Result of FASTA (omim) for
pFN21AE5389
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5389, 308 aa
1>>>pF1KE5389 308 - 308 aa - 308 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.4037+/-0.000479; mu= 21.2325+/- 0.030
mean_var=110.2424+/-32.434, 0's: 0 Z-trim(108.9): 324 B-trim: 2131 in 2/53
Lambda= 0.122152
statistics sampled from 16538 (17081) to 16538 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.544), E-opt: 0.2 (0.2), width: 16
Scan time: 5.610
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 1008 189.1 9.4e-48
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XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 830 157.8 2.6e-38
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 829 157.6 3e-38
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 816 155.3 1.4e-37
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 802 152.9 8.1e-37
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XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 795 151.6 1.9e-36
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 794 151.4 2.1e-36
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NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 791 150.9 3e-36
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 787 150.2 4.9e-36
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 786 150.0 5.6e-36
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 766 146.5 6.5e-35
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 766 146.5 6.5e-35
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 751 143.9 4.1e-34
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 750 143.7 4.6e-34
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 514 102.1 1.5e-21
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 495 98.8 1.6e-20
NP_005949 (OMIM: 600665) melatonin receptor type 1 ( 350) 225 51.2 3.5e-06
NP_003958 (OMIM: 607405) trace amine-associated re ( 337) 210 48.6 2.1e-05
NP_000530 (OMIM: 136880,180380,610445,613731) rhod ( 348) 209 48.4 2.4e-05
NP_001471 (OMIM: 600377) galanin receptor type 1 [ ( 349) 205 47.7 4e-05
NP_000667 (OMIM: 600446) adenosine receptor A2b [H ( 332) 202 47.1 5.6e-05
XP_011531136 (OMIM: 152790,176410,238320) PREDICTE ( 380) 191 45.3 0.00023
XP_005264366 (OMIM: 152790,176410,238320) PREDICTE ( 380) 191 45.3 0.00023
NP_001307659 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphat ( 382) 191 45.3 0.00023
NP_001391 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphate r ( 382) 191 45.3 0.00023
XP_006712078 (OMIM: 152790,176410,238320) PREDICTE ( 389) 191 45.3 0.00023
NP_005192 (OMIM: 601834) C-C chemokine receptor ty ( 355) 190 45.1 0.00025
NP_005217 (OMIM: 601965) sphingosine 1-phosphate r ( 378) 190 45.1 0.00026
XP_016859579 (OMIM: 152790,176410,238320) PREDICTE ( 487) 191 45.5 0.00026
XP_011531133 (OMIM: 152790,176410,238320) PREDICTE ( 487) 191 45.5 0.00026
NP_150598 (OMIM: 606665) melanopsin isoform 1 [Hom ( 478) 188 44.9 0.00038
XP_016872445 (OMIM: 606665) PREDICTED: melanopsin ( 528) 188 45.0 0.0004
NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 185 44.2 0.00045
NP_000697 (OMIM: 600821) vasopressin V1a receptor ( 418) 180 43.4 0.00093
NP_000520 (OMIM: 202200,607397) adrenocorticotropi ( 297) 178 42.8 0.00099
XP_016881270 (OMIM: 202200,607397) PREDICTED: adre ( 297) 178 42.8 0.00099
NP_001278840 (OMIM: 202200,607397) adrenocorticotr ( 297) 178 42.8 0.00099
NP_064445 (OMIM: 300822,303700,303900) long-wave-s ( 364) 176 42.6 0.0014
NP_001041 (OMIM: 182452) somatostatin receptor typ ( 369) 176 42.6 0.0014
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NP_001041695 (OMIM: 102775) adenosine receptor A1 ( 326) 175 42.4 0.0015
NP_000665 (OMIM: 102775) adenosine receptor A1 [Ho ( 326) 175 42.4 0.0015
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NP_872588 (OMIM: 602548) nociceptin receptor isofo ( 370) 172 41.9 0.0023
>>NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C46 [H (309 aa)
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pF1KE5 METQNLTVVTEFILLGLTQSQDAQLLVFVLVLIFYLIILPGNFLIIFTIKSDPGLTAPLY
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NP_001 LNPLLNLACTDTHMLELFIAANSGFICLLNFALLLVSYVVILCSLRTHSLEARHKALSTC
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NP_001 VSHITVVILFFVPCIFVYMRPAATLPIDKAVAIFYTMITPMLNPLIYTLKNAQMKNAIRK
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pF1KE5 LLSQHMFC
: :.
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300
>>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor (311 aa)
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pF1KE5 METQNLTVVTEFILLGLTQSQDAQLLVFVLVLIFYLIILPGNFLIIFTIKSDPGLTA
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pF1KE5 MAFDRYIAICRPLHYSTIMNPRACYALSLVLWLGGFIHSIVQVALILHLPFCGPNQLDNF
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pF1KE5 FCDVPQVIKLACTNTFVVELLMVSNSGLLSLLCFLGLLASY-AVILCRIREHSSEGKSKA
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pF1KE5 ISTCTTHIIIIFLMFGPAIFIYTCPFQAFPAD--KVVSLFHTVIFPLMNPVIYTLRNQEV
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300
pF1KE5 KASMRKLLSQHMFC
......:.
NP_001 RGAVKRLMGWE
310
>>NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [Homo (317 aa)
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pF1KE5 METQNLTVVTEFILLGLTQSQDAQLLVFVLVLIFYLIILPGNFLIIFTIKSDPGLTAPLY
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pF1KE5 SMRKLLSQHMFC
. .:::
NP_036 AWQKLLWKFSGLTSKLAT
300 310
>>XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
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Smith-Waterman score: 830; 42.8% identity (74.8% similar) in 306 aa overlap (1-302:1-305)
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pF1KE5 METQNLTVVTEFILLGLTQSQDAQLLVFVLVLIFYLIILPGNFLIIFTIKSDPGLTAPLY
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pF1KE5 FFLGNLALLDASYSFIVVPRMLVDFLSEKKVISYRSCITQLFFLHFLGAGEMFLLVVMAF
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XP_011 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSS-PSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKG
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pF1KE5 SMRKLLSQHMFC
. .:::
XP_011 AWQKLLWKFSGLTSKLAT
300 310
>>XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
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Smith-Waterman score: 830; 42.8% identity (74.8% similar) in 306 aa overlap (1-302:1-305)
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pF1KE5 METQNLTVVTEFILLGLTQSQDAQLLVFVLVLIFYLIILPGNFLIIFTIKSDPGLTAPLY
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XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
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pF1KE5 FFLGNLALLDASYSFIVVPRMLVDFLSEKKVISYRSCITQLFFLHFLGAGEMFLLVVMAF
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XP_011 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
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pF1KE5 DRYIAICRPLHYSTIMNPRACYALSLVLWLGGFIHSIVQVALILHLPFCGPNQLDNFFCD
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XP_011 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
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pF1KE5 VPQVIKLACTNTFVVELLMVSNSGLLSLLCFLGLLASYAVILCRI-REHSSEGKSKAIST
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XP_011 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
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pF1KE5 CTTHIIIIFLMFGPAIFIYTCPFQAFPA---DKVVSLFHTVIFPLMNPVIYTLRNQEVKA
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XP_011 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSS-PSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKG
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pF1KE5 SMRKLLSQHMFC
. .:::
XP_011 AWQKLLWKFSGLTSKLAT
300 310
>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
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Smith-Waterman score: 829; 40.1% identity (74.5% similar) in 302 aa overlap (4-302:6-307)
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pF1KE5 METQNLTVVTEFILLGLTQSQDAQLLVFVLVLIFYLIILPGNFLIIFTIKSDPGLTAP
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NP_006 MEFTDRNYTLVTEFILLGFPTRPELQIVLFLMFLTLYAIILIGNIGLMLLIRIDPHLQTP
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pF1KE5 LYFFLGNLALLDASYSFIVVPRMLVDFLSEKKVISYRSCITQLFFLHFLGAGEMFLLVVM
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NP_006 MYFFLSNLSFVDLCYFSDIVPKMLVNFLSENKSISYYGCALQFYFFCTFADTESFILAAM
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 AFDRYIAICRPLHYSTIMNPRACYALSLVLWLGGFIHSIVQVALILHLPFCGPNQLDNFF
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NP_006 AYDRYVAICNPLLYTVVMSRGICMRLIVLSYLGGNMSSLVHTSFAFILKYCDKNVINHFF
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 CDVPQVIKLACTNTFVVELLMVSNSGLLSLLCFLGLLASYAVILCRI-REHSSEGKSKAI
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NP_006 CDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFIIIIISYFFILLSVLKIRSFSGRKKTF
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 STCTTHIIIIFLMFGPAIFIYTCPFQAF-P-ADKVVSLFHTVIFPLMNPVIYTLRNQEVK
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NP_006 STCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKDVK
250 260 270 280 290 300
300
pF1KE5 ASMRKLLSQHMFC
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NP_006 DAAEKVLRSKVDSS
310
>>NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [Homo (312 aa)
initn: 743 init1: 611 opt: 816 Z-score: 795.4 bits: 155.3 E(85289): 1.4e-37
Smith-Waterman score: 816; 40.7% identity (72.1% similar) in 305 aa overlap (5-306:3-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 METQNLTVVTEFILLGLTQSQDAQLLVFVLVLIFYLIILPGNFLIIFTIKSDPGLTAPLY
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NP_009 MVNQSSTPGFLLLGFSEHPGLERTLFVVVLTSYLLTLVGNTLIILLSALDPKLHSPMY
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FFLGNLALLDASYSFIVVPRMLVDFLSEKKVISYRSCITQLFFLHFLGAGEMFLLVVMAF
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NP_009 FFLSNLSFLDLCFTTSCVPQMLVNLWGPKKTISFLDCSVQIFIFLSLGTTECILLTVMAF
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130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYIAICRPLHYSTIMNPRACYALSLVLWLGGFIHSIVQVALILHLPFCGPNQLDNFFCD
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NP_009 DRYVAVCQPLHYATIIHPRLCWQLASVAWVIGLVESVVQTPSTLHLPFCPDRQVDDFVCE
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KE5 VPQVIKLACTNTFVVELLMVSNSGLLSLLCFLGLLASY-AVILCRIREHSSEGKSKAIST
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NP_009 VPALIRLSCEDTSYNEIQVAVASVFILVVPLSLILVSYGAITWAVLRINSAKGRRKAFGT
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CTTHIIIIFLMFGPAIFIYTCPFQAFPAD--KVVSLFHTVIFPLMNPVIYTLRNQEVKAS
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NP_009 CSSHLTVVTLFYSSVIAVYLQPKNPYAQERGKFFGLFYAVGTPSLNPLIYTLRNKEVTRA
240 250 260 270 280 290
300
pF1KE5 MRKLLSQHMFC
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NP_009 FRRLLGKEMGLTQS
300 310
>>NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [Homo (317 aa)
initn: 757 init1: 571 opt: 802 Z-score: 782.0 bits: 152.9 E(85289): 8.1e-37
Smith-Waterman score: 802; 39.3% identity (72.4% similar) in 308 aa overlap (1-304:1-308)
10 20 30 40 50
pF1KE5 METQNLTVVTEFILLGLTQ-SQDAQLLVFVLVLIFYLIILPGNFLIIFTIKSDPGLTAPL
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NP_835 MAIGNWTEISEFILMSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLKGNSLIILVTLADPMLHSPM
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 YFFLGNLALLDASYSFIVVPRMLVDFLSEKKVISYRSCITQLFFLHFLGAGEMFLLVVMA
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NP_835 YFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLLAQDTTISFLGCATQMYFFFFFGVAECFLLATMA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 FDRYIAICRPLHYSTIMNPRACYALSLVLWLGGFIHSIVQVALILHLPFCGPNQLDNFFC
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NP_835 YDRYVAICSPLHYPVIMNQRTRAKLAAASWFPGFPVATVQTTWLFSFPFCGTNKVNHFFC
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 DVPQVIKLACTNTFVVELLMVSNSGLLSLLCFLGLLASYAVILCRI-REHSSEGKSKAIS
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NP_835 DSPPVLKLVCADTALFEIYAIVGTILVVMIPCLLILCSYTRIAAAILKIPSAKGKHKAFS
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 TCTTHIIIIFLMFGPAIFIYTCP-FQAFP-ADKVVSLFHTVIFPLMNPVIYTLRNQEVKA
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NP_835 TCSSHLLVVSLFYISSSLTYFWPKSNNSPESKKLLSLSYTVVTPMLNPIIYSLRNSEVKN
250 260 270 280 290 300
300
pF1KE5 SMRKLLSQHMFC
.. . . .
NP_835 ALSRTFHKVLALRNCIP
310
>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
initn: 758 init1: 587 opt: 795 Z-score: 775.4 bits: 151.6 E(85289): 1.9e-36
Smith-Waterman score: 795; 36.8% identity (74.8% similar) in 310 aa overlap (1-307:1-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 METQNLTVVTEFILLGLTQSQDAQLLVFVLVLIFYLIILPGNFLIIFTIKSDPGLTAPLY
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NP_036 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FFLGNLALLDASYSFIVVPRMLVDFLSEKKVISYRSCITQLFFLHFLGAGEMFLLVVMAF
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NP_036 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYIAICRPLHYSTIMNPRACYALSLVLWLGGFIHSIVQVALILHLPFCGPNQLDNFFCD
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NP_036 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230
pF1KE5 VPQVIKLACTNTFVVELLMVSNSGLLSLLCFLGLLASYAVILCRI-REHSSEGKSKAIST
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NP_036 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CTTHIIIIFLMFGPAIFIYTCPFQAFPADK--VVSLFHTVIFPLMNPVIYTLRNQEVKAS
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NP_036 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA
250 260 270 280 290 300
300
pF1KE5 MRKLLSQHMFC
..:.... .:
NP_036 LKKVVGRVVFSV
310
>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa)
initn: 758 init1: 587 opt: 795 Z-score: 775.4 bits: 151.6 E(85289): 1.9e-36
Smith-Waterman score: 795; 36.8% identity (74.8% similar) in 310 aa overlap (1-307:1-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 METQNLTVVTEFILLGLTQSQDAQLLVFVLVLIFYLIILPGNFLIIFTIKSDPGLTAPLY
: : . :.::.::::... . : :.::. : .:: . ::.:::.... : : .:.:
XP_011 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FFLGNLALLDASYSFIVVPRMLVDFLSEKKVISYRSCITQLFFLHFLGAGEMFLLVVMAF
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XP_011 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYIAICRPLHYSTIMNPRACYALSLVLWLGGFIHSIVQVALILHLPFCGPNQLDNFFCD
:...:.:.::::.. :. . : : ::. . .. .... :. : ::. : . .::::
XP_011 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230
pF1KE5 VPQVIKLACTNTFVVELLMVSNSGLLSLLCFLGLLASYAVILCRI-REHSSEGKSKAIST
: ..::.:..: . :....:...:. . :: .:::: : : . . :..:. ::.::
XP_011 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CTTHIIIIFLMFGPAIFIYTCPFQAFPADK--VVSLFHTVIFPLMNPVIYTLRNQEVKAS
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XP_011 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA
250 260 270 280 290 300
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pF1KE5 MRKLLSQHMFC
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XP_011 LKKVVGRVVFSV
310
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]