FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5428, 312 aa
1>>>pF1KE5428 312 - 312 aa - 312 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5858+/-0.0011; mu= 14.1537+/- 0.064
mean_var=160.2138+/-57.522, 0's: 0 Z-trim(104.2): 373 B-trim: 940 in 2/48
Lambda= 0.101327
statistics sampled from 7272 (7779) to 7272 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.595), E-opt: 0.2 (0.239), width: 16
Scan time: 2.020
The best scores are: opt bits E(32554)
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CCDS31119.1 OR2G6 gene_id:391211|Hs108|chr1 ( 316) 1214 190.2 1.8e-48
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CCDS31092.1 OR2G2 gene_id:81470|Hs108|chr1 ( 317) 1209 189.5 3e-48
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CCDS43434.1 OR2J2 gene_id:26707|Hs108|chr6 ( 312) 1135 178.6 5.3e-45
CCDS56515.1 OR2A42 gene_id:402317|Hs108|chr7 ( 310) 994 158.0 8.5e-39
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CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 961 153.2 2.5e-37
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CCDS55177.1 OR2A7 gene_id:401427|Hs108|chr7 ( 310) 925 147.9 9.3e-36
CCDS43672.1 OR2A14 gene_id:135941|Hs108|chr7 ( 310) 925 147.9 9.3e-36
CCDS43668.1 OR2A5 gene_id:393046|Hs108|chr7 ( 311) 924 147.8 1e-35
CCDS31109.1 OR2T33 gene_id:391195|Hs108|chr1 ( 320) 922 147.5 1.3e-35
CCDS5149.1 OR2A4 gene_id:79541|Hs108|chr6 ( 310) 919 147.0 1.7e-35
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CCDS31107.1 OR2M3 gene_id:127062|Hs108|chr1 ( 312) 919 147.1 1.7e-35
CCDS31116.1 OR2T2 gene_id:401992|Hs108|chr1 ( 324) 919 147.1 1.7e-35
CCDS32936.1 OR7A10 gene_id:390892|Hs108|chr19 ( 309) 918 146.9 1.9e-35
CCDS31514.1 OR10AG1 gene_id:282770|Hs108|chr11 ( 301) 916 146.6 2.3e-35
CCDS31115.1 OR2T1 gene_id:26696|Hs108|chr1 ( 369) 915 146.6 2.8e-35
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CCDS43666.1 OR2F2 gene_id:135948|Hs108|chr7 ( 317) 909 145.6 4.8e-35
CCDS31123.1 OR2T35 gene_id:403244|Hs108|chr1 ( 323) 907 145.3 5.9e-35
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 907 145.3 5.9e-35
CCDS35091.1 OR13C5 gene_id:138799|Hs108|chr9 ( 318) 905 145.0 7.1e-35
>>CCDS10502.1 OR2C1 gene_id:4993|Hs108|chr16 (312 aa)
initn: 2034 init1: 2034 opt: 2034 Z-score: 1631.6 bits: 310.0 E(32554): 1.5e-84
Smith-Waterman score: 2034; 99.7% identity (99.7% similar) in 312 aa overlap (1-312:1-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MDGVNDSSLQGFVLMGISDHPQLEMIFFIAILFSYLLTLLGNSTIILLSRLEARLHTPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MDGVNDSSLQGFVLMGISDHPQLEMIFFIAILFSYLLTLLGNSTIILLSRLEARLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FFLSNLSSLDLAFATSSVPQMLINLWGPGKTISYGGCITQLYVFLWLGATECILLVVMAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 FFLSNLSSLDLAFATSSVPQMLINLWGPGKTISYGGCITQLYVFLWLGATECILLVVMAF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
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:::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 DRYVAVCRPLRYTAIMNPQLCWLLAVIACLGGLGNSVIQSTFTLQLPLCGHRRVEGFLCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 VPAMIKLACGDTSLNQAVLNGVCTFFTAVPLSIIVISYCLIAQAVLKIRSAEGRRKAFNT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 VPAMIKLACGDTSLNQAVLNGVCTFFTAVPLSIIVISYCLIAQAVLKIRSAEGRRKAFNT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CLSHLLVVFLFYGSASYGYLLPAKNSKQDQGKFISLFYSLVTPMVNPLIYTLRNMEVKGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 CLSHLLVVFLFYGSASYGYLLPAKNSKQDQGKFISLFYSLVTPMVNPLIYTLRNMEVKGA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 LRRLLGKGREVG
::::::::::::
CCDS10 LRRLLGKGREVG
310
>>CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 (309 aa)
initn: 1257 init1: 1257 opt: 1259 Z-score: 1019.3 bits: 196.7 E(32554): 1.9e-50
Smith-Waterman score: 1259; 61.2% identity (85.9% similar) in 304 aa overlap (5-307:5-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MDGVNDSSLQGFVLMGISDHPQLEMIFFIAILFSYLLTLLGNSTIILLSRLEARLHTPMY
:.:::. :.:.:.::::.:: ..:. .:: :::::.:: :::..: :. ::::::
CCDS31 MGLGNESSLMDFILLGFSDHPRLEAVLFVFVLFFYLLTLVGNFTIIIISYLDPPLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FFLSNLSSLDLAFATSSVPQMLINLWGPGKTISYGGCITQLYVFLWLGATECILLVVMAF
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CCDS31 FFLSNLSLLDICFTTSLAPQTLVNLQRPKKTITYGGCVAQLYISLALGSTECILLADMAL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYVAVCRPLRYTAIMNPQLCWLLAVIAWLGGLGNSVIQSTFTLQLPLCGHRRVEGFLCE
:::.:::.::.:..::::.:: :: :.::.::..:.:..::::::::::..:.. :.::
CCDS31 DRYIAVCKPLHYVVIMNPRLCQQLASISWLSGLASSLIHATFTLQLPLCGNHRLDHFICE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 VPAMIKLACGDTSLNQAVLNGVCTFFTAVPLSIIVISYCLIAQAVLKIRSAEGRRKAFNT
:::..:::: ::..:. :: : ..:...: ..: ::: .:.::::.:.:.:.:.:::.:
CCDS31 VPALLKLACVDTTVNELVLFVVSVLFVVIPPALISISYGFITQAVLRIKSVEARHKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CLSHLLVVFLFYGSASYGYLLPAKNSKQDQGKFISLFYSLVTPMVNPLIYTLRNMEVKGA
: ::: ::..:::. : :: :. . :::::::::::..::: .::.:::::: ..: :
CCDS31 CSSHLTVVIIFYGTIIYVYLQPSDSYAQDQGKFISLFYTMVTPTLNPIIYTLRNKDMKEA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 LRRLL-GKGREVG
::.:: ::
CCDS31 LRKLLSGKL
>>CCDS1634.2 OR2C3 gene_id:81472|Hs108|chr1 (320 aa)
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Smith-Waterman score: 1233; 58.4% identity (84.9% similar) in 305 aa overlap (1-305:2-306)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MDGVNDSSLQGFVLMGISDHPQLEMIFFIAILFSYLLTLLGNSTIILLSRLEARLHTPM
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CCDS16 MMEIANVSSPEVFVLLGFSTRPSLETVLFIVVLSFYMVSILGNGIIILVSHTDVHLHTPM
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pF1KE5 YFFLSNLSSLDLAFATSSVPQMLINLWGPGKTISYGGCITQLYVFLWLGATECILLVVMA
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CCDS16 YFFLANLPFLDMSFTTSIVPQLLANLWGPQKTISYGGCVVQFYISHWLGATECVLLATMS
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pF1KE5 FDRYVAVCRPLRYTAIMNPQLCWLLAVIAWLGGLGNSVIQSTFTLQLPLCGHRRVEGFLC
.:::.:.::::.::.::.:::: ::. .::::: .:.. ::.:. :::::. .. :.:
CCDS16 YDRYAAICRPLHYTVIMHPQLCLGLALASWLGGLTTSMVGSTLTMLLPLCGNNCIDHFFC
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180 190 200 210 220 230
pF1KE5 EVPAMIKLACGDTSLNQAVLNGVCTFFTAVPLSIIVISYCLIAQAVLKIRSAEGRRKAFN
:.: ...::: :::::. . . :...::..:..:: ::.::::::::::::::::
CCDS16 EMPLIMQLACVDTSLNEMEMYLASFVFVVLPLGLILVSYGHIARAVLKIRSAEGRRKAFN
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240 250 260 270 280 290
pF1KE5 TCLSHLLVVFLFYGSASYGYLLPAKNSKQDQGKFISLFYSLVTPMVNPLIYTLRNMEVKG
:: ::. :: ::::: . :: :::.....:::::.:::..::: .::::::::: :::.
CCDS16 TCSSHVAVVSLFYGSIIFMYLQPAKSTSHEQGKFIALFYTVVTPALNPLIYTLRNTEVKS
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 ALRRLLGKGREVG
:::...
CCDS16 ALRHMVLENCCGSAGKLAQI
310 320
>>CCDS4660.1 OR2H1 gene_id:26716|Hs108|chr6 (316 aa)
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Smith-Waterman score: 1225; 59.6% identity (82.1% similar) in 307 aa overlap (4-310:2-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MDGVNDSSLQGFVLMGISDHPQLEMIFFIAILFSYLLTLLGNSTIILLSRLEARLHTPMY
::.:: .::.:.:.:.:: :: .:.... ::::::.::. ::::: : :::.:::
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pF1KE5 FFLSNLSSLDLAFATSSVPQMLINLWGPGKTISYGGCITQLYVFLWLGATECILLVVMAF
::::.:: ::: :.:: :::::.::::: ::::. :: .::..:: ::.::::::.::::
CCDS46 FFLSDLSFLDLCFTTSCVPQMLVNLWGPKKTISFLGCSVQLFIFLSLGTTECILLTVMAF
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pF1KE5 DRYVAVCRPLRYTAIMNPQLCWLLAVIAWLGGLGNSVIQSTFTLQLPLCGHRRVEGFLCE
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CCDS46 DRYVAVCQPLHYATIIHPRLCWQLASVAWVMSLVQSIVQTPSTLHLPFCPHQQIDDFLCE
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190 200 210 220 230 240
pF1KE5 VPAMIKLACGDTSLNQAVLNGVCTFFTAVPLSIIVISYCLIAQAVLKIRSAEGRRKAFNT
::..:.:.::::: :. : ..:..::::.:. :: :::::.: :: . ::::.:
CCDS46 VPSLIRLSCGDTSYNEIQLAVSSVIFVVVPLSLILASYGATAQAVLRINSATAWRKAFGT
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CLSHLLVVFLFYGSASYGYLLPAKNSKQDQGKFISLFYSLVTPMVNPLIYTLRNMEVKGA
: ::: :: :::.:. :: : . : .:::..:::.. :: .:::.::::: :.: :
CCDS46 CSSHLTVVTLFYSSVIAVYLQPKNPYAQGRGKFFGLFYAVGTPSLNPLVYTLRNKEIKRA
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE5 LRRLLGKGREVG
::::::: :.
CCDS46 LRRLLGKERDSRESWRAA
300 310
>>CCDS34365.1 OR2H2 gene_id:7932|Hs108|chr6 (312 aa)
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Smith-Waterman score: 1221; 59.9% identity (81.9% similar) in 309 aa overlap (4-312:2-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MDGVNDSSLQGFVLMGISDHPQLEMIFFIAILFSYLLTLLGNSTIILLSRLEARLHTPMY
::.:: ::.:.:.:.:: :: .:...: ::::::.::. ::::: :. .::.:::
CCDS34 MVNQSSTPGFLLLGFSEHPGLERTLFVVVLTSYLLTLVGNTLIILLSALDPKLHSPMY
10 20 30 40 50
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pF1KE5 FFLSNLSSLDLAFATSSVPQMLINLWGPGKTISYGGCITQLYVFLWLGATECILLVVMAF
::::::: ::: :.:: :::::.::::: ::::. : .:...:: ::.::::::.::::
CCDS34 FFLSNLSFLDLCFTTSCVPQMLVNLWGPKKTISFLDCSVQIFIFLSLGTTECILLTVMAF
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYVAVCRPLRYTAIMNPQLCWLLAVIAWLGGLGNSVIQSTFTLQLPLCGHRRVEGFLCE
:::::::.::.:..:..:.::: :: .::. :: .::.:. ::.::.: :.:. :.::
CCDS34 DRYVAVCQPLHYATIIHPRLCWQLASVAWVIGLVESVVQTPSTLHLPFCPDRQVDDFVCE
120 130 140 150 160 170
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pF1KE5 VPAMIKLACGDTSLNQAVLNGVCTFFTAVPLSIIVISYCLIAQAVLKIRSAEGRRKAFNT
:::.:.:.: ::: :. . . .:. .::::.:..:: :. :::.: ::.::::::.:
CCDS34 VPALIRLSCEDTSYNEIQVAVASVFILVVPLSLILVSYGAITWAVLRINSAKGRRKAFGT
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CLSHLLVVFLFYGSASYGYLLPAKNSKQDQGKFISLFYSLVTPMVNPLIYTLRNMEVKGA
: ::: :: :::.:. :: : . :..:::..:::.. :: .::::::::: :: :
CCDS34 CSSHLTVVTLFYSSVIAVYLQPKNPYAQERGKFFGLFYAVGTPSLNPLIYTLRNKEVTRA
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE5 LRRLLGKGREVG
.:::::: :.:
CCDS34 FRRLLGK--EMGLTQS
300 310
>>CCDS31119.1 OR2G6 gene_id:391211|Hs108|chr1 (316 aa)
initn: 1220 init1: 1199 opt: 1214 Z-score: 983.7 bits: 190.2 E(32554): 1.8e-48
Smith-Waterman score: 1214; 57.7% identity (84.9% similar) in 305 aa overlap (1-305:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MDGVNDSSLQGFVLMGISDHPQLEMIFFIAILFSYLLTLLGNSTIILLSRLEARLHTPMY
:. .:.:: .::.:.:.::.:::: ..: ::. :.:.::::...::. :..:::::::
CCDS31 MEETNNSSEKGFLLLGFSDQPQLERFLFAIILYFYVLSLLGNTALILVCCLDSRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FFLSNLSSLDLAFATSSVPQMLINLWGPGKTISYGGCITQLYVFLWLGATECILLVVMAF
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CCDS31 FFLSNLSCVDICFTTSVAPQLLVTMNKKDKTMSYGGCVAQLYVAMGLGSSECILLAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYVAVCRPLRYTAIMNPQLCWLLAVIAWLGGLGNSVIQSTFTLQLPLCGHRRVEGFLCE
:::.:::::::: :::.:..: :: :::.:: .:.:: ..:.:::::::: .. ..::
CCDS31 DRYAAVCRPLRYIAIMHPRFCASLAGGAWLSGLITSLIQCSLTVQLPLCGHRTLDHIFCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 VPAMIKLACGDTSLNQAVLNGVCTFFTAVPLSIIVISYCLIAQAVLKIRSAEGRRKAFNT
::..::::: ::..:.: : . . : ::. .:..:: .:.::::.:.:: ::.:::.:
CCDS31 VPVLIKLACVDTTFNEAELFVASVVFLIVPVLLILVSYGFITQAVLRIKSAAGRQKAFGT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
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CCDS31 CSSHLVVVIIFYGTIIFMYLQPANRRSKNQGKFVSLFYTIVTPLLNPIIYTLRNKDVKGA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 LRRLLGKGREVG
:: :.
CCDS31 LRTLILGSAAGQSHKD
310
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10 20 30 40 50 60
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10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FFLSNLSSLDLAFATSSVPQMLINLWGPGKTISYGGCITQLYVFLWLGATECILLVVMAF
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CCDS46 FFLSNLSLLDLCYTTSTVPQMLVNICNTRKVISYGGCVAQLFIFLALGSTECLLLAVMCF
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CCDS46 DRFVAICRPLHYSIIMHQRLCFQLAAASWISGFSNSVLQSTWTLKMPLCGHKEVDHFFCE
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CCDS46 VPALLKLSCVDTTANEAELFFISVLFLLIPVTLILISYAFIVQAVLRIQSAEGQRKAFGT
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250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 LRRLLGKGREVG
..::..:
CCDS46 FKRLVAKSLLNQEIRNMQMISFAKDTVLTYLTNFSASCPIFVITIENYCNLPQRKFP
310 320 330 340 350
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10 20 30 40 50
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CCDS31 MGMVRHTNESNLAGFILLGFSDYPQLQKVLFVLILILYLLTILGNTTIILVSRLEPKLHM
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CCDS31 PMYFFLSHLSFLYRCFTSSVIPQLLVNLWEPMKTIAYGGCLVHLYNSHALGSTECVLPAV
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pF1KE5 MAFDRYVAVCRPLRYTAIMNPQLCWLLAVIAWLGGLGNSVIQSTFTLQLPLCGHRRVEGF
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CCDS31 MSCDRYVAVCRPLHYTVLMHIHLCMALASMAWLSGIATTLVQSTLTLQLPFCGHRQVDHF
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CCDS31 ICEVPVLIKLACVGTTFNEAELFVASILFLIVPVSFILVSSGYIAHAVLRIKSATRRQKA
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pF1KE5 FNTCLSHLLVVFLFYGSASYGYLLPAKNSKQDQGKFISLFYSLVTPMVNPLIYTLRNMEV
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CCDS31 FGTCFSHLTVVTIFYGTIIFMYLQPAKSRSRDQGKFVSLFYTVVTRMLNPLIYTLRIKEV
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300 310
pF1KE5 KGALRRLLGKGREVG
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CCDS31 KGALKKVLAKALGVNIL
310
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CCDS34 MGSFNTSFEDGFILVGFSDWPQLEPILFVFIFIFYSLTLFGNTIIIALSWLDLRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
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CCDS34 FFLSHLSLLDLCFTTSTVPQLLINLCGVDRTITRGGCVAQLFIYLALGSTECVLLVVMAF
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CCDS34 DRYAAVCRPLHYMAIMHPHLCQTLAIASWGAGFVNSLIQTGLAMAMPLCGHR-LNHFFCE
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pF1KE5 VPAMIKLACGDTSLNQAVLNGVCTFFTAVPLSIIVISYCLIAQAVLKIRSAEGRRKAFNT
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CCDS34 MPVFLKLACADTEGTEAKMFVARVIVVAVPAALILGSYVHIAHAVLRVKSTAGRRKAFGT
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CCDS34 CGSHLLVVFLFYGSAIYTYLQSIHNYSEREGKFVALFYTIITPILNPLIYTLRNKDVKGA
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pF1KE5 LRRLLGKGREVG
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CCDS34 LWKVLWRGRDSG
300 310
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CCDS43 MNDDGKVNASSEGYFILVGFSNWPHLEVVIFVVVLIFYLMTLIGNLFIIILSYLDSHLHT
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pF1KE5 PMYFFLSNLSSLDLAFATSSVPQMLINLWGPGKTISYGGCITQLYVFLWLGATECILLVV
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CCDS43 MSYDRYAAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLAVASWVSGFTNSALHSSFTFWVPLCGHRQVDHF
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CCDS43 FCEVPALLRLSCVDTHVNELTLMITSSIFVLIPLILILTSYGAIVRAILRMQSTTGLQKV
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CCDS43 RGAVKRLMGWE
310
312 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]