Result of FASTA (omim) for
pFN21AE5433
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5433, 320 aa
1>>>pF1KE5433 320 - 320 aa - 320 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.7376+/-0.000546; mu= 19.0819+/- 0.034
mean_var=116.3675+/-35.560, 0's: 0 Z-trim(107.5): 401 B-trim: 956 in 1/46
Lambda= 0.118894
statistics sampled from 15049 (15605) to 15049 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.509), E-opt: 0.2 (0.183), width: 16
Scan time: 6.280
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 1334 240.8 2.8e-63
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 1104 201.3 2.1e-51
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 1069 195.3 1.4e-49
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 1069 195.3 1.4e-49
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 1069 195.3 1.4e-49
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 959 176.4 6.5e-44
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 900 166.3 7.3e-41
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 879 162.7 8.9e-40
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 876 162.2 1.3e-39
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 871 161.4 2.3e-39
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 870 161.2 2.6e-39
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 867 160.7 3.7e-39
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 854 158.4 1.7e-38
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 854 158.4 1.7e-38
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 851 157.9 2.5e-38
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 851 157.9 2.5e-38
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 851 157.9 2.5e-38
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 838 155.7 1.1e-37
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 818 152.3 1.3e-36
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 785 146.6 6.3e-35
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 569 109.6 9.1e-24
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 564 108.7 1.6e-23
NP_063941 (OMIM: 155540,602025,607948) melanocorti ( 323) 234 52.1 1.8e-06
NP_005904 (OMIM: 600042) melanocortin receptor 5 [ ( 325) 224 50.4 6e-06
XP_016856596 (OMIM: 602392) PREDICTED: orexin rece ( 389) 214 48.8 2.2e-05
XP_016856595 (OMIM: 602392) PREDICTED: orexin rece ( 425) 214 48.9 2.3e-05
XP_016856594 (OMIM: 602392) PREDICTED: orexin rece ( 425) 214 48.9 2.3e-05
NP_001516 (OMIM: 602392) orexin receptor type 1 [H ( 425) 214 48.9 2.3e-05
NP_001517 (OMIM: 602393) orexin receptor type 2 [H ( 444) 213 48.7 2.6e-05
XP_016866287 (OMIM: 602393) PREDICTED: orexin rece ( 461) 213 48.7 2.7e-05
NP_001307659 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphat ( 382) 206 47.4 5.6e-05
NP_001391 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphate r ( 382) 206 47.4 5.6e-05
NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 204 47.0 6.6e-05
NP_778227 (OMIM: 608282) trace amine-associated re ( 348) 198 46.0 0.00014
XP_011542714 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 308) 197 45.7 0.00014
XP_016868585 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 317) 197 45.8 0.00015
XP_011542713 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 324) 197 45.8 0.00015
NP_001309433 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic re ( 342) 197 45.8 0.00015
NP_001309432 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic re ( 370) 197 45.8 0.00016
NP_001309431 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic re ( 372) 197 45.9 0.00016
NP_005903 (OMIM: 155541,601665) melanocortin recep ( 332) 196 45.6 0.00017
NP_150645 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic recep ( 429) 197 45.9 0.00017
XP_006716356 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 429) 197 45.9 0.00017
NP_001028252 (OMIM: 604849) trace amine-associated ( 351) 196 45.6 0.00017
NP_150647 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic recep ( 455) 197 46.0 0.00018
NP_000671 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic recep ( 466) 197 46.0 0.00018
XP_016868584 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 475) 197 46.0 0.00018
XP_006716355 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 475) 197 46.0 0.00018
NP_150646 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic recep ( 475) 197 46.0 0.00018
XP_016868583 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 475) 197 46.0 0.00018
>>NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 [Ho (312 aa)
initn: 1334 init1: 1334 opt: 1334 Z-score: 1257.0 bits: 240.8 E(85289): 2.8e-63
Smith-Waterman score: 1334; 66.9% identity (85.4% similar) in 308 aa overlap (1-308:1-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 METGNQTHAQEFLLLGFSATSEIQFILFGLFLSMYLVTFTGNLLIILAICSDSHLHTPMY
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NP_001 MEAENLTELSKFLLLGLSDDPELQPVLFGLFLSMYLVTVLGNLLIILAVSSDSHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FFLSNLSFADLCFTSTTVPKMLLNILTQNKFITYAGCLSQIFFFTSFGCLDNLLLTVMAY
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NP_001 FFLSNLSFVDICFISTTVPKMLVSIQARSKDISYMGCLTQVYFLMMFAGMDTFLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRFVAICHPLHYTVIMNPQLCGLLVLGSWCISVMGSLLETLTVLRLSFCTKMEIPHFFCD
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NP_001 DRFVAICHPLHYTVIMNPCLCGLLVLASWFIIFWFSLVHILLMKRLTFSTGTEIPHFFCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 LLEVLKLACSDTFINNVVIYFATGVLGVISFTGIFFSYYKIVFSILRISSAGRKHKAFST
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NP_001 PAQVLKVACSNTLLNNIVLYVATALLGVFPVAGILFSYSQIVSSLMGMSSTKGKYKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CGSHLSVVTLFYGTGFGVYLSSAATPSSRTSLVASVMYTMVTPMLNPFIYSLRNTDMKRA
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NP_001 CGSHLCVVSLFYGTGLGVYLSSAVTHSSQSSSTASVMYAMVTPMLNPFIYSLRNKDVKGA
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE5 LGRLLSRATFFNGDITAGLS
: ::::::
NP_001 LERLLSRADSCP
310
>>NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [Homo (312 aa)
initn: 1092 init1: 932 opt: 1104 Z-score: 1043.8 bits: 201.3 E(85289): 2.1e-51
Smith-Waterman score: 1104; 56.2% identity (82.8% similar) in 308 aa overlap (1-307:1-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 METGNQTHAQEFLLLGFSATSEIQFILFGLFLSMYLVTFTGNLLIILAICSDSHLHTPMY
:. :::....::::::.: . : : ::: .:::::::: .::.:::::: :::.::::.:
NP_002 MDGGNQSEGSEFLLLGMSESPEQQRILFWMFLSMYLVTVVGNVLIILAISSDSRLHTPVY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FFLSNLSFADLCFTSTTVPKMLLNILTQNKFITYAGCLSQIFFFTSFGCLDNLLLTVMAY
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NP_002 FFLANLSFTDLFFVTNTIPKMLVNLQSHNKAISYAGCLTQLYFLVSLVALDNLILAVMAY
70 80 90 100 110 120
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pF1KE5 DRFVAICHPLHYTVIMNPQLCGLLVLGSWCISVMGSLLETLTVLRLSFCTKMEIPHFFCD
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NP_002 DRYVAICCPLHYTTAMSPKLCILLLSLCWVLSVLYGLIHTLLMTRVTFCGSRKIHYIFCE
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190 200 210 220 230
pF1KE5 LLEVLKLACSDTFINNVVIYFATGV-LGVISFTGIFFSYYKIVFSILRISSAGRKHKAFS
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NP_002 MYVLLRMACSNIQINHTVL-IATGCFIFLIPFGFVIISYVLIIRAILRIPSVSKKYKAFS
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 TCGSHLSVVTLFYGTGFGVYLSSAATPSSRTSLVASVMYTMVTPMLNPFIYSLRNTDMKR
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NP_002 TCASHLGAVSLFYGTLCMVYLKPLHTYSVKDS-VATVMYAVVTPMMNPFIYSLRNKDMHG
240 250 260 270 280 290
300 310 320
pF1KE5 ALGRLLSRATFFNGDITAGLS
::::::..
NP_002 ALGRLLDKHFKRLT
300 310
>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
initn: 1110 init1: 1067 opt: 1069 Z-score: 1011.3 bits: 195.3 E(85289): 1.4e-49
Smith-Waterman score: 1069; 53.1% identity (78.8% similar) in 311 aa overlap (1-310:1-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 METGNQTHAQEFLLLGFSATSEIQFILFGLFLSMYLVTFTGNLLIILAICSDSHLHTPMY
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NP_036 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
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pF1KE5 FFLSNLSFADLCFTSTTVPKMLLNILTQNKFITYAGCLSQIFFFTSFGCLDNLLLTVMAY
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NP_036 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
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pF1KE5 DRFVAICHPLHYTVIMNPQLCGLLVLGSWCISVMGSLLETLTVLRLSFCTKMEIPHFFCD
:.:::.:::::::. :. :::.::: : : .. .. ::.:: . ::::. : :::::
NP_036 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
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pF1KE5 LLEVLKLACSDTFINNVVIYFATGVLGVIS-FTGIFFSYYKIVFSILRISSAGRKHKAFS
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NP_036 VTPLLKLSCSDTHLNEVII-LSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFS
190 200 210 220 230
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pF1KE5 TCGSHLSVVTLFYGTGFGVYLSSAATPSSRTSLVASVMYTMVTPMLNPFIYSLRNTDMKR
::::::.:: :::.: ..::.. .. :.. . .:.:.::.:::::::::::::: .:
NP_036 TCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKG
240 250 260 270 280 290
300 310 320
pF1KE5 ALGRLLSRATFFNGDITAGLS
:: ....:..:
NP_036 ALKKVVGRVVFSV
300 310
>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa)
initn: 1110 init1: 1067 opt: 1069 Z-score: 1011.3 bits: 195.3 E(85289): 1.4e-49
Smith-Waterman score: 1069; 53.1% identity (78.8% similar) in 311 aa overlap (1-310:1-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 METGNQTHAQEFLLLGFSATSEIQFILFGLFLSMYLVTFTGNLLIILAICSDSHLHTPMY
: ::. ..::::::.: . : .:: .::::::.: :::::::.. :: ::::::
XP_011 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
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pF1KE5 FFLSNLSFADLCFTSTTVPKMLLNILTQNKFITYAGCLSQIFFFTSFGCLDNLLLTVMAY
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XP_011 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
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pF1KE5 DRFVAICHPLHYTVIMNPQLCGLLVLGSWCISVMGSLLETLTVLRLSFCTKMEIPHFFCD
:.:::.:::::::. :. :::.::: : : .. .. ::.:: . ::::. : :::::
XP_011 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
130 140 150 160 170 180
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pF1KE5 LLEVLKLACSDTFINNVVIYFATGVLGVIS-FTGIFFSYYKIVFSILRISSAGRKHKAFS
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XP_011 VTPLLKLSCSDTHLNEVII-LSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFS
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 TCGSHLSVVTLFYGTGFGVYLSSAATPSSRTSLVASVMYTMVTPMLNPFIYSLRNTDMKR
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XP_011 TCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKG
240 250 260 270 280 290
300 310 320
pF1KE5 ALGRLLSRATFFNGDITAGLS
:: ....:..:
XP_011 ALKKVVGRVVFSV
300 310
>>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa)
initn: 1110 init1: 1067 opt: 1069 Z-score: 1011.2 bits: 195.3 E(85289): 1.4e-49
Smith-Waterman score: 1069; 53.1% identity (78.8% similar) in 311 aa overlap (1-310:11-320)
10 20 30 40 50
pF1KE5 METGNQTHAQEFLLLGFSATSEIQFILFGLFLSMYLVTFTGNLLIILAIC
: ::. ..::::::.: . : .:: .::::::.: :::::::..
XP_011 MGDRRADPRPMSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVS
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pF1KE5 SDSHLHTPMYFFLSNLSFADLCFTSTTVPKMLLNILTQNKFITYAGCLSQIFFFTSFGCL
:: ::::::::::::::.:.::. ::::::: : . ... :.. :::.:..: : .
XP_011 IDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDM
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pF1KE5 DNLLLTVMAYDRFVAICHPLHYTVIMNPQLCGLLVLGSWCISVMGSLLETLTVLRLSFCT
::.::.:::::.:::.:::::::. :. :::.::: : : .. .. ::.:: . ::::.
XP_011 DNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCA
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pF1KE5 KMEIPHFFCDLLEVLKLACSDTFINNVVIYFATGVLGVIS-FTGIFFSYYKIVFSILRIS
: :::::. .:::.:::: .:.:.: .. :.: .:. : :. ::..:. ..:..
XP_011 DNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVII-LSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVP
190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE5 SAGRKHKAFSTCGSHLSVVTLFYGTGFGVYLSSAATPSSRTSLVASVMYTMVTPMLNPFI
:. . ::::::::::.:: :::.: ..::.. .. :.. . .:.:.::.:::::::::
XP_011 STKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFI
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320
pF1KE5 YSLRNTDMKRALGRLLSRATFFNGDITAGLS
::::: .: :: ....:..:
XP_011 YSLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
300 310 320
>>NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN1 [H (311 aa)
initn: 1009 init1: 959 opt: 959 Z-score: 909.3 bits: 176.4 E(85289): 6.5e-44
Smith-Waterman score: 959; 49.3% identity (76.3% similar) in 304 aa overlap (4-307:5-308)
10 20 30 40 50
pF1KE5 METGNQTHAQEFLLLGFSATSEIQFILFGLFLSMYLVTFTGNLLIILAICSDSHLHTPM
:: :. :.::::: .: .:: .:: .:..... :: .:. : ::::::::
NP_001 MTGGGNITEITYFILLGFSDFPRIIKVLFTIFLVIYITSLAWNLSLIVLIRMDSHLHTPM
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 YFFLSNLSFADLCFTSTTVPKMLLNILTQNKFITYAGCLSQIFFFTSFGCLDNLLLTVMA
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NP_001 YFFLSNLSFIDVCYISSTVPKMLSNLLQEQQTITFVGCIIQYFIFSTMGLSESCLMTAMA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 YDRFVAICHPLHYTVIMNPQLCGLLVLGSWCISVMGSLLETLTVLRLSFCTKMEIPHFFC
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NP_001 YDRYAAICNPLLYSSIMSPTLCVWMVLGAYMTGLTASLFQIGALLQLHFCGSNVIRHFFC
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 DLLEVLKLACSDTFINNVVIYFATGVLGVISFTGIFFSYYKIVFSILRISSAGRKHKAFS
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NP_001 DMPQLLILSCTDTFFVQVMTAILTMFFGIASALVIMISYGYIGISIMKITSAKGRSKAFN
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 TCGSHLSVVTLFYGTGFGVYLSSAATPSSRTSLVASVMYTMVTPMLNPFIYSLRNTDMKR
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NP_001 TCASHLTAVSLFYTSGIFVYLSSSSGGSSSFDRFASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEIKD
250 260 270 280 290 300
300 310 320
pF1KE5 ALGRLLSRATFFNGDITAGLS
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NP_001 ALKRLQKRKCC
310
>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
initn: 935 init1: 888 opt: 900 Z-score: 854.6 bits: 166.3 E(85289): 7.3e-41
Smith-Waterman score: 900; 47.0% identity (74.2% similar) in 302 aa overlap (5-305:7-307)
10 20 30 40 50
pF1KE5 METGNQTHAQEFLLLGFSATSEIQFILFGLFLSMYLVTFTGNLLIILAICSDSHLHTP
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NP_006 MEFTDRNYTLVTEFILLGFPTRPELQIVLFLMFLTLYAIILIGNIGLMLLIRIDPHLQTP
10 20 30 40 50 60
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pF1KE5 MYFFLSNLSFADLCFTSTTVPKMLLNILTQNKFITYAGCLSQIFFFTSFGCLDNLLLTVM
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NP_006 MYFFLSNLSFVDLCYFSDIVPKMLVNFLSENKSISYYGCALQFYFFCTFADTESFILAAM
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pF1KE5 AYDRFVAICHPLHYTVIMNPQLCGLLVLGSWCISVMGSLLETLTVLRLSFCTKMEIPHFF
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NP_006 AYDRYVAICNPLLYTVVMSRGICMRLIVLSYLGGNMSSLVHTSFAFILKYCDKNVINHFF
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pF1KE5 CDLLEVLKLACSDTFINNVVIYFATGVLGVISFTGIFFSYYKIVFSILRISS-AGRKHKA
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NP_006 CDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFIIIIISYFFILLSVLKIRSFSGRK-KT
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pF1KE5 FSTCGSHLSVVTLFYGTGFGVYLSSAATPSSRTSLVASVMYTMVTPMLNPFIYSLRNTDM
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NP_006 FSTCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKDV
240 250 260 270 280 290
300 310 320
pF1KE5 KRALGRLLSRATFFNGDITAGLS
: : ..:
NP_006 KDAAEKVLRSKVDSS
300 310
>>NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 [Ho (314 aa)
initn: 859 init1: 859 opt: 879 Z-score: 835.1 bits: 162.7 E(85289): 8.9e-40
Smith-Waterman score: 879; 46.6% identity (74.9% similar) in 307 aa overlap (1-305:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 METGNQTHAQEFLLLGFSATSEIQFILFGLFLSMYLVTFTGNLLIILAICSDSHLHTPMY
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NP_001 MDGTNGSTQTHFILLGFSDRPHLERILFVVILIAYLLTLVGNTTIILVSRLDPHLHTPMY
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pF1KE5 FFLSNLSFADLCFTSTTVPKMLLNILTQNKFITYAGCLSQIFFFTSFGCLDNLLLTVMAY
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NP_001 FFLAHLSFLDLSFTTSSIPQLLYNLNGCDKTISYMGCAIQLFLFLGLGGVECLLLAVMAY
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pF1KE5 DRFVAICHPLHYTVIMNPQLCGLLVLGSWCISVMGSLLETLTVLRLSFCTKMEIPHFFCD
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NP_001 DRCVAICKPLHYMVIMNPRLCRGLVSVTWGCGVANSLAMSPVTLRLPRCGHHEVDHFLRE
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pF1KE5 LLEVLKLACSDTF-INNVVIYFATGV-LGVISFTGIFFSYYKIVFSILRISSAGRKHKAF
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NP_001 MPALIRMACVSTVAIEGTVFVLAVGVVLSPLVF--ILLSYSYIVRAVLQIRSASGRQKAF
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pF1KE5 STCGSHLSVVTLFYGTGFGVYLSSAATPSSRTSLVASVMYTMVTPMLNPFIYSLRNTDMK
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NP_001 GTCGSHLTVVSLFYGNIIYMYMQPGASSSQDQGMFLMLFYNIVTPLLNPLIYTLRNREVK
240 250 260 270 280 290
300 310 320
pF1KE5 RALGRLLSRATFFNGDITAGLS
::::::
NP_001 GALGRLLLGKRELGKE
300 310
>>NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [Homo (308 aa)
initn: 914 init1: 751 opt: 876 Z-score: 832.4 bits: 162.2 E(85289): 1.3e-39
Smith-Waterman score: 876; 44.6% identity (74.9% similar) in 307 aa overlap (1-307:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 METGNQTHAQEFLLLGFSATSEIQFILFGLFLSMYLVTFTGNLLIILAICSDSHLHTPMY
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NP_003 MRQINQTQVTEFLLLGLSDGPHTEQLLFIVLLGVYLVTVLGNLLLISLVHVDSQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
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pF1KE5 FFLSNLSFADLCFTSTTVPKMLLNILTQNKFITYAGCLSQIFFFTSFGCLDNLLLTVMAY
::: :::.:::::... ::. :...:...: :... : ....:: ::: . ::.::.:
NP_003 FFLCNLSLADLCFSTNIVPQALVHLLSRKKVIAFTLCAARLLFFLIFGCTQCALLAVMSY
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pF1KE5 DRFVAICHPLHYTVIMNPQLCGLLVLGSWCISVMGSLLETLTVLRLSFCTKMEIPHFFCD
::.::::.::.: ::. ..: :. ::: ... :...: .::: . . : ::::.
NP_003 DRYVAICNPLRYPNIMTWKVCVQLATGSWTSGILVSVVDTTFILRLPYRGSNSIAHFFCE
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pF1KE5 LLEVLKLACSDTFINNVVIYFATGVLGVISFTGIFFSYYKIVFSILRISSAGRKHKAFST
.: :: .:: ....:.. :. .: :. :: .:. ......:. . :::::
NP_003 APALLILASTDTHASEMAIFLMGVVILLIPVFLILVSYGRIIVTVVKMKSTVGSLKAFST
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pF1KE5 CGSHLSVVTLFYGTGFGVYLSSAATPSSRTSLVASVMYTMVTPMLNPFIYSLRNTDMKRA
::::: :: ::::... .:.. .. ... :. ::.:..:::::::.:::::: :.: :
NP_003 CGSHLMVVILFYGSAIITYMTPKSSKQQEKSV--SVFYAIVTPMLNPLIYSLRNKDVKAA
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pF1KE5 LGRLLSRATFFNGDITAGLS
: .. .:
NP_003 LRKVATRNFP
300
>>NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [Homo (312 aa)
initn: 871 init1: 871 opt: 871 Z-score: 827.8 bits: 161.4 E(85289): 2.3e-39
Smith-Waterman score: 871; 43.9% identity (73.9% similar) in 303 aa overlap (5-307:3-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 METGNQTHAQEFLLLGFSATSEIQFILFGLFLSMYLVTFTGNLLIILAICSDSHLHTPMY
::. . ::::::: .. :: . :. ::.:..:: :::: : .::.:::
NP_009 MVNQSSTPGFLLLGFSEHPGLERTLFVVVLTSYLLTLVGNTLIILLSALDPKLHSPMY
10 20 30 40 50
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pF1KE5 FFLSNLSFADLCFTSTTVPKMLLNILTQNKFITYAGCLSQIFFFTSFGCLDNLLLTVMAY
:::::::: :::::.. ::.::.:. .: :.. : :::.: :.: . .::::::.
NP_009 FFLSNLSFLDLCFTTSCVPQMLVNLWGPKKTISFLDCSVQIFIFLSLGTTECILLTVMAF
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pF1KE5 DRFVAICHPLHYTVIMNPQLCGLLVLGSWCISVMGSLLETLTVLRLSFCTKMEIPHFFCD
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NP_009 DRYVAVCQPLHYATIIHPRLCWQLASVAWVIGLVESVVQTPSTLHLPFCPDRQVDDFVCE
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pF1KE5 LLEVLKLACSDTFINNVVIYFATGVLGVISFTGIFFSYYKIVFSILRISSAGRKHKAFST
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NP_009 VPALIRLSCEDTSYNEIQVAVASVFILVVPLSLILVSYGAITWAVLRINSAKGRRKAFGT
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]