Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5390
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5390, 308 aa
1>>>pF1KE5390 308 - 308 aa - 308 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9186+/-0.0013; mu= 12.2716+/- 0.076
mean_var=183.9983+/-63.453, 0's: 0 Z-trim(101.8): 392 B-trim: 412 in 1/49
Lambda= 0.094551
statistics sampled from 6185 (6668) to 6185 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.539), E-opt: 0.2 (0.205), width: 16
Scan time: 1.870
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31114.1 OR2T6 gene_id:254879|Hs108|chr1 ( 308) 2081 297.2 1e-80
CCDS31115.1 OR2T1 gene_id:26696|Hs108|chr1 ( 369) 1533 222.6 3.7e-58
CCDS31124.1 OR2T27 gene_id:403239|Hs108|chr1 ( 317) 1415 206.4 2.4e-53
CCDS31116.1 OR2T2 gene_id:401992|Hs108|chr1 ( 324) 1369 200.1 1.8e-51
CCDS31123.1 OR2T35 gene_id:403244|Hs108|chr1 ( 323) 1353 197.9 8.4e-51
CCDS55695.1 OR2T29 gene_id:343563|Hs108|chr1 ( 315) 1249 183.7 1.5e-46
CCDS31118.1 OR2T5 gene_id:401993|Hs108|chr1 ( 315) 1248 183.6 1.7e-46
CCDS31113.1 OR2T4 gene_id:127074|Hs108|chr1 ( 348) 1219 179.7 2.8e-45
CCDS31121.1 OR2T10 gene_id:127069|Hs108|chr1 ( 312) 1168 172.7 3.2e-43
CCDS4461.1 OR2V2 gene_id:285659|Hs108|chr5 ( 315) 1146 169.7 2.6e-42
CCDS31100.1 OR2T8 gene_id:343172|Hs108|chr1 ( 312) 1122 166.4 2.5e-41
CCDS31117.1 OR2T3 gene_id:343173|Hs108|chr1 ( 318) 1121 166.3 2.8e-41
CCDS31109.1 OR2T33 gene_id:391195|Hs108|chr1 ( 320) 1117 165.7 4.1e-41
CCDS31110.1 OR2T12 gene_id:127064|Hs108|chr1 ( 320) 1102 163.7 1.7e-40
CCDS31120.1 OR2T34 gene_id:127068|Hs108|chr1 ( 318) 1095 162.7 3.3e-40
CCDS58992.1 OR2V1 gene_id:26693|Hs108|chr5 ( 315) 1091 162.2 4.7e-40
CCDS31106.1 OR2M2 gene_id:391194|Hs108|chr1 ( 347) 1077 160.3 1.9e-39
CCDS31105.1 OR2M5 gene_id:127059|Hs108|chr1 ( 312) 1073 159.7 2.6e-39
CCDS31103.1 OR2L2 gene_id:26246|Hs108|chr1 ( 312) 1065 158.6 5.5e-39
CCDS31107.1 OR2M3 gene_id:127062|Hs108|chr1 ( 312) 1063 158.4 6.7e-39
CCDS31111.1 OR2M7 gene_id:391196|Hs108|chr1 ( 312) 1057 157.5 1.2e-38
CCDS31104.1 OR2L3 gene_id:391192|Hs108|chr1 ( 312) 1049 156.5 2.5e-38
CCDS31108.1 OR2M4 gene_id:26245|Hs108|chr1 ( 311) 1045 155.9 3.6e-38
CCDS58068.1 OR2L5 gene_id:81466|Hs108|chr1 ( 312) 1045 155.9 3.6e-38
CCDS31413.1 OR2AG2 gene_id:338755|Hs108|chr11 ( 316) 1041 155.4 5.4e-38
CCDS31102.1 OR2AK2 gene_id:391191|Hs108|chr1 ( 335) 1035 154.6 9.8e-38
CCDS31414.1 OR2AG1 gene_id:144125|Hs108|chr11 ( 316) 1003 150.2 1.9e-36
CCDS34696.1 OR2AE1 gene_id:81392|Hs108|chr7 ( 323) 991 148.6 6.1e-36
CCDS32895.1 OR2Z1 gene_id:284383|Hs108|chr19 ( 314) 981 147.2 1.6e-35
CCDS1637.1 OR2L13 gene_id:284521|Hs108|chr1 ( 312) 976 146.5 2.5e-35
CCDS43673.1 OR2A1 gene_id:346528|Hs108|chr7 ( 310) 944 142.1 5.1e-34
CCDS56515.1 OR2A42 gene_id:402317|Hs108|chr7 ( 310) 944 142.1 5.1e-34
CCDS43672.1 OR2A14 gene_id:135941|Hs108|chr7 ( 310) 940 141.6 7.4e-34
CCDS43668.1 OR2A5 gene_id:393046|Hs108|chr7 ( 311) 932 140.5 1.6e-33
CCDS43670.1 OR2A12 gene_id:346525|Hs108|chr7 ( 310) 909 137.4 1.4e-32
CCDS43671.1 OR2A2 gene_id:442361|Hs108|chr7 ( 318) 901 136.3 3e-32
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 896 135.6 4.8e-32
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 888 134.5 1e-31
CCDS35089.1 OR13C3 gene_id:138803|Hs108|chr9 ( 347) 883 133.9 1.7e-31
CCDS30899.1 OR6Y1 gene_id:391112|Hs108|chr1 ( 325) 882 133.7 1.8e-31
CCDS31416.1 OR2D2 gene_id:120776|Hs108|chr11 ( 308) 880 133.4 2.2e-31
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 879 133.3 2.4e-31
CCDS35092.1 OR13C2 gene_id:392376|Hs108|chr9 ( 318) 879 133.3 2.4e-31
CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11 ( 330) 879 133.3 2.5e-31
CCDS35093.1 OR13C9 gene_id:286362|Hs108|chr9 ( 318) 878 133.1 2.7e-31
CCDS34365.1 OR2H2 gene_id:7932|Hs108|chr6 ( 312) 877 133.0 2.9e-31
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 877 133.0 2.9e-31
CCDS30898.1 OR10R2 gene_id:343406|Hs108|chr1 ( 335) 874 132.6 4e-31
CCDS31514.1 OR10AG1 gene_id:282770|Hs108|chr11 ( 301) 870 132.0 5.5e-31
CCDS34364.1 OR10C1 gene_id:442194|Hs108|chr6 ( 312) 869 131.9 6.2e-31
>>CCDS31114.1 OR2T6 gene_id:254879|Hs108|chr1 (308 aa)
initn: 2081 init1: 2081 opt: 2081 Z-score: 1562.5 bits: 297.2 E(32554): 1e-80
Smith-Waterman score: 2081; 100.0% identity (100.0% similar) in 308 aa overlap (1-308:1-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MNENNETLTRGFTLMGLFTHNKCSGFFFGVICAVFFMAMIANGVMIFLINIDPHLHTPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MNENNETLTRGFTLMGLFTHNKCSGFFFGVICAVFFMAMIANGVMIFLINIDPHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLLSHLSVIDTLYISTIVPKMLVDYLMGEGTISFIACTAQCFLYMGFMGAEFFLLGLMAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FLLSHLSVIDTLYISTIVPKMLVDYLMGEGTISFIACTAQCFLYMGFMGAEFFLLGLMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYVAICNPLRYPVLISWRVCWMILASSWFGGALDSFLLTPITMSLPFCASHQINHFFCE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DRYVAICNPLRYPVLISWRVCWMILASSWFGGALDSFLLTPITMSLPFCASHQINHFFCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 APTMLRLACGDKTTYETVMYVCCVAMLLIPFSVVTASYTRILITVHQMTSAEGRKKAFAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 APTMLRLACGDKTTYETVMYVCCVAMLLIPFSVVTASYTRILITVHQMTSAEGRKKAFAT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CSSHMMVVTLFYGAALYTYTLPQSYHTPIKDKVFSAFYTILTPLLNPLIYSLRNRDVMGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 CSSHMMVVTLFYGAALYTYTLPQSYHTPIKDKVFSAFYTILTPLLNPLIYSLRNRDVMGA
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 LKRVVARC
::::::::
CCDS31 LKRVVARC
>>CCDS31115.1 OR2T1 gene_id:26696|Hs108|chr1 (369 aa)
initn: 1569 init1: 1525 opt: 1533 Z-score: 1157.7 bits: 222.6 E(32554): 3.7e-58
Smith-Waterman score: 1533; 73.0% identity (90.6% similar) in 307 aa overlap (1-307:52-357)
10 20 30
pF1KE5 MNENNETLTRGFTLMGLFTHNKCSGFFFGV
:.: : . : ::.::::.... ::..:..
CCDS31 INSHVVILLPWECYHLIWKILPYIGTTVGSMEEYNTSST-DFTFMGLFNRKETSGLIFAI
30 40 50 60 70 80
40 50 60 70 80 90
pF1KE5 ICAVFFMAMIANGVMIFLINIDPHLHTPMYFLLSHLSVIDTLYISTIVPKMLVDYLMGEG
: .:: :..:::::::::. : .:::::::::::::.:: .:::::::::::.::. .
CCDS31 ISIIFFTALMANGVMIFLIQTDLRLHTPMYFLLSHLSLIDMMYISTIVPKMLVNYLLDQR
90 100 110 120 130 140
100 110 120 130 140 150
pF1KE5 TISFIACTAQCFLYMGFMGAEFFLLGLMAYDRYVAICNPLRYPVLISWRVCWMILASSWF
::::..:::: :::. ..:::::::::::::::::::::::::::.: ::::::.:.:::
CCDS31 TISFVGCTAQHFLYLTLVGAEFFLLGLMAYDRYVAICNPLRYPVLMSRRVCWMIIAGSWF
150 160 170 180 190 200
160 170 180 190 200 210
pF1KE5 GGALDSFLLTPITMSLPFCASHQINHFFCEAPTMLRLACGDKTTYETVMYVCCVAMLLIP
::.::.:::::::::.::: :..:::::::::..:.:::.: . :::::::::: :::::
CCDS31 GGSLDGFLLTPITMSFPFCNSREINHFFCEAPAVLKLACADTALYETVMYVCCVLMLLIP
210 220 230 240 250 260
220 230 240 250 260 270
pF1KE5 FSVVTASYTRILITVHQMTSAEGRKKAFATCSSHMMVVTLFYGAALYTYTLPQSYHTPIK
:::: :::.::: ::. :.:.:::::::::::::: ::.::::::.::: ::.::: : .
CCDS31 FSVVLASYARILTTVQCMSSVEGRKKAFATCSSHMTVVSLFYGAAMYTYMLPHSYHKPAQ
270 280 290 300 310 320
280 290 300
pF1KE5 DKVFSAFYTILTPLLNPLIYSLRNRDVMGALKRVVARC
:::.:.:::::::.::::::::::.:: :::::...:
CCDS31 DKVLSVFYTILTPMLNPLIYSLRNKDVTGALKRALGRFKGPQRVSGGVF
330 340 350 360
>>CCDS31124.1 OR2T27 gene_id:403239|Hs108|chr1 (317 aa)
initn: 1402 init1: 1402 opt: 1415 Z-score: 1071.3 bits: 206.4 E(32554): 2.4e-53
Smith-Waterman score: 1415; 64.9% identity (89.0% similar) in 308 aa overlap (1-308:1-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MNENNETLTRGFTLMGLFTHNKCSGFFFGVICAVFFMAMIANGVMIFLINIDPHLHTPMY
:...: .. : :.:::.. . ..:..: ::. .. .: : :.::.:: .::::::
CCDS31 MEQSNYSVYADFILLGLFSNARFPWLLFALILLVFLTSIASNVVKIILIHIDSRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLLSHLSVIDTLYISTIVPKMLVDYLMGEGTISFIACTAQCFLYMGFMGAEFFLLGLMAY
::::.::. : ::::::::::::: .:.. .::: .:::: :::. . ::::::::::.:
CCDS31 FLLSQLSLRDILYISTIVPKMLVDQVMSQRAISFAGCTAQHFLYLTLAGAEFFLLGLMSY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYVAICNPLRYPVLISWRVCWMILASSWFGGALDSFLLTPITMSLPFCASHQINHFFCE
::::::::::.::::.: ..::.:.:..:.::..:.:::::.::..:::::..:::::::
CCDS31 DRYVAICNPLHYPVLMSRKICWLIVAAAWLGGSIDGFLLTPVTMQFPFCASREINHFFCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 APTMLRLACGDKTTYETVMYVCCVAMLLIPFSVVTASYTRILITVHQMTSAEGRKKAFAT
.:..:.:.: : ..:::.:::::. ::::::::...:::::::::..:. :::: :: ::
CCDS31 VPALLKLSCTDTSAYETAMYVCCIMMLLIPFSVISGSYTRILITVYRMSEAEGRGKAVAT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CSSHMMVVTLFYGAALYTYTLPQSYHTPIKDKVFSAFYTILTPLLNPLIYSLRNRDVMGA
:::::.::.::::::.:::.::.::::: .::. :::::::::.::::::::::.:: ::
CCDS31 CSSHMVVVSLFYGAAMYTYVLPHSYHTPEQDKAVSAFYTILTPMLNPLIYSLRNKDVTGA
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 LKRVVARC
:..::.::
CCDS31 LQKVVGRCVSSGKVTTF
310
>>CCDS31116.1 OR2T2 gene_id:401992|Hs108|chr1 (324 aa)
initn: 1369 init1: 1369 opt: 1369 Z-score: 1037.3 bits: 200.1 E(32554): 1.8e-51
Smith-Waterman score: 1369; 63.7% identity (88.7% similar) in 300 aa overlap (9-308:10-309)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MNENNETLTRGFTLMGLFTHNKCSGFFFGVICAVFFMAMIANGVMIFLINIDPHLHTPM
. .:.: ::.:: :..:... ..: .:. :: :::.::..: .:::::
CCDS31 MGMEGLLQNSTNFVLTGLITHPAFPGLLFAIVFSIFVVAITANLVMILLIHMDSRLHTPM
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 YFLLSHLSVIDTLYISTIVPKMLVDYLMGEGTISFIACTAQCFLYMGFMGAEFFLLGLMA
:::::.::..::.:: ::::: : : . ::::..:..: :::. ..:.:::::::::
CCDS31 YFLLSQLSIMDTIYICITVPKMLQDLLSKDKTISFLGCAVQIFLYLTLIGGEFFLLGLMA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 YDRYVAICNPLRYPVLISWRVCWMILASSWFGGALDSFLLTPITMSLPFCASHQINHFFC
::::::.:::::::.:.. ::: .....:: ::.::.:.:::.:::.::: :..::::::
CCDS31 YDRYVAVCNPLRYPLLMNRRVCLFMVVGSWVGGSLDGFMLTPVTMSFPFCRSREINHFFC
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 EAPTMLRLACGDKTTYETVMYVCCVAMLLIPFSVVTASYTRILITVHQMTSAEGRKKAFA
: :..:.:.: : . :::.::.::: :::::.::...:::.::.:::.:.:::::.::::
CCDS31 EIPAVLKLSCTDTSLYETLMYACCVLMLLIPLSVISVSYTHILLTVHRMNSAEGRRKAFA
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 TCSSHMMVVTLFYGAALYTYTLPQSYHTPIKDKVFSAFYTILTPLLNPLIYSLRNRDVMG
:::::.:::..:::::.:: .::.::::: :::: :::::::::.::::::::::.:: .
CCDS31 TCSSHIMVVSVFYGAAFYTNVLPHSYHTPEKDKVVSAFYTILTPMLNPLIYSLRNKDVAA
250 260 270 280 290 300
300
pF1KE5 ALKRVVARC
::..:..::
CCDS31 ALRKVLGRCGSSQSIRVATVIRKG
310 320
>>CCDS31123.1 OR2T35 gene_id:403244|Hs108|chr1 (323 aa)
initn: 1042 init1: 1042 opt: 1353 Z-score: 1025.6 bits: 197.9 E(32554): 8.4e-51
Smith-Waterman score: 1353; 63.7% identity (88.3% similar) in 300 aa overlap (9-308:10-308)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MNENNETLTRGFTLMGLFTHNKCSGFFFGVICAVFFMAMIANGVMIFLINIDPHLHTPM
. .:.: ::.:: :..:.:. ..: .:. :: :::.::..: .:::::
CCDS31 MGMEGLLQNSTNFVLTGLITHPAFPGLLFAVVFSIFVVAITANLVMILLIHMDSRLHTPM
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 YFLLSHLSVIDTLYISTIVPKMLVDYLMGEGTISFIACTAQCFLYMGFMGAEFFLLGLMA
:::::.::..::.:: ::::: : : . ::::..:..: : :. ..:.:::::::::
CCDS31 YFLLSQLSIMDTIYICITVPKMLQDLLSKDKTISFLGCAVQIF-YLTLIGGEFFLLGLMA
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 YDRYVAICNPLRYPVLISWRVCWMILASSWFGGALDSFLLTPITMSLPFCASHQINHFFC
::::::.:::::::.:.. ::: .....:: ::.::.:.:::.:::.::: :..::::::
CCDS31 YDRYVAVCNPLRYPLLMNRRVCLFMVVGSWVGGSLDGFMLTPVTMSFPFCRSREINHFFC
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 EAPTMLRLACGDKTTYETVMYVCCVAMLLIPFSVVTASYTRILITVHQMTSAEGRKKAFA
: :..:.:.: : . :::.::.::: :::::.::...:::.::.:::.:.:::::.::::
CCDS31 EIPAVLKLSCTDTSLYETLMYACCVLMLLIPLSVISVSYTHILLTVHRMNSAEGRRKAFA
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 TCSSHMMVVTLFYGAALYTYTLPQSYHTPIKDKVFSAFYTILTPLLNPLIYSLRNRDVMG
:::::.:::..:::::.:: .::.::::: :::: :::::::::.::::::::::.:: .
CCDS31 TCSSHIMVVSVFYGAAFYTNVLPHSYHTPEKDKVVSAFYTILTPMLNPLIYSLRNKDVAA
240 250 260 270 280 290
300
pF1KE5 ALKRVVARC
::..:..::
CCDS31 ALRKVLGRCGSSQSIRVATVIRKG
300 310 320
>>CCDS55695.1 OR2T29 gene_id:343563|Hs108|chr1 (315 aa)
initn: 1291 init1: 1239 opt: 1249 Z-score: 949.0 bits: 183.7 E(32554): 1.5e-46
Smith-Waterman score: 1249; 60.1% identity (83.1% similar) in 301 aa overlap (5-305:9-309)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MNENNETLTRGFTLMGLFTHNKCSGFFFGVICAVFFMAMIANGVMIFLINIDPHLH
:.: : ::::: ..: ... :: .::. :. .:.:.:.::. : :::
CCDS55 MANITRMANHTGRLDFILMGLFRQSKHPALLSVVIFVVFLKALSGNAVLILLIHCDAHLH
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 TPMYFLLSHLSVIDTLYISTIVPKMLVDYLMGEGTISFIACTAQCFLYMGFMGAEFFLLG
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CCDS55 SPMYFFISQLSLMDMAYISVTVPKMLLDQVMGVNKVSAPECGMQMFLYLTLAGSEFFLLA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 LMAYDRYVAICNPLRYPVLISWRVCWMILASSWFGGALDSFLLTPITMSLPFCASHQINH
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CCDS55 TMAYDRYVAICHPLRYPVLMNHRVCLFLASGCWFLGSVDGFMLTPITMSFPFCRSWEIHH
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 FFCEAPTMLRLACGDKTTYETVMYVCCVAMLLIPFSVVTASYTRILITVHQMTSAEGRKK
::::.:.. :.:.: . :::.::.::: ::::: .....:: ::.:::.:.:::::::
CCDS55 FFCEVPAVTILSCSDTSLYETLMYLCCVLMLLIPVTIISSSYLLILLTVHRMNSAEGRKK
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 AFATCSSHMMVVTLFYGAALYTYTLPQSYHTPIKDKVFSAFYTILTPLLNPLIYSLRNRD
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CCDS55 AFATCSSHLTVVILFYGAAVYTYMLPSSYHTPEKDMMVSVFYTILTPVLNPLIYSLRNKD
250 260 270 280 290 300
300
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::::::...
CCDS55 VMGALKKMLTVRFVL
310
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10 20 30 40 50
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:.: : ::::: ..: ... :: .::. :. .:.:.:.::. : :::
CCDS31 MANITRMANHTGKLDFILMGLFRRSKHPALLSVVIFVVFLKALSGNAVLILLIHCDAHLH
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 TPMYFLLSHLSVIDTLYISTIVPKMLVDYLMGEGTISFIACTAQCFLYMGFMGAEFFLLG
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CCDS31 SPMYFFISQLSLMDMAYISVTVPKMLLDQVMGVNKVSAPECGMQMFLYLTLAGSEFFLLA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 LMAYDRYVAICNPLRYPVLISWRVCWMILASSWFGGALDSFLLTPITMSLPFCASHQINH
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CCDS31 TMAYDRYVAICHPLRYPVLMNHRVCLFLASGCWFLGSVDGFMLTPITMSFPFCRSWEIHH
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180 190 200 210 220 230
pF1KE5 FFCEAPTMLRLACGDKTTYETVMYVCCVAMLLIPFSVVTASYTRILITVHQMTSAEGRKK
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CCDS31 FFCEVPAVTILSCSDTSLYETLMYLCCVLMLLIPVTIISSSYLLILLTVHRMNSAEGRKK
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240 250 260 270 280 290
pF1KE5 AFATCSSHMMVVTLFYGAALYTYTLPQSYHTPIKDKVFSAFYTILTPLLNPLIYSLRNRD
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CCDS31 AFATCSSHLTVVILFYGAAVYTYMLPSSYHTPEKDMMVSVFYTILTPVLNPLIYSLRNKD
250 260 270 280 290 300
300
pF1KE5 VMGALKRVVARC
::::::...
CCDS31 VMGALKKMLTVRFVL
310
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10 20 30
pF1KE5 MNENNETLTRGFTLMGLFTHNKCSGFFFGVICAV
:.: : :.::: ..: ... :: .:
CCDS31 MASHTGWSDFILMGLFRQSKHPMANITWMANHTGWSDFILLGLFRQSKHPALLCVVIFVV
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40 50 60 70 80 90
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CCDS31 FLMALSGNAVLILLIHCDAHLHTPMYFFISQLSLMDMAYISVTVPKMLLDQVMGVNKISA
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100 110 120 130 140 150
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: : :.:. . :.:::::. ::::::::::.:::::::.. ::: .. .. :: :..
CCDS31 PECGMQMFFYVTLAGSEFFLLATMAYDRYVAICHPLRYPVLMNHRVCLFLSSGCWFLGSV
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160 170 180 190 200 210
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:.: .:::::..:: .:..:.:::::.:..: :.:.: . :: ::.::: ::::: ..
CCDS31 DGFTFTPITMTFPFRGSREIHHFFCEVPAVLNLSCSDTSLYEIFMYLCCVLMLLIPVVII
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pF1KE5 TASYTRILITVHQMTSAEGRKKAFATCSSHMMVVTLFYGAALYTYTLPQSYHTPIKDKVF
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CCDS31 SSSYLLILLTIHGMNSAEGRKKAFATCSSHLTVVILFYGAAIYTYMLPSSYHTPEKDMMV
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280 290 300
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CCDS31 SVFYTILTPVVNPLIYSLRNKDVMGALKKMLTVEPAFQKAME
310 320 330 340
>>CCDS31121.1 OR2T10 gene_id:127069|Hs108|chr1 (312 aa)
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CCDS31 MRLANQTLGGDFFLLGIFSQISHPGRLCLLIFSIFLMAVSWNITLILLIHIDSSLHTPMY
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:....::.:: :::. ::::::. : . ::: ..: .: ..:. . ::: ::. :::
CCDS31 FFINQLSLIDLTYISVTVPKMLVNQLAKDKTISVLGCGTQMYFYLQLGGAECCLLAAMAY
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CCDS31 DRYVAICHPLRYSVLMSHRVCLLLASGCWFVGSVDGFMLTPIAMSFPFCRSHEIQHFFCE
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CCDS31 VPAVLKLSCSDTSLYKIFMYLCCVIMLLIPVTVISVSYYYIILTIHKMNSVEGRKKAFTT
190 200 210 220 230 240
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CCDS31 CSSHITVVSLFYGAAIYNYMLPSSYQTPEKDMMSSFFYTILTPVLNPIIYSFRNKDVTRA
250 260 270 280 290 300
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::....
CCDS31 LKKMLSVQKPPY
310
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CCDS44 METWVNQSYTDGFFLLGIFSHSTADLVLFSVVMAVFTVALCGNVLLIFLIYMDPHLHTPM
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CCDS44 YDRYVAISHPLHYPILMNQRVCLQITGSSWAFGIIDGLIQMVVVMNFPYCGLRKVNHFFC
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CCDS44 EMLSLLKLACVDTSLFEKVIFACCVFMLLFPFSIIVASYAHILGTVLQMHSAQAWKKALA
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]