Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5459
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5459, 315 aa
1>>>pF1KE5459 315 - 315 aa - 315 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7232+/-0.00116; mu= 13.1747+/- 0.067
mean_var=189.7735+/-68.740, 0's: 0 Z-trim(103.4): 396 B-trim: 418 in 1/46
Lambda= 0.093101
statistics sampled from 6884 (7373) to 6884 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.569), E-opt: 0.2 (0.226), width: 16
Scan time: 2.290
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11023.1 OR3A1 gene_id:4994|Hs108|chr17 ( 315) 2062 290.3 1.3e-78
CCDS42233.1 OR3A2 gene_id:4995|Hs108|chr17 ( 321) 1725 245.1 5.5e-65
CCDS11025.1 OR3A3 gene_id:8392|Hs108|chr17 ( 321) 1642 233.9 1.2e-61
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 981 145.2 6.6e-35
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 950 141.0 1.2e-33
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 928 138.0 9.1e-33
CCDS10496.1 OR1F1 gene_id:4992|Hs108|chr16 ( 312) 923 137.4 1.4e-32
CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 ( 308) 919 136.8 2.1e-32
CCDS35122.1 OR1J4 gene_id:26219|Hs108|chr9 ( 313) 917 136.5 2.5e-32
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 913 136.0 3.7e-32
CCDS31711.1 OR8B12 gene_id:219858|Hs108|chr11 ( 310) 912 135.9 4e-32
CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11 ( 327) 910 135.6 5e-32
CCDS35121.1 OR1J2 gene_id:26740|Hs108|chr9 ( 313) 903 134.7 9.3e-32
CCDS41481.1 OR1C1 gene_id:26188|Hs108|chr1 ( 314) 902 134.5 1e-31
CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6 ( 357) 900 134.4 1.3e-31
CCDS31094.1 OR13G1 gene_id:441933|Hs108|chr1 ( 307) 897 133.8 1.6e-31
CCDS43670.1 OR2A12 gene_id:346525|Hs108|chr7 ( 310) 896 133.7 1.8e-31
CCDS35120.1 OR1J1 gene_id:347168|Hs108|chr9 ( 322) 896 133.7 1.8e-31
CCDS32896.1 OR1M1 gene_id:125963|Hs108|chr19 ( 313) 894 133.5 2.1e-31
CCDS31698.1 OR8D4 gene_id:338662|Hs108|chr11 ( 314) 894 133.5 2.2e-31
CCDS6844.1 OR1N1 gene_id:138883|Hs108|chr9 ( 311) 890 132.9 3.1e-31
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 890 132.9 3.1e-31
CCDS32901.1 OR7D4 gene_id:125958|Hs108|chr19 ( 312) 888 132.6 3.7e-31
CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11 ( 311) 886 132.4 4.5e-31
CCDS35123.1 OR1N2 gene_id:138882|Hs108|chr9 ( 330) 886 132.4 4.7e-31
CCDS12319.1 OR7A17 gene_id:26333|Hs108|chr19 ( 309) 885 132.2 4.9e-31
CCDS43668.1 OR2A5 gene_id:393046|Hs108|chr7 ( 311) 884 132.1 5.4e-31
CCDS31709.1 OR8B3 gene_id:390271|Hs108|chr11 ( 313) 884 132.1 5.4e-31
CCDS43673.1 OR2A1 gene_id:346528|Hs108|chr7 ( 310) 882 131.8 6.5e-31
CCDS56515.1 OR2A42 gene_id:402317|Hs108|chr7 ( 310) 882 131.8 6.5e-31
CCDS8446.1 OR8B8 gene_id:26493|Hs108|chr11 ( 311) 882 131.8 6.5e-31
CCDS53630.1 OR5M10 gene_id:390167|Hs108|chr11 ( 315) 882 131.8 6.6e-31
CCDS32936.1 OR7A10 gene_id:390892|Hs108|chr19 ( 309) 880 131.6 7.9e-31
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 879 131.5 8.8e-31
CCDS32937.1 OR1I1 gene_id:126370|Hs108|chr19 ( 355) 877 131.3 1.1e-30
CCDS4642.1 OR2B6 gene_id:26212|Hs108|chr6 ( 313) 876 131.0 1.1e-30
CCDS30906.1 OR6N2 gene_id:81442|Hs108|chr1 ( 317) 875 130.9 1.3e-30
CCDS43671.1 OR2A2 gene_id:442361|Hs108|chr7 ( 318) 875 130.9 1.3e-30
CCDS43669.1 OR2A25 gene_id:392138|Hs108|chr7 ( 310) 874 130.8 1.4e-30
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 873 130.6 1.5e-30
CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 ( 309) 870 130.2 2e-30
CCDS12318.1 OR7A5 gene_id:26659|Hs108|chr19 ( 319) 870 130.2 2e-30
CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11 ( 330) 870 130.3 2.1e-30
CCDS32047.1 OR10G2 gene_id:26534|Hs108|chr14 ( 310) 869 130.1 2.2e-30
CCDS31522.1 OR5J2 gene_id:282775|Hs108|chr11 ( 312) 869 130.1 2.2e-30
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 869 130.1 2.2e-30
CCDS34364.1 OR10C1 gene_id:442194|Hs108|chr6 ( 312) 868 130.0 2.4e-30
CCDS31708.1 OR8B2 gene_id:26595|Hs108|chr11 ( 313) 868 130.0 2.4e-30
CCDS31099.1 OR2W3 gene_id:343171|Hs108|chr1 ( 314) 867 129.8 2.7e-30
CCDS11024.1 OR1E1 gene_id:8387|Hs108|chr17 ( 314) 866 129.7 2.9e-30
>>CCDS11023.1 OR3A1 gene_id:4994|Hs108|chr17 (315 aa)
initn: 2062 init1: 2062 opt: 2062 Z-score: 1524.9 bits: 290.3 E(32554): 1.3e-78
Smith-Waterman score: 2062; 100.0% identity (100.0% similar) in 315 aa overlap (1-315:1-315)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MQPESGANGTVIAEFILLGLLEAPGLQPVVFVLFLFAYLVTVRGNLSILAAVLVEPKLHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MQPESGANGTVIAEFILLGLLEAPGLQPVVFVLFLFAYLVTVRGNLSILAAVLVEPKLHT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 PMYFFLGNLSVLDVGCISVTVPSMLSRLLSRKRAVPCGACLTQLFFFHLFVGVDCFLLTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PMYFFLGNLSVLDVGCISVTVPSMLSRLLSRKRAVPCGACLTQLFFFHLFVGVDCFLLTA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 MAYDRFLAICRPLTYSTRMSQTVQRMLVAASWACAFTNALTHTVAMSTLNFCGPNVINHF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MAYDRFLAICRPLTYSTRMSQTVQRMLVAASWACAFTNALTHTVAMSTLNFCGPNVINHF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 YCDLPQLFQLSCSSTQLNELLLFAVGFIMAGTPMALIVISYIHVAAAVLRIRSVEGRKKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 YCDLPQLFQLSCSSTQLNELLLFAVGFIMAGTPMALIVISYIHVAAAVLRIRSVEGRKKA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 FSTCGSHLTVVAIFYGSGIFNYMRLGSTKLSDKDKAVGIFNTVINPMLNPIIYSFRNPDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 FSTCGSHLTVVAIFYGSGIFNYMRLGSTKLSDKDKAVGIFNTVINPMLNPIIYSFRNPDV
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 QSAIWRMLTGRRSLA
:::::::::::::::
CCDS11 QSAIWRMLTGRRSLA
310
>>CCDS42233.1 OR3A2 gene_id:4995|Hs108|chr17 (321 aa)
initn: 1725 init1: 1725 opt: 1725 Z-score: 1280.2 bits: 245.1 E(32554): 5.5e-65
Smith-Waterman score: 1725; 81.5% identity (94.6% similar) in 314 aa overlap (1-314:7-320)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MQPESGANGTVIAEFILLGLLEAPGLQPVVFVLFLFAYLVTVRGNLSILAAVLV
:.::.:.: :..::::::::... .:::::::.:::::::. :::::::::::
CCDS42 MSLQKLMEPEAGTNRTAVAEFILLGLVQTEEMQPVVFVLLLFAYLVTTGGNLSILAAVLV
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 EPKLHTPMYFFLGNLSVLDVGCISVTVPSMLSRLLSRKRAVPCGACLTQLFFFHLFVGVD
:::::.:::::::::::::::::.::::.::.::::.: .. :::.:::::::..:.:
CCDS42 EPKLHAPMYFFLGNLSVLDVGCITVTVPAMLGRLLSHKSTISYDACLSQLFFFHLLAGMD
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 CFLLTAMAYDRFLAICRPLTYSTRMSQTVQRMLVAASWACAFTNALTHTVAMSTLNFCGP
:::::::::::.::::.:::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::
CCDS42 CFLLTAMAYDRLLAICQPLTYSTRMSQTVQRMLVAASLACAFTNALTHTVAMSTLNFCGP
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 NVINHFYCDLPQLFQLSCSSTQLNELLLFAVGFIMAGTPMALIVISYIHVAAAVLRIRSV
: .::::::::::::::::::::::::::::::::::::..::. .: ::::::::::::
CCDS42 NEVNHFYCDLPQLFQLSCSSTQLNELLLFAVGFIMAGTPLVLIITAYSHVAAAVLRIRSV
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 EGRKKAFSTCGSHLTVVAIFYGSGIFNYMRLGSTKLSDKDKAVGIFNTVINPMLNPIIYS
::::::::::::::::: .:.: :::::::::: . :::::.::.:::::::::::.:::
CCDS42 EGRKKAFSTCGSHLTVVCLFFGRGIFNYMRLGSEEASDKDKGVGVFNTVINPMLNPLIYS
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 FRNPDVQSAIWRMLTGRRSLA
.::::::.:.:... :::::
CCDS42 LRNPDVQGALWQIFLGRRSLT
310 320
>>CCDS11025.1 OR3A3 gene_id:8392|Hs108|chr17 (321 aa)
initn: 1642 init1: 1642 opt: 1642 Z-score: 1220.0 bits: 233.9 E(32554): 1.2e-61
Smith-Waterman score: 1642; 77.7% identity (94.6% similar) in 314 aa overlap (1-314:7-320)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MQPESGANGTVIAEFILLGLLEAPGLQPVVFVLFLFAYLVTVRGNLSILAAVLV
:.::.:.: :..::::::::... .:::::::.:::::::. :::::::::::
CCDS11 MSLQKLMEPEAGTNRTAVAEFILLGLVQTEEMQPVVFVLLLFAYLVTTGGNLSILAAVLV
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 EPKLHTPMYFFLGNLSVLDVGCISVTVPSMLSRLLSRKRAVPCGACLTQLFFFHLFVGVD
:::::.:::::::::::::::::.::::.::.::::.: .. :::.:::::::..:.:
CCDS11 EPKLHAPMYFFLGNLSVLDVGCITVTVPAMLGRLLSHKSTISYDACLSQLFFFHLLAGMD
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 CFLLTAMAYDRFLAICRPLTYSTRMSQTVQRMLVAASWACAFTNALTHTVAMSTLNFCGP
:::::::::::.::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 CFLLTAMAYDRLLAICQPLTYSTRMSQTVQRMLVAASWACAFTNALTHTVAMSTLNFCGP
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 NVINHFYCDLPQLFQLSCSSTQLNELLLFAVGFIMAGTPMALIVISYIHVAAAVLRIRSV
: .::::::::::::::::::::::::::... .:: .:...: .:: ::.::::.:::.
CCDS11 NEVNHFYCDLPQLFQLSCSSTQLNELLLFVAAAFMAVAPLVFISVSYAHVVAAVLQIRSA
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 EGRKKAFSTCGSHLTVVAIFYGSGIFNYMRLGSTKLSDKDKAVGIFNTVINPMLNPIIYS
:::::::::::::::::.::::.:.:.::::::.. :::::.::.: :::::::::.:::
CCDS11 EGRKKAFSTCGSHLTVVGIFYGTGVFSYMRLGSVESSDKDKGVGVFMTVINPMLNPLIYS
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 FRNPDVQSAIWRMLTGRRSLA
.:: :::.:. ..:.:.:::
CCDS11 LRNTDVQGALCQLLVGKRSLT
310 320
>>CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 (321 aa)
initn: 987 init1: 966 opt: 981 Z-score: 740.2 bits: 145.2 E(32554): 6.6e-35
Smith-Waterman score: 981; 47.8% identity (80.5% similar) in 297 aa overlap (8-304:5-301)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MQPESGANGTVIAEFILLGLLEAPGLQPVVFVLFLFAYLVTVRGNLSILAAVLVEPKLHT
: :.:.:::.::. . :: ..:..:...:. :. ::. :. .....:.:::
CCDS46 MERKNQTAITEFIILGFSNLNELQFLLFTIFFLTYFCTLGGNILIILTTVTDPHLHT
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 PMYFFLGNLSVLDVGCISVTVPSMLSRLLSRKRAVPCGACLTQLFFFHLFVGVDCFLLTA
:::.:::::. .:. . .::.:. .:::.:... .:..::: : .::: .:.::.:
CCDS46 PMYYFLGNLAFIDICYTTSNVPQMMVHLLSKKKSISYVGCVVQLFAFVFFVGSECLLLAA
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 MAYDRFLAICRPLTYSTRMSQTVQRMLVAASWACAFTNALTHTVAMSTLNFCGPNVINHF
:::::..::: :: ::. .:... .:.:. :: .: :...::: : ::: : ::.:
CCDS46 MAYDRYIAICNPLRYSVILSKVLCNQLAASCWAAGFLNSVVHTVLTFCLPFCGNNQINYF
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 YCDLPQLFQLSCSSTQLNELLLFAVGFIMAGTPMALIVISYIHVAAAVLRIRSVEGRKKA
.::.: :. :::..:..::: :...: ... ::. ::.::: . ...:::.: :::.::
CCDS46 FCDIPPLLILSCGNTSVNELALLSTGVFIGWTPFLCIVLSYICIISTILRIQSSEGRRKA
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 FSTCGSHLTVVAIFYGSGIFNYMRLGSTKLSDKDKAVGIFNTVINPMLNPIIYSFRNPDV
::::.:::..: .::::.::.:.: :: ::. :... .:..::::::::..:: :.
CCDS46 FSTCASHLAIVFLFYGSAIFTYVRPISTYSLKKDRLVSVLYSVVTPMLNPIIYTLRNKDI
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE5 QSAIWRMLTGRRSLA
. :.
CCDS46 KEAVKTIGSKWQPPISSLDSKLTY
300 310 320
>>CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 (309 aa)
initn: 947 init1: 631 opt: 950 Z-score: 717.8 bits: 141.0 E(32554): 1.2e-33
Smith-Waterman score: 950; 46.2% identity (78.4% similar) in 301 aa overlap (8-308:3-302)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MQPESGANGTVIAEFILLGLLEAPGLQPVVFVLFLFAYLVTVRGNLSILAAVLVEPKLHT
:.: ..::::::: . :.:: ... ::: ::.:. :: .... . . .:::
CCDS31 MENSTEVTEFILLGLTDDPNLQIPLLLAFLFIYLITLLGNGGMMVIIHSDSHLHT
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 PMYFFLGNLSVLDVGCISVTVPSMLSRLLSRKRAVPCGACLTQLFFFHLFVGVDCFLLTA
::::::.:::..:.: :...:. .. : : .:. .: .:.::: :. :.:.::..
CCDS31 PMYFFLSNLSLVDLGYSSAVAPKTVAALRSGDKAISYDGCAAQFFFFVGFATVECYLLAS
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 MAYDRFLAICRPLTYSTRMSQTVQRMLVAASWACAFTNALTHTVAMSTLNFCGPNVINHF
::::: :.:::: :.: :. : .:...:.. .: :: :... :.::: : ::::
CCDS31 MAYDRHAAVCRPLHYTTTMTAGVCALLATGSYVSGFLNASIHAAGTFRLSFCGSNEINHF
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 YCDLPQLFQLSCSSTQLNELLLFAVGFIMAGTPMALIVISYIHVAAAVLRIRSVEGRKKA
.::.: :. ::::.:....:..:..:: . : . .:.:::. . .. :..:.::.::.
CCDS31 FCDIPPLLALSCSDTRISKLVVFVAGFNVFFT-LLVILISYFFICITIQRMHSAEGQKKV
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 FSTCGSHLTVVAIFYGSGIFNYMRLGSTKLSDKDKAVGIFNTVINPMLNPIIYSFRNPDV
::::.::::...::::. :: :.. .:.. : :: ...: ::. :::::.:::.:: .:
CCDS31 FSTCASHLTALSIFYGTIIFMYLQPNSSQSVDTDKIASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEV
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE5 QSAIWRMLTGRRSLA
.::.:..:
CCDS31 KSALWKILNKLYPQY
300
>>CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 925 init1: 925 opt: 928 Z-score: 701.8 bits: 138.0 E(32554): 9.1e-33
Smith-Waterman score: 928; 45.8% identity (76.1% similar) in 297 aa overlap (8-303:3-298)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MQPESGANGTVIAEFILLGLLEAPGLQPVVFVLFLFAYLVTVRGNLSILAAVLVEPKLHT
:.: ..::::.:: . : :: .:..::: ::.:. :::... .:.. :::
CCDS31 MENNTEVTEFILVGLTDDPELQIPLFIVFLFIYLITLVGNLGMIELILLDSCLHT
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 PMYFFLGNLSVLDVGCISVTVPSMLSRLLSRKRAVPCGACLTQLFFFHLFVGVDCFLLTA
::::::.:::..: : :...:... .:. . . .:: ::.::: :. .. :::..
CCDS31 PMYFFLSNLSLVDFGYSSAVTPKVMVGFLTGDKFILYNACATQFFFFVAFITAESFLLAS
60 70 80 90 100 110
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