Result of FASTA (omim) for
pFN21AE5396
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5396, 309 aa
1>>>pF1KE5396 309 - 309 aa - 309 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.6584+/-0.000494; mu= 19.4132+/- 0.030
mean_var=142.9468+/-41.527, 0's: 0 Z-trim(108.7): 310 B-trim: 986 in 1/50
Lambda= 0.107272
statistics sampled from 16255 (16759) to 16255 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.548), E-opt: 0.2 (0.196), width: 16
Scan time: 6.670
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 1142 189.3 8.3e-48
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 862 146.0 9.2e-35
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XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 862 146.0 9.4e-35
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 842 142.9 7.9e-34
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NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 808 137.7 3.1e-32
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 808 137.7 3.1e-32
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 802 136.7 5.8e-32
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 775 132.5 1e-30
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 773 132.2 1.3e-30
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 768 131.4 2.2e-30
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 758 129.9 6.4e-30
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 755 129.4 8.9e-30
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 747 128.2 2.1e-29
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 746 128.0 2.3e-29
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 745 127.9 2.7e-29
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 743 127.6 3.2e-29
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 734 126.2 8.3e-29
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 731 125.7 1.2e-28
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 556 98.7 1.7e-20
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 488 88.1 2.5e-17
NP_150598 (OMIM: 606665) melanopsin isoform 1 [Hom ( 478) 212 45.7 0.00022
XP_016872445 (OMIM: 606665) PREDICTED: melanopsin ( 528) 212 45.8 0.00023
NP_000667 (OMIM: 600446) adenosine receptor A2b [H ( 332) 204 44.2 0.00043
NP_000721 (OMIM: 118444) cholecystokinin receptor ( 428) 203 44.2 0.00054
NP_001718 (OMIM: 300107) bombesin receptor subtype ( 399) 201 43.9 0.00065
NP_778237 (OMIM: 608923) trace amine-associated re ( 345) 192 42.4 0.0016
NP_005903 (OMIM: 155541,601665) melanocortin recep ( 332) 191 42.2 0.0017
NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 189 41.9 0.0022
NP_795344 (OMIM: 118445) gastrin/cholecystokinin t ( 447) 190 42.3 0.0022
NP_063941 (OMIM: 155540,602025,607948) melanocorti ( 323) 188 41.7 0.0024
XP_005253267 (OMIM: 118445) PREDICTED: gastrin/cho ( 516) 190 42.4 0.0024
NP_000729 (OMIM: 118510) muscarinic acetylcholine ( 460) 189 42.1 0.0025
XP_011543044 (OMIM: 118510) PREDICTED: muscarinic ( 460) 189 42.1 0.0025
XP_016855642 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 190 42.5 0.0026
XP_016855641 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 190 42.5 0.0026
XP_016855651 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 190 42.5 0.0026
XP_011542347 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 190 42.5 0.0026
XP_005273089 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 190 42.5 0.0026
XP_016855646 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 190 42.5 0.0026
XP_011542343 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 190 42.5 0.0026
XP_016855648 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 190 42.5 0.0026
XP_016855645 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 190 42.5 0.0026
NP_000731 (OMIM: 100100,118494) muscarinic acetylc ( 590) 190 42.5 0.0026
XP_011542346 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 190 42.5 0.0026
XP_016855643 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 190 42.5 0.0026
XP_016855652 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 190 42.5 0.0026
XP_011542345 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 190 42.5 0.0026
XP_016855644 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 190 42.5 0.0026
>>NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C46 [H (309 aa)
initn: 1134 init1: 1134 opt: 1142 Z-score: 979.3 bits: 189.3 E(85289): 8.3e-48
Smith-Waterman score: 1142; 53.1% identity (80.9% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGAKNNVTEFVLFGLFESREMQHTCFVVFFLFHVLTVLGNLLVIITINARKTLKSPMYFF
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NP_001 MENRNNMTEFVLLGLTENPKMQKIIFVVFFVIYIITVVGYVLIVVTITASPSLGSPMYLS
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pF1KE5 LSQLSFADICYPSTTIPKMIADTFVEHKIISFNGCMTQLFSAHFFGGTEIFLLTAMAYDR
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70 80 90 100 110 120
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pF1KE5 YVAICRPLHYTAIMDCRKCGLLAGASWLAGFLHSILQTLLTVQLPFCGPNEIDNFFCDVH
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NP_001 YVAICKPLHYMTIMNQCVCALLMGVVWMGGFLHATIQILFIFQLPFCGPNVIDHFMCDLN
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pF1KE5 PLLKLACADTYMVGLIVVANSGMISLASFFILIISYVIILLNLRSQSSEDRRKAVSTCGS
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pF1KE5 HVITVLLVLMPPMFMYIRPSTTLAADKLIILFNIVMPPLLNPLIYTLRNNDVKNAMRKLF
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NP_001 HITVVILFFVPCIFVYMRPAATLPIDKAVAIFYTMITPMLNPLIYTLKNAQMKNAIRKLC
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 RVKRSLGEK
: :.:
NP_001 SRKDISGDK
>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KE5 MGAKNNVTEFVLFGLFESREMQHTCFVVFFLFHVLTVLGNLLVIITINARKTLKSPMY
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NP_036 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
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pF1KE5 FFLSQLSFADICYPSTTIPKMIADTFVEHKIISFNGCMTQLFSAHFFGGTEIFLLTAMAY
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pF1KE5 DRYVAICRPLHYTAIMDCRKCGLLAGASWLAGFLHSILQTLLTVQLPFCGPNEIDNFFCD
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240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CGSHVITVLLVLMPPMFMYIRPSTTLAADK--LIILFNIVMPPLLNPLIYTLRNNDVKNA
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NP_036 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA
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300
pF1KE5 MRKLFRVKRSLGEK
..:.
NP_036 LKKVVGRVVFSV
310
>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KE5 MGAKNNVTEFVLFGLFESREMQHTCFVVFFLFHVLTVLGNLLVIITINARKTLKSPMY
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XP_011 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
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pF1KE5 FFLSQLSFADICYPSTTIPKMIADTFVEHKIISFNGCMTQLFSAHFFGGTEIFLLTAMAY
::::.:::.:::. ::.:::.:. ..: . ::: ::.::.. . .: . :::..:::
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pF1KE5 DRYVAICRPLHYTAIMDCRKCGLLAGASWLAGFLHSILQTLLTVQLPFCGPNEIDNFFCD
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pF1KE5 VHPLLKLACADTYMVGLIVVANSGMISLASFFILIISYVIILLN-LRSQSSEDRRKAVST
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pF1KE5 CGSHVITVLLVLMPPMFMYIRPSTTLAADK--LIILFNIVMPPLLNPLIYTLRNNDVKNA
::::. .::: . .:. : .. .:.: . .. :. :.:::.::.::: .:.:
XP_011 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA
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300
pF1KE5 MRKLFRVKRSLGEK
..:.
XP_011 LKKVVGRVVFSV
310
>>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa)
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Smith-Waterman score: 862; 42.8% identity (76.6% similar) in 299 aa overlap (4-299:16-314)
10 20 30 40
pF1KE5 MGAKNNVTEFVLFGLFESREMQHTCFVVFFLFHVLTVLGNLLVIITIN
...:.::.:.:: .. ..:: :: :. ... :::::::.:....
XP_011 MGDRRADPRPMSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVS
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pF1KE5 ARKTLKSPMYFFLSQLSFADICYPSTTIPKMIADTFVEHKIISFNGCMTQLFSAHFFGGT
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pF1KE5 EIFLLTAMAYDRYVAICRPLHYTAIMDCRKCGLLAGASWLAGFLHSILQTLLTVQLPFCG
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.. : :: ::::::. .::: . .:. : .. .:.: . .. :. :.:::.::
XP_011 TKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIY
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pF1KE5 TLRNNDVKNAMRKLFRVKRSLGEK
.::: .:.:..:.
XP_011 SLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
310 320
>>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor (311 aa)
initn: 812 init1: 614 opt: 842 Z-score: 728.3 bits: 142.9 E(85289): 7.9e-34
Smith-Waterman score: 842; 42.2% identity (73.6% similar) in 303 aa overlap (2-299:5-307)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MGAKNNVTE--FVLFGLFESREMQHTCFVVFFLFHVLTVLGNLLVIITINARKTLKS
: : .: :.: :. . ... . ::: ..:...:..:::..:: . :..
NP_001 MNDDGKVNASSEGYFILVGFSNWPHLEVVIFVVVLIFYLMTLIGNLFIIILSYLDSHLHT
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NP_001 PMYFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLWGPEKTISYAGCMIQLYFVLALGTTECVLLVV
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pF1KE5 MAYDRYVAICRPLHYTAIMDCRKCGLLAGASWLAGFLHSILQTLLTVQLPFCGPNEIDNF
:.::::.:.:::::::..: : : ::: :::..:: .: :.. .: .:.:: ..:.:
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pF1KE5 FCDVHPLLKLACADTYMVGLIVVANSGMISLASFFILIISY-VIILLNLRSQSSEDRRKA
::.: ::.:.:.::.. : .. .:... : ..... :: .:. :: ::. .:.
NP_001 FCEVPALLRLSCVDTHVNELTLMITSSIFVLIPLILILTSYGAIVRAILRMQSTTGLQKV
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pF1KE5 VSTCGSHVITVLLVLMPPMFMYIRPSTTLAAD--KLIILFNIVMPPLLNPLIYTLRNNDV
.:::.:...: : ..: : ::..: . . : :.: :: :. : ::::::::::. :
NP_001 FGTCGAHLMAVSLFFIPAMCMYLQPPSGNSQDQGKFIALFYTVVTPSLNPLIYTLRNKVV
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300
pF1KE5 KNAMRKLFRVKRSLGEK
..:...:
NP_001 RGAVKRLMGWE
310
>>XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
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Smith-Waterman score: 808; 41.0% identity (73.4% similar) in 305 aa overlap (1-300:1-305)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MGAKNN--VTEFVLFGLFESREMQHTCFVVFFLFHVLTVLGNLLVIITINARKTLKSPMY
::. :. :.::.:.:: . . . . ::.:....:.::::: :... : . :..:::
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60 70 80 90 100 110
pF1KE5 FFLSQLSFADICYPSTTIPKMIADTFVEHKIISFNGCMTQLFSAHFFGGTEIFLLTAMAY
:::..::..:. : ....:...: ..::: : :..: .::: . .:: :. ::..:::
XP_011 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 DRYVAICRPLHYTAIMDCRKCGLLAGASWLAGFLHSILQTLLTVQLPFCGPNEIDNFFCD
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XP_011 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 VHPLLKLACADTYMVGLIVVANSGMISLASFFILIISYV-IILLNLRSQSSEDRRKAVST
. ...:::.:: . ....: .. .. : ....::. :: :. :: : :.:: :
XP_011 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
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240 250 260 270 280 290
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250 260 270 280 290 300
300
pF1KE5 MRKLFRVKRSLGEK
.::.
XP_011 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
>>NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [Homo (317 aa)
initn: 810 init1: 605 opt: 808 Z-score: 699.8 bits: 137.7 E(85289): 3.1e-32
Smith-Waterman score: 808; 41.0% identity (73.4% similar) in 305 aa overlap (1-300:1-305)
10 20 30 40 50
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NP_036 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
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pF1KE5 DRYVAICRPLHYTAIMDCRKCGLLAGASWLAGFLHSILQTLLTVQLPFCGPNEIDNFFCD
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NP_036 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
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pF1KE5 VHPLLKLACADTYMVGLIVVANSGMISLASFFILIISYV-IILLNLRSQSSEDRRKAVST
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NP_036 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
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pF1KE5 CGSHVITVLLVLMPPMFMYIRP--STTLAADKLIILFNIVMPPLLNPLIYTLRNNDVKNA
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NP_036 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA
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300
pF1KE5 MRKLFRVKRSLGEK
.::.
NP_036 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
>>XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
initn: 810 init1: 605 opt: 808 Z-score: 699.8 bits: 137.7 E(85289): 3.1e-32
Smith-Waterman score: 808; 41.0% identity (73.4% similar) in 305 aa overlap (1-300:1-305)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MGAKNN--VTEFVLFGLFESREMQHTCFVVFFLFHVLTVLGNLLVIITINARKTLKSPMY
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XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
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pF1KE5 FFLSQLSFADICYPSTTIPKMIADTFVEHKIISFNGCMTQLFSAHFFGGTEIFLLTAMAY
:::..::..:. : ....:...: ..::: : :..: .::: . .:: :. ::..:::
XP_011 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 DRYVAICRPLHYTAIMDCRKCGLLAGASWLAGFLHSILQTLLTVQLPFCGPNEIDNFFCD
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XP_011 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
130 140 150 160 170 180
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pF1KE5 VHPLLKLACADTYMVGLIVVANSGMISLASFFILIISYV-IILLNLRSQSSEDRRKAVST
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XP_011 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
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pF1KE5 CGSHVITVLLVLMPPMFMYIRP--STTLAADKLIILFNIVMPPLLNPLIYTLRNNDVKNA
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XP_011 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA
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300
pF1KE5 MRKLFRVKRSLGEK
.::.
XP_011 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
initn: 727 init1: 600 opt: 802 Z-score: 694.8 bits: 136.7 E(85289): 5.8e-32
Smith-Waterman score: 802; 42.9% identity (71.8% similar) in 301 aa overlap (7-303:11-310)
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pF1KE5 MGAKNNVTEFVLFGLFESR-EMQHTCFVVFFLFHVLTVLGNLLVIITINARKTLKS
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NP_006 MEFTDRNYTLVTEFILLG-FPTRPELQIVLFLMFLTLYAIILIGNIGLMLLIRIDPHLQT
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NP_006 PMYFFLSNLSFVDLCYFSDIVPKMLVNFLSENKSISYYGCALQFYFFCTFADTESFILAA
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pF1KE5 MAYDRYVAICRPLHYTAIMDCRKCGLLAGASWLAGFLHSILQTLLTVQLPFCGPNEIDNF
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NP_006 MAYDRYVAICNPLLYTVVMSRGICMRLIVLSYLGGNMSSLVHTSFAFILKYCDKNVINHF
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pF1KE5 FCDVHPLLKLACADTYMVGLIVVANSGMISLASFFILIISYVIILLN-LRSQSSEDRRKA
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NP_006 FCDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFIIIIISYFFILLSVLKIRSFSGRKKT
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pF1KE5 VSTCGSHVITVLLVLMPPMFMYIRPSTTLA--ADKLIILFNIVMPPLLNPLIYTLRNNDV
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NP_006 FSTCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKDV
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pF1KE5 KNAMRKLFRVKRSLGEK
:.: .:..: :
NP_006 KDAAEKVLRSKVDSS
300 310
>>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo (314 aa)
initn: 778 init1: 574 opt: 775 Z-score: 672.3 bits: 132.5 E(85289): 1e-30
Smith-Waterman score: 775; 41.5% identity (71.7% similar) in 311 aa overlap (1-305:1-310)
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pF1KE5 MGAKN--NVTEFVLFGLFESREMQHTCFVVFFLFHVLTVLGNLLVIITINARKTLKSPMY
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NP_003 MTRKNYTSLTEFVLLGLADTLELQIILFLFFLVIYTLTVLGNLGMILLIRIDSQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
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NP_003 FFLANLSFVDVCNSTTITPKMLADLLSEKKTISFAGCFLQMYFFISLATTECILFGLMAY
70 80 90 100 110 120
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pF1KE5 DVHPLLKLACADTYMVGLIVVANSGMISLASFFILIISYVIILLNLRS-QSSEDRRKAVS
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NP_003 DSPPLFKLSCSDTILKESISSILAGVNIVGTLLVILSSYSYVLFSIFSMHSGEGRHRAFS
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pF1KE5 TCGSHVITVLLVLMPPMFMYIRPSTT--LAADKLIILFNIVMPPLLNPLIYTLRNNDVKN
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]