTPSEEHMKNKNNVTEFILLGLTQNPEGQKVLFVTFL
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE5 LFYILTMVGNLLIVVTVTVSETLGSPMYFFLAGLSFIDIIYSSSISPRLISGLFFGNNSI
:.:..:..:::::.::. .:..::::::::::.::::: .::....:..: :. ...:
CCDS31 LIYMVTIMGNLLIIVTIMASQSLGSPMYFFLASLSFIDTVYSTAFAPKMIVDLLSEKKTI
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE5 SFQSCMAQLFIEHLFGGSEVFLLLVMAYDCYVAICKPLHYLVIMRQWVCVLLLVVSWVGG
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CCDS31 SFQGCMAQLFMDHLFAGAEVILLVVMAYDRYMAICKPLHELITMNRRVCVLMLLAAWIGG
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KE5 FLHSVFQLSIIYGLPFCGPNVIDHFFCDMYPLLKLVCTDTHAIGLLVVANGGLACTIVFL
::::. :. .:: ::::::::::.:.::.::::::.::.:.. :: ..:::: :...:.
CCDS31 FLHSLVQFLFIYQLPFCGPNVIDNFLCDLYPLLKLACTNTYVTGLSMIANGGAICAVTFF
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KE5 LLLISYGVILHSLKNLSQKGRQKALSTCSSHMTVVVFFFVPCIFMYARPARTFPIDKSVS
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CCDS31 TILLSYGVILHSLKTQSLEGKRKAFYTCASHVTVVILFFVPCIFLYARPNSTFPIDKSMT
250 260 270 280 290 300
280 290 300
pF1KE5 VFYTVITPMLNPLIYTLRNSEMTSAMKKLWRRDLISSST
: : ::::::::::::.:.:: :::.::: .
CCDS31 VVLTFITPMLNPLIYTLKNAEMKSAMRKLWSKKVSLAGKWLYHS
310 320 330 340
>>CCDS73289.1 OR4A5 gene_id:81318|Hs108|chr11 (315 aa)
initn: 717 init1: 717 opt: 1358 Z-score: 1199.9 bits: 230.2 E(32554): 1.6e-60
Smith-Waterman score: 1358; 66.8% identity (85.9% similar) in 304 aa overlap (1-304:1-303)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MEPRKNVTDFVLLGFTQNPKEQKVLFVMFLLFYILTMVGNLLIVVTVTVSETLGSPMYFF
:. .:.:.::::::.:.: ::.::::::: :..:.:::::::: . .: .::::::::
CCDS73 MRQNNNITEFVLLGFSQDPGVQKALFVMFLLTYLVTVVGNLLIVVDIIASPSLGSPMYFF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LAGLSFIDIIYSSSISPRLISGLFFGNNSISFQSCMAQLFIEHLFGGSEVFLLLVMAYDC
:: ::::: ::..:::.:: ::: ...::::.::.::::.:.:::.:::::.::: :
CCDS73 LACLSFIDAAYSTTISPKLIVGLFCDKKTISFQGCMGQLFIDHFFGGAEVFLLVVMACDR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 YVAICKPLHYLVIMRQWVCVLLLVVSWVGGFLHSVFQLSIIYGLPFCGPNVIDHFFCDMY
:::::::::::.:: . :: :::::. .:::.::.::. ..:.::::::::: :: :::.
CCDS73 YVAICKPLHYLTIMNRQVCFLLLVVAMIGGFVHSAFQI-VVYSLPFCGPNVIVHFSCDMH
130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 PLLKLVCTDTHAIGLLVVANGGLACTIVFLLLLISYGVILHSLKNLSQKGRQKALSTCSS
:::.:.::::. ::: ::.:.: : ..: :::::::::: :::. ::. : ::::::::
CCDS73 PLLELACTDTYFIGLTVVVNSGAICMVIFNLLLISYGVILSSLKTYSQEKRGKALSTCSS
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 HMTVVVFFFVPCIFMYARPARTFPIDKSVSVFYTVITPMLNPLIYTLRNSEMTSAMKKLW
::::.:::::::.:.::. .:: :: ..::::.:: ::.::::::::::: .:..::
CCDS73 GSTVVVLFFVPCIFIYVRPVSNFPTDKFMTVFYTIITHMLSPLIYTLRNSEMRNAIEKLL
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 RRDLISSST
. :
CCDS73 GKKLTIFIIGGVSVLM
300 310
>>CCDS31496.1 OR4C12 gene_id:283093|Hs108|chr11 (309 aa)
initn: 1309 init1: 1309 opt: 1309 Z-score: 1157.5 bits: 222.3 E(32554): 3.7e-58
Smith-Waterman score: 1309; 60.1% identity (86.4% similar) in 308 aa overlap (1-308:1-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MEPRKNVTDFVLLGFTQNPKEQKVLFVMFLLFYILTMVGNLLIVVTVTVSETLGSPMYFF
:: .::::.:.:.:.:::: .:: ::.::..:..:. ::::::::.:.:..:.::::::
CCDS31 MEKKKNVTEFILIGLTQNPIMEKVTFVVFLVLYMITLSGNLLIVVTITTSQALSSPMYFF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LAGLSFIDIIYSSSISPRLISGLFFGNNSISFQSCMAQLFIEHLFGGSEVFLLLVMAYDC
:. ::.:: .:::: .:.:: : .. :::..:::: . ::.::..:..:: ::: ::
CCDS31 LTHLSLIDTVYSSSSAPKLIVDSFQEKKIISFNGCMAQAYAEHIFGATEIILLTVMACDC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 YVAICKPLHYLVIMRQWVCVLLLVVSWVGGFLHSVFQLSIIYGLPFCGPNVIDHFFCDMY
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CCDS31 YVAICKPLNYTTIMSHSLCILLVAVAWVGGFLHATIQILFTVWLPFCGPNVIGHFMCDLY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 PLLKLVCTDTHAIGLLVVANGGLACTIVFLLLLISYGVILHSLKNLSQKGRQKALSTCSS
::::::: :::..::.:..:.:. : . ::.:..:: .::.:::: : .:: :::::: :
CCDS31 PLLKLVCIDTHTLGLFVAVNSGFICLLNFLILVVSYVIILRSLKNNSLEGRCKALSTCIS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 HMTVVVFFFVPCIFMYARPARTFPIDKSVSVFYTVITPMLNPLIYTLRNSEMTSAMKKLW
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CCDS31 HIIVVVLFFVPCIFVYLRSVTTLPIDKAVAVFYTMVVPMLNPVVYTLRNAEVKSAIRKLW
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 RRDLISSST
:. . :..
CCDS31 RKKVTSDND
>>CCDS31499.1 OR4A16 gene_id:81327|Hs108|chr11 (328 aa)
initn: 1296 init1: 1296 opt: 1296 Z-score: 1145.9 bits: 220.2 E(32554): 1.7e-57
Smith-Waterman score: 1296; 64.3% identity (85.7% similar) in 300 aa overlap (1-300:1-300)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MEPRKNVTDFVLLGFTQNPKEQKVLFVMFLLFYILTMVGNLLIVVTVTVSETLGSPMYFF
:.: .:::.:::::.::.: .:.:::::::.::.:::::::: ::. : .::: ::::
CCDS31 MRPSSNVTEFVLLGLTQDPDVKKTLFVMFLLIYIVTMVGNLLIWVTTIGSPSLGSLMYFF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LAGLSFIDIIYSSSISPRLISGLFFGNNSISFQSCMAQLFIEHLFGGSEVFLLLVMAYDC
:: ::..: :::...::.:. :. . .::...::.:::::::.::.:::::.:::::
CCDS31 LAYLSLMDAIYSTAMSPKLMIDLLCDKIAISLSACMGQLFIEHLLGGAEVFLLVVMAYDR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 YVAICKPLHYLVIMRQWVCVLLLVVSWVGGFLHSVFQLSIIYGLPFCGPNVIDHFFCDMY
:::: :::::: :: . ::.:::::. .:::.::: :. ..:.::.:::::::: ::::
CCDS31 YVAISKPLHYLNIMNRLVCILLLVVAMIGGFVHSVVQIVFLYSLPICGPNVIDHSVCDMY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 PLLKLVCTDTHAIGLLVVANGGLACTIVFLLLLISYGVILHSLKNLSQKGRQKALSTCSS
:::.:.: ::. ::: ::::::. : ..: .:::: ::::. ::. ::. :.::: :: :
CCDS31 PLLELLCLDTYFIGLTVVANGGIICMVIFTFLLISCGVILNFLKTYSQEERHKALPTCIS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 HMTVVVFFFVPCIFMYARPARTFPIDKSVSVFYTVITPMLNPLIYTLRNSEMTSAMKKLW
:. ::.. ::::::::.::. .::.:: ..:::..:: :::::::.::.::: .:::.::
CCDS31 HIIVVALVFVPCIFMYVRPVSNFPFDKLMTVFYSIITLMLNPLIYSLRQSEMKNAMKNLW
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 RRDLISSST
CCDS31 CEKLSIVRKRVSPTLNIFIPSSKATNRR
310 320
>>CCDS73288.1 OR4C46 gene_id:119749|Hs108|chr11 (309 aa)
initn: 1288 init1: 1288 opt: 1288 Z-score: 1139.3 bits: 218.9 E(32554): 3.9e-57
Smith-Waterman score: 1288; 61.4% identity (85.9% similar) in 306 aa overlap (1-306:1-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MEPRKNVTDFVLLGFTQNPKEQKVLFVMFLLFYILTMVGNLLIVVTVTVSETLGSPMYFF
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CCDS73 HITVVILFFVPCIFVYMRPAATLPIDKAVAIFYTMITPMLNPLIYTLKNAQMKNAIRKLC
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CCDS31 LAYLSFIDACYSSVNTPKLITDSLYENKTILFNGCMTQVFGEHFFRGVEVILLTVMAYDH
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CCDS31 HITVVILSFIPCIFVYMRPPATLPIDKAVAVFYTMITSMLNPLIYTLRNAQMKNAIRKLC
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: :::
CCDS31 SRKAISSVK
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CCDS31 MENQNNVTEFILLGLTENLELWKIFSAVFLVMYVATVLENLLIVVTIITSQSLRSPMYFF
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CCDS31 YVAICKPLHYTIIMSPRVCCLMVGGAWVGGFMHAMIQLLFMYQIPFCGPNIIDHFICDLF
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CCDS31 QLLTLACTDTHILGLLVTLNSGMMCVAIFLILIASYTVILCSLKSYSSKGRHKALSTCSS
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.
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CCDS31 VVTVCGNMLIVVTITSSPTLASPVYFFLANLSFIDTFYSSSMAPKLIADSLYEGRTISYE
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CCDS31 SLVQLLLVLWLPFCGPNVINHFACDLYPLLEVACTNTYVIGLLVVANSGLICLLNFLMLA
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CCDS31 HGKIISENKG
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]