Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5392
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5392, 309 aa
1>>>pF1KE5392 309 - 309 aa - 309 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1491+/-0.00131; mu= 11.1373+/- 0.077
mean_var=181.7863+/-63.548, 0's: 0 Z-trim(102.2): 430 B-trim: 383 in 1/48
Lambda= 0.095125
statistics sampled from 6314 (6847) to 6314 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.552), E-opt: 0.2 (0.21), width: 16
Scan time: 2.150
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS32936.1 OR7A10 gene_id:390892|Hs108|chr19 ( 309) 2034 292.4 3e-79
CCDS12319.1 OR7A17 gene_id:26333|Hs108|chr19 ( 309) 1678 243.5 1.5e-64
CCDS12318.1 OR7A5 gene_id:26659|Hs108|chr19 ( 319) 1612 234.5 8.2e-62
CCDS32901.1 OR7D4 gene_id:125958|Hs108|chr19 ( 312) 1388 203.7 1.5e-52
CCDS32900.1 OR7D2 gene_id:162998|Hs108|chr19 ( 312) 1377 202.2 4.1e-52
CCDS12320.1 OR7C2 gene_id:26658|Hs108|chr19 ( 319) 1375 202.0 5.1e-52
CCDS12317.1 OR7C1 gene_id:26664|Hs108|chr19 ( 320) 1371 201.4 7.4e-52
CCDS32899.1 OR7G3 gene_id:390883|Hs108|chr19 ( 312) 1337 196.7 1.9e-50
CCDS32897.1 OR7G2 gene_id:390882|Hs108|chr19 ( 345) 1332 196.1 3.2e-50
CCDS32898.2 OR7G1 gene_id:125962|Hs108|chr19 ( 311) 1276 188.4 6.1e-48
CCDS45955.1 OR7E24 gene_id:26648|Hs108|chr19 ( 339) 1268 187.3 1.4e-47
CCDS11020.1 OR1G1 gene_id:8390|Hs108|chr17 ( 313) 1177 174.8 7.6e-44
CCDS10496.1 OR1F1 gene_id:4992|Hs108|chr16 ( 312) 1127 167.9 8.8e-42
CCDS35123.1 OR1N2 gene_id:138882|Hs108|chr9 ( 330) 1102 164.5 9.8e-41
CCDS11024.1 OR1E1 gene_id:8387|Hs108|chr17 ( 314) 1095 163.5 1.9e-40
CCDS35122.1 OR1J4 gene_id:26219|Hs108|chr9 ( 313) 1094 163.4 2e-40
CCDS32896.1 OR1M1 gene_id:125963|Hs108|chr19 ( 313) 1068 159.8 2.4e-39
CCDS6844.1 OR1N1 gene_id:138883|Hs108|chr9 ( 311) 1058 158.5 6.2e-39
CCDS41481.1 OR1C1 gene_id:26188|Hs108|chr1 ( 314) 1052 157.6 1.1e-38
CCDS35121.1 OR1J2 gene_id:26740|Hs108|chr9 ( 313) 1049 157.2 1.5e-38
CCDS11019.1 OR1D2 gene_id:4991|Hs108|chr17 ( 312) 1041 156.1 3.1e-38
CCDS35120.1 OR1J1 gene_id:347168|Hs108|chr9 ( 322) 1040 156.0 3.5e-38
CCDS31545.1 OR1S2 gene_id:219958|Hs108|chr11 ( 325) 1038 155.7 4.3e-38
CCDS58499.1 OR1D5 gene_id:8386|Hs108|chr17 ( 312) 1021 153.4 2.1e-37
CCDS32937.1 OR1I1 gene_id:126370|Hs108|chr19 ( 355) 1012 152.2 5.4e-37
CCDS35129.1 OR1L4 gene_id:254973|Hs108|chr9 ( 311) 997 150.1 2.1e-36
CCDS35130.2 OR1L6 gene_id:392390|Hs108|chr9 ( 311) 977 147.3 1.4e-35
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 969 146.3 3e-35
CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6 ( 357) 968 146.2 3.5e-35
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 953 144.1 1.4e-34
CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 ( 326) 947 143.3 2.5e-34
CCDS4642.1 OR2B6 gene_id:26212|Hs108|chr6 ( 313) 944 142.8 3.2e-34
CCDS35125.1 OR1Q1 gene_id:158131|Hs108|chr9 ( 314) 943 142.7 3.5e-34
CCDS11022.1 OR1A1 gene_id:8383|Hs108|chr17 ( 309) 939 142.1 5.1e-34
CCDS35127.2 OR1L1 gene_id:26737|Hs108|chr9 ( 310) 939 142.1 5.1e-34
CCDS43670.1 OR2A12 gene_id:346525|Hs108|chr7 ( 310) 939 142.1 5.1e-34
CCDS31119.1 OR2G6 gene_id:391211|Hs108|chr1 ( 316) 931 141.0 1.1e-33
CCDS43434.1 OR2J2 gene_id:26707|Hs108|chr6 ( 312) 929 140.8 1.3e-33
CCDS31099.1 OR2W3 gene_id:343171|Hs108|chr1 ( 314) 929 140.8 1.3e-33
CCDS8446.1 OR8B8 gene_id:26493|Hs108|chr11 ( 311) 928 140.6 1.5e-33
CCDS1634.2 OR2C3 gene_id:81472|Hs108|chr1 ( 320) 926 140.4 1.8e-33
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 925 140.2 2e-33
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 924 140.1 2.2e-33
CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 ( 309) 923 139.9 2.3e-33
CCDS35128.1 OR1L3 gene_id:26735|Hs108|chr9 ( 324) 919 139.4 3.5e-33
CCDS53631.1 OR5M1 gene_id:390168|Hs108|chr11 ( 315) 918 139.3 3.8e-33
CCDS32020.1 OR4Q3 gene_id:441669|Hs108|chr14 ( 313) 916 139.0 4.6e-33
CCDS53630.1 OR5M10 gene_id:390167|Hs108|chr11 ( 315) 916 139.0 4.6e-33
CCDS31709.1 OR8B3 gene_id:390271|Hs108|chr11 ( 313) 915 138.8 5.1e-33
CCDS34358.1 OR2B3 gene_id:442184|Hs108|chr6 ( 313) 914 138.7 5.6e-33
>>CCDS32936.1 OR7A10 gene_id:390892|Hs108|chr19 (309 aa)
initn: 2034 init1: 2034 opt: 2034 Z-score: 1536.3 bits: 292.4 E(32554): 3e-79
Smith-Waterman score: 2034; 100.0% identity (100.0% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MKSWNNTIILEFLLLGISEEPELQAFLFGLFLSMYLVTVLGNLLIILATISDSHLHTPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MKSWNNTIILEFLLLGISEEPELQAFLFGLFLSMYLVTVLGNLLIILATISDSHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FFLSNLSFVDICFVSTTVPKMLVNIQTHNKVITYAGCITQMCFFLLFVGLDNFLLTVMAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 FFLSNLSFVDICFVSTTVPKMLVNIQTHNKVITYAGCITQMCFFLLFVGLDNFLLTVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRFVAICHPLHYMVIMNPQLCGLLVLASWIMSVLNSMLQSLMVLPLPFCTHMEIPHFFCE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DRFVAICHPLHYMVIMNPQLCGLLVLASWIMSVLNSMLQSLMVLPLPFCTHMEIPHFFCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 INQVVHLACSDTFLNDIVMYFAVALLGGGPLTGILYSYSKIVSSIRAISSAQGKYKAFST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 INQVVHLACSDTFLNDIVMYFAVALLGGGPLTGILYSYSKIVSSIRAISSAQGKYKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CASHLSVVSLFYGTCLGVYLSSAATHNSHTGAAASVMYTVVTPMLNPFIYSLRNKHIKGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 CASHLSVVSLFYGTCLGVYLSSAATHNSHTGAAASVMYTVVTPMLNPFIYSLRNKHIKGA
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 MKTFFRGKQ
:::::::::
CCDS32 MKTFFRGKQ
>>CCDS12319.1 OR7A17 gene_id:26333|Hs108|chr19 (309 aa)
initn: 1678 init1: 1678 opt: 1678 Z-score: 1272.3 bits: 243.5 E(32554): 1.5e-64
Smith-Waterman score: 1678; 82.5% identity (93.5% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MKSWNNTIILEFLLLGISEEPELQAFLFGLFLSMYLVTVLGNLLIILATISDSHLHTPMY
:. :.: : ::.:::.::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MEPENDTGISEFVLLGLSEEPELQPFLFGLFLSMYLVTVLGNLLIILATISDSHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FFLSNLSFVDICFVSTTVPKMLVNIQTHNKVITYAGCITQMCFFLLFVGLDNFLLTVMAY
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CCDS12 FFLSNLSFADICFISTTIPKMLINIQTQSRVITYAGCITQMCFFVLFGGLDSLLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRFVAICHPLHYMVIMNPQLCGLLVLASWIMSVLNSMLQSLMVLPLPFCTHMEIPHFFCE
:::::::::::: :::::.::::::::::....:::. :::::: : ::: .::::::::
CCDS12 DRFVAICHPLHYTVIMNPRLCGLLVLASWMIAALNSLSQSLMVLWLSFCTDLEIPHFFCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 INQVVHLACSDTFLNDIVMYFAVALLGGGPLTGILYSYSKIVSSIRAISSAQGKYKAFST
.:::.:::::::::::. ::::..::.::::.::: ::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LNQVIHLACSDTFLNDMGMYFAAGLLAGGPLVGILCSYSKIVSSIRAISSAQGKYKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CASHLSVVSLFYGTCLGVYLSSAATHNSHTGAAASVMYTVVTPMLNPFIYSLRNKHIKGA
::::::::::: : :::::.:::::::::.:.:::::::.:::::::::::::: :: :
CCDS12 CASHLSVVSLFCCTGLGVYLTSAATHNSHTSATASVMYTVATPMLNPFIYSLRNKDIKRA
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 MKTFFRGKQ
.: :::::
CCDS12 LKMSFRGKQ
>>CCDS12318.1 OR7A5 gene_id:26659|Hs108|chr19 (319 aa)
initn: 1614 init1: 1595 opt: 1612 Z-score: 1223.2 bits: 234.5 E(32554): 8.2e-62
Smith-Waterman score: 1612; 81.4% identity (93.4% similar) in 301 aa overlap (1-301:1-301)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MKSWNNTIILEFLLLGISEEPELQAFLFGLFLSMYLVTVLGNLLIILATISDSHLHTPMY
:. :.: : ::::::.:.:: :: :::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MEPGNDTQISEFLLLGFSQEPGLQPFLFGLFLSMYLVTVLGNLLIILATISDSHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FFLSNLSFVDICFVSTTVPKMLVNIQTHNKVITYAGCITQMCFFLLFVGLDNFLLTVMAY
::::::::.::: .:::.::::.::::.:::::: .:. :: ::.::.:..::::.::::
CCDS12 FFLSNLSFADICVTSTTIPKMLMNIQTQNKVITYIACLMQMYFFILFAGFENFLLSVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRFVAICHPLHYMVIMNPQLCGLLVLASWIMSVLNSMLQSLMVLPLPFCTHMEIPHFFCE
::::::::::::::::::.:::::::::: ::.: :.:: :::. : ::: .::::::::
CCDS12 DRFVAICHPLHYMVIMNPHLCGLLVLASWTMSALYSLLQILMVVRLSFCTALEIPHFFCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 INQVVHLACSDTFLNDIVMYFAVALLGGGPLTGILYSYSKIVSSIRAISSAQGKYKAFST
.:::..:::::.::: .:.::.:::::::::::::::::::.:::.::::::::::::::
CCDS12 LNQVIQLACSDSFLNHMVIYFTVALLGGGPLTGILYSYSKIISSIHAISSAQGKYKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CASHLSVVSLFYGTCLGVYLSSAATHNSHTGAAASVMYTVVTPMLNPFIYSLRNKHIKGA
:::::::::::::. ::::::::::.:::..:.:::::::::::::::::::::: :: :
CCDS12 CASHLSVVSLFYGAILGVYLSSAATRNSHSSATASVMYTVVTPMLNPFIYSLRNKDIKRA
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 MKTFFRGKQ
.
CCDS12 LGIHLLWGTMKGQFFKKCP
310
>>CCDS32901.1 OR7D4 gene_id:125958|Hs108|chr19 (312 aa)
initn: 1399 init1: 1378 opt: 1388 Z-score: 1057.2 bits: 203.7 E(32554): 1.5e-52
Smith-Waterman score: 1388; 68.9% identity (89.2% similar) in 305 aa overlap (1-305:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MKSWNNTIILEFLLLGISEEPELQAFLFGLFLSMYLVTVLGNLLIILATISDSHLHTPMY
:.. : : . .:::::.:..:::: ::::::::::::::::::::::. ::::::::::
CCDS32 MEAENLTELSKFLLLGLSDDPELQPVLFGLFLSMYLVTVLGNLLIILAVSSDSHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FFLSNLSFVDICFVSTTVPKMLVNIQTHNKVITYAGCITQMCFFLLFVGLDNFLLTVMAY
:::::::::::::.:::::::::.::...: :.: ::.::. :...:.:.:.:::.::::
CCDS32 FFLSNLSFVDICFISTTVPKMLVSIQARSKDISYMGCLTQVYFLMMFAGMDTFLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRFVAICHPLHYMVIMNPQLCGLLVLASWIMSVLNSMLQSLMVLPLPFCTHMEIPHFFCE
:::::::::::: ::::: ::::::::::.. :... :.. : : : ::::::::
CCDS32 DRFVAICHPLHYTVIMNPCLCGLLVLASWFIIFWFSLVHILLMKRLTFSTGTEIPHFFCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 INQVVHLACSDTFLNDIVMYFAVALLGGGPLTGILYSYSKIVSSIRAISSAQGKYKAFST
::...:::.:.::.::.: :.:::: :..:::.:::.::::. ..::..::::::::
CCDS32 PAQVLKVACSNTLLNNIVLYVATALLGVFPVAGILFSYSQIVSSLMGMSSTKGKYKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CASHLSVVSLFYGTCLGVYLSSAATHNSHTGAAASVMYTVVTPMLNPFIYSLRNKHIKGA
:.::: :::::::: ::::::::.::.:.....:::::..::::::::::::::: .:::
CCDS32 CGSHLCVVSLFYGTGLGVYLSSAVTHSSQSSSTASVMYAMVTPMLNPFIYSLRNKDVKGA
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 MKTFFRGKQ
.. ..
CCDS32 LERLLSRADSCP
310
>>CCDS32900.1 OR7D2 gene_id:162998|Hs108|chr19 (312 aa)
initn: 1396 init1: 1363 opt: 1377 Z-score: 1049.0 bits: 202.2 E(32554): 4.1e-52
Smith-Waterman score: 1377; 66.2% identity (88.9% similar) in 305 aa overlap (1-305:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MKSWNNTIILEFLLLGISEEPELQAFLFGLFLSMYLVTVLGNLLIILATISDSHLHTPMY
:.. :.: .:::.:::.::.:::: :.::::::::::::::::::::: ::::::::::
CCDS32 MEAGNQTGFLEFILLGLSEDPELQPFIFGLFLSMYLVTVLGNLLIILAISSDSHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FFLSNLSFVDICFVSTTVPKMLVNIQTHNKVITYAGCITQMCFFLLFVGLDNFLLTVMAY
:::::::.::::: . ::::::::::.::.:.: :.::. : ..: ::..:::::::
CCDS32 FFLSNLSWVDICFSTCIVPKMLVNIQTENKAISYMDCLTQVYFSMFFPILDTLLLTVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRFVAICHPLHYMVIMNPQLCGLLVLASWIMSVLNSMLQSLMVLPLPFCTHMEIPHFFCE
:::::.:::::::.::::.::::::...:...:..:.:. ... : :: .::::::::
CCDS32 DRFVAVCHPLHYMIIMNPHLCGLLVFVTWLIGVMTSLLHISLMMHLIFCKDFEIPHFFCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 INQVVHLACSDTFLNDIVMYFAVALLGGGPLTGILYSYSKIVSSIRAISSAQGKYKAFST
.. ...:::::::::. ..:: ...:: :: ::..:::.:.:::: .::. :: ::.::
CCDS32 LTYILQLACSDTFLNSTLIYFMTGVLGVFPLLGIIFSYSRIASSIRKMSSSGGKQKALST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CASHLSVVSLFYGTCLGVYLSSAATHNSHTGAAASVMYTVVTPMLNPFIYSLRNKHIKGA
:.:::::::::::: .::...::.::.:. ..:::::::::::::::::::::: .:::
CCDS32 CGSHLSVVSLFYGTGIGVHFTSAVTHSSQKISVASVMYTVVTPMLNPFIYSLRNKDVKGA
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 MKTFFRGKQ
. ...
CCDS32 LGSLLSRAASCL
310
>>CCDS12320.1 OR7C2 gene_id:26658|Hs108|chr19 (319 aa)
initn: 1379 init1: 1042 opt: 1375 Z-score: 1047.4 bits: 202.0 E(32554): 5.1e-52
Smith-Waterman score: 1375; 69.1% identity (89.0% similar) in 301 aa overlap (1-301:1-300)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MKSWNNTIILEFLLLGISEEPELQAFLFGLFLSMYLVTVLGNLLIILATISDSHLHTPMY
:. :.: . .:::::..:. ..: .: ::::::::::..:::::::. ::::::::::
CCDS12 MERGNQTEVGNFLLLGFAEDSDMQLLLHGLFLSMYLVTIIGNLLIILTISSDSHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FFLSNLSFVDICFVSTTVPKMLVNIQTHNKVITYAGCITQMCFFLLFVGLDNFLLTVMAY
::::::::.::::.:::::::::::::..:.::.:::.::. ::. : :::.:::. ::
CCDS12 FFLSNLSFADICFTSTTVPKMLVNIQTQSKMITFAGCLTQIFFFIAFGCLDNLLLTMTAY
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130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRFVAICHPLHYMVIMNPQLCGLLVLASWIMSVLNSMLQSLMVLPLPFCTHMEIPHFFCE
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CCDS12 DRFVAICYPLHYTVIMNPRLCGLLVLGSWCISVMGSLLETLTILRLSFCTNMEIPHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 INQVVHLACSDTFLNDIVMYFAVALLGGGPLTGILYSYSKIVSSIRAISSAQGKYKAFST
..:..:::::::.:.:::::.. .:: :: :::.:::.: ::. .: :.:..:::::
CCDS12 PSEVLKLACSDTFINNIVMYFVTIVLGVFPLCGILFSYSQIFSSVLRVS-ARGQHKAFST
190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CASHLSVVSLFYGTCLGVYLSSAATHNSHTGAAASVMYTVVTPMLNPFIYSLRNKHIKGA
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CCDS12 CGSHLSVVSLFYGTGLGVYLSSAVTPPSRTSLAASVMYTMVTPMLNPFIYSLRNKDMKGS
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 MKTFFRGKQ
.
CCDS12 LGRLLLRATSLKEGTIAKLS
300 310
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pF1KE5 MKSWNNTIILEFLLLGISEEPELQAFLFGLFLSMYLVTVLGNLLIILATISDSHLHTPMY
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CCDS12 METGNQTHAQEFLLLGFSATSEIQFILFGLFLSMYLVTFTGNLLIILAICSDSHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FFLSNLSFVDICFVSTTVPKMLVNIQTHNKVITYAGCITQMCFFLLFVGLDNFLLTVMAY
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CCDS12 FFLSNLSFADLCFTSTTVPKMLLNILTQNKFITYAGCLSQIFFFTSFGCLDNLLLTVMAY
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pF1KE5 DRFVAICHPLHYMVIMNPQLCGLLVLASWIMSVLNSMLQSLMVLPLPFCTHMEIPHFFCE
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CCDS12 DRFVAVCHPLHYTVIMNPQLCGLLVLGSWCISVMGSLLETLTVLRLSFCTEMEIPHFFCD
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pF1KE5 INQVVHLACSDTFLNDIVMYFAVALLGGGPLTGILYSYSKIVSSIRAISSAQGKYKAFST
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CCDS12 LLEVLKLACSDTFINNVVIYFATGVLGVISFTGIFFSYYKIVFSILRISSAGRKHKAFST
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pF1KE5 CASHLSVVSLFYGTCLGVYLSSAATHNSHTGAAASVMYTVVTPMLNPFIYSLRNKHIKGA
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CCDS12 CGSHLSVVTLFYGTGFGVYLSSAATPSSRTSLVASVMYTMVTPMLNPFIYSLRNTDMKRA
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 M------KTFFRGKQ
. ::: :
CCDS12 LGRLLSRATFFNGDITAGLS
310 320
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pF1KE5 MKSWNNTIILEFLLLGISEEPELQAFLFGLFLSMYLVTVLGNLLIILATISDSHLHTPMY
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CCDS32 MKAGNFSDTPEFFLLGLSGDPELQPILFMLFLSMYLATMLGNLLIILAVNSDSHLHTPMY
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pF1KE5 FFLSNLSFVDICFVSTTVPKMLVNIQTHNKVITYAGCITQMCFFLLFVGLDNFLLTVMAY
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CCDS32 FLLSILSLVDICFTSTTMPKMLVNIQAQAQSINYTGCLTQICFVLVFVGLENGILVMMAY
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pF1KE5 DRFVAICHPLHYMVIMNPQLCGLLVLASWIMSVLNSMLQSLMVLPLPFCTHMEIPHFFCE
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CCDS32 DRFVAICHPLRYNVIMNPKLCGLLLLLSFIVSVLDALLHTLMVLQLTFCIDLEIPHFFCE
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pF1KE5 INQVVHLACSDTFLNDIVMYFAVALLGGGPLTGILYSYSKIVSSIRAISSAQGKYKAFST
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CCDS32 LAHILKLACSDVLINNILVYLVTSLLGVVPLSGIIFSYTRIVSSVMKIPSAGGKYKAFSI
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pF1KE5 CASHLSVVSLFYGTCLGVYLSSAATHNSHTGAAASVMYTVVTPMLNPFIYSLRNKHIKGA
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CCDS32 CGSHLIVVSLFYGTGFGVYLSSGATHSSRKGAIASVMYTVVTPMLNPLIYSLRNKDMLKA
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pF1KE5 MKTFFRGKQ
..
CCDS32 LRKLISRIPSFH
310
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10 20 30
pF1KE5 MKSWNNTIILEFLLLGISEEPELQAFLFGLFLSMYLVTV
:.. :.: : .:::::. :.:::: ::.:::::::::.
CCDS32 MPMQLLLTDFIIFSIRFIINSMEARNQTAISKFLLLGLIEDPELQPVLFSLFLSMYLVTI
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE5 LGNLLIILATISDSHLHTPMYFFLSNLSFVDICFVSTTVPKMLVNIQTHNKVITYAGCIT
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CCDS32 LGNLLILLAVISDSHLHTPMYFFLSNLSFLDICLSTTTIPKMLVNIQAQNRSITYSGCLT
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pF1KE5 QMCFFLLFVGLDNFLLTVMAYDRFVAICHPLHYMVIMNPQLCGLLVLASWIMSVLNSMLQ
:.:: :.:.::.: ::..:::::.:::::::.: :::::.:::::.: : . ::.:..:
CCDS32 QICFVLFFAGLENCLLAAMAYDRYVAICHPLRYTVIMNPRLCGLLILLSLLTSVVNALLL
130 140 150 160 170 180
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pF1KE5 SLMVLPLPFCTHMEIPHFFCEINQVVHLACSDTFLNDIVMYFAVALLGGGPLTGILYSYS
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CCDS32 SLMVLRLSFCTDLEIPLFFCELAQVIQLTCSDTLINNILIYFAACIFGGVPLSGIILSYT
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CCDS32 QITSCVLRMPSASGKHKAVSTCGSHLSIVLLFYGAGLGVYISSVVTDSPRKTAVASVMYS
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pF1KE5 VVTPMLNPFIYSLRNKHIKGAMKTFFRGKQ
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CCDS32 VFPQMVNPFIYSLRNKDMKGTLRKFIGRIPSLLWCAICFGFRFLE
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CCDS32 MGPRNQTAVSEFLLMKVTEDPELKLIPFSLFLSMYLVTILGNLLILLAVISDSHLHTPMY
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CCDS32 FLLFNLSFTDICLTTTTVPKILVNIQAQNQSITYTGCLTQICLVLVFAGLESCFLAVMAY
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CCDS32 DRYVAICHPLRYTVLMNVHFWGLLILLSMFMSTMDALVQSLMVLQLSFCKNVEIPLFFCE
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pF1KE5 INQVVHLACSDTFLNDIVMYFAVALLGGGPLTGILYSYSKIVSSIRAISSAQGKYKAFST
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CCDS32 VVQVIKLACSDTLINNILIYFASSVFGAIPLSGIIFSYSQIVTSVLRMPSARGKYKAFST
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CCDS32 LRKLIGRLFPF
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]