Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5458
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5458, 317 aa
1>>>pF1KE5458 317 - 317 aa - 317 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0877+/-0.00124; mu= 17.2254+/- 0.073
mean_var=73.9526+/-16.766, 0's: 0 Z-trim(100.3): 48 B-trim: 371 in 1/47
Lambda= 0.149141
statistics sampled from 6002 (6043) to 6002 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.516), E-opt: 0.2 (0.186), width: 16
Scan time: 2.120
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS8637.1 TAS2R14 gene_id:50840|Hs108|chr12 ( 317) 2047 450.3 9.1e-127
CCDS8635.1 TAS2R13 gene_id:50838|Hs108|chr12 ( 303) 901 203.7 1.5e-52
CCDS53749.1 TAS2R43 gene_id:259289|Hs108|chr12 ( 309) 796 181.1 9.5e-46
CCDS53748.1 TAS2R46 gene_id:259292|Hs108|chr12 ( 309) 789 179.6 2.7e-45
CCDS53747.1 TAS2R31 gene_id:259290|Hs108|chr12 ( 309) 785 178.8 4.9e-45
CCDS53750.1 TAS2R30 gene_id:259293|Hs108|chr12 ( 319) 779 177.5 1.2e-44
CCDS8638.1 TAS2R50 gene_id:259296|Hs108|chr12 ( 299) 774 176.4 2.5e-44
CCDS8640.1 TAS2R19 gene_id:259294|Hs108|chr12 ( 299) 764 174.2 1.1e-43
CCDS8639.1 TAS2R20 gene_id:259295|Hs108|chr12 ( 309) 750 171.2 9.1e-43
CCDS8631.1 TAS2R7 gene_id:50837|Hs108|chr12 ( 318) 722 165.2 6e-41
CCDS8634.1 TAS2R10 gene_id:50839|Hs108|chr12 ( 307) 657 151.2 9.5e-37
CCDS31747.1 TAS2R42 gene_id:353164|Hs108|chr12 ( 314) 641 147.8 1.1e-35
CCDS8632.1 TAS2R8 gene_id:50836|Hs108|chr12 ( 309) 578 134.2 1.3e-31
CCDS8633.1 TAS2R9 gene_id:50835|Hs108|chr12 ( 312) 568 132.1 5.6e-31
CCDS5867.1 TAS2R3 gene_id:50831|Hs108|chr7 ( 316) 549 128.0 9.6e-30
CCDS47729.1 TAS2R39 gene_id:259285|Hs108|chr7 ( 338) 453 107.4 1.7e-23
CCDS43662.1 TAS2R40 gene_id:259286|Hs108|chr7 ( 323) 447 106.1 4e-23
CCDS3876.1 TAS2R1 gene_id:50834|Hs108|chr5 ( 299) 415 99.1 4.4e-21
CCDS34765.1 TAS2R38 gene_id:5726|Hs108|chr7 ( 333) 413 98.7 6.5e-21
CCDS5869.1 TAS2R5 gene_id:54429|Hs108|chr7 ( 299) 399 95.7 4.8e-20
CCDS43663.1 TAS2R41 gene_id:259287|Hs108|chr7 ( 307) 366 88.6 6.7e-18
CCDS5868.1 TAS2R4 gene_id:50832|Hs108|chr7 ( 299) 338 82.6 4.3e-16
CCDS5785.1 TAS2R16 gene_id:50833|Hs108|chr7 ( 291) 323 79.3 3.9e-15
CCDS5885.1 TAS2R60 gene_id:338398|Hs108|chr7 ( 318) 291 72.5 5e-13
>>CCDS8637.1 TAS2R14 gene_id:50840|Hs108|chr12 (317 aa)
initn: 2047 init1: 2047 opt: 2047 Z-score: 2389.4 bits: 450.3 E(32554): 9.1e-127
Smith-Waterman score: 2047; 100.0% identity (100.0% similar) in 317 aa overlap (1-317:1-317)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGGVIKSIFTFVLIVEFIIGNLGNSFIALVNCIDWVKGRKISSVDRILTALAISRISLVW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 MGGVIKSIFTFVLIVEFIIGNLGNSFIALVNCIDWVKGRKISSVDRILTALAISRISLVW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LIFGSWCVSVFFPALFATEKMFRMLTNIWTVINHFSVWLATGLGTFYFLKIANFSNSIFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 LIFGSWCVSVFFPALFATEKMFRMLTNIWTVINHFSVWLATGLGTFYFLKIANFSNSIFL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 YLKWRVKKVVLVLLLVTSVFLFLNIALINIHINASINGYRRNKTCSSDSSNFTRFSSLIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 YLKWRVKKVVLVLLLVTSVFLFLNIALINIHINASINGYRRNKTCSSDSSNFTRFSSLIV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 LTSTVFIFIPFTLSLAMFLLLIFSMWKHRKKMQHTVKISGDASTKAHRGVKSVITFFLLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 LTSTVFIFIPFTLSLAMFLLLIFSMWKHRKKMQHTVKISGDASTKAHRGVKSVITFFLLY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 AIFSLSFFISVWTSERLEENLIILSQVMGMAYPSCHSCVLILGNKKLRQASLSVLLWLRY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 AIFSLSFFISVWTSERLEENLIILSQVMGMAYPSCHSCVLILGNKKLRQASLSVLLWLRY
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 MFKDGEPSGHKEFRESS
:::::::::::::::::
CCDS86 MFKDGEPSGHKEFRESS
310
>>CCDS8635.1 TAS2R13 gene_id:50838|Hs108|chr12 (303 aa)
initn: 933 init1: 774 opt: 901 Z-score: 1057.0 bits: 203.7 E(32554): 1.5e-52
Smith-Waterman score: 901; 50.0% identity (74.3% similar) in 304 aa overlap (1-299:1-302)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGGVIKSIFTFVLIVEFIIGNLGNSFIALVNCIDWVKGRKISSVDRILTALAISRISLVW
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CCDS86 MESALPSIFTLVIIAEFIIGNLSNGFIVLINCIDWVSKRELSSVDKLLIILAISRIGLIW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LIFGSWCVSVFFPALFATEKMFRMLTNIWTVINHFSVWLATGLGTFYFLKIANFSNSIFL
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CCDS86 EILVSWFLALHYLAIFVSGTGLRIMIFSWIVSNHFNLWLATIFSIFYLLKIASFSSPAFL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 YLKWRVKKVVLVLLLVTSVFLFLNIALINIHINASINGYRRNKTCSSDSSNFTRFSSLIV
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CCDS86 YLKWRVNKVILMILLGTLVFLFLNLIQINMHIKDWLDRYERNTTWNFSMSDFETFSVSVK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230
pF1KE5 LTSTVFIFIPFTLSLAMFLLLIFSMWKHRKKMQHTVKISGDASTKAHRG-VKSVITFFLL
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CCDS86 FTMTMFSLTPFTVAFISFLLLIFSLQKHLQKMQLNYKGHRDPRTKVHTNALKIVISFLLF
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 YAIFSLSFFISVWTSERLEENLII--LSQVMGMAYPSCHSCVLILGNKKLRQASLSVL--
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CCDS86 YASFFLCVLIS-WISE-LYQNTVIYMLCETIGVFSPSSHSFLLILGNAKLRQAFLLVAAK
250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 LWLRYMFKDGEPSGHKEFRESS
.: .
CCDS86 VWAKR
300
>>CCDS53749.1 TAS2R43 gene_id:259289|Hs108|chr12 (309 aa)
initn: 693 init1: 333 opt: 796 Z-score: 934.8 bits: 181.1 E(32554): 9.5e-46
Smith-Waterman score: 796; 46.5% identity (73.6% similar) in 303 aa overlap (8-308:8-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGGVIKSIFTFVLIVEFIIGNLGNSFIALVNCIDWVKGRKISSVDRILTALAISRISLVW
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CCDS53 MITFLPIIFSSLVVVTFVIGNFANGFIALVNSIEWFKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LIFGSWCVSVFFPALFATEKMFRMLTNIWTVINHFSVWLATGLGTFYFLKIANFSNSIFL
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CCDS53 VLLLNWYSTVLNPA-FNSVEVRTTAYNIWAVINHFSNWLATTLSIFYLLKIANFSNFIFL
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 YLKWRVKKVVLVLLLVTSVFLFLNIALINIHINASINGYRRNKTCSSDSSNFTRFSSLIV
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CCDS53 HLKRRVKSVILVMLLGPLLFLACHLFVINMNEIVRTKEFEGNMTWKIKLKSAMYFSNMTV
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KE5 LTSTVFIFIPFTLSLAMFLLLIFSMWKHRKKMQHTVKISGDASTKAH-RGVKSVITFFLL
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CCDS53 --TMVANLVPFTLTLLSFMLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVISFLLL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 YAIFSLSFFISVWTSERLEEN-LIILSQVMGMAYPSCHSCVLILGNKKLRQASLSVLLWL
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CCDS53 CAIYFLSIMISVWSFGSLENKPVFMFCKAIRFSYPSIHPFILIWGNKKLKQTFLSVFWQM
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 RYMFKDGEPSGHKEFRESS
:: : :: .
CCDS53 RYWVK-GEKTSSP
300
>>CCDS53748.1 TAS2R46 gene_id:259292|Hs108|chr12 (309 aa)
initn: 558 init1: 329 opt: 789 Z-score: 926.7 bits: 179.6 E(32554): 2.7e-45
Smith-Waterman score: 789; 45.8% identity (73.9% similar) in 306 aa overlap (8-308:8-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGGVIKSIFTFVLIVEFIIGNLGNSFIALVNCIDWVKGRKISSVDRILTALAISRISLVW
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CCDS53 MITFLPIIFSILIVVTFVIGNFANGFIALVNSIEWFKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE5 LIFGSWCVSVFFPALFATEKMFRMLT-NIWTVINHFSVWLATGLGTFYFLKIANFSNSIF
.. .: .. . ::. . : :. . :.:.:::::: ::::.:. ::.:::::::: ::
CCDS53 VLVLNWYATELNPAFNSIE--VRITAYNVWAVINHFSNWLATSLSIFYLLKIANFSNLIF
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 LYLKWRVKKVVLVLLLVTSVFLFLNIALINIHINASINGYRRNKT--CSSDSSNFTRFSS
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CCDS53 LHLKRRVKSVVLVILLGPLLFLVCHLFVINMNQIIWTKEYEGNMTWKIKLRSAMYLSNTT
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 LIVLTSTVFIFIPFTLSLAMFLLLIFSMWKHRKKMQHTVKISGDASTKAH-RGVKSVITF
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CCDS53 VTILAN----LVPFTLTLISFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSMKVHIKALQTVTSF
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 FLLYAIFSLSFFISVWTSERLEEN-LIILSQVMGMAYPSCHSCVLILGNKKLRQASLSVL
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CCDS53 LLLCAIYFLSIIMSVWSFESLENKPVFMFCEAIAFSYPSTHPFILIWGNKKLKQTFLSVL
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 LWLRYMFKDGEPSGHKEFRESS
.:: : .::
CCDS53 WHVRYWVKGEKPSSS
300
>>CCDS53747.1 TAS2R31 gene_id:259290|Hs108|chr12 (309 aa)
initn: 565 init1: 325 opt: 785 Z-score: 922.0 bits: 178.8 E(32554): 4.9e-45
Smith-Waterman score: 785; 46.1% identity (72.9% similar) in 310 aa overlap (1-308:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGGVIKSIFTFVLIVEFIIGNLGNSFIALVNCIDWVKGRKISSVDRILTALAISRISLVW
: : ::. :..: :.:::..:.:::::: :. :: .::: .:.::::::.::..:.:
CCDS53 MTTFIPIIFSSVVVVLFVIGNFANGFIALVNSIERVKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LIFGSWCVSVFFPALFATEKMFRMLTNIWTVINHFSVWLATGLGTFYFLKIANFSNSIFL
... .: .:: ::....: . :.:.: .::: ::::.:. ::.:::::::: :::
CCDS53 VLLLNWYSTVFNPAFYSVE-VRTTAYNVWAVTGHFSNWLATSLSIFYLLKIANFSNLIFL
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 YLKWRVKKVVLVLLLVTSVFLFLNIALINIHINASINGYRRNKTCSSDSSNFTRFSSLIV
.:: :::.:.::.:: .:: .. .::.. . . :. : : . . . .:. :
CCDS53 HLKRRVKSVILVMLLGPLLFLACQLFVINMKEIVRTKEYEGNLTWKIKLRSAVYLSDATV
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KE5 LTSTVFIFIPFTLSLAMFLLLIFSMWKHRKKMQHTVKISGDASTKAH-RGVKSVITFFLL
.:. ..::::.: ::::: :. :: :::: : : : :::.: .....:: :.::
CCDS53 --TTLGNLVPFTLTLLCFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVIFFLLL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 YAIFSLSFFISVWTSERLEEN-LIILSQVMGMAYPSCHSCVLILGNKKLRQASLSVLLWL
:.. ::..::::. ::.. .... ... ..::: : .:: :::::.:. :::: .
CCDS53 CAVYFLSIMISVWSFGSLENKPVFMFCKAIRFSYPSIHPFILIWGNKKLKQTFLSVLRQV
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 RYMFKDGEPSGHKEFRESS
:: : .::
CCDS53 RYWVKGEKPSSP
300
>>CCDS53750.1 TAS2R30 gene_id:259293|Hs108|chr12 (319 aa)
initn: 578 init1: 332 opt: 779 Z-score: 914.9 bits: 177.5 E(32554): 1.2e-44
Smith-Waterman score: 779; 45.8% identity (72.6% similar) in 310 aa overlap (8-314:8-313)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGGVIKSIFTFVLIVEFIIGNLGNSFIALVNCIDWVKGRKISSVDRILTALAISRISLVW
::.....: :.:::..:.:::::: :.::: .::: ::.::::::.::..:.:
CCDS53 MITFLPIIFSILIVVIFVIGNFANGFIALVNSIEWVKRQKISFVDQILTALAVSRVGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE5 LIFGSWCVSVFFPALFATEKMFRMLT-NIWTVINHFSVWLATGLGTFYFLKIANFSNSIF
... : .. . ::....: :. . :.:.: :::: ::::.:. ::.:.:::::: ::
CCDS53 VLLLHWYATQLNPAFYSVE--VRITAYNVWAVTNHFSSWLATSLSMFYLLRIANFSNLIF
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 LYLKWRVKKVVLVLLLVTSVFLFLNIALINIHINASINGYRRNKTCSSDSSNFTRFSSLI
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CCDS53 LRIKRRVKSVVLVILLGPLLFLVCHLFVINMDETVWTKEYEGNVTWKIKLRSAMYHSNMT
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 VLTSTVFIFIPFTLSLAMFLLLIFSMWKHRKKMQHTVKISGDASTKAH-RGVKSVITFFL
. . . :.:.::.: ::::: :. :: :::: : : : :::.: .....: .:.:
CCDS53 L--TMLANFVPLTLTLISFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVTSFLL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 LYAIFSLSFFISVWTSERLEEN-LIILSQVMGMAYPSCHSCVLILGNKKLRQASLSVLLW
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CCDS53 LCAIYFLSMIISVCNFGRLEKQPVFMFCQAIIFSYPSTHPFILILGNKKLKQIFLSVLRH
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 LRYMFKDGEPSGHKEFRESS
.:: :: :. :
CCDS53 VRYWVKDRSLRLHRFTRGALCVF
300 310
>>CCDS8638.1 TAS2R50 gene_id:259296|Hs108|chr12 (299 aa)
initn: 743 init1: 270 opt: 774 Z-score: 909.4 bits: 176.4 E(32554): 2.5e-44
Smith-Waterman score: 774; 45.2% identity (76.2% similar) in 294 aa overlap (9-299:9-298)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGGVIKSIFTFVLIVEFIIGNLGNSFIALVNCIDWVKGRKISSVDRILTALAISRISLVW
:.....: :..::..:.:::::: ::::: .::::.:.::::::.:::.:.:
CCDS86 MITFLYIFFSILIMVLFVLGNFANGFIALVNFIDWVKRKKISSADQILTALAVSRIGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE5 LIFGSWCVSVFFPALFATEKMFRMLT-NIWTVINHFSVWLATGLGTFYFLKIANFSNSIF
.. .: ..:. ::....: .:. . : :.: ::::.:::..:. ::.:::::::: .:
CCDS86 ALLLNWYLTVLNPAFYSVE--LRITSYNAWVVTNHFSMWLAANLSIFYLLKIANFSNLLF
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 LYLKWRVKKVVLVLLLVTSVFLFLNIALINIHINASINGYRRNKTCSSDSSNFTRFSSLI
:.:: ::..:.::.:: : .:: .. . :. . . :. : : . : ...: :
CCDS86 LHLKRRVRSVILVILLGTLIFLVCHLLVANMDESMWAEEYEGNMTGKMKLRNTVHLSYLT
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 VLTSTVFIFIPFTLSLAMFLLLIFSMWKHRKKMQHTVKISGDASTKAH-RGVKSVITFFL
: .:.. :::::::: ::.:: :. :: :::: . : : :::.: ......:.:.:
CCDS86 V--TTLWSFIPFTLSLISFLMLICSLCKHLKKMQLHGEGSQDLSTKVHIKALQTLISFLL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 LYAIFSLSFFISVWTSERLEEN-LIILSQVMGMAYPSCHSCVLILGNKKLRQASLSVLLW
: ::: : ...:::. .::... ....:...: : . : .:: .:::... : .:
CCDS86 LCAIFFLFLIVSVWSPRRLRNDPVVMVSKAVGNIYLAFDSFILIWRTKKLKHTFLLILCQ
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 LRYMFKDGEPSGHKEFRESS
.:
CCDS86 IRC
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10 20 30 40 50
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CCDS86 MMCFLLIISSILVVFAFVLGNVANGFIALVNVIDWVNTRKISSAEQILTALVVSRIGLL
10 20 30 40 50
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CCDS86 WVMLFLWYATVFNSALYGLE--VRIVASNAWAVTNHFSMWLAASLSIFCLLKIANFSNLI
60 70 80 90 100 110
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CCDS86 TV--TTLANLIPFTLSLICFLLLICSLCKHLKKMRLHSKGSQDPSTKVHIKALQTVTSFL
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.:.::. : .. :.:. . . .:..: :.... ::: :: .::.:..::.:. ::::
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300 310
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:
CCDS86 WQMTR
>>CCDS8639.1 TAS2R20 gene_id:259295|Hs108|chr12 (309 aa)
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CCDS86 VILLHWYSTVLNPTS-SNLKVIIFISNAWAVTNHFSIWLATSLSIFYLLKIVNFSRLIFH
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.:: ..:.::::..: . :: .... . .::. . . : : . : ..:.: :
CCDS86 HLKRKAKSVVLVIVLGSLFFLVCHLVMKHTYINVWTEECEGNVTWKIKLRNAMHLSNLTV
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CCDS86 --AMLANLIPFTLTLISFLLLIYSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKIHIKALQTVTSFLIL
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CCDS86 LAIYFLCLIISFWNFKMRPKEIVLMLCQAFGIIYPSFHSFILIWGNKTLKQTFLSVL-WQ
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CCDS86 VTCWAKGQNQSTP
300
>>CCDS8631.1 TAS2R7 gene_id:50837|Hs108|chr12 (318 aa)
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CCDS86 MADKVQTTLLFLAVGEFSVGILGNAFIGLVNCMDWVKKRKIASIDLILTSLAISRICLLC
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CCDS86 VILLDCFILVLYPDVYATGKEMRIIDFFWTLTNHLSIWFATCLSIYYFFKIGNFFHPLFL
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CCDS86 WMKWRIDRVISWILLGCVVLSVFISLPATENLNADFRFCVKAKRKTNLTWSCRVNKTQHA
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CCDS86 FLLLFIAYYLSFLIATSSYFMPETELAVIFGESIALIYPSSHSFILILGNNKLRHASLKV
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CCDS86 IWKVMSILKGRKFQQHKQI
300 310
317 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 00:58:04 2016 done: Tue Nov 8 00:58:04 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]