Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5447
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5447, 328 aa
1>>>pF1KE5447 328 - 328 aa - 328 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4635+/-0.00131; mu= 14.9899+/- 0.078
mean_var=63.9587+/-13.019, 0's: 0 Z-trim(98.9): 30 B-trim: 0 in 0/47
Lambda= 0.160370
statistics sampled from 5537 (5545) to 5537 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.515), E-opt: 0.2 (0.17), width: 16
Scan time: 2.350
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS47752.1 PRKAG2 gene_id:51422|Hs108|chr7 ( 328) 2093 493.6 9.3e-140
CCDS43683.1 PRKAG2 gene_id:51422|Hs108|chr7 ( 525) 2093 493.6 1.4e-139
CCDS5928.1 PRKAG2 gene_id:51422|Hs108|chr7 ( 569) 2093 493.7 1.5e-139
CCDS8777.1 PRKAG1 gene_id:5571|Hs108|chr12 ( 331) 1555 369.1 2.8e-102
CCDS55824.1 PRKAG1 gene_id:5571|Hs108|chr12 ( 299) 1528 362.8 1.9e-100
CCDS2424.1 PRKAG3 gene_id:53632|Hs108|chr2 ( 489) 1388 330.5 1.7e-90
CCDS55825.1 PRKAG1 gene_id:5571|Hs108|chr12 ( 340) 1221 291.8 5.2e-79
>>CCDS47752.1 PRKAG2 gene_id:51422|Hs108|chr7 (328 aa)
initn: 2093 init1: 2093 opt: 2093 Z-score: 2622.6 bits: 493.6 E(32554): 9.3e-140
Smith-Waterman score: 2093; 100.0% identity (100.0% similar) in 328 aa overlap (1-328:1-328)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MLEKLEFEDEAVEDSESGVYMRFMRSHKCYDIVPTSSKLVVFDTTLQVKKAFFALVANGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MLEKLEFEDEAVEDSESGVYMRFMRSHKCYDIVPTSSKLVVFDTTLQVKKAFFALVANGV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 RAAPLWESKKQSFVGMLTITDFINILHRYYKSPMVQIYELEEHKIETWRELYLQETFKPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 RAAPLWESKKQSFVGMLTITDFINILHRYYKSPMVQIYELEEHKIETWRELYLQETFKPL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 VNISPDASLFDAVYSLIKNKIHRLPVIDPISGNALYILTHKRILKFLQLFMSDMPKPAFM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VNISPDASLFDAVYSLIKNKIHRLPVIDPISGNALYILTHKRILKFLQLFMSDMPKPAFM
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 KQNLDELGIGTYHNIAFIHPDTPIIKALNIFVERRISALPVVDESGKVVDIYSKFDVINL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 KQNLDELGIGTYHNIAFIHPDTPIIKALNIFVERRISALPVVDESGKVVDIYSKFDVINL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 AAEKTYNNLDITVTQALQHRSQYFEGVVKCNKLEILETIVDRIVRAEVHRLVVVNEADSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 AAEKTYNNLDITVTQALQHRSQYFEGVVKCNKLEILETIVDRIVRAEVHRLVVVNEADSI
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE5 VGIISLSDILQALILTPAGAKQKETETE
::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VGIISLSDILQALILTPAGAKQKETETE
310 320
>>CCDS43683.1 PRKAG2 gene_id:51422|Hs108|chr7 (525 aa)
initn: 2093 init1: 2093 opt: 2093 Z-score: 2619.4 bits: 493.6 E(32554): 1.4e-139
Smith-Waterman score: 2093; 100.0% identity (100.0% similar) in 328 aa overlap (1-328:198-525)
10 20 30
pF1KE5 MLEKLEFEDEAVEDSESGVYMRFMRSHKCY
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PTRPPLASPTHYAPSKAAALAAALGPAEAGMLEKLEFEDEAVEDSESGVYMRFMRSHKCY
170 180 190 200 210 220
40 50 60 70 80 90
pF1KE5 DIVPTSSKLVVFDTTLQVKKAFFALVANGVRAAPLWESKKQSFVGMLTITDFINILHRYY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 DIVPTSSKLVVFDTTLQVKKAFFALVANGVRAAPLWESKKQSFVGMLTITDFINILHRYY
230 240 250 260 270 280
100 110 120 130 140 150
pF1KE5 KSPMVQIYELEEHKIETWRELYLQETFKPLVNISPDASLFDAVYSLIKNKIHRLPVIDPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 KSPMVQIYELEEHKIETWRELYLQETFKPLVNISPDASLFDAVYSLIKNKIHRLPVIDPI
290 300 310 320 330 340
160 170 180 190 200 210
pF1KE5 SGNALYILTHKRILKFLQLFMSDMPKPAFMKQNLDELGIGTYHNIAFIHPDTPIIKALNI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SGNALYILTHKRILKFLQLFMSDMPKPAFMKQNLDELGIGTYHNIAFIHPDTPIIKALNI
350 360 370 380 390 400
220 230 240 250 260 270
pF1KE5 FVERRISALPVVDESGKVVDIYSKFDVINLAAEKTYNNLDITVTQALQHRSQYFEGVVKC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 FVERRISALPVVDESGKVVDIYSKFDVINLAAEKTYNNLDITVTQALQHRSQYFEGVVKC
410 420 430 440 450 460
280 290 300 310 320
pF1KE5 NKLEILETIVDRIVRAEVHRLVVVNEADSIVGIISLSDILQALILTPAGAKQKETETE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 NKLEILETIVDRIVRAEVHRLVVVNEADSIVGIISLSDILQALILTPAGAKQKETETE
470 480 490 500 510 520
>>CCDS5928.1 PRKAG2 gene_id:51422|Hs108|chr7 (569 aa)
initn: 2093 init1: 2093 opt: 2093 Z-score: 2618.8 bits: 493.7 E(32554): 1.5e-139
Smith-Waterman score: 2093; 100.0% identity (100.0% similar) in 328 aa overlap (1-328:242-569)
10 20 30
pF1KE5 MLEKLEFEDEAVEDSESGVYMRFMRSHKCY
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 PTRPPLASPTHYAPSKAAALAAALGPAEAGMLEKLEFEDEAVEDSESGVYMRFMRSHKCY
220 230 240 250 260 270
40 50 60 70 80 90
pF1KE5 DIVPTSSKLVVFDTTLQVKKAFFALVANGVRAAPLWESKKQSFVGMLTITDFINILHRYY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 DIVPTSSKLVVFDTTLQVKKAFFALVANGVRAAPLWESKKQSFVGMLTITDFINILHRYY
280 290 300 310 320 330
100 110 120 130 140 150
pF1KE5 KSPMVQIYELEEHKIETWRELYLQETFKPLVNISPDASLFDAVYSLIKNKIHRLPVIDPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 KSPMVQIYELEEHKIETWRELYLQETFKPLVNISPDASLFDAVYSLIKNKIHRLPVIDPI
340 350 360 370 380 390
160 170 180 190 200 210
pF1KE5 SGNALYILTHKRILKFLQLFMSDMPKPAFMKQNLDELGIGTYHNIAFIHPDTPIIKALNI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 SGNALYILTHKRILKFLQLFMSDMPKPAFMKQNLDELGIGTYHNIAFIHPDTPIIKALNI
400 410 420 430 440 450
220 230 240 250 260 270
pF1KE5 FVERRISALPVVDESGKVVDIYSKFDVINLAAEKTYNNLDITVTQALQHRSQYFEGVVKC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 FVERRISALPVVDESGKVVDIYSKFDVINLAAEKTYNNLDITVTQALQHRSQYFEGVVKC
460 470 480 490 500 510
280 290 300 310 320
pF1KE5 NKLEILETIVDRIVRAEVHRLVVVNEADSIVGIISLSDILQALILTPAGAKQKETETE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 NKLEILETIVDRIVRAEVHRLVVVNEADSIVGIISLSDILQALILTPAGAKQKETETE
520 530 540 550 560
>>CCDS8777.1 PRKAG1 gene_id:5571|Hs108|chr12 (331 aa)
initn: 1552 init1: 1552 opt: 1555 Z-score: 1949.8 bits: 369.1 E(32554): 2.8e-102
Smith-Waterman score: 1555; 76.1% identity (92.9% similar) in 309 aa overlap (14-322:23-330)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MLEKLEFEDEAVEDSESGVYMRFMRSHKCYDIVPTSSKLVVFDTTLQVKKA
.:...:: ::.::.:::..:::::::::::.::::::
CCDS87 METVISSDSSPAVENEHPQETPESNNSVYTSFMKSHRCYDLIPTSSKLVVFDTSLQVKKA
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 FFALVANGVRAAPLWESKKQSFVGMLTITDFINILHRYYKSPMVQIYELEEHKIETWREL
:::::.:::::::::.::::::::::::::::::::::::: .::::::::::::::::.
CCDS87 FFALVTNGVRAAPLWDSKKQSFVGMLTITDFINILHRYYKSALVQIYELEEHKIETWREV
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 YLQETFKPLVNISPDASLFDAVYSLIKNKIHRLPVIDPISGNALYILTHKRILKFLQLFM
:::..::::: :::.::::::: :::.::::::::::: :::.:::::::::::::.::.
CCDS87 YLQDSFKPLVCISPNASLFDAVSSLIRNKIHRLPVIDPESGNTLYILTHKRILKFLKLFI
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 SDMPKPAFMKQNLDELGIGTYHNIAFIHPDTPIIKALNIFVERRISALPVVDESGKVVDI
...::: ::...:.:: :::: :::... ::. ::.:::..:.::::::::.:.::::
CCDS87 TEFPKPEFMSKSLEELQIGTYANIAMVRTTTPVYVALGIFVQHRVSALPVVDEKGRVVDI
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 YSKFDVINLAAEKTYNNLDITVTQALQHRSQYFEGVVKCNKLEILETIVDRIVRAEVHRL
:::::::::::::::::::..::.::::::.:::::.:: : ::::..:.:.::::::
CCDS87 YSKFDVINLAAEKTYNNLDVSVTKALQHRSHYFEGVLKCYLHETLETIINRLVEAEVHRL
250 260 270 280 290 300
300 310 320
pF1KE5 VVVNEADSIVGIISLSDILQALILTPAGAKQKETETE
:::.: : . ::.:::::::::.:: .: :.
CCDS87 VVVDENDVVKGIVSLSDILQALVLT-GGEKKP
310 320 330
>>CCDS55824.1 PRKAG1 gene_id:5571|Hs108|chr12 (299 aa)
initn: 1525 init1: 1525 opt: 1528 Z-score: 1916.7 bits: 362.8 E(32554): 1.9e-100
Smith-Waterman score: 1528; 77.3% identity (93.3% similar) in 299 aa overlap (24-322:1-298)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MLEKLEFEDEAVEDSESGVYMRFMRSHKCYDIVPTSSKLVVFDTTLQVKKAFFALVANGV
:.::.:::..:::::::::::.:::::::::::.:::
CCDS55 MKSHRCYDLIPTSSKLVVFDTSLQVKKAFFALVTNGV
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 RAAPLWESKKQSFVGMLTITDFINILHRYYKSPMVQIYELEEHKIETWRELYLQETFKPL
::::::.::::::::::::::::::::::::: .::::::::::::::::.:::..::::
CCDS55 RAAPLWDSKKQSFVGMLTITDFINILHRYYKSALVQIYELEEHKIETWREVYLQDSFKPL
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 VNISPDASLFDAVYSLIKNKIHRLPVIDPISGNALYILTHKRILKFLQLFMSDMPKPAFM
: :::.::::::: :::.::::::::::: :::.:::::::::::::.::....::: ::
CCDS55 VCISPNASLFDAVSSLIRNKIHRLPVIDPESGNTLYILTHKRILKFLKLFITEFPKPEFM
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 KQNLDELGIGTYHNIAFIHPDTPIIKALNIFVERRISALPVVDESGKVVDIYSKFDVINL
...:.:: :::: :::... ::. ::.:::..:.::::::::.:.:::::::::::::
CCDS55 SKSLEELQIGTYANIAMVRTTTPVYVALGIFVQHRVSALPVVDEKGRVVDIYSKFDVINL
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 AAEKTYNNLDITVTQALQHRSQYFEGVVKCNKLEILETIVDRIVRAEVHRLVVVNEADSI
::::::::::..::.::::::.:::::.:: : ::::..:.:.:::::::::.: : .
CCDS55 AAEKTYNNLDVSVTKALQHRSHYFEGVLKCYLHETLETIINRLVEAEVHRLVVVDENDVV
220 230 240 250 260 270
310 320
pF1KE5 VGIISLSDILQALILTPAGAKQKETETE
::.:::::::::.:: .: :.
CCDS55 KGIVSLSDILQALVLT-GGEKKP
280 290
>>CCDS2424.1 PRKAG3 gene_id:53632|Hs108|chr2 (489 aa)
initn: 1380 init1: 1380 opt: 1388 Z-score: 1738.3 bits: 330.5 E(32554): 1.7e-90
Smith-Waterman score: 1388; 63.3% identity (88.9% similar) in 316 aa overlap (4-319:169-483)
10 20 30
pF1KE5 MLEKLEFEDEAVEDSESGVYMRFMRSHKCYDIV
:: ..:: .. . .:::::. : ::: .
CCDS24 FPATEAWECELEGLLEERPALCLSPQAPFPKLGWDDE-LRKPGAQIYMRFMQEHTCYDAM
140 150 160 170 180 190
40 50 60 70 80 90
pF1KE5 PTSSKLVVFDTTLQVKKAFFALVANGVRAAPLWESKKQSFVGMLTITDFINILHRYYKSP
::::::.::: :..::::::::::::::::::.:::::::::::::::: .:::::.::
CCDS24 ATSSKLVIFDTMLEIKKAFFALVANGVRAAPLWDSKKQSFVGMLTITDFILVLHRYYRSP
200 210 220 230 240 250
100 110 120 130 140 150
pF1KE5 MVQIYELEEHKIETWRELYLQETFKPLVNISPDASLFDAVYSLIKNKIHRLPVIDPISGN
.:::::.:.::::::::.::: :::::.:::. :::.:::.::::.::::::.::.:::
CCDS24 LVQIYEIEQHKIETWREIYLQGCFKPLVSISPNDSLFEAVYTLIKNRIHRLPVLDPVSGN
260 270 280 290 300 310
160 170 180 190 200 210
pF1KE5 ALYILTHKRILKFLQLFMSDMPKPAFMKQNLDELGIGTYHNIAFIHPDTPIIKALNIFVE
.:.::::::.::::..: : .:.:.:. .....:::::....: . .::. ::.:::.
CCDS24 VLHILTHKRLLKFLHIFGSLLPRPSFLYRTIQDLGIGTFRDLAVVLETAPILTALDIFVD
320 330 340 350 360 370
220 230 240 250 260 270
pF1KE5 RRISALPVVDESGKVVDIYSKFDVINLAAEKTYNNLDITVTQALQHRSQYFEGVVKCNKL
::.::::::.: :.:: .::.::::.:::..:::.::..: .::..:. .:::..:.
CCDS24 RRVSALPVVNECGQVVGLYSRFDVIHLAAQQTYNHLDMSVGEALRQRTLCLEGVLSCQPH
380 390 400 410 420 430
280 290 300 310 320
pF1KE5 EILETIVDRIVRAEVHRLVVVNEADSIVGIISLSDILQALILTPAGAKQKETETE
: : ..:::.: .:::::.:.:.. ..:..:::::::::.:.:::
CCDS24 ESLGEVIDRIAREQVHRLVLVDETQHLLGVVSLSDILQALVLSPAGIDALGA
440 450 460 470 480
>>CCDS55825.1 PRKAG1 gene_id:5571|Hs108|chr12 (340 aa)
initn: 1218 init1: 1218 opt: 1221 Z-score: 1532.0 bits: 291.8 E(32554): 5.2e-79
Smith-Waterman score: 1527; 73.9% identity (90.3% similar) in 318 aa overlap (14-322:23-339)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MLEKLEFEDEAVEDSESGVYMRFMRSHKCYDIVPTSSKLVVFDTTLQVKKA
.:...:: ::.::.:::..:::::::::::.::::::
CCDS55 METVISSDSSPAVENEHPQETPESNNSVYTSFMKSHRCYDLIPTSSKLVVFDTSLQVKKA
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100
pF1KE5 FFALVANGVRAAPLWESKKQSFV---------GMLTITDFINILHRYYKSPMVQIYELEE
:::::.:::::::::.::::::: :::::::::::::::::: .::::::::
CCDS55 FFALVTNGVRAAPLWDSKKQSFVVLRALSCPLGMLTITDFINILHRYYKSALVQIYELEE
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE5 HKIETWRELYLQETFKPLVNISPDASLFDAVYSLIKNKIHRLPVIDPISGNALYILTHKR
::::::::.:::..::::: :::.::::::: :::.::::::::::: :::.::::::::
CCDS55 HKIETWREVYLQDSFKPLVCISPNASLFDAVSSLIRNKIHRLPVIDPESGNTLYILTHKR
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE5 ILKFLQLFMSDMPKPAFMKQNLDELGIGTYHNIAFIHPDTPIIKALNIFVERRISALPVV
:::::.::....::: ::...:.:: :::: :::... ::. ::.:::..:.::::::
CCDS55 ILKFLKLFITEFPKPEFMSKSLEELQIGTYANIAMVRTTTPVYVALGIFVQHRVSALPVV
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE5 DESGKVVDIYSKFDVINLAAEKTYNNLDITVTQALQHRSQYFEGVVKCNKLEILETIVDR
::.:.:::::::::::::::::::::::..::.::::::.:::::.:: : ::::..:
CCDS55 DEKGRVVDIYSKFDVINLAAEKTYNNLDVSVTKALQHRSHYFEGVLKCYLHETLETIINR
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320
pF1KE5 IVRAEVHRLVVVNEADSIVGIISLSDILQALILTPAGAKQKETETE
.:.:::::::::.: : . ::.:::::::::.:: .: :.
CCDS55 LVEAEVHRLVVVDENDVVKGIVSLSDILQALVLT-GGEKKP
310 320 330 340
328 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 00:51:07 2016 done: Tue Nov 8 00:51:07 2016
Total Scan time: 2.350 Total Display time: 0.010
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]