Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5404
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5404, 310 aa
1>>>pF1KE5404 310 - 310 aa - 310 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3201+/-0.00106; mu= 15.2912+/- 0.063
mean_var=62.8704+/-13.131, 0's: 0 Z-trim(101.6): 80 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.161753
statistics sampled from 6526 (6607) to 6526 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.561), E-opt: 0.2 (0.203), width: 16
Scan time: 1.820
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS6716.1 HSD17B3 gene_id:3293|Hs108|chr9 ( 310) 1996 474.8 3.7e-134
CCDS7905.1 HSD17B12 gene_id:51144|Hs108|chr11 ( 312) 707 174.0 1.3e-43
CCDS10942.1 HSDL1 gene_id:83693|Hs108|chr16 ( 330) 550 137.4 1.5e-32
CCDS54046.1 HSDL1 gene_id:83693|Hs108|chr16 ( 275) 268 71.5 8.2e-13
CCDS9743.1 DHRS7 gene_id:51635|Hs108|chr14 ( 339) 250 67.4 1.8e-11
CCDS9605.1 DHRS4 gene_id:10901|Hs108|chr14 ( 278) 242 65.4 5.6e-11
>>CCDS6716.1 HSD17B3 gene_id:3293|Hs108|chr9 (310 aa)
initn: 1996 init1: 1996 opt: 1996 Z-score: 2522.0 bits: 474.8 E(32554): 3.7e-134
Smith-Waterman score: 1996; 100.0% identity (100.0% similar) in 310 aa overlap (1-310:1-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGDVLEQFFILTGLLVCLACLAKCVRFSRCVLLNYWKVLPKSFLRSMGQWAVITGAGDGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 MGDVLEQFFILTGLLVCLACLAKCVRFSRCVLLNYWKVLPKSFLRSMGQWAVITGAGDGI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 GKAYSFELAKRGLNVVLISRTLEKLEAIATEIERTTGRSVKIIQADFTKDDIYEHIKEKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 GKAYSFELAKRGLNVVLISRTLEKLEAIATEIERTTGRSVKIIQADFTKDDIYEHIKEKL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 AGLEIGILVNNVGMLPNLLPSHFLNAPDEIQSLIHCNITSVVKMTQLILKHMESRQKGLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 AGLEIGILVNNVGMLPNLLPSHFLNAPDEIQSLIHCNITSVVKMTQLILKHMESRQKGLI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 LNISSGIALFPWPLYSMYSASKAFVCAFSKALQEEYKAKEVIIQVLTPYAVSTAMTKYLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 LNISSGIALFPWPLYSMYSASKAFVCAFSKALQEEYKAKEVIIQVLTPYAVSTAMTKYLN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 TNVITKTADEFVKESLNYVTIGGETCGCLAHEILAGFLSLIPAWAFYSGAFQRLLLTHYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 TNVITKTADEFVKESLNYVTIGGETCGCLAHEILAGFLSLIPAWAFYSGAFQRLLLTHYV
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 AYLKLNTKVR
::::::::::
CCDS67 AYLKLNTKVR
310
>>CCDS7905.1 HSD17B12 gene_id:51144|Hs108|chr11 (312 aa)
initn: 691 init1: 345 opt: 707 Z-score: 896.3 bits: 174.0 E(32554): 1.3e-43
Smith-Waterman score: 707; 41.7% identity (71.2% similar) in 295 aa overlap (18-306:19-312)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MGDVLEQFFILTGLLVCLACLAKCVRFSRCVLLNYWKVLPKSFLR-SMGQWAVITGAGD
.: :: . .: . : : : .. . ..:.:::.::. :
CCDS79 MESALPAAGFLYWVGAGTVAYLALRISYSLFTALRVWGVGNEAGVGPGLGEWAVVTGSTD
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 GIGKAYSFELAKRGLNVVLISRTLEKLEAIATEIERTTGRSVKIIQADFTKDDIYEHIKE
::::.:. ::::.:..::::::. .::. ...::.. .. : .::...:::..::
CCDS79 GIGKSYAEELAKHGMKVVLISRSKDKLDQVSSEIKEKFKVETRTIAVDFASEDIYDKIKT
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 KLAGLEIGILVNNVGMLPNLLPSHFLNAPDE---IQSLIHCNITSVVKMTQLILKHMESR
::::::::::::::: . : .::..:: :...:. :: :: :::::.: : :
CCDS79 GLAGLEIGILVNNVGMSYEY-PEYFLDVPDLDNVIKKMININILSVCKMTQLVLPGMVER
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 QKGLILNISSGIALFPWPLYSMYSASKAFVCAFSKALQEEYKAKEVIIQVLTPYAVSTAM
.:: ::::::: ...: :: ..:::.:.:: ::. :.:::..: :..: . :: :.: .
CCDS79 SKGAILNISSGSGMLPVPLLTIYSATKTFVDFFSQCLHEEYRSKGVFVQSVLPYFVATKL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 TKYLNTNVITKTADEFVKESLNYVTIGGETCGCLAHEILAGFLSLIPAWAFYSGAFQ--R
.: . .. . . ::: ... : . ..: : : : ......: .:.: . . ... .
CCDS79 AKIRKPTLDKPSPETFVKSAIKTVGLQSRTNGYLIHALMGSIISNLPSWIYLKIVMNMNK
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 LLLTHYVAYLKLNTKVR
.::. : :
CCDS79 STRAHYLKKTKKN
300 310
>>CCDS10942.1 HSDL1 gene_id:83693|Hs108|chr16 (330 aa)
initn: 487 init1: 286 opt: 550 Z-score: 697.9 bits: 137.4 E(32554): 1.5e-32
Smith-Waterman score: 550; 38.8% identity (68.2% similar) in 255 aa overlap (43-290:62-314)
20 30 40 50 60 70
pF1KE5 GLLVCLACLAKCVRFSRCVLLNYWKVLPKSFLRSMGQWAVITGAGDGIGKAYSFELAKRG
.....:.:::..:: :::::::. :::.::
CCDS10 YTARKSITVICDFYSLIRLHFIPRLGSRADLIKQYGRWAVVSGATDGIGKAYAEELASRG
40 50 60 70 80 90
80 90 100 110 120 130
pF1KE5 LNVVLISRTLEKLEAIATEIERTTGRSVKIIQADFTKD-DIYEHIKEKLAGLEIGILVNN
::..::::. :::...: .: : . :: :::.. .:: :.: : ..::::::
CCDS10 LNIILISRNEEKLQVVAKDIADTYKVETDIIVADFSSGREIYLPIREALKDKDVGILVNN
100 110 120 130 140 150
140 150 160 170 180
pF1KE5 VGML-PNLLPSHFLN-APDEIQSLIHCNITSVVKMTQLILKHMESRQKGLILNISSGIAL
::.. : :..: . . :.. ..:. ::... :....: : :.:: :..::::
CCDS10 VGVFYP--YPQYFTQLSEDKLWDIINVNIAAASLMVHVVLPGMVERKKGAIVTISSGSCC
160 170 180 190 200
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 FPWPLYSMYSASKAFVCAFSKALQEEYKAKEVIIQVLTPYAVSTAMTKYLN----TNVIT
: : . .:::::.. ::.::: :: .: ...: : :. :.:.:: : . ..
CCDS10 KPTPQLAAFSASKAYLDHFSRALQYEYASKGIFVQSLIPFYVATSMTAPSNFLHRCSWLV
210 220 230 240 250 260
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 KTADEFVKESLNYVTIGGETCGCLAHEILAGFLSLIPAWAFYSGAFQRLLLTHYVAYLKL
. ....... . :. .: : .: : : . .: : . ::
CCDS10 PSPKVYAHHAVSTLGISKRTTGYWSHSIQFLFAQYMPEWLWVWGANILNRSLRKEALSCT
270 280 290 300 310 320
310
pF1KE5 NTKVR
CCDS10 A
330
>>CCDS54046.1 HSDL1 gene_id:83693|Hs108|chr16 (275 aa)
initn: 405 init1: 227 opt: 268 Z-score: 343.5 bits: 71.5 E(32554): 8.2e-13
Smith-Waterman score: 337; 31.0% identity (55.6% similar) in 252 aa overlap (43-290:62-259)
20 30 40 50 60 70
pF1KE5 GLLVCLACLAKCVRFSRCVLLNYWKVLPKSFLRSMGQWAVITGAGDGIGKAYSFELAKRG
.....:.:::..:: :::::::. :::.::
CCDS54 YTARKSITVICDFYSLIRLHFIPRLGSRADLIKQYGRWAVVSGATDGIGKAYAEELASRG
40 50 60 70 80 90
80 90 100 110 120 130
pF1KE5 LNVVLISRTLEKLEAIATEIERTTGRSVKIIQADFTKDDIYEHIKEKLAGLEIGILVNNV
::..::::. :::. ::. ..:
CCDS54 LNIILISRNEEKLQY-------------------FTQ------LSE--------------
100 110
140 150 160 170 180 190
pF1KE5 GMLPNLLPSHFLNAPDEIQSLIHCNITSVVKMTQLILKHMESRQKGLILNISSGIALFPW
:.. ..:. ::... :....: : :.:: :..:::: :
CCDS54 ---------------DKLWDIINVNIAAASLMVHVVLPGMVERKKGAIVTISSGSCCKPT
120 130 140 150
200 210 220 230 240
pF1KE5 PLYSMYSASKAFVCAFSKALQEEYKAKEVIIQVLTPYAVSTAMTKYLN----TNVITKTA
: . .:::::.. ::.::: :: .: ...: : :. :.:.:: : . .. .
CCDS54 PQLAAFSASKAYLDHFSRALQYEYASKGIFVQSLIPFYVATSMTAPSNFLHRCSWLVPSP
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 DEFVKESLNYVTIGGETCGCLAHEILAGFLSLIPAWAFYSGAFQRLLLTHYVAYLKLNTK
....... . :. .: : .: : : . .: : . ::
CCDS54 KVYAHHAVSTLGISKRTTGYWSHSIQFLFAQYMPEWLWVWGANILNRSLRKEALSCTA
220 230 240 250 260 270
310
pF1KE5 VR
>>CCDS9743.1 DHRS7 gene_id:51635|Hs108|chr14 (339 aa)
initn: 232 init1: 118 opt: 250 Z-score: 319.4 bits: 67.4 E(32554): 1.8e-11
Smith-Waterman score: 250; 27.7% identity (57.8% similar) in 256 aa overlap (3-247:4-253)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MGDVLEQFFILTGLLVCLACLAKCVRFSR--CVLLNYWK-VLPKSFLRSMGQWAVITGA
..: ...: .::. :. : . .: . .: :. :. : .: : .:::
CCDS97 MNWELLLWLLVLCALLLLLVQLLRFLRADGDLTLLWAEWQGRRPEWELTDMVVW--VTGA
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 GDGIGKAYSFELAKRGLNVVLISRTLEKLEAIAT---EIERTTGRSVKIIQADFTKDDIY
..:::. ...:.: :...:: .: ...:: . : ... .. :.: :
CCDS97 SSGIGEELAYQLSKLGVSLVLSARRVHELERVKRRCLENGNLKEKDILVLPLDLT--DTG
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160
pF1KE5 EHIKEKLAGLE----IGILVNNVGMLPNLLPSHFLNAPDEIQSLIHCNITSVVKMTQLIL
: : :. : ::::: :: : .. : ..::. : ..:..:. .:
CCDS97 SHEAATKAVLQEFGRIDILVNNGGMSQRSLCMD--TSLDVYRKLIELNYLGTVSLTKCVL
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE5 KHMESRQKGLILNISSGIALFPWPLYSMYSASKAFVCAFSKALQEEYKAKE-VIIQVLTP
:: :..: :....: .... :: : ::: . .: ..:. : . .:.. . :
CCDS97 PHMIERKQGKIVTVNSILGIISVPLSIGYCASKHALRGFFNGLRTELATYPGIIVSNICP
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE5 YAVSTAMTKYLNTNVITKTADEFVKESLNYVTIGGETCGCLAHEILAGFLSLIPAWAFYS
:.. ... .. .:::
CCDS97 GPVQSNIVENSLAGEVTKTIGNNGDQSHKMTTSRCVRLMLISMANDLKEVWISEQPFLLV
240 250 260 270 280 290
>>CCDS9605.1 DHRS4 gene_id:10901|Hs108|chr14 (278 aa)
initn: 124 init1: 105 opt: 242 Z-score: 310.6 bits: 65.4 E(32554): 5.6e-11
Smith-Waterman score: 242; 27.9% identity (62.2% similar) in 222 aa overlap (51-266:35-248)
30 40 50 60 70 80
pF1KE5 LAKCVRFSRCVLLNYWKVLPKSFLRSMGQWAVITGAGDGIGKAYSFELAKRGLNVVLISR
:..:.. :::: : . .::. : .::. ::
CCDS96 GLLGLCARAWNSVRMASSGMTRRDPLANKVALVTASTDGIGFAIARRLAQDGAHVVVSSR
10 20 30 40 50 60
90 100 110 120 130
pF1KE5 TLEKLE-AIAT---EIERTTGRSVKIIQADFTKDDIYEHIKEKLAGLEIGILVNNVGMLP
.... :.:: : .:: .. .:. . . .: : : : :::.:... :
CCDS96 KQQNVDQAVATLQGEGLSVTGTVCHVGKAEDRERLVATAVK--LHG-GIDILVSNAAVNP
70 80 90 100 110 120
140 150 160 170 180 190
pF1KE5 NLLPSHFLNAPDEI-QSLIHCNITSVVKMTQLILKHMESRQKGLILNISSGIALFPWPLY
. . .... .:. .. . :. . . ::. .. .::.: : .. .:: :. : : .
CCDS96 FF--GSIMDVTEEVWDKTLDINVKAPALMTKAVVPEMEKRGGGSVVIVSSIAAFSPSPGF
130 140 150 160 170
200 210 220 230 240 250
pF1KE5 SMYSASKAFVCAFSKALQEEYKAKEVIIQVLTPYAVSTAMTKYLNTNVITKTADEFVKES
: :..::. . ...:.: : ... .. :.: ..:.....: . : .: .::.
CCDS96 SPYNVSKTALLGLTKTLAIELAPRNIRVNCLAPGLIKTSFSRML---WMDKEKEESMKET
180 190 200 210 220 230
260 270 280 290 300 310
pF1KE5 LNYVTIG-GETCGCLAHEILAGFLSLIPAWAFYSGAFQRLLLTHYVAYLKLNTKVR
: .: : :
CCDS96 LRIRRLGEPEDCAGIVSFLCSEDASYITGETVVVGGGTPSRL
240 250 260 270
310 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 00:24:28 2016 done: Tue Nov 8 00:24:28 2016
Total Scan time: 1.820 Total Display time: 0.000
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]