Result of FASTA (omim) for
pFN21AE5435
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5435, 318 aa
1>>>pF1KE5435 318 - 318 aa - 318 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3120+/-0.000433; mu= 15.8390+/- 0.027
mean_var=110.6821+/-33.123, 0's: 0 Z-trim(110.1): 407 B-trim: 1071 in 1/50
Lambda= 0.121909
statistics sampled from 17748 (18360) to 17748 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.549), E-opt: 0.2 (0.215), width: 16
Scan time: 5.750
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 929 174.9 1.9e-43
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 858 162.4 1.1e-39
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 858 162.4 1.1e-39
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 858 162.4 1.1e-39
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 851 161.2 2.6e-39
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 844 159.9 6.1e-39
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 844 159.9 6.1e-39
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 841 159.4 8.7e-39
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 830 157.5 3.4e-38
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 830 157.5 3.4e-38
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 830 157.5 3.4e-38
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 827 156.9 4.8e-38
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 826 156.8 5.5e-38
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 823 156.2 7.6e-38
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 823 156.3 8.1e-38
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 804 152.9 7.9e-37
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 795 151.3 2.4e-36
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 786 149.7 7.1e-36
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 772 147.3 3.9e-35
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 729 139.7 7.4e-33
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 557 109.5 9.6e-24
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 549 108.1 2.6e-23
NP_000673 (OMIM: 104260,607876) alpha-2B adrenergi ( 450) 208 48.3 3.6e-05
NP_000668 (OMIM: 600445) adenosine receptor A3 iso ( 318) 206 47.7 3.7e-05
NP_000520 (OMIM: 202200,607397) adrenocorticotropi ( 297) 200 46.6 7.3e-05
NP_001278840 (OMIM: 202200,607397) adrenocorticotr ( 297) 200 46.6 7.3e-05
XP_016881270 (OMIM: 202200,607397) PREDICTED: adre ( 297) 200 46.6 7.3e-05
NP_000904 (OMIM: 602548) nociceptin receptor isofo ( 370) 201 46.9 7.5e-05
XP_016883343 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 370) 201 46.9 7.5e-05
NP_001186948 (OMIM: 602548) nociceptin receptor is ( 370) 201 46.9 7.5e-05
NP_872588 (OMIM: 602548) nociceptin receptor isofo ( 370) 201 46.9 7.5e-05
XP_016883342 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 388) 201 47.0 7.7e-05
XP_011527130 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 388) 201 47.0 7.7e-05
XP_016883341 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 388) 201 47.0 7.7e-05
NP_001305782 (OMIM: 602548) nociceptin receptor is ( 399) 201 47.0 7.8e-05
NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 197 46.2 0.00011
NP_778237 (OMIM: 608923) trace amine-associated re ( 345) 197 46.2 0.00012
NP_000789 (OMIM: 126453,143465,606798) D(1B) dopam ( 477) 198 46.5 0.00013
NP_072093 (OMIM: 607970) probable G-protein couple ( 494) 198 46.6 0.00013
XP_016877085 (OMIM: 607970) PREDICTED: probable G- ( 494) 198 46.6 0.00013
XP_016877087 (OMIM: 607970) PREDICTED: probable G- ( 494) 198 46.6 0.00013
XP_016877086 (OMIM: 607970) PREDICTED: probable G- ( 494) 198 46.6 0.00013
XP_016877088 (OMIM: 607970) PREDICTED: probable G- ( 494) 198 46.6 0.00013
NP_001471 (OMIM: 600377) galanin receptor type 1 [ ( 349) 196 46.0 0.00013
NP_001305783 (OMIM: 602548) nociceptin receptor is ( 365) 196 46.0 0.00014
XP_016883344 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 365) 196 46.0 0.00014
NP_002377 (OMIM: 155555,203200,266300,613098,61309 ( 317) 195 45.8 0.00014
NP_005904 (OMIM: 600042) melanocortin receptor 5 [ ( 325) 195 45.8 0.00014
NP_005903 (OMIM: 155541,601665) melanocortin recep ( 332) 195 45.8 0.00014
NP_000902 (OMIM: 165195) delta-type opioid recepto ( 372) 195 45.9 0.00016
>>NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [Homo (317 aa)
initn: 925 init1: 543 opt: 929 Z-score: 900.9 bits: 174.9 E(85289): 1.9e-43
Smith-Waterman score: 929; 47.8% identity (76.6% similar) in 312 aa overlap (1-310:1-310)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MQRANHSTVTQFILVGFSVFP-HLQLMLFLLFLLMYLFTLLGNLLIMATVWSERSLHTPM
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NP_835 MAIGNWTEISEFILMSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLKGNSLIILVTLADPMLHSPM
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 YLFLCALSVSEILYTVAIIPRMLADLLSTQRSIAFLACASQMFFSFSFGFTHSFLLTVMG
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NP_835 YFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLLAQDTTISFLGCATQMYFFFFFGVAECFLLATMA
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pF1KE5 YDRYVAICHPLRYNVLMSPRGCACLVGCSWAGGLVMGMVVTSAIFHLAFCGHKEIHHFAC
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NP_835 YDRYVAICSPLHYPVIMNQRTRAKLAAASWFPGFPVATVQTTWLFSFPFCGTNKVNHFFC
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pF1KE5 HVPPLLKLACGDDVLV-VAKGVGLVCITALLGCFLLILLSYAFIVAAILKIPSAEGRNKA
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NP_835 DSPPVLKLVCADTALFEIYAIVGTI-LVVMIPC-LLILCSYTRIAAAILKIPSAKGKHKA
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pF1KE5 FSTCASHLTVVVVHYGFASVIYLKPKSPQSLEGDTLMGITYTVLTPFLSPIIFSLRNKEL
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NP_835 FSTCSSHLLVVSLFYISSSLTYFWPKSNNSPESKKLLSLSYTVVTPMLNPIIYSLRNSEV
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 KVAMKKTFFSKLYPEKNVMM
: :...:: . :
NP_835 KNALSRTFHKVLALRNCIP
300 310
>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
initn: 784 init1: 484 opt: 858 Z-score: 833.5 bits: 162.4 E(85289): 1.1e-39
Smith-Waterman score: 858; 45.1% identity (73.4% similar) in 308 aa overlap (1-304:1-303)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MQRANHSTVTQFILVGFSVFPHLQLMLFLLFLLMYLFTLLGNLLIMATVWSERSLHTPMY
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NP_036 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
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pF1KE5 LFLCALSVSEILYTVAIIPRMLADLLSTQRSIAFLACASQMFFSFSFGFTHSFLLTVMGY
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pF1KE5 DRYVAICHPLRYNVLMSPRGCACLVGCSWAGGLVMGMVVTSAIFHLAFCGHKEIHHFACH
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NP_036 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
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NP_036 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGA-LVMITP----FLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRW
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pF1KE5 KAFSTCASHLTVVVVHYGFASVIYLKPKSPQSLEGDTLMGITYTVLTPFLSPIIFSLRNK
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NP_036 KAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNR
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300 310
pF1KE5 ELKVAMKKTFFSKLYPEKNVMM
:: :.::
NP_036 YLKGALKKVVGRVVFSV
300 310
>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa)
initn: 784 init1: 484 opt: 858 Z-score: 833.5 bits: 162.4 E(85289): 1.1e-39
Smith-Waterman score: 858; 45.1% identity (73.4% similar) in 308 aa overlap (1-304:1-303)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MQRANHSTVTQFILVGFSVFPHLQLMLFLLFLLMYLFTLLGNLLIMATVWSERSLHTPMY
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XP_011 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
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pF1KE5 LFLCALSVSEILYTVAIIPRMLADLLSTQRSIAFLACASQMFFSFSFGFTHSFLLTVMGY
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XP_011 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
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pF1KE5 DRYVAICHPLRYNVLMSPRGCACLVGCSWAGGLVMGMVVTSAIFHLAFCGHKEIHHFACH
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XP_011 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
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pF1KE5 VPPLLKLACGD----DVLVVAKGVGLVCITALLGCFLLILLSYAFIVAAILKIPSAEGRN
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XP_011 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGA-LVMITP----FLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRW
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pF1KE5 KAFSTCASHLTVVVVHYGFASVIYLKPKSPQSLEGDTLMGITYTVLTPFLSPIIFSLRNK
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XP_011 KAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNR
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300 310
pF1KE5 ELKVAMKKTFFSKLYPEKNVMM
:: :.::
XP_011 YLKGALKKVVGRVVFSV
300 310
>>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa)
initn: 784 init1: 484 opt: 858 Z-score: 833.3 bits: 162.4 E(85289): 1.1e-39
Smith-Waterman score: 858; 45.1% identity (73.4% similar) in 308 aa overlap (1-304:11-313)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MQRANHSTVTQFILVGFSVFPHLQLMLFLLFLLMYLFTLLGNLLIMATVW
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XP_011 MGDRRADPRPMSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVS
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pF1KE5 SERSLHTPMYLFLCALSVSEILYTVAIIPRMLADLLSTQRSIAFLACASQMFFSFSFGFT
. ::::::.:: :: .: .. . .:.:::. . ..:.: .: .::.: : :
XP_011 IDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDM
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pF1KE5 HSFLLTVMGYDRYVAICHPLRYNVLMSPRGCACLVGCSWAGGLVMGMVVTSAIFHLAFCG
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XP_011 DNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGA-LVMITP----FLCILASYMHITCTV
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XP_011 LKVPSTKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPML
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290 300 310
pF1KE5 SPIIFSLRNKELKVAMKKTFFSKLYPEKNVMM
.:.:.::::. :: :.::
XP_011 NPFIYSLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
300 310 320
>>NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G1 [H (307 aa)
initn: 854 init1: 536 opt: 851 Z-score: 826.9 bits: 161.2 E(85289): 2.6e-39
Smith-Waterman score: 851; 42.6% identity (78.5% similar) in 303 aa overlap (5-306:2-302)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MQRANHSTVTQFILVGFSVFPHLQLMLFLLFLLMYLFTLLGNLLIMATVWSERSLHTPMY
:::.::.::..:.. :.:: ..::.::..:: ..:::.::. . . .::::::
NP_001 MNHSVVTEFIILGLTKKPELQGIIFLFFLIVYLVAFLGNMLIIIAKIYNNTLHTPMY
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pF1KE5 LFLCALSVSEILYTVAIIPRMLADLLSTQRSIAFLACASQMF-FSFSFGFTHSFLLTVMG
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NP_001 VFLLTLAVVDIICTTSIIPKMLGTMLTSENTISYAGCMSQLFLFTWSLG-AEMVLFTTMA
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pF1KE5 YDRYVAICHPLRYNVLMSPRGCACLVGCSWAGGLVMGMVVTSAIFHLAFCGHKEIHHFAC
:::::::: ::.:...:. . :. :.. : ... . : :. :..:.::: . : :: :
NP_001 YDRYVAICFPLHYSTIMNHHMCVALLSMVMAIAVTNSWVHTALIMRLTFCGPNTIDHFFC
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pF1KE5 HVPPLLKLACGDDVLVVAKGVGLVCITALLGCFLLILLSYAFIVAAILKIPSAEGRNKAF
..:::: :.:. : . : .. :: .: :.: .::.::..:::.: ..::. :::
NP_001 EIPPLLALSCSP-VRINEVMVYVADITLAIGDFILTCISYGFIIVAILRIRTVEGKRKAF
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pF1KE5 STCASHLTVVVVHYGFASVIYLKPKSPQSLEGDTLMGITYTVLTPFLSPIIFSLRNKELK
:::.::::::...:. . :..: : ..: : ... ::..:: :.:...:..:.:..
NP_001 STCSSHLTVVTLYYSPVIYTYIRPASSYTFERDKVVAALYTLVTPTLNPMVYSFQNREMQ
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 VAMKKTFFSKLYPEKNVMM
....:.:
NP_001 AGIRKVFAFLKH
300
>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
initn: 873 init1: 561 opt: 844 Z-score: 820.1 bits: 159.9 E(85289): 6.1e-39
Smith-Waterman score: 844; 43.6% identity (73.0% similar) in 307 aa overlap (5-310:7-311)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MQRANHSTVTQFILVGFSVFPHLQLMLFLLFLLMYLFTLLGNLLIMATVWSERSLHTP
:.. ::.:::.:: . :.::..:::.:: .: . :.::. .: . . :.::
NP_006 MEFTDRNYTLVTEFILLGFPTRPELQIVLFLMFLTLYAIILIGNIGLMLLIRIDPHLQTP
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 MYLFLCALSVSEILYTVAIIPRMLADLLSTQRSIAFLACASQMFFSFSFGFTHSFLLTVM
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NP_006 MYFFLSNLSFVDLCYFSDIVPKMLVNFLSENKSISYYGCALQFYFFCTFADTESFILAAM
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 GYDRYVAICHPLRYNVLMSPRG-CACLVGCSWAGGLVMGMVVTSAIFHLAFCGHKEIHHF
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NP_006 AYDRYVAICNPLLYTVVMS-RGICMRLIVLSYLGGNMSSLVHTSFAFILKYCDKNVINHF
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 ACHVPPLLKLACGDDVLVVAKGVGLVCITALLGCFLLILLSYAFIVAAILKIPSAEGRNK
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NP_006 FCDLPPLLKLSC-TDTTINEWLLSTYGSSVEIICFIIIIISYFFILLSVLKIRSFSGRKK
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 AFSTCASHLTVVVVHYGFASVIYLKPKSPQSLEGDTLMGITYTVLTPFLSPIIFSLRNKE
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NP_006 TFSTCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKD
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 LKVAMKKTFFSKLYPEKNVMM
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NP_006 VKDAAEKVLRSKVDSS
300 310
>>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo (314 aa)
initn: 803 init1: 514 opt: 844 Z-score: 820.1 bits: 159.9 E(85289): 6.1e-39
Smith-Waterman score: 844; 41.7% identity (75.4% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MQRANHSTVTQFILVGFSVFPHLQLMLFLLFLLMYLFTLLGNLLIMATVWSERSLHTPMY
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NP_003 MTRKNYTSLTEFVLLGLADTLELQIILFLFFLVIYTLTVLGNLGMILLIRIDSQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
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pF1KE5 LFLCALSVSEILYTVAIIPRMLADLLSTQRSIAFLACASQMFFSFSFGFTHSFLLTVMGY
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NP_003 FFLANLSFVDVCNSTTITPKMLADLLSEKKTISFAGCFLQMYFFISLATTECILFGLMAY
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pF1KE5 DRYVAICHPLRYNVLMSPRGCACLVGCSWAGGLVMGMVVTSAIFHLAFCGHKEIHHFACH
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NP_003 DRYAAICRPLLYSLIMSRTVYLKMAAGAFAAGLLNFMVNTSHVSSLSFCDSNVIHHFFCD
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190 200 210 220 230 240
pF1KE5 VPPLLKLACGDDVLVVAKGVGLVCITALLGCFLLILLSYAFIVAAILKIPSAEGRNKAFS
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NP_003 SPPLFKLSCSDTILKESISSILAGVN-IVGTLLVILSSYSYVLFSIFSMHSGEGRHRAFS
190 200 210 220 230
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pF1KE5 TCASHLTVVVVHYGFASVIYLKPKSPQSLEGDTLMGITYTVLTPFLSPIIFSLRNKELKV
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NP_003 TCASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRSKEVKK
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310
pF1KE5 AMKKTFFSKLYPEKNVMM
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NP_003 ALANVISRKRTSSFL
300 310
>>NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [Homo (308 aa)
initn: 825 init1: 572 opt: 841 Z-score: 817.4 bits: 159.4 E(85289): 8.7e-39
Smith-Waterman score: 841; 42.8% identity (76.3% similar) in 304 aa overlap (1-304:1-301)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MQRANHSTVTQFILVGFSVFPHLQLMLFLLFLLMYLFTLLGNLLIMATVWSERSLHTPMY
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NP_003 MRQINQTQVTEFLLLGLSDGPHTEQLLFIVLLGVYLVTVLGNLLLISLVHVDSQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
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pF1KE5 LFLCALSVSEILYTVAIIPRMLADLLSTQRSIAFLACASQMFFSFSFGFTHSFLLTVMGY
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NP_003 FFLCNLSLADLCFSTNIVPQALVHLLSRKKVIAFTLCAARLLFFLIFGCTQCALLAVMSY
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pF1KE5 DRYVAICHPLRYNVLMSPRGCACLVGCSWAGGLVMGMVVTSAIFHLAFCGHKEIHHFACH
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NP_003 DRYVAICNPLRYPNIMTWKVCVQLATGSWTSGILVSVVDTTFILRLPYRGSNSIAHFFCE
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pF1KE5 VPPLLKLACGDDVLVVAKGVGLVCITALLGCFLLILLSYAFIVAAILKIPSAEGRNKAFS
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NP_003 APALLILA-STDTHASEMAIFLMGVVILLIPVFLILVSYGRIIVTVVKMKSTVGSLKAFS
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pF1KE5 TCASHLTVVVVHYGFASVIYLKPKSPQSLEGDTLMGITYTVLTPFLSPIIFSLRNKELKV
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NP_003 TCGSHLMVVILFYGSAIITYMTPKSSKQQEKS--VSVFYAIVTPMLNPLIYSLRNKDVKA
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310
pF1KE5 AMKKTFFSKLYPEKNVMM
:..:
NP_003 ALRKVATRNFP
300
>>XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
initn: 818 init1: 526 opt: 830 Z-score: 806.8 bits: 157.5 E(85289): 3.4e-38
Smith-Waterman score: 830; 43.0% identity (72.5% similar) in 316 aa overlap (1-310:1-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MQRANHSTVTQFILVGFSVFPHLQLMLFLLFLLMYLFTLLGNLLIMATVWSERSLHTPMY
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XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
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pF1KE5 LFLCALSVSEILYTVAIIPRMLADLLSTQRSIAFLACASQMFFSFSFGFTHSFLLTVMGY
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XP_011 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
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pF1KE5 DRYVAICHPLRYNVLMSPRGCACLVGCSWAGGLVMGMVVTSAIFHLAFCGHKEIHHFACH
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XP_011 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
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pF1KE5 VPPLLKLACGD----DVLVVAKGVGLVCITALLGCFLLILLSYAFIVAAILKIPSAEGRN
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XP_011 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVL-----LMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRK
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pF1KE5 KAFSTCASHLTVVVVHYGFASVIYLKPKSPQSLEGDTLMGITYTVLTPFLSPIIFSLRNK
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XP_011 KAFHTCASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNK
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 ELKVAMKKTF--FSKLYPEKNVMM
:.: : .: . :: :
XP_011 EVKGAWQKLLWKFSGLTSKLAT
300 310
>>XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
initn: 818 init1: 526 opt: 830 Z-score: 806.8 bits: 157.5 E(85289): 3.4e-38
Smith-Waterman score: 830; 43.0% identity (72.5% similar) in 316 aa overlap (1-310:1-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MQRANHSTVTQFILVGFSVFPHLQLMLFLLFLLMYLFTLLGNLLIMATVWSERSLHTPMY
: :.. :..:::.:.: .. ::.:::.::. :.::: ::. . . ::::::
XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LFLCALSVSEILYTVAIIPRMLADLLSTQRSIAFLACASQMFFSFSFGFTHSFLLTVMGY
.:: ::. .. :.....:..:: .:. ...: : .::.:.:::...: . ::.::.:
XP_011 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYVAICHPLRYNVLMSPRGCACLVGCSWAGGLVMGMVVTSAIFHLAFCGHKEIHHFACH
:::::.: :::...: :: :. ::..:.. . : :. :.: .: .: : :..:.
XP_011 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230
pF1KE5 VPPLLKLACGD----DVLVVAKGVGLVCITALLGCFLLILLSYAFIVAAILKIPSAEGRN
. ...::: : .: ...... : :. : :.:::: :...:::: : :::.
XP_011 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVL-----LMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRK
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 KAFSTCASHLTVVVVHYGFASVIYLKPKSPQSLEGDTLMGITYTVLTPFLSPIIFSLRNK
::: :::::::::.. :: : :..:.: :. . :... :..:::.:.:.:.:::::
XP_011 KAFHTCASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNK
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 ELKVAMKKTF--FSKLYPEKNVMM
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XP_011 EVKGAWQKLLWKFSGLTSKLAT
300 310
318 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]