Result of FASTA (omim) for
pFN21AE5430
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5430, 319 aa
1>>>pF1KE5430 319 - 319 aa - 319 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1120+/-0.000533; mu= 16.9910+/- 0.033
mean_var=94.4466+/-23.875, 0's: 0 Z-trim(106.9): 321 B-trim: 1919 in 2/49
Lambda= 0.131972
statistics sampled from 14446 (14974) to 14446 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.502), E-opt: 0.2 (0.176), width: 16
Scan time: 5.310
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 963 194.5 2.4e-49
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 956 193.1 6.2e-49
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 956 193.1 6.2e-49
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 956 193.1 6.2e-49
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 927 187.6 2.7e-47
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 925 187.2 3.7e-47
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 882 179.1 1.1e-44
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 879 178.5 1.6e-44
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 877 178.1 2.1e-44
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 875 177.7 2.7e-44
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 850 173.0 7.3e-43
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 847 172.4 1.1e-42
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 847 172.4 1.1e-42
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 847 172.4 1.1e-42
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 816 166.5 6.7e-41
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 812 165.7 1.1e-40
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 801 163.6 4.7e-40
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 792 161.9 1.5e-39
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 790 161.5 2e-39
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 600 125.4 1.6e-28
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 585 122.5 1.1e-27
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 584 122.3 1.3e-27
NP_000903 (OMIM: 165196) kappa-type opioid recepto ( 380) 212 51.6 3.1e-06
NP_001305426 (OMIM: 165196) kappa-type opioid rece ( 409) 212 51.6 3.2e-06
NP_001699 (OMIM: 190900,613522) short-wave-sensiti ( 348) 205 50.2 7.3e-06
NP_004239 (OMIM: 600895) prolactin-releasing pepti ( 370) 204 50.0 8.7e-06
NP_000530 (OMIM: 136880,180380,610445,613731) rhod ( 348) 203 49.8 9.5e-06
NP_071640 (OMIM: 142703) histamine H2 receptor iso ( 359) 201 49.5 1.3e-05
XP_006714928 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 362) 201 49.5 1.3e-05
NP_001124527 (OMIM: 142703) histamine H2 receptor ( 397) 201 49.5 1.4e-05
XP_011532850 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422) 201 49.5 1.4e-05
XP_016864915 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422) 201 49.5 1.4e-05
XP_011532851 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422) 201 49.5 1.4e-05
XP_005265961 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422) 201 49.5 1.4e-05
XP_006714927 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422) 201 49.5 1.4e-05
XP_016883343 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 370) 192 47.8 4.2e-05
NP_872588 (OMIM: 602548) nociceptin receptor isofo ( 370) 192 47.8 4.2e-05
NP_001186948 (OMIM: 602548) nociceptin receptor is ( 370) 192 47.8 4.2e-05
NP_000904 (OMIM: 602548) nociceptin receptor isofo ( 370) 192 47.8 4.2e-05
XP_016883341 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 388) 192 47.8 4.4e-05
XP_016883342 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 388) 192 47.8 4.4e-05
XP_011527130 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 388) 192 47.8 4.4e-05
NP_001305782 (OMIM: 602548) nociceptin receptor is ( 399) 192 47.8 4.5e-05
XP_016883344 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 365) 188 47.0 7.1e-05
NP_001305783 (OMIM: 602548) nociceptin receptor is ( 365) 188 47.0 7.1e-05
NP_063941 (OMIM: 155540,602025,607948) melanocorti ( 323) 186 46.6 8.5e-05
NP_001295400 (OMIM: 605666) cysteinyl leukotriene ( 346) 186 46.6 8.9e-05
NP_001295394 (OMIM: 605666) cysteinyl leukotriene ( 346) 186 46.6 8.9e-05
NP_001295396 (OMIM: 605666) cysteinyl leukotriene ( 346) 186 46.6 8.9e-05
NP_001295398 (OMIM: 605666) cysteinyl leukotriene ( 346) 186 46.6 8.9e-05
>>NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [Homo (312 aa)
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Smith-Waterman score: 963; 47.9% identity (76.7% similar) in 313 aa overlap (8-319:5-311)
10 20 30 40 50 60
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::.: : :::: . :.::
NP_009 NKEVTRAFRRLLGKEMGLTQS
300 310
>>XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
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XP_011 NKEVKGAWQKLLWKFSGLTSKLAT
300 310
>>XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
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pF1KE5 MEKANETSPVMGFVLLRLSAHPELEKTFFVLILLMYLVILLGNGVLILVTILDSRLHTPM
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pF1KE5 TCSAHLTVVIVFYGTLFFMYGKPKSKDSMGADKEDLSDKLIPLFYGVVTPMLNPIIYSLR
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310
pF1KE5 NKDVKAAVRRLL-RPKGFTQ
::.::.: ..:: . .:.:
XP_011 NKEVKGAWQKLLWKFSGLTSKLAT
300 310
>>NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [Homo (317 aa)
initn: 972 init1: 808 opt: 956 Z-score: 999.5 bits: 193.1 E(85289): 6.2e-49
Smith-Waterman score: 956; 47.6% identity (79.8% similar) in 307 aa overlap (13-318:12-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MEKANETSPVMGFVLLRLSAHPELEKTFFVLILLMYLVILLGNGVLILVTILDSRLHTPM
:.:: ::. . . ..:::.:.::.: .::: ...:. :::::::::
NP_036 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPM
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pF1KE5 YFFLGNLSFLDICFTTSSVPLVLDSFLTPQETISFSACAVQMALSFAMAGTECLLLSMMA
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pF1KE5 FDRYVAICNPLRYSVIMSKAAYMPMAASSWAIGGAASVVHTSLAIQLPFCGDNVINHFTC
.:::::.:. ::::.:: . .: .::. : .: :.:....:::.: .. :.:..:
NP_036 YDRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISC
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pF1KE5 TCSAHLTVVIVFYGTLFFMYGKPKSKDSMGADKEDLSDKLIPLFYGVVTPMLNPIIYSLR
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NP_036 TCASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSV------LQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLR
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pF1KE5 NKDVKAAVRRLL-RPKGFTQ
::.::.: ..:: . .:.:
NP_036 NKEVKGAWQKLLWKFSGLTSKLAT
300 310
>>XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory recep (300 aa)
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Smith-Waterman score: 927; 47.7% identity (77.2% similar) in 298 aa overlap (8-305:5-296)
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pF1KE5 MEKANETSPVMGFVLLRLSAHPELEKTFFVLILLMYLVILLGNGVLILVTILDSRLHTPM
: . ::.:: .: :: ::.:.::..: ::. :.:: ..::.. :: .::.::
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pF1KE5 EILAVLKLACADISINVISMEVTNVIFLGVPVLFISFSYVFIITTILRIPSAEGRKKVFS
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pF1KE5 NKDVKAAVRRLLRPKGFTQ
::. :
XP_011 NKEQKRRGS
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>>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor (311 aa)
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Smith-Waterman score: 925; 44.5% identity (76.8% similar) in 310 aa overlap (3-312:6-308)
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pF1KE5 MEKANETSPVMGFVLLRLSAHPELEKTFFVLILLMYLVILLGNGVLILVTILDSRLH
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10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 TPMYFFLGNLSFLDICFTTSSVPLVLDSFLTPQETISFSACAVQMALSFAMAGTECLLLS
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NP_001 TPMYFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLWGPEKTISYAGCMIQLYFVLALGTTECVLLV
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 MMAFDRYVAICNPLRYSVIMSKAAYMPMAASSWAIGGAASVVHTSLAIQLPFCGDNVINH
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NP_001 VMSYDRYAAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLAVASWVSGFTNSALHSSFTFWVPLCGHRQVDH
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 FTCEILAVLKLACADISINVISMEVTNVIFLGVPVLFISFSYVFIITTILRIPSAEGRKK
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NP_001 FFCEVPALLRLSCVDTHVNELTLMITSSIFVLIPLILILTSYGAIVRAILRMQSTTGLQK
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 VFSTCSAHLTVVIVFYGTLFFMYGKPKSKDSMGADKEDLSDKLIPLFYGVVTPMLNPIIY
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NP_001 VFGTCGAHLMAVSLFFIPAMCMYLQPPSGNSQ--DQ----GKFIALFYTVVTPSLNPLIY
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 SLRNKDVKAAVRRLLRPKGFTQ
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NP_001 TLRNKVVRGAVKRLMGWE
300 310
>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
initn: 899 init1: 755 opt: 882 Z-score: 923.4 bits: 179.1 E(85289): 1.1e-44
Smith-Waterman score: 882; 45.0% identity (75.7% similar) in 309 aa overlap (10-315:11-310)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MEKANETSPVMGFVLLRLSAHPELEKTFFVLILLMYLVILLGN-GVLILVTILDSRLHT
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NP_006 MEFTDRNYTLVTEFILLGFPTRPELQIVLFLMFLTLYAIILIGNIGLMLLIRI-DPHLQT
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 PMYFFLGNLSFLDICFTTSSVPLVLDSFLTPQETISFSACAVQMALSFAMAGTECLLLSM
::::::.::::.:.:. .. :: .: .::. ...::. .::.:. . ..: :: ..:.
NP_006 PMYFFLSNLSFVDLCYFSDIVPKMLVNFLSENKSISYYGCALQFYFFCTFADTESFILAA
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 MAFDRYVAICNPLRYSVIMSKAAYMPMAASSWAIGGAASVVHTSLAIQLPFCGDNVINHF
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NP_006 MAYDRYVAICNPLLYTVVMSRGICMRLIVLSYLGGNMSSLVHTSFAFILKYCDKNVINHF
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 TCEILAVLKLACADISIN--VISMEVTNVIFLGVPVLFISFSYVFIITTILRIPSAEGRK
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NP_006 FCDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFIIIIIS--YFFILLSVLKIRSFSGRK
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 KVFSTCSAHLTVVIVFYGTLFFMYGKPKSKDSMGADKEDLSDKLIPLFYGVVTPMLNPII
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NP_006 KTFSTCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPN------TDKIISVFYTIFIPVLNPLI
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 YSLRNKDVKAAVRRLLRPKGFTQ
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NP_006 YSLRNKDVKDAAEKVLRSKVDSS
300 310
>>NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 [Ho (314 aa)
initn: 740 init1: 740 opt: 879 Z-score: 920.3 bits: 178.5 E(85289): 1.6e-44
Smith-Waterman score: 879; 43.6% identity (76.8% similar) in 319 aa overlap (1-315:1-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MEKANETSPVMGFVLLRLSAHPELEKTFFVLILLMYLVILLGNGVLILVTILDSRLHTPM
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NP_001 MDGTNGSTQTH-FILLGFSDRPHLERILFVVILIAYLLTLVGNTTIILVSRLDPHLHTPM
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 YFFLGNLSFLDICFTTSSVPLVLDSFLTPQETISFSACAVQMALSFAMAGTECLLLSMMA
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NP_001 YFFLAHLSFLDLSFTTSSIPQLLYNLNGCDKTISYMGCAIQLFLFLGLGGVECLLLAVMA
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 FDRYVAICNPLRYSVIMSKAAYMPMAASSWAIGGAASVVHTSLAIQLPFCGDNVINHFTC
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NP_001 YDRCVAICKPLHYMVIMNPRLCRGLVSVTWGCGVANSLAMSPVTLRLPRCGHHEVDHFLR
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KE5 EILAVLKLACADISINVISMEVTNVIF-LGV---PVLFISFSYVFIITTILRIPSAEGRK
:. :....:: ......: : .. .:: :..:: .:: .:. ..:.: :: ::.
NP_001 EMPALIRMAC----VSTVAIEGTVFVLAVGVVLSPLVFILLSYSYIVRAVLQIRSASGRQ
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 KVFSTCSAHLTVVIVFYGTLFFMYGKPKSKDSMGADKEDLSDKLIPLFYGVVTPMLNPII
:.:.::..::::: .:::....:: .: ::.. . . .. :::..:::.:::.:
NP_001 KAFGTCGSHLTVVSLFYGNIIYMYMQP------GASSSQDQGMFLMLFYNIVTPLLNPLI
240 250 260 270 280
300 310
pF1KE5 YSLRNKDVKAAVRRLLRPKGFTQ
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NP_001 YTLRNREVKGALGRLLLGKRELGKE
290 300 310
>>NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [Homo (317 aa)
initn: 864 init1: 738 opt: 877 Z-score: 918.2 bits: 178.1 E(85289): 2.1e-44
Smith-Waterman score: 877; 48.2% identity (73.6% similar) in 299 aa overlap (13-310:12-304)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MEKANETSPVMGFVLLRLSAHP-ELEKTFFVLILLMYLVILLGNGVLILVTILDSRLHTP
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NP_835 MAIGNWTEISEFILMSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLKGNSLIILVTLADPMLHSP
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 MYFFLGNLSFLDICFTTSSVPLVLDSFLTPQETISFSACAVQMALSFAMAGTECLLLSMM
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NP_835 MYFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLLAQDTTISFLGCATQMYFFFFFGVAECFLLATM
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 AFDRYVAICNPLRYSVIMSKAAYMPMAASSWAIGGAASVVHTSLAIQLPFCGDNVINHFT
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NP_835 AYDRYVAICSPLHYPVIMNQRTRAKLAAASWFPGFPVATVQTTWLFSFPFCGTNKVNHFF
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 CEILAVLKLACADISINVISMEVTNVIFLGVPVLFISFSYVFIITTILRIPSAEGRKKVF
:. ::::.::: .. : : ... . .: :.: ::. : ..::.::::.:..:.:
NP_835 CDSPPVLKLVCADTALFEIYAIVGTILVVMIPCLLILCSYTRIAAAILKIPSAKGKHKAF
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 STCSAHLTVVIVFYGTLFFMYGKPKSKDSMGADKEDLSDKLIPLFYGVVTPMLNPIIYSL
::::.:: :: .:: . . : :::..: : ::. : : :::::::::::::
NP_835 STCSSHLLVVSLFYISSSLTYFWPKSNNS------PESKKLLSLSYTVVTPMLNPIIYSL
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 RNKDVKAAVRRLLRPKGFTQ
::..:: :. :
NP_835 RNSEVKNALSRTFHKVLALRNCIP
300 310
>>NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [Homo (308 aa)
initn: 870 init1: 729 opt: 875 Z-score: 916.3 bits: 177.7 E(85289): 2.7e-44
Smith-Waterman score: 875; 45.0% identity (75.2% similar) in 311 aa overlap (1-311:1-302)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MEKANETSPVMGFVLLRLSAHPELEKTFFVLILLMYLVILLGNGVLILVTILDSRLHTPM
:.. :.:. : :.:: :: :. :. .:...: .::: .::: .:: .. .::.:::::
NP_003 MRQINQTQ-VTEFLLLGLSDGPHTEQLLFIVLLGVYLVTVLGNLLLISLVHVDSQLHTPM
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 YFFLGNLSFLDICFTTSSVPLVLDSFLTPQETISFSACAVQMALSFAMAGTECLLLSMMA
:::: :::. :.::.:. :: .: .:. ...:.:. ::... . . .. :.: ::..:.
NP_003 YFFLCNLSLADLCFSTNIVPQALVHLLSRKKVIAFTLCAARLLFFLIFGCTQCALLAVMS
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 FDRYVAICNPLRYSVIMSKAAYMPMAASSWAIGGAASVVHTSLAIQLPFCGDNVINHFTC
.:::::::::::: ::. . . .:..::. : .::: :.. ..::. :.: : :: :
NP_003 YDRYVAICNPLRYPNIMTWKVCVQLATGSWTSGILVSVVDTTFILRLPYRGSNSIAHFFC
120 130 140 150 160 170
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pF1KE5 EILAVLKLACADISINVISMEVTNVIFLGVPVLFISFSYVFIITTILRIPSAEGRKKVFS
: :.: :: .: . ... . .:..: .::..: :: ::.:.... :. : :.::
NP_003 EAPALLILASTDTHASEMAIFLMGVVILLIPVFLILVSYGRIIVTVVKMKSTVGSLKAFS
180 190 200 210 220 230
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::..:: :::.:::. .. : :::. .. .: . .::..:::::::.:::::
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]