Result of FASTA (omim) for
pFN21AE5458
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5458, 317 aa
1>>>pF1KE5458 317 - 317 aa - 317 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.5814+/-0.000552; mu= 20.2305+/- 0.034
mean_var=76.1089+/-16.265, 0's: 0 Z-trim(106.4): 80 B-trim: 1034 in 1/50
Lambda= 0.147013
statistics sampled from 14463 (14534) to 14463 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.491), E-opt: 0.2 (0.17), width: 16
Scan time: 5.620
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_076411 (OMIM: 604790) taste receptor type 2 mem ( 317) 2047 444.3 1.6e-124
NP_076409 (OMIM: 604792) taste receptor type 2 mem ( 303) 901 201.2 2.2e-51
NP_795365 (OMIM: 612668) taste receptor type 2 mem ( 309) 796 178.9 1.1e-44
NP_795368 (OMIM: 612774) taste receptor type 2 mem ( 309) 789 177.4 3.2e-44
NP_795366 (OMIM: 612669) taste receptor type 2 mem ( 309) 785 176.6 5.8e-44
NP_001091112 (OMIM: 613963) taste receptor type 2 ( 319) 779 175.3 1.4e-43
NP_795371 (OMIM: 609627) taste receptor type 2 mem ( 299) 774 174.2 2.8e-43
NP_795369 (OMIM: 613961) taste receptor type 2 mem ( 299) 764 172.1 1.2e-42
NP_795367 (OMIM: 613967) taste receptor type 2 mem ( 299) 754 170.0 5.4e-42
XP_003961040 (OMIM: 612668) PREDICTED: taste recep ( 299) 754 170.0 5.4e-42
XP_006726600 (OMIM: 612668) PREDICTED: taste recep ( 299) 754 170.0 5.4e-42
NP_795370 (OMIM: 613962) taste receptor type 2 mem ( 309) 750 169.2 9.9e-42
NP_076408 (OMIM: 604793) taste receptor type 2 mem ( 318) 722 163.3 6.2e-40
NP_076410 (OMIM: 604791) taste receptor type 2 mem ( 307) 657 149.4 8.5e-36
NP_852094 (OMIM: 613966) taste receptor type 2 mem ( 314) 641 146.1 9.1e-35
NP_076407 (OMIM: 604794) taste receptor type 2 mem ( 309) 578 132.7 9.5e-31
NP_076406 (OMIM: 604795) taste receptor type 2 mem ( 312) 568 130.6 4.2e-30
NP_058639 (OMIM: 604868) taste receptor type 2 mem ( 316) 549 126.6 6.8e-29
NP_795363 (OMIM: 613964) taste receptor type 2 mem ( 323) 447 104.9 2.3e-22
NP_062545 (OMIM: 604796) taste receptor type 2 mem ( 299) 415 98.1 2.4e-20
NP_789787 (OMIM: 171200,607751) taste receptor typ ( 333) 410 97.1 5.3e-20
NP_061853 (OMIM: 605062) taste receptor type 2 mem ( 299) 399 94.7 2.5e-19
NP_795364 (OMIM: 613965) taste receptor type 2 mem ( 307) 366 87.7 3.2e-17
NP_058640 (OMIM: 604869) taste receptor type 2 mem ( 299) 338 81.8 2e-15
NP_058641 (OMIM: 103780,604867) taste receptor typ ( 291) 323 78.6 1.7e-14
NP_803186 (OMIM: 613968) taste receptor type 2 mem ( 318) 291 71.8 2e-12
NP_065684 (OMIM: 605234) vomeronasal type-1 recept ( 353) 214 55.6 1.8e-07
>>NP_076411 (OMIM: 604790) taste receptor type 2 member (317 aa)
initn: 2047 init1: 2047 opt: 2047 Z-score: 2356.8 bits: 444.3 E(85289): 1.6e-124
Smith-Waterman score: 2047; 100.0% identity (100.0% similar) in 317 aa overlap (1-317:1-317)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGGVIKSIFTFVLIVEFIIGNLGNSFIALVNCIDWVKGRKISSVDRILTALAISRISLVW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_076 MGGVIKSIFTFVLIVEFIIGNLGNSFIALVNCIDWVKGRKISSVDRILTALAISRISLVW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LIFGSWCVSVFFPALFATEKMFRMLTNIWTVINHFSVWLATGLGTFYFLKIANFSNSIFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_076 LIFGSWCVSVFFPALFATEKMFRMLTNIWTVINHFSVWLATGLGTFYFLKIANFSNSIFL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 YLKWRVKKVVLVLLLVTSVFLFLNIALINIHINASINGYRRNKTCSSDSSNFTRFSSLIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_076 YLKWRVKKVVLVLLLVTSVFLFLNIALINIHINASINGYRRNKTCSSDSSNFTRFSSLIV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 LTSTVFIFIPFTLSLAMFLLLIFSMWKHRKKMQHTVKISGDASTKAHRGVKSVITFFLLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_076 LTSTVFIFIPFTLSLAMFLLLIFSMWKHRKKMQHTVKISGDASTKAHRGVKSVITFFLLY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 AIFSLSFFISVWTSERLEENLIILSQVMGMAYPSCHSCVLILGNKKLRQASLSVLLWLRY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_076 AIFSLSFFISVWTSERLEENLIILSQVMGMAYPSCHSCVLILGNKKLRQASLSVLLWLRY
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 MFKDGEPSGHKEFRESS
:::::::::::::::::
NP_076 MFKDGEPSGHKEFRESS
310
>>NP_076409 (OMIM: 604792) taste receptor type 2 member (303 aa)
initn: 933 init1: 774 opt: 901 Z-score: 1043.4 bits: 201.2 E(85289): 2.2e-51
Smith-Waterman score: 901; 50.0% identity (74.3% similar) in 304 aa overlap (1-299:1-302)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGGVIKSIFTFVLIVEFIIGNLGNSFIALVNCIDWVKGRKISSVDRILTALAISRISLVW
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NP_076 MESALPSIFTLVIIAEFIIGNLSNGFIVLINCIDWVSKRELSSVDKLLIILAISRIGLIW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LIFGSWCVSVFFPALFATEKMFRMLTNIWTVINHFSVWLATGLGTFYFLKIANFSNSIFL
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NP_076 EILVSWFLALHYLAIFVSGTGLRIMIFSWIVSNHFNLWLATIFSIFYLLKIASFSSPAFL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 YLKWRVKKVVLVLLLVTSVFLFLNIALINIHINASINGYRRNKTCSSDSSNFTRFSSLIV
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NP_076 YLKWRVNKVILMILLGTLVFLFLNLIQINMHIKDWLDRYERNTTWNFSMSDFETFSVSVK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230
pF1KE5 LTSTVFIFIPFTLSLAMFLLLIFSMWKHRKKMQHTVKISGDASTKAHRG-VKSVITFFLL
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NP_076 FTMTMFSLTPFTVAFISFLLLIFSLQKHLQKMQLNYKGHRDPRTKVHTNALKIVISFLLF
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 YAIFSLSFFISVWTSERLEENLII--LSQVMGMAYPSCHSCVLILGNKKLRQASLSVL--
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NP_076 YASFFLCVLIS-WISE-LYQNTVIYMLCETIGVFSPSSHSFLLILGNAKLRQAFLLVAAK
250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 LWLRYMFKDGEPSGHKEFRESS
.: .
NP_076 VWAKR
300
>>NP_795365 (OMIM: 612668) taste receptor type 2 member (309 aa)
initn: 693 init1: 333 opt: 796 Z-score: 922.9 bits: 178.9 E(85289): 1.1e-44
Smith-Waterman score: 796; 46.5% identity (73.6% similar) in 303 aa overlap (8-308:8-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGGVIKSIFTFVLIVEFIIGNLGNSFIALVNCIDWVKGRKISSVDRILTALAISRISLVW
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NP_795 MITFLPIIFSSLVVVTFVIGNFANGFIALVNSIEWFKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LIFGSWCVSVFFPALFATEKMFRMLTNIWTVINHFSVWLATGLGTFYFLKIANFSNSIFL
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NP_795 VLLLNWYSTVLNPA-FNSVEVRTTAYNIWAVINHFSNWLATTLSIFYLLKIANFSNFIFL
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 YLKWRVKKVVLVLLLVTSVFLFLNIALINIHINASINGYRRNKTCSSDSSNFTRFSSLIV
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NP_795 HLKRRVKSVILVMLLGPLLFLACHLFVINMNEIVRTKEFEGNMTWKIKLKSAMYFSNMTV
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KE5 LTSTVFIFIPFTLSLAMFLLLIFSMWKHRKKMQHTVKISGDASTKAH-RGVKSVITFFLL
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NP_795 --TMVANLVPFTLTLLSFMLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVISFLLL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 YAIFSLSFFISVWTSERLEEN-LIILSQVMGMAYPSCHSCVLILGNKKLRQASLSVLLWL
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NP_795 CAIYFLSIMISVWSFGSLENKPVFMFCKAIRFSYPSIHPFILIWGNKKLKQTFLSVFWQM
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 RYMFKDGEPSGHKEFRESS
:: : :: .
NP_795 RYWVK-GEKTSSP
300
>>NP_795368 (OMIM: 612774) taste receptor type 2 member (309 aa)
initn: 558 init1: 329 opt: 789 Z-score: 914.9 bits: 177.4 E(85289): 3.2e-44
Smith-Waterman score: 789; 45.8% identity (73.9% similar) in 306 aa overlap (8-308:8-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGGVIKSIFTFVLIVEFIIGNLGNSFIALVNCIDWVKGRKISSVDRILTALAISRISLVW
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NP_795 MITFLPIIFSILIVVTFVIGNFANGFIALVNSIEWFKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE5 LIFGSWCVSVFFPALFATEKMFRMLT-NIWTVINHFSVWLATGLGTFYFLKIANFSNSIF
.. .: .. . ::. . : :. . :.:.:::::: ::::.:. ::.:::::::: ::
NP_795 VLVLNWYATELNPAFNSIE--VRITAYNVWAVINHFSNWLATSLSIFYLLKIANFSNLIF
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 LYLKWRVKKVVLVLLLVTSVFLFLNIALINIHINASINGYRRNKT--CSSDSSNFTRFSS
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NP_795 LHLKRRVKSVVLVILLGPLLFLVCHLFVINMNQIIWTKEYEGNMTWKIKLRSAMYLSNTT
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 LIVLTSTVFIFIPFTLSLAMFLLLIFSMWKHRKKMQHTVKISGDASTKAH-RGVKSVITF
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NP_795 VTILAN----LVPFTLTLISFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSMKVHIKALQTVTSF
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 FLLYAIFSLSFFISVWTSERLEEN-LIILSQVMGMAYPSCHSCVLILGNKKLRQASLSVL
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NP_795 LLLCAIYFLSIIMSVWSFESLENKPVFMFCEAIAFSYPSTHPFILIWGNKKLKQTFLSVL
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 LWLRYMFKDGEPSGHKEFRESS
.:: : .::
NP_795 WHVRYWVKGEKPSSS
300
>>NP_795366 (OMIM: 612669) taste receptor type 2 member (309 aa)
initn: 565 init1: 325 opt: 785 Z-score: 910.3 bits: 176.6 E(85289): 5.8e-44
Smith-Waterman score: 785; 46.1% identity (72.9% similar) in 310 aa overlap (1-308:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGGVIKSIFTFVLIVEFIIGNLGNSFIALVNCIDWVKGRKISSVDRILTALAISRISLVW
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NP_795 MTTFIPIIFSSVVVVLFVIGNFANGFIALVNSIERVKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LIFGSWCVSVFFPALFATEKMFRMLTNIWTVINHFSVWLATGLGTFYFLKIANFSNSIFL
... .: .:: ::....: . :.:.: .::: ::::.:. ::.:::::::: :::
NP_795 VLLLNWYSTVFNPAFYSVE-VRTTAYNVWAVTGHFSNWLATSLSIFYLLKIANFSNLIFL
70 80 90 100 110
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pF1KE5 YLKWRVKKVVLVLLLVTSVFLFLNIALINIHINASINGYRRNKTCSSDSSNFTRFSSLIV
.:: :::.:.::.:: .:: .. .::.. . . :. : : . . . .:. :
NP_795 HLKRRVKSVILVMLLGPLLFLACQLFVINMKEIVRTKEYEGNLTWKIKLRSAVYLSDATV
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pF1KE5 LTSTVFIFIPFTLSLAMFLLLIFSMWKHRKKMQHTVKISGDASTKAH-RGVKSVITFFLL
.:. ..::::.: ::::: :. :: :::: : : : :::.: .....:: :.::
NP_795 --TTLGNLVPFTLTLLCFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVIFFLLL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 YAIFSLSFFISVWTSERLEEN-LIILSQVMGMAYPSCHSCVLILGNKKLRQASLSVLLWL
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NP_795 CAVYFLSIMISVWSFGSLENKPVFMFCKAIRFSYPSIHPFILIWGNKKLKQTFLSVLRQV
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 RYMFKDGEPSGHKEFRESS
:: : .::
NP_795 RYWVKGEKPSSP
300
>>NP_001091112 (OMIM: 613963) taste receptor type 2 memb (319 aa)
initn: 578 init1: 332 opt: 779 Z-score: 903.3 bits: 175.3 E(85289): 1.4e-43
Smith-Waterman score: 779; 45.8% identity (72.6% similar) in 310 aa overlap (8-314:8-313)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGGVIKSIFTFVLIVEFIIGNLGNSFIALVNCIDWVKGRKISSVDRILTALAISRISLVW
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NP_001 MITFLPIIFSILIVVIFVIGNFANGFIALVNSIEWVKRQKISFVDQILTALAVSRVGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE5 LIFGSWCVSVFFPALFATEKMFRMLT-NIWTVINHFSVWLATGLGTFYFLKIANFSNSIF
... : .. . ::....: :. . :.:.: :::: ::::.:. ::.:.:::::: ::
NP_001 VLLLHWYATQLNPAFYSVE--VRITAYNVWAVTNHFSSWLATSLSMFYLLRIANFSNLIF
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 LYLKWRVKKVVLVLLLVTSVFLFLNIALINIHINASINGYRRNKTCSSDSSNFTRFSSLI
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NP_001 LRIKRRVKSVVLVILLGPLLFLVCHLFVINMDETVWTKEYEGNVTWKIKLRSAMYHSNMT
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 VLTSTVFIFIPFTLSLAMFLLLIFSMWKHRKKMQHTVKISGDASTKAH-RGVKSVITFFL
. . . :.:.::.: ::::: :. :: :::: : : : :::.: .....: .:.:
NP_001 L--TMLANFVPLTLTLISFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVTSFLL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 LYAIFSLSFFISVWTSERLEEN-LIILSQVMGMAYPSCHSCVLILGNKKLRQASLSVLLW
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NP_001 LCAIYFLSMIISVCNFGRLEKQPVFMFCQAIIFSYPSTHPFILILGNKKLKQIFLSVLRH
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 LRYMFKDGEPSGHKEFRESS
.:: :: :. :
NP_001 VRYWVKDRSLRLHRFTRGALCVF
300 310
>>NP_795371 (OMIM: 609627) taste receptor type 2 member (299 aa)
initn: 743 init1: 270 opt: 774 Z-score: 897.9 bits: 174.2 E(85289): 2.8e-43
Smith-Waterman score: 774; 45.2% identity (76.2% similar) in 294 aa overlap (9-299:9-298)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGGVIKSIFTFVLIVEFIIGNLGNSFIALVNCIDWVKGRKISSVDRILTALAISRISLVW
:.....: :..::..:.:::::: ::::: .::::.:.::::::.:::.:.:
NP_795 MITFLYIFFSILIMVLFVLGNFANGFIALVNFIDWVKRKKISSADQILTALAVSRIGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE5 LIFGSWCVSVFFPALFATEKMFRMLT-NIWTVINHFSVWLATGLGTFYFLKIANFSNSIF
.. .: ..:. ::....: .:. . : :.: ::::.:::..:. ::.:::::::: .:
NP_795 ALLLNWYLTVLNPAFYSVE--LRITSYNAWVVTNHFSMWLAANLSIFYLLKIANFSNLLF
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 LYLKWRVKKVVLVLLLVTSVFLFLNIALINIHINASINGYRRNKTCSSDSSNFTRFSSLI
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NP_795 LHLKRRVRSVILVILLGTLIFLVCHLLVANMDESMWAEEYEGNMTGKMKLRNTVHLSYLT
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 VLTSTVFIFIPFTLSLAMFLLLIFSMWKHRKKMQHTVKISGDASTKAH-RGVKSVITFFL
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NP_795 V--TTLWSFIPFTLSLISFLMLICSLCKHLKKMQLHGEGSQDLSTKVHIKALQTLISFLL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 LYAIFSLSFFISVWTSERLEEN-LIILSQVMGMAYPSCHSCVLILGNKKLRQASLSVLLW
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NP_795 LCAIFFLFLIVSVWSPRRLRNDPVVMVSKAVGNIYLAFDSFILIWRTKKLKHTFLLILCQ
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 LRYMFKDGEPSGHKEFRESS
.:
NP_795 IRC
>>NP_795369 (OMIM: 613961) taste receptor type 2 member (299 aa)
initn: 556 init1: 324 opt: 764 Z-score: 886.4 bits: 172.1 E(85289): 1.2e-42
Smith-Waterman score: 764; 46.9% identity (75.2% similar) in 294 aa overlap (8-297:7-295)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MGGVIKSIFTFVLIV-EFIIGNLGNSFIALVNCIDWVKGRKISSVDRILTALAISRISLV
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NP_795 MMCFLLIISSILVVFAFVLGNVANGFIALVNVIDWVNTRKISSAEQILTALVVSRIGLL
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 WLIFGSWCVSVFFPALFATEKMFRML-TNIWTVINHFSVWLATGLGTFYFLKIANFSNSI
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NP_795 WVMLFLWYATVFNSALYGLE--VRIVASNAWAVTNHFSMWLAASLSIFCLLKIANFSNLI
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 FLYLKWRVKKVVLVLLLVTSVFLFLNIALINIHINASINGYRRNKTCSSDSSNFTRFSSL
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NP_795 SLHLKKRIKSVVLVILLGPLVFLICNLAVITMDERVWTKEYEGNVTWKIKLRNAIHLSSL
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 IVLTSTVFIFIPFTLSLAMFLLLIFSMWKHRKKMQHTVKISGDASTKAH-RGVKSVITFF
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NP_795 TV--TTLANLIPFTLSLICFLLLICSLCKHLKKMRLHSKGSQDPSTKVHIKALQTVTSFL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 LLYAIFSLSFFISVWTSERLEENLIIL-SQVMGMAYPSCHSCVLILGNKKLRQASLSVLL
.:.::. : .. :.:. . . .:..: :.... ::: :: .::.:..::.:. ::::
NP_795 MLFAIYFLCIITSTWNLRTQQSKLVLLLCQTVAIMYPSFHSFILIMGSRKLKQTFLSVL-
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 WLRYMFKDGEPSGHKEFRESS
:
NP_795 WQMTR
>>NP_795367 (OMIM: 613967) taste receptor type 2 member (299 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGGVIKSIFTFVLIVEFIIGNLGNSFIALVNCIDWVKGRKISSVDRILTALAISRISLVW
::.....: :.:::..:.:::::: .::: .::: .:.:.::::.::..:.:
NP_795 MITFLPIIFSILVVVTFVIGNFANGFIALVNSTEWVKRQKISFADQIVTALAVSRVGLLW
10 20 30 40 50 60
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pF1KE5 LIFGSWCVSVFFPALFATEKMFRMLTNIWTVINHFSVWLATGLGTFYFLKIANFSNSIFL
... .: .:. ::....: . :::.: .::: : ::.:. ::.:::::::: :::
NP_795 VLLLNWYSTVLNPAFYSVE-LRTTAYNIWAVTGHFSNWPATSLSIFYLLKIANFSNLIFL
70 80 90 100 110
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pF1KE5 YLKWRVKKVVLVLLLVTSVFLFLNIALINIHINASINGYRRNKTCSSDSSNFTRFSSLIV
:: :::.:.::.:: .:: .. ..:.. . . :. : : . .:. :
NP_795 RLKRRVKSVILVVLLGPLLFLACHLFVVNMNQIVWTKEYEGNMTWKIKLRRAMYLSDTTV
120 130 140 150 160 170
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pF1KE5 LTSTVFIFIPFTLSLAMFLLLIFSMWKHRKKMQHTVKISGDASTKAH-RGVKSVITFFLL
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NP_795 --TMLANLVPFTVTLISFLLLVCSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKVLQTVISFFLL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 YAIFSLSFFISVWTSERLEEN-LIILSQVMGMAYPSCHSCVLILGNKKLRQASLSVLLWL
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NP_795 RAIYFVSVIISVWSFKNLENKPVFMFCQAIGFSCSSAHPFILIWGNKKLKQTYLSVLWQM
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 RYMFKDGEPSGHKEFRESS
::
NP_795 RY
>>XP_003961040 (OMIM: 612668) PREDICTED: taste receptor (299 aa)
initn: 530 init1: 289 opt: 754 Z-score: 875.0 bits: 170.0 E(85289): 5.4e-42
Smith-Waterman score: 754; 44.7% identity (72.9% similar) in 295 aa overlap (8-300:8-299)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGGVIKSIFTFVLIVEFIIGNLGNSFIALVNCIDWVKGRKISSVDRILTALAISRISLVW
::.....: :.:::..:.:::::: .::: .::: .:.:.::::.::..:.:
XP_003 MITFLPIIFSILVVVTFVIGNFANGFIALVNSTEWVKRQKISFADQIVTALAVSRVGLLW
10 20 30 40 50 60
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pF1KE5 LIFGSWCVSVFFPALFATEKMFRMLTNIWTVINHFSVWLATGLGTFYFLKIANFSNSIFL
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XP_003 VLLLNWYSTVLNPAFYSVE-LRTTAYNIWAVTGHFSNWPATSLSIFYLLKIANFSNLIFL
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 YLKWRVKKVVLVLLLVTSVFLFLNIALINIHINASINGYRRNKTCSSDSSNFTRFSSLIV
:: :::.:.::.:: .:: .. ..:.. . . :. : : . .:. :
XP_003 RLKRRVKSVILVVLLGPLLFLACHLFVVNMNQIVWTKEYEGNMTWKIKLRRAMYLSDTTV
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pF1KE5 LTSTVFIFIPFTLSLAMFLLLIFSMWKHRKKMQHTVKISGDASTKAH-RGVKSVITFFLL
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XP_003 --TMLANLVPFTVTLISFLLLVCSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKVLQTVISFFLL
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XP_003 RAIYFVSVIISVWSFKNLENKPVFMFCQAIGFSCSSAHPFILIWGNKKLKQTYLSVLWQM
240 250 260 270 280 290
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::
XP_003 RY
317 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
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start: Tue Nov 8 00:58:05 2016 done: Tue Nov 8 00:58:05 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]