FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5438, 315 aa
1>>>pF1KE5438 315 - 315 aa - 315 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3875+/-0.00134; mu= 9.8138+/- 0.078
mean_var=194.7178+/-67.531, 0's: 0 Z-trim(101.3): 456 B-trim: 354 in 1/49
Lambda= 0.091912
statistics sampled from 5916 (6467) to 5916 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.54), E-opt: 0.2 (0.199), width: 16
Scan time: 2.060
The best scores are: opt bits E(32554)
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CCDS53391.1 OR6P1 gene_id:128366|Hs108|chr1 ( 317) 918 135.3 6e-32
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CCDS32017.1 OR11H12 gene_id:440153|Hs108|chr14 ( 326) 878 130.0 2.4e-30
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CCDS7773.1 OR10A5 gene_id:144124|Hs108|chr11 ( 317) 864 128.2 8.6e-30
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CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 854 126.8 2.1e-29
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CCDS43672.1 OR2A14 gene_id:135941|Hs108|chr7 ( 310) 850 126.3 3.1e-29
CCDS11019.1 OR1D2 gene_id:4991|Hs108|chr17 ( 312) 849 126.2 3.4e-29
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 849 126.2 3.4e-29
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 848 126.0 3.7e-29
CCDS41916.1 OR4E2 gene_id:26686|Hs108|chr14 ( 313) 843 125.4 5.8e-29
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CCDS58499.1 OR1D5 gene_id:8386|Hs108|chr17 ( 312) 840 125.0 7.7e-29
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CCDS30898.1 OR10R2 gene_id:343406|Hs108|chr1 ( 335) 840 125.0 8e-29
CCDS7783.1 OR5P3 gene_id:120066|Hs108|chr11 ( 311) 837 124.6 1e-28
CCDS43115.1 OR5K1 gene_id:26339|Hs108|chr3 ( 308) 836 124.4 1.1e-28
CCDS11024.1 OR1E1 gene_id:8387|Hs108|chr17 ( 314) 836 124.4 1.1e-28
CCDS31514.1 OR10AG1 gene_id:282770|Hs108|chr11 ( 301) 835 124.3 1.2e-28
CCDS43667.1 OR6B1 gene_id:135946|Hs108|chr7 ( 311) 833 124.0 1.5e-28
CCDS31095.1 OR6F1 gene_id:343169|Hs108|chr1 ( 308) 832 123.9 1.6e-28
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 832 123.9 1.6e-28
CCDS35087.1 OR13F1 gene_id:138805|Hs108|chr9 ( 319) 832 123.9 1.6e-28
CCDS43433.1 OR2J3 gene_id:442186|Hs108|chr6 ( 311) 830 123.6 1.9e-28
>>CCDS34363.1 OR11A1 gene_id:26531|Hs108|chr6 (315 aa)
initn: 2030 init1: 2030 opt: 2030 Z-score: 1484.0 bits: 282.8 E(32554): 2.4e-76
Smith-Waterman score: 2030; 99.4% identity (100.0% similar) in 315 aa overlap (1-315:1-315)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MEIVSTGNETITEFVLLGFYDIPELHFLFFIVFTAVYVFIIIGNMLIIVAVVSSQRLHKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MEIVSTGNETITEFVLLGFYDIPELHFLFFIVFTAVYVFIIIGNMLIIVAVVSSQRLHKP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 MYIFLANLSFLDIFYTSAVMPKMLEGFLQEATISVAGCLLQFFIFGSLATAECLLLAVMA
:::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MYIFLANLSFLDILYTSAVMPKMLEGFLQEATISVAGCLLQFFIFGSLATAECLLLAVMA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 YDRYLAICYPLHYPLLMGPRRYMGLVVTTWLSGFVVDGLVVALVTQLRFCGPNHIDQFYC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::
CCDS34 YDRYLAICYPLHYPLLMGPRRYMGLVVTTWLSGFVVDGLVVALVAQLRFCGPNHIDQFYC
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190 200 210 220 230 240
pF1KE5 DFMLFVGLACSDPRVAQVTTLILSVFCLTIPFGLILTSYARIVVAVLRVPAGASRRRAFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 DFMLFVGLACSDPRVAQVTTLILSVFCLTIPFGLILTSYARIVVAVLRVPAGASRRRAFS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 TCSSHLAVVTTFYGTLMIFYVAPSAVHSQLLSKVFSLLYTVVTPLFNPVIYTMRNKEVHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TCSSHLAVVTTFYGTLMIFYVAPSAVHSQLLSKVFSLLYTVVTPLFNPVIYTMRNKEVHQ
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 ALRKILCIKQTETLD
:::::::::::::::
CCDS34 ALRKILCIKQTETLD
310
>>CCDS46559.1 OR6B2 gene_id:389090|Hs108|chr2 (312 aa)
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Smith-Waterman score: 939; 45.7% identity (79.1% similar) in 302 aa overlap (11-311:9-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MEIVSTGNETITEFVLLGFYDIPELHFLFFIVFTAVYVFIIIGNMLIIVAVVSSQRLHKP
.. :.:.:. : :..:.:..: .:.:... :. ::. : :: ::.:
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70 80 90 100 110
pF1KE5 MYIFLANLSFLDIFYTSAVMPKMLEGFL-QEATISVAGCLLQFFIFGSLATAECLLLAVM
:: ::...:::.:.:.: . :::::::: :. :: .::. :...:.::. .::.::: :
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pF1KE5 AYDRYLAICYPLHYPLLMGPRRYMGLVVTTWLSGFVVDGLVVALVTQLRFCGPNHIDQFY
:::::.:::.::.: .:. : . :: ...:::... . : ..... ::: : ...:.
CCDS46 AYDRYVAICHPLRYHVLVTPGLCLQLVGFSFVSGFTISMIKVCFISSVTFCGSNVLNHFF
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180 190 200 210 220 230
pF1KE5 CDFMLFVGLACSDPRVAQVTTLILSVFCLTIPFGLILTSYARIVVAVLRVPAGASRRRAF
::. .. :::.: .:... .::. . :..:. . :: .:..::::.:.... :::
CCDS46 CDISPILKLACTDFSTAELVDFILAFIILVFPLLATILSYWHITLAVLRIPSATGCWRAF
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 STCSSHLAVVTTFYGTLMIFYVAPSAVHSQLLSKVFSLLYTVVTPLFNPVIYTMRNKEVH
:::.:::.:::.:: .:...:: :.:. :: .:..: .::::::..::.:: .:::: .
CCDS46 STCASHLTVVTVFYTALLFMYVRPQAIDSQSSNKLISAVYTVVTPIINPLIYCLRNKEFK
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 QALRKILCIKQTETLD
.::.: : . ::
CCDS46 DALKKALGLGQTSH
300 310
>>CCDS42837.1 OR6B3 gene_id:150681|Hs108|chr2 (331 aa)
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Smith-Waterman score: 932; 45.8% identity (80.0% similar) in 295 aa overlap (11-304:9-303)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MEIVSTGNETITEFVLLGFYDIPELHFLFFIVFTAVYVFIIIGNMLIIVAVVSSQRLHKP
. :.:.:: : :..:.:..: .:.:... :. ::..: :: ::.:
CCDS42 MSGENVTRVGTFILVGFPTAPGLQYLLFLLFLLTYLFVLVENLAIILTVWSSTSLHRP
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pF1KE5 MYIFLANLSFLDIFYTSAVMPKMLEGFL-QEATISVAGCLLQFFIFGSLATAECLLLAVM
:: ::...:::.:.:.: . :::::::: :. :: .::. :...:.::. .::.::: :
CCDS42 MYYFLSSMSFLEIWYVSDITPKMLEGFLLQQKRISFVGCMTQLYFFSSLVCTECVLLASM
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pF1KE5 AYDRYLAICYPLHYPLLMGPRRYMGLVVTTWLSGFVVDGLVVALVTQLRFCGPNHIDQFY
:::::.:::.::.: .:. : . :: ...:::... . : ..... ::: : ...:.
CCDS42 AYDRYVAICHPLRYHVLVTPGLCLQLVGFSFVSGFTISMIKVCFISSVTFCGSNVLNHFF
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pF1KE5 CDFMLFVGLACSDPRVAQVTTLILSVFCLTIPFGLILTSYARIVVAVLRVPAGASRRRAF
::. .. :::.: .:... .::. . :..:. . :::.:..::::.:.... :::
CCDS42 CDISPILKLACTDFSTAELVDFILAFIILVFPLLATMLSYAHITLAVLRIPSATGCWRAF
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240 250 260 270 280 290
pF1KE5 STCSSHLAVVTTFYGTLMIFYVAPSAVHSQLLSKVFSLLYTVVTPLFNPVIYTMRNKEVH
::.:::.:::.:: .:...:: :.:. :. .:..:.::::.::..::.:: .:::: .
CCDS42 FTCASHLTVVTVFYTALLFMYVRPQAIDSRSSNKLISVLYTVITPILNPLIYCLRNKEFK
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300 310
pF1KE5 QALRKILCIKQTETLD
.::.:
CCDS42 NALKKAFGLTSCAVEGRLSSLLELHLQIHSQPL
300 310 320 330
>>CCDS32033.1 OR11H6 gene_id:122748|Hs108|chr14 (330 aa)
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Smith-Waterman score: 919; 47.3% identity (77.0% similar) in 300 aa overlap (11-306:27-323)
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pF1KE5 MEIVSTGNETITEFVLLGFYDIPELHFLFFIVFTAVYVFIIIGN
.::::::::. :.. :: . ..:.. ..::
CCDS32 MFFIIHSLVTSVFLTALGPQNRTMHFVTEFVLLGFHGQREMQSCFFSFILVLYLLTLLGN
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:. :: ..::: ::::.:.:..::.:.: :...:.:: ..:.: ::: .::.:::.
CCDS32 GAIVCAVKLDRRLHTPMYILLGNFAFLEIWYISSTVPNMLVNILSEIKTISFSGCFLQFY
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pF1KE5 IFGSLATAECLLLAVMAYDRYLAICYPLHYPLLMGPRRYMGLVVTTWLSGFVVDGLVVAL
.: ::.:.::..:.::::::::::: ::::: .: . . :: . :..::. . ..:
CCDS32 FFFSLGTTECFFLSVMAYDRYLAICRPLHYPSIMTGKFCIILVCVCWVGGFLCYPVPIVL
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..:: ::::: ::.. :: . .::: . : : :: .: : :: :: ::.
CCDS32 ISQLPFCGPNIIDHLVCDPGPLFALACIS---APSTELICYTFNSMIIFGPFLSILGSYT
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230 240 250 260 270 280
pF1KE5 RIVVAVLRVPAGASRRRAFSTCSSHLAVVTTFYGTLMIFYVAPSAVHSQLLSKVFSLLYT
.. ::: .:.::.: .:::::.::: ::. ::::::..::.:.. . ..:...:.::
CCDS32 LVIRAVLCIPSGAGRTKAFSTCGSHLMVVSLFYGTLMVMYVSPTSGNPAGMQKIITLVYT
240 250 260 270 280 290
290 300 310
pF1KE5 VVTPLFNPVIYTMRNKEVHQALRKILCIKQTETLD
..::..::.::..:::....::...:
CCDS32 AMTPFLNPLIYSLRNKDMKDALKRVLGLTVSQN
300 310 320 330
>>CCDS53391.1 OR6P1 gene_id:128366|Hs108|chr1 (317 aa)
initn: 684 init1: 684 opt: 918 Z-score: 687.1 bits: 135.3 E(32554): 6e-32
Smith-Waterman score: 918; 42.0% identity (78.7% similar) in 305 aa overlap (1-304:1-303)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MEIVSTGNETITEFVLLGFYDIPELHFLFFIVFTAVYVFIIIGNMLIIVAVVSSQRLHKP
:. .: :. . ::::.:: : :..:.:..: :.:.. .. : ::. .. . ::.:
CCDS53 MRNLSGGH--VEEFVLVGFPTTPPLQLLLFVLFFAIYLLTLLENALIVFTIWLAPSLHRP
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pF1KE5 MYIFLANLSFLDIFYTSAVMPKMLEGFL-QEATISVAGCLLQFFIFGSLATAECLLLAVM
::.::..::::...: ....:..: .:: :.. .: .::. :...: .:: .::.:::::
CCDS53 MYFFLGHLSFLELWYINVTIPRLLAAFLTQDGRVSYVGCMTQLYFFIALACTECVLLAVM
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pF1KE5 AYDRYLAICYPLHYPLLMGPRRYMGLVVTTWLSGFVVDGLVVALVTQLRFCGPNHIDQFY
::::::::: :: :: :: :....: ::: . . . ...:: .:::: :..:.
CCDS53 AYDRYLAICGPLLYPSLMPSSLATRLAAASWGSGFFSSMMKLLFISQLSYCGPNIINHFF
120 130 140 150 160 170
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pF1KE5 CDFMLFVGLACSDPRVAQVTTLILSVFCLTIPFGLILTSYARIVVAVLRVPAGASRRRAF
::. ...:.::: . :... ..:.. . .:. ...::. :..:.::.:.. .:..::
CCDS53 CDISPLLNLTCSDKEQAELVDFLLALVMILLPLLAVVSSYTAIIAAILRIPTSRGRHKAF
180 190 200 210 220 230
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pF1KE5 STCSSHLAVVTTFYGTLMIFYVAPSAVHSQLLSKVFSLLYTVVTPLFNPVIYTMRNKEVH
:::..:::::. .:.. .. :. : :... .:..:.:::...:.:::.:: .:::::.
CCDS53 STCAAHLAVVVIYYSSTLFTYARPRAMYTFNHNKIISVLYTIIVPFFNPAIYCLRNKEVK
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 QALRKILCIKQTETLD
.:.::
CCDS53 EAFRKTVMGRCHYPRDVQD
300 310
>>CCDS32034.1 OR11H4 gene_id:390442|Hs108|chr14 (324 aa)
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Smith-Waterman score: 914; 46.0% identity (77.5% similar) in 302 aa overlap (6-306:14-315)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MEIVSTGNETITEFVLLGFYDIPELHFLFFIVFTAVYVFIIIGNMLIIVAVV
.... .:::.:::: ......: .: ..::. ..:: :: ::
CCDS32 MSFFFVDLRPMNRSATHIVTEFILLGFPGCWKIQIFLFSLFLVIYVLTLLGNGAIIYAVR
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 SSQRLHKPMYIFLANLSFLDIFYTSAVMPKMLEGFLQEA-TISVAGCLLQFFIFGSLATA
. :: :::..:.:..::.:.:.:...:.:: ..:... .:: .::.:::..: ::.:.
CCDS32 CNPLLHTPMYFLLGNFAFLEIWYVSSTIPNMLVNILSKTKAISFSGCFLQFYFFFSLGTT
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 ECLLLAVMAYDRYLAICYPLHYPLLMGPRRYMGLVVTTWLSGFVVDGLVVALVTQLRFCG
:::.:::::::::::::.::.:: .: : :: :: ::. . . ..:: :::
CCDS32 ECLFLAVMAYDRYLAICHPLQYPAIMTVRFCGKLVSFCWLIGFLGYPIPIFYISQLPFCG
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 PNHIDQFYCDFMLFVGLACSDPRVAQVTTLILSVFCLTIPFGLILTSYARIVVAVLRVPA
:: ::.: ::. ...:.:. ... : . : . :: :: ...::..::.
CCDS32 PNIIDHFLCDMDPLMALSCAPAPITECIFYTQSSLVLFFTSMYILRSYILLLTAVFQVPS
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 GASRRRAFSTCSSHLAVVTTFYGTLMIFYVAPSAVHSQLLSKVFSLLYTVVTPLFNPVIY
.:.::.:::::.:::.::. ::::.:..::.:. ::.:...:.:.:.::::::.::
CCDS32 AAGRRKAFSTCGSHLVVVSLFYGTVMVMYVSPTYGIPTLLQKILTLVYSVTTPLFNPLIY
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 TMRNKEVHQALRKILCIKQTETLD
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CCDS32 TLRNKDMKLALRNVLFGMRIRQNS
310 320
>>CCDS32032.1 OR11G2 gene_id:390439|Hs108|chr14 (345 aa)
initn: 918 init1: 673 opt: 914 Z-score: 683.8 bits: 134.8 E(32554): 9.1e-32
Smith-Waterman score: 914; 47.0% identity (78.0% similar) in 300 aa overlap (6-304:42-341)
10 20 30
pF1KE5 MEIVSTGNETITEFVLLGFYDIPELHFLFFIVFTA
... :.: :.:::: : ..:.:..::.
CCDS32 NLIPHLCLHRHSVIAGAFTIHRHMKIFNSPSNSSTFTGFILLGFPCPREGQILLFVLFTV
20 30 40 50 60 70
40 50 60 70 80 90
pF1KE5 VYVFIIIGNMLIIVAVVSSQRLHKPMYIFLANLSFLDIFYTSAVMPKMLEGFLQEATI-S
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CCDS32 VYLLTLMGNGSIICAVHWDQRLHAPMYILLANFSFLEICYVTSTVPSMLANFLSDTKIIS
80 90 100 110 120 130
100 110 120 130 140 150
pF1KE5 VAGCLLQFFIFGSLATAECLLLAVMAYDRYLAICYPLHYPLLMGPRRYMGLVVTTWLSGF
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CCDS32 FSGCFLQFYFFFSLGSTECFFLAVMAFDRYLAICRPLRYPTIMTRRLCTNLVVNCWVLGF
140 150 160 170 180 190
160 170 180 190 200 210
pF1KE5 VVDGLVVALVTQLRFCGPNHIDQFYCDFMLFVGLACSDPRVAQVTTLILSVFCLTIPFGL
. . .. ..:. ::: ::.: :: .. :.:. : ... .:: . . . : .
CCDS32 IWFLIPIVNISQMSFCGSRIIDHFLCDPAPLLTLTCKKGPVIELVFSVLSPLPVFMLFLF
200 210 220 230 240 250
220 230 240 250 260 270
pF1KE5 ILTSYARIVVAVLRVPAGASRRRAFSTCSSHLAVVTTFYGTLMIFYVAPSAVHSQLLSKV
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CCDS32 IVGSYALVVRAVLRVPSAAGRRKAFSTCGSHLAVVSLFYGSVLVMYGSPPSKNEAGKQKT
260 270 280 290 300 310
280 290 300 310
pF1KE5 FSLLYTVVTPLFNPVIYTMRNKEVHQALRKILCIKQTETLD
.:.:.:::::.:::::..:::....::.:
CCDS32 VTLFYSVVTPLLNPVIYSLRNKDMRKALKKFWGT
320 330 340
>>CCDS31098.1 OR11L1 gene_id:391189|Hs108|chr1 (322 aa)
initn: 911 init1: 672 opt: 910 Z-score: 681.3 bits: 134.3 E(32554): 1.3e-31
Smith-Waterman score: 910; 46.3% identity (77.5% similar) in 298 aa overlap (10-306:8-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MEIVSTGNETITEFVLLGFYDIPELHFLFFIVFTAVYVFIIIGNMLIIVAVVSSQRLHKP
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CCDS31 MEPQNTSTVTNFQLLGFQNLLEWQALLFVIFLLIYCLTIIGNVVIITVVSQGLRLHSP
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE5 MYIFLANLSFLDIFYTSAVMPKMLEGFLQEA-TISVAGCLLQFFIFGSLATAECLLLAVM
::.:: .::::...:::...: .: ..:. . .:: ..:. :...: :...::.::: :
CCDS31 MYMFLQHLSFLEVWYTSTTVPLLLANLLSWGQAISFSACMAQLYFFVFLGATECFLLAFM
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 AYDRYLAICYPLHYPLLMGPRRYMGLVVTTWLSGFVVDGLVVALVTQLRFCGPNHIDQFY
::::::::: ::.::.:: :::..: .: . : ....: ::: :.:..:.
CCDS31 AYDRYLAICSPLRYPFLMHRGLCARLVVVSWCTGVSTGFLPSLMISRLDFCGRNQINHFF
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 CDFMLFVGLACSDPRVAQVTTLILSVFCLTIPFGLILTSYARIVVAVLRVPAGASRRRAF
::. .. :.:: ...:: .:::. : : : : : :. :: ..::.:. ..::..:
CCDS31 CDLPPLMQLSCSRVYITEVTIFILSIAVLCICFFLTLGPYVFIVSSILRIPSTSGRRKTF
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 STCSSHLAVVTTFYGTLMIFYVAPSAVHSQLLSKVFSLLYTVVTPLFNPVIYTMRNKEVH
:::.::::::: .:::.. .:: :: ..:..:..:::::::.:::::..:::. .
CCDS31 STCGSHLAVVTLYYGTMISMYVCPSPHLLPEINKIISVFYTVVTPLLNPVIYSLRNKDFK
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 QALRKILCIKQTETLD
.:.::..
CCDS31 EAVRKVMRRKCGILWSTSKRKFLY
300 310 320
>>CCDS7772.1 OR6A2 gene_id:8590|Hs108|chr11 (327 aa)
initn: 910 init1: 667 opt: 905 Z-score: 677.6 bits: 133.6 E(32554): 2e-31
Smith-Waterman score: 905; 43.5% identity (76.5% similar) in 310 aa overlap (11-315:10-319)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MEIVSTGNETITEFVLLGFYDIPELHFLFFIVFTAVYVFIIIGNMLIIVAVVSSQRLHKP
..::::::: :. :.: .. .::... : :::.:. . . ::::
CCDS77 MEWRNHSGRVSEFVLLGFPAPAPLQVLLFALLLLAYVLVLTENTLIIMAIRNHSTLHKP
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE5 MYIFLANLSFLDIFYTSAVMPKMLEGFL---QE--ATISVAGCLLQFFIFGSLATAECLL
::.::::.:::.:.:.....:::: ::. :. :: ::. :...: .:. .::.:
CCDS77 MYFFLANMSFLEIWYVTVTIPKMLAGFVGSKQDHGQLISFEGCMTQLYFFLGLGCTECVL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 LAVMAYDRYLAICYPLHYPLLMGPRRYMGLVVTTWLSGFVVDGLVVALVTQLRFCGPNHI
:::::::::.:::::::::.... : . ... .: .:: .. . : :.. : .:::: :
CCDS77 LAVMAYDRYMAICYPLHYPVIVSGRLCVQMAAGSWAGGFGISMVKVFLISGLSYCGPNII
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 DQFYCDFMLFVGLACSDPRVAQVTTLILSVFCLTIPFGLILTSYARIVVAVLRVPAGASR
..:.:: ...:.:.: .:..: .::..: : :... .::. :. ::...:..:.:
CCDS77 NHFFCDVSPLLNLSCTDMSTAELTDFILAIFILLGPLSVTGASYVAITGAVMHIPSAAGR
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 RRAFSTCSSHLAVVTTFYGTLMIFYVAPSAVHSQLLSKVFSLLYTVVTPLFNPVIYTMRN
.:::::.:::.:: ::.. ...:. :.:. . .:. :.::.:..::.::.:: .::
CCDS77 YKAFSTCASHLTVVIIFYAASIFIYARPKALSAFDTNKLVSVLYAVIVPLLNPIIYCLRN
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 KEVHQALRKILCIKQTETLD
.::..:: : . : . :
CCDS77 QEVKRALCCTLHLYQHQDPDPKKASRNV
300 310 320
>>CCDS43670.1 OR2A12 gene_id:346525|Hs108|chr7 (310 aa)
initn: 919 init1: 695 opt: 896 Z-score: 671.4 bits: 132.4 E(32554): 4.5e-31
Smith-Waterman score: 896; 43.5% identity (77.1% similar) in 301 aa overlap (8-306:4-304)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MEIVSTGNET-ITEFVLLGFYDIPELHFLFFIVFTAVYVFIIIGNMLIIVAVVSSQRLHK
:.: ::: .:::: : :....: : : . ..:: .:. . ..:::
CCDS43 MESNQTWITEVILLGFQVDPALELFLFGFFLLFYSLTLMGNGIILGLIYLDSRLHT
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 PMYIFLANLSFLDIFYTSAVMPKMLEGF-LQEATISVAGCLLQFFIFGSLATAECLLLAV
:::.::..:...:. :.:...:::: .. ... .:: : :.:: :.. ..: .:::.:..
CCDS43 PMYVFLSHLAIVDMSYASSTVPKMLANLVMHKKVISFAPCILQTFLYLAFAITECLILVM
60 70 80 90 100 110
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pF1KE5 MAYDRYLAICYPLHYPLLMGPRRYMGLVVTTWLSGFVVDGLVVALVTQLRFCGPNHIDQF
: ::::.:::.::.: :.:. : :. : :. .:.. . ..:. .: ::::..:..:
CCDS43 MCYDRYVAICHPLQYTLIMNWRVCTVLASTCWIFSFLLALVHITLILRLPFCGPQKINHF
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 YCDFMLFVGLACSDPRVAQVTTLILSVFCLTIPFGLILTSYARIVVAVLRVPAGASRRRA
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CCDS43 FCQIMSVFKLACADTRLNQVVLFAGSAFILVGPLCLVLVSYLHILVAILRIQSGEGRRKA
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 FSTCSSHLAVVTTFYGTLMIFYVAPSAVHSQLLSKVFSLLYTVVTPLFNPVIYTMRNKEV
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CCDS43 FSTCSSHLCVVGLFFGSAIVMYMAPKSSHSQERRKILSLFYSLFNPILNPLIYSLRNAEV
240 250 260 270 280 290
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CCDS43 KGALKRVLWKQRSM
300 310
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Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]