Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5444
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5444, 312 aa
1>>>pF1KE5444 312 - 312 aa - 312 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6354+/-0.00123; mu= 14.0841+/- 0.071
mean_var=160.4593+/-51.884, 0's: 0 Z-trim(104.1): 406 B-trim: 875 in 2/47
Lambda= 0.101249
statistics sampled from 7215 (7754) to 7215 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.596), E-opt: 0.2 (0.238), width: 16
Scan time: 2.430
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS43434.1 OR2J2 gene_id:26707|Hs108|chr6 ( 312) 2078 316.2 2e-86
CCDS43433.1 OR2J3 gene_id:442186|Hs108|chr6 ( 311) 1836 280.9 8.9e-76
CCDS1634.2 OR2C3 gene_id:81472|Hs108|chr1 ( 320) 1234 193.0 2.7e-49
CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6 ( 357) 1230 192.4 4.3e-49
CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 ( 309) 1203 188.4 6e-48
CCDS31119.1 OR2G6 gene_id:391211|Hs108|chr1 ( 316) 1198 187.7 1e-47
CCDS4642.1 OR2B6 gene_id:26212|Hs108|chr6 ( 313) 1192 186.8 1.9e-47
CCDS4656.1 OR2W1 gene_id:26692|Hs108|chr6 ( 320) 1184 185.7 4.2e-47
CCDS34323.1 OR2Y1 gene_id:134083|Hs108|chr5 ( 311) 1179 184.9 6.9e-47
CCDS31090.1 OR2B11 gene_id:127623|Hs108|chr1 ( 317) 1175 184.3 1e-46
CCDS34365.1 OR2H2 gene_id:7932|Hs108|chr6 ( 312) 1168 183.3 2.1e-46
CCDS31099.1 OR2W3 gene_id:343171|Hs108|chr1 ( 314) 1167 183.2 2.3e-46
CCDS4660.1 OR2H1 gene_id:26716|Hs108|chr6 ( 316) 1167 183.2 2.3e-46
CCDS34358.1 OR2B3 gene_id:442184|Hs108|chr6 ( 313) 1154 181.3 8.7e-46
CCDS31092.1 OR2G2 gene_id:81470|Hs108|chr1 ( 317) 1140 179.2 3.6e-45
CCDS10502.1 OR2C1 gene_id:4993|Hs108|chr16 ( 312) 1110 174.8 7.5e-44
CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11 ( 330) 1010 160.3 1.9e-39
CCDS6778.1 OR2K2 gene_id:26248|Hs108|chr9 ( 316) 1005 159.5 3.1e-39
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 993 157.7 1e-38
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 979 155.7 4.4e-38
CCDS35092.1 OR13C2 gene_id:392376|Hs108|chr9 ( 318) 959 152.8 3.3e-37
CCDS31416.1 OR2D2 gene_id:120776|Hs108|chr11 ( 308) 958 152.6 3.6e-37
CCDS35087.1 OR13F1 gene_id:138805|Hs108|chr9 ( 319) 956 152.3 4.5e-37
CCDS35093.1 OR13C9 gene_id:286362|Hs108|chr9 ( 318) 954 152.1 5.5e-37
CCDS35123.1 OR1N2 gene_id:138882|Hs108|chr9 ( 330) 953 151.9 6.2e-37
CCDS11024.1 OR1E1 gene_id:8387|Hs108|chr17 ( 314) 948 151.2 9.9e-37
CCDS35089.1 OR13C3 gene_id:138803|Hs108|chr9 ( 347) 947 151.1 1.2e-36
CCDS31104.1 OR2L3 gene_id:391192|Hs108|chr1 ( 312) 946 150.9 1.2e-36
CCDS43670.1 OR2A12 gene_id:346525|Hs108|chr7 ( 310) 944 150.6 1.5e-36
CCDS35088.1 OR13C4 gene_id:138804|Hs108|chr9 ( 318) 942 150.3 1.8e-36
CCDS7773.1 OR10A5 gene_id:144124|Hs108|chr11 ( 317) 941 150.2 2e-36
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 937 149.6 3e-36
CCDS35094.1 OR13D1 gene_id:286365|Hs108|chr9 ( 346) 937 149.6 3.2e-36
CCDS35091.1 OR13C5 gene_id:138799|Hs108|chr9 ( 318) 936 149.4 3.4e-36
CCDS31102.1 OR2AK2 gene_id:391191|Hs108|chr1 ( 335) 935 149.3 3.8e-36
CCDS56515.1 OR2A42 gene_id:402317|Hs108|chr7 ( 310) 932 148.8 5e-36
CCDS43673.1 OR2A1 gene_id:346528|Hs108|chr7 ( 310) 932 148.8 5e-36
CCDS31828.1 OR10P1 gene_id:121130|Hs108|chr12 ( 313) 931 148.7 5.5e-36
CCDS32936.1 OR7A10 gene_id:390892|Hs108|chr19 ( 309) 929 148.4 6.7e-36
CCDS31103.1 OR2L2 gene_id:26246|Hs108|chr1 ( 312) 928 148.2 7.5e-36
CCDS31415.1 OR10A2 gene_id:341276|Hs108|chr11 ( 303) 926 147.9 9e-36
CCDS35090.1 OR13C8 gene_id:138802|Hs108|chr9 ( 320) 926 148.0 9.3e-36
CCDS10496.1 OR1F1 gene_id:4992|Hs108|chr16 ( 312) 925 147.8 1e-35
CCDS53629.1 OR5M11 gene_id:219487|Hs108|chr11 ( 305) 923 147.5 1.2e-35
CCDS6596.2 OR2S2 gene_id:56656|Hs108|chr9 ( 319) 923 147.5 1.3e-35
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 922 147.4 1.4e-35
CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11 ( 311) 919 146.9 1.9e-35
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 917 146.7 2.3e-35
CCDS31514.1 OR10AG1 gene_id:282770|Hs108|chr11 ( 301) 915 146.3 2.7e-35
CCDS43671.1 OR2A2 gene_id:442361|Hs108|chr7 ( 318) 913 146.1 3.5e-35
>>CCDS43434.1 OR2J2 gene_id:26707|Hs108|chr6 (312 aa)
initn: 2078 init1: 2078 opt: 2078 Z-score: 1665.0 bits: 316.2 E(32554): 2e-86
Smith-Waterman score: 2078; 99.7% identity (100.0% similar) in 312 aa overlap (1-312:1-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MMIKKNASSEDFFILLGFSNWPQLEVVLFVVILIFYLMTLTGNLFIIILSYVDSHLHTPM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MMIKKNASSEDFFILLGFSNWPQLEVVLFVVILIFYLMTLTGNLFIIILSYVDSHLHTPM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 YFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLRGPEKTISYAGCMVQLYFVLALGIAECVLLVVMS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::
CCDS43 YFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLRGPEKTISYAGCMVQLYFVLALGITECVLLVVMS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 YDRYVAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLVAASWVIGFTISALHSSFTFWVPLCGHRLVDHFFC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 YDRYVAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLVAASWVIGFTISALHSSFTFWVPLCGHRLVDHFFC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 EVPALLRLSCVDTHANELTLMVMSSIFVLIPLILILTTYGAIARAVLSMQSTTGLQKVFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 EVPALLRLSCVDTHANELTLMVMSSIFVLIPLILILTTYGAIARAVLSMQSTTGLQKVFR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 TCGAHLMVVSLFFIPVMCMYLQPPSENSPDQGKFIALFYTVVTPSLNPLIYTLRNKHVKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 TCGAHLMVVSLFFIPVMCMYLQPPSENSPDQGKFIALFYTVVTPSLNPLIYTLRNKHVKG
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 AAKRLLGWEWGK
::::::::::::
CCDS43 AAKRLLGWEWGK
310
>>CCDS43433.1 OR2J3 gene_id:442186|Hs108|chr6 (311 aa)
initn: 1836 init1: 1836 opt: 1836 Z-score: 1473.9 bits: 280.9 E(32554): 8.9e-76
Smith-Waterman score: 1836; 88.6% identity (95.4% similar) in 306 aa overlap (4-309:6-311)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MMIKKNASSEDFFILLGFSNWPQLEVVLFVVILIFYLMTLTGNLFIIILSYVDSHLHT
: ::::: .:::.::::::.::::.:::.:::::::: ::::::::::.::::::
CCDS43 MNDDGKVNASSEGYFILVGFSNWPHLEVVIFVVVLIFYLMTLIGNLFIIILSYLDSHLHT
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 PMYFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLRGPEKTISYAGCMVQLYFVLALGIAECVLLVV
:::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::.::::::::: .:::::::
CCDS43 PMYFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLWGPEKTISYAGCMIQLYFVLALGTTECVLLVV
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 MSYDRYVAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLVAASWVIGFTISALHSSFTFWVPLCGHRLVDHF
::::::.::::::::::::::::::::..:::: ::: ::::::::::::::::: ::::
CCDS43 MSYDRYAAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLAVASWVSGFTNSALHSSFTFWVPLCGHRQVDHF
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 FCEVPALLRLSCVDTHANELTLMVMSSIFVLIPLILILTTYGAIARAVLSMQSTTGLQKV
::::::::::::::::.::::::. ::::::::::::::.::::.::.: ::::::::::
CCDS43 FCEVPALLRLSCVDTHVNELTLMITSSIFVLIPLILILTSYGAIVRAILRMQSTTGLQKV
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 FRTCGAHLMVVSLFFIPVMCMYLQPPSENSPDQGKFIALFYTVVTPSLNPLIYTLRNKHV
: :::::::.:::::::.::::::::: :: ::::::::::::::::::::::::::: :
CCDS43 FGTCGAHLMAVSLFFIPAMCMYLQPPSGNSQDQGKFIALFYTVVTPSLNPLIYTLRNKVV
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 KGAAKRLLGWEWGK
.::.:::.:::
CCDS43 RGAVKRLMGWE
310
>>CCDS1634.2 OR2C3 gene_id:81472|Hs108|chr1 (320 aa)
initn: 1289 init1: 1234 opt: 1234 Z-score: 998.6 bits: 193.0 E(32554): 2.7e-49
Smith-Waterman score: 1234; 57.8% identity (84.3% similar) in 306 aa overlap (1-306:1-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MMIKKNASSEDFFILLGFSNWPQLEVVLFVVILIFYLMTLTGNLFIIILSYVDSHLHTPM
:: :.:: . :.:::::. :.::.:::.:.: ::.... :: .::..:..: ::::::
CCDS16 MMEIANVSSPEVFVLLGFSTRPSLETVLFIVVLSFYMVSILGNGIIILVSHTDVHLHTPM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 YFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLRGPEKTISYAGCMVQLYFVLALGIAECVLLVVMS
::::.:: :::. .::: .::::.:: ::.:::::.::.::.:. :: .:::::..::
CCDS16 YFFLANLPFLDMSFTTSIVPQLLANLWGPQKTISYGGCVVQFYISHWLGATECVLLATMS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 YDRYVAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLVAASWVIGFTISALHSSFTFWVPLCGHRLVDHFFC
::::.:.::::::::.:::..: :. :::. :.: : . :..:. .::::. .:::::
CCDS16 YDRYAAICRPLHYTVIMHPQLCLGLALASWLGGLTTSMVGSTLTMLLPLCGNNCIDHFFC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 EVPALLRLSCVDTHANELTLMVMSSIFVLIPLILILTTYGAIARAVLSMQSTTGLQKVFR
:.: ...:.:::: ::. ... : .::..:: :::..:: ::::::...:. : .:.:
CCDS16 EMPLIMQLACVDTSLNEMEMYLASFVFVVLPLGLILVSYGHIARAVLKIRSAEGRRKAFN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 TCGAHLMVVSLFFIPVMCMYLQPPSENSPDQGKFIALFYTVVTPSLNPLIYTLRNKHVKG
::..:. :::::. .. ::::: . .: .::::::::::::::.:::::::::: .::.
CCDS16 TCSSHVAVVSLFYGSIIFMYLQPAKSTSHEQGKFIALFYTVVTPALNPLIYTLRNTEVKS
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 AAKRLLGWEWGK
: ....
CCDS16 ALRHMVLENCCGSAGKLAQI
310 320
>>CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6 (357 aa)
initn: 1274 init1: 1225 opt: 1230 Z-score: 994.9 bits: 192.4 E(32554): 4.3e-49
Smith-Waterman score: 1230; 59.5% identity (84.4% similar) in 301 aa overlap (6-306:5-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MMIKKNASSEDFFILLGFSNWPQLEVVLFVVILIFYLMTLTGNLFIIILSYVDSHLHTPM
: : . :::: ::. : ::. ::..:. :..:. ::: ::..:.:: .:::::
CCDS46 MNWVNKSVPQEFILLVFSDQPWLEIPPFVMFLFSYILTIFGNLTIILVSHVDFKLHTPM
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 YFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLRGPEKTISYAGCMVQLYFVLALGIAECVLLVVMS
::::::::.::::::::..::.:::. . .:.:::.::..::.. :::: .::.::.::
CCDS46 YFFLSNLSLLDLCYTTSTVPQMLVNICNTRKVISYGGCVAQLFIFLALGSTECLLLAVMC
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 YDRYVAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLVAASWVIGFTISALHSSFTFWVPLCGHRLVDHFFC
.::.::.::::::...:: :.: :.::::. ::. :.:.:..:. .:::::. ::::::
CCDS46 FDRFVAICRPLHYSIIMHQRLCFQLAAASWISGFSNSVLQSTWTLKMPLCGHKEVDHFFC
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 EVPALLRLSCVDTHANELTLMVMSSIFVLIPLILILTTYGAIARAVLSMQSTTGLQKVFR
::::::.:::::: ::: :. .: .:.:::. ::: .:. :..::: .::. : .:.:
CCDS46 EVPALLKLSCVDTTANEAELFFISVLFLLIPVTLILISYAFIVQAVLRIQSAEGQRKAFG
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 TCGAHLMVVSLFFIPVMCMYLQPPSENSPDQGKFIALFYTVVTPSLNPLIYTLRNKHVKG
:::.::.:::::. .. ::::::: .: :.::...:: ...: :::::::::::.::
CCDS46 TCGSHLIVVSLFYGTAISMYLQPPSPSSKDRGKMVSLFCGIIAPMLNPLIYTLRNKEVKE
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE5 AAKRLLGWEWGK
: :::.
CCDS46 AFKRLVAKSLLNQEIRNMQMISFAKDTVLTYLTNFSASCPIFVITIENYCNLPQRKFP
300 310 320 330 340 350
>>CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 (309 aa)
initn: 1199 init1: 1199 opt: 1203 Z-score: 974.3 bits: 188.4 E(32554): 6e-48
Smith-Waterman score: 1203; 58.5% identity (84.4% similar) in 301 aa overlap (6-306:5-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MMIKKNASSEDFFILLGFSNWPQLEVVLFVVILIFYLMTLTGNLFIIILSYVDSHLHTPM
: :: :::::::. :.::.:::: .:.:::.::.::. :::.::.: :::::
CCDS31 MGLGNESSLMDFILLGFSDHPRLEAVLFVFVLFFYLLTLVGNFTIIIISYLDPPLHTPM
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 YFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLRGPEKTISYAGCMVQLYFVLALGIAECVLLVVMS
::::::::.::.:.::: :: ::::. :.:::.:.::..:::. :::: .::.::. :.
CCDS31 YFFLSNLSLLDICFTTSLAPQTLVNLQRPKKTITYGGCVAQLYISLALGSTECILLADMA
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 YDRYVAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLVAASWVIGFTISALHSSFTFWVPLCGHRLVDHFFC
:::.:::.::::.:.:.::.:. :.. ::. :.. : .:..::. .::::.. .:::.:
CCDS31 LDRYIAVCKPLHYVVIMNPRLCQQLASISWLSGLASSLIHATFTLQLPLCGNHRLDHFIC
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 EVPALLRLSCVDTHANELTLMVMSSIFVLIPLILILTTYGAIARAVLSMQSTTGLQKVFR
::::::.:.:::: .:::.:.:.: .::.:: :: .:: :..::: ..:. . .:.:
CCDS31 EVPALLKLACVDTTVNELVLFVVSVLFVVIPPALISISYGFITQAVLRIKSVEARHKAFS
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 TCGAHLMVVSLFFIPVMCMYLQPPSENSPDQGKFIALFYTVVTPSLNPLIYTLRNKHVKG
::..:: :: .:. .. .:::: . . ::::::.::::.:::.:::.::::::: .:
CCDS31 TCSSHLTVVIIFYGTIIYVYLQPSDSYAQDQGKFISLFYTMVTPTLNPIIYTLRNKDMKE
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE5 AAKRLLGWEWGK
: ..::
CCDS31 ALRKLLSGKL
300
>>CCDS31119.1 OR2G6 gene_id:391211|Hs108|chr1 (316 aa)
initn: 1212 init1: 1188 opt: 1198 Z-score: 970.2 bits: 187.7 E(32554): 1e-47
Smith-Waterman score: 1198; 55.1% identity (81.4% similar) in 312 aa overlap (2-312:1-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MMIKKNASSEDFFILLGFSNWPQLEVVLFVVILIFYLMTLTGNLFIIILSYVDSHLHTPM
: . : ::: :.:::::. :::: ::..:: ::...: :: .:.. .::.:::::
CCDS31 MEETNNSSEKGFLLLGFSDQPQLERFLFAIILYFYVLSLLGNTALILVCCLDSRLHTPM
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
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CCDS34 ALWKVL-WRGRDSG
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]