FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5443, 313 aa
1>>>pF1KE5443 313 - 313 aa - 313 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.7053+/-0.000439; mu= 18.8679+/- 0.027
mean_var=88.8302+/-23.182, 0's: 0 Z-trim(110.9): 281 B-trim: 2283 in 2/50
Lambda= 0.136080
statistics sampled from 18894 (19391) to 18894 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.593), E-opt: 0.2 (0.227), width: 16
Scan time: 7.090
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 1219 249.9 5.1e-66
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 1168 239.8 5.3e-63
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 1167 239.6 6.1e-63
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 1140 234.3 2.3e-61
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 1022 211.2 2.3e-54
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 1022 211.2 2.3e-54
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 1022 211.2 2.3e-54
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 1001 207.0 3.9e-53
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 918 190.8 3.1e-48
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 909 189.0 1.1e-47
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 906 188.4 1.6e-47
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 903 187.8 2.4e-47
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 903 187.8 2.4e-47
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 903 187.8 2.5e-47
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 891 185.5 1.2e-46
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 887 184.7 2.2e-46
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 880 183.3 5.5e-46
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 868 180.9 2.8e-45
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 844 176.2 7.4e-44
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 770 161.7 1.7e-39
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 540 116.6 6.9e-26
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 520 112.6 1.1e-24
NP_064445 (OMIM: 300822,303700,303900) long-wave-s ( 364) 221 54.0 5.4e-07
NP_001307659 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphat ( 382) 210 51.9 2.5e-06
NP_001391 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphate r ( 382) 210 51.9 2.5e-06
NP_000504 (OMIM: 300821,303700,303800) medium-wave ( 364) 207 51.3 3.6e-06
XP_005274835 (OMIM: 300525) PREDICTED: P2Y purinoc ( 359) 200 49.9 9.3e-06
XP_011543933 (OMIM: 300525) PREDICTED: P2Y purinoc ( 359) 200 49.9 9.3e-06
XP_011544480 (OMIM: 300525) PREDICTED: P2Y purinoc ( 359) 200 49.9 9.3e-06
XP_011544481 (OMIM: 300525) PREDICTED: P2Y purinoc ( 359) 200 49.9 9.3e-06
NP_835230 (OMIM: 300525) P2Y purinoceptor 8 [Homo ( 359) 200 49.9 9.3e-06
XP_005274486 (OMIM: 300525) PREDICTED: P2Y purinoc ( 359) 200 49.9 9.3e-06
XP_011543934 (OMIM: 300525) PREDICTED: P2Y purinoc ( 359) 200 49.9 9.3e-06
XP_006724927 (OMIM: 300525) PREDICTED: P2Y purinoc ( 548) 200 50.1 1.2e-05
XP_006724506 (OMIM: 300525) PREDICTED: P2Y purinoc ( 548) 200 50.1 1.2e-05
NP_005949 (OMIM: 600665) melatonin receptor type 1 ( 350) 194 48.7 2.1e-05
NP_000721 (OMIM: 118444) cholecystokinin receptor ( 428) 193 48.6 2.7e-05
NP_000530 (OMIM: 136880,180380,610445,613731) rhod ( 348) 189 47.7 4.1e-05
NP_003848 (OMIM: 603691) galanin receptor type 2 [ ( 387) 189 47.8 4.4e-05
NP_000612 (OMIM: 103780,164230,181500,182135,60678 ( 471) 187 47.5 6.5e-05
NP_005217 (OMIM: 601965) sphingosine 1-phosphate r ( 378) 183 46.6 9.7e-05
NP_000697 (OMIM: 600821) vasopressin V1a receptor ( 418) 183 46.6 0.0001
NP_003958 (OMIM: 607405) trace amine-associated re ( 337) 181 46.1 0.00012
XP_016874705 (OMIM: 602927) PREDICTED: probable G- ( 415) 180 46.0 0.00016
XP_011518927 (OMIM: 602927) PREDICTED: probable G- ( 415) 180 46.0 0.00016
XP_016874701 (OMIM: 602927) PREDICTED: probable G- ( 434) 180 46.0 0.00016
XP_016874702 (OMIM: 602927) PREDICTED: probable G- ( 434) 180 46.0 0.00016
XP_016874704 (OMIM: 602927) PREDICTED: probable G- ( 434) 180 46.0 0.00016
XP_011518926 (OMIM: 602927) PREDICTED: probable G- ( 434) 180 46.0 0.00016
XP_016874703 (OMIM: 602927) PREDICTED: probable G- ( 434) 180 46.0 0.00016
>>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor (311 aa)
initn: 1219 init1: 1219 opt: 1219 Z-score: 1306.2 bits: 249.9 E(85289): 5.1e-66
Smith-Waterman score: 1219; 59.9% identity (83.4% similar) in 302 aa overlap (4-305:7-308)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MNWVNDSIIQEFILLGFSDRPWLEFPLLVVFLISYTVTIFGNLTIILVSRLDTKLHT
:: : :::.:::. : :: ..:: :: : .:..::: ::..: ::..:::
NP_001 MNDDGKVNASSEGYFILVGFSNWPHLEVVIFVVVLIFYLMTLIGNLFIIILSYLDSHLHT
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60 70 80 90 100 110
pF1KE5 PMYFFLTNLSLLDLCYTTCTVPQMLVNLCSIRKVISYRGCVAQLFIFLALGATEYLLLAV
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NP_001 PMYFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLWGPEKTISYAGCMIQLYFVLALGTTECVLLVV
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120 130 140 150 160 170
pF1KE5 MSFDRFVAICRPLHYSVIMHQRLCLQLAAASWVTGFSNSVWLSTLTLQLPLCDPYVIDHF
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NP_001 MSYDRYAAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLAVASWVSGFTNSALHSSFTFWVPLCGHRQVDHF
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 LCEVPALLKLSCVETTANEAELFLVSELFHLIPLTLILISYAFIVRAVLRIQSAEGRQKA
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NP_001 FCEVPALLRLSCVDTHVNELTLMITSSIFVLIPLILILTSYGAIVRAILRMQSTTGLQKV
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240 250 260 270 280 290
pF1KE5 FGTCGSHLIVVSLFYSTAVSVYLQPPSPSSKDQGKMVSLFYGIIAPMLNPLIYTLRNKEV
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NP_001 FGTCGAHLMAVSLFFIPAMCMYLQPPSGNSQDQGKFIALFYTVVTPSLNPLIYTLRNKVV
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 KEGFKRLVARVFLIKK
. . :::.
NP_001 RGAVKRLMGWE
310
>>NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [Homo (312 aa)
initn: 1198 init1: 1168 opt: 1168 Z-score: 1252.1 bits: 239.8 E(85289): 5.3e-63
Smith-Waterman score: 1168; 56.9% identity (83.2% similar) in 304 aa overlap (4-307:2-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MNWVNDSIIQEFILLGFSDRPWLEFPLLVVFLISYTVTIFGNLTIILVSRLDTKLHTPMY
::.: :.:::::..: :: :.:: : :: .:. :: :::.: :: :::.:::
NP_009 MVNQSSTPGFLLLGFSEHPGLERTLFVVVLTSYLLTLVGNTLIILLSALDPKLHSPMY
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pF1KE5 FFLTNLSLLDLCYTTCTVPQMLVNLCSIRKVISYRGCVAQLFIFLALGATEYLLLAVMSF
:::.:::.::::.:: :::::::: . .:.::. : .:.::::.::.:: .::.::.:
NP_009 FFLSNLSFLDLCFTTSCVPQMLVNLWGPKKTISFLDCSVQIFIFLSLGTTECILLTVMAF
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pF1KE5 DRFVAICRPLHYSVIMHQRLCLQLAAASWVTGFSNSVWLSTLTLQLPLCDPYVIDHFLCE
::.::.:.::::..:.: ::: :::...:: :. .:: . ::.::.: .: :.::
NP_009 DRYVAVCQPLHYATIIHPRLCWQLASVAWVIGLVESVVQTPSTLHLPFCPDRQVDDFVCE
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190 200 210 220 230 240
pF1KE5 VPALLKLSCVETTANEAELFLVSELFHLIPLTLILISYAFIVRAVLRIQSAEGRQKAFGT
::::..::: .:. :: .. ..: .. ..::.:::.::. :. :::::.::.::.:::::
NP_009 VPALIRLSCEDTSYNEIQVAVASVFILVVPLSLILVSYGAITWAVLRINSAKGRRKAFGT
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250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CGSHLIVVSLFYSTAVSVYLQPPSPSSKDQGKMVSLFYGIIAPMLNPLIYTLRNKEVKEG
:.::: ::.::::....::::: .: ....::. .:::.. .: ::::::::::::: ..
NP_009 CSSHLTVVTLFYSSVIAVYLQPKNPYAQERGKFFGLFYAVGTPSLNPLIYTLRNKEVTRA
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE5 FKRLVARVFLIKK
:.::...
NP_009 FRRLLGKEMGLTQS
300 310
>>NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 [Ho (314 aa)
initn: 1185 init1: 1155 opt: 1167 Z-score: 1251.0 bits: 239.6 E(85289): 6.1e-63
Smith-Waterman score: 1167; 58.4% identity (82.3% similar) in 305 aa overlap (1-305:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MNWVNDSIIQEFILLGFSDRPWLEFPLLVVFLISYTVTIFGNLTIILVSRLDTKLHTPMY
:. .: : .:::::::::: :: :.::.::.: .:. :: ::::::::: .::::::
NP_001 MDGTNGSTQTHFILLGFSDRPHLERILFVVILIAYLLTLVGNTTIILVSRLDPHLHTPMY
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pF1KE5 FFLTNLSLLDLCYTTCTVPQMLVNLCSIRKVISYRGCVAQLFIFLALGATEYLLLAVMSF
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pF1KE5 DRFVAICRPLHYSVIMHQRLCLQLAAASWVTGFSNSVWLSTLTLQLPLCDPYVIDHFLCE
:: ::::.:::: :::. ::: :....: : .::. .: .::.:: : . .:::: :
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pF1KE5 VPALLKLSCVETTANEAELFLVSELFHLIPLTLILISYAFIVRAVLRIQSAEGRQKAFGT
.:::....:: :.: :. .:... : ::..::.::..::::::.:.:: ::::::::
NP_001 MPALIRMACVSTVAIEGTVFVLAVGVVLSPLVFILLSYSYIVRAVLQIRSASGRQKAFGT
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pF1KE5 CGSHLIVVSLFYSTAVSVYLQPPSPSSKDQGKMVSLFYGIIAPMLNPLIYTLRNKEVKEG
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NP_001 CGSHLTVVSLFYGNIIYMYMQPGASSSQDQGMFLMLFYNIVTPLLNPLIYTLRNREVKGA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 FKRLVARVFLIKK
. ::.
NP_001 LGRLLLGKRELGKE
310
>>XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory recep (300 aa)
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Smith-Waterman score: 1140; 57.6% identity (82.7% similar) in 295 aa overlap (4-298:2-296)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MNWVNDSIIQEFILLGFSDRPWLEFPLLVVFLISYTVTIFGNLTIILVSRLDTKLHTPMY
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XP_011 MVNQSSTPGFLLLGFSEHPGLERTLFVVVLTSYLLTLVGNTLIILLSALDPKLHSPMY
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pF1KE5 FFLTNLSLLDLCYTTCTVPQMLVNLCSIRKVISYRGCVAQLFIFLALGATEYLLLAVMSF
:::.:::.::::.:: :::::::: . .:.::. : .:.::::.::.:: .::.::.:
XP_011 FFLSNLSFLDLCFTTSCVPQMLVNLWGPKKTISFLDCSVQIFIFLSLGTTECILLTVMAF
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pF1KE5 DRFVAICRPLHYSVIMHQRLCLQLAAASWVTGFSNSVWLSTLTLQLPLCDPYVIDHFLCE
::.::.:.::::..:.: ::: :::...:: :. .:: . ::.::.: .: :.::
XP_011 DRYVAVCQPLHYATIIHPRLCWQLASVAWVIGLVESVVQTPSTLHLPFCPDRQVDDFVCE
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pF1KE5 VPALLKLSCVETTANEAELFLVSELFHLIPLTLILISYAFIVRAVLRIQSAEGRQKAFGT
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XP_011 VPALIRLSCEDTSYNEIQVAVASVFILVVPLSLILVSYGAITWAVLRINSAKGRRKAFGT
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pF1KE5 CGSHLIVVSLFYSTAVSVYLQPPSPSSKDQGKMVSLFYGIIAPMLNPLIYTLRNKEVKEG
:.::: ::.::::....::::: .: ....::. .:::.. .: :::::::::::: :
XP_011 CSSHLTVVTLFYSSVIAVYLQPKNPYAQERGKFFGLFYAVGTPSLNPLIYTLRNKEQKRR
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE5 FKRLVARVFLIKK
XP_011 GS
300
>>XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
initn: 1045 init1: 1011 opt: 1022 Z-score: 1097.1 bits: 211.2 E(85289): 2.3e-54
Smith-Waterman score: 1022; 50.3% identity (81.5% similar) in 302 aa overlap (5-305:5-305)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MNWVNDSIIQEFILLGFSDRPW-LEFPLLVVFLISYTVTIFGNLTIILVSRLDTKLHTPM
:.. ..::::::.:. : . :.:.::. :.::..:: :.:. :::..:::::
XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSS-DWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPM
10 20 30 40 50
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pF1KE5 YFFLTNLSLLDLCYTTCTVPQMLVNLCSIRKVISYRGCVAQLFIFLALGATEYLLLAVMS
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XP_011 YFFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMA
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pF1KE5 FDRFVAICRPLHYSVIMHQRLCLQLAAASWVTGFSNSVWLSTLTLQLPLCDPYVIDHFLC
.::.::.: :.::.::: :: .:: .:::.:: .: ...:.:::.: :::. :
XP_011 YDRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISC
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pF1KE5 EVPALLKLSCVETTANEAELFLVSELFHLIPLTLILISYAFIVRAVLRIQSAEGRQKAFG
:. :...:.::.:..::. ... : .. . :. :.:.:: :. ..:.::: :::.:::
XP_011 ELLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFH
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pF1KE5 TCGSHLIVVSLFYSTAVSVYLQPPSPSSKDQGKMVSLFYGIIAPMLNPLIYTLRNKEVKE
::.::: ::.: :..:. .:.:: : : : :. :.::.:..:::::.::.:::::::
XP_011 TCASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKG
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 GFKRLVARVFLIKK
....:.
XP_011 AWQKLLWKFSGLTSKLAT
300 310
>>XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
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Smith-Waterman score: 1022; 50.3% identity (81.5% similar) in 302 aa overlap (5-305:5-305)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MNWVNDSIIQEFILLGFSDRPW-LEFPLLVVFLISYTVTIFGNLTIILVSRLDTKLHTPM
:.. ..::::::.:. : . :.:.::. :.::..:: :.:. :::..:::::
XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSS-DWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPM
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 YFFLTNLSLLDLCYTTCTVPQMLVNLCSIRKVISYRGCVAQLFIFLALGATEYLLLAVMS
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XP_011 YFFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMA
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 FDRFVAICRPLHYSVIMHQRLCLQLAAASWVTGFSNSVWLSTLTLQLPLCDPYVIDHFLC
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XP_011 YDRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISC
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 EVPALLKLSCVETTANEAELFLVSELFHLIPLTLILISYAFIVRAVLRIQSAEGRQKAFG
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XP_011 ELLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFH
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 TCGSHLIVVSLFYSTAVSVYLQPPSPSSKDQGKMVSLFYGIIAPMLNPLIYTLRNKEVKE
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XP_011 TCASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKG
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 GFKRLVARVFLIKK
....:.
XP_011 AWQKLLWKFSGLTSKLAT
300 310
>>NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [Homo (317 aa)
initn: 1045 init1: 1011 opt: 1022 Z-score: 1097.1 bits: 211.2 E(85289): 2.3e-54
Smith-Waterman score: 1022; 50.3% identity (81.5% similar) in 302 aa overlap (5-305:5-305)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MNWVNDSIIQEFILLGFSDRPW-LEFPLLVVFLISYTVTIFGNLTIILVSRLDTKLHTPM
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NP_036 MGTDNQTWVSEFILLGLSS-DWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPM
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 YFFLTNLSLLDLCYTTCTVPQMLVNLCSIRKVISYRGCVAQLFIFLALGATEYLLLAVMS
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NP_036 YFFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMA
60 70 80 90 100 110
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pF1KE5 FDRFVAICRPLHYSVIMHQRLCLQLAAASWVTGFSNSVWLSTLTLQLPLCDPYVIDHFLC
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NP_036 YDRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISC
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 EVPALLKLSCVETTANEAELFLVSELFHLIPLTLILISYAFIVRAVLRIQSAEGRQKAFG
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NP_036 ELLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFH
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 TCGSHLIVVSLFYSTAVSVYLQPPSPSSKDQGKMVSLFYGIIAPMLNPLIYTLRNKEVKE
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NP_036 TCASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKG
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 GFKRLVARVFLIKK
....:.
NP_036 AWQKLLWKFSGLTSKLAT
300 310
>>NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [Homo (308 aa)
initn: 1013 init1: 831 opt: 1001 Z-score: 1075.0 bits: 207.0 E(85289): 3.9e-53
Smith-Waterman score: 1001; 50.5% identity (78.0% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MNWVNDSIIQEFILLGFSDRPWLEFPLLVVFLISYTVTIFGNLTIILVSRLDTKLHTPMY
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NP_003 MRQINQTQVTEFLLLGLSDGPHTEQLLFIVLLGVYLVTVLGNLLLISLVHVDSQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
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pF1KE5 FFLTNLSLLDLCYTTCTVPQMLVNLCSIRKVISYRGCVAQLFIFLALGATEYLLLAVMSF
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NP_003 FFLCNLSLADLCFSTNIVPQALVHLLSRKKVIAFTLCAARLLFFLIFGCTQCALLAVMSY
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pF1KE5 DRFVAICRPLHYSVIMHQRLCLQLAAASWVTGFSNSVWLSTLTLQLPLCDPYVIDHFLCE
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NP_003 DRYVAICNPLRYPNIMTWKVCVQLATGSWTSGILVSVVDTTFILRLPYRGSNSIAHFFCE
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pF1KE5 VPALLKLSCVETTANEAELFLVSELFHLIPLTLILISYAFIVRAVLRIQSAEGRQKAFGT
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NP_003 APALLILASTDTHASEMAIFLMGVVILLIPVFLILVSYGRIIVTVVKMKSTVGSLKAFST
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pF1KE5 CGSHLIVVSLFYSTAVSVYLQPPSPSSKDQGKMVSLFYGIIAPMLNPLIYTLRNKEVKEG
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NP_003 CGSHLMVVILFYGSAIITYMTPK--SSKQQEKSVSVFYAIVTPMLNPLIYSLRNKDVKAA
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310
pF1KE5 FKRLVARVFLIKK
......: :
NP_003 LRKVATRNFP
300
>>NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN1 [H (311 aa)
initn: 942 init1: 915 opt: 918 Z-score: 986.9 bits: 190.8 E(85289): 3.1e-48
Smith-Waterman score: 918; 44.6% identity (75.9% similar) in 303 aa overlap (5-307:6-308)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MNWVNDSIIQEFILLGFSDRPWLEFPLLVVFLISYTVTIFGNLTIILVSRLDTKLHTPM
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NP_001 MTGGGNITEITYFILLGFSDFPRIIKVLFTIFLVIYITSLAWNLSLIVLIRMDSHLHTPM
10 20 30 40 50 60
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pF1KE5 YFFLTNLSLLDLCYTTCTVPQMLVNLCSIRKVISYRGCVAQLFIFLALGATEYLLLAVMS
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NP_001 YFFLSNLSFIDVCYISSTVPKMLSNLLQEQQTITFVGCIIQYFIFSTMGLSESCLMTAMA
70 80 90 100 110 120
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pF1KE5 FDRFVAICRPLHYSVIMHQRLCLQLAAASWVTGFSNSVWLSTLTLQLPLCDPYVIDHFLC
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NP_001 YDRYAAICNPLLYSSIMSPTLCVWMVLGAYMTGLTASLFQIGALLQLHFCGSNVIRHFFC
130 140 150 160 170 180
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pF1KE5 EVPALLKLSCVETTANEAELFLVSELFHLIPLTLILISYAFIVRAVLRIQSAEGRQKAFG
..: :: :::..: .. ... .: . .:.:::..: ....: ::.::.:::.
NP_001 DMPQLLILSCTDTFFVQVMTAILTMFFGIASALVIMISYGYIGISIMKITSAKGRSKAFN
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240 250 260 270 280 290
pF1KE5 TCGSHLIVVSLFYSTAVSVYLQPPSPSSKDQGKMVSLFYGIIAPMLNPLIYTLRNKEVKE
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NP_001 TCASHLTAVSLFYTSGIFVYLSSSSGGSSSFDRFASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEIKD
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 GFKRLVARVFLIKK
..::: :
NP_001 ALKRLQKRKCC
310
>>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo (314 aa)
initn: 952 init1: 904 opt: 909 Z-score: 977.3 bits: 189.0 E(85289): 1.1e-47
Smith-Waterman score: 909; 43.0% identity (78.5% similar) in 307 aa overlap (1-307:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MNWVNDSIIQEFILLGFSDRPWLEFPLLVVFLISYTVTIFGNLTIILVSRLDTKLHTPMY
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NP_003 MTRKNYTSLTEFVLLGLADTLELQIILFLFFLVIYTLTVLGNLGMILLIRIDSQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FFLTNLSLLDLCYTTCTVPQMLVNLCSIRKVISYRGCVAQLFIFLALGATEYLLLAVMSF
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NP_003 FFLANLSFVDVCNSTTITPKMLADLLSEKKTISFAGCFLQMYFFISLATTECILFGLMAY
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pF1KE5 DRFVAICRPLHYSVIMHQRLCLQLAAASWVTGFSNSVWLSTLTLQLPLCDPYVIDHFLCE
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NP_003 DRYAAICRPLLYSLIMSRTVYLKMAAGAFAAGLLNFMVNTSHVSSLSFCDSNVIHHFFCD
130 140 150 160 170 180
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NP_003 SPPLFKLSCSDTILKESISSILAGVNIVGTLLVILSSYSYVLFSIFSMHSGEGRHRAFST
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pF1KE5 CGSHLIVVSLFYSTAVSVYLQPPSPSSKDQGKMVSLFYGIIAPMLNPLIYTLRNKEVKEG
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NP_003 CASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRSKEVKKA
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NP_003 LANVISRKRTSSFL
310
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]