Result of FASTA (omim) for
pFN21AE5421
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5421, 312 aa
1>>>pF1KE5421 312 - 312 aa - 312 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0087+/-0.000502; mu= 17.4181+/- 0.031
mean_var=134.8633+/-37.948, 0's: 0 Z-trim(108.1): 331 B-trim: 874 in 1/48
Lambda= 0.110440
statistics sampled from 15748 (16217) to 15748 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.532), E-opt: 0.2 (0.19), width: 16
Scan time: 6.500
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 871 151.2 2.5e-36
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 855 148.7 1.5e-35
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 843 146.7 5.5e-35
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 831 144.8 2.1e-34
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 827 144.2 3.2e-34
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 825 143.9 4.1e-34
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 825 143.9 4.1e-34
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 825 143.9 4.1e-34
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 801 140.0 5.6e-33
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 798 139.6 7.9e-33
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 797 139.5 9.1e-33
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 789 138.2 2.1e-32
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 789 138.2 2.1e-32
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 789 138.2 2.2e-32
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 787 137.8 2.7e-32
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 777 136.3 8.1e-32
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 776 136.1 8.9e-32
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 713 126.0 9.5e-29
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 711 125.7 1.2e-28
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 696 123.3 6.2e-28
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 479 88.8 1.6e-17
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 446 83.5 6.1e-16
XP_011508791 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 313) 236 50.0 7.2e-06
XP_006712259 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 333) 236 50.1 7.4e-06
XP_006712258 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 370) 236 50.2 7.9e-06
XP_011508790 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 376) 236 50.2 7.9e-06
XP_011508789 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 403) 236 50.2 8.3e-06
NP_006047 (OMIM: 604153) neuromedin-U receptor 1 [ ( 426) 236 50.2 8.5e-06
XP_011543933 (OMIM: 300525) PREDICTED: P2Y purinoc ( 359) 209 45.8 0.00015
XP_011544481 (OMIM: 300525) PREDICTED: P2Y purinoc ( 359) 209 45.8 0.00015
XP_005274486 (OMIM: 300525) PREDICTED: P2Y purinoc ( 359) 209 45.8 0.00015
NP_835230 (OMIM: 300525) P2Y purinoceptor 8 [Homo ( 359) 209 45.8 0.00015
XP_005274835 (OMIM: 300525) PREDICTED: P2Y purinoc ( 359) 209 45.8 0.00015
XP_011544480 (OMIM: 300525) PREDICTED: P2Y purinoc ( 359) 209 45.8 0.00015
XP_011543934 (OMIM: 300525) PREDICTED: P2Y purinoc ( 359) 209 45.8 0.00015
NP_000862 (OMIM: 601109) 5-hydroxytryptamine recep ( 440) 208 45.8 0.00019
XP_006724506 (OMIM: 300525) PREDICTED: P2Y purinoc ( 548) 209 46.1 0.00019
XP_006724927 (OMIM: 300525) PREDICTED: P2Y purinoc ( 548) 209 46.1 0.00019
NP_001050 (OMIM: 162332,614840) neuromedin-K recep ( 465) 207 45.7 0.00022
XP_011535972 (OMIM: 605108) PREDICTED: neuromedin- ( 321) 202 44.6 0.00031
NP_064552 (OMIM: 605108) neuromedin-U receptor 2 [ ( 415) 202 44.8 0.00036
XP_011527129 (OMIM: 162651) PREDICTED: neurotensin ( 336) 197 43.9 0.00055
NP_002522 (OMIM: 162651) neurotensin receptor type ( 418) 197 44.0 0.00062
XP_011529100 (OMIM: 300253) PREDICTED: probable G- ( 373) 191 43.0 0.0011
NP_061842 (OMIM: 300253) probable G-protein couple ( 373) 191 43.0 0.0011
NP_000697 (OMIM: 600821) vasopressin V1a receptor ( 418) 191 43.1 0.0012
NP_005758 (OMIM: 278150,609239) lysophosphatidic a ( 344) 185 42.0 0.0021
NP_001155969 (OMIM: 278150,609239) lysophosphatidi ( 344) 185 42.0 0.0021
NP_001155970 (OMIM: 278150,609239) lysophosphatidi ( 344) 185 42.0 0.0021
XP_005246587 (OMIM: 146928) PREDICTED: C-X-C chemo ( 360) 183 41.7 0.0027
>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
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Smith-Waterman score: 871; 45.1% identity (74.9% similar) in 295 aa overlap (10-304:13-307)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MEKWNHTSNDFILLGLLPPNQTGIFLLCLIILIFFLASVGNSAMIHLIHVDPRLHTP
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NP_006 STCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKDVK
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300 310
pF1KE5 GAMRRVFGIFSFLKE
: ..:.
NP_006 DAAEKVLRSKVDSS
310
>>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo (314 aa)
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Smith-Waterman score: 855; 43.1% identity (73.4% similar) in 304 aa overlap (1-303:1-304)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MEKWNHTS-NDFILLGLLPPNQTGIFLLCLIILIFFLASVGNSAMIHLIHVDPRLHTPMY
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NP_003 MTRKNYTSLTEFVLLGLADTLELQIILFLFFLVIYTLTVLGNLGMILLIRIDSQLHTPMY
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NP_003 FFLANLSFVDVCNSTTITPKMLADLLSEKKTISFAGCFLQMYFFISLATTECILFGLMAY
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pF1KE5 DRYLAICHSLYYPIRMSKMMCVKMIGGSWTLGSINSLAHTVFALHIPYCRSRAIDHFFCD
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pF1KE5 VPAMLLLACTDTWVYEYMVFVSTSLFLLFPFIGITSSCGRVLFAVYHMHSKEGRKKAFTT
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NP_003 SPPLFKLSCSDTILKESISSILAGVNIVGTLLVILSSYSYVLFSIFSMHSGEGRHRAFST
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pF1KE5 ISTHLTVVIFYYAPFVYTYLRPRNLRSPAEDKILAVFYTILTPMLNPIIYSLRNKEVLGA
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NP_003 CASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRSKEVKKA
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300 310
pF1KE5 MRRVFGIFSFLKE
. :
NP_003 LANVISRKRTSSFL
310
>>NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [Homo (308 aa)
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Smith-Waterman score: 843; 43.4% identity (74.0% similar) in 304 aa overlap (1-303:1-302)
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pF1KE5 MEKWNHTS-NDFILLGLLPPNQTGIFLLCLIILIFFLASVGNSAMIHLIHVDPRLHTPMY
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pF1KE5 VPAMLLLACTDTWVYEYMVFVSTSLFLLFPFIGITSSCGRVLFAVYHMHSKEGRKKAFTT
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NP_003 APALLILASTDTHASEMAIFLMGVVILLIPVFLILVSYGRIIVTVVKMKSTVGSLKAFST
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pF1KE5 ISTHLTVVIFYYAPFVYTYLRPRNLRSPAEDKILAVFYTILTPMLNPIIYSLRNKEVLGA
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NP_003 CGSHLMVVILFYGSAIITYMTPKS--SKQQEKSVSVFYAIVTPMLNPLIYSLRNKDVKAA
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pF1KE5 MRRVFGIFSFLKE
.:.:
NP_003 LRKVATRNFP
300
>>NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [Homo (312 aa)
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Smith-Waterman score: 831; 40.7% identity (72.8% similar) in 302 aa overlap (5-305:3-304)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MEKWNHTSND-FILLGLLPPNQTGIFLLCLIILIFFLASVGNSAMIHLIHVDPRLHTPMY
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NP_009 MVNQSSTPGFLLLGFSEHPGLERTLFVVVLTSYLLTLVGNTLIILLSALDPKLHSPMY
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pF1KE5 FLLSQLSLMDLMYISTTVPKMAYNFLSGQKGISFLGCGVQSFFFLTMACSEGLLLTSMAY
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NP_009 FFLSNLSFLDLCFTTSCVPQMLVNLWGPKKTISFLDCSVQIFIFLSLGTTECILLTVMAF
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pF1KE5 DRYLAICHSLYYPIRMSKMMCVKMIGGSWTLGSINSLAHTVFALHIPYCRSRAIDHFFCD
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NP_009 DRYVAVCQPLHYATIIHPRLCWQLASVAWVIGLVESVVQTPSTLHLPFCPDRQVDDFVCE
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pF1KE5 ISTHLTVVIFYYAPFVYTYLRPRNLRSPAEDKILAVFYTILTPMLNPIIYSLRNKEVLGA
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NP_009 CSSHLTVVTLFYSSVIAVYLQPKNPYAQERGKFFGLFYAVGTPSLNPLIYTLRNKEVTRA
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300 310
pF1KE5 MRRVFGIFSFLKE
.::..:
NP_009 FRRLLGKEMGLTQS
300 310
>>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor (311 aa)
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Smith-Waterman score: 827; 41.0% identity (71.7% similar) in 307 aa overlap (3-305:6-309)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MEKWNHTSND-FILLGL--LPPNQTGIFLLCLIILIFFLAS-VGNSAMIHLIHVDPR
: : .:. :::.:. : .. ::. ..:::.: . .:: .: : ..: .
NP_001 MNDDGKVNASSEGYFILVGFSNWPHLEVVIFV---VVLIFYLMTLIGNLFIIILSYLDSH
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pF1KE5 LHTPMYFLLSQLSLMDLMYISTTVPKMAYNFLSGQKGISFLGCGVQSFFFLTMACSEGLL
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NP_001 LHTPMYFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLWGPEKTISYAGCMIQLYFVLALGTTECVL
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pF1KE5 LTSMAYDRYLAICHSLYYPIRMSKMMCVKMIGGSWTLGSINSLAHTVFALHIPYCRSRAI
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NP_001 LVVMSYDRYAAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLAVASWVSGFTNSALHSSFTFWVPLCGHRQV
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pF1KE5 DHFFCDVPAMLLLACTDTWVYEYMVFVSTSLFLLFPFIGITSSCGRVLFAVYHMHSKEGR
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NP_001 DHFFCEVPALLRLSCVDTHVNELTLMITSSIFVLIPLILILTSYGAIVRAILRMQSTTGL
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pF1KE5 KKAFTTISTHLTVVIFYYAPFVYTYLRPRNLRSPAEDKILAVFYTILTPMLNPIIYSLRN
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NP_001 QKVFGTCGAHLMAVSLFFIPAMCMYLQPPSGNSQDQGKFIALFYTVVTPSLNPLIYTLRN
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pF1KE5 KEVLGAMRRVFGIFSFLKE
: : ::..:..:
NP_001 KVVRGAVKRLMGWE
300 310
>>XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
initn: 845 init1: 822 opt: 825 Z-score: 733.5 bits: 143.9 E(85289): 4.1e-34
Smith-Waterman score: 825; 41.7% identity (75.5% similar) in 302 aa overlap (9-310:10-311)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MEKWNHTSNDFILLGLLPPNQTGIFLLCLIILIFFLASVGNSAMIHLIHVDPRLHTPMY
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XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
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pF1KE5 FLLSQLSLMDLMYISTTVPKMAYNFLSGQKGISFLGCGVQSFFFLTMACSEGLLLTSMAY
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XP_011 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
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120 130 140 150 160 170
pF1KE5 DRYLAICHSLYYPIRMSKMMCVKMIGGSWTLGSINSLAHTVFALHIPYCRSRAIDHFFCD
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XP_011 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 VPAMLLLACTDTWVYEYMVFVSTSLFLLFPFIGITSSCGRVLFAVYHMHSKEGRKKAFTT
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XP_011 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 ISTHLTVVIFYYAPFVYTYLRPRNLRSPAEDKILAVFYTILTPMLNPIIYSLRNKEVLGA
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XP_011 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 MRRVFGIFSFLKE
.... :: :
XP_011 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
>>NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [Homo (317 aa)
initn: 845 init1: 822 opt: 825 Z-score: 733.5 bits: 143.9 E(85289): 4.1e-34
Smith-Waterman score: 825; 41.7% identity (75.5% similar) in 302 aa overlap (9-310:10-311)
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pF1KE5 MEKWNHTSNDFILLGLLPPNQTGIFLLCLIILIFFLASVGNSAMIHLIHVDPRLHTPMY
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pF1KE5 FLLSQLSLMDLMYISTTVPKMAYNFLSGQKGISFLGCGVQSFFFLTMACSEGLLLTSMAY
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NP_036 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
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pF1KE5 DRYLAICHSLYYPIRMSKMMCVKMIGGSWTLGSINSLAHTVFALHIPYCRSRAIDHFFCD
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NP_036 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
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pF1KE5 VPAMLLLACTDTWVYEYMVFVSTSLFLLFPFIGITSSCGRVLFAVYHMHSKEGRKKAFTT
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NP_036 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
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NP_036 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA
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300 310
pF1KE5 MRRVFGIFSFLKE
.... :: :
NP_036 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
>>XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
initn: 845 init1: 822 opt: 825 Z-score: 733.5 bits: 143.9 E(85289): 4.1e-34
Smith-Waterman score: 825; 41.7% identity (75.5% similar) in 302 aa overlap (9-310:10-311)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MEKWNHTSNDFILLGLLPPNQTGIFLLCLIILIFFLASVGNSAMIHLIHVDPRLHTPMY
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XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
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pF1KE5 FLLSQLSLMDLMYISTTVPKMAYNFLSGQKGISFLGCGVQSFFFLTMACSEGLLLTSMAY
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XP_011 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
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pF1KE5 DRYLAICHSLYYPIRMSKMMCVKMIGGSWTLGSINSLAHTVFALHIPYCRSRAIDHFFCD
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XP_011 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
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pF1KE5 VPAMLLLACTDTWVYEYMVFVSTSLFLLFPFIGITSSCGRVLFAVYHMHSKEGRKKAFTT
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XP_011 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
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300 310
pF1KE5 MRRVFGIFSFLKE
.... :: :
XP_011 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
>>XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory recep (300 aa)
initn: 790 init1: 790 opt: 801 Z-score: 713.1 bits: 140.0 E(85289): 5.6e-33
Smith-Waterman score: 801; 40.4% identity (72.6% similar) in 292 aa overlap (5-295:3-294)
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pF1KE5 MEKWNHTSND-FILLGLLPPNQTGIFLLCLIILIFFLASVGNSAMIHLIHVDPRLHTPMY
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pF1KE5 FLLSQLSLMDLMYISTTVPKMAYNFLSGQKGISFLGCGVQSFFFLTMACSEGLLLTSMAY
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XP_011 FFLSNLSFLDLCFTTSCVPQMLVNLWGPKKTISFLDCSVQIFIFLSLGTTECILLTVMAF
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pF1KE5 DRYLAICHSLYYPIRMSKMMCVKMIGGSWTLGSINSLAHTVFALHIPYCRSRAIDHFFCD
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XP_011 DRYVAVCQPLHYATIIHPRLCWQLASVAWVIGLVESVVQTPSTLHLPFCPDRQVDDFVCE
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pF1KE5 VPAMLLLACTDTWVYEYMVFVSTSLFLLFPFIGITSSCGRVLFAVYHMHSKEGRKKAFTT
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XP_011 VPALIRLSCEDTSYNEIQVAVASVFILVVPLSLILVSYGAITWAVLRINSAKGRRKAFGT
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pF1KE5 ISTHLTVVIFYYAPFVYTYLRPRNLRSPAEDKILAVFYTILTPMLNPIIYSLRNKEVLGA
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XP_011 CSSHLTVVTLFYSSVIAVYLQPKNPYAQERGKFFGLFYAVGTPSLNPLIYTLRNKEQKRR
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300 310
pF1KE5 MRRVFGIFSFLKE
XP_011 GS
300
>>NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN1 [H (311 aa)
initn: 838 init1: 795 opt: 798 Z-score: 710.3 bits: 139.6 E(85289): 7.9e-33
Smith-Waterman score: 798; 44.1% identity (70.8% similar) in 295 aa overlap (11-303:13-305)
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NP_001 FCDMPQLLILSCTDTFFVQVMTAILTMFFGIASALVIMISYGYIGISIMKITSAKGRSKA
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pF1KE5 FTTISTHLTVVIFYYAPFVYTYLRPRNLRSPAEDKILAVFYTILTPMLNPIIYSLRNKEV
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]