Result of FASTA (omim) for
pFN21AE5395
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5395, 309 aa
1>>>pF1KE5395 309 - 309 aa - 309 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6361+/-0.000523; mu= 13.5272+/- 0.032
mean_var=96.0605+/-22.606, 0's: 0 Z-trim(107.4): 217 B-trim: 875 in 1/49
Lambda= 0.130858
statistics sampled from 15212 (15500) to 15212 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.515), E-opt: 0.2 (0.182), width: 16
Scan time: 4.090
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 1178 233.6 4e-61
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 888 178.8 1.2e-44
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 888 178.8 1.2e-44
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 888 178.8 1.2e-44
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 874 176.2 7.6e-44
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 845 170.7 3.4e-42
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 839 169.6 7.3e-42
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 834 168.6 1.4e-41
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 827 167.3 3.6e-41
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 825 166.9 4.6e-41
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 825 166.9 4.6e-41
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 825 166.9 4.6e-41
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 821 166.2 8e-41
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 818 165.6 1.1e-40
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 817 165.4 1.3e-40
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 814 164.9 1.9e-40
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 808 163.7 4.3e-40
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 793 160.9 3e-39
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 767 156.0 8.8e-38
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 751 153.0 7.4e-37
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 514 108.2 2.2e-23
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 478 101.4 2.5e-21
NP_150598 (OMIM: 606665) melanopsin isoform 1 [Hom ( 478) 193 47.8 5.2e-05
XP_016872445 (OMIM: 606665) PREDICTED: melanopsin ( 528) 193 47.8 5.6e-05
XP_011508791 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 313) 189 46.9 6.4e-05
XP_006712259 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 333) 189 46.9 6.7e-05
XP_006712258 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 370) 189 46.9 7.3e-05
XP_011508790 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 376) 189 46.9 7.4e-05
XP_011508789 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 403) 189 47.0 7.7e-05
NP_006047 (OMIM: 604153) neuromedin-U receptor 1 [ ( 426) 189 47.0 8.1e-05
NP_473362 (OMIM: 300393,300943) probable G-protein ( 508) 178 45.0 0.00039
NP_005275 (OMIM: 600553) G-protein coupled recepto ( 362) 173 43.9 0.00058
NP_001273028 (OMIM: 600553) G-protein coupled rece ( 377) 173 43.9 0.0006
NP_001391 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphate r ( 382) 172 43.7 0.00069
NP_001307659 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphat ( 382) 172 43.7 0.00069
NP_000612 (OMIM: 103780,164230,181500,182135,60678 ( 471) 172 43.8 0.0008
NP_001307687 (OMIM: 601122) 5-hydroxytryptamine re ( 439) 170 43.4 0.00099
XP_006712545 (OMIM: 601122) PREDICTED: 5-hydroxytr ( 456) 170 43.4 0.001
NP_000858 (OMIM: 601122) 5-hydroxytryptamine recep ( 481) 170 43.4 0.0011
NP_055441 (OMIM: 604849) trace amine-associated re ( 306) 167 42.7 0.0011
NP_063941 (OMIM: 155540,602025,607948) melanocorti ( 323) 163 42.0 0.002
XP_011532064 (OMIM: 167055) PREDICTED: oxytocin re ( 389) 164 42.2 0.002
NP_000907 (OMIM: 167055) oxytocin receptor [Homo s ( 389) 164 42.2 0.002
NP_000667 (OMIM: 600446) adenosine receptor A2b [H ( 332) 163 42.0 0.002
NP_000697 (OMIM: 600821) vasopressin V1a receptor ( 418) 164 42.3 0.0021
NP_005217 (OMIM: 601965) sphingosine 1-phosphate r ( 378) 163 42.0 0.0022
NP_000903 (OMIM: 165196) kappa-type opioid recepto ( 380) 163 42.0 0.0022
XP_016872446 (OMIM: 606665) PREDICTED: melanopsin ( 405) 163 42.1 0.0023
NP_001305426 (OMIM: 165196) kappa-type opioid rece ( 409) 163 42.1 0.0024
NP_005903 (OMIM: 155541,601665) melanocortin recep ( 332) 161 41.6 0.0026
>>NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C46 [H (309 aa)
initn: 1169 init1: 1148 opt: 1178 Z-score: 1218.4 bits: 233.6 E(85289): 4e-61
Smith-Waterman score: 1178; 57.0% identity (82.1% similar) in 307 aa overlap (1-307:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MASTSNVTELIFTGLFQDPAVQSVCFVVFLPVYLATVVGNGLIVLTVSISKSLDSPMYFF
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NP_001 MENRNNMTEFVLLGLTENPKMQKIIFVVFFVIYIITVVGYVLIVVTITASPSLGSPMYLS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LSCLSLVEISYSSTIAPKFIIDLLAKIKTISLEGCLTQIFFFHFFGVAEILLIVVMAYDC
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NP_001 LAYLSFIDACYSSVNTPNLITHSLYGKKAILFNGCMTQVFGEHFFGGAEGILLTVMAYDH
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130 140 150 160 170 180
pF1KE5 YVAICKPLHYMNIISRQLCHLLVAGSWLGGFCHSIIQILVIIQLPFCGPNVIDHYFCDLQ
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NP_001 YVAICKPLHYMTIMNQCVCALLMGVVWMGGFLHATIQILFIFQLPFCGPNVIDHFMCDLN
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190 200 210 220 230 240
pF1KE5 PLFKLACTDTFMEGVIVLANSGLFSVFSFLILVSSYIVILVNLRNHSAEGRHKALSTCAS
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NP_001 PLLNLACTDTHMLELFIAANSGFICLLNFALLLVSYVVILCSLRTHSLEARHKALSTCVS
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pF1KE5 HITVVILFFGPAIFLYMRPSSTFTEDKLVAVFYTVITPMLNPIIYTLRNAEVKIAIRRLW
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NP_001 HITVVILFFVPCIFVYMRPAATLPIDKAVAIFYTMITPMLNPLIYTLKNAQMKNAIRKLC
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SKKENPGRE
:.:. :
NP_001 SRKDISGDK
>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa)
initn: 863 init1: 639 opt: 888 Z-score: 922.5 bits: 178.8 E(85289): 1.2e-44
Smith-Waterman score: 888; 45.3% identity (76.8% similar) in 298 aa overlap (5-299:7-304)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MASTSNVTELIFTGLFQDPAVQSVCFVVFLPVYLATVVGNGLIVLTVSISKSLDSPMY
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XP_011 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
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60 70 80 90 100 110
pF1KE5 FFLSCLSLVEISYSSTIAPKFIIDLLAKIKTISLEGCLTQIFFFHFFGVAEILLIVVMAY
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pF1KE5 DCYVAICKPLHYMNIISRQLCHLLVAGSWLGGFCHSIIQILVIIQLPFCGPNVIDHYFCD
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XP_011 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
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pF1KE5 LQPLFKLACTDTFMEGVIVLANSGLFSVFSFLILVSSYIVILVN-LRNHSAEGRHKALST
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XP_011 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST
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240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CASHITVVILFFGPAIFLYMRPSSTFT--EDKLVAVFYTVITPMLNPIIYTLRNAEVKIA
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XP_011 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA
250 260 270 280 290 300
300
pF1KE5 IRRLWSKKENPGRE
....
XP_011 LKKVVGRVVFSV
310
>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
initn: 863 init1: 639 opt: 888 Z-score: 922.5 bits: 178.8 E(85289): 1.2e-44
Smith-Waterman score: 888; 45.3% identity (76.8% similar) in 298 aa overlap (5-299:7-304)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MASTSNVTELIFTGLFQDPAVQSVCFVVFLPVYLATVVGNGLIVLTVSISKSLDSPMY
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NP_036 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
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60 70 80 90 100 110
pF1KE5 FFLSCLSLVEISYSSTIAPKFIIDLLAKIKTISLEGCLTQIFFFHFFGVAEILLIVVMAY
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NP_036 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
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pF1KE5 DCYVAICKPLHYMNIISRQLCHLLVAGSWLGGFCHSIIQILVIIQLPFCGPNVIDHYFCD
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NP_036 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
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pF1KE5 LQPLFKLACTDTFMEGVIVLANSGLFSVFSFLILVSSYIVILVN-LRNHSAEGRHKALST
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NP_036 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST
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pF1KE5 CASHITVVILFFGPAIFLYMRPSSTFT--EDKLVAVFYTVITPMLNPIIYTLRNAEVKIA
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NP_036 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA
250 260 270 280 290 300
300
pF1KE5 IRRLWSKKENPGRE
....
NP_036 LKKVVGRVVFSV
310
>>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa)
initn: 863 init1: 639 opt: 888 Z-score: 922.3 bits: 178.8 E(85289): 1.2e-44
Smith-Waterman score: 888; 45.3% identity (76.8% similar) in 298 aa overlap (5-299:17-314)
10 20 30 40
pF1KE5 MASTSNVTELIFTGLFQDPAVQSVCFVVFLPVYLATVVGNGLIVLTVS
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XP_011 MGDRRADPRPMSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVS
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pF1KE5 ISKSLDSPMYFFLSCLSLVEISYSSTIAPKFIIDLLAKIKTISLEGCLTQIFFFHFFGVA
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XP_011 IDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDM
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pF1KE5 EILLIVVMAYDCYVAICKPLHYMNIISRQLCHLLVAGSWLGGFCHSIIQILVIIQLPFCG
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XP_011 DNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCA
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pF1KE5 PNVIDHYFCDLQPLFKLACTDTFMEGVIVLANSGLFSVFSFLILVSSYIVILVN-LRNHS
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XP_011 DNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPS
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pF1KE5 AEGRHKALSTCASHITVVILFFGPAIFLYMRPSSTFT--EDKLVAVFYTVITPMLNPIIY
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XP_011 TKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIY
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290 300
pF1KE5 TLRNAEVKIAIRRLWSKKENPGRE
.::: .: :....
XP_011 SLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
310 320
>>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo (314 aa)
initn: 901 init1: 565 opt: 874 Z-score: 908.2 bits: 176.2 E(85289): 7.6e-44
Smith-Waterman score: 874; 43.7% identity (75.8% similar) in 302 aa overlap (5-303:7-308)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MASTSNVTELIFTGLFQDPAVQSVCFVVFLPVYLATVVGNGLIVLTVSISKSLDSPMY
...::... :: . .: . :. :: .: ::.:: ..: . :...: .:::
NP_003 MTRKNYTSLTEFVLLGLADTLELQIILFLFFLVIYTLTVLGNLGMILLIRIDSQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
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pF1KE5 FFLSCLSLVEISYSSTIAPKFIIDLLAKIKTISLEGCLTQIFFFHFFGVAEILLIVVMAY
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NP_003 FFLANLSFVDVCNSTTITPKMLADLLSEKKTISFAGCFLQMYFFISLATTECILFGLMAY
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120 130 140 150 160 170
pF1KE5 DCYVAICKPLHYMNIISRQLCHLLVAGSWLGGFCHSIIQILVIIQLPFCGPNVIDHYFCD
: :.:::.:: : :.:: . ..::.. .:. . ... . .: :: ::: :.:::
NP_003 DRYAAICRPLLYSLIMSRTVYLKMAAGAFAAGLLNFMVNTSHVSSLSFCDSNVIHHFFCD
130 140 150 160 170 180
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pF1KE5 LQPLFKLACTDTFMEGVIVLANSGLFSVFSFLILVSSYIVILVNLRN-HSAEGRHKALST
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NP_003 SPPLFKLSCSDTILKESISSILAGVNIVGTLLVILSSYSYVLFSIFSMHSGEGRHRAFST
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CASHITVVILFFGPAIFLYMRPSSTFT--EDKLVAVFYTVITPMLNPIIYTLRNAEVKIA
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NP_003 CASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRSKEVKKA
250 260 270 280 290 300
300
pF1KE5 IRRLWSKKENPGRE
. . :.:
NP_003 LANVISRKRTSSFL
310
>>NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [Homo (317 aa)
initn: 827 init1: 586 opt: 845 Z-score: 878.5 bits: 170.7 E(85289): 3.4e-42
Smith-Waterman score: 845; 44.0% identity (75.5% similar) in 302 aa overlap (5-302:7-308)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MASTSNVTELIFTGLFQDPA-VQSVCFVVFLPVYLATVVGNGLIVLTVSISKSLDSPM
....:.:. .. . :. .::. :..:: .::.:. ::.::.:.. . : :::
NP_835 MAIGNWTEISEFILMSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLKGNSLIILVTLADPMLHSPM
10 20 30 40 50 60
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pF1KE5 YFFLSCLSLVEISYSSTIAPKFIIDLLAKIKTISLEGCLTQIFFFHFFGVAEILLIVVMA
:::: ::..::... .:.::.. :::. :::. :: ::..:: :::::: .:...::
NP_835 YFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLLAQDTTISFLGCATQMYFFFFFGVAECFLLATMA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 YDCYVAICKPLHYMNIISRQLCHLLVAGSWLGGFCHSIIQILVIIQLPFCGPNVIDHYFC
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NP_835 YDRYVAICSPLHYPVIMNQRTRAKLAAASWFPGFPVATVQTTWLFSFPFCGTNKVNHFFC
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 DLQPLFKLACTDTFMEGVIVLANSGLFSVFSFLILVSSYIVILVN-LRNHSAEGRHKALS
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NP_835 DSPPVLKLVCADTALFEIYAIVGTILVVMIPCLLILCSYTRIAAAILKIPSAKGKHKAFS
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 TCASHITVVILFFGPAIFLYMRPSSTFTED--KLVAVFYTVITPMLNPIIYTLRNAEVKI
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NP_835 TCSSHLLVVSLFYISSSLTYFWPKSNNSPESKKLLSLSYTVVTPMLNPIIYSLRNSEVKN
250 260 270 280 290 300
300
pF1KE5 AIRRLWSKKENPGRE
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NP_835 ALSRTFHKVLALRNCIP
310
>>NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN1 [H (311 aa)
initn: 806 init1: 552 opt: 839 Z-score: 872.5 bits: 169.6 E(85289): 7.3e-42
Smith-Waterman score: 839; 41.7% identity (74.4% similar) in 309 aa overlap (1-303:1-309)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MASTSNVTELIFTGL--FQD-PAVQSVCFVVFLPVYLATVVGNGLIVLTVSISKSLDSPM
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NP_001 MTGGGNITEITYFILLGFSDFPRIIKVLFTIFLVIYITSLAWNLSLIVLIRMDSHLHTPM
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pF1KE5 YFFLSCLSLVEISYSSTIAPKFIIDLLAKIKTISLEGCLTQIFFFHFFGVAEILLIVVMA
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NP_001 YFFLSNLSFIDVCYISSTVPKMLSNLLQEQQTITFVGCIIQYFIFSTMGLSESCLMTAMA
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pF1KE5 YDCYVAICKPLHYMNIISRQLCHLLVAGSWLGGFCHSIIQILVIIQLPFCGPNVIDHYFC
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NP_001 YDRYAAICNPLLYSSIMSPTLCVWMVLGAYMTGLTASLFQIGALLQLHFCGSNVIRHFFC
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pF1KE5 DLQPLFKLACTDTFMEGVIVLANSGLFSVFSFLILVSSYIVILVN-LRNHSAEGRHKALS
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NP_001 DMPQLLILSCTDTFFVQVMTAILTMFFGIASALVIMISYGYIGISIMKITSAKGRSKAFN
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pF1KE5 TCASHITVVILFFGPAIFLYMRPSS--TFTEDKLVAVFYTVITPMLNPIIYTLRNAEVKI
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NP_001 TCASHLTAVSLFYTSGIFVYLSSSSGGSSSFDRFASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEIKD
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300
pF1KE5 AIRRLWSKKENPGRE
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NP_001 ALKRLQKRKCC
310
>>NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [Homo (308 aa)
initn: 836 init1: 533 opt: 834 Z-score: 867.5 bits: 168.6 E(85289): 1.4e-41
Smith-Waterman score: 834; 42.8% identity (75.6% similar) in 299 aa overlap (5-302:7-305)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MASTSNVTELIFTGLFQDPAVQSVCFVVFLPVYLATVVGNGLIVLTVSISKSLDSPMY
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NP_003 MRQINQTQVTEFLLLGLSDGPHTEQLLFIVLLGVYLVTVLGNLLLISLVHVDSQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
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pF1KE5 FFLSCLSLVEISYSSTIAPKFIIDLLAKIKTISLEGCLTQIFFFHFFGVAEILLIVVMAY
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NP_003 FFLCNLSLADLCFSTNIVPQALVHLLSRKKVIAFTLCAARLLFFLIFGCTQCALLAVMSY
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pF1KE5 DCYVAICKPLHYMNIISRQLCHLLVAGSWLGGFCHSIIQILVIIQLPFCGPNVIDHYFCD
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NP_003 DRYVAICNPLRYPNIMTWKVCVQLATGSWTSGILVSVVDTTFILRLPYRGSNSIAHFFCE
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pF1KE5 LQPLFKLACTDTFM-EGVIVLANSGLFSVFSFLILVSSYIVILVNLRNHSAEGRHKALST
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NP_003 APALLILASTDTHASEMAIFLMGVVILLIPVFLILVSYGRIIVTVVKMKSTVGSLKAFST
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pF1KE5 CASHITVVILFFGPAIFLYMRPSSTFTEDKLVAVFYTVITPMLNPIIYTLRNAEVKIAIR
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NP_003 CGSHLMVVILFYGSAIITYMTPKSSKQQEKSVSVFYAIVTPMLNPLIYSLRNKDVKAALR
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300
pF1KE5 RLWSKKENPGRE
.. ..
NP_003 KVATRNFP
>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
initn: 822 init1: 587 opt: 827 Z-score: 860.2 bits: 167.3 E(85289): 3.6e-41
Smith-Waterman score: 827; 42.0% identity (72.7% similar) in 300 aa overlap (7-303:11-310)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MASTSNVTELIFTGLFQDPAVQSVCFVVFLPVYLATVVGNGLIVLTVSISKSLDSP
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NP_006 MEFTDRNYTLVTEFILLGFPTRPELQIVLFLMFLTLYAIILIGNIGLMLLIRIDPHLQTP
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pF1KE5 MYFFLSCLSLVEISYSSTIAPKFIIDLLAKIKTISLEGCLTQIFFFHFFGVAEILLIVVM
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NP_006 MYFFLSNLSFVDLCYFSDIVPKMLVNFLSENKSISYYGCALQFYFFCTFADTESFILAAM
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pF1KE5 AYDCYVAICKPLHYMNIISRQLCHLLVAGSWLGGFCHSIIQILVIIQLPFCGPNVIDHYF
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NP_006 AYDRYVAICNPLLYTVVMSRGICMRLIVLSYLGGNMSSLVHTSFAFILKYCDKNVINHFF
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pF1KE5 CDLQPLFKLACTDTFMEGVIVLANSGLFSVFSFLILVSSYIVILVN-LRNHSAEGRHKAL
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NP_006 CDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFIIIIISYFFILLSVLKIRSFSGRKKTF
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pF1KE5 STCASHITVVILFFGPAIFLYMRPSSTFTE--DKLVAVFYTVITPMLNPIIYTLRNAEVK
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NP_006 STCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKDVK
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300
pF1KE5 IAIRRLWSKKENPGRE
: ... .:
NP_006 DAAEKVLRSKVDSS
310
>>NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [Homo (317 aa)
initn: 821 init1: 536 opt: 825 Z-score: 858.1 bits: 166.9 E(85289): 4.6e-41
Smith-Waterman score: 825; 44.0% identity (73.5% similar) in 298 aa overlap (7-300:9-306)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MASTSNVTELIFTGLFQDPAVQSVCFVVFLPVYLATVVGNGLIVLTVSISKSLDSPMY
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NP_036 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
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pF1KE5 FFLSCLSLVEISYSSTIAPKFIIDLLAKIKTISLEGCLTQIFFFHFFGVAEILLIVVMAY
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NP_036 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
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pF1KE5 DCYVAICKPLHYMNIISRQLCHLLVAGSWLGGFCHSIIQILVIIQLPFCGPNVIDHYFCD
: :::.: :.: :. :: :. ::..:: : .: . .:::.: . ::: :.
NP_036 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
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NP_036 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]