Result of FASTA (omim) for
pFN21AE5392
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5392, 309 aa
1>>>pF1KE5392 309 - 309 aa - 309 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9164+/-0.000543; mu= 18.1956+/- 0.034
mean_var=111.9351+/-31.569, 0's: 0 Z-trim(107.9): 376 B-trim: 904 in 1/49
Lambda= 0.121225
statistics sampled from 15425 (15962) to 15425 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.519), E-opt: 0.2 (0.187), width: 16
Scan time: 6.050
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 1388 254.4 2.1e-67
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 1127 208.8 1.2e-53
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 1127 208.8 1.2e-53
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 1127 208.8 1.2e-53
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 1041 193.7 3.9e-49
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 929 174.2 3.1e-43
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 912 171.2 2.4e-42
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 903 169.6 7.2e-42
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 882 165.9 9.2e-41
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 872 164.2 3e-40
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 862 162.5 1e-39
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 860 162.1 1.3e-39
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 860 162.1 1.3e-39
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 860 162.1 1.3e-39
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 857 161.6 1.9e-39
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 855 161.2 2.4e-39
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 854 161.0 2.7e-39
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 852 160.7 3.4e-39
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 800 151.6 2e-36
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 793 150.4 4.4e-36
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 532 104.7 2.5e-22
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 525 103.5 5.8e-22
NP_000903 (OMIM: 165196) kappa-type opioid recepto ( 380) 239 53.6 7.3e-07
NP_001305426 (OMIM: 165196) kappa-type opioid rece ( 409) 239 53.6 7.7e-07
NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 224 50.9 4.2e-06
NP_063941 (OMIM: 155540,602025,607948) melanocorti ( 323) 215 49.3 1.2e-05
NP_003292 (OMIM: 188545) thyrotropin-releasing hor ( 398) 211 48.7 2.2e-05
XP_011515565 (OMIM: 188545) PREDICTED: thyrotropin ( 398) 211 48.7 2.2e-05
NP_004239 (OMIM: 600895) prolactin-releasing pepti ( 370) 202 47.1 6.4e-05
NP_005903 (OMIM: 155541,601665) melanocortin recep ( 332) 199 46.5 8.6e-05
NP_000015 (OMIM: 109690,600807,601665) beta-2 adre ( 413) 198 46.5 0.00011
NP_001269833 (OMIM: 165196) kappa-type opioid rece ( 291) 192 45.2 0.00019
NP_001050 (OMIM: 162332,614840) neuromedin-K recep ( 465) 194 45.8 0.00019
NP_000530 (OMIM: 136880,180380,610445,613731) rhod ( 348) 192 45.3 0.00021
NP_001517 (OMIM: 602393) orexin receptor type 2 [H ( 444) 193 45.6 0.00021
XP_016866287 (OMIM: 602393) PREDICTED: orexin rece ( 461) 193 45.7 0.00022
NP_001041695 (OMIM: 102775) adenosine receptor A1 ( 326) 191 45.1 0.00023
NP_000665 (OMIM: 102775) adenosine receptor A1 [Ho ( 326) 191 45.1 0.00023
NP_003848 (OMIM: 603691) galanin receptor type 2 [ ( 387) 191 45.2 0.00025
NP_005904 (OMIM: 600042) melanocortin receptor 5 [ ( 325) 189 44.8 0.00029
NP_000904 (OMIM: 602548) nociceptin receptor isofo ( 370) 189 44.8 0.00031
NP_001186948 (OMIM: 602548) nociceptin receptor is ( 370) 189 44.8 0.00031
XP_016883343 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 370) 189 44.8 0.00031
NP_872588 (OMIM: 602548) nociceptin receptor isofo ( 370) 189 44.8 0.00031
XP_011542714 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 308) 188 44.6 0.00031
XP_016883341 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 388) 189 44.9 0.00032
XP_011527130 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 388) 189 44.9 0.00032
XP_016883342 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 388) 189 44.9 0.00032
XP_016868585 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 317) 188 44.6 0.00032
XP_011542713 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 324) 188 44.6 0.00032
>>NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 [Ho (312 aa)
initn: 1399 init1: 1378 opt: 1388 Z-score: 1331.1 bits: 254.4 E(85289): 2.1e-67
Smith-Waterman score: 1388; 68.9% identity (89.2% similar) in 305 aa overlap (1-305:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MKSWNNTIILEFLLLGISEEPELQAFLFGLFLSMYLVTVLGNLLIILATISDSHLHTPMY
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NP_001 MEAENLTELSKFLLLGLSDDPELQPVLFGLFLSMYLVTVLGNLLIILAVSSDSHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FFLSNLSFVDICFVSTTVPKMLVNIQTHNKVITYAGCITQMCFFLLFVGLDNFLLTVMAY
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NP_001 FFLSNLSFVDICFISTTVPKMLVSIQARSKDISYMGCLTQVYFLMMFAGMDTFLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
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pF1KE5 DRFVAICHPLHYMVIMNPQLCGLLVLASWIMSVLNSMLQSLMVLPLPFCTHMEIPHFFCE
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NP_001 DRFVAICHPLHYTVIMNPCLCGLLVLASWFIIFWFSLVHILLMKRLTFSTGTEIPHFFCE
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190 200 210 220 230 240
pF1KE5 INQVVHLACSDTFLNDIVMYFAVALLGGGPLTGILYSYSKIVSSIRAISSAQGKYKAFST
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NP_001 PAQVLKVACSNTLLNNIVLYVATALLGVFPVAGILFSYSQIVSSLMGMSSTKGKYKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CASHLSVVSLFYGTCLGVYLSSAATHNSHTGAAASVMYTVVTPMLNPFIYSLRNKHIKGA
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NP_001 CGSHLCVVSLFYGTGLGVYLSSAVTHSSQSSSTASVMYAMVTPMLNPFIYSLRNKDVKGA
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 MKTFFRGKQ
.. ..
NP_001 LERLLSRADSCP
310
>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
initn: 1116 init1: 1116 opt: 1127 Z-score: 1084.4 bits: 208.8 E(85289): 1.2e-53
Smith-Waterman score: 1127; 54.6% identity (81.8% similar) in 302 aa overlap (1-302:1-302)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MKSWNNTIILEFLLLGISEEPELQAFLFGLFLSMYLVTVLGNLLIILATISDSHLHTPMY
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NP_036 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
10 20 30 40 50 60
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pF1KE5 FFLSNLSFVDICFVSTTVPKMLVNIQTHNKVITYAGCITQMCFFLLFVGLDNFLLTVMAY
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NP_036 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRFVAICHPLHYMVIMNPQLCGLLVLASWIMSVLNSMLQSLMVLPLPFCTHMEIPHFFCE
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NP_036 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 INQVVHLACSDTFLNDIVMYFAVALLGGGPLTGILYSYSKIVSSIRAISSAQGKYKAFST
.. ...:.:::: ::.... ::. :. :: :: .:. .. . :..:..:::::
NP_036 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CASHLSVVSLFYGTCLGVYLSSAATHNSHTGAAASVMYTVVTPMLNPFIYSLRNKHIKGA
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NP_036 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 MKTFFRGKQ
.:
NP_036 LKKVVGRVVFSV
310
>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa)
initn: 1116 init1: 1116 opt: 1127 Z-score: 1084.4 bits: 208.8 E(85289): 1.2e-53
Smith-Waterman score: 1127; 54.6% identity (81.8% similar) in 302 aa overlap (1-302:1-302)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MKSWNNTIILEFLLLGISEEPELQAFLFGLFLSMYLVTVLGNLLIILATISDSHLHTPMY
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XP_011 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FFLSNLSFVDICFVSTTVPKMLVNIQTHNKVITYAGCITQMCFFLLFVGLDNFLLTVMAY
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XP_011 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
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pF1KE5 DRFVAICHPLHYMVIMNPQLCGLLVLASWIMSVLNSMLQSLMVLPLPFCTHMEIPHFFCE
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XP_011 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 INQVVHLACSDTFLNDIVMYFAVALLGGGPLTGILYSYSKIVSSIRAISSAQGKYKAFST
.. ...:.:::: ::.... ::. :. :: :: .:. .. . :..:..:::::
XP_011 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST
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pF1KE5 CASHLSVVSLFYGTCLGVYLSSAATHNSHTGAAASVMYTVVTPMLNPFIYSLRNKHIKGA
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XP_011 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 MKTFFRGKQ
.:
XP_011 LKKVVGRVVFSV
310
>>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa)
initn: 1116 init1: 1116 opt: 1127 Z-score: 1084.3 bits: 208.8 E(85289): 1.2e-53
Smith-Waterman score: 1127; 54.6% identity (81.8% similar) in 302 aa overlap (1-302:11-312)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MKSWNNTIILEFLLLGISEEPELQAFLFGLFLSMYLVTVLGNLLIILATI
:.. :.. . ::::::.:..:. : .:: .::::::.::::::::::..
XP_011 MGDRRADPRPMSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVS
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 SDSHLHTPMYFFLSNLSFVDICFVSTTVPKMLVNIQTHNKVITYAGCITQMCFFLLFVGL
:: ::::::::::::::::::: :::::::.: ....:.. ::.::: : ..:: .
XP_011 IDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDM
70 80 90 100 110 120
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pF1KE5 DNFLLTVMAYDRFVAICHPLHYMVIMNPQLCGLLVLASWIMSVLNSMLQSLMVLPLPFCT
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XP_011 DNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCA
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pF1KE5 HMEIPHFFCEINQVVHLACSDTFLNDIVMYFAVALLGGGPLTGILYSYSKIVSSIRAISS
: ::::... ...:.:::: ::.... ::. :. :: :: .:. .. . :
XP_011 DNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPS
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 AQGKYKAFSTCASHLSVVSLFYGTCLGVYLSSAATHNSHTGAAASVMYTVVTPMLNPFIY
..:..::::::.:::.:: :::.: ..::.. ..:... . :.:.:::::::::::::
XP_011 TKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIY
250 260 270 280 290 300
300
pF1KE5 SLRNKHIKGAMKTFFRGKQ
::::...:::.:
XP_011 SLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
310 320
>>NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [Homo (312 aa)
initn: 1029 init1: 903 opt: 1041 Z-score: 1003.1 bits: 193.7 E(85289): 3.9e-49
Smith-Waterman score: 1041; 53.5% identity (79.1% similar) in 301 aa overlap (1-301:1-300)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MKSWNNTIILEFLLLGISEEPELQAFLFGLFLSMYLVTVLGNLLIILATISDSHLHTPMY
: . :.. ::::::.:: :: : .:: .:::::::::.::.::::: :::.::::.:
NP_002 MDGGNQSEGSEFLLLGMSESPEQQRILFWMFLSMYLVTVVGNVLIILAISSDSRLHTPVY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FFLSNLSFVDICFVSTTVPKMLVNIQTHNKVITYAGCITQMCFFLLFVGLDNFLLTVMAY
:::.::::.:. ::..:.::::::.:.:::.:.::::.::. :.. .:.:::..:.::::
NP_002 FFLANLSFTDLFFVTNTIPKMLVNLQSHNKAISYAGCLTQLYFLVSLVALDNLILAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRFVAICHPLHYMVIMNPQLCGLLVLASWIMSVLNSMLQSLMVLPLPFCTHMEIPHFFCE
::.:::: :::: . :.:.:: ::. :..::: .....:.. . :: .: ..:::
NP_002 DRYVAICCPLHYTTAMSPKLCILLLSLCWVLSVLYGLIHTLLMTRVTFCGSRKIHYIFCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 INQVVHLACSDTFLNDIVMYFAVALLGGGPLTGILYSYSKIVSSIRAISSAQGKYKAFST
. ....:::. .: :. . .. :. .. :: :. .: : :.. :::::::
NP_002 MYVLLRMACSNIQINHTVLIATGCFIFLIPFGFVIISYVLIIRAILRIPSVSKKYKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CASHLSVVSLFYGTCLGVYLSSAATHNSHTGAAASVMYTVVTPMLNPFIYSLRNKHIKGA
:::::..::::::: :::. :. : ..:.:::.:::::.:::::::::: ..::
NP_002 CASHLGAVSLFYGTLCMVYLKPLHTY-SVKDSVATVMYAVVTPMMNPFIYSLRNKDMHGA
250 260 270 280 290
pF1KE5 MKTFFRGKQ
.
NP_002 LGRLLDKHFKRLT
300 310
>>NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 [Ho (314 aa)
initn: 907 init1: 907 opt: 929 Z-score: 897.2 bits: 174.2 E(85289): 3.1e-43
Smith-Waterman score: 929; 45.8% identity (77.1% similar) in 310 aa overlap (1-309:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MKSWNNTIILEFLLLGISEEPELQAFLFGLFLSMYLVTVLGNLLIILATISDSHLHTPMY
: . :.. .:.:::.:..:.:. .:: ..: ::.:..:: :::.. : :::::::
NP_001 MDGTNGSTQTHFILLGFSDRPHLERILFVVILIAYLLTLVGNTTIILVSRLDPHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FFLSNLSFVDICFVSTTVPKMLVNIQTHNKVITYAGCITQMCFFLLFVGLDNFLLTVMAY
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NP_001 FFLAHLSFLDLSFTTSSIPQLLYNLNGCDKTISYMGCAIQLFLFLGLGGVECLLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRFVAICHPLHYMVIMNPQLCGLLVLASWIMSVLNSMLQSLMVLPLPFCTHMEIPHFFCE
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NP_001 DRCVAICKPLHYMVIMNPRLCRGLVSVTWGCGVANSLAMSPVTLRLPRCGHHEVDHFLRE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230
pF1KE5 INQVVHLACSDTF-LNDIVMYFAVALLGGGPLTGILYSYSKIVSSIRAISSAQGKYKAFS
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NP_001 MPALIRMACVSTVAIEGTVFVLAVGVVLS-PLVFILLSYSYIVRAVLQIRSASGRQKAFG
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 TCASHLSVVSLFYGTCLGVYLSSAATHNSHTGAAASVMYTVVTPMLNPFIYSLRNKHIKG
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NP_001 TCGSHLTVVSLFYGNIIYMYMQPGASSSQDQGMFLMLFYNIVTPLLNPLIYTLRNREVKG
240 250 260 270 280 290
300
pF1KE5 AMKTFFRGKQ
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NP_001 ALGRLLLGKRELGKE
300 310
>>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor (311 aa)
initn: 889 init1: 862 opt: 912 Z-score: 881.2 bits: 171.2 E(85289): 2.4e-42
Smith-Waterman score: 912; 44.3% identity (78.0% similar) in 291 aa overlap (12-302:15-305)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MKSWNNTIILEFLLLGISEEPELQAFLFGLFLSMYLVTVLGNLLIILATISDSHLHT
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NP_001 MNDDGKVNASSEGYFILVGFSNWPHLEVVIFVVVLIFYLMTLIGNLFIIILSYLDSHLHT
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 PMYFFLSNLSFVDICFVSTTVPKMLVNIQTHNKVITYAGCITQMCFFLLFVGLDNFLLTV
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NP_001 PMYFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLWGPEKTISYAGCMIQLYFVLALGTTECVLLVV
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 MAYDRFVAICHPLHYMVIMNPQLCGLLVLASWIMSVLNSMLQSLMVLPLPFCTHMEIPHF
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NP_001 MSYDRYAAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLAVASWVSGFTNSALHSSFTFWVPLCGHRQVDHF
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 FCEINQVVHLACSDTFLNDIVMYFAVALLGGGPLTGILYSYSKIVSSIRAISSAQGKYKA
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NP_001 FCEVPALLRLSCVDTHVNELTLMITSSIFVLIPLILILTSYGAIVRAILRMQSTTGLQKV
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 FSTCASHLSVVSLFYGTCLGVYLSSAATHNSHTGAAASVMYTVVTPMLNPFIYSLRNKHI
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NP_001 FGTCGAHLMAVSLFFIPAMCMYLQPPSGNSQDQGKFIALFYTVVTPSLNPLIYTLRNKVV
250 260 270 280 290 300
300
pF1KE5 KGAMKTFFRGKQ
.::.:
NP_001 RGAVKRLMGWE
310
>>NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN1 [H (311 aa)
initn: 932 init1: 883 opt: 903 Z-score: 872.7 bits: 169.6 E(85289): 7.2e-42
Smith-Waterman score: 903; 47.5% identity (74.1% similar) in 305 aa overlap (5-308:6-309)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MKSWNNTIILEFLLLGISEEPELQAFLFGLFLSMYLVTVLGNLLIILATISDSHLHTPM
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NP_001 MTGGGNITEITYFILLGFSDFPRIIKVLFTIFLVIYITSLAWNLSLIVLIRMDSHLHTPM
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 YFFLSNLSFVDICFVSTTVPKMLVNIQTHNKVITYAGCITQMCFFLLFVGL-DNFLLTVM
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NP_001 YFFLSNLSFIDVCYISSTVPKMLSNLLQEQQTITFVGCIIQY-FIFSTMGLSESCLMTAM
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 AYDRFVAICHPLHYMVIMNPQLCGLLVLASWIMSVLNSMLQSLMVLPLPFCTHMEIPHFF
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NP_001 AYDRYAAICNPLLYSSIMSPTLCVWMVLGAYMTGLTASLFQIGALLQLHFCGSNVIRHFF
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 CEINQVVHLACSDTFLNDIVMYFAVALLGGGPLTGILYSYSKIVSSIRAISSAQGKYKAF
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NP_001 CDMPQLLILSCTDTFFVQVMTAILTMFFGIASALVIMISYGYIGISIMKITSAKGRSKAF
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 STCASHLSVVSLFYGTCLGVYLSSAATHNSHTGAAASVMYTVVTPMLNPFIYSLRNKHIK
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NP_001 NTCASHLTAVSLFYTSGIFVYLSSSSGGSSSFDRFASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEIK
240 250 260 270 280 290
300
pF1KE5 GAMKTFFRGKQ
:.: . . :
NP_001 DALKRLQKRKCC
300 310
>>NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [Homo (312 aa)
initn: 878 init1: 878 opt: 882 Z-score: 852.8 bits: 165.9 E(85289): 9.2e-41
Smith-Waterman score: 882; 44.3% identity (75.8% similar) in 298 aa overlap (12-309:10-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MKSWNNTIILEFLLLGISEEPELQAFLFGLFLSMYLVTVLGNLLIILATISDSHLHTPMY
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NP_009 MVNQSSTPGFLLLGFSEHPGLERTLFVVVLTSYLLTLVGNTLIILLSALDPKLHSPMY
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FFLSNLSFVDICFVSTTVPKMLVNIQTHNKVITYAGCITQMCFFLLFVGLDNFLLTVMAY
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NP_009 FFLSNLSFLDLCFTTSCVPQMLVNLWGPKKTISFLDCSVQIFIFLSLGTTECILLTVMAF
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRFVAICHPLHYMVIMNPQLCGLLVLASWIMSVLNSMLQSLMVLPLPFCTHMEIPHFFCE
::.::.:.:::: .:..:.:: :. ..:......:..:. .: :::: .. : ::
NP_009 DRYVAVCQPLHYATIIHPRLCWQLASVAWVIGLVESVVQTPSTLHLPFCPDRQVDDFVCE
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 INQVVHLACSDTFLNDIVMYFAVALLGGGPLTGILYSYSKIVSSIRAISSAQGKYKAFST
. ...:.: :: :.: . : ... ::. :: ::. :. .. :.::.:. :::.:
NP_009 VPALIRLSCEDTSYNEIQVAVASVFILVVPLSLILVSYGAITWAVLRINSAKGRRKAFGT
180 190 200 210 220 230
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pF1KE5 CASHLSVVSLFYGTCLGVYLSSAATHNSHTGAAASVMYTVVTPMLNPFIYSLRNKHIKGA
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NP_009 CSSHLTVVTLFYSSVIAVYLQPKNPYAQERGKFFGLFYAVGTPSLNPLIYTLRNKEVTRA
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 MKTFFRGKQ
.. .. ::.
NP_009 FRRLL-GKEMGLTQS
300 310
>>XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory recep (300 aa)
initn: 872 init1: 872 opt: 872 Z-score: 843.6 bits: 164.2 E(85289): 3e-40
Smith-Waterman score: 872; 45.3% identity (76.0% similar) in 287 aa overlap (12-298:10-296)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MKSWNNTIILEFLLLGISEEPELQAFLFGLFLSMYLVTVLGNLLIILATISDSHLHTPMY
:::::.::.: :. :: . :. ::.:..:: :::: . : .::.:::
XP_011 MVNQSSTPGFLLLGFSEHPGLERTLFVVVLTSYLLTLVGNTLIILLSALDPKLHSPMY
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FFLSNLSFVDICFVSTTVPKMLVNIQTHNKVITYAGCITQMCFFLLFVGLDNFLLTVMAY
::::::::.:.::... ::.::::. .:.:.. : .:. .:: . . .::::::.
XP_011 FFLSNLSFLDLCFTTSCVPQMLVNLWGPKKTISFLDCSVQIFIFLSLGTTECILLTVMAF
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRFVAICHPLHYMVIMNPQLCGLLVLASWIMSVLNSMLQSLMVLPLPFCTHMEIPHFFCE
::.::.:.:::: .:..:.:: :. ..:......:..:. .: :::: .. : ::
XP_011 DRYVAVCQPLHYATIIHPRLCWQLASVAWVIGLVESVVQTPSTLHLPFCPDRQVDDFVCE
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 INQVVHLACSDTFLNDIVMYFAVALLGGGPLTGILYSYSKIVSSIRAISSAQGKYKAFST
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XP_011 VPALIRLSCEDTSYNEIQVAVASVFILVVPLSLILVSYGAITWAVLRINSAKGRRKAFGT
180 190 200 210 220 230
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XP_011 GS
300
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]