FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5421, 312 aa
1>>>pF1KE5421 312 - 312 aa - 312 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0927+/-0.00126; mu= 11.0356+/- 0.073
mean_var=158.1638+/-54.135, 0's: 0 Z-trim(102.4): 390 B-trim: 768 in 2/47
Lambda= 0.101981
statistics sampled from 6417 (6936) to 6417 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.556), E-opt: 0.2 (0.213), width: 16
Scan time: 1.970
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS1637.1 OR2L13 gene_id:284521|Hs108|chr1 ( 312) 2089 320.2 1.3e-87
CCDS31104.1 OR2L3 gene_id:391192|Hs108|chr1 ( 312) 1498 233.3 1.9e-61
CCDS31103.1 OR2L2 gene_id:26246|Hs108|chr1 ( 312) 1494 232.7 2.9e-61
CCDS58068.1 OR2L5 gene_id:81466|Hs108|chr1 ( 312) 1489 231.9 4.8e-61
CCDS31102.1 OR2AK2 gene_id:391191|Hs108|chr1 ( 335) 1116 177.1 1.7e-44
CCDS31115.1 OR2T1 gene_id:26696|Hs108|chr1 ( 369) 1080 171.9 6.9e-43
CCDS31105.1 OR2M5 gene_id:127059|Hs108|chr1 ( 312) 1062 169.1 3.9e-42
CCDS4461.1 OR2V2 gene_id:285659|Hs108|chr5 ( 315) 1062 169.1 3.9e-42
CCDS31107.1 OR2M3 gene_id:127062|Hs108|chr1 ( 312) 1060 168.8 4.8e-42
CCDS58992.1 OR2V1 gene_id:26693|Hs108|chr5 ( 315) 1049 167.2 1.5e-41
CCDS31109.1 OR2T33 gene_id:391195|Hs108|chr1 ( 320) 1041 166.0 3.4e-41
CCDS31106.1 OR2M2 gene_id:391194|Hs108|chr1 ( 347) 1041 166.1 3.6e-41
CCDS31111.1 OR2M7 gene_id:391196|Hs108|chr1 ( 312) 1023 163.4 2.1e-40
CCDS31100.1 OR2T8 gene_id:343172|Hs108|chr1 ( 312) 1019 162.8 3.1e-40
CCDS55695.1 OR2T29 gene_id:343563|Hs108|chr1 ( 315) 1011 161.6 7.2e-40
CCDS31118.1 OR2T5 gene_id:401993|Hs108|chr1 ( 315) 1010 161.5 7.9e-40
CCDS31113.1 OR2T4 gene_id:127074|Hs108|chr1 ( 348) 1009 161.4 9.3e-40
CCDS31116.1 OR2T2 gene_id:401992|Hs108|chr1 ( 324) 1006 160.9 1.2e-39
CCDS31124.1 OR2T27 gene_id:403239|Hs108|chr1 ( 317) 1005 160.7 1.3e-39
CCDS31110.1 OR2T12 gene_id:127064|Hs108|chr1 ( 320) 1001 160.2 2e-39
CCDS31108.1 OR2M4 gene_id:26245|Hs108|chr1 ( 311) 996 159.4 3.3e-39
CCDS31123.1 OR2T35 gene_id:403244|Hs108|chr1 ( 323) 995 159.3 3.7e-39
CCDS31114.1 OR2T6 gene_id:254879|Hs108|chr1 ( 308) 976 156.5 2.5e-38
CCDS31121.1 OR2T10 gene_id:127069|Hs108|chr1 ( 312) 948 152.3 4.4e-37
CCDS34696.1 OR2AE1 gene_id:81392|Hs108|chr7 ( 323) 943 151.6 7.5e-37
CCDS32895.1 OR2Z1 gene_id:284383|Hs108|chr19 ( 314) 942 151.5 8.1e-37
CCDS31414.1 OR2AG1 gene_id:144125|Hs108|chr11 ( 316) 936 150.6 1.5e-36
CCDS31413.1 OR2AG2 gene_id:338755|Hs108|chr11 ( 316) 928 149.4 3.4e-36
CCDS31117.1 OR2T3 gene_id:343173|Hs108|chr1 ( 318) 906 146.2 3.2e-35
CCDS31120.1 OR2T34 gene_id:127068|Hs108|chr1 ( 318) 897 144.8 8.1e-35
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 871 141.0 1.1e-33
CCDS43434.1 OR2J2 gene_id:26707|Hs108|chr6 ( 312) 864 140.0 2.3e-33
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 862 139.7 2.8e-33
CCDS35092.1 OR13C2 gene_id:392376|Hs108|chr9 ( 318) 861 139.6 3.2e-33
CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11 ( 330) 860 139.4 3.6e-33
CCDS30906.1 OR6N2 gene_id:81442|Hs108|chr1 ( 317) 859 139.3 3.9e-33
CCDS56515.1 OR2A42 gene_id:402317|Hs108|chr7 ( 310) 855 138.7 5.7e-33
CCDS43673.1 OR2A1 gene_id:346528|Hs108|chr7 ( 310) 855 138.7 5.7e-33
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 855 138.7 5.8e-33
CCDS43668.1 OR2A5 gene_id:393046|Hs108|chr7 ( 311) 851 138.1 8.7e-33
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 848 137.6 1.2e-32
CCDS35093.1 OR13C9 gene_id:286362|Hs108|chr9 ( 318) 846 137.3 1.5e-32
CCDS31416.1 OR2D2 gene_id:120776|Hs108|chr11 ( 308) 843 136.9 1.9e-32
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 836 135.9 4e-32
CCDS31119.1 OR2G6 gene_id:391211|Hs108|chr1 ( 316) 834 135.6 4.9e-32
CCDS35091.1 OR13C5 gene_id:138799|Hs108|chr9 ( 318) 832 135.3 6.1e-32
CCDS34365.1 OR2H2 gene_id:7932|Hs108|chr6 ( 312) 831 135.1 6.7e-32
CCDS31090.1 OR2B11 gene_id:127623|Hs108|chr1 ( 317) 831 135.1 6.7e-32
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 830 135.0 7.4e-32
CCDS43433.1 OR2J3 gene_id:442186|Hs108|chr6 ( 311) 827 134.5 1e-31
>>CCDS1637.1 OR2L13 gene_id:284521|Hs108|chr1 (312 aa)
initn: 2089 init1: 2089 opt: 2089 Z-score: 1686.5 bits: 320.2 E(32554): 1.3e-87
Smith-Waterman score: 2089; 100.0% identity (100.0% similar) in 312 aa overlap (1-312:1-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MEKWNHTSNDFILLGLLPPNQTGIFLLCLIILIFFLASVGNSAMIHLIHVDPRLHTPMYF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 MEKWNHTSNDFILLGLLPPNQTGIFLLCLIILIFFLASVGNSAMIHLIHVDPRLHTPMYF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LLSQLSLMDLMYISTTVPKMAYNFLSGQKGISFLGCGVQSFFFLTMACSEGLLLTSMAYD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 LLSQLSLMDLMYISTTVPKMAYNFLSGQKGISFLGCGVQSFFFLTMACSEGLLLTSMAYD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 RYLAICHSLYYPIRMSKMMCVKMIGGSWTLGSINSLAHTVFALHIPYCRSRAIDHFFCDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 RYLAICHSLYYPIRMSKMMCVKMIGGSWTLGSINSLAHTVFALHIPYCRSRAIDHFFCDV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 PAMLLLACTDTWVYEYMVFVSTSLFLLFPFIGITSSCGRVLFAVYHMHSKEGRKKAFTTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 PAMLLLACTDTWVYEYMVFVSTSLFLLFPFIGITSSCGRVLFAVYHMHSKEGRKKAFTTI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 STHLTVVIFYYAPFVYTYLRPRNLRSPAEDKILAVFYTILTPMLNPIIYSLRNKEVLGAM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 STHLTVVIFYYAPFVYTYLRPRNLRSPAEDKILAVFYTILTPMLNPIIYSLRNKEVLGAM
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 RRVFGIFSFLKE
::::::::::::
CCDS16 RRVFGIFSFLKE
310
>>CCDS31104.1 OR2L3 gene_id:391192|Hs108|chr1 (312 aa)
initn: 1498 init1: 1498 opt: 1498 Z-score: 1216.6 bits: 233.3 E(32554): 1.9e-61
Smith-Waterman score: 1498; 72.3% identity (89.4% similar) in 303 aa overlap (1-303:1-303)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MEKWNHTSNDFILLGLLPPNQTGIFLLCLIILIFFLASVGNSAMIHLIHVDPRLHTPMYF
::..:.::.::::::..::.. :.::. ::..::..: .:: .:: :: .: .:::::::
CCDS31 MENYNQTSTDFILLGFFPPSRIGLFLFILIVFIFLMALIGNLSMILLIFLDTHLHTPMYF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LLSQLSLMDLMYISTTVPKMAYNFLSGQKGISFLGCGVQSFFFLTMACSEGLLLTSMAYD
:::::::.:: :::: ::::: .::::.:.::: :::.::::: ... .:.:::.:::::
CCDS31 LLSQLSLIDLNYISTIVPKMASDFLSGNKSISFTGCGIQSFFFSALGGAEALLLASMAYD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 RYLAICHSLYYPIRMSKMMCVKMIGGSWTLGSINSLAHTVFALHIPYCRSRAIDHFFCDV
::.::: :.::::::: ::: :: ::: .::::. ::::..::::::.::::.::::::
CCDS31 RYIAICFPLHYPIRMSKRMCVLMITGSWIIGSINACAHTVYVLHIPYCQSRAINHFFCDV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 PAMLLLACTDTWVYEYMVFVSTSLFLLFPFIGITSSCGRVLFAVYHMHSKEGRKKAFTTI
:::. ::: :::::: ::.::..::.::::.:. : ::::.:::::.: ::::::. :
CCDS31 PAMVTLACMDTWVYEGTVFLSTTIFLVFPFIAISCSYGRVLLAVYHMKSAEGRKKAYLTC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 STHLTVVIFYYAPFVYTYLRPRNLRSPAEDKILAVFYTILTPMLNPIIYSLRNKEVLGAM
::::::: ::::::::::::::.::::.:::.:::::: :::::::::::::::::.::.
CCDS31 STHLTVVTFYYAPFVYTYLRPRSLRSPTEDKVLAVFYTTLTPMLNPIIYSLRNKEVMGAL
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 RRVFGIFSFLKE
::
CCDS31 TRVSQRICSGKM
310
>>CCDS31103.1 OR2L2 gene_id:26246|Hs108|chr1 (312 aa)
initn: 1551 init1: 1490 opt: 1494 Z-score: 1213.4 bits: 232.7 E(32554): 2.9e-61
Smith-Waterman score: 1494; 72.2% identity (89.3% similar) in 309 aa overlap (1-308:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MEKWNHTSNDFILLGLLPPNQTGIFLLCLIILIFFLASVGNSAMIHLIHVDPRLHTPMYF
::..:.::.:::::::.: .. :.:.. ::.:::..: .:: .:: :: .: .:::::::
CCDS31 MENYNQTSTDFILLGLFPQSRIGLFVFTLIFLIFLMALIGNLSMILLIFLDIHLHTPMYF
10 20 30 40 50 60
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pF1KE5 LLSQLSLMDLMYISTTVPKMAYNFLSGQKGISFLGCGVQSFFFLTMACSEGLLLTSMAYD
:::::::.:: :::: ::::.:.:: :.:.::: :::.:::::::.: .:::::::::::
CCDS31 LLSQLSLIDLNYISTIVPKMVYDFLYGNKSISFTGCGIQSFFFLTLAVAEGLLLTSMAYD
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pF1KE5 RYLAICHSLYYPIRMSKMMCVKMIGGSWTLGSINSLAHTVFALHIPYCRSRAIDHFFCDV
::.::: :.::::.:: .:: :: ::: ..:::: ::::.:: ::::.::::.::::::
CCDS31 RYVAICFPLHYPIRISKRVCVMMITGSWMISSINSCAHTVYALCIPYCKSRAINHFFCDV
130 140 150 160 170 180
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pF1KE5 PAMLLLACTDTWVYEYMVFVSTSLFLLFPFIGITSSCGRVLFAVYHMHSKEGRKKAFTTI
:::: :::::::::: ::.:...::..:: ::. : ::::.:::.::: ::::::..:
CCDS31 PAMLTLACTDTWVYESTVFLSSTIFLVLPFTGIACSYGRVLLAVYRMHSAEGRKKAYSTC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 STHLTVVIFYYAPFVYTYLRPRNLRSPAEDKILAVFYTILTPMLNPIIYSLRNKEVLGAM
::::::: ::::::.:::.:::.::::.::::::::::::::::::::::::::::.::.
CCDS31 STHLTVVSFYYAPFAYTYVRPRSLRSPTEDKILAVFYTILTPMLNPIIYSLRNKEVMGAL
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 RRVFG-IFSFLKE
.:. :::
CCDS31 TQVIQKIFSVKM
310
>>CCDS58068.1 OR2L5 gene_id:81466|Hs108|chr1 (312 aa)
initn: 1483 init1: 1483 opt: 1489 Z-score: 1209.4 bits: 231.9 E(32554): 4.8e-61
Smith-Waterman score: 1489; 72.2% identity (89.3% similar) in 309 aa overlap (1-308:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MEKWNHTSNDFILLGLLPPNQTGIFLLCLIILIFFLASVGNSAMIHLIHVDPRLHTPMYF
::..:.::.:::::::.::.. :.::. :..:::..: .:: .:: :: .: .:::::::
CCDS58 MENYNQTSTDFILLGLFPPSKIGLFLFILFVLIFLMALIGNLSMILLIFLDTHLHTPMYF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LLSQLSLMDLMYISTTVPKMAYNFLSGQKGISFLGCGVQSFFFLTMACSEGLLLTSMAYD
:::::::.:: :::: ::::: .:: :.:.:::.:::.:::::.:.: .:.:::::::::
CCDS58 LLSQLSLIDLNYISTIVPKMASDFLYGNKSISFIGCGIQSFFFMTFAGAEALLLTSMAYD
70 80 90 100 110 120
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pF1KE5 RYLAICHSLYYPIRMSKMMCVKMIGGSWTLGSINSLAHTVFALHIPYCRSRAIDHFFCDV
::.::: :.::::::: : : :: ::: .::::: ::::.:..::::.::::.::::::
CCDS58 RYVAICFPLHYPIRMSKRMYVLMITGSWMIGSINSCAHTVYAFRIPYCKSRAINHFFCDV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 PAMLLLACTDTWVYEYMVFVSTSLFLLFPFIGITSSCGRVLFAVYHMHSKEGRKKAFTTI
:::: ::::::::::: ::.:...::.::: ::. : : ::.:::.::: ::::::..:
CCDS58 PAMLTLACTDTWVYEYTVFLSSTIFLVFPFTGIACSYGWVLLAVYRMHSAEGRKKAYSTC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 STHLTVVIFYYAPFVYTYLRPRNLRSPAEDKILAVFYTILTPMLNPIIYSLRNKEVLGAM
::::::: ::::::.:::: ::.::: .:::.::::::::::::::::::::::::.::.
CCDS58 STHLTVVTFYYAPFAYTYLCPRSLRSLTEDKVLAVFYTILTPMLNPIIYSLRNKEVMGAL
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 RRVF-GIFSFLKE
::. .:::
CCDS58 TRVIQNIFSVKM
310
>>CCDS31102.1 OR2AK2 gene_id:391191|Hs108|chr1 (335 aa)
initn: 1157 init1: 1114 opt: 1116 Z-score: 912.5 bits: 177.1 E(32554): 1.7e-44
Smith-Waterman score: 1116; 53.6% identity (82.0% similar) in 306 aa overlap (1-305:16-321)
10 20 30 40
pF1KE5 MEKWNHT-SNDFILLGLLPPNQTGIFLLCLIILIFFLASVGNSAM
:. :.. ..::.:.::. . . .:. .: .: .: .:: .
CCDS31 MNISDVISFDILVSAMKTGNQSFGTDFLLVGLFQYGWINSLLFVVIATLFTVALTGNIML
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE5 IHLIHVDPRLHTPMYFLLSQLSLMDLMYISTTVPKMAYNFLSGQKGISFLGCGVQSFFFL
::::... ::::::::::::::..::::::::::::: .::: .: : :::: .:.. ::
CCDS31 IHLIRLNTRLHTPMYFLLSQLSIVDLMYISTTVPKMAVSFLSQSKTIRFLGCEIQTYVFL
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE5 TMACSEGLLLTSMAYDRYLAICHSLYYPIRMSKMMCVKMIGGSWTLGSINSLAHTVFALH
... .:.::: :.::::.:::: :.::. ::: .: :.. .:. ::::.. ::.....
CCDS31 ALGGTEALLLGFMSYDRYVAICHPLHYPMLMSKKICCLMVACAWASGSINAFIHTLYVFQ
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE5 IPYCRSRAIDHFFCDVPAMLLLACTDTWVYEYMVFVSTSLFLLFPFIGITSSCGRVLFAV
.:.:::: :.::::.:::.: :.: :: ::: :..: ..::.::..: .: .:::..:
CCDS31 LPFCRSRLINHFFCEVPALLSLVCQDTSQYEYTVLLSGLIILLLPFLAILASYARVLIVV
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE5 YHMHSKEGRKKAFTTISTHLTVVIFYYAPFVYTYLRPRNLRSPAEDKILAVFYTILTPML
..: : .:. :: .: :.:: :. ..:: ..:: ::..::::..:: .::::::.::.:
CCDS31 FQMSSGKGQAKAVSTCSSHLIVASLFYATTLFTYTRPHSLRSPSRDKAVAVFYTIVTPLL
250 260 270 280 290 300
290 300 310
pF1KE5 NPIIYSLRNKEVLGAMRRVFGIFSFLKE
::.::::::::: ::.::..:
CCDS31 NPFIYSLRNKEVTGAVRRLLGYWICCRKYDFRSLY
310 320 330
>>CCDS31115.1 OR2T1 gene_id:26696|Hs108|chr1 (369 aa)
initn: 1102 init1: 1080 opt: 1080 Z-score: 883.4 bits: 171.9 E(32554): 6.9e-43
Smith-Waterman score: 1080; 52.1% identity (80.5% similar) in 307 aa overlap (1-307:52-358)
10 20 30
pF1KE5 MEKWNHTSNDFILLGLLPPNQTGIFLLCLI
::..: .:.:: ..::. ..:. ... .:
CCDS31 INSHVVILLPWECYHLIWKILPYIGTTVGSMEEYNTSSTDFTFMGLFNRKETSGLIFAII
30 40 50 60 70 80
40 50 60 70 80 90
pF1KE5 ILIFFLASVGNSAMIHLIHVDPRLHTPMYFLLSQLSLMDLMYISTTVPKMAYNFLSGQKG
.::: : ..:..:: ::..: :::::::::::.:::.:.::::: :::: :.: :.
CCDS31 SIIFFTALMANGVMIFLIQTDLRLHTPMYFLLSHLSLIDMMYISTIVPKMLVNYLLDQRT
90 100 110 120 130 140
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CCDS31 ALRKVLGKGKCGE
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CCDS44 EMLSLLKLACVDTSLFEKVIFACCVFMLLFPFSIIVASYAHILGTVLQMHSAQAWKKALA
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CCDS44 ALRKGLDRCRIGSQH
310
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CCDS31 CSSHLLVVGMYYGAALFMYIRPTSDRSPTQDKMVSVFYTILTPMLNPLIYSLRNKEVTRA
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CCDS58 EVQALLKLACADTSLFDTLLFACCVFMLLLPFSIIMASYACILGAVLRIRSAQAWKKALA
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]