Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5461
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5461, 309 aa
1>>>pF1KE5461 309 - 309 aa - 309 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9236+/-0.00147; mu= 12.7700+/- 0.086
mean_var=208.5512+/-72.795, 0's: 0 Z-trim(100.8): 418 B-trim: 356 in 1/46
Lambda= 0.088811
statistics sampled from 5765 (6271) to 5765 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.528), E-opt: 0.2 (0.193), width: 16
Scan time: 1.560
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31827.1 OR6C4 gene_id:341418|Hs108|chr12 ( 309) 1991 268.9 3.6e-72
CCDS58241.1 OR2AP1 gene_id:121129|Hs108|chr12 ( 309) 1663 226.8 1.6e-59
CCDS31816.1 OR6C74 gene_id:254783|Hs108|chr12 ( 312) 1458 200.6 1.3e-51
CCDS31823.1 OR6C76 gene_id:390326|Hs108|chr12 ( 312) 1445 198.9 4.1e-51
CCDS31819.1 OR6C3 gene_id:254786|Hs108|chr12 ( 311) 1443 198.7 4.9e-51
CCDS31820.1 OR6C75 gene_id:390323|Hs108|chr12 ( 312) 1440 198.3 6.5e-51
CCDS31824.1 OR6C2 gene_id:341416|Hs108|chr12 ( 312) 1415 195.1 5.9e-50
CCDS31821.1 OR6C65 gene_id:403282|Hs108|chr12 ( 312) 1379 190.5 1.5e-48
CCDS31818.1 OR6C1 gene_id:390321|Hs108|chr12 ( 312) 1373 189.7 2.5e-48
CCDS31826.2 OR6C68 gene_id:403284|Hs108|chr12 ( 312) 1365 188.7 5e-48
CCDS31817.1 OR6C6 gene_id:283365|Hs108|chr12 ( 314) 1359 187.9 8.6e-48
CCDS31825.1 OR6C70 gene_id:390327|Hs108|chr12 ( 312) 1353 187.1 1.5e-47
CCDS31696.1 OR6M1 gene_id:390261|Hs108|chr11 ( 313) 1022 144.7 8.6e-35
CCDS31695.1 OR6X1 gene_id:390260|Hs108|chr11 ( 312) 980 139.3 3.6e-33
CCDS31700.1 OR6T1 gene_id:219874|Hs108|chr11 ( 323) 975 138.7 5.7e-33
CCDS32038.1 OR6S1 gene_id:341799|Hs108|chr14 ( 331) 955 136.2 3.4e-32
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 932 133.2 2.6e-31
CCDS31095.1 OR6F1 gene_id:343169|Hs108|chr1 ( 308) 931 133.0 2.8e-31
CCDS47728.1 OR6V1 gene_id:346517|Hs108|chr7 ( 313) 923 132.0 5.6e-31
CCDS32033.1 OR11H6 gene_id:122748|Hs108|chr14 ( 330) 921 131.8 6.9e-31
CCDS34364.1 OR10C1 gene_id:442194|Hs108|chr6 ( 312) 912 130.6 1.5e-30
CCDS1634.2 OR2C3 gene_id:81472|Hs108|chr1 ( 320) 911 130.5 1.7e-30
CCDS31709.1 OR8B3 gene_id:390271|Hs108|chr11 ( 313) 909 130.2 2e-30
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 903 129.5 3.4e-30
CCDS7773.1 OR10A5 gene_id:144124|Hs108|chr11 ( 317) 902 129.4 3.7e-30
CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 ( 309) 899 129.0 4.7e-30
CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 898 128.8 5.2e-30
CCDS32032.1 OR11G2 gene_id:390439|Hs108|chr14 ( 345) 898 128.9 5.5e-30
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 896 128.6 6.2e-30
CCDS43661.1 OR9A4 gene_id:130075|Hs108|chr7 ( 314) 895 128.4 6.8e-30
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 894 128.3 7.4e-30
CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11 ( 330) 893 128.2 8.3e-30
CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1 ( 312) 890 127.8 1.1e-29
CCDS53629.1 OR5M11 gene_id:219487|Hs108|chr11 ( 305) 887 127.4 1.4e-29
CCDS31098.1 OR11L1 gene_id:391189|Hs108|chr1 ( 322) 884 127.1 1.8e-29
CCDS31708.1 OR8B2 gene_id:26595|Hs108|chr11 ( 313) 882 126.8 2.2e-29
CCDS8446.1 OR8B8 gene_id:26493|Hs108|chr11 ( 311) 881 126.6 2.3e-29
CCDS31090.1 OR2B11 gene_id:127623|Hs108|chr1 ( 317) 881 126.7 2.4e-29
CCDS31415.1 OR10A2 gene_id:341276|Hs108|chr11 ( 303) 880 126.5 2.5e-29
CCDS7774.1 OR10A4 gene_id:283297|Hs108|chr11 ( 315) 880 126.5 2.6e-29
CCDS31710.1 OR8B4 gene_id:283162|Hs108|chr11 ( 309) 879 126.4 2.8e-29
CCDS53391.1 OR6P1 gene_id:128366|Hs108|chr1 ( 317) 879 126.4 2.8e-29
CCDS35087.1 OR13F1 gene_id:138805|Hs108|chr9 ( 319) 879 126.4 2.8e-29
CCDS32936.1 OR7A10 gene_id:390892|Hs108|chr19 ( 309) 878 126.3 3.1e-29
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 878 126.3 3.1e-29
CCDS35130.2 OR1L6 gene_id:392390|Hs108|chr9 ( 311) 876 126.0 3.7e-29
CCDS32896.1 OR1M1 gene_id:125963|Hs108|chr19 ( 313) 875 125.9 4e-29
CCDS31541.1 OR6Q1 gene_id:219952|Hs108|chr11 ( 317) 875 125.9 4e-29
CCDS31518.1 OR8H2 gene_id:390151|Hs108|chr11 ( 312) 874 125.8 4.4e-29
CCDS4642.1 OR2B6 gene_id:26212|Hs108|chr6 ( 313) 874 125.8 4.4e-29
>>CCDS31827.1 OR6C4 gene_id:341418|Hs108|chr12 (309 aa)
initn: 1991 init1: 1991 opt: 1991 Z-score: 1409.2 bits: 268.9 E(32554): 3.6e-72
Smith-Waterman score: 1991; 99.7% identity (100.0% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MKNRTMFGEFILLGLTNQPELQVMIFIFLFLTYMLSVLGNLTIITLTLLDPHLQTPMYFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::
CCDS31 MKNRTMFGEFILLGLTNQPELQVMIFIFLFLTYMLSILGNLTIITLTLLDPHLQTPMYFF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LRNFSFLEISFTSIFIPRFLTSMTTGNKVISFAGCLTQYFFAIFLGATEFYLLASMSYDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LRNFSFLEISFTSIFIPRFLTSMTTGNKVISFAGCLTQYFFAIFLGATEFYLLASMSYDR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 YVAICKPLHYLTIMSSRVCIQLVFCSWLGGFLAILPPIILMTQVDFCVSNILNHYYCDYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 YVAICKPLHYLTIMSSRVCIQLVFCSWLGGFLAILPPIILMTQVDFCVSNILNHYYCDYG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 PLVELACSDTSLLELMVILLAVVTLMVTLVLVTLSYTYIIRTILRIPSAQQRTKAFSTCS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PLVELACSDTSLLELMVILLAVVTLMVTLVLVTLSYTYIIRTILRIPSAQQRTKAFSTCS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SHMIVISLSYGSCMFMYINPSAKEGGAFNKGIAVLITSVTPLLNPFIYTLRNQQVKQAFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SHMIVISLSYGSCMFMYINPSAKEGGAFNKGIAVLITSVTPLLNPFIYTLRNQQVKQAFK
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 DSVKKIVKL
:::::::::
CCDS31 DSVKKIVKL
>>CCDS58241.1 OR2AP1 gene_id:121129|Hs108|chr12 (309 aa)
initn: 1682 init1: 1663 opt: 1663 Z-score: 1182.0 bits: 226.8 E(32554): 1.6e-59
Smith-Waterman score: 1663; 79.9% identity (93.2% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MKNRTMFGEFILLGLTNQPELQVMIFIFLFLTYMLSVLGNLTIITLTLLDPHLQTPMYFF
:::.:.. ::::::::. ::::: .: ::::.:.::.::::::. ::::: :::::::::
CCDS58 MKNKTVLTEFILLGLTDVPELQVAVFTFLFLAYLLSILGNLTILILTLLDSHLQTPMYFF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LRNFSFLEISFTSIFIPRFLTSMTTGNKVISFAGCLTQYFFAIFLGATEFYLLASMSYDR
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CCDS58 LRNFSFLEISFTNIFIPRVLISITTGNKSISFAGCFTQYFFAMFLGATEFYLLAAMSYDR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 YVAICKPLHYLTIMSSRVCIQLVFCSWLGGFLAILPPIILMTQVDFCVSNILNHYYCDYG
:::::::::: ::::::.::::.:::::::..::.: : ::.: :::.:: ::::.:::
CCDS58 YVAICKPLHYTTIMSSRICIQLIFCSWLGGLMAIIPTITLMSQQDFCASNRLNHYFCDYE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 PLVELACSDTSLLELMVILLAVVTLMVTLVLVTLSYTYIIRTILRIPSAQQRTKAFSTCS
::.::.::::::.: .:.:.: :::.:::::: :::..::.:::..::::::::::::::
CCDS58 PLLELSCSDTSLIEKVVFLVASVTLVVTLVLVILSYAFIIKTILKLPSAQQRTKAFSTCS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SHMIVISLSYGSCMFMYINPSAKEGGAFNKGIAVLITSVTPLLNPFIYTLRNQQVKQAFK
::::::::::::::::::::::::: .::::.:.:::::.::::::::::::::::: ::
CCDS58 SHMIVISLSYGSCMFMYINPSAKEGDTFNKGVALLITSVAPLLNPFIYTLRNQQVKQPFK
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 DSVKKIVKL
: :::...:
CCDS58 DMVKKLLNL
>>CCDS31816.1 OR6C74 gene_id:254783|Hs108|chr12 (312 aa)
initn: 1458 init1: 1458 opt: 1458 Z-score: 1040.0 bits: 200.6 E(32554): 1.3e-51
Smith-Waterman score: 1458; 68.0% identity (91.8% similar) in 306 aa overlap (1-306:1-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MKNRTMFGEFILLGLTNQPELQVMIFIFLFLTYMLSVLGNLTIITLTLLDPHLQTPMYFF
:.:.: ..:::::::..:.:::.::..::.:::::. :::::::::::: ::.::::::
CCDS31 MRNHTTVANFILLGLTDDPQLQVIIFLLLFFTYMLSITGNLTIITLTLLDLHLKTPMYFF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LRNFSFLEISFTSIFIPRFLTSMTTGNKVISFAGCLTQYFFAIFLGATEFYLLASMSYDR
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CCDS31 LRNFSFLEVSFTTVYIPKFLVSMATGDKTISYNDCAAQLFFTILLGATEFFLLAAMSYER
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 YVAICKPLHYLTIMSSRVCIQLVFCSWLGGFLAILPPIILMTQVDFCVSNILNHYYCDYG
:::::::::: :::::::: ::: ::..::: :.::... :.:::..: ..:..:: .
CCDS31 YVAICKPLHYTTIMSSRVCSLLVFASWMAGFLIIFPPLLMGLQLDFCAANTVDHFFCDVS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 PLVELACSDTSLLELMVILLAVVTLMVTLVLVTLSYTYIIRTILRIPSAQQRTKAFSTCS
:...:.:.::...:::..: :..::.:::::: :::: ::::::.:::.::: :::::::
CCDS31 PILQLSCTDTDIIELMMLLSAILTLLVTLVLVILSYTNIIRTILKIPSSQQRKKAFSTCS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SHMIVISLSYGSCMFMYINPSAKEGGAFNKGIAVLITSVTPLLNPFIYTLRNQQVKQAFK
:::.:.:.:::::.:::..::::: ..:::::.: :::.:.::::::::::.:::..::
CCDS31 SHMVVVSISYGSCIFMYVKPSAKERVSLNKGIALLSTSVAPMLNPFIYTLRNKQVKDVFK
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 DSVKKIVKL
.::::
CCDS31 HTVKKIELFSMK
310
>>CCDS31823.1 OR6C76 gene_id:390326|Hs108|chr12 (312 aa)
initn: 1132 init1: 1132 opt: 1445 Z-score: 1031.0 bits: 198.9 E(32554): 4.1e-51
Smith-Waterman score: 1445; 70.3% identity (88.2% similar) in 306 aa overlap (1-306:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MKNRTMFGEFILLGLTNQPELQVMIFIFLFLTYMLSVLGNLTIITLTLLDPHLQTPMYFF
::::: .:::::::..:.:::.:: ::::::.::: ::::::.::::: ::.::::::
CCDS31 MKNRTSVTDFILLGLTDNPQLQVVIFSFLFLTYVLSVTGNLTIISLTLLDSHLKTPMYFF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LRNFSFLEISFTSIFIPRFLTSMTTGNKVISFAGCLTQYFFAIFLGATEFYLLASMSYDR
::::: :::::::. :::: :. ::.: ::. .: .: :: ::::.:::.::::::::
CCDS31 LRNFS-LEISFTSVCNPRFLISILTGDKSISYNACAAQLFFFIFLGSTEFFLLASMSYDC
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 YVAICKPLHYLTIMSSRVCIQLVFCSWLGGFLAILPPIILMTQVDFCVSNILNHYYCDYG
:::::::::: ::::.:.: ::.. :::.:::.:.::. . :.::: ::...:. :: .
CCDS31 YVAICKPLHYTTIMSDRICYQLIISSWLAGFLVIFPPLAMGLQLDFCDSNVIDHFTCDSA
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 PLVELACSDTSLLELMVILLAVVTLMVTLVLVTLSYTYIIRTILRIPSAQQRTKAFSTCS
::....:.::: :::: ..::. ::. ::.:: ::::::::::::::::::: :::::::
CCDS31 PLLQISCTDTSTLELMSFILALFTLISTLILVILSYTYIIRTILRIPSAQQRKKAFSTCS
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SHMIVISLSYGSCMFMYINPSAKEGGAFNKGIAVLITSVTPLLNPFIYTLRNQQVKQAFK
::.::.:.:::::.:::.. ::::: :..::.:.: :::.:.::::::::::::::::::
CCDS31 SHVIVVSISYGSCIFMYVKTSAKEGVALTKGVAILNTSVAPMLNPFIYTLRNQQVKQAFK
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 DSVKKIVKL
: ..::
CCDS31 DVLRKISHKKKKH
300 310
>>CCDS31819.1 OR6C3 gene_id:254786|Hs108|chr12 (311 aa)
initn: 1495 init1: 1436 opt: 1443 Z-score: 1029.7 bits: 198.7 E(32554): 4.9e-51
Smith-Waterman score: 1443; 67.9% identity (90.2% similar) in 305 aa overlap (3-307:2-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MKNRTMFGEFILLGLTNQPELQVMIFIFLFLTYMLSVLGNLTIITLTLLDPHLQTPMYFF
:.:: ::.::::...:.::..::.:::.::.::: :::::::::..: :::::::::
CCDS31 MNHTMVTEFVLLGLSDDPDLQIVIFLFLFITYILSVTGNLTIITLTFVDSHLQTPMYFF
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LRNFSFLEISFTSIFIPRFLTSMTTGNKVISFAGCLTQYFFAIFLGATEFYLLASMSYDR
::::::::::::.. ::::: .. : ::.::. .: .: :: ::.:.::::.:..:::::
CCDS31 LRNFSFLEISFTTVCIPRFLGAIITRNKTISYNNCAAQLFFFIFMGVTEFYILTAMSYDR
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 YVAICKPLHYLTIMSSRVCIQLVFCSWLGGFLAILPPIILMTQVDFCVSNILNHYYCDYG
:::::::::: .::. ..: ::.:.::.:::.:.::..:. :.:.:.::...:. :::
CCDS31 YVAICKPLHYTSIMNRKLCTLLVLCAWLSGFLTIFPPLMLLLQLDYCASNVIDHFACDYF
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 PLVELACSDTSLLELMVILLAVVTLMVTLVLVTLSYTYIIRTILRIPSAQQRTKAFSTCS
::..:.:::: :::.. . .:.:::. ::.:: ::: ::::::::::::.:: :::::::
CCDS31 PLLQLSCSDTWLLEVIGFYFALVTLLFTLALVILSYMYIIRTILRIPSASQRKKAFSTCS
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SHMIVISLSYGSCMFMYINPSAKEGGAFNKGIAVLITSVTPLLNPFIYTLRNQQVKQAFK
:::::::.:::::.::: :::::: ....::::.: :::.:.::::::::::::::::::
CCDS31 SHMIVISISYGSCIFMYANPSAKEKASLTKGIAILNTSVAPMLNPFIYTLRNQQVKQAFK
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 DSVKKIVKL
. :.:.:
CCDS31 NVVHKVVFYANQ
300 310
>>CCDS31820.1 OR6C75 gene_id:390323|Hs108|chr12 (312 aa)
initn: 1473 init1: 1421 opt: 1440 Z-score: 1027.6 bits: 198.3 E(32554): 6.5e-51
Smith-Waterman score: 1440; 68.7% identity (89.6% similar) in 307 aa overlap (1-307:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MKNRTMFGEFILLGLTNQPELQVMIFIFLFLTYMLSVLGNLTIITLTLLDPHLQTPMYFF
:.: : .:::::::..:. ::..::::..:::::: ::: :::::: :::::::::::
CCDS31 MRNSTAVTDFILLGLTSDPQWQVVLFIFLLVTYMLSVTGNLIIITLTLSDPHLQTPMYFF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LRNFSFLEISFTSIFIPRFLTSMTTGNKVISFAGCLTQYFFAIFLGATEFYLLASMSYDR
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CCDS31 PMLQLSCTNTHFLELMAFFLAVVTLMVTLTLVILSYTNIIRTILKIPSMSQRKKAFSTCS
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CCDS31 SHMIVVSISYSSCIFMYIKTSARERVTLSKGVAVLNTSVAPLLNPFIYTLRNKQVKQAFK
250 260 270 280 290 300
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310
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CCDS31 MKNHTVIRTFILLGLTGDPHLQVLLFIFLFLTYMLSVTGNLTIITLTLVDHHLKTPMYFF
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CCDS31 YVAICKPLHYVVIMNNRVCTLLVLCCWVAGLMIIVPPLSLGLQLEFCDSNAIDHFSCDAG
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CCDS31 PLLKISCSDTWVIEQMVILMAVFALIITLVCVILSYLYIVRTILKFPSVQQRKKAFSTCS
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CCDS31 SHMIVVSIAYGSCIFIYIKPSAKDEVAINKGVSVLTTSVAPLLNPFIYTLRNKQVKQAFS
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CCDS31 DSIKRIAFLSKK
310
>>CCDS31821.1 OR6C65 gene_id:403282|Hs108|chr12 (312 aa)
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CCDS31 MPNMTSIREFILLGFTDNPELQVVIFFFMLITYLLSVSGNMIIIMLTLSNIHLKTPMYFF
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CCDS31 LRNFSFLEISFTTVFIPRFLINIATGDTTISYNASMAQVFFLILLGSTEFFLLAVMSYDR
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CCDS31 YVAICKPLHYTTIMSNKVCNWLVISSWLAGFLIIFPPVIMGLQLDFCDSSTIDHFICDSS
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CCDS31 PMLLIACTDTQFLELMAFLLAVFTLMVTLALVVLSYTLILKTILKIPSAQQRKKAFSTCS
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CCDS31 SHMIVVSVSYGSCIFMCVKTSAKEGMALSKGVAVLNTSVAPMLNPFIYTLRNQQVKQALR
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pF1KE5 DSVKKIVKL
. .:::..:
CCDS31 EFTKKILSLNKQ
310
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CCDS31 LRNFSILEISFTTVSIPKFLGNIISGDKTISFNNCIVQLFFFILLGVTEFYLLAAMSYDR
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CCDS31 YVAICKPLHCLSIMNRRVCTLLVFTSWLVSFLIIFPALMLLLKLHYCRSNIIDHFTCDYF
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CCDS31 PLLQLACSDTKFLEVMGFSCAAFTLMFTLALIFLSYIYIIRTILRIPSTSQRTKAFSTCS
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CCDS31 NMARKTVFFTST
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CCDS31 LQNLSFLEISFTATCVPRFLYSISTGNKIITYNACVIQLFFADLFGVTEFFLLATMSYDR
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CCDS31 PILKIPCSDTSLIEQMVVASAVLTFIITLVCVVLSYTYIIRTILKFPSVQQKKKAFSTCS
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]